GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 476 - 499 of 499 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID ▼ Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
RAC2 GTPase cycle
  • C05D9.3
  • CELE_F22G12.5
  • CELE_T04C9.1
  • CELE_Y57G11C.1147
  • CELE_Y67A10A.7
  • CELE_Y71H2AM.12
  • PLD
  • aap-1
  • abi-1
  • age-1
  • cav-1
  • cav-2
  • cdc-42
  • cdh-4
  • ced-10
  • ced-5
  • cgef-1
  • cyk-1
  • cyk-4
  • gcp-2.1
  • gcp-2.2
  • gex-2
  • gex-3
  • git-1
  • gop-3
  • kin-18
  • let-99
  • magu-1
  • max-2
  • mtx-1
  • pak-1
  • pak-2
  • pes-7
  • pld-1
  • rab-7
  • rac-1
  • rac-2
  • rga-1
  • rga-5
  • rga-8
  • rhi-1
  • snb-1
  • sulu
  • syd-1
  • tiam-1
  • toe-2
  • unc-73
  • vab-1
  • vang-1
  • vav-1
  • wve-1
Caenorhabditis elegans
RAC3 GTPase cycle
  • C05D9.3
  • CELE_F22G12.5
  • CELE_F23H11.4
  • CELE_T04C9.1
  • CELE_Y34B4A.4
  • CELE_Y57G11C.1147
  • aap-1
  • abi-1
  • abl-1
  • aex-4
  • cav-1
  • cav-2
  • cdc-42
  • cdh-4
  • ced-10
  • cgef-1
  • cyk-1
  • cyk-4
  • gap
  • gcp-2.1
  • gcp-2.2
  • gex-2
  • gex-3
  • git-1
  • glt-1
  • glt-3
  • glt-4
  • glt-5
  • glt-6
  • glt-7
  • kin-18
  • let-99
  • magu-1
  • max-2
  • ocrl-1
  • pac-1
  • pak-1
  • pak-2
  • rab-7
  • rac-1
  • rga-1
  • rga-5
  • rga-6
  • rga-8
  • rhi-1
  • ric-4
  • snb-1
  • srgp-1
  • sulu
  • syd-1
  • tag-325
  • tag-81
  • tiam-1
  • toe-2
  • unc-112
  • unc-73
  • vab-1
  • vang-1
  • vav-1
  • wve-1
Caenorhabditis elegans
Neddylation
  • 3L686
  • C10E2.2
  • C14B1.3
  • C14C10.5
  • CELE_F32B4.5
  • CELE_F35G12.12
  • CELE_F39B2.5
  • CELE_M60.7
  • CELE_R08E3.3
  • CELE_R11D1.1
  • CELE_R31.2
  • CELE_T28D6.4
  • CELE_T28F2.2
  • CELE_VM106R.1
  • CELE_ZK792.4
  • F47D12.9
  • T23G5.3
  • adpr-1
  • cand-1
  • ccd-3
  • cdc-48.2
  • cdt-2
  • cfl-1
  • che-1
  • csa-1
  • csn-1
  • csn-2
  • csn-3
  • csn-4
  • csn-5
  • csn-6
  • cul-1
  • cul-2
  • cul-3
  • cul-4
  • cul-5
  • dcaf-13
  • dcn-1
  • ddb-1
  • div-3
  • dre-1
  • elb-1
  • elc-1
  • fbxl-1
  • fem-1
  • hif-1
  • ikb-1
  • isx-1
  • kel-1
  • kel-20
  • let-70
  • lin-19
  • lin-53
  • lsy-15
  • mask-1
  • mec-15
  • mfb-1
  • mtpn-1
  • ned-8
  • npl-4.2
  • par-2
  • pas-1
  • pas-2
  • pas-3
  • pas-4
  • pas-5
  • pas-6
  • pbs-1
  • pbs-2
  • pbs-3
  • pbs-4
  • pbs-5
  • pbs-7
  • psmd-9
  • psme-3
  • rba-2
  • rbbp-5
  • rbx-1
  • rbx-2
  • rfl-1
  • rpn-1
  • rpn-10
  • rpn-11
  • rpn-12
  • rpn-2
  • rpn-3
  • rpn-5
  • rpn-6.1
  • rpn-7
  • rpn-8
  • rpn-9
  • rpt-1
  • rpt-2
  • rpt-3
  • rpt-4
  • rpt-5
  • rpt-6
  • skn-1
  • sknr-1
  • skpt-1
  • skr-1
  • spsb-1
  • spsb-2
  • swah-1
  • swan-2
  • swd-3.1
  • swd-3.2
  • tag-125
  • tag-30
  • trp-4
  • tub-2
  • uba-3
  • ubc-2
  • ubh-3
  • ubia
  • ubib
  • ubl-1
  • ubq-1
  • ubq-2
  • ufd-1
  • ula-1
  • ulp-3
  • unc-44
  • vhl-1
  • wdr-23
  • wdr-5.1
  • wdr-5.2
  • zfp-2
Caenorhabditis elegans
TGF-beta receptor signaling in EMT (epithelial to mesenchymal transition)
  • CELE_Y105E8A.25
  • aPKC
  • cet-1
  • daf-1
  • daf-4
  • daf-7
  • dbl-1
  • par-3
  • par-6
  • pkc-3
  • rho-1
  • rhoa
  • ubia
  • ubib
  • ubl-1
  • ubq-1
  • ubq-2
  • unc-129
Caenorhabditis elegans
RHOB GTPase cycle
  • C07B5.4
  • CELE_T04C9.1
  • CELE_Y105E8A.25
  • aap-1
  • aex-4
  • ani-2
  • bar-1
  • cav-1
  • cav-2
  • cdh-10
  • cgef-1
  • cyk-1
  • cyk-4
  • daam-1
  • ect-2
  • ephx-1
  • gck-4
  • gcp-2.1
  • gcp-2.2
  • gei-1
  • hmp-2
  • hum-7
  • inft-2
  • let-502
  • let-99
  • osg-1
  • pes-7
  • pkn-1
  • pvl-1
  • rga-1
  • rga-5
  • rhgf-1
  • rhi-1
  • rho-1
  • rhoa
  • ric-4
  • snb-1
  • spy-1
  • sto-2
  • tag-81
  • toe-2
  • unc-73
  • vang-1
  • vav-1
  • wrm-1
  • zoo-1
Caenorhabditis elegans
RHOA GTPase cycle
  • C07B5.4
  • CELE_F23H11.4
  • CELE_H40L08.1
  • CELE_T04C9.1
  • CELE_Y105E8A.25
  • PLD
  • aap-1
  • aex-4
  • ani-2
  • bar-1
  • cav-1
  • cav-2
  • cdh-10
  • ced-5
  • cgef-1
  • cri-3
  • cyk-1
  • cyk-4
  • daam-1
  • ect-2
  • ephx-1
  • fozi-1
  • frm-3
  • gck-4
  • gcp-2.1
  • gcp-2.2
  • gei-1
  • hmp-2
  • hum-7
  • inft-2
  • let-502
  • let-99
  • maa-1
  • osg-1
  • pes-7
  • pix-1
  • pkn-1
  • pld-1
  • pmp-2
  • pvl-1
  • rga-1
  • rga-2
  • rga-4
  • rga-5
  • rga-6
  • rga-8
  • rga-9
  • rhgf-1
  • rhgf-2
  • rhi-1
  • rho-1
  • rhoa
  • ric-4
  • sly-1
  • snb-1
  • spv-1
  • spy-1
  • srgp-1
  • sto-2
  • tag-325
  • tag-81
  • tiam-1
  • toe-2
  • uig-1
  • unc-73
  • vang-1
  • vav-1
  • wrm-1
  • zoo-1
Caenorhabditis elegans
G alpha (12/13) signalling events
  • CELE_Y105E8A.25
  • cgef-1
  • dnbp-1
  • eat-11
  • ect-2
  • ephx-1
  • exc-5
  • gbp-2
  • gpa-12
  • gpa-17
  • gpb-1
  • gpb-2
  • gpc-1
  • gpc-2
  • itsn-1
  • let-341
  • let-502
  • osg-1
  • pix-1
  • plx-2
  • rhgf-1
  • rhgf-2
  • rho-1
  • rhoa
  • ser-5
  • sos-1
  • tiam-1
  • uig-1
  • unc-73
  • vav-1
Caenorhabditis elegans
EPHB-mediated forward signaling
  • CELE_Y105E8A.25
  • act-1
  • act-2
  • act-3
  • act-4
  • arp-2
  • arx-1
  • arx-2
  • arx-3
  • arx-4
  • arx-5
  • arx-6
  • arx-7
  • cdc-42
  • ced-10
  • itsn-1
  • kin-32
  • let-502
  • let-60
  • lin-34
  • nmr-1
  • nmr-2
  • pak-1
  • rac-1
  • rho-1
  • rhoa
  • sdn-1
  • src-1
  • tiam-1
  • unc-73
Caenorhabditis elegans
RAC1 GTPase cycle
  • C05D9.3
  • CELE_F22G12.5
  • CELE_F23H11.4
  • CELE_F46H5.4
  • CELE_T04C9.1
  • CELE_Y105E8A.25
  • CELE_Y57G11C.1147
  • PLD
  • aap-1
  • abi-1
  • abl-1
  • aex-4
  • age-1
  • cav-1
  • cav-2
  • cdc-42
  • ced-10
  • ced-5
  • cgef-1
  • chin-1
  • citk-1
  • citk-2
  • cyk-1
  • cyk-4
  • ect-2
  • ephx-1
  • fozi-1
  • frm-3
  • gap
  • gcp-2.1
  • gcp-2.2
  • gei-1
  • gex-2
  • gex-3
  • git-1
  • glt-1
  • glt-3
  • glt-4
  • glt-5
  • glt-6
  • glt-7
  • gpa-12
  • hum-7
  • kin-18
  • let-341
  • let-99
  • magu-1
  • max-2
  • mrck-1
  • pac-1
  • pak-1
  • pak-2
  • par-6
  • pes-7
  • pix-1
  • pkn-1
  • pld-1
  • rab-7
  • rac-1
  • rga-1
  • rga-2
  • rga-5
  • rga-8
  • rga-9
  • rhgf-1
  • rhi-1
  • ric-4
  • rlbp-1
  • snb-1
  • sos-1
  • spv-1
  • srgp-1
  • sulu
  • syd-1
  • tag-325
  • tag-77
  • tag-81
  • tiam-1
  • toe-2
  • uig-1
  • unc-112
  • unc-73
  • vab-1
  • vang-1
  • vav-1
  • wve-1
Caenorhabditis elegans
Inactivation, recovery and regulation of the phototransduction cascade
  • CELE_F57C9.6
  • arr-1
  • cal-5
  • che-6
  • cng-1
  • cng-2
  • cng-3
  • daf-11
  • fnta-1
  • fntb-1
  • gcy-1
  • gcy-10
  • gcy-11
  • gcy-12
  • gcy-13
  • gcy-14
  • gcy-15
  • gcy-16
  • gcy-17
  • gcy-18
  • gcy-19
  • gcy-2
  • gcy-20
  • gcy-21
  • gcy-22
  • gcy-23
  • gcy-25
  • gcy-27
  • gcy-29
  • gcy-3
  • gcy-4
  • gcy-5
  • gcy-6
  • gcy-7
  • gcy-8
  • gcy-9
  • gpc-1
  • grk-1
  • ncs-2
  • odr-1
  • pef-1
  • tax-2
  • tax-4
Caenorhabditis elegans
Phase 2 - plateau phase
  • STG-1
  • ccb-1
  • ccb-2
  • egl-19
  • stg-1
  • stg-2
  • unc-36
  • unc-72
Caenorhabditis elegans
Phase 0 - rapid depolarisation
  • STG-1
  • ccb-1
  • ccb-2
  • egl-19
  • stg-1
  • stg-2
  • unc-36
  • unc-72
Caenorhabditis elegans
Regulation of insulin secretion
  • C03B1.13
  • C35A11.4
  • CELE_F11D5.5
  • CELE_F11D5.7
  • CELE_F13B12.2
  • CELE_F48E3.2
  • CELE_F53H8.3
  • CELE_K08F9.1
  • CELE_K08H10.6
  • CELE_K09C4.1
  • CELE_K09C4.4
  • CELE_K09C4.5
  • CELE_Y37A1A.3
  • CELE_Y39B6A.41
  • CELE_Y39E4B.5
  • CELE_Y61A9LA.1
  • CELE_ZK829.9
  • R09B5.11
  • ccb-1
  • ccb-2
  • egl-19
  • fdgt-2
  • fgt-1
  • slcf-2
  • unc-2
  • unc-36
  • unc-72
Caenorhabditis elegans
Presynaptic depolarization and calcium channel opening
  • STG-1
  • ccb-1
  • ccb-2
  • stg-1
  • stg-2
  • unc-2
  • unc-36
  • unc-72
Caenorhabditis elegans
RHOH GTPase cycle
  • C34F11.5
  • CELE_F33H2.2
  • CELE_K09B11.5
  • CELE_R151.1
  • CELE_T25B9.5
  • CELE_Y110A7A.9
  • CELE_Y52D5A.2
  • CELE_Y69E1A.3
  • CELE_Y71H2AM.12
  • CELE_ZK792.4
  • K02D10.1
  • abts-1
  • bar-1
  • cav-1
  • cav-2
  • cdc-48.2
  • ced-10
  • csk-1
  • dbt-1
  • gcp-2.1
  • gcp-2.2
  • glt-1
  • glt-3
  • glt-4
  • glt-5
  • glt-6
  • glt-7
  • hgap-1
  • hmp-2
  • kin-21
  • let-502
  • max-2
  • metr-1
  • pak-1
  • pak-2
  • pvl-1
  • rab-7
  • rac-1
  • rac-2
  • rhi-1
  • snb-1
  • spy-1
  • src-1
  • sto-2
  • ubxn-2
  • vang-1
  • wrm-1
Caenorhabditis elegans
Heme signaling
  • C25G4.17
  • clec-185
  • slc-46A
  • slc-46a
  • slcr-46.1
  • slcr-46.2
  • slcr-46.3
  • vem-1
Caenorhabditis elegans
Neutrophil degranulation
  • B0546.3
  • C01B10.9
  • C03B1.13
  • C03F11.3
  • C05D9.3
  • C07A12.7
  • C25G4.17
  • C27A2.12
  • C27C7.5
  • C28G1.2
  • C33G3.4
  • C35A11.4
  • C36E8.4
  • C39H7.4
  • C49C3.10
  • C53D6.7
  • C54G4.4
  • CELE_F07A5.4
  • CELE_F10D11.6
  • CELE_F11C7.2
  • CELE_F11D5.5
  • CELE_F11D5.7
  • CELE_F11F1.1
  • CELE_F11G11.5
  • CELE_F13B12.2
  • CELE_F13H10.6
  • CELE_F15D3.4
  • CELE_F20H11.4
  • CELE_F21F3.2
  • CELE_F26G1.1
  • CELE_F41C6.4
  • CELE_F43D2.6
  • CELE_F44E2.10
  • CELE_F44G3.7
  • CELE_F46A8.3
  • CELE_F46A8.4
  • CELE_F46A8.5
  • CELE_F46A8.8
  • CELE_F47B7.2
  • CELE_F47E1.2
  • CELE_F47E1.4
  • CELE_F47G9.6
  • CELE_F48E3.2
  • CELE_F49F1.10
  • CELE_F49F1.11
  • CELE_F49F1.18
  • CELE_F49F1.9
  • CELE_F52E1.2
  • CELE_F53B1.8
  • CELE_F53H8.3
  • CELE_F58D5.2
  • CELE_H20J04.9
  • CELE_H27A22.1
  • CELE_H40L08.1
  • CELE_K02G10.5
  • CELE_K03B8.6
  • CELE_K08F9.1
  • CELE_K08H10.6
  • CELE_K09C4.1
  • CELE_K09C4.4
  • CELE_K09C4.5
  • CELE_M04G7.2
  • CELE_M6.11
  • CELE_R05F9.6
  • CELE_R11H6.5
  • CELE_T10B10.8
  • CELE_T13H5.1
  • CELE_T21B6.3
  • CELE_T22F3.12
  • CELE_T28F4.3
  • CELE_W08E12.7
  • CELE_Y105E8B.9
  • CELE_Y106G6D.4
  • CELE_Y106G6E.1
  • CELE_Y106G6H.14
  • CELE_Y16B4A.2
  • CELE_Y32F6B.1
  • CELE_Y37A1A.3
  • CELE_Y38H6C.8
  • CELE_Y39B6A.41
  • CELE_Y39E4B.5
  • CELE_Y42H9AR.2
  • CELE_Y43F4B.5
  • CELE_Y48G8AL.15
  • CELE_Y50D7A.10
  • CELE_Y51B9A.9
  • CELE_Y57G11C.33
  • CELE_Y70G10A.3
  • CELE_Y71G12B.31
  • CELE_Y71H2AM.12
  • CELE_ZK616.65
  • CELE_ZK829.9
  • F09E5.3
  • F25G6.8
  • F33D4.4
  • PLD
  • R04B3.2
  • R07B1.3
  • R09B5.11
  • R09H10.3
  • SC
  • T19B4.3
  • T22D1.3
  • W03G11.3
  • ZK652.6
  • ZK686.3
  • ZK697.8
  • aagr-1
  • aagr-2
  • abt-1
  • acl-2
  • acly-1
  • acp-5
  • acp-6
  • acp-7
  • acr-12
  • acr-2
  • acr-3
  • acr-6
  • acr-8
  • acs-20
  • acs-22
  • adm-1
  • adm-2
  • aex-1
  • aex-4
  • aex-6
  • agl-1
  • aldo-1
  • aldo-2
  • alh-4
  • aman-1
  • ampd-1
  • amph-1
  • anp-1
  • apa-2
  • aph-2
  • apy-1
  • argn-1
  • arl-8
  • arp-1
  • arp-11
  • arp-2
  • arx-2
  • arx-7
  • asah-1
  • atad-3
  • atg-7
  • bar-1
  • ben-1
  • bgal-1
  • bgal-2
  • cal-5
  • cand-1
  • cas-1
  • cct-2
  • cct-8
  • cctb
  • cdc-48.2
  • cdd-2
  • cdh-4
  • cdk-12
  • cdtl-7
  • ced-10
  • ced-5
  • cfh-1
  • chat-1
  • cht-1
  • cht-3
  • cht-4
  • chtl-1
  • cku-70
  • cku-80
  • clec-149
  • clec-185
  • clec-196
  • clec-199
  • clec-202
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Caenorhabditis elegans
Downregulation of ERBB4 signaling
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Caenorhabditis elegans
Regulation of PTEN stability and activity
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Caenorhabditis elegans
Downregulation of SMAD2/3:SMAD4 transcriptional activity
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Caenorhabditis elegans
Stimuli-sensing channels
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Caenorhabditis elegans
ISG15 antiviral mechanism
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Caenorhabditis elegans
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Caenorhabditis elegans
Serine biosynthesis
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  • F26H9.5
  • phdh-1
  • serr-1
Caenorhabditis elegans

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Last updated: August 19, 2024