GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 701 - 725 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▼ Organism GlyTouCan ID
Regulation of TP53 Activity through Acetylation
  • Akt1
  • Akt2
  • Akt3
  • Brd1
  • Brd7
  • Brpf1
  • Brpf3
  • Chd3
  • Chd4
  • Ep300
  • Gatad2a
  • Gatad2b
  • Hdac1
  • Hdac2
  • Ing5
  • Kat6a
  • Mbd3
  • Meaf6
  • Moz
  • Mta2
  • Myst3
  • P53
  • Pml
  • Rbbp4
  • Rbbp7
  • Tp53
Rattus norvegicus (Norway rat)
Regulation of TP53 Degradation
  • Akt1
  • Akt2
  • Akt3
  • Atm
  • Ccna1
  • Ccna2
  • Ccng
  • Ccng1
  • Cdc2
  • Cdc2a
  • Cdk1
  • Cdk2
  • Cdkn1
  • Cdkn2
  • Daxx
  • Frap1
  • Gbl
  • Hausp
  • LOC100360645
  • Lst8
  • Mapkap1
  • Mdm2
  • Mdm4
  • Mdmx
  • Mip1
  • Mlst8
  • Mtor
  • P53
  • Pdk1
  • Pdpk1
  • Phf20
  • Ppp2ca
  • Ppp2cb
  • Ppp2r1a
  • Ppp2r1b
  • Ppp2r5c
  • Protor1
  • Prr5
  • Raft1
  • Rffl
  • Rictor
  • Rnf34
  • Rps27a
  • Sgk
  • Sgk1
  • Sin1
  • Tp53
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Ubp41
  • Ubp69
  • Usp2
  • Usp7
Rattus norvegicus (Norway rat)
FLT3 Signaling
  • Akt1
  • Akt2
  • Akt3
  • Ash
  • Flt3
  • Foxo3
  • Gab2
  • Grb10
  • Grb2
  • Hras
  • Hras1
  • Kras
  • Kras2
  • Nras
  • Pik3ca
  • Pik3r1
  • Sos1
Rattus norvegicus (Norway rat)
G beta:gamma signalling through PI3Kgamma
  • Akt1
  • Akt2
  • Akt3
  • Arha
  • Arha2
  • Gnb1
  • Gnb2
  • Gnb3
  • Gnb4
  • Gnb5
  • Gng10-ps1
  • Gng11
  • Gng12
  • Gng3
  • Gng4
  • Gng5
  • Gng5-ps4
  • Gng7
  • Gng8
  • Gng9
  • Gngt1
  • Gngt11
  • Gngt5
  • Gngt7
  • Gngt9
  • Pdk1
  • Pdpk1
  • Pik3cg
  • Pik3r5
  • Pik3r6
  • Rhoa
Rattus norvegicus (Norway rat)
Regulation of PTEN stability and activity
  • Akt1
  • Akt2
  • Akt3
  • Api3
  • Birc4
  • Ck2n
  • Csnk2a1
  • Csnk2a2
  • Csnk2b
  • Frk
  • Gask
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mecl1
  • Mkrn1
  • Mss1
  • Nedd4
  • Nedd4a
  • Otud3
  • Prex2
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Pten
  • Ring12
  • Rnf146
  • Rpf1
  • Rps27a
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Tnks
  • Tnks2
  • Trim27
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Usp13
  • Wwp2
  • Xiap
Rattus norvegicus (Norway rat)
MTOR signalling
  • Akt1
  • Akt1s1
  • ENSRNOG00000066475
  • Frap1
  • Gbl
  • Lamtor1
  • Lamtor3
  • Lamtor4
  • Lamtor5
  • Lst8
  • Map2k1ip1
  • Mlst8
  • Mtor
  • Raft1
  • Rheb
  • Rptor
  • RragB
  • Rraga
  • Rragc
  • Rragc_predicted
  • Rragd
  • Slc38a9
  • Ywhab
Rattus norvegicus (Norway rat)
AKT phosphorylates targets in the cytosol
  • Akt1
  • Akt1s1
  • Akt2
  • Akt3
  • Casp9
  • Cdkn1a
  • Cdkn1b
  • Chuk
  • Mdm2
  • Mkrn1
  • RNCASP9
  • Tsc2
  • p27Kip1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Synthesis of Prostaglandins (PG) and Thromboxanes (TX)
  • Akr1c1
  • Akr1c21
  • Cbr
  • Cbr1
  • Cox-1
  • Cox-2
  • Cox1
  • Cox2
  • Cyp5
  • Cyp5a1
  • Cyp8
  • Cyp8b1
  • Gsts
  • Hpgds
  • Hsd17b5
  • Pgds
  • Pges
  • Pig12
  • Ptgds
  • Ptgds2
  • Ptges
  • Ptges2
  • Ptges3
  • Ptgis
  • Ptgs1
  • Ptgs2
  • Tbxas1
  • Tebp
Rattus norvegicus (Norway rat)
Synthesis of bile acids and bile salts via 27-hydroxycholesterol
  • Akr1c1
  • Akr1c21
  • Akr1d1
  • Bar
  • Cca2
  • Cyp27
  • Cyp27a1
  • Cyp7
  • Cyp7a1
  • Cyp7b1
  • Cyp8
  • Cyp8b1
  • Fxr
  • Hsd17b5
  • Hsd3b7
  • Ncoa1
  • Ncoa2
  • Nr1h4
  • Nr2b1
  • Ptgis
  • Rip14
  • Rxra
  • Tif2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Fructose biosynthesis
  • Akr1b1
  • Akr1b4
  • Aldr1
  • Sdh1
  • Sord
Rattus norvegicus (Norway rat)
Formation of xylulose-5-phosphate
  • Akr1a1
  • Alr
  • Cry
  • Cryl1
  • Dcxr
  • Glb
  • Sdh1
  • Sord
  • Xylb
Rattus norvegicus (Norway rat)
Intra-Golgi traffic
  • Akp3
  • Alpi
  • Alpp
  • Arf1
  • Bet1l
  • Cog1
  • Cog2
  • Cog3
  • Cog4
  • Cog5
  • Cog6
  • Cog7
  • Cyth1
  • Cyth2
  • Cyth3
  • Cyth4
  • Erg1
  • Gosr1
  • Gosr2
  • Gs15
  • Gs27
  • Gs28
  • Napa
  • Napb
  • Napg
  • Nsf
  • Pscd1
  • Pscd2
  • Pscd3
  • RGD1310016
  • Rab30
  • Rab33b
  • Rab36
  • Rab39a
  • Rgp1
  • Ric1
  • Sec7a
  • Sec7b
  • Sec7c
  • Snap
  • Snap29
  • Snapa
  • Snapb
  • Stx16
  • Stx5
  • Stx5a
  • Stx6
  • Trip11
  • Vps45
  • Vps45a
  • Vti1a
  • Vti1l2
  • Ykt6
Rattus norvegicus (Norway rat)
Post-translational modification: synthesis of GPI-anchored proteins
  • Akp3
  • Alpi
  • Alpl
  • Alpp
  • Art3
  • Art4
  • Bst1
  • C4.4a
  • Cd109
  • Cd52
  • Cdw52
  • Ceacam1
  • Ceacam6
  • Cgm4
  • Cntn3
  • Cntn4
  • Cntn5
  • Cpm
  • Erc
  • Fcgr3a
  • Fcgr4
  • Folr2
  • Folr4
  • Gp2
  • Gpihbp1
  • Gpld1
  • Hnt
  • Izumo1r
  • LOC100910068
  • LOC292666
  • Lamp
  • Lsamp
  • Ly6d
  • Ly6e
  • Ly6g6c
  • Ly6g6d
  • Ly6h
  • Ly6k
  • Lypd1
  • Lypd2
  • Lypd3
  • Lypd4
  • Lypd5
  • Lypd6b
  • Lypd8
  • Lypdc1
  • Mdga1
  • Meltf
  • Mfi2
  • Mpf
  • Msln
  • Negr1
  • Ngrh1
  • Nrn1
  • Nt
  • Ntm
  • Obcam
  • Opcml
  • Otoa
  • Plet1
  • Prnd
  • Prss21
  • Prss41
  • Psca
  • Psg29
  • Psgb1
  • Rb7
  • Reck
  • Rtn4rl2
  • Spaca4
  • Sprn
  • Tecta
  • Tectb
  • Tex101
  • Thy-1
  • Thy1
  • Vnn1
  • Xpnpep2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Phase 3 - rapid repolarisation
  • Akap9
  • Erg
  • Kcna5
  • Kcna9
  • Kcne1l
  • Kcne2
  • Kcne3
  • Kcne4
  • Kcne5
  • Kcnh2
  • Kcnq1
  • Kvlqt1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Phase 2 - plateau phase
  • Akap9
  • Cach2
  • Cacn2
  • Cacna1c
  • Cacna2d2
  • Cacnb1
  • Cacnb2
  • Cacng4
  • Cacng6
  • Cacng7
  • Cacng8
  • Cacnl1a1
  • Cacnlb1
  • Cacnlb2
  • Cchl1a1
  • Kcna9
  • Kcne1l
  • Kcne2
  • Kcne3
  • Kcne4
  • Kcne5
  • Kcnq1
  • Kvlqt1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Trafficking of AMPA receptors
  • Akap150
  • Akap5
  • Cacng2
  • Cacng3
  • Cacng4
  • Cacng8
  • Camk2a
  • Camk2b
  • Camk2d
  • Camk2g
  • Dlg1
  • Dlg4
  • Dlgh1
  • Dlgh4
  • Epb4.1l1
  • Epb41l1
  • GluA1
  • GluA3
  • Glur1
  • Glur3
  • Glur4
  • Gria1
  • Gria3
  • Gria4
  • Mdm2
  • Myo6
  • Psd95
  • Stg
Rattus norvegicus (Norway rat)
Factors involved in megakaryocyte development and platelet production
  • Ak3
  • Ak3l1
  • Akap
  • Akap1
  • Akap10
  • Akl3l
  • Aps
  • Capza1
  • Capza2
  • Capzb
  • Carmil1
  • Cbx5
  • Cdc42
  • Dock10
  • Dock11
  • Dock2
  • Dock3
  • Dock4
  • Dock5
  • Dock6
  • Dock7
  • Dock8
  • Ehd1
  • Ehd2
  • Ehd3
  • Fzo1a
  • Fzo1b
  • Gata1
  • Gata2
  • Gata4
  • Gata6
  • H3-3b
  • H3.3b
  • H3c13
  • H3f3b
  • Hdac1
  • Hdac2
  • Hist2h3c2
  • Hmg20b
  • Itpk1
  • Jak2
  • Jmjd1c
  • Kdm1a
  • Maff
  • Mafg
  • Mfn1
  • Mfn2
  • Nfe2
  • Phf21a
  • Pkacb
  • Prkaca
  • Prkacb
  • Prkar1a
  • Prkar1b
  • Prkar2a
  • Prkar2b
  • Rab5a
  • Rac
  • Rac1
  • Rad51b
  • Rad51c
  • Rbsn
  • Rcor1
  • Sh2-b
  • Sh2b1
  • Sh2b2
  • Sh2bpsm1
  • Vps45
  • Vps45a
  • Zfpm1
  • Zfpm2
  • Zfyve20
Rattus norvegicus (Norway rat)
Interconversion of nucleotide di- and triphosphates
  • Ak1
  • Ak2
  • Ak3l1
  • Ak4
  • Ak5
  • Ak6
  • Ak7
  • Ak8
  • Ak9
  • Akd2
  • Cinap
  • Cmpk
  • Cmpk1
  • Ctps1
  • Ctps2
  • Dctd
  • Dtymk
  • Dut
  • Dutp
  • Glrx
  • Glrx1
  • Grx
  • Gsr
  • Guk1
  • Nme1
  • Nme2
  • Nme3
  • Nudt13
  • RGD1559879
  • Rrm1
  • Rrm2
  • Rrm2b
  • Trxr1
  • Txn
  • Txn1
  • Txnrd1
  • Tyms
Rattus norvegicus (Norway rat)
Oxygen-dependent proline hydroxylation of Hypoxia-inducible Factor Alpha
  • Ajuba
  • Cul2
  • Egln1
  • Egln2
  • Egln3
  • Elob
  • Eloc
  • Epas1
  • Hif1a
  • Hif2a
  • Hif3a
  • Jub
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • Limd1
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mecl1
  • Mss1
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Rbx1
  • Ring12
  • Rps27a
  • Sm20
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Tceb1
  • Tceb2
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubc4
  • Ubcep1
  • Ubch4
  • Ubch5b
  • Ubcl1
  • Ube2d1
  • Ube2d2
  • Ube2d3
  • Vhl
  • Wtip
Rattus norvegicus (Norway rat)
RIPK1-mediated regulated necrosis
  • Aip1
  • Flot1
  • Flot2
  • Mlkl
  • Pdcd6ip
  • Reg1
  • Reg2
  • Rip3
  • Ripk1
  • Ripk3
  • Sdcbp
Rattus norvegicus (Norway rat)
Regulation of necroptotic cell death
  • Aip1
  • Api3
  • Birc2
  • Birc3
  • Birc4
  • Casp8
  • Cdc37
  • Fadd
  • Flot1
  • Flot2
  • Hsp86
  • Hsp90aa1
  • Hspca
  • Itch
  • LOC100360645
  • Mlkl
  • NEWGENE_1308361
  • Ogt
  • Park2
  • Pdcd6ip
  • Prkn
  • Reg1
  • Reg2
  • Rip3
  • Ripk1
  • Ripk3
  • Rps27a
  • Sdcbp
  • Tradd
  • Traf2
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Ube2l3
  • Xiap
Rattus norvegicus (Norway rat)
Transcriptional and post-translational regulation of MITF-M expression and activity
  • Aimp1
  • Aimp2
  • Cbp
  • Crebbp
  • Crm1
  • Dars
  • Dars1
  • Drs1
  • Eef1e1
  • Eprs
  • Eprs1
  • Erk1
  • Erk2
  • Gsk3b
  • Hint
  • Hint1
  • Iars1
  • Jtv1
  • KIT
  • Kars
  • Kars1
  • Kit
  • Kitl
  • Kitlg
  • Lars
  • Lars1
  • Mapk
  • Mapk1
  • Mapk3
  • Mapkapk1a
  • Mars1
  • Mgf
  • Mitf
  • Pkci1
  • Prkm1
  • Prkm3
  • Qars
  • Qars1
  • Rars
  • Rars1
  • Rps6ka1
  • Rsk1
  • Wnt3a
  • Xpo1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA
  • Aim2
  • Mre11
  • Mre11a
Rattus norvegicus (Norway rat)
Costimulation by the CD28 family
  • Ailim
  • Ash
  • Btla
  • Grb2
  • Icos
  • Icoslg
  • Pik3ca
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Pik3r3
  • Ptph6
  • Ptpn11
  • Ptpn6
  • Tnfrsf14
Rattus norvegicus (Norway rat)
PI5P, PP2A and IER3 Regulate PI3K/AKT Signaling
  • Ailim
  • Akt1
  • Areg
  • Ash
  • Btc
  • Cd19
  • Cd28
  • Cd80
  • Cd86
  • Dtr
  • Egf
  • Egfr
  • Erbb2
  • Erbb3
  • Erbeta
  • Ereg
  • Erk1
  • Erk2
  • Esr
  • Esr1
  • Esr2
  • Estr
  • FGF15
  • FGF22
  • FGF6
  • Fgf-1
  • Fgf-2
  • Fgf-5
  • Fgf-7
  • Fgf-9
  • Fgf1
  • Fgf10
  • Fgf16
  • Fgf17
  • Fgf18
  • Fgf19
  • Fgf2
  • Fgf20
  • Fgf22
  • Fgf23
  • Fgf3
  • Fgf4
  • Fgf5
  • Fgf5c
  • Fgf5d
  • Fgf6
  • Fgf7
  • Fgf7a
  • Fgf7b
  • Fgf8
  • Fgf8a
  • Fgf9
  • Fgfa
  • Fgfr1
  • Fgfr2
  • Fgfr3
  • Fgfr4
  • Fit1
  • Flg
  • Flt3
  • Frs2
  • Fyn
  • Gab1
  • Gab2
  • Grb2
  • Hbegf
  • Hegfl
  • Hgf
  • Icos
  • Il1rap
  • Il1rl1
  • Il33
  • Ins-1
  • Ins1
  • Insr
  • Irak1
  • Irak4
  • Irs-1
  • Irs1
  • Irs2
  • KIT
  • Kgf
  • Kit
  • Kitl
  • Kitlg
  • Kl
  • Klb
  • LOC100361758
  • LOC100909468
  • Lck
  • Mapk
  • Mapk1
  • Mapk3
  • Met
  • Mgf
  • Myd88
  • Ndf
  • Neu
  • Nr3a1
  • Nr3a2
  • Nrg1
  • Nrg2
  • Nrg3
  • Ntak
  • Pdgfa
  • Pdgfb
  • Pdgfr
  • Pdgfr1
  • Pdgfra
  • Pdgfrb
  • Pik3ap1
  • Pik3ca
  • Pik3cb
  • Pik3cd
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Pik3r3
  • Pip4k2a
  • Pip4k2b
  • Pip4k2c
  • Pip4ka
  • Pip5k1a
  • Pip5k1b
  • Pip5k1c
  • Pip5k2a
  • Pip5k2b
  • Pip5k2c
  • Ppp2ca
  • Ppp2cb
  • Ppp2r1a
  • Ppp2r1b
  • Ppp2r5a
  • Ppp2r5b
  • Ppp2r5c
  • Ppp2r5d
  • Ppp2r5e
  • Prkm1
  • Prkm3
  • Ptpn11
  • Rac
  • Rac1
  • Rac2
  • Rhog
  • Rpa1
  • Sdgf
  • Src
  • Strn
  • Tgfa
  • Traf6
  • Trat1
  • Vav
  • Vav1
Rattus norvegicus (Norway rat)

About Release Notes Help Feedback

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GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

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Last updated: August 19, 2024