GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 476 - 499 of 499 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▼ Organism GlyTouCan ID
Norepinephrine Neurotransmitter Release Cycle
  • B0252.3
  • B0361.11
  • C06H5.6
  • C44C10.3
  • C46C2.2
  • CELE_F23F12.13
  • CELE_F45E10.2
  • CELE_K05F1.6
  • CELE_K09E9.1
  • CELE_K11D9.3
  • CELE_T08B1.1
  • CELE_T12B3.2
  • CELE_T22F7.1
  • CELE_Y57G11C.23
  • CELE_Y82E9BR.16
  • CELE_ZK892.3
  • F23F12.3/F23F12.1
  • aex-4
  • cat-1
  • cpx-1
  • lan-2
  • oct-1
  • oct-2
  • pes-23
  • rab-3
  • ric-4
  • rimb-1
  • snb-1
  • snb-2
  • snb-5
  • snb-6
  • snb-7
  • snt-1
  • suex-2
  • syd-2
  • tag-168
  • tag-81
  • unc-10
  • unc-13
  • unc-18
  • unc-64
  • vamp-7
Caenorhabditis elegans
Neurotransmitter clearance
  • B0252.3
  • B0361.11
  • C06H5.6
  • C44C10.3
  • C46C2.2
  • CELE_F23F12.13
  • CELE_F45E10.2
  • CELE_K05F1.6
  • CELE_K09E9.1
  • CELE_K11D9.3
  • CELE_T08B1.1
  • CELE_T12B3.2
  • CELE_T22F7.1
  • CELE_Y57G11C.23
  • CELE_Y82E9BR.16
  • CELE_ZK892.3
  • F23F12.3/F23F12.1
  • ace-1
  • cest-1
  • cest-1.1
  • cest-1.2
  • cest-12
  • cest-13
  • cest-16
  • cest-17
  • cest-19
  • cest-2.1
  • cest-2.2
  • cest-2.3
  • cest-24
  • cest-26
  • ges-1
  • oct-1
  • oct-2
  • pes-23
  • suex-2
Caenorhabditis elegans
Carnitine metabolism
  • B0252.3
  • B0361.11
  • C06H5.6
  • C44C10.3
  • C46C2.2
  • CELE_F23F12.13
  • CELE_F45E10.2
  • CELE_K05F1.6
  • CELE_K09E9.1
  • CELE_K11D9.3
  • CELE_T08B1.1
  • CELE_T12B3.2
  • CELE_T22F7.1
  • CELE_W03F9.4
  • CELE_Y57G11C.23
  • CELE_Y82E9BR.16
  • CELE_ZK892.3
  • F23F12.3/F23F12.1
  • aak-2
  • aakb-1
  • aakb-2
  • aakg-1
  • aakg-2
  • aakg-3
  • aakg-4
  • aakg-5
  • cnr-14
  • cpt-1
  • cpt-2
  • cpt-3
  • cpt-4
  • cpt-5
  • cpt-6
  • dif-1
  • nhr-2
  • nhr-24
  • nhr-7
  • nhr-85
  • nhr-91
  • nr1g1
  • oct-1
  • oct-2
  • pes-23
  • sex-1
  • suex-2
  • unc-55
Caenorhabditis elegans
Ciprofloxacin ADME
  • B0252.3
  • B0361.11
  • C06H5.6
  • C44C10.3
  • C46C2.2
  • CELE_F21G4.1
  • CELE_F23F12.13
  • CELE_F45E10.2
  • CELE_K05F1.6
  • CELE_K09E9.1
  • CELE_K11D9.3
  • CELE_T08B1.1
  • CELE_T12B3.2
  • CELE_T22F7.1
  • CELE_Y57G11C.23
  • CELE_Y82E9BR.16
  • CELE_ZK892.3
  • F23F12.3/F23F12.1
  • abcx-1
  • oct-1
  • oct-2
  • pes-23
  • suex-2
  • wht-5
Caenorhabditis elegans
Aspirin ADME
  • B0252.3
  • B0361.11
  • C06H5.6
  • C44C10.3
  • C46C2.2
  • CELE_F21G4.1
  • CELE_F23F12.13
  • CELE_F43H9.4
  • CELE_F45E10.2
  • CELE_K05F1.6
  • CELE_K09E9.1
  • CELE_K11D9.3
  • CELE_T08B1.1
  • CELE_T10B10.4
  • CELE_T12B3.2
  • CELE_T22F7.1
  • CELE_Y57G11C.23
  • CELE_Y82E9BR.16
  • CELE_ZK892.3
  • F23F12.3/F23F12.1
  • ace-1
  • cest-1
  • cest-1.1
  • cest-1.2
  • cest-12
  • cest-13
  • cest-16
  • cest-17
  • cest-19
  • cest-2.1
  • cest-2.2
  • cest-2.3
  • cest-24
  • cest-26
  • cyp-23A1
  • cyp-23a1
  • cyp-33A1
  • cyp-33B1
  • cyp-33C1
  • cyp-33C11
  • cyp-33C12
  • cyp-33C2
  • cyp-33C3
  • cyp-33C4
  • cyp-33C5
  • cyp-33C6
  • cyp-33C7
  • cyp-33C8
  • cyp-33C9
  • cyp-33D1
  • cyp-33D3
  • cyp-33E1
  • cyp-33E2
  • cyp-33E3
  • cyp-33a1
  • cyp-33b1
  • cyp-33c1
  • cyp-33c11
  • cyp-33c12
  • cyp-33c2
  • cyp-33c3
  • cyp-33c4
  • cyp-33c5
  • cyp-33c6
  • cyp-33c7
  • cyp-33c8
  • cyp-33c9
  • cyp-33d1
  • cyp-33d3
  • cyp-33e1
  • cyp-33e2
  • cyp-33e3
  • cyp-34A1
  • cyp-34A10
  • cyp-34A2
  • cyp-34A5
  • cyp-34A6
  • cyp-34A7
  • cyp-34A8
  • cyp-34A9
  • cyp-34a1
  • cyp-34a10
  • cyp-34a2
  • cyp-34a4
  • cyp-34a5
  • cyp-34a6
  • cyp-34a7
  • cyp-34a8
  • cyp-34a9
  • cyp-35A1
  • cyp-35A2
  • cyp-35A3
  • cyp-35A4
  • cyp-35A5
  • cyp-35B1
  • cyp-35B2
  • cyp-35B3
  • cyp-35C1
  • cyp-35a1
  • cyp-35a2
  • cyp-35a3
  • cyp-35a4
  • cyp-35a5
  • cyp-35b1
  • cyp-35b2
  • cyp-35b3
  • cyp-35c1
  • cyp-35d1
  • cyp-36A1
  • cyp36a1
  • dach-1
  • daf-9
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  • mct-1
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  • mct-3
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  • mct-5
  • mct-6
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  • mrp-2
  • mrp-3
  • mrp-4
  • mrp-7
  • mrp-8
  • oct-1
  • oct-2
  • pes-23
  • rig-6
  • slcf-1
  • suex-2
Caenorhabditis elegans
Organic cation transport
  • B0252.3
  • B0361.11
  • C06H5.6
  • C44C10.3
  • C46C2.2
  • C53B4.3
  • CELE_F23F12.13
  • CELE_F45E10.2
  • CELE_K05F1.6
  • CELE_K09E9.1
  • CELE_K11D9.3
  • CELE_T08B1.1
  • CELE_T12B3.2
  • CELE_T22F7.1
  • CELE_Y57G11C.23
  • CELE_Y82E9BR.16
  • CELE_ZK892.3
  • F23F12.3/F23F12.1
  • mab-2
  • oct-1
  • oct-2
  • pes-23
  • rnt-1
  • run-1
  • suex-2
Caenorhabditis elegans
Non-integrin membrane-ECM interactions
  • B0252.1
  • R09H10.3
  • ZK697.8
  • let-756
  • pvf-1
  • rig-5
  • ttn-1
Caenorhabditis elegans
Regulation of TP53 Activity through Acetylation
  • B0025.4
  • akt-1
  • akt-2
  • chd-3
  • dcp-66
  • evl-11
  • hda-1
  • hda-3
  • let-418
  • lin-40
  • lin-49
  • lin-53
  • lsy-13
  • mys-4
  • nhl-2
  • nhl-3
  • rba-1
  • rba-2
  • tam-1
Caenorhabditis elegans
Glycosphingolipid biosynthesis
  • B0024.15
  • B0205.4
  • cerk-1
  • cgt-2
  • ugt-60
Caenorhabditis elegans
Lewis blood group biosynthesis
  • B0024.15
  • B0205.4
  • BE10.3
  • C05E4.15
  • C27D9.1
  • CEFT-4
  • CELE_F10E7.1
  • CELE_F53A2.11
  • CELE_F53C3.11
  • CELE_T05A7.11
  • CELE_T05A7.13
  • CELE_Y47D3A.1
  • fut-3
  • pha-1
  • pha1
Caenorhabditis elegans
Antigen Presentation: Folding, assembly and peptide loading of class I MHC
  • AC3.5
  • CELE_F49B2.6
  • CELE_R03G8.6
  • CELE_T12E12.6
  • CELE_Y42A5A.1
  • CELE_Y53F4B.20
  • CELE_Y67D8C.9
  • T16G12.1
  • anp-1
  • haf-2
  • haf-4
  • haf-7
  • haf-8
  • haf-9
  • pam-1
  • sar-1
  • sec-23
  • sec-24.1
  • sec-24.2
Caenorhabditis elegans
Metabolism of Angiotensinogen to Angiotensins
  • AC3.5
  • C28G1.2
  • CELE_F02D8.4
  • CELE_F15D3.4
  • CELE_F41C6.4
  • CELE_F44G3.7
  • CELE_F49B2.6
  • CELE_R03G8.6
  • CELE_T06A4.1
  • CELE_T06A4.3
  • CELE_T12E12.6
  • CELE_W01A8.6
  • CELE_Y18H1A.9
  • CELE_Y42A5A.1
  • CELE_Y53F4B.20
  • CELE_Y59C2A.1
  • CELE_Y67D8C.9
  • CELE_ZC434.9
  • T16G12.1
  • acn-1
  • anp-1
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  • asp-12
  • asp-13
  • asp-14
  • asp-15
  • asp-16
  • asp-17
  • asp-18
  • asp-19
  • asp-2
  • asp-3
  • asp-4
  • asp-5
  • asp-6
  • asp-7
  • asp-8
  • asp-9
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  • cest-16
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  • cest-2.2
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  • cest-24
  • cest-26
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  • nep-25
  • nep-26
  • nep-3
  • nep-4
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  • nep-9
  • pam-1
  • srp-1
  • srp-2
  • srp-3
  • srp-6
  • srp-7
  • srp-8
  • suro-1
  • vha-20
Caenorhabditis elegans
Apoptotic execution phase
  • 4D656
  • drp-1
Caenorhabditis elegans
TP53 Regulates Transcription of DNA Repair Genes
  • 3L686
  • T24H10.1
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  • cdk-12
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  • gtf-2h3
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  • rpb-8
  • rpb-9
  • spt-16
  • spt-4
  • spt-5
  • tceb-3
  • xpb-1
  • xpd-1
Caenorhabditis elegans
RNA Polymerase II Transcription Elongation
  • 3L686
  • CELE_F02E9.10
  • F13B12.1
  • T24H10.1
  • ama-1
  • ccnk-1
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  • cdk-7
  • cdk-9
  • cit-1.1
  • cit-1.2
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  • gtf-2h1
  • gtf-2h3
  • hmg-4
  • leo-1
  • mnat-1
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  • rpb-1
  • rpb-10
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  • rpb-4
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  • rpb-6
  • rpb-7
  • rpb-8
  • rpb-9
  • spt-16
  • spt-4
  • spt-5
  • tceb-3
  • tpr-3
  • xpb-1
  • xpd-1
Caenorhabditis elegans
Formation of RNA Pol II elongation complex
  • 3L686
  • CELE_F02E9.10
  • F13B12.1
  • T24H10.1
  • ama-1
  • ccnk-1
  • cdc-73
  • cdk-7
  • cdk-9
  • cit-1.1
  • cit-1.2
  • ctr-9
  • eaf-1
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  • elc-1
  • ell-1
  • emb-5
  • fcp-1
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  • gtf-2H3
  • gtf-2H4
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  • gtf-2f2
  • gtf-2h1
  • gtf-2h3
  • hmg-4
  • leo-1
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  • pafo-1
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  • rpb-11
  • rpb-12
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  • rpb-3
  • rpb-4
  • rpb-5
  • rpb-6
  • rpb-7
  • rpb-8
  • rpb-9
  • spt-16
  • spt-4
  • spt-5
  • tceb-3
  • tpr-3
  • xpb-1
  • xpd-1
Caenorhabditis elegans
RNA Polymerase II Pre-transcription Events
  • 3L686
  • CELE_F02E9.10
  • F13B12.1
  • T24H10.1
  • TFIIE-alpha
  • TFIIE-beta
  • ama-1
  • cbp-20
  • cbp-80
  • ccnk-1
  • cdc-73
  • cdk-7
  • cdk-9
  • cit-1.1
  • cit-1.2
  • ctr-9
  • eaf-1
  • elb-1
  • elc-1
  • ell-1
  • emb-5
  • fcp-1
  • fust-1
  • gtf-2A2
  • gtf-2E1
  • gtf-2E2
  • gtf-2F1
  • gtf-2F2
  • gtf-2H1
  • gtf-2H2C
  • gtf-2H3
  • gtf-2H4
  • gtf-2H5
  • gtf-2e1
  • gtf-2e2
  • gtf-2f1
  • gtf-2f2
  • gtf-2h1
  • gtf-2h3
  • hmg-4
  • leo-1
  • mnat-1
  • ncbp-1
  • ncbp-2
  • pafo-1
  • pqn-51
  • rpb-1
  • rpb-10
  • rpb-11
  • rpb-12
  • rpb-2
  • rpb-3
  • rpb-4
  • rpb-5
  • rpb-6
  • rpb-7
  • rpb-8
  • rpb-9
  • spt-16
  • spt-4
  • spt-5
  • taf-1
  • taf-10
  • taf-11
  • taf-11.3
  • taf-12
  • taf-13
  • taf-2
  • taf-3
  • taf-4
  • taf-5
  • taf-6.1
  • taf-7.1
  • taf-7.2
  • taf-9
  • tbp
  • tbp-1
  • tceb-3
  • tpr-3
  • ttb-1
  • xpb-1
  • xpd-1
Caenorhabditis elegans
Oxygen-dependent proline hydroxylation of Hypoxia-inducible Factor Alpha
  • 3L686
  • C14C10.5
  • CELE_F35G12.12
  • ccd-3
  • cul-2
  • div-3
  • egl-9
  • elb-1
  • elc-1
  • hif-1
  • let-70
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  • pas-2
  • pas-3
  • pas-4
  • pas-5
  • pas-6
  • pbs-1
  • pbs-2
  • pbs-3
  • pbs-4
  • pbs-5
  • pbs-7
  • psmd-9
  • psme-3
  • rbx-1
  • rpn-1
  • rpn-10
  • rpn-11
  • rpn-12
  • rpn-2
  • rpn-3
  • rpn-5
  • rpn-6.1
  • rpn-7
  • rpn-8
  • rpn-9
  • rpt-1
  • rpt-2
  • rpt-3
  • rpt-4
  • rpt-5
  • rpt-6
  • ubc-2
  • ubia
  • ubib
  • ubl-1
  • ubq-1
  • ubq-2
  • vhl-1
Caenorhabditis elegans
Neddylation
  • 3L686
  • C10E2.2
  • C14B1.3
  • C14C10.5
  • CELE_F32B4.5
  • CELE_F35G12.12
  • CELE_F39B2.5
  • CELE_M60.7
  • CELE_R08E3.3
  • CELE_R11D1.1
  • CELE_R31.2
  • CELE_T28D6.4
  • CELE_T28F2.2
  • CELE_VM106R.1
  • CELE_ZK792.4
  • F47D12.9
  • T23G5.3
  • adpr-1
  • cand-1
  • ccd-3
  • cdc-48.2
  • cdt-2
  • cfl-1
  • che-1
  • csa-1
  • csn-1
  • csn-2
  • csn-3
  • csn-4
  • csn-5
  • csn-6
  • cul-1
  • cul-2
  • cul-3
  • cul-4
  • cul-5
  • dcaf-13
  • dcn-1
  • ddb-1
  • div-3
  • dre-1
  • elb-1
  • elc-1
  • fbxl-1
  • fem-1
  • hif-1
  • ikb-1
  • isx-1
  • kel-1
  • kel-20
  • let-70
  • lin-19
  • lin-53
  • lsy-15
  • mask-1
  • mec-15
  • mfb-1
  • mtpn-1
  • ned-8
  • npl-4.2
  • par-2
  • pas-1
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Caenorhabditis elegans
Downregulation of TGF-beta receptor signaling
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Caenorhabditis elegans
Regulation of RUNX2 expression and activity
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Caenorhabditis elegans
Downregulation of ERBB2 signaling
  • 1G758
  • CELE_F14B4.1
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  • ubq-2
Caenorhabditis elegans
Regulation of PTEN stability and activity
  • 1G758
  • C14C10.5
  • CELE_F35G12.12
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  • ubia
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Caenorhabditis elegans
Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation
  • 1G758
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Caenorhabditis elegans

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Last updated: August 19, 2024