GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 226 - 250 of 1070 in total
Pathway Name ▲ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Dectin-1 mediated noncanonical NF-kB signaling
  • Btrc
  • Chuk
  • Cul1
  • Fbxw11
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Map3k14
  • Mecl1
  • Mss1
  • Nfkb2
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Relb
  • Ring12
  • Rps27a
  • Skp1
  • Skp1a
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Uba3
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Ube1c
  • Ube2m
Rattus norvegicus (Norway rat)
Dectin-2 family
  • Clec4d
  • Clec4e
  • Clecsf8
  • Clecsf9
  • Fce1g
  • Fcer1g
  • Fyn
  • Lyn
  • Mcl
  • Mincle
  • Plcg2
  • Syk
Rattus norvegicus (Norway rat)
Defensins
  • Defa
  • Defa-rs1
  • Defa10
  • Defa11
  • Defa24
  • Defa6
  • Defa8
  • Defa9
  • Defal1
  • Defb1
  • Defb14
  • Defb17
  • Defb18
  • Defb2
  • Defb21
  • Defb24
  • Defb25
  • Defb28
  • Defb3
  • Defb30
  • Defb36
  • Defb4
  • Defb41
  • Defb43
  • Defcr4
  • ENSRNOG00000064390
  • Np4
  • Rd5
Rattus norvegicus (Norway rat)
Degradation of AXIN
  • Axin
  • Axin1
  • Axin2
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mecl1
  • Mss1
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Ring12
  • Rnf146
  • Rps27a
  • Smurf2
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Tnks
  • Tnks2
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Degradation of DVL
  • C3ip1
  • Cul3
  • Dact1
  • Dvl1
  • Dvl2
  • Dvl3
  • Hecw1
  • Klhl12
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100361515
  • LOC100365869
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mecl1
  • Mss1
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Rbx1
  • Ring12
  • Rps27a
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Degradation of GLI1 by the proteasome
  • Btrc
  • Cul1
  • Gli1
  • Itch
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mecl1
  • Mss1
  • Numb
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Rbx1
  • Ring12
  • Rps27a
  • Skp1
  • Skp1a
  • Sufu
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Degradation of beta-catenin by the destruction complex
  • Amer1
  • Apc
  • Axin
  • Axin1
  • Btrc
  • Catnb
  • Csnk1a1
  • Ctnnb1
  • Cul1
  • Gsk3b
  • LOC100360606
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • LOC100909468
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mecl1
  • Mss1
  • Ppp2ca
  • Ppp2cb
  • Ppp2r1a
  • Ppp2r1b
  • Ppp2r5a
  • Ppp2r5b
  • Ppp2r5c
  • Ppp2r5d
  • Ppp2r5e
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Rbx1
  • Ring12
  • Rps27a
  • Skp1
  • Skp1a
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Zranb1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Degradation of cysteine and homocysteine
  • Ado
  • Cdo1
  • Cth
  • Fmo-1
  • Fmo1
  • Gadl1
  • Mpst
  • Trx2
  • Tst
  • Txn2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Degradation of the extracellular matrix
  • 2b7
  • A2m
  • A2m1
  • Acan
  • Adam10
  • Adam15
  • Adam8
  • Adamts4
  • Adamts5
  • Agc
  • Agc1
  • Bcan
  • Behab
  • Bsg
  • Capa6
  • Capn1
  • Capn10
  • Capn11
  • Capn12
  • Capn13
  • Capn15
  • Capn2
  • Capn3
  • Capn4
  • Capn5
  • Capn6
  • Capn7
  • Capn8
  • Capn9
  • Capns1
  • Cast
  • Cd44
  • Cdh1
  • Cls1
  • Cls4
  • Css1
  • Ctsg
  • Ctsk
  • Ctsl
  • Ctsl1
  • Ctss
  • Dcn
  • Elane
  • Htra
  • Htra1
  • Madm
  • Mdc15
  • Mmel
  • Mmp-7
  • Mmp1
  • Mmp10
  • Mmp11
  • Mmp12
  • Mmp13
  • Mmp14
  • Mmp1a
  • Mmp2
  • Mmp20
  • Mmp3
  • Mmp7
  • Mmp8
  • Mmp9
  • Mtmmp
  • Ncl2
  • Ncl4
  • Optc
  • Prss11
  • Scube1
  • Scube3
  • Spp-1
  • Spp1
  • Tmprss6
Rattus norvegicus (Norway rat)
Depolymerization of the Nuclear Lamina
  • Ccnb1
  • Cdc2
  • Cdc2a
  • Cdk1
  • Cdkn1
  • Cnep1r1
  • Ctdnep1
  • Dullard
  • Emd
  • Lmn1
  • Lmna
  • Lmnb1
  • Lpin1
  • Lpin2
  • Lpin3
  • Pkca
  • Pkcb
  • Prkca
  • Prkcb
  • Prkcb1
  • Rbm39
  • Tmem188
Rattus norvegicus (Norway rat)
Deposition of new CENPA-containing nucleosomes at the centromere
  • Cenpc
  • Cenpc1
  • Cenph
  • Cenpi
  • Cenpk
  • Cenpl
  • Cenpm
  • Cenpn
  • Cenpo
  • Cenpp
  • Cenpq
  • Cenpr
  • Cenpt
  • Cenpu
  • Cenpw
  • Cug2
  • ENSRNOG00000062927
  • ENSRNOG00000064540
  • ENSRNOG00000066901
  • ENSRNOG00000068034
  • Fshprh1
  • H2ab3
  • H2ac10
  • H2ac18
  • H2ac4
  • H2afb3
  • H2afx
  • H2aj
  • H2ax
  • H2az2
  • H2bc1
  • H2bc12l1
  • H2bc6
  • H2bcl1
  • H2bcl2
  • H2bu1
  • H4c16
  • H4c2
  • H4f16
  • H4ft
  • Hist1h2ba
  • Hist1h2bc
  • Hist1h2bg
  • Hist1h2bo
  • Hist1h2bq
  • Hist1h4b
  • Hist1h4m
  • Hist2h2aa3
  • Hist4
  • Hist4h4
  • Hjurp
  • Itgb3bp
  • Knl1
  • LOC100365043
  • LOC100910200
  • LOC120097726
  • LOC679342
  • LOC681185
  • LOC684797
  • Lrpr1
  • Mis18a
  • Mis18bp1
  • Mlf1ip
  • Npm1
  • Nrif3
  • Oip5
  • Rbbp4
  • Rbbp7
  • Rsf1
  • Ruvbl1
  • Smarca5
  • Th2b
  • Tip49
  • Tip49a
Rattus norvegicus (Norway rat)
Dermatan sulfate biosynthesis
  • Bcan
  • Behab
  • Bgn
  • Caleb
  • Chst14
  • Cspg2
  • Cspg3
  • Cspg4
  • Cspg5
  • Dcn
  • Dse
  • Dsel
  • Ncan
  • Ng2
  • Ngc
  • Ust
  • Vcan
Rattus norvegicus (Norway rat)
Detoxification of Reactive Oxygen Species
  • AC128290.1
  • Aipla2
  • Aop2
  • Cas1
  • Cat
  • Ccs
  • Cyba
  • Cybb
  • Cycs
  • Cycsl2
  • Cycsl3
  • Ero1a
  • Ero1l
  • Giig11
  • Gpx1
  • Gpx2
  • Gpx3
  • Gpx5
  • Gpx6
  • Gpx7
  • Gpx8
  • Gsr
  • Gstp1
  • Kox
  • LOC690675
  • Ncf1
  • Ncf2
  • Ncf4
  • Nox4
  • Nudt2
  • P4hb
  • Pdia1
  • Prdx1
  • Prdx2
  • Prdx3
  • Prdx5
  • Prdx6
  • RGD1562558
  • Sod-3
  • Sod1
  • Sod2
  • Sod3
  • Tdpx1
  • Tdpx2
  • Trx2
  • Trxr1
  • Trxr2
  • Tsa
  • Txn
  • Txn1
  • Txn2
  • Txnrd1
  • Txnrd2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Digestion
  • Alpi
  • Guc2c
  • Guca2
  • Guca2a
  • Guca2b
  • Gucy2c
  • Pir
Rattus norvegicus (Norway rat)
Digestion of dietary carbohydrate
  • Chia
  • Chit1
  • LOC120100609
  • Lct
  • Lph
  • Si
Rattus norvegicus (Norway rat)
Digestion of dietary lipid
  • Cel
  • Clps
  • Lipf
  • Plrp1
  • Plrp2
  • Pnlip
  • Pnliprp1
  • Pnliprp2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Dimerization of procaspase-8
  • AABR07018323.1
  • Apt1
  • Apt1Lg1
  • Casp8
  • Cd95l
  • Cflar
  • Fadd
  • Fas
  • Fasl
  • Faslg
  • Ripk1
  • Tnfrsf10b
  • Tnfrsf6
  • Tnfsf10
  • Tnfsf6
  • Tnlg6a
  • Tradd
  • Traf2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Disassembly of the destruction complex and recruitment of AXIN to the membrane
  • Amer1
  • Apc
  • Axin
  • Axin1
  • Catnb
  • Cav
  • Cav1
  • Csnk1a1
  • Ctnnb1
  • Dvl1
  • Dvl2
  • Dvl3
  • Frat1
  • Frat2
  • Fzd1
  • Fzd2
  • Fzd5
  • Gsk3b
  • LOC100361515
  • LOC100909468
  • LOC679110
  • Lrp5
  • Lrp6
  • Ppp2ca
  • Ppp2cb
  • Ppp2r1a
  • Ppp2r1b
  • Ppp2r5a
  • Ppp2r5b
  • Ppp2r5c
  • Ppp2r5d
  • Ppp2r5e
  • Wnt1
  • Wnt3a
  • Wnt8a
  • Wnt8b
Rattus norvegicus (Norway rat)
Disinhibition of SNARE formation
  • Pkca
  • Pkcb
  • Pkcc
  • Pkcg
  • Prkca
  • Prkcb
  • Prkcb1
  • Prkcc
  • Prkcg
  • Stx4
  • Stx4a
  • Stxbp3
  • munc-18c
Rattus norvegicus (Norway rat)
Dissolution of Fibrin Clot
  • Anx2
  • Anxa2
  • Hrg
  • Hrg1
  • Pai1
  • Pai2
  • Pi7
  • Planh1
  • Planh2
  • Plat
  • Plau
  • Plaur
  • Plg
  • Pn1
  • S100a10
  • Serpinb2
  • Serpinb6a
  • Serpinb8
  • Serpine1
  • Serpine2
  • Serpinf2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Dopamine Neurotransmitter Release Cycle
  • Apba1
  • Bzrap1
  • Cask
  • Cplx1
  • Lin7a
  • Lin7b
  • Lin7c
  • Mals1
  • Mals2
  • Mals3
  • Mint1
  • Ppfia1
  • Ppfia2
  • Ppfia3
  • Ppfia4
  • Rab3a
  • Rbp1
  • Rim1
  • Rims1
  • Sap
  • Slc18a2
  • Snap
  • Snap25
  • Stx1a
  • Stxbp1
  • Svat
  • Syb2
  • Syn1
  • Syn2
  • Syn3
  • Syt1
  • Tspoap1
  • Unc13b
  • Unc13h2
  • Unc18a
  • Vamp2
  • Veli1
  • Veli1a
  • Veli2
  • Veli3
  • Vmat2
  • X11
Rattus norvegicus (Norway rat)
Dopamine receptors
  • Drd2
  • Drd3
  • Drd4
  • Drd5
Rattus norvegicus (Norway rat)
Downregulation of ERBB2 signaling
  • Batk
  • Btc
  • Cdc37
  • Ctk
  • Cul5
  • Dtr
  • Egf
  • Egfr
  • Erbb2
  • Erbb3
  • Ereg
  • Hbegf
  • Hegfl
  • Hsp86
  • Hsp90aa1
  • Hspca
  • LOC100360645
  • Matk
  • Ndf
  • Neu
  • Nrg1
  • Nrg2
  • Nrg3
  • Ntak
  • Ptpn12
  • Ptpn18
  • Rps27a
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Vacm1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Downregulation of ERBB2:ERBB3 signaling
  • Akt1
  • Akt2
  • Akt3
  • Erbb2
  • Erbb3
  • LOC100360645
  • Ndf
  • Neu
  • Nrg1
  • Nrg2
  • Ntak
  • Rnf41
  • Rps27a
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Usp8
Rattus norvegicus (Norway rat)
Downregulation of SMAD2/3:SMAD4 transcriptional activity
  • Adprt
  • Atp1b4
  • Erk1
  • Erk2
  • Hdac1
  • LOC100360645
  • Madh2
  • Madh3
  • Madh4
  • Mapk
  • Mapk1
  • Mapk3
  • Ncor2
  • Nedd4l
  • Parp1
  • Pp2c1
  • Ppm1a
  • Pppm1a
  • Prkm1
  • Prkm3
  • Rps27a
  • Ski
  • Skil
  • Smad2
  • Smad3
  • Smad4
  • Smurf2
  • Snw1
  • Tgif1
  • Trim33
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Ube2d1
  • Ube2d3
Rattus norvegicus (Norway rat)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Last updated: August 19, 2024