GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 26 - 50 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name ▲ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR3
  • Fgf-1
  • Fgf-2
  • Fgf-5
  • Fgf-9
  • Fgf1
  • Fgf16
  • Fgf17
  • Fgf18
  • Fgf2
  • Fgf20
  • Fgf23
  • Fgf4
  • Fgf5
  • Fgf7a
  • Fgf8
  • Fgf9
  • Fgfa
  • Fgfr3
  • Plcg1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR4
  • FGF15
  • FGF6
  • Fgf-1
  • Fgf-2
  • Fgf-9
  • Fgf1
  • Fgf16
  • Fgf17
  • Fgf18
  • Fgf19
  • Fgf2
  • Fgf20
  • Fgf23
  • Fgf4
  • Fgf6
  • Fgf7a
  • Fgf7b
  • Fgf8
  • Fgf8a
  • Fgf9
  • Fgfa
  • Fgfr4
  • Klb
  • Plcg1
Rattus norvegicus (Norway rat)
PECAM1 interactions
  • Fyn
  • Inpp5d
  • Itgav
  • Itgb3
  • Lck
  • Lyn
  • Pecam
  • Pecam1
  • Plcg1
  • Ptph6
  • Ptpn11
  • Ptpn6
  • Ship
  • Ship1
  • Src
  • Yes1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Activated NTRK3 signals through PLCG1
  • Ntf-3
  • Ntf3
  • Ntrk3
  • Plcg1
  • Trkc
Rattus norvegicus (Norway rat)
GPVI-mediated activation cascade
  • Arha
  • Arha2
  • Arhb
  • Cdc42
  • Clec1b
  • Fce1g
  • Fcer1g
  • Fyn
  • G6b
  • Gp6
  • Lat
  • Lck
  • Lcp2
  • Lyn
  • Mpig6b
  • Pdk1
  • Pdpk1
  • Pdpn
  • Pik3ca
  • Pik3cb
  • Pik3cg
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Pik3r3
  • Pik3r5
  • Pik3r6
  • Plcg2
  • Ptph6
  • Ptpn11
  • Ptpn6
  • Rac
  • Rac1
  • Rac2
  • Rhoa
  • Rhob
  • Rhog
  • Syk
  • Vav
  • Vav1
  • Vav2
  • Vav3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Antigen activates B Cell Receptor (BCR) leading to generation of second messengers
  • AABR07034730.2
  • AABR07060971.1
  • AABR07061001.1
  • AABR07065782.1
  • AABR07065808.1
  • AABR07065812.2
  • AABR07065813.1
  • Ash
  • Blnk
  • Btk
  • Cd19
  • Cd22
  • Cd79a
  • Cd79b
  • Dapp1
  • ENSRNOG00000062324
  • ENSRNOG00000062682
  • ENSRNOG00000062762
  • ENSRNOG00000062853
  • ENSRNOG00000062915
  • ENSRNOG00000062976
  • ENSRNOG00000063148
  • ENSRNOG00000063329
  • ENSRNOG00000063340
  • ENSRNOG00000063341
  • ENSRNOG00000063422
  • ENSRNOG00000063550
  • ENSRNOG00000063572
  • ENSRNOG00000063707
  • ENSRNOG00000063791
  • ENSRNOG00000064041
  • ENSRNOG00000064061
  • ENSRNOG00000064085
  • ENSRNOG00000064245
  • ENSRNOG00000064481
  • ENSRNOG00000064582
  • ENSRNOG00000065160
  • ENSRNOG00000065181
  • ENSRNOG00000065191
  • ENSRNOG00000065237
  • ENSRNOG00000065406
  • ENSRNOG00000065564
  • ENSRNOG00000065629
  • ENSRNOG00000065670
  • ENSRNOG00000065675
  • ENSRNOG00000065690
  • ENSRNOG00000065855
  • ENSRNOG00000066010
  • ENSRNOG00000066072
  • ENSRNOG00000066203
  • ENSRNOG00000066380
  • ENSRNOG00000066406
  • ENSRNOG00000066431
  • ENSRNOG00000066785
  • ENSRNOG00000066812
  • ENSRNOG00000066814
  • ENSRNOG00000066904
  • ENSRNOG00000066922
  • ENSRNOG00000066926
  • ENSRNOG00000066971
  • ENSRNOG00000067010
  • ENSRNOG00000067025
  • ENSRNOG00000067233
  • ENSRNOG00000067273
  • ENSRNOG00000067516
  • ENSRNOG00000067603
  • ENSRNOG00000067643
  • ENSRNOG00000067679
  • ENSRNOG00000067883
  • ENSRNOG00000068055
  • ENSRNOG00000068059
  • ENSRNOG00000068381
  • ENSRNOG00000068499
  • ENSRNOG00000068847
  • ENSRNOG00000069193
  • ENSRNOG00000069427
  • ENSRNOG00000069491
  • ENSRNOG00000069766
  • ENSRNOG00000069828
  • ENSRNOG00000069901
  • ENSRNOG00000069940
  • ENSRNOG00000070091
  • ENSRNOG00000070192
  • ENSRNOG00000070244
  • ENSRNOG00000070247
  • ENSRNOG00000070810
  • ENSRNOG00000070812
  • ENSRNOG00000070816
  • ENSRNOG00000070832
  • ENSRNOG00000070933
  • ENSRNOG00000071049
  • ENSRNOG00000071091
  • Grb2
  • Igkv2-112l1
  • Igkv8-30l1
  • Igkvl-ps6
  • Igkvl10
  • Igkvl12
  • Igkvl13
  • Igkvl2
  • Iglc1
  • Igll1
  • Insp3r
  • Itpr1
  • Itpr2
  • Itpr3
  • LOC100361758
  • LOC100363522
  • LOC100365500
  • LOC100911032
  • LOC102551948
  • LOC690813
  • Nck1
  • Pik3ap1
  • Pik3cd
  • Pik3r1
  • Plcg2
  • Ptph6
  • Ptpn6
  • RGD1561722
  • RGD1564696
  • Ruk
  • Seta
  • Sh3kbp1
  • Sim
  • Sos1
  • Stim1
  • Syk
  • Trp1
  • Trpc1
  • Vav
  • Vav1
Rattus norvegicus (Norway rat)
CLEC7A (Dectin-1) signaling
  • Bcl10
  • Card9
  • Chuk
  • Clec7a
  • Ikbkb
  • Ikbkg
  • Ikkb
  • Malt1
  • Map3k7
  • Map3k7ip2
  • Nemo
  • Pkcd
  • Plcg2
  • Prkcd
  • Src
  • Tab1
  • Tab2
  • Tab3
  • Traf6
Rattus norvegicus (Norway rat)
Toll Like Receptor 4 (TLR4) Cascade
  • Bpi
  • Cd14
  • Cd180
  • Dnm
  • Dnm1
  • Dnm2
  • Dnm3
  • Dyn2
  • Dyn3
  • Lbp
  • Ly86
  • Ly96
  • Plcg2
  • Ptpn4
  • Ticam2
  • Tlr4
Rattus norvegicus (Norway rat)
Dectin-2 family
  • Clec4d
  • Clec4e
  • Clecsf8
  • Clecsf9
  • Fce1g
  • Fcer1g
  • Fyn
  • Lyn
  • Mcl
  • Mincle
  • Plcg2
  • Syk
Rattus norvegicus (Norway rat)
Synthesis of PIPs at the Golgi membrane
  • Arf1
  • Arf3
  • Inpp5e
  • Ocrl
  • Pi4k2a
  • Pi4k2b
  • Pi4ka
  • Pi4kb
  • Pi4kii
  • Pik3c2a
  • Pik3c2g
  • Pik3c3
  • Pik3r4
  • Pik4ca
  • Pik4cb
  • Pikfyve
  • Sac1
  • Sacm1l
  • Tpte
  • Tpte2
  • Vac14
  • Vps34
Rattus norvegicus (Norway rat)
Synthesis of PIPs at the early endosome membrane
  • Inpp4a
  • Inpp4b
  • Inpp5f
  • Mtm1
  • Mtmr12
  • Mtmr2
  • Mtmr4
  • Pi4k2a
  • Pi4k2b
  • Pi4kii
  • Pik3c2a
  • Pik3c3
  • Pik3r4
  • Pikfyve
  • Pip3ap
  • Vac14
  • Vps34
Rattus norvegicus (Norway rat)
RHOG GTPase cycle
  • AABR07021955.1
  • Ankle2
  • Arfgap3
  • Arhgap1
  • Arhgap21
  • Arhgap32
  • Arhgap35
  • Arhgap5
  • Arhgdia
  • Arhgdib
  • Arhgdig
  • Arhgef16
  • Arhgef26
  • Arhgef5
  • Borg5
  • Cav
  • Cav1
  • Cdc42
  • Cdc42ep1
  • Cyfip1
  • Depdc1b
  • Diaph3
  • Dock2
  • Dock3
  • Dock4
  • Dock5
  • Dsg2
  • Duo
  • Ehsh1
  • Elmo2
  • Emd
  • Epha2
  • Ergic53
  • Esyt1
  • Fam62a
  • Garre1
  • Grlf1
  • Hapip
  • Hspe1
  • Iqgap2
  • Itgb1
  • Itsn
  • Itsn1
  • Kalrn
  • Ktn1
  • LOC687105
  • Lamtor1
  • Lbr
  • Lem4
  • Letm1
  • Lman1
  • Map3k11
  • Mbc2
  • Mcam
  • Mcf2
  • Mcf2l
  • Mlk3
  • Mpp7
  • Muc18
  • Ndufa5
  • Ndufs3
  • Ophn1
  • Ost
  • P190A
  • Pak2
  • Pak4
  • Pgrmc2
  • Pik3r1
  • Pld1
  • Plekhg3
  • Prex1
  • Rab7
  • Rab7a
  • Rbm39
  • Rhog
  • Shmt2
  • Stbd1
  • Stx5
  • Stx5a
  • Syb3
  • Tfrc
  • Trfr
  • Trio
  • Vamp3
  • Vangl1
  • Vapb
  • Vav
  • Vav1
  • Vav2
  • Vav3
  • Vrk2
  • Ykt6
  • p190ARHOGAP
Rattus norvegicus (Norway rat)
Metabolism of folate and pterines
  • Aldh1l1
  • Aldh1l2
  • Dhfr
  • Folr2
  • Fpgs
  • Fthfd
  • Hcp1
  • Mthfd
  • Mthfd1
  • Mthfd1l
  • Mthfd2
  • Mthfd2l
  • Mthfr
  • Mthfs
  • Pcft
  • Shmt1
  • Shmt2
  • Slc19a1
  • Slc25a32
  • Slc46a1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Glucocorticoid biosynthesis
  • Cbg
  • Cyp11b-1
  • Cyp11b-2
  • Cyp11b-3
  • Cyp11b1
  • Cyp11b2
  • Cyp11b3
  • Cyp17
  • Cyp17a1
  • Cyp21
  • Cyp21a1
  • Hsd11
  • Hsd11b1
  • Hsd11b2
  • Hsd11k
  • Hsd3b
  • Hsd3b1
  • Hsd3b5
  • Hsd3b5-ps1
  • Hsd3b6
  • Pomc
  • Pomc2
  • Serpina6
Rattus norvegicus (Norway rat)
Prednisone ADME
  • Abcb1
  • Akr1c1
  • Akr1c21
  • Alb
  • Cbg
  • Cyp3a-1
  • Cyp3a-2
  • Cyp3a1
  • Cyp3a11
  • Cyp3a13
  • Cyp3a18
  • Cyp3a2
  • Cyp3a62
  • Cyp3a9
  • Hsd11
  • Hsd11b1
  • Hsd11b2
  • Hsd11k
  • Hsd17b5
  • Mdr1
  • Mdr1b
  • Pgy1
  • RGD1559459
  • Serpina6
  • Udpgtr2
  • Ugt1
  • Ugt1a2
  • Ugt1a3
  • Ugt1a5
  • Ugt2b
  • Ugt2b1
  • Ugt2b12
  • Ugt2b15
  • Ugt2b17
  • Ugt2b2
  • Ugt2b3
  • Ugt2b34l1
  • Ugt2b36
  • Ugt2b37
  • Ugt2b4
  • Ugt2b5
  • Ugt2b6
  • Ugt2b7
  • Ugt2b8
Rattus norvegicus (Norway rat)
pre-mRNA splicing
  • AABR07026797.1
  • AABR07029847.1
  • AABR07065078.1
  • AC109542.1
  • Acin1
  • Alyref
  • Ath55
  • Auf1
  • Bat1
  • Bat1a
  • Bcas2
  • Bud13
  • Bud31
  • Bwd
  • C3h9orf78
  • Cactin
  • Casc3
  • Cbp20
  • Cbp80
  • Ccdc12
  • Ccdc16
  • Ccdc55
  • Cdc40
  • Cdc5l
  • Cherp
  • Cl-4
  • Crn
  • Crnkl1
  • Ctnnbl1
  • Cwc15
  • Cwc22
  • Cwc25
  • Cyp10l
  • Ddx23
  • Ddx39b
  • Ddx42
  • Ddx46
  • Ddx48
  • Ddx5
  • Dhx15
  • Dhx35
  • Dhx38
  • Dhx8
  • Dhx9
  • Edg2
  • Eftud2
  • Eif4a3
  • Fam32a
  • Fam50a
  • Fblim1
  • Fus
  • G10
  • Gpatch1
  • Gtf2f1
  • Gtf2f2
  • Hars2
  • Hel117
  • Hnrnp
  • Hnrnpa1
  • Hnrnpa2b1
  • Hnrnpa3
  • Hnrnpc
  • Hnrnpd
  • Hnrnpf
  • Hnrnph1
  • Hnrnph2
  • Hnrnpk
  • Hnrnpl
  • Hnrnpr
  • Hnrnpr-ps2
  • Hnrnpu
  • Hnrpa1
  • Hnrpa2b1
  • Hnrpc
  • Hnrpd
  • Hnrpf
  • Hnrph
  • Hnrph1
  • Hnrph2
  • Hnrpk
  • Hnrpr
  • Hnrpu
  • Hrs
  • Hsc70
  • Hsc73
  • Hspa8
  • Htatsf1
  • Ik
  • Ini
  • Isy1
  • Kcrf
  • LOC100360750
  • LOC100910750
  • LOC100911361
  • LOC120096281
  • LOC120098305
  • LOC687679
  • LSM3
  • LSM4
  • LSM5
  • Leng1
  • Lsm3
  • Lsm4
  • Lsm5
  • Lsm5l1
  • Lsm6
  • Lsm6l1
  • Lsm7
  • Luc7l3
  • Magoh
  • Magohb
  • Mfap1al1
  • Mln51
  • Mtrex
  • Ncbp1
  • Ncbp2
  • Nhp2l1
  • Nkap
  • Nsrp1
  • Nsrp70
  • Otag12
  • Pcbp1
  • Pcbp2
  • Pcdc5rp
  • Phf5a
  • Plrg1
  • Pnn
  • Polr2a
  • Polr2b
  • Polr2c
  • Polr2d
  • Polr2e
  • Polr2f
  • Polr2g
  • Polr2i
  • Polr2j
  • Ppih
  • Ppil1
  • Ppil2
  • Ppil3
  • Ppil4
  • Ppwd1
  • Pqbp1
  • Prcc
  • Prkrip1
  • Prp18
  • Prp19
  • Prp4k
  • Prpf18
  • Prpf19
  • Prpf3
  • Prpf31
  • Prpf38a
  • Prpf4
  • Prpf40a
  • Prpf4b
  • Prpf6
  • Prpf8
  • Ptb
  • Ptbp1
  • Puf60
  • Pybp
  • RGD1305178
  • RGD1561590
  • RGD1563634
  • RGD1564148
  • Rap30
  • Rbm10
  • Rbm17
  • Rbm22
  • Rbm25
  • Rbm25l1
  • Rbm39
  • Rbm42
  • Rbm5
  • Rbm7
  • Rbm8
  • Rbm8a
  • Rbmx
  • Rbmx2
  • Rbmxrt
  • Rnps1
  • SNRPD2
  • SNRPD3
  • Sap18
  • Sap18-ps1
  • Sart1
  • Sde2
  • Sf1
  • Sf3a1
  • Sf3a2
  • Sf3a3
  • Sf3b1
  • Sf3b2
  • Sf3b3
  • Sf3b4
  • Sf3b5
  • Sf4
  • Sfrs10
  • Sfrs2
  • Sfrs5
  • Sfrs9
  • Siahbp1
  • Sipp1
  • Slu7
  • Smn
  • Smndc1
  • Smu1
  • Snip1
  • Snrnp200
  • Snrnp27
  • Snrnp40
  • Snrnp70
  • Snrpa
  • Snrpa1
  • Snrpb
  • Snrpc
  • Snrpd2
  • Snrpd3
  • Snrpe
  • Snrpepl2
  • Snrpf
  • Snrpg
  • Snrpgl1
  • Snrpn
  • Snu13
  • Snw1
  • Spf30
  • Srrm1
  • Srrm2
  • Srrt
  • Srsf1
  • Srsf10
  • Srsf11
  • Srsf12
  • Srsf2
  • Srsf3
  • Srsf5
  • Srsf7
  • Srsf8
  • Srsf9
  • Steep1
  • Sugp1
  • Syf1
  • Syf2
  • Tbfii
  • Tcerg1
  • Tra2b
  • U2af1
  • U2af1l4
  • U2af2
  • U2surp
  • Uap56
  • Ubl5
  • Upf3b
  • Usp39
  • Wbp11
  • Wbp4
  • Wdr70
  • Xab2
  • YJU2
  • Yb1
  • Ybx1
  • Yju2
  • Zfp830
  • Zmat2
  • Znf830
Rattus norvegicus (Norway rat)
RHO GTPases activate PKNs
  • Arha
  • Arha2
  • Arhb
  • Cdc25c
  • Cpi
  • Cpi17
  • Mbs
  • Msfs1
  • Mypt1
  • Pak2
  • Pdk1
  • Pdpk1
  • Pkn
  • Pkn1
  • Pkn2
  • Ppp1cb
  • Ppp1r12a
  • Ppp1r12b
  • Ppp1r14a
  • Prk1
  • Prk2
  • Prkcl1
  • Prkcl2
  • Rac
  • Rac1
  • Rhoa
  • Rhob
  • Sfn
  • Ywhab
  • Ywhae
  • Ywhag
  • Ywhah
  • Ywhaq
  • Ywhaz
Rattus norvegicus (Norway rat)
TP53 Regulates Metabolic Genes
  • AC128290.1
  • Akt1
  • Akt2
  • Akt3
  • Ampk1
  • COX2
  • Ccdc44
  • Coi
  • Coii
  • Coiii
  • Cox11
  • Cox14
  • Cox16
  • Cox18
  • Cox4
  • Cox4a
  • Cox4i1
  • Cox5a
  • Cox5b
  • Cox6a1
  • Cox6al
  • Cox6b1
  • Cox6c
  • Cox6c2
  • Cox7a2l
  • Cox7b
  • Cox7c
  • Cox7c1
  • Cox8
  • Cox8a
  • Cox8l
  • Cycs
  • Cycsl2
  • Cycsl3
  • Ddit4
  • ENSRNOG00000066475
  • Frap1
  • G6pd
  • G6pdx
  • Ga
  • Gbl
  • Gls
  • Gls2
  • Gpi
  • Gpx2
  • Gsr
  • LOC120096563
  • LOC690675
  • Lamtor1
  • Lamtor3
  • Lamtor4
  • Lamtor5
  • Lrp157
  • Lrpprc
  • Lst8
  • Map2k1ip1
  • Mlst8
  • Msfs1
  • Mt-co1
  • Mt-co2
  • Mt-co3
  • Mtco1
  • Mtco2
  • Mtco3
  • Mtor
  • Prdx1
  • Prdx2
  • Prdx5
  • Prkaa1
  • Prkab1
  • Prkab2
  • Prkag1
  • Prkag2
  • Prkag3
  • RGD1562558
  • Raft1
  • Redd1
  • Rheb
  • Rptor
  • RragB
  • Rraga
  • Rragc
  • Rragc_predicted
  • Rragd
  • Rtp801
  • Sco1
  • Sesn1
  • Sesn2
  • Sesn3
  • Sfn
  • Slc38a9
  • Surf-1
  • Surf1
  • Taco1
  • Tdpx1
  • Tdpx2
  • Tigar
  • Trxr1
  • Tsc1
  • Tsc2
  • Txn
  • Txn1
  • Txnrd1
  • Tymp
  • Ywhab
  • Ywhae
  • Ywhag
  • Ywhah
  • Ywhaq
  • Ywhaz
Rattus norvegicus (Norway rat)
Activation of BAD and translocation to mitochondria
  • Bad
  • Cna2
  • Cnb
  • Msfs1
  • Ppp3cc
  • Ppp3r1
  • Sfn
  • Ywhab
  • Ywhae
  • Ywhag
  • Ywhah
  • Ywhaq
  • Ywhaz
Rattus norvegicus (Norway rat)
Chk1/Chk2(Cds1) mediated inactivation of Cyclin B:Cdk1 complex
  • Ccnb1
  • Cdc2
  • Cdc25c
  • Cdc2a
  • Cdk1
  • Cdkn1
  • Msfs1
  • Sfn
  • Wee1
  • Ywhab
  • Ywhae
  • Ywhag
  • Ywhah
  • Ywhaq
  • Ywhaz
Rattus norvegicus (Norway rat)
Signaling by Hippo
  • Amot
  • Amotl1
  • Amotl2
  • Casp3
  • Cpp32
  • Dvl2
  • LOC100361515
  • Lats1
  • Lats2
  • Mob1a
  • Mob1b
  • Mobk1b
  • Mobkl1b
  • Mst2
  • Nphp4
  • Sav1
  • Stk3
  • Stk4
  • Tjp1
  • Tjp2
  • Ww45
  • Wwc1
  • Wwtr1
  • Yap
  • Yap1
  • Yap65
  • Ywhab
  • Ywhae
Rattus norvegicus (Norway rat)
Regulation of localization of FOXO transcription factors
  • Akt1
  • Akt2
  • Akt3
  • Foxo1
  • Foxo1a
  • Foxo3
  • Foxo4
  • Foxo6
  • Msfs1
  • Sfn
  • Ywhab
  • Ywhag
  • Ywhaq
  • Ywhaz
Rattus norvegicus (Norway rat)
Rap1 signalling
  • AABR07006724.1
  • Cgef2
  • Epac
  • Epac1
  • Epac2
  • Krev1
  • Msfs1
  • Pkacb
  • Prkaca
  • Prkacb
  • Prkg1
  • Raf
  • Raf1
  • Rap1a
  • Rap1b
  • Rap1gap
  • Rap1gap2
  • Rapgef3
  • Rapgef4
  • Rasgrp
  • Rasgrp1
  • Rasgrp2
  • Sipa1
  • Ywhab
  • Ywhaz
Rattus norvegicus (Norway rat)
Butyrate Response Factor 1 (BRF1) binds and destabilizes mRNA
  • Akt1
  • Brf1
  • Cmg1
  • Dcp1a
  • Dcp2
  • Dis3
  • Exosc1
  • Exosc2
  • Exosc3
  • Exosc4
  • Exosc5
  • Exosc6
  • Exosc7
  • Exosc8
  • Exosc9
  • LOC103690064
  • LOC679140
  • Mapkapk2
  • Tis11b
  • Xrn1
  • Ywhab
  • Zfp36l1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Tristetraprolin (TTP, ZFP36) binds and destabilizes mRNA
  • Dcp1a
  • Dcp2
  • Dis3
  • Exosc1
  • Exosc2
  • Exosc3
  • Exosc4
  • Exosc5
  • Exosc6
  • Exosc7
  • Exosc8
  • Exosc9
  • LOC103690064
  • LOC679140
  • Mapkapk2
  • Tis11
  • Tnpo1
  • Ttp
  • Xrn1
  • Ywhab
  • Zfp36
Rattus norvegicus (Norway rat)

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Last updated: August 19, 2024