GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 76 - 100 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID ▲ Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
APC/C:Cdc20 mediated degradation of Securin
  • Anapc1
  • Anapc15
  • Anapc16
  • Anapc2
  • Anapc4
  • Anapc5
  • Anapc7
  • Cdc16
  • Cdc20
  • Cdc23
  • Cdc26
  • Cdc27
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • LOC100366017
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mecl1
  • Mss1
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Pttg
  • Pttg1
  • Ring12
  • Rps27a
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Ube2c
  • Ube2d1
  • Ube2e1
  • Ube2s
Rattus norvegicus (Norway rat)
Hedgehog ligand biogenesis
  • Derl2
  • Dhh
  • Erlec1
  • Hhat
  • Ihh
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • LOC100910831
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mecl1
  • Mss1
  • Os9
  • P4hb
  • Pdia1
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Ring12
  • Rps27a
  • Sel1h
  • Sel1l
  • Shh
  • Sug1
  • Syvn1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Vcp
  • Vhh-1
Rattus norvegicus (Norway rat)
G2/M Checkpoints
  • Gtse1
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mecl1
  • Mss1
  • P53
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Ring12
  • Rps27a
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Tp53
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
AUF1 (hnRNP D0) binds and destabilizes mRNA
  • Auf1
  • Eif4g1
  • Hnrnpd
  • Hnrpd
  • Hsc70
  • Hsc73
  • Hsp27
  • Hsp70-1
  • Hsp70-2
  • Hspa1
  • Hspa1a
  • Hspa1b
  • Hspa2
  • Hspa8
  • Hspb1
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mecl1
  • Mss1
  • Pabp1
  • Pabpc1
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Ring12
  • Rps27a
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Ubiquitin-dependent degradation of Cyclin D
  • Ccnd1
  • Cdk4
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mecl1
  • Mss1
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Ring12
  • Rps27a
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Ubiquitin Mediated Degradation of Phosphorylated Cdc25A
  • Cdc25a
  • Chek1
  • Chk1
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mecl1
  • Mss1
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Ring12
  • Rps27a
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Regulation of ornithine decarboxylase (ODC)
  • Azin1
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mecl1
  • Mss1
  • Nmor1
  • Nqo1
  • Oaz
  • Oaz1
  • Oaz2
  • Oaz3
  • Oazi
  • Oazin
  • Odc
  • Odc1
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Ring12
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
Rattus norvegicus (Norway rat)
Assembly of the pre-replicative complex
  • Anapc1
  • Anapc15
  • Anapc16
  • Anapc2
  • Anapc4
  • Anapc5
  • Anapc7
  • Cdc16
  • Cdc23
  • Cdc26
  • Cdc27
  • Cdt1
  • Fzr1
  • Gmnn
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • LOC100366017
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mcm2
  • Mcm3
  • Mcm4
  • Mcm5
  • Mecl1
  • Mss1
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psmf1
  • Ring12
  • Rps27a
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Ube2c
  • Ube2d1
  • Ube2e1
  • Ube2s
Rattus norvegicus (Norway rat)
Autodegradation of Cdh1 by Cdh1:APC/C
  • Anapc1
  • Anapc15
  • Anapc16
  • Anapc2
  • Anapc4
  • Anapc5
  • Anapc7
  • Cdc16
  • Cdc23
  • Cdc26
  • Cdc27
  • Fzr1
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • LOC100366017
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mecl1
  • Mss1
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psmf1
  • Ring12
  • Rps27a
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Ube2c
  • Ube2d1
  • Ube2e1
  • Ube2s
Rattus norvegicus (Norway rat)
PRPP biosynthesis
  • ENSRNOG00000063771
  • LOC314140
  • Prps1
  • Prps1l1
  • Prps1l3
  • Prps2
Rattus norvegicus (Norway rat)
RAB geranylgeranylation
  • Chm
  • Chml
  • Ggta
  • Ggtb
  • Prl2
  • Ptp4a2
  • Rab1
  • Rab10
  • Rab11
  • Rab11a
  • Rab11b
  • Rab12
  • Rab13
  • Rab14
  • Rab15
  • Rab16
  • Rab17
  • Rab18
  • Rab19
  • Rab1A
  • Rab1b
  • Rab2
  • Rab20
  • Rab21
  • Rab22a
  • Rab23
  • Rab26
  • Rab27
  • Rab27a
  • Rab27b
  • Rab29
  • Rab2a
  • Rab2b
  • Rab30
  • Rab31
  • Rab33a
  • Rab33b
  • Rab34
  • Rab35
  • Rab36
  • Rab37
  • Rab38
  • Rab39a
  • Rab3a
  • Rab3b
  • Rab3c
  • Rab3d
  • Rab4
  • Rab40b
  • Rab40c
  • Rab43
  • Rab44
  • Rab4a
  • Rab4b
  • Rab5a
  • Rab5b
  • Rab5c
  • Rab6
  • Rab6a
  • Rab6b
  • Rab7
  • Rab7a
  • Rab7b
  • Rab7l1
  • Rab8
  • Rab8a
  • Rab8b
  • Rab9
  • Rab9a
  • Rab9b
  • Rabggta
  • Rabggtb
  • Rep1
Rattus norvegicus (Norway rat)
RAB GEFs exchange GTP for GDP on RABs
  • AABR07042915.1
  • Akt1
  • Akt2
  • Akt3
  • Als2
  • Als2cl
  • Ankrd27
  • Ccz1
  • Ccz1b
  • Chm
  • Chml
  • Dennd1a
  • Dennd1b
  • Dennd1c
  • Dennd2a
  • Dennd2b
  • Dennd2c
  • Dennd2d
  • Dennd3
  • Dennd4a
  • Dennd4b
  • Dennd4c
  • Dennd5a
  • Dennd5b
  • Dennd6a
  • Dennd6b
  • Gapvd1
  • Gdi1
  • Gdi2
  • Gdi3
  • Grab
  • Hps1
  • Hps4
  • LOC100909916
  • Madd
  • Mon1a
  • Mon1b
  • RGD1310016
  • RGD1562639
  • RGD1564492
  • Rab1
  • Rab10
  • Rab12
  • Rab13
  • Rab14
  • Rab18
  • Rab1A
  • Rab1b
  • Rab21
  • Rab27
  • Rab27a
  • Rab27b
  • Rab31
  • Rab35
  • Rab38
  • Rab39a
  • Rab3a
  • Rab3gap
  • Rab3gap1
  • Rab3gap2
  • Rab3il1
  • Rab3ip
  • Rab5a
  • Rab5b
  • Rab5c
  • Rab6
  • Rab6a
  • Rab6b
  • Rab7
  • Rab7a
  • Rab7b
  • Rab8
  • Rab8a
  • Rab8b
  • Rab9
  • Rab9a
  • Rab9b
  • Rabgdia
  • Rabgef1
  • Rabin3
  • Rabin8
  • Rep1
  • Rgp1
  • Ric1
  • Rin1
  • Rin2
  • Rin3
  • Rinl
  • Sbdn
  • Sbf1
  • Sbf2
  • Trappc1
  • Trappc10
  • Trappc11
  • Trappc12
  • Trappc13
  • Trappc2
  • Trappc2l
  • Trappc2ll1
  • Trappc3
  • Trappc4
  • Trappc5
  • Trappc6a
  • Trappc6b
  • Trappc8
  • Trappc9
  • Ttc15
  • Ulk1
  • Ywhae
Rattus norvegicus (Norway rat)
COPI-independent Golgi-to-ER retrograde traffic
  • AABR07000222.1
  • Actr10
  • Actr1a
  • Agpat3
  • Bicd1
  • Bicd2
  • Capza1
  • Capza2
  • Capza3
  • Capzb
  • Cpla2
  • Ctrn1
  • Dctn1
  • Dctn2
  • Dctn3l1
  • Dctn4
  • Dctn5
  • Dctn6
  • Dhc1
  • Dlc2
  • Dnch1
  • Dnchc1
  • Dnci1
  • Dnci2
  • Dncic1
  • Dncic2
  • Dncl1
  • Dnclc1
  • Dncli1
  • Dncli2
  • Dnec1
  • Dyhc
  • Dync1h1
  • Dync1i1
  • Dync1i2
  • Dync1li1
  • Dync1li2
  • Dynll1
  • Dynll2
  • Galnt1
  • Galnt2
  • Lis-1
  • Lis1
  • Map1c
  • Pafah1b1
  • Pafah1b2
  • Pafah1b3
  • Pafaha
  • Pafahb
  • Pafahg
  • Pin
  • Pla2g4
  • Pla2g4a
  • Pla2g6
  • Pnpla9
  • Rab18
  • Rab3gap
  • Rab3gap1
  • Rab3gap2
  • Rab6
  • Rab6a
  • Rab6b
Rattus norvegicus (Norway rat)
TCF dependent signaling in response to WNT
  • Axin
  • Axin1
  • Axin2
  • Catnb
  • Ctnnb1
  • LOC100360645
  • Rnf146
  • Rps27a
  • Ryk
  • Tnks
  • Tnks2
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Usp34
  • Wnt-5a
  • Wnt1
  • Wnt3
  • Wnt3a
  • Wnt5a
Rattus norvegicus (Norway rat)
Glycogen synthesis
  • Gbe1
  • Gyg
  • Gyg1
  • Gys1
  • Pgm1
  • Ppp1r3c
  • Ppp1r5
  • Ugp2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Iron uptake and transport
  • AABR07054189.1
  • Abcg2
  • Aco1
  • Bcrp1
  • Boct
  • Boit
  • Cand1
  • Cp
  • Cul1
  • Cybrd1
  • Dct1
  • Dcytb
  • Dmt1
  • Fbxl5
  • Fpn1
  • Fpt1
  • Fth
  • Fth1
  • Fth1-ps5
  • Ftl
  • Ftl1
  • Ftl1l2
  • Ftmt
  • Hcp1
  • Heph
  • Hmox1
  • Hmox2
  • Ireb1
  • Ireb2
  • Irebp
  • Irp2
  • LOC100359668
  • LOC100360645
  • Lcn2
  • Nedd8
  • Nramp2
  • Pcft
  • Rps27a
  • Skp1
  • Skp1a
  • Slc11a2
  • Slc22a17
  • Slc40a1
  • Slc46a1
  • Tf
  • Tip120
  • Tip120a
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
pre-mRNA splicing
  • AABR07026797.1
  • AABR07029847.1
  • AABR07065078.1
  • AC109542.1
  • Acin1
  • Alyref
  • Ath55
  • Auf1
  • Bat1
  • Bat1a
  • Bcas2
  • Bud13
  • Bud31
  • Bwd
  • C3h9orf78
  • Cactin
  • Casc3
  • Cbp20
  • Cbp80
  • Ccdc12
  • Ccdc16
  • Ccdc55
  • Cdc40
  • Cdc5l
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Rattus norvegicus (Norway rat)
Regulation of TNFR1 signaling
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Rattus norvegicus (Norway rat)
NOD1/2 Signaling Pathway
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Rattus norvegicus (Norway rat)
TNFR1-induced NF-kappa-B signaling pathway
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  • Cyld1
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Rattus norvegicus (Norway rat)
TNFR1-induced proapoptotic signaling
  • Api3
  • Birc2
  • Birc3
  • Birc4
  • Cyld
  • Cyld1
  • Fadd
  • Ikbke
  • Mib2
  • Otud1
  • Otud7b
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  • Pkcbpb15
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  • Rbck1
  • Ripk1
  • Rnf31
  • Spata2
  • Tbk1
  • Tnf
  • Tnfa
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  • Tnfr1
  • Tnfrsf1a
  • Tnfsf2
  • Tradd
  • Traf2
  • Ubce7ip3
  • Ubp41
  • Ubp69
  • Usp2
  • Usp21
  • Usp4
  • Xiap
Rattus norvegicus (Norway rat)
TNF receptor superfamily (TNFSF) members mediating non-canonical NF-kB pathway
  • Birc2
  • Birc3
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  • Cd40l
  • Cd40lg
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  • Ltb
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  • Rankl
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  • Tnfsf11
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  • Tnlg4a
  • Traf2
  • Traf3
  • Trance
Rattus norvegicus (Norway rat)
Regulation of necroptotic cell death
  • Aip1
  • Api3
  • Birc2
  • Birc3
  • Birc4
  • Casp8
  • Cdc37
  • Fadd
  • Flot1
  • Flot2
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  • Hspca
  • Itch
  • LOC100360645
  • Mlkl
  • NEWGENE_1308361
  • Ogt
  • Park2
  • Pdcd6ip
  • Prkn
  • Reg1
  • Reg2
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  • Ripk1
  • Ripk3
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  • Tradd
  • Traf2
  • Uba80
  • Ubb
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  • Ubc
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  • Xiap
Rattus norvegicus (Norway rat)
IKK complex recruitment mediated by RIP1
  • Birc2
  • Birc3
  • Cd14
  • Chuk
  • Ikbkb
  • Ikbkg
  • Ikkb
  • LOC100360645
  • Ly96
  • Nemo
  • Plin3
  • Rip3
  • Ripk1
  • Ripk3
  • Rps27a
  • Sarm1
  • Ticam1
  • Ticam2
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  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubc4
  • Ubcep1
  • Ubch4
  • Ubch5b
  • Ubcl1
  • Ube2d1
  • Ube2d2
  • Ube2d3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Regulation of TP53 Activity through Acetylation
  • Akt1
  • Akt2
  • Akt3
  • Brd1
  • Brd7
  • Brpf1
  • Brpf3
  • Chd3
  • Chd4
  • Ep300
  • Gatad2a
  • Gatad2b
  • Hdac1
  • Hdac2
  • Ing5
  • Kat6a
  • Mbd3
  • Meaf6
  • Moz
  • Mta2
  • Myst3
  • P53
  • Pml
  • Rbbp4
  • Rbbp7
  • Tp53
Rattus norvegicus (Norway rat)

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Last updated: August 19, 2024