GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 576 - 600 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▼ Organism GlyTouCan ID
Cargo concentration in the ER
  • Areg
  • Cd59
  • Cnih1
  • Cnih2
  • Cnih3
  • Col7a1
  • Ctsc
  • Ctsy
  • Ctsz
  • Ergic53
  • Ergl
  • F8
  • Folr1
  • GluA1
  • Glur1
  • Gosr2
  • Gria1
  • Gs27
  • Lman1
  • Lman1l
  • Lman2
  • Mcfd2
  • Mia2
  • Mia3
  • Preb
  • Rnp24
  • Sar1b
  • Sdgf
  • Sdnsf
  • Sec12
  • Sec22b
  • Sec22l1
  • Sec23a
  • Sec24a
  • Sec24b
  • Sec24c
  • Sec24d
  • Serpina1
  • Stx5
  • Stx5a
  • Tgfa
  • Tmed10
  • Tmed2
  • Tmp21
Rattus norvegicus (Norway rat)
EGFR interacts with phospholipase C-gamma
  • Areg
  • Btc
  • Dtr
  • Egf
  • Egfr
  • Ereg
  • Hbegf
  • Hegfl
  • Plcg1
  • Sdgf
  • Tgfa
Rattus norvegicus (Norway rat)
GRB2 events in EGFR signaling
  • Areg
  • Ash
  • Btc
  • Dtr
  • Egf
  • Egfr
  • Ereg
  • Grb2
  • Hbegf
  • Hegfl
  • Hras
  • Hras1
  • Kras
  • Kras2
  • Nras
  • Sdgf
  • Sos1
  • Tgfa
Rattus norvegicus (Norway rat)
SHC1 events in EGFR signaling
  • Areg
  • Ash
  • Btc
  • Dtr
  • Egf
  • Egfr
  • Ereg
  • Grb2
  • Hbegf
  • Hegfl
  • Hras
  • Hras1
  • Kras
  • Kras2
  • Nras
  • Sdgf
  • Shc1
  • Sos1
  • Tgfa
Rattus norvegicus (Norway rat)
GAB1 signalosome
  • Areg
  • Ash
  • Btc
  • Cbp
  • Csk
  • Dtr
  • Egf
  • Egfr
  • Ereg
  • Gab1
  • Grb2
  • Hbegf
  • Hegfl
  • Pag
  • Pag1
  • Pik3ca
  • Pik3r1
  • Ptpn11
  • Pxn
  • Sdgf
  • Src
  • Tgfa
Rattus norvegicus (Norway rat)
EGFR downregulation
  • Areg
  • Arhgef7
  • Ash
  • Btc
  • Cbl
  • Cdc42
  • Dtr
  • Egf
  • Egfr
  • Epn1
  • Eps15
  • Eps15l1
  • Ereg
  • Grb2
  • Hbegf
  • Hegfl
  • Hgs
  • Hrs
  • Hrs2
  • LOC100360645
  • Pak3bp
  • Pixb
  • Ptpn12
  • Ptpn3
  • Rps27a
  • Ruk
  • Sdgf
  • Seta
  • Sh3d2a
  • Sh3d2c1
  • Sh3gl1
  • Sh3gl2
  • Sh3gl3
  • Sh3kbp1
  • Sh3p13
  • Sh3p4
  • Sh3p8
  • Spry1
  • Spry2
  • Stam
  • Stam2
  • Tgfa
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Retrograde transport at the Trans-Golgi-Network
  • Are1
  • Arf7
  • Arfip2
  • Arfrp1
  • Arl1
  • Arp1
  • Cog1
  • Cog2
  • Cog3
  • Cog4
  • Cog5
  • Cog6
  • Cog7
  • Dbndd2
  • Erg1
  • Gcc1
  • Gcc185
  • Gcc2
  • Golga1
  • Golga4
  • Igf2r
  • M6pr
  • Napa
  • Napb
  • Napg
  • Nsf
  • RGD1310016
  • Rab43
  • Rab6
  • Rab6a
  • Rab6b
  • Rab9
  • Rab9a
  • Rab9b
  • Rabepk
  • Rgp1
  • Rhobtb3
  • Ric1
  • Sacm2l
  • Scoc
  • Scoco
  • Snap
  • Snapa
  • Snapb
  • Stx16
  • Stx6
  • Syb3
  • Sys1
  • Tmf1
  • Ttgn1
  • Usp6nl
  • Vamp3
  • Vamp4
  • Vps51
  • Vps52
  • Vps53
  • Vps54
  • Vps54l
  • Vti1a
  • Vti1l2
Rattus norvegicus (Norway rat)
COPI-dependent Golgi-to-ER retrograde traffic
  • Arcn1
  • Arf1
  • Arf1gap
  • Arf3
  • Arf4
  • Arf5
  • Arfgap1
  • Arfgap2
  • Arfgap3
  • Bnip1
  • Cenpe
  • Copa
  • Copb
  • Copb1
  • Copb2
  • Copd
  • Cope
  • Copg
  • Copg1
  • Copg2
  • Copz1
  • Copz2
  • Erg1
  • Gbf1
  • Kdelr1
  • Kdelr2
  • Kdelr3
  • Khc
  • Kif11
  • Kif12
  • Kif13b
  • Kif15
  • Kif16b
  • Kif18a
  • Kif18b
  • Kif19
  • Kif19a
  • Kif1a
  • Kif1b
  • Kif1c
  • Kif1d
  • Kif2
  • Kif20b
  • Kif21a
  • Kif21b
  • Kif22
  • Kif23
  • Kif26a
  • Kif26b
  • Kif27
  • Kif28p
  • Kif2a
  • Kif2b
  • Kif2c
  • Kif3a
  • Kif3b
  • Kif3c
  • Kif4a
  • Kif4b
  • Kif5a
  • Kif5b
  • Kif6
  • Kif9
  • Kifap3
  • Kifc1
  • Kifc2
  • Klc
  • Klc1
  • Klc2
  • Klc3
  • Klc4
  • Klp2
  • Klp6
  • Kns2
  • Knsl8
  • Krp1
  • Krp2
  • Napa
  • Napb
  • Napg
  • Nbas
  • Nsf
  • Rab1
  • Rab1A
  • Rab1b
  • Racgap1
  • Rint1
  • Rnp24
  • Sec20l
  • Sec22b
  • Sec22l1
  • Snap
  • Snapa
  • Snapb
  • Stx18
  • Tmed10
  • Tmed2
  • Tmed3
  • Tmed7
  • Tmed9
  • Tmp21
  • Use1
  • Zfp289
  • Znf289
  • Zw10
Rattus norvegicus (Norway rat)
Activated PKN1 stimulates transcription of AR (androgen receptor) regulated genes KLK2 and KLK3
  • Ar
  • ENSRNOG00000062927
  • ENSRNOG00000064540
  • ENSRNOG00000066901
  • ENSRNOG00000068034
  • H2ab3
  • H2ac10
  • H2ac18
  • H2ac4
  • H2afb3
  • H2afx
  • H2aj
  • H2ax
  • H2az2
  • H2bc1
  • H2bc12l1
  • H2bc6
  • H2bcl1
  • H2bcl2
  • H2bu1
  • H3-3b
  • H3.3b
  • H3c13
  • H3f3b
  • H4c16
  • H4c2
  • H4f16
  • H4ft
  • Hist1h2ba
  • Hist1h2bc
  • Hist1h2bg
  • Hist1h2bo
  • Hist1h2bq
  • Hist1h4b
  • Hist1h4m
  • Hist2h2aa3
  • Hist2h3c2
  • Hist4
  • Hist4h4
  • Kdm1a
  • Kdm4c
  • LOC100365043
  • LOC100910200
  • LOC120097726
  • LOC684797
  • Ncoa2
  • Nr3c4
  • Pkn
  • Pkn1
  • Prk1
  • Prkcl1
  • Th2b
  • Tif2
Rattus norvegicus (Norway rat)
SUMOylation of intracellular receptors
  • Ar
  • Bar
  • C-erba-alpha
  • Erba2
  • Esr
  • Esr1
  • Estr
  • Ftzf1
  • Fxr
  • Grl
  • Hdac4
  • Lxra
  • Lxrb
  • Miz1
  • Mlr
  • Nr1a1
  • Nr1a2
  • Nr1c1
  • Nr1h2
  • Nr1h3
  • Nr1h4
  • Nr1i1
  • Nr1i2
  • Nr2b1
  • Nr3a1
  • Nr3c1
  • Nr3c2
  • Nr3c3
  • Nr3c4
  • Nr5a1
  • Nr5a2
  • Pgr
  • Pias1
  • Pias2
  • Pias3
  • Pias4
  • Piasx
  • Ppar
  • Ppara
  • Pxr
  • Rara
  • Rip14
  • Rora
  • Rxra
  • Smt3a
  • Smt3h2
  • Sumo1
  • Sumo2
  • Sumo3
  • Thra
  • Thrb
  • Ubce9
  • Ube2i
  • Vdr
Rattus norvegicus (Norway rat)
Vasopressin regulates renal water homeostasis via Aquaporins
  • Aqp1
  • Aqp2
  • Aqp3
  • Aqp4
  • Avp
  • Avpr2
  • Chip28
  • Gnas
  • Gnas1
  • Gnb1
  • Gnb2
  • Gnb3
  • Gnb4
  • Gnb5
  • Gng10-ps1
  • Gng11
  • Gng12
  • Gng3
  • Gng4
  • Gng5
  • Gng5-ps4
  • Gng7
  • Gng8
  • Gng9
  • Gngt1
  • Gngt11
  • Gngt5
  • Gngt7
  • Gngt9
  • Myo5b
  • Pkacb
  • Prkaca
  • Prkacb
  • Prkar1a
  • Prkar1b
  • Prkar2a
  • Prkar2b
  • Rab11
  • Rab11a
  • Rab11fip2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Passive transport by Aquaporins
  • Aqp1
  • Aqp10
  • Aqp11
  • Aqp12a
  • Aqp2
  • Aqp3
  • Aqp4
  • Aqp5
  • Aqp7
  • Aqp8
  • Aqp9
  • Chip28
  • LOC686596
  • Mip
Rattus norvegicus (Norway rat)
FasL/ CD95L signaling
  • Apt1
  • Apt1Lg1
  • Casp8
  • Cd95l
  • Fadd
  • Fas
  • Fasl
  • Faslg
  • Tnfrsf6
  • Tnfsf6
Rattus norvegicus (Norway rat)
Regulation of KIT signaling
  • Aps
  • Ash
  • Cbl
  • Fyn
  • Grb2
  • KIT
  • Kit
  • Kitl
  • Kitlg
  • Lck
  • Lyn
  • Mgf
  • Pkca
  • Prkca
  • Ptph6
  • Ptpn6
  • Sh2b2
  • Sos1
  • Src
  • Yes1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Ligand-independent caspase activation via DCC
  • Appl1
  • Casp3
  • Casp9
  • Cpp32
  • Dcc
  • RNCASP9
Rattus norvegicus (Norway rat)
Transport of fatty acids
  • Apod
  • Fatp
  • Fatp1
  • Lcn12
  • Lcn9
  • Slc27a1
  • Slc27a4
  • Slc27a6
  • Vegp
  • Vegp1
  • Vegp2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Scavenging by Class H Receptors
  • Apob
  • Sparc
  • Stab1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Platelet sensitization by LDL
  • Apob
  • Cpla2
  • Csbp1
  • Csbp2
  • Fgr
  • LOC100909468
  • Lrp8
  • Mapk14
  • Pecam
  • Pecam1
  • Pla2g4
  • Pla2g4a
  • Ppp2ca
  • Ppp2cb
  • Ppp2r1a
  • Ppp2r1b
  • Ppp2r5a
  • Ppp2r5b
  • Ppp2r5c
  • Ppp2r5d
  • Ppp2r5e
  • Ptph6
  • Ptpn11
  • Ptpn6
Rattus norvegicus (Norway rat)
Regulation of TLR by endogenous ligand
  • Apob
  • Cd14
  • Cd36
  • Fat
  • Fga
  • Fgb
  • Fgg
  • Gsdmd
  • Gsdme
  • Hmg-1
  • Hmg1
  • Hmgb1
  • Hmgb1-ps33
  • Hmgb1-ps4
  • Hmgb1l1
  • Hmgb1l2
  • Hmgb1l3
  • Hmgb1l5
  • LOC108349189
  • LOC108350839
  • Lbp
  • Ly96
  • Mrp14
  • Mrp8
  • S100a1
  • S100a8
  • S100a9
  • Tlr1
  • Tlr2
  • Tlr4
  • Tlr6
  • Tlr7
Rattus norvegicus (Norway rat)
Chylomicron clearance
  • Apob
  • Apoe
  • Arh
  • Ldlr
  • Ldlrap1
  • Lipc
Rattus norvegicus (Norway rat)
VLDL assembly
  • Apob
  • Apoc1
  • Apoc4
  • Ecl
  • Mtp
  • Mttp
  • P4hb
  • Pdia1
Rattus norvegicus (Norway rat)
VLDL clearance
  • Apob
  • Apobr
  • Apoc1
  • Apoc4
  • Ecl
  • Vldlr
Rattus norvegicus (Norway rat)
Scavenging by Class B Receptors
  • Apoa1
  • Apob
  • Cd36
  • Fat
  • Scarb1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Heme signaling
  • Apoa1
  • Apob
  • Bach1
  • Clec1b
  • Crm1
  • Hba-a1
  • Hba1
  • Hbb
  • Hcp1
  • LOC100911490
  • Ly96
  • Pcft
  • Pgrmc2
  • Slc46a1
  • Tlr4
  • Xpo1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Scavenging by Class A Receptors
  • Apoa1
  • Apob
  • Apoe
  • Calr
  • Grp94
  • Hsp90b1
  • Hspc4
  • Marco
  • Msr1
  • Scgb3a2
  • Tra1
Rattus norvegicus (Norway rat)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Last updated: August 19, 2024