GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 526 - 548 of 548 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Acyl chain remodelling of PS
  • CPLA2
  • LOC613966
  • LPCAT3
  • LPCAT4
  • MBOAT1
  • OSBPL10
  • OSBPL5
  • OSBPL8
  • PLA2G12A
  • PLA2G16
  • PLA2G1B
  • PLA2G2A
  • PLA2G2D1
  • PLA2G2E
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
  • PLA2G4D
  • PLA2G4E
  • PLA2G4F
  • PLA2R1
Bos taurus (domestic cattle)
Transport of vitamins, nucleosides, and related molecules
  • PDZD11
  • SLC33A1
  • SLC5A6
Bos taurus (domestic cattle)
G alpha (i) signalling events
  • ACKR3
  • ADORA1
  • ADORA3
  • ADRA2A
  • ADRA2B
  • ADRA2C
  • AGT
  • AGTR2
  • APLN
  • APLNR
  • BCP
  • BDKRB2
  • C3
  • C3AR1
  • C5
  • C5AR1
  • CASR
  • CCL1
  • CCL19
  • CCL20
  • CCL21
  • CCL25
  • CCL27
  • CCL28
  • CCL4
  • CCL5
  • CCR1
  • CCR10
  • CCR3
  • CCR4
  • CCR5
  • CCR6
  • CCR8
  • CCR9
  • CHRM2
  • CMKBR5
  • CNR1
  • CNR2
  • CORT
  • CX3CR1
  • CXCL10
  • CXCL11
  • CXCL12
  • CXCL13
  • CXCL16
  • CXCL3
  • CXCL6
  • CXCL8
  • CXCL9
  • CXCR1
  • CXCR2
  • CXCR3
  • CXCR4
  • CXCR5
  • CXCR6
  • CXCR7
  • DRD3
  • GABBR1
  • GABBR2
  • GAL
  • GALN
  • GALR1
  • GALR2
  • GALR3
  • GCP2
  • GNAI1
  • GNAI2
  • GNAI3
  • GNAT1
  • GNAT2
  • GNAT3
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNGT1
  • GNGT12
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GPR17
  • GPR18
  • GPR183
  • GPR31
  • GPR37
  • GPR37L1
  • GPR8
  • GPR92
  • GPRC2A
  • GPSM1
  • GPSM2
  • GRM2
  • GRM3
  • GRM4
  • GRM6
  • GRM7
  • GRM8
  • HRH4
  • HTR1B
  • HTR1D
  • HTR1E
  • HTR1F
  • HTR5A
  • IL8
  • KNG1
  • LOC782957
  • LPAR1
  • LPAR2
  • LPAR3
  • LPAR5
  • MCHR1
  • MCHR2
  • MIP3A
  • MTNR1A
  • MTNR1B
  • NMS
  • NMUR1
  • NMUR2
  • NPB
  • NPBWR1
  • NPBWR2
  • NPY
  • NPY1R
  • NPY2R
  • NPY4R
  • NPY5R
  • OPN1LW
  • OPN1SW
  • OPN5
  • OPRD1
  • OPRK1
  • OPRL1
  • OPRM1
  • OXER1
  • OXGR1
  • P2RY12
  • P2RY14
  • P2RY4
  • PBX2
  • PCAR1
  • PCP2
  • PDYN
  • PENK
  • PMCH
  • PNOC
  • POMC
  • PPBP
  • PPY
  • PPYR1
  • PSAP
  • PTGDR2
  • PTGER3
  • PYY
  • RCP
  • RGR
  • RGS1
  • RGS11
  • RGS13
  • RGS14
  • RGS16
  • RGS17
  • RGS18
  • RGS19
  • RGS20
  • RGS21
  • RGS3
  • RGS4
  • RGS5
  • RGS6
  • RGS7
  • RGS8
  • RGS9
  • RHO
  • RRH
  • S1PR2
  • S1PR3
  • S1PR5
  • SCY4A
  • SCYA20
  • SCYA5
  • SCYB6
  • SERPINA8
  • SRC
  • SST
  • SSTR1
  • SSTR2
  • SSTR5
  • SUCNR1
  • T2R10C
  • T2R65A
  • TAS1R1
  • TAS1R2
  • TAS1R3
  • TAS2R1
  • TAS2R16
  • TAS2R3
  • TAS2R39
  • TAS2R4
  • TAS2R40
  • TAS2R42
  • TAS2R46
  • TAS2R60
  • TAS2R7
  • TAS2R8
  • gpr81
Bos taurus (domestic cattle)
Heme degradation
  • ABCC1
  • ABCC2
  • ABCG2
  • ALB
  • BLVRA
  • BLVRB
  • FABP1
  • GSTA1
  • GSTA2
  • GSTA5
  • HMOX1
  • HMOX2
  • MRP1
  • SCAN
  • SLCO1B3
  • SLCO2B1
  • UGT1A1
Bos taurus (domestic cattle)
The NLRP3 inflammasome
  • HSP90AB1
  • HSPC3
  • HSPCB
  • NLRP3
  • P2RX7
  • PANX
  • PANX1
  • PSTPIP1
  • PYCARD
  • SUGT1
  • TXN
  • TXNIP
Bos taurus (domestic cattle)
Basigin interactions
  • ATP1B1
  • ATP1B2
  • ATP1B3
  • BSG
  • CAV1
  • ITGA3
  • ITGA6
  • ITGB1
  • LOC112441463
  • MAG
  • PPIA
  • PPIL2
  • SLC16A1
  • SLC16A3
  • SLC16A8
  • SLC3A2
  • SLC7A10
  • SLC7A11
  • SLC7A5
  • SLC7A6
  • SLC7A7
  • SLC7A8
  • SLC7A9
  • SPN
Bos taurus (domestic cattle)
PD-1 signaling
  • BLA-DQB
  • BOLA-DQA1
  • BOLA-DQA2
  • BOLA-DQA5
  • BOLA-DRA
  • BOLA-DRB2
  • BOLA-DRB3
  • BOLA-DYA
  • BoLA-DIB
  • BoLA-DRA
  • BoLA-DYB
  • CD247
  • CD274
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • CSK
  • DYB
  • HLA-DRA
  • LCK
  • LOC100848815
  • PD-L1
  • PDCD1LG2
  • PTPN11
  • PTPN6
  • TRAV29-1
Bos taurus (domestic cattle)
O-linked glycosylation of mucins
  • B3GNT2
  • B3GNT4
  • B3GNT5
  • B3GNT6
  • B3GNT8
  • B3GNT9
  • B3GNTL1
  • B4GALT5
  • B4GALT6
  • C1GALT1
  • C1GALT1C1
  • CHST4
  • GALNT1
  • GALNT10
  • GALNT11
  • GALNT12
  • GALNT13
  • GALNT14
  • GALNT15
  • GALNT16
  • GALNT17
  • GALNT18
  • GALNT2
  • GALNT3
  • GALNT5
  • GALNT6
  • GALNT7
  • GALNT8
  • GALNTL1
  • GALNTL5
  • GCNT1
  • GCNT3
  • GCNT4
  • LOC789503
  • MUC1
  • MUC15
  • MUC2
  • MUC20
Bos taurus (domestic cattle)
Muscarinic acetylcholine receptors
  • CHRM1
  • CHRM2
  • CHRM3
  • CHRM5
Bos taurus (domestic cattle)
Androgen biosynthesis
  • CGA
  • CYP17
  • CYP17A1
  • HSD17B3
  • HSD3B
  • LHB
  • LOC789567
  • POMC
  • SRD5A1
  • SRD5A2
  • SRD5A3
Bos taurus (domestic cattle)
trans-Golgi Network Vesicle Budding
  • ARF1
  • GBF1
  • SNAP23
  • STX4
  • SYB2
  • VAMP2
  • VAMP8
Bos taurus (domestic cattle)
SHC-mediated cascade:FGFR2
  • AFGF
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF5B
  • FGF5C
  • FGF6
  • FGF6A
  • FGF7
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR2
  • Fgf4
  • GRB2
  • HBGF-1
  • KRAS
  • NRAS
  • SHC1
  • SOS1
Bos taurus (domestic cattle)
Neurexins and neuroligins
  • CASK
  • DLG3
  • DLG4
  • DLGAP1
  • DLGAP3
  • DLGAP4
  • E41P
  • EPB41
  • EPB41L1
  • EPB41L2
  • EPB41L3
  • EPB41L5
  • GRM1
  • GRM5
  • HOMER1
  • HOMER2
  • HOMER3
  • LOC100300059
  • LRRTM1
  • LRRTM2
  • LRRTM3
  • LRRTM4
  • NLGN1
  • NLGN2
  • NLGN3
  • NRXN3
  • SHANK1
  • SHANK3
  • SORBS2
Bos taurus (domestic cattle)
TFAP2 (AP-2) family regulates transcription of cell cycle factors
  • KDM5B
  • MYC
  • TFAP2C
Bos taurus (domestic cattle)
Negative regulation of FGFR1 signaling
  • AFGF
  • CBL
  • ERK2
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF17
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF5
  • FGF5C
  • FGF6
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR1
  • FRS2
  • Fgf4
  • GRB2
  • HBGF-1
  • KL
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PRKM1
  • PTPN11
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Bos taurus (domestic cattle)
Deactivation of the beta-catenin transactivating complex
  • AKT2
  • APC
  • CBY
  • CBY1
  • CHD8
  • CTBP1
  • CTNNB1
  • CTNNBIP1
  • HDAC1
  • LEF1
  • PGEA1
  • RPS27A
  • SOX13
  • SOX17
  • SOX3
  • SOX4
  • SOX6
  • SOX7
  • SOX9
  • TCF7
  • TCF7L1
  • TCF7L2
  • TLE1
  • TLE2
  • TLE3
  • TLE4
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • XIAP
  • XPO1
  • YWHAZ
Bos taurus (domestic cattle)
Sphingolipid de novo biosynthesis
  • ABCC1
  • ABCG2
  • ADMP
  • CERS1
  • CERS2
  • CERS3
  • CERS4
  • CERS5
  • CERS6
  • CERT
  • CERT1
  • COL4A3BP
  • CSNK1G2
  • CYB5B
  • DEGS1
  • DEGS2
  • DES1
  • FA2H
  • LASS1
  • LASS2
  • LASS3
  • LASS4
  • MFSD2B
  • MRP1
  • ORMDL1
  • ORMDL2
  • ORMDL3
  • OSBP
  • PPM1L
  • PRKD1
  • PRKD2
  • PRKD3
  • SAMD8
  • SGMS1
  • SGMS2
  • SPHK1
  • SPHK2
  • SPTLC1
  • SPTLC2
  • SPTSSA
  • SPTSSB
  • SSSPTA
  • SSSPTB
  • STARD11
  • VAPA
  • VAPB
Bos taurus (domestic cattle)
Fatty acyl-CoA biosynthesis
  • ACACA
  • ACLY
  • CBR4
  • FABGL
  • FASN
  • HKE6
  • MORC2
  • PPT1
  • PPT2
  • SCD
  • SCD5
  • SLC27A2
Bos taurus (domestic cattle)
Regulation of RUNX2 expression and activity
  • ADRM1
  • CUL1
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • RPS27A
  • RUNX2
  • SKP1
  • SKP1A
  • SKP2
  • STUB1
  • SUG1
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Bos taurus (domestic cattle)
HSP90 chaperone cycle for SHRs
  • ACTR10
  • ACTR1A
  • AR
  • ARP10
  • CAPZA1
  • CAPZA2
  • CAPZA3
  • DCTN1
  • DCTN2
  • DCTN3
  • DCTN4
  • DCTN5
  • DCTN6
  • DNAJA1
  • DNAJA2
  • DNAJA4
  • DNAJB1
  • DNCL1
  • DYNC1H1
  • DYNC1I1
  • DYNC1LI1
  • DYNC1LI2
  • DYNLL1
  • DYNLL2
  • FKBP4
  • FKBP5
  • HSC70
  • HSP70-1
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPA1A
  • HSPA1L
  • HSPA2
  • HSPA8
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • NR3C1
  • NR3C2
  • PGR
  • PTGES3
  • STIP1
Bos taurus (domestic cattle)
Norepinephrine Neurotransmitter Release Cycle
  • CPLX1
  • MAOA
  • OCT1
  • PPFIA1
  • PPFIA2
  • PPFIA3
  • PPFIA4
  • RAB3A
  • RIMS1
  • SLC18A2
  • SLC22A1
  • SLC22A2
  • SNAP25
  • STX1A
  • STXBP1
  • SYB2
  • SYT1
  • UNC13B
  • UNC18A
  • VAMP2
Bos taurus (domestic cattle)
Synthesis, secretion, and inactivation of Glucose-dependent Insulinotropic Polypeptide (GIP)
  • CD26
  • DPP4
  • GIP
  • GPR119
Bos taurus (domestic cattle)
Condensation of Prometaphase Chromosomes
  • CK2A1
  • CK2N
  • CSNK2A1
  • CSNK2A2
  • CSNK2B
  • NCAPD2
  • NCAPG
  • NCAPH
  • SMC2
  • SMC4
Bos taurus (domestic cattle)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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GlyCosmos Portal v4.2.1

Last updated: April 7, 2025