GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 126 - 150 of 1070 in total
Pathway Name ▲ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Biosynthesis of the N-glycan precursor (dolichol lipid-linked oligosaccharide, LLO) and transfer to a nascent protein
  • Alg1
  • Alg12
  • Alg13
  • Alg14
  • Alg2
  • Alg3
  • Alg6
  • Alg8
  • Alg9
  • Dpagt1
  • Mpdu1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Biotin transport and metabolism
  • Acac
  • Acaca
  • Acacb
  • Btd
  • Hlcs
  • Mcca
  • Mccc1
  • Mccc2
  • Pc
  • Pcca
  • Pccb
  • Pdzd11
  • Slc5a6
  • Smvt
Rattus norvegicus (Norway rat)
Branched-chain amino acid catabolism
  • Acad8
  • Acadsb
  • Acat1
  • Aldh6a1
  • Auh
  • Bcat1
  • Bcat2
  • Bcatm
  • Bckdha
  • Bckdhb
  • Bckdk
  • Dbt
  • Dld
  • Eca40
  • Echs1
  • Erab
  • Hadh2
  • Hibadh
  • Hibch
  • Hsd17b10
  • Ivd
  • Mcca
  • Mccc1
  • Mccc2
  • Mmsdh
Rattus norvegicus (Norway rat)
Breakdown of the nuclear lamina
  • Casp6
  • Lmn1
  • Lmna
  • Lmnb1
  • Mch2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Butyrate Response Factor 1 (BRF1) binds and destabilizes mRNA
  • Akt1
  • Brf1
  • Cmg1
  • Dcp1a
  • Dcp2
  • Dis3
  • Exosc1
  • Exosc2
  • Exosc3
  • Exosc4
  • Exosc5
  • Exosc6
  • Exosc7
  • Exosc8
  • Exosc9
  • LOC103690064
  • LOC679140
  • Mapkapk2
  • Tis11b
  • Xrn1
  • Ywhab
  • Zfp36l1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Butyrophilin (BTN) family interactions
  • Btn1a1
  • Btn2a2
  • Btnl2
  • Btnl9
  • Cd209a
  • LOC684480
  • Ppl
  • Xdh
Rattus norvegicus (Norway rat)
CASP8 activity is inhibited
  • AABR07018323.1
  • Apt1
  • Apt1Lg1
  • Casp8
  • Cd95l
  • Cflar
  • Fadd
  • Fas
  • Fasl
  • Faslg
  • Ripk1
  • Tnfrsf10b
  • Tnfrsf6
  • Tnfsf10
  • Tnfsf6
  • Tnlg6a
  • Tradd
  • Traf2
Rattus norvegicus (Norway rat)
CD22 mediated BCR regulation
  • AABR07034730.2
  • AABR07060971.1
  • AABR07061001.1
  • AABR07065782.1
  • AABR07065808.1
  • AABR07065812.2
  • AABR07065813.1
  • Cd22
  • Cd79a
  • Cd79b
  • ENSRNOG00000062324
  • ENSRNOG00000062682
  • ENSRNOG00000062762
  • ENSRNOG00000062853
  • ENSRNOG00000062915
  • ENSRNOG00000062976
  • ENSRNOG00000063148
  • ENSRNOG00000063329
  • ENSRNOG00000063340
  • ENSRNOG00000063341
  • ENSRNOG00000063422
  • ENSRNOG00000063550
  • ENSRNOG00000063572
  • ENSRNOG00000063707
  • ENSRNOG00000063791
  • ENSRNOG00000064041
  • ENSRNOG00000064061
  • ENSRNOG00000064085
  • ENSRNOG00000064245
  • ENSRNOG00000064481
  • ENSRNOG00000064582
  • ENSRNOG00000065160
  • ENSRNOG00000065181
  • ENSRNOG00000065191
  • ENSRNOG00000065237
  • ENSRNOG00000065406
  • ENSRNOG00000065564
  • ENSRNOG00000065629
  • ENSRNOG00000065670
  • ENSRNOG00000065675
  • ENSRNOG00000065690
  • ENSRNOG00000065855
  • ENSRNOG00000066010
  • ENSRNOG00000066072
  • ENSRNOG00000066203
  • ENSRNOG00000066380
  • ENSRNOG00000066406
  • ENSRNOG00000066431
  • ENSRNOG00000066785
  • ENSRNOG00000066812
  • ENSRNOG00000066814
  • ENSRNOG00000066904
  • ENSRNOG00000066922
  • ENSRNOG00000066926
  • ENSRNOG00000066971
  • ENSRNOG00000067010
  • ENSRNOG00000067025
  • ENSRNOG00000067233
  • ENSRNOG00000067273
  • ENSRNOG00000067516
  • ENSRNOG00000067603
  • ENSRNOG00000067643
  • ENSRNOG00000067679
  • ENSRNOG00000067883
  • ENSRNOG00000068055
  • ENSRNOG00000068059
  • ENSRNOG00000068381
  • ENSRNOG00000068499
  • ENSRNOG00000068847
  • ENSRNOG00000069193
  • ENSRNOG00000069427
  • ENSRNOG00000069491
  • ENSRNOG00000069766
  • ENSRNOG00000069828
  • ENSRNOG00000069901
  • ENSRNOG00000069940
  • ENSRNOG00000070091
  • ENSRNOG00000070192
  • ENSRNOG00000070244
  • ENSRNOG00000070247
  • ENSRNOG00000070810
  • ENSRNOG00000070812
  • ENSRNOG00000070816
  • ENSRNOG00000070832
  • ENSRNOG00000070933
  • ENSRNOG00000071049
  • ENSRNOG00000071091
  • Igkv2-112l1
  • Igkv8-30l1
  • Igkvl-ps6
  • Igkvl10
  • Igkvl12
  • Igkvl13
  • Igkvl2
  • Iglc1
  • Igll1
  • LOC100363522
  • LOC100365500
  • LOC100911032
  • LOC102551948
  • LOC690813
  • Lyn
  • Ptph6
  • Ptpn6
  • RGD1561722
  • RGD1564696
Rattus norvegicus (Norway rat)
CD28 co-stimulation
  • Cd28
  • Cd80
  • Cd86
  • Fyn
  • Grap2
  • Lck
  • Lyn
  • Src
  • Yes1
Rattus norvegicus (Norway rat)
CD28 dependent PI3K/Akt signaling
  • Akt1
  • Akt2
  • Akt3
  • Cd28
  • Cd80
  • Cd86
  • Frap1
  • Fyn
  • Gbl
  • Lck
  • Lst8
  • Map3k14
  • Map3k8
  • Mapkap1
  • Mip1
  • Mlst8
  • Mtor
  • Nipk
  • Pdk1
  • Pdpk1
  • Pik3ca
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Pik3r3
  • Protor1
  • Prr5
  • Raft1
  • Rictor
  • Sin1
  • Them4
  • Tpl2
  • Trib3
Rattus norvegicus (Norway rat)
CD28 dependent Vav1 pathway
  • Ash
  • Cd28
  • Cd80
  • Cd86
  • Cdc42
  • Fyn
  • Grb2
  • Lck
  • Pak1
  • Pak2
  • Pak3
  • Rac
  • Rac1
  • Vav
  • Vav1
Rattus norvegicus (Norway rat)
CDC42 GTPase cycle
  • AABR07021955.1
  • AABR07032856.1
  • Abr
  • Arap1
  • Arap2
  • Arap3
  • Arhgap1
  • Arhgap10
  • Arhgap17
  • Arhgap20
  • Arhgap21
  • Arhgap22
  • Arhgap24
  • Arhgap26
  • Arhgap27
  • Arhgap29
  • Arhgap30
  • Arhgap31
  • Arhgap32
  • Arhgap33
  • Arhgap35
  • Arhgap4
  • Arhgap40
  • Arhgap42
  • Arhgap44
  • Arhgap45
  • Arhgap5
  • Arhgap7
  • Arhgap9
  • Arhgdia
  • Arhgdib
  • Arhgdig
  • Arhgef10
  • Arhgef11
  • Arhgef12
  • Arhgef15
  • Arhgef16
  • Arhgef19
  • Arhgef25
  • Arhgef26
  • Arhgef5
  • Arhgef6
  • Arhgef9
  • Bcr
  • Camgap1
  • Cav
  • Cav1
  • Cdc42
  • Def6
  • Depdc1b
  • Dlc1
  • Dnmbp
  • Dock10
  • Dock11
  • Dock6
  • Dock7
  • Dock8
  • Ect2
  • Ehsh1
  • Fam13b
  • Farp1
  • Fgd1
  • Fgd2
  • Fgd3
  • Fgd4
  • Geft
  • Gmip
  • Gna13
  • Grf2
  • Grlf1
  • Itsn
  • Itsn1
  • Ktn1
  • LOC687105
  • Lbr
  • Mcf2
  • Mcf2l
  • Myo9b
  • Myr5
  • Ngef
  • Ophn1
  • Ost
  • P190A
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Plekhg1
  • Plekhg2
  • Plekhg3
  • Prex1
  • Prex2
  • RGD1565043
  • Racgap1
  • Ralbp1
  • Rasgrf2
  • Rhogap
  • Rich2
  • Spata13
  • Srgap1
  • Srgap2
  • Srgap3
  • Stard12
  • Stard13
  • Stard8
  • Syde1
  • Tagap
  • Tiam1
  • Trio
  • Tuba
  • Vav2
  • Vav3
  • Ykt6
  • p190ARHOGAP
Rattus norvegicus (Norway rat)
CDK-mediated phosphorylation and removal of Cdc6
  • Anapc1
  • Anapc15
  • Anapc16
  • Anapc2
  • Anapc4
  • Anapc5
  • Anapc7
  • Ccna1
  • Ccna2
  • Ccne
  • Ccne1
  • Ccne2
  • Cdc16
  • Cdc23
  • Cdc26
  • Cdc27
  • Cdc6
  • Cdk2
  • Cdkn2
  • Fzr1
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • LOC100366017
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mecl1
  • Mss1
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Ring12
  • Rps27a
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Ube2c
  • Ube2d1
  • Ube2e1
  • Ube2s
Rattus norvegicus (Norway rat)
CLEC7A (Dectin-1) induces NFAT activation
  • CaMIII
  • Calm3
  • Calna
  • Cam3
  • Camc
  • Cna2
  • Cnb
  • Nfat4
  • Nfatc1
  • Nfatc2
  • Nfatc3
  • Ppp3ca
  • Ppp3cb
  • Ppp3r1
  • RGD1560225
Rattus norvegicus (Norway rat)
CLEC7A (Dectin-1) signaling
  • Bcl10
  • Card9
  • Chuk
  • Clec7a
  • Ikbkb
  • Ikbkg
  • Ikkb
  • Malt1
  • Map3k7
  • Map3k7ip2
  • Nemo
  • Pkcd
  • Plcg2
  • Prkcd
  • Src
  • Tab1
  • Tab2
  • Tab3
  • Traf6
Rattus norvegicus (Norway rat)
COPI-dependent Golgi-to-ER retrograde traffic
  • Arcn1
  • Arf1
  • Arf1gap
  • Arf3
  • Arf4
  • Arf5
  • Arfgap1
  • Arfgap2
  • Arfgap3
  • Bnip1
  • Cenpe
  • Copa
  • Copb
  • Copb1
  • Copb2
  • Copd
  • Cope
  • Copg
  • Copg1
  • Copg2
  • Copz1
  • Copz2
  • Erg1
  • Gbf1
  • Kdelr1
  • Kdelr2
  • Kdelr3
  • Khc
  • Kif11
  • Kif12
  • Kif13b
  • Kif15
  • Kif16b
  • Kif18a
  • Kif18b
  • Kif19
  • Kif19a
  • Kif1a
  • Kif1b
  • Kif1c
  • Kif1d
  • Kif2
  • Kif20b
  • Kif21a
  • Kif21b
  • Kif22
  • Kif23
  • Kif26a
  • Kif26b
  • Kif27
  • Kif28p
  • Kif2a
  • Kif2b
  • Kif2c
  • Kif3a
  • Kif3b
  • Kif3c
  • Kif4a
  • Kif4b
  • Kif5a
  • Kif5b
  • Kif6
  • Kif9
  • Kifap3
  • Kifc1
  • Kifc2
  • Klc
  • Klc1
  • Klc2
  • Klc3
  • Klc4
  • Klp2
  • Klp6
  • Kns2
  • Knsl8
  • Krp1
  • Krp2
  • Napa
  • Napb
  • Napg
  • Nbas
  • Nsf
  • Rab1
  • Rab1A
  • Rab1b
  • Racgap1
  • Rint1
  • Rnp24
  • Sec20l
  • Sec22b
  • Sec22l1
  • Snap
  • Snapa
  • Snapb
  • Stx18
  • Tmed10
  • Tmed2
  • Tmed3
  • Tmed7
  • Tmed9
  • Tmp21
  • Use1
  • Zfp289
  • Znf289
  • Zw10
Rattus norvegicus (Norway rat)
COPI-independent Golgi-to-ER retrograde traffic
  • AABR07000222.1
  • Actr10
  • Actr1a
  • Agpat3
  • Bicd1
  • Bicd2
  • Capza1
  • Capza2
  • Capza3
  • Capzb
  • Cpla2
  • Ctrn1
  • Dctn1
  • Dctn2
  • Dctn3l1
  • Dctn4
  • Dctn5
  • Dctn6
  • Dhc1
  • Dlc2
  • Dnch1
  • Dnchc1
  • Dnci1
  • Dnci2
  • Dncic1
  • Dncic2
  • Dncl1
  • Dnclc1
  • Dncli1
  • Dncli2
  • Dnec1
  • Dyhc
  • Dync1h1
  • Dync1i1
  • Dync1i2
  • Dync1li1
  • Dync1li2
  • Dynll1
  • Dynll2
  • Galnt1
  • Galnt2
  • Lis-1
  • Lis1
  • Map1c
  • Pafah1b1
  • Pafah1b2
  • Pafah1b3
  • Pafaha
  • Pafahb
  • Pafahg
  • Pin
  • Pla2g4
  • Pla2g4a
  • Pla2g6
  • Pnpla9
  • Rab18
  • Rab3gap
  • Rab3gap1
  • Rab3gap2
  • Rab6
  • Rab6a
  • Rab6b
Rattus norvegicus (Norway rat)
COPI-mediated anterograde transport
  • AABR07000222.1
  • Actr10
  • Actr1a
  • Ank1
  • Arcn1
  • Arf1
  • Arf1gap
  • Arf3
  • Arf4
  • Arf5
  • Arfgap1
  • Arfgap2
  • Arfgap3
  • Bet1
  • Bet1l
  • Capza1
  • Capza2
  • Capza3
  • Capzb
  • Cd55
  • Cd59
  • Cog1
  • Cog2
  • Cog3
  • Cog4
  • Cog5
  • Cog6
  • Cog7
  • Copa
  • Copb
  • Copb1
  • Copb2
  • Copd
  • Cope
  • Copg
  • Copg1
  • Copg2
  • Copz1
  • Copz2
  • Ctrn1
  • Dctn1
  • Dctn2
  • Dctn3l1
  • Dctn4
  • Dctn5
  • Dctn6
  • Dhc1
  • Dlc2
  • Dnch1
  • Dnchc1
  • Dnci1
  • Dnci2
  • Dncic1
  • Dncic2
  • Dncl1
  • Dnclc1
  • Dncli1
  • Dncli2
  • Dnec1
  • Dyhc
  • Dync1h1
  • Dync1i1
  • Dync1i2
  • Dync1li1
  • Dync1li2
  • Dynll1
  • Dynll2
  • Erg1
  • Folr1
  • Gbf1
  • Golga2
  • Golgb1
  • Gorasp1
  • Gosr1
  • Gosr2
  • Grasp65
  • Gs15
  • Gs27
  • Gs28
  • Ins-1
  • Ins1
  • Kdelr1
  • Kdelr2
  • Kdelr3
  • Map1c
  • Napa
  • Napb
  • Napg
  • Nsf
  • Pin
  • Rab1
  • Rab1A
  • Rab1b
  • Rnp24
  • Snap
  • Snapa
  • Snapb
  • Spna2
  • Spnb3
  • Spta1
  • Spta2
  • Sptan1
  • Sptb
  • Sptbn1
  • Sptbn2
  • Sptbn4
  • Sptbn5
  • Stx5
  • Stx5a
  • Tmed10
  • Tmed2
  • Tmed3
  • Tmed7
  • Tmed9
  • Tmem115
  • Tmp21
  • Uso1
  • Vdp
  • Ykt6
  • Zfp289
  • Znf289
Rattus norvegicus (Norway rat)
COPII-mediated vesicle transport
  • AABR07042915.1
  • Ankrd28
  • Areg
  • Bet1
  • Cd59
  • Cnih1
  • Cnih2
  • Cnih3
  • Col7a1
  • Csnk1d
  • Ctsc
  • Ctsy
  • Ctsz
  • Erg1
  • Ergic53
  • Ergl
  • F8
  • Folr1
  • GluA1
  • Glur1
  • Golga2
  • Gorasp1
  • Gosr2
  • Grasp65
  • Gria1
  • Gs27
  • Hckid
  • LOC100909916
  • Lman1
  • Lman1l
  • Lman2
  • Lztr2
  • Mcfd2
  • Napa
  • Napb
  • Napg
  • Nsf
  • Ppp6c
  • Ppp6r3
  • Ppp6r3-ps1
  • Ppv
  • Preb
  • RGD1564492
  • Ra410
  • Rab1
  • Rab1A
  • Rab1b
  • Rgpr
  • Rnp24
  • Saps3-ps1
  • Sar1b
  • Sbdn
  • Scfd1
  • Sdgf
  • Sdnsf
  • Sec12
  • Sec13
  • Sec13l1
  • Sec16a
  • Sec16b
  • Sec22a
  • Sec22b
  • Sec22c
  • Sec22l1
  • Sec22l2
  • Sec23a
  • Sec23ip
  • Sec24a
  • Sec24b
  • Sec24c
  • Sec24d
  • Sec31a
  • Sec31l1
  • Serpina1
  • Sly1
  • Snap
  • Snapa
  • Snapb
  • Stx17
  • Stx5
  • Stx5a
  • Stxbp1l2
  • Tfg
  • Tgfa
  • Tmed10
  • Tmed2
  • Tmp21
  • Trappc1
  • Trappc10
  • Trappc2
  • Trappc2l
  • Trappc2ll1
  • Trappc3
  • Trappc4
  • Trappc5
  • Trappc6a
  • Trappc6b
  • Trappc9
  • Uso1
  • Vap1
  • Vdp
  • Ykt6
Rattus norvegicus (Norway rat)
COX reactions
  • Cox-1
  • Cox1
  • Ptgs1
Rattus norvegicus (Norway rat)
CREB phosphorylation
  • Atf1
  • Creb-1
  • Creb1
  • Mapkapk1a
  • Mapkapk2
  • Rps6ka1
  • Rps6ka2
  • Rps6ka3
  • Rps6ka5
  • Rsk1
Rattus norvegicus (Norway rat)
CREB1 phosphorylation through NMDA receptor-mediated activation of RAS signaling
  • Creb-1
  • Creb1
  • Mapkapk1a
  • Rps6ka1
  • Rps6ka2
  • Rps6ka3
  • Rps6ka6
  • Rsk1
Rattus norvegicus (Norway rat)
CREB1 phosphorylation through the activation of Adenylate Cyclase
  • Pkacb
  • Prkaca
  • Prkacb
  • Prkar1a
  • Prkar1b
  • Prkar2a
  • Prkar2b
Rattus norvegicus (Norway rat)
CREB1 phosphorylation through the activation of CaMKII/CaMKK/CaMKIV cascasde
  • CaMIII
  • Calm3
  • Cam3
  • Camc
  • Camk4
  • Camkk1
  • Camkk2
Rattus norvegicus (Norway rat)
CREB3 factors activate genes
  • Creb3
  • Creb3l3
  • Crebrf
  • Mbtps1
  • S1p
  • Ski1
Rattus norvegicus (Norway rat)

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Last updated: August 19, 2024