GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 701 - 725 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
AURKA Activation by TPX2
  • AABR07000222.1
  • Actr1a
  • Aik
  • Airk1
  • Akap9
  • Alms1
  • Ark1
  • Aura
  • Aurka
  • Ayk1
  • Azi1
  • Btak
  • Ccdc5
  • Ccp110
  • Cdc2
  • Cdc2a
  • Cdk1
  • Cdk5rap2
  • Cdkn1
  • Cenpj
  • Cep131
  • Cep135
  • Cep152
  • Cep164
  • Cep192
  • Cep250
  • Cep290
  • Cep41
  • Cep43
  • Cep57
  • Cep63
  • Cep70
  • Cep72
  • Cep76
  • Cep78
  • Cetn2
  • Ck1e-2
  • Ckap5
  • Clasp1
  • Csnk1d
  • Csnk1e
  • Ctrn1
  • Dctn1
  • Dctn2
  • Dctn3l1
  • Dhc1
  • Dnch1
  • Dnchc1
  • Dnci2
  • Dncic2
  • Dncl1
  • Dnclc1
  • Dnec1
  • Dyhc
  • Dync1h1
  • Dync1i2
  • Dynll1
  • Fgfr1op
  • Haus1
  • Haus4
  • Haus5
  • Haus6
  • Haus7
  • Haus8
  • Hckid
  • Hice1
  • Hsp86
  • Hsp90aa1
  • Hspca
  • Iak1
  • LOC309692
  • Lis-1
  • Lis1
  • Map1c
  • Mapre1
  • Nde1
  • Nedd1
  • Nek2l1
  • Ninl
  • Nude
  • Nude1
  • Ny-sar-48
  • Odf2
  • Odf84
  • Ofd1
  • Pafah1b1
  • Pafaha
  • Pcm1
  • Pcnt
  • Pin
  • Plk
  • Plk1
  • Plk4
  • Ppp2r1a
  • Prkaca
  • Prkar2b
  • Sak
  • Sdccag8
  • Sfi1
  • Ssna1
  • Stk15
  • Stk6
  • Tpx2
  • Tsga14
  • Tuba1
  • Tuba1a
  • Tuba4
  • Tuba4a
  • Tubb2c
  • Tubb4b
  • Tubb5
  • Tubg
  • Tubg1
  • Ywhae
  • Ywhag
Rattus norvegicus (Norway rat)
Recognition and association of DNA glycosylase with site containing an affected purine
  • Acd
  • ENSRNOG00000062927
  • ENSRNOG00000064540
  • ENSRNOG00000066901
  • ENSRNOG00000068034
  • H2ab3
  • H2ac10
  • H2ac18
  • H2ac4
  • H2afb3
  • H2afx
  • H2aj
  • H2ax
  • H2az2
  • H2bc1
  • H2bc12l1
  • H2bc6
  • H2bcl1
  • H2bcl2
  • H2bu1
  • H4c16
  • H4c2
  • H4f16
  • H4ft
  • Hist1h2ba
  • Hist1h2bc
  • Hist1h2bg
  • Hist1h2bo
  • Hist1h2bq
  • Hist1h4b
  • Hist1h4m
  • Hist2h2aa3
  • Hist4
  • Hist4h4
  • LOC100365043
  • LOC100910200
  • LOC120097726
  • LOC684797
  • Mmh
  • Neil3
  • Ogg1
  • Ogh1
  • Pot1
  • Rap1
  • Terf2
  • Terf2ip
  • Th2b
Rattus norvegicus (Norway rat)
Nonsense Mediated Decay (NMD) enhanced by the Exon Junction Complex (EJC)
  • AABR07029195.1
  • AABR07031505.1
  • AABR07060610.1
  • AABR07064810.1
  • AABR07071986.1
  • AABR07072260.1
  • Arbp
  • Casc3
  • Cbp20
  • Cbp80
  • Dcp1a
  • Ddx48
  • ENSRNOG00000068086
  • Eif4a3
  • Eif4g1
  • Etf1
  • Fau
  • Fte-1
  • Fte1
  • Gspt1
  • Gspt2
  • LOC100360645
  • LOC100361060
  • LOC100361854
  • LOC100361933
  • LOC100910714
  • LOC102550668
  • LOC103692829
  • LOC108351255
  • LOC120093247
  • LOC120094652
  • LOC120097744
  • LOC120099964
  • LOC120103572
  • Lamr1
  • Magoh
  • Magohb
  • Mln51
  • Ncbp1
  • Ncbp2
  • Pabp1
  • Pabpc1
  • Pnrc2
  • Ppp2ca
  • Ppp2r1a
  • Ppp2r2a
  • RGD1562402
  • RGD1563956
  • RGD1564606
  • Rbm8
  • Rbm8a
  • Rig
  • Rnps1
  • Rp2
  • Rpl1
  • Rpl10
  • Rpl10a
  • Rpl10l
  • Rpl10l1
  • Rpl11
  • Rpl12
  • Rpl12-ps2
  • Rpl12l2
  • Rpl13
  • Rpl13a
  • Rpl14
  • Rpl15
  • Rpl17
  • Rpl18
  • Rpl18a
  • Rpl19
  • Rpl21
  • Rpl21-ps26
  • Rpl21l2
  • Rpl21l3
  • Rpl21l5
  • Rpl22
  • Rpl23
  • Rpl23al1
  • Rpl24
  • Rpl26
  • Rpl27
  • Rpl27a
  • Rpl27al3
  • Rpl28
  • Rpl29
  • Rpl3
  • Rpl30
  • Rpl31
  • Rpl32
  • Rpl34
  • Rpl34-ps1
  • Rpl34l1
  • Rpl34l2
  • Rpl35
  • Rpl35al8
  • Rpl36a
  • Rpl36al-ps5
  • Rpl36al1
  • Rpl36l3
  • Rpl37
  • Rpl37l4
  • Rpl38
  • Rpl39
  • Rpl39l1
  • Rpl3l
  • Rpl4
  • Rpl44
  • Rpl5
  • Rpl6
  • Rpl7
  • Rpl7a
  • Rpl8
  • Rpl9
  • Rpl9l2
  • Rplp0
  • Rplp1
  • Rplp2
  • Rps10
  • Rps11
  • Rps12l8
  • Rps13
  • Rps14
  • Rps15
  • Rps15a
  • Rps16
  • Rps17
  • Rps18
  • Rps19
  • Rps2
  • Rps20
  • Rps21
  • Rps23
  • Rps24
  • Rps25
  • Rps26
  • Rps26-ps13
  • Rps26l2
  • Rps26l4
  • Rps26l6
  • Rps27
  • Rps27a
  • Rps27l
  • Rps28
  • Rps29
  • Rps3
  • Rps3a
  • Rps4
  • Rps4x
  • Rps4y2
  • Rps5
  • Rps6
  • Rps7
  • Rps7-ps23
  • Rps8
  • Rps9
  • Rpsa
  • S27-1
  • Smg1
  • Smg5
  • Smg6
  • Smg7
  • Smg8
  • Smg9
  • Uba80
  • Ubbl1
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Upf1
  • Upf2
  • Upf3a
  • Upf3b
Rattus norvegicus (Norway rat)
Intestinal lipid absorption
  • Npc1l1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Glycogen synthesis
  • Gbe1
  • Gyg
  • Gyg1
  • Gys1
  • Pgm1
  • Ppp1r3c
  • Ppp1r5
  • Ugp2
Rattus norvegicus (Norway rat)
APAP ADME
  • Aac1
  • Aac2
  • Abcc1
  • Abcc2
  • Abcc3
  • Abcc4
  • Abcc5
  • Abcg2
  • Acy1
  • Acy1a
  • Bcrp1
  • Cmoat
  • Cmoat2
  • Cmrp
  • Cndp2
  • Cyp2e
  • Cyp2e-1
  • Cyp2e1
  • Ggt
  • Ggt1
  • Ggt5
  • Ggt6
  • Ggt7
  • Ggtl3
  • Ggtla1
  • Gstm2
  • Gstp1
  • Gstt1
  • Mlp2
  • Mrp1
  • Mrp2
  • Mrp3
  • Mrp4
  • Mrp5
  • Nat1
  • Nat2
  • Nat3
  • RGD1559459
  • Smp2a
  • St1a1
  • St2a1
  • St2a2
  • Sult1a1
  • Sult2a1
  • Sult2a2
  • Sult2a6
  • Udpgtr2
  • Ugt1
  • Ugt1a1
  • Ugt1a6
  • Ugt1a7
  • Ugt1a7c
  • Ugt1a8
  • Ugt2b
  • Ugt2b1
  • Ugt2b12
  • Ugt2b15
  • Ugt2b17
  • Ugt2b2
  • Ugt2b3
  • Ugt2b34l1
  • Ugt2b36
  • Ugt2b37
  • Ugt2b4
  • Ugt2b5
  • Ugt2b6
  • Ugt2b7
  • Ugt2b8
Rattus norvegicus (Norway rat)
Activation of BIM and translocation to mitochondria
  • Bcl2l11
  • Bim
  • Bod
  • Dncl1
  • Dnclc1
  • Dynll1
  • Jnk1
  • Mapk8
  • Pin
  • Prkm8
Rattus norvegicus (Norway rat)
Sema4D mediated inhibition of cell attachment and migration
  • Arha
  • Arha2
  • Arhgap35
  • Grlf1
  • Met
  • P190A
  • Plxnb1
  • Rac
  • Rac1
  • Rhoa
  • Rnd1
  • Rras
  • Sema4d
  • p190ARHOGAP
Rattus norvegicus (Norway rat)
TWIK-releated acid-sensitive K+ channel (TASK)
  • Kcnk3
  • Kcnk9
  • Task
  • Task1
  • Task3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Notch-HLH transcription pathway
  • Cbp
  • Crebbp
  • HDAC9
  • Hdac1
  • Hdac10
  • Hdac11
  • Hdac2
  • Hdac3
  • Hdac4
  • Hdac5
  • Hdac8
  • Hdac9
  • Kat2a
  • Kat2b
  • LOC687001
  • Maml1
  • Maml2
  • Maml3
  • Ncor2
  • Notch3
  • Rbpj
  • Snw1
  • Tbl1x
  • Tbl1xr1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Fatty Acids bound to GPR40 (FFAR1) regulate insulin secretion
  • Ffar1
  • Gna11
  • Gna14
  • Gna15
  • Gnaq
  • Gpr40
  • Plcb1
  • Plcb2
  • Plcb3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Cleavage of the damaged purine
  • Acd
  • ENSRNOG00000062927
  • ENSRNOG00000064540
  • ENSRNOG00000066901
  • ENSRNOG00000068034
  • H2ab3
  • H2ac10
  • H2ac18
  • H2ac4
  • H2afb3
  • H2afx
  • H2aj
  • H2ax
  • H2az2
  • H2bc1
  • H2bc12l1
  • H2bc6
  • H2bcl1
  • H2bcl2
  • H2bu1
  • H4c16
  • H4c2
  • H4f16
  • H4ft
  • Hist1h2ba
  • Hist1h2bc
  • Hist1h2bg
  • Hist1h2bo
  • Hist1h2bq
  • Hist1h4b
  • Hist1h4m
  • Hist2h2aa3
  • Hist4
  • Hist4h4
  • LOC100365043
  • LOC100910200
  • LOC120097726
  • LOC684797
  • Mmh
  • Mpg
  • Mutyh
  • Myh
  • Neil3
  • Ogg1
  • Ogh1
  • Pot1
  • Rap1
  • Terf2
  • Terf2ip
  • Th2b
Rattus norvegicus (Norway rat)
SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
  • AABR07029195.1
  • AABR07031505.1
  • AABR07060610.1
  • AABR07064810.1
  • AABR07071986.1
  • AABR07072260.1
  • Arbp
  • ENSRNOG00000068086
  • Fau
  • Fte-1
  • Fte1
  • LOC100360645
  • LOC100361060
  • LOC100361854
  • LOC100361933
  • LOC100910714
  • LOC102550668
  • LOC103692829
  • LOC108348180
  • LOC108351255
  • LOC120093247
  • LOC120094652
  • LOC120097744
  • LOC120099964
  • LOC120103572
  • Lamr1
  • RGD1562402
  • RGD1563956
  • RGD1564606
  • Rig
  • Rp2
  • Rpl1
  • Rpl10
  • Rpl10a
  • Rpl10l
  • Rpl10l1
  • Rpl11
  • Rpl12
  • Rpl12-ps2
  • Rpl12l2
  • Rpl13
  • Rpl13a
  • Rpl14
  • Rpl15
  • Rpl17
  • Rpl18
  • Rpl18a
  • Rpl19
  • Rpl21
  • Rpl21-ps26
  • Rpl21l2
  • Rpl21l3
  • Rpl21l5
  • Rpl22
  • Rpl23
  • Rpl23al1
  • Rpl24
  • Rpl26
  • Rpl27
  • Rpl27a
  • Rpl27al3
  • Rpl28
  • Rpl29
  • Rpl3
  • Rpl30
  • Rpl31
  • Rpl32
  • Rpl34
  • Rpl34-ps1
  • Rpl34l1
  • Rpl34l2
  • Rpl35
  • Rpl35al8
  • Rpl36a
  • Rpl36al-ps5
  • Rpl36al1
  • Rpl36l3
  • Rpl37
  • Rpl37l4
  • Rpl38
  • Rpl39
  • Rpl39l1
  • Rpl3l
  • Rpl4
  • Rpl44
  • Rpl5
  • Rpl6
  • Rpl7
  • Rpl7a
  • Rpl8
  • Rpl9
  • Rpl9l2
  • Rplp0
  • Rplp1
  • Rplp2
  • Rps10
  • Rps11
  • Rps12l8
  • Rps13
  • Rps14
  • Rps15
  • Rps15a
  • Rps16
  • Rps17
  • Rps18
  • Rps19
  • Rps2
  • Rps20
  • Rps21
  • Rps23
  • Rps24
  • Rps25
  • Rps26
  • Rps26-ps13
  • Rps26l2
  • Rps26l4
  • Rps26l6
  • Rps27
  • Rps27a
  • Rps27l
  • Rps28
  • Rps29
  • Rps3
  • Rps3a
  • Rps4
  • Rps4x
  • Rps4y2
  • Rps5
  • Rps6
  • Rps7
  • Rps7-ps23
  • Rps8
  • Rps9
  • Rpsa
  • S27-1
  • Srp14
  • Srp19
  • Srp54
  • Srp68
  • Srp72
  • Srp9
  • Uba80
  • Ubbl1
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Dectin-2 family
  • Clec4d
  • Clec4e
  • Clecsf8
  • Clecsf9
  • Fce1g
  • Fcer1g
  • Fyn
  • Lyn
  • Mcl
  • Mincle
  • Plcg2
  • Syk
Rattus norvegicus (Norway rat)
RUNX1 regulates estrogen receptor mediated transcription
  • Aml1
  • Cbfa2
  • Cbfb
  • Esr
  • Esr1
  • Estr
  • Nr3a1
  • Runx1
Rattus norvegicus (Norway rat)
HATs acetylate histones
  • Atf2
  • Brd1
  • Brpf1
  • Brpf3
  • ENSRNOG00000064540
  • ENSRNOG00000066901
  • ENSRNOG00000068034
  • H2bc1
  • H2bc12l1
  • H2bc18
  • H2bc6
  • H2bcl1
  • H2bcl2
  • H2bu1
  • H3c13
  • H4c16
  • H4c2
  • H4f16
  • H4ft
  • Hat1
  • Hbo1
  • Hcfc1
  • Hist1h2ba
  • Hist1h2bc
  • Hist1h2bg
  • Hist1h2bo
  • Hist1h2bq
  • Hist1h4b
  • Hist1h4m
  • Hist2h3c2
  • Hist4
  • Hist4h4
  • Ing4
  • Ing5
  • Jade1
  • Jade2
  • Jade3
  • Kansl1
  • Kansl2
  • Kansl3
  • Kat6a
  • Kat6b
  • Kat7
  • Kat8
  • LOC100365043
  • LOC100910200
  • LOC100912338
  • LOC684797
  • Mcrs1
  • Meaf6
  • Moz
  • Msl1
  • Msl2
  • Msl3
  • Myst1
  • Myst2
  • Myst3
  • Ncoa1
  • Ncoa2
  • Nsl2
  • Nsl3
  • Ogt
  • Pax3
  • Phf15
  • Phf20
  • Rbbp7
  • Th2b
  • Tif2
  • Wdr5
Rattus norvegicus (Norway rat)
Activation of AMPA receptors
  • GluA1
  • GluA2
  • GluA3
  • Glur1
  • Glur2
  • Glur3
  • Glur4
  • Gria1
  • Gria2
  • Gria3
  • Gria4
Rattus norvegicus (Norway rat)
Relaxin receptors
  • Insl3
  • Insl7
  • Lgr7
  • Rlf
  • Rln
  • Rln1
  • Rln3
  • Rxfp1
  • Rxfp2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Acyl chain remodelling of PE
  • A-C1
  • Abhd4
  • Cpla2
  • Grcc3f
  • H-rev107
  • Hrasls
  • Hrasls3
  • Hrasls5
  • Hrasrs
  • Hrev107
  • Hrlp5
  • Lpcat3
  • Lpcat4
  • Mboat1
  • Mboat2
  • Mboat5
  • Oact2
  • Oact5
  • Pla2g10
  • Pla2g12a
  • Pla2g16
  • Pla2g1b
  • Pla2g2a
  • Pla2g2d
  • Pla2g2f
  • Pla2g3
  • Pla2g4
  • Pla2g4a
  • Pla2g4b
  • Pla2g4c
  • Pla2g4d
  • Pla2g4e
  • Pla2g4f
  • Pla2g5
  • Pla2g6
  • Pla2r1
  • Plaat1
  • Plaat3
  • Plaat5
  • Plbd1
  • Pnpla8
  • Pnpla9
  • RLP-2
  • Rlp-1
  • Rlp-3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Sema3A PAK dependent Axon repulsion
  • Fes
  • Fyn
  • Hsp84
  • Hsp86
  • Hsp90aa1
  • Hsp90ab1
  • Hspc3
  • Hspca
  • Hspcb
  • Limk
  • Limk1
  • Nrp1
  • Pak1
  • Pak2
  • Pak3
  • Plxna1
  • Plxna2
  • Plxna3
  • Plxna4
  • Plxna4a
  • Rac
  • Rac1
  • Sema3a
Rattus norvegicus (Norway rat)
Nonsense Mediated Decay (NMD) independent of the Exon Junction Complex (EJC)
  • AABR07029195.1
  • AABR07031505.1
  • AABR07060610.1
  • AABR07064810.1
  • AABR07071986.1
  • AABR07072260.1
  • Arbp
  • Cbp20
  • Cbp80
  • ENSRNOG00000068086
  • Eif4g1
  • Etf1
  • Fau
  • Fte-1
  • Fte1
  • Gspt1
  • Gspt2
  • LOC100360645
  • LOC100361060
  • LOC100361854
  • LOC100361933
  • LOC100910714
  • LOC102550668
  • LOC103692829
  • LOC108351255
  • LOC120093247
  • LOC120094652
  • LOC120097744
  • LOC120099964
  • LOC120103572
  • Lamr1
  • Ncbp1
  • Ncbp2
  • Pabp1
  • Pabpc1
  • RGD1562402
  • RGD1563956
  • RGD1564606
  • Rig
  • Rp2
  • Rpl1
  • Rpl10
  • Rpl10a
  • Rpl10l
  • Rpl10l1
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  • Rpl12l2
  • Rpl13
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  • Rpl18a
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  • Rpl21-ps26
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  • Rpl22
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  • Rpl4
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  • Rpl5
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  • Rpl9l2
  • Rplp0
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  • Rps4x
  • Rps4y2
  • Rps5
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  • Rps7-ps23
  • Rps8
  • Rps9
  • Rpsa
  • S27-1
  • Uba80
  • Ubbl1
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Upf1
Rattus norvegicus (Norway rat)
COPII-mediated vesicle transport
  • AABR07042915.1
  • Ankrd28
  • Areg
  • Bet1
  • Cd59
  • Cnih1
  • Cnih2
  • Cnih3
  • Col7a1
  • Csnk1d
  • Ctsc
  • Ctsy
  • Ctsz
  • Erg1
  • Ergic53
  • Ergl
  • F8
  • Folr1
  • GluA1
  • Glur1
  • Golga2
  • Gorasp1
  • Gosr2
  • Grasp65
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  • Gs27
  • Hckid
  • LOC100909916
  • Lman1
  • Lman1l
  • Lman2
  • Lztr2
  • Mcfd2
  • Napa
  • Napb
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  • Nsf
  • Ppp6c
  • Ppp6r3
  • Ppp6r3-ps1
  • Ppv
  • Preb
  • RGD1564492
  • Ra410
  • Rab1
  • Rab1A
  • Rab1b
  • Rgpr
  • Rnp24
  • Saps3-ps1
  • Sar1b
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  • Scfd1
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  • Sdnsf
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  • Sec31l1
  • Serpina1
  • Sly1
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  • Snapa
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  • Stx5a
  • Stxbp1l2
  • Tfg
  • Tgfa
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  • Tmed2
  • Tmp21
  • Trappc1
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  • Trappc2ll1
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  • Trappc6b
  • Trappc9
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  • Vap1
  • Vdp
  • Ykt6
Rattus norvegicus (Norway rat)
FCERI mediated Ca+2 mobilization
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  • Calm3
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  • Camc
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  • Grap2
  • Grb2
  • Igkv2-112l1
  • Igkv8-30l1
  • Igkvl-ps6
  • Igkvl10
  • Igkvl12
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  • Igkvl2
  • Iglc1
  • Igll1
  • Itk
  • LOC100363522
  • LOC100365500
  • LOC100911032
  • LOC102551948
  • LOC690813
  • Lat
  • Lcp2
  • Lyn
  • Nfat4
  • Nfatc1
  • Nfatc2
  • Nfatc3
  • Plcg1
  • Plcg2
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  • Ppp3cb
  • Ppp3r1
  • RGD1560225
  • RGD1561722
  • RGD1564696
  • Shc1
  • Sos1
  • Syk
  • Tec
  • Txk
  • Vav
  • Vav1
  • Vav2
  • Vav3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Phase 4 - resting membrane potential
  • Irk1
  • Irk2
  • Irk3
  • Irk4
  • Kcnj12
  • Kcnj14
  • Kcnj2
  • Kcnj4
  • Kcnk1
  • Kcnk10
  • Kcnk12
  • Kcnk13
  • Kcnk15
  • Kcnk16
  • Kcnk18
  • Kcnk2
  • Kcnk3
  • Kcnk4
  • Kcnk5
  • Kcnk6
  • Kcnk7
  • Kcnk9
  • LOC364241
  • Task
  • Task1
  • Task3
  • Task5
  • Trek
  • Trek2
  • Tresk-2
  • Tresk2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Highly calcium permeable nicotinic acetylcholine receptors
  • Acra
  • Acra2
  • Acra3
  • Acra4
  • Acra5
  • Acra6
  • Acrb2
  • Acrb3
  • Acrb4
  • Chrna1
  • Chrna2
  • Chrna3
  • Chrna4
  • Chrna5
  • Chrna6
  • Chrnb2
  • Chrnb3
  • Chrnb4
Rattus norvegicus (Norway rat)

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Last updated: August 19, 2024