GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 826 - 850 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
Pre-NOTCH Processing in Golgi
  • Notch3
  • Rnp24
  • Tmed2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Toll Like Receptor 10 (TLR10) Cascade
  • Tlr10
Rattus norvegicus (Norway rat)
FRS-mediated FGFR2 signaling
  • Ash
  • FGF22
  • FGF6
  • Fgf-1
  • Fgf-2
  • Fgf-5
  • Fgf-7
  • Fgf-9
  • Fgf1
  • Fgf10
  • Fgf16
  • Fgf17
  • Fgf18
  • Fgf2
  • Fgf20
  • Fgf22
  • Fgf23
  • Fgf3
  • Fgf4
  • Fgf5
  • Fgf5c
  • Fgf5d
  • Fgf6
  • Fgf7
  • Fgf7a
  • Fgf7b
  • Fgf8
  • Fgf9
  • Fgfa
  • Fgfr2
  • Frs2
  • Frs3
  • Grb2
  • Hras
  • Hras1
  • Kgf
  • Kras
  • Kras2
  • Nras
  • Ptpn11
  • Snt2
  • Sos1
Rattus norvegicus (Norway rat)
SOS-mediated signalling
  • Ash
  • Grb2
  • Irs-1
  • Irs1
  • Irs2
  • Sos1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Antigen Presentation: Folding, assembly and peptide loading of class I MHC
  • 1700031A10Rik
  • 2781a1
  • 2788a1a2
  • 2795a1
  • 2800a1a2
  • 2812a1a2
  • 2824a1
  • 2829a1a2
  • 2846a1a2
  • 2860a1
  • 2865a2
  • 2869a1a2
  • 2879a1
  • 2886a1-a1a2
  • 2901a1a2
  • 2906a1
  • 2920a1a2
  • 2927a1
  • 2941a1a2
  • 2945a1a2
  • 2950a1
  • 2953a1a2
  • 2959a1
  • 2976a1
  • 2981a1a2
  • 2984a1a2
  • 2994a1
  • 3082ex4-5
  • 3252a3
  • 3258a2
  • 3281a3
  • 3298a3
  • AABR07044308.2
  • AABR07044362.1
  • AABR07072807.1
  • AC120486.1
  • Abcb2
  • Abcb3
  • Appils
  • Arts1
  • B2m
  • Calr
  • Canx
  • ENSRNOG00000064836
  • ENSRNOG00000069480
  • Erap1
  • Erp60
  • Grp58
  • Grp78
  • H2-M10.6
  • H2-M10.6l
  • Hspa5
  • LOC102546590
  • LOC120093125
  • Mtp1
  • Mtp2
  • Nerg-ps11
  • Nerg-ps12
  • Nerg-ps13
  • Nerg-ps14
  • Nerg-ps15
  • Pbp-ps
  • Pdia3
  • Ppid-ps
  • Ppp1cb-ps
  • RT1-A1
  • RT1-A2
  • RT1-CE1
  • RT1-CE11
  • RT1-CE14
  • RT1-CE16
  • RT1-CE2
  • RT1-M1-1
  • RT1-M1-2
  • RT1-M1-3
  • RT1-M1-4
  • RT1-M1-5
  • RT1-M10-1
  • RT1-M10-2
  • RT1-M10-3
  • RT1-M10-4
  • RT1-M2
  • RT1-M3-1
  • RT1-M5
  • RT1-M7
  • RT1-M8
  • RT1-N3
  • RT1-O1l1
  • RT1-P2
  • RT1-S3
  • Rcrg1-ps25
  • Rcrg1-ps26
  • Rcrg1-ps27
  • Rcrg1-ps28
  • Rcrg1-ps29
  • Rcrg1-ps30
  • Rcrg1-ps31
  • Rcrg1-ps32
  • Rcrg1-ps33
  • Rcrg1-ps34
  • Rcrg1-ps35
  • Rcrg1-ps36
  • Rcrg1-ps37
  • Rcrg1-ps38
  • Rcrg1-ps39
  • Rcrg1-ps40
  • Rpl39-ps
  • Sar1b
  • Sec13
  • Sec13l1
  • Sec23a
  • Sec24a
  • Sec24b
  • Sec24c
  • Sec24d
  • Sec31a
  • Sec31l1
  • Tap1
  • Tap2
  • Tapbp
  • Trim15
  • Trim31
  • Trim39-ps
  • Vap1
Rattus norvegicus (Norway rat)
trans-Golgi Network Vesicle Budding
  • Arf1
  • Gbf1
  • Snap23
  • Stx4
  • Stx4a
  • Syb2
  • Sybl1
  • Vamp2
  • Vamp7
  • Vamp8
Rattus norvegicus (Norway rat)
RUNX1 interacts with co-factors whose precise effect on RUNX1 targets is not known
  • Actl6a
  • Actl6b
  • Aml1
  • Arid1a
  • Arid1b
  • Baf190a
  • Baf57
  • Baf60b
  • Brg1
  • Cbfa2
  • Cbfb
  • Cbx2
  • Cbx4
  • Cbx6
  • Cbx8
  • Ck2n
  • Csnk2a1
  • Csnk2a2
  • Csnk2b
  • Ep300
  • LOC120102351
  • Pbrm1
  • Pcgf5
  • Phc1
  • Phc2
  • Phc3
  • Ring1
  • Ring1b
  • Rnf1
  • Rnf2
  • Runx1
  • Rybp
  • Scml2
  • Smarca2
  • Smarca4
  • Smarcb1
  • Smarcc1
  • Smarcc2
  • Smarcd1
  • Smarcd2
  • Smarcd3
  • Smarce1
  • Snf2b
  • Snf2l4
  • Yaf2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Condensation of Prometaphase Chromosomes
  • Ck2n
  • Csnk2a1
  • Csnk2a2
  • Csnk2b
  • Ncapd2
  • Ncapg
  • Ncaph
  • Smc2
  • Smc4
Rattus norvegicus (Norway rat)
PTK6 Regulates RTKs and Their Effectors AKT1 and DOK1
  • Akt1
  • Arap1
  • Cbl
  • Dok1
  • LOC100360645
  • Ptk6
  • Rps27a
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Phase 0 - rapid depolarisation
  • Cach2
  • Cacn2
  • Cacna1c
  • Cacna2d2
  • Cacnb1
  • Cacnb2
  • Cacng4
  • Cacng6
  • Cacng7
  • Cacng8
  • Cacnl1a1
  • Cacnlb1
  • Cacnlb2
  • Cchl1a1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Ub-specific processing proteases
  • Abcc7
  • Ada3
  • Adrb2
  • Adrb2r
  • Adrm1
  • Ar
  • Arrb1
  • Arrb2
  • Atxn7
  • Axin
  • Axin1
  • Axin2
  • Becn1
  • Birc2
  • Birc3
  • Ccna1
  • Ccna2
  • Ccp110
  • Cdc20
  • Cdc25a
  • Cftr
  • Clspn
  • Cyld
  • Cyld1
  • Ddb2
  • Dn7
  • ENSRNOG00000062927
  • ENSRNOG00000064803
  • ENSRNOG00000067432
  • Fkbp8
  • Foxo4
  • Gp110
  • H2ac10
  • H2ac18
  • H2ac25
  • H2ac4
  • H2aj
  • Hausp
  • Hgs
  • Hif1a
  • Hist2h2aa3
  • Hist3h2a
  • Hrs
  • Hrs2
  • Ide
  • Ifih1
  • Ikba
  • Ikbkg
  • Il33
  • Inrf2
  • Kat2a
  • Keap1
  • Kpc1
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • LOC100910107
  • LOC120097726
  • LOC120097921
  • LOC120098474
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mad1
  • Madh1
  • Madh2
  • Madh3
  • Madh7
  • Map3k7
  • Mat2b
  • Mdm2
  • Mdm4
  • Mdmx
  • Mecl1
  • Mss1
  • Mul1
  • Myc
  • Nemo
  • Nfkbia
  • Nr3c4
  • Otub1
  • P53
  • Polb
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Pten
  • Ptrh2
  • Rce1
  • Rig1
  • Ring12
  • Ripk1
  • Rnf123
  • Rnf128
  • Rnf146
  • Rps27a
  • Ruvbl1
  • Siah2
  • Skp2
  • Smad1
  • Smad2
  • Smad3
  • Smad7
  • Smurf2
  • Snx3
  • Stam2
  • Suds3
  • Sug1
  • Tab1
  • Tada2b
  • Tada3
  • Tada3l
  • Taf9b
  • Taf9l
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Tgfbr1
  • Tip49
  • Tip49a
  • Tnks
  • Tnks2
  • Tomm20
  • Tomm70
  • Tomm70a
  • Tp53
  • Traf2
  • Traf6
  • Trrap
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Ubp41
  • Ubp69
  • Ufd1
  • Ufd1l
  • Usp10
  • Usp11
  • Usp12
  • Usp13
  • Usp14
  • Usp15
  • Usp16
  • Usp17l
  • Usp17l8
  • Usp17la
  • Usp17la2
  • Usp17lh
  • Usp17li
  • Usp18
  • Usp19
  • Usp2
  • Usp20
  • Usp21
  • Usp22
  • Usp24
  • Usp25
  • Usp26
  • Usp28
  • Usp29
  • Usp3
  • Usp30
  • Usp33
  • Usp34
  • Usp37
  • Usp4
  • Usp42
  • Usp44
  • Usp47
  • Usp48
  • Usp5
  • Usp7
  • Usp8
  • Vdac1
  • Vdac2
  • Vdac3
  • Wdr20
  • Wdr48
  • ubp109
  • usp12
Rattus norvegicus (Norway rat)
DARPP-32 events
  • Cdk5
  • Cdkn5
  • Dpde1
  • PSSALRE
  • Pde4a
  • Pde4b
  • Pde4c
  • Pde4d
  • Pkacb
  • Ppp1a
  • Ppp1ca
  • Ppp1r1b
  • Ppp2ca
  • Ppp2cb
  • Ppp2r1a
  • Ppp2r1b
  • Ppp2r5d
  • Prkaca
  • Prkacb
  • Prkar1a
  • Prkar1b
  • Prkar2a
  • Prkar2b
Rattus norvegicus (Norway rat)
Formation of WDR5-containing histone-modifying complexes
  • Abp10
  • Ada3
  • Akap8l
  • Ash2l
  • Bod1l1
  • Ccdc101
  • Csrp2bp
  • Cxxc1
  • Dr1
  • Hcfc1
  • Hcfc2
  • Kansl1
  • Kansl2
  • Kansl3
  • Kat14
  • Kat2a
  • Kat2b
  • Kat8
  • Kmt2a
  • Kmt2b
  • Kmt2c
  • Ledgf
  • Mbip
  • Mcrs1
  • Men1
  • Mll
  • Mll1
  • Myst1
  • Nsl2
  • Nsl3
  • Ogt
  • Pagr1
  • Paxip1
  • Phf20
  • Phf20l1
  • Psip1
  • Rbbp5
  • Setd1a
  • Setd1b
  • Sgf29
  • Tada2a
  • Tada2l
  • Tada3
  • Tada3l
  • Wdr5
  • Wdr82
  • Yeats2
  • Zzz3
Rattus norvegicus (Norway rat)
PKMTs methylate histone lysines
  • Aebp2
  • Ash1l
  • Ash2l
  • Atf7ip
  • Dot1l
  • Eed
  • Ehmt1
  • Ehmt2
  • Ezh2
  • H3c13
  • H4c16
  • H4c2
  • H4f16
  • H4ft
  • Hist1h4b
  • Hist1h4m
  • Hist2h3c2
  • Hist4
  • Hist4h4
  • Kmt2a
  • Kmt2b
  • Kmt2c
  • Kmt5a
  • Kmt5b
  • Kmt5c
  • LOC120093163
  • LOC498295
  • Mll
  • Mll1
  • Nfkb2
  • Nsd1
  • Nsd2
  • Nsd3
  • Prdm16
  • Prdm9
  • Rbbp4
  • Rbbp5
  • Rbbp7
  • Rela
  • Setd1a
  • Setd1b
  • Setd2
  • Setd3
  • Setd6
  • Setd7
  • Setdb1
  • Setdb2
  • Smyd2
  • Smyd3
  • Suv39h1
  • Suv39h2
  • Suv420h1
  • Suv420h2
  • Suz12
  • Wdr5
  • Whsc1
  • Whsc1l1
Rattus norvegicus (Norway rat)
NOD1/2 Signaling Pathway
  • Aamp
  • Birc2
  • Birc3
  • Casp1
  • Casp2
  • Casp8
  • Casp9
  • Csbp1
  • Csbp2
  • Cyld
  • Cyld1
  • Ich1
  • Ikbkg
  • Il1bc
  • Il1bce
  • Itch
  • Map2k6
  • Map3k7
  • Map3k7ip2
  • Mapk11
  • Mapk12
  • Mapk13
  • Mapk14
  • Mkk6
  • Nemo
  • Nod1
  • Nod2
  • RNCASP9
  • Ripk2
  • Sapk3
  • Tab1
  • Tab2
  • Tab3
  • Tnfaip3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Butyrophilin (BTN) family interactions
  • Btn1a1
  • Btn2a2
  • Btnl2
  • Btnl9
  • Cd209a
  • LOC684480
  • Ppl
  • Xdh
Rattus norvegicus (Norway rat)
Transport of gamma-carboxylated protein precursors from the endoplasmic reticulum to the Golgi apparatus
  • Bglap
  • Bglap2
  • Cf9
  • F10
  • F2
  • F7
  • F9
  • Gas6
  • Proc
  • Pros
  • Pros1
  • Proz
Rattus norvegicus (Norway rat)
Organic anion transporters
  • Bnpi
  • Dnpi
  • Gc1
  • Nis
  • Npt1
  • Slc17a1
  • Slc17a6
  • Slc17a7
  • Slc17a8
  • Slc20a3
  • Slc20a4
  • Slc25a1
  • Slc25a10
  • Slc25a11
  • Slc25a18
  • Slc25a22
  • Slc5a5
  • Slc5a8
  • Vglut1
  • Vglut2
  • Vglut3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Digestion of dietary lipid
  • Cel
  • Clps
  • Lipf
  • Plrp1
  • Plrp2
  • Pnlip
  • Pnliprp1
  • Pnliprp2
Rattus norvegicus (Norway rat)
HDL assembly
  • A2m
  • A2m1
  • Abca1
  • Apoa1
  • Bmp1
  • LOC100364821
  • Pkacb
  • Prkaca
  • Prkacb
  • Zdhhc8
Rattus norvegicus (Norway rat)
ERBB2 Activates PTK6 Signaling
  • Btc
  • Dtr
  • Egf
  • Egfr
  • Erbb2
  • Erbb3
  • Ereg
  • Hbegf
  • Hegfl
  • Ndf
  • Neu
  • Nrg1
  • Nrg2
  • Nrg3
  • Ntak
  • Ptk6
Rattus norvegicus (Norway rat)
Defensins
  • Defa
  • Defa-rs1
  • Defa10
  • Defa11
  • Defa24
  • Defa6
  • Defa8
  • Defa9
  • Defal1
  • Defb1
  • Defb14
  • Defb17
  • Defb18
  • Defb2
  • Defb21
  • Defb24
  • Defb25
  • Defb28
  • Defb3
  • Defb30
  • Defb36
  • Defb4
  • Defb41
  • Defb43
  • Defcr4
  • ENSRNOG00000064390
  • Np4
  • Rd5
Rattus norvegicus (Norway rat)
mTORC1-mediated signalling
  • Akt1s1
  • ENSRNOG00000066475
  • Eef2k
  • Eif4e
  • Eif4ebp1
  • Eif4g1
  • Fkbp1
  • Fkbp1a
  • Frap1
  • Gbl
  • Lamtor1
  • Lamtor3
  • Lamtor4
  • Lamtor5
  • Lst8
  • Map2k1ip1
  • Mlst8
  • Mtor
  • Raft1
  • Rheb
  • Rps6
  • Rps6kb1
  • Rptor
  • RragB
  • Rraga
  • Rragc
  • Rragc_predicted
  • Rragd
  • Slc38a9
  • Ywhab
Rattus norvegicus (Norway rat)
Estrogen-dependent gene expression
  • AC109542.1
  • Aib1
  • Aml1
  • Atf2
  • Carm1
  • Cbfa2
  • Cbfb
  • Cbp
  • Ccnt1
  • Cdk9
  • Cited1
  • Crebbp
  • Ddx5
  • ENSRNOG00000062927
  • ENSRNOG00000064540
  • ENSRNOG00000066901
  • ENSRNOG00000068034
  • Ep300
  • Esp3
  • Esr
  • Esr1
  • Estr
  • Fkbp4
  • Fkbp52
  • Fos
  • Foxa1
  • Greb1
  • Gtf2a1
  • Gtf2a2
  • Gtf2f1
  • Gtf2f2
  • H2ab3
  • H2ac10
  • H2ac18
  • H2ac4
  • H2afb3
  • H2afx
  • H2aj
  • H2ax
  • H2az2
  • H2bc1
  • H2bc12l1
  • H2bc6
  • H2bcl1
  • H2bcl2
  • H2bu1
  • H3-3b
  • H3.3b
  • H3c13
  • H3f3b
  • H4c16
  • H4c2
  • H4f16
  • H4ft
  • Hdac1
  • Hist1h2ba
  • Hist1h2bc
  • Hist1h2bg
  • Hist1h2bo
  • Hist1h2bq
  • Hist1h4b
  • Hist1h4m
  • Hist2h2aa3
  • Hist2h3c2
  • Hist4
  • Hist4h4
  • Hnf3a
  • Hrmt1l2
  • Hsp84
  • Hsp86
  • Hsp90aa1
  • Hsp90ab1
  • Hspc3
  • Hspca
  • Hspcb
  • Htatip
  • Jun
  • Kat2b
  • Kat5
  • Kdm1a
  • Kdm4b
  • LOC100365043
  • LOC100910200
  • LOC120097726
  • LOC120098305
  • LOC684797
  • Ncoa1
  • Ncoa3
  • Nr3a1
  • Nr3c3
  • Nr5a2
  • Nrip1
  • Oct-1
  • Otf-1
  • Otf1
  • Pgr
  • Polr2a
  • Polr2b
  • Polr2c
  • Polr2d
  • Polr2e
  • Polr2f
  • Polr2g
  • Polr2i
  • Polr2j
  • Pou2f1
  • Prmt1
  • Prmt4
  • Ptges3
  • RGD1564091
  • Rap30
  • Rjg-9
  • Runx1
  • Tbp
  • Tcf-3a
  • Tcf3a
  • Tebp
  • Th2b
  • Tip60
  • Tip60b
  • Tle3
  • Yy1
  • Zfp217
  • yy1
Rattus norvegicus (Norway rat)
DDX58/IFIH1-mediated induction of interferon-alpha/beta
  • Hsp84
  • Hsp86
  • Hsp90aa1
  • Hsp90ab1
  • Hspc3
  • Hspca
  • Hspcb
  • Ips1
  • Irf3
  • Mavs
  • Tbk1
  • Tomm70
  • Tomm70a
  • Visa
Rattus norvegicus (Norway rat)

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Last updated: August 19, 2024