GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 276 - 300 of 499 in total
Pathway Name ▲ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Neurotransmitter receptors and postsynaptic signal transmission
  • acc-1
  • acc-2
  • acc-3
  • acc-4
  • acr-20
  • acr-21
  • acr-22
  • acr-23
  • acr-24
  • acr-4
  • acr-5
  • avr-14
  • avr-15
  • deg-3
  • des-2
  • gbr-4
  • ggr-1
  • ggr-2
  • ggr-3
  • glc-1
  • glc-2
  • glc-3
  • glc-4
  • lgc-10
  • lgc-11
  • lgc-12
  • lgc-30
  • lgc-31
  • lgc-32
  • lgc-34
  • lgc-39
  • lgc-4
  • lgc-40
  • lgc-41
  • lgc-42
  • lgc-44
  • lgc-45
  • lgc-46
  • lgc-47
  • lgc-48
  • lgc-49
  • lgc-5
  • lgc-50
  • lgc-51
  • lgc-52
  • lgc-53
  • lgc-54
  • lgc-55
  • lgc-56
  • lgc-58
  • lgc-6
  • lgc-7
  • lgc-8
  • lgc-9
  • mod-1
Caenorhabditis elegans
Neurotransmitter release cycle
  • Y55D5A.3
Caenorhabditis elegans
Neutrophil degranulation
  • B0546.3
  • C01B10.9
  • C03B1.13
  • C03F11.3
  • C05D9.3
  • C07A12.7
  • C25G4.17
  • C27A2.12
  • C27C7.5
  • C28G1.2
  • C33G3.4
  • C35A11.4
  • C36E8.4
  • C39H7.4
  • C49C3.10
  • C53D6.7
  • C54G4.4
  • CELE_F07A5.4
  • CELE_F10D11.6
  • CELE_F11C7.2
  • CELE_F11D5.5
  • CELE_F11D5.7
  • CELE_F11F1.1
  • CELE_F11G11.5
  • CELE_F13B12.2
  • CELE_F13H10.6
  • CELE_F15D3.4
  • CELE_F20H11.4
  • CELE_F21F3.2
  • CELE_F26G1.1
  • CELE_F41C6.4
  • CELE_F43D2.6
  • CELE_F44E2.10
  • CELE_F44G3.7
  • CELE_F46A8.3
  • CELE_F46A8.4
  • CELE_F46A8.5
  • CELE_F46A8.8
  • CELE_F47B7.2
  • CELE_F47E1.2
  • CELE_F47E1.4
  • CELE_F47G9.6
  • CELE_F48E3.2
  • CELE_F49F1.10
  • CELE_F49F1.11
  • CELE_F49F1.18
  • CELE_F49F1.9
  • CELE_F52E1.2
  • CELE_F53B1.8
  • CELE_F53H8.3
  • CELE_F58D5.2
  • CELE_H20J04.9
  • CELE_H27A22.1
  • CELE_H40L08.1
  • CELE_K02G10.5
  • CELE_K03B8.6
  • CELE_K08F9.1
  • CELE_K08H10.6
  • CELE_K09C4.1
  • CELE_K09C4.4
  • CELE_K09C4.5
  • CELE_M04G7.2
  • CELE_M6.11
  • CELE_R05F9.6
  • CELE_R11H6.5
  • CELE_T10B10.8
  • CELE_T13H5.1
  • CELE_T21B6.3
  • CELE_T22F3.12
  • CELE_T28F4.3
  • CELE_W08E12.7
  • CELE_Y105E8B.9
  • CELE_Y106G6D.4
  • CELE_Y106G6E.1
  • CELE_Y106G6H.14
  • CELE_Y16B4A.2
  • CELE_Y32F6B.1
  • CELE_Y37A1A.3
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  • CELE_Y39B6A.41
  • CELE_Y39E4B.5
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  • CELE_Y48G8AL.15
  • CELE_Y50D7A.10
  • CELE_Y51B9A.9
  • CELE_Y57G11C.33
  • CELE_Y70G10A.3
  • CELE_Y71G12B.31
  • CELE_Y71H2AM.12
  • CELE_ZK616.65
  • CELE_ZK829.9
  • F09E5.3
  • F25G6.8
  • F33D4.4
  • PLD
  • R04B3.2
  • R07B1.3
  • R09B5.11
  • R09H10.3
  • SC
  • T19B4.3
  • T22D1.3
  • W03G11.3
  • ZK652.6
  • ZK686.3
  • ZK697.8
  • aagr-1
  • aagr-2
  • abt-1
  • acl-2
  • acly-1
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  • acp-6
  • acp-7
  • acr-12
  • acr-2
  • acr-3
  • acr-6
  • acr-8
  • acs-20
  • acs-22
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  • adm-2
  • aex-1
  • aex-4
  • aex-6
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  • aldo-1
  • aldo-2
  • alh-4
  • aman-1
  • ampd-1
  • amph-1
  • anp-1
  • apa-2
  • aph-2
  • apy-1
  • argn-1
  • arl-8
  • arp-1
  • arp-11
  • arp-2
  • arx-2
  • arx-7
  • asah-1
  • atad-3
  • atg-7
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  • bgal-1
  • bgal-2
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  • cct-8
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  • cht-3
  • cht-4
  • chtl-1
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  • cku-80
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  • clec-196
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  • clec-91
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  • clp-4
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  • lec-10
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  • lec-4
  • lec-5
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  • lec-7
  • lec-8
  • lec-9
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  • let-502
  • let-60
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  • lev-8
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  • pxn-1
  • pxn-2
  • pyk-1
  • pyk-2
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  • rab-5
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  • rog-1
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  • scl-15
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  • scl-3
  • scl-5
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  • scl-7
  • scl-8
  • scl-9
  • scm-1
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  • smf-3
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  • zmp-2
  • zmp-3
  • zmp-5
  • zmp-6
Caenorhabditis elegans
Nicotinamide salvaging
  • R107.2
  • Y18D10A.3
  • anmt-1
  • ndx-9
  • nprt-1
  • oct-1
  • slc-5A12
Caenorhabditis elegans
Nicotinate metabolism
  • nadk-2
  • nmat-1
  • nmat-2
  • qns-1
Caenorhabditis elegans
Non-integrin membrane-ECM interactions
  • B0252.1
  • R09H10.3
  • ZK697.8
  • let-756
  • pvf-1
  • rig-5
  • ttn-1
Caenorhabditis elegans
Nonsense Mediated Decay (NMD) enhanced by the Exon Junction Complex (EJC)
  • C16C8.14
  • C16C8.16
  • C16C8.20
  • C37A2.7
  • CELE_W01D2.1
  • CELE_Y37E3.8
  • RBM8
  • Y14
  • casc-3
  • cbp-20
  • cbp-80
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  • etf-1
  • ifg-1
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  • ncbp-1
  • ncbp-2
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  • rla-0
  • rla-1
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  • rnp-5
  • rpa-0
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  • rpl-30
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  • rpl-32
  • rpl-33
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  • rpl-36
  • rpl-36.A
  • rpl-37a
  • rpl-38
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  • rpl-4
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  • rpl-8
  • rpl-9
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  • rps-10
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  • rps-13
  • rps-14
  • rps-15
  • rps-16
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  • rps-19
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  • rps-26
  • rps-27
  • rps-28
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  • rps-3
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  • rps-5
  • rps-6
  • rps-7
  • rps-8
  • rps-9
  • smg-1
  • smg-2
  • smg-3
  • smg-4
  • smg-6
  • smg-8
  • smg-9
  • sur-6
  • ubl-1
Caenorhabditis elegans
Nonsense Mediated Decay (NMD) independent of the Exon Junction Complex (EJC)
  • C16C8.14
  • C16C8.16
  • C16C8.20
  • C37A2.7
  • CELE_W01D2.1
  • CELE_Y37E3.8
  • cbp-20
  • cbp-80
  • erfa-1
  • erfa-3
  • etf-1
  • ifg-1
  • ncbp-1
  • ncbp-2
  • pab-1
  • rla-0
  • rla-1
  • rpa-0
  • rpa-1
  • rpl-1
  • rpl-10
  • rpl-10a
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  • rpl-12
  • rpl-13
  • rpl-14
  • rpl-15
  • rpl-16
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  • rpl-18
  • rpl-19
  • rpl-2
  • rpl-20
  • rpl-21
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  • rpl-24.1
  • rpl-25.2
  • rpl-26
  • rpl-27
  • rpl-28
  • rpl-29
  • rpl-3
  • rpl-30
  • rpl-31
  • rpl-32
  • rpl-33
  • rpl-35
  • rpl-36
  • rpl-36.A
  • rpl-37a
  • rpl-38
  • rpl-39
  • rpl-4
  • rpl-41
  • rpl-43
  • rpl-5
  • rpl-6
  • rpl-7
  • rpl-7A
  • rpl-8
  • rpl-9
  • rps-0
  • rps-1
  • rps-10
  • rps-11
  • rps-12
  • rps-13
  • rps-14
  • rps-15
  • rps-16
  • rps-17
  • rps-18
  • rps-19
  • rps-2
  • rps-20
  • rps-21
  • rps-22
  • rps-23
  • rps-24
  • rps-25
  • rps-26
  • rps-27
  • rps-28
  • rps-29
  • rps-3
  • rps-4
  • rps-5
  • rps-6
  • rps-7
  • rps-8
  • rps-9
  • smg-2
  • ubl-1
Caenorhabditis elegans
Norepinephrine Neurotransmitter Release Cycle
  • B0252.3
  • B0361.11
  • C06H5.6
  • C44C10.3
  • C46C2.2
  • CELE_F23F12.13
  • CELE_F45E10.2
  • CELE_K05F1.6
  • CELE_K09E9.1
  • CELE_K11D9.3
  • CELE_T08B1.1
  • CELE_T12B3.2
  • CELE_T22F7.1
  • CELE_Y57G11C.23
  • CELE_Y82E9BR.16
  • CELE_ZK892.3
  • F23F12.3/F23F12.1
  • aex-4
  • cat-1
  • cpx-1
  • lan-2
  • oct-1
  • oct-2
  • pes-23
  • rab-3
  • ric-4
  • rimb-1
  • snb-1
  • snb-2
  • snb-5
  • snb-6
  • snb-7
  • snt-1
  • suex-2
  • syd-2
  • tag-168
  • tag-81
  • unc-10
  • unc-13
  • unc-18
  • unc-64
  • vamp-7
Caenorhabditis elegans
Nuclear Receptor transcription pathway
  • XL285
  • chr-3
  • cnr-14
  • cnr-3
  • cnr-8
  • csr-1
  • daf-12
  • daf-20
  • fax-1
  • gei-8
  • let-527
  • mig-7
  • nhr-1
  • nhr-10
  • nhr-100
  • nhr-101
  • nhr-114
  • nhr-116
  • nhr-118
  • nhr-120
  • nhr-129
  • nhr-136
  • nhr-137
  • nhr-14
  • nhr-141
  • nhr-147
  • nhr-148
  • nhr-149
  • nhr-152
  • nhr-153
  • nhr-154
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  • nhr-258
  • nhr-277
  • nhr-3
  • nhr-35
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  • nhr-41
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  • nhr-48
  • nhr-49
  • nhr-6
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  • nhr-64
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  • nhr-68
  • nhr-69
  • nhr-7
  • nhr-76
  • nhr-8
  • nhr-85
  • nhr-91
  • nhr-93
  • nr1g1
  • nr4a5
  • pqn-12
  • sex-1
  • unc-55
Caenorhabditis elegans
Nuclear events mediated by NFE2L2
  • aak-2
  • cbp-1
  • skn-1
  • sknr-1
Caenorhabditis elegans
Nuclear signaling by ERBB4
  • CELE_T12G3.2
  • aph-1
  • aph-2
  • dhs-7
  • kin-7
  • let-23
  • pen-1
  • pen-2
  • sel-12
  • src-1
  • sta-1
  • sta-2
  • stat-b
  • yap-1
Caenorhabditis elegans
Nucleotide catabolism
  • sahd-1
Caenorhabditis elegans
O-glycosylation of TSR domain-containing proteins
  • CELE_F09F9.4
  • CELE_F11C7.2
  • CELE_T21B6.3
  • CELE_ZC250.2
  • gon-1
  • pad-2
  • sbsp-1
  • spon-1
Caenorhabditis elegans
O-linked glycosylation of mucins
  • C02H6.1
  • C16D9.6
  • C17A2.3
  • C38H2.2
  • C49C3.4
  • CELE_E03H4.3
  • CELE_F56H6.1
  • CELE_W09D10.5
  • CELE_Y38C1AB.1
  • F37A4.3
  • bus-4
  • cnp-2
  • gly-1
  • gly-10
  • gly-11
  • gly-15
  • gly-16
  • gly-17
  • gly-18
  • gly-19
  • gly-3
  • gly-4
  • gly-6
  • gly-7
  • gly-8
  • gly-9
  • paml-1
Caenorhabditis elegans
Orc1 removal from chromatin
  • C14C10.5
  • CELE_F35G12.12
  • CELE_T07F10.5
  • CELE_T24A6.1
  • MCM7
  • cdc-6
  • cdk-2
  • cdt-1
  • cul-1
  • cya-1
  • let-358
  • lin-19
  • lin-6
  • mcm-2
  • mcm-3
  • mcm-4
  • mcm-5
  • mcm-6
  • mcm-7
  • orc-1
  • orc-2
  • orc-4
  • orc-5
  • pas-1
  • pas-2
  • pas-3
  • pas-4
  • pas-5
  • pas-6
  • pbs-1
  • pbs-2
  • pbs-3
  • pbs-4
  • pbs-5
  • pbs-7
  • psmd-9
  • psme-3
  • rbx-1
  • rpn-1
  • rpn-10
  • rpn-11
  • rpn-12
  • rpn-2
  • rpn-3
  • rpn-5
  • rpn-6.1
  • rpn-7
  • rpn-8
  • rpn-9
  • rpt-1
  • rpt-2
  • rpt-3
  • rpt-4
  • rpt-5
  • rpt-6
  • skpt-1
  • skr-1
  • ubia
  • ubib
  • ubl-1
  • ubq-1
  • ubq-2
Caenorhabditis elegans
Organic anion transport
  • B0252.3
  • B0361.11
  • C06H5.6
  • C44C10.3
  • C46C2.2
  • CELE_F23F12.13
  • CELE_F45E10.2
  • CELE_K05F1.6
  • CELE_K09E9.1
  • CELE_K11D9.3
  • CELE_T08B1.1
  • CELE_T12B3.2
  • CELE_T22F7.1
  • CELE_Y57G11C.23
  • CELE_Y82E9BR.16
  • CELE_ZK892.3
  • F23F12.3/F23F12.1
  • oct-1
  • oct-2
  • pes-23
  • suex-2
Caenorhabditis elegans
Organic anion transporters
  • C38C10.2
  • CELE_F52H2.4
  • K11H3.3
  • cima-1
  • eat-4
  • misc-1
  • slc-17.1
  • slc-17.3
  • slc-17.4
  • slc-17.5
  • slc-17.6
  • slc-17.7
  • slc-17.8
  • slc-17.9
  • slc-25A18.1
  • slc-25A18.2
  • slc-25a10
  • slc-25a18.1
  • slc-25a18.2
  • slc-5A12
  • vglu-2
  • vglu-3
Caenorhabditis elegans
Organic cation transport
  • B0252.3
  • B0361.11
  • C06H5.6
  • C44C10.3
  • C46C2.2
  • C53B4.3
  • CELE_F23F12.13
  • CELE_F45E10.2
  • CELE_K05F1.6
  • CELE_K09E9.1
  • CELE_K11D9.3
  • CELE_T08B1.1
  • CELE_T12B3.2
  • CELE_T22F7.1
  • CELE_Y57G11C.23
  • CELE_Y82E9BR.16
  • CELE_ZK892.3
  • F23F12.3/F23F12.1
  • mab-2
  • oct-1
  • oct-2
  • pes-23
  • rnt-1
  • run-1
  • suex-2
Caenorhabditis elegans
Other semaphorin interactions
  • mab-20
  • plx-1
  • ptp-3
  • sema-1a
  • smp-1
  • smp-2
Caenorhabditis elegans
Oxygen-dependent proline hydroxylation of Hypoxia-inducible Factor Alpha
  • 3L686
  • C14C10.5
  • CELE_F35G12.12
  • ccd-3
  • cul-2
  • div-3
  • egl-9
  • elb-1
  • elc-1
  • hif-1
  • let-70
  • pas-1
  • pas-2
  • pas-3
  • pas-4
  • pas-5
  • pas-6
  • pbs-1
  • pbs-2
  • pbs-3
  • pbs-4
  • pbs-5
  • pbs-7
  • psmd-9
  • psme-3
  • rbx-1
  • rpn-1
  • rpn-10
  • rpn-11
  • rpn-12
  • rpn-2
  • rpn-3
  • rpn-5
  • rpn-6.1
  • rpn-7
  • rpn-8
  • rpn-9
  • rpt-1
  • rpt-2
  • rpt-3
  • rpt-4
  • rpt-5
  • rpt-6
  • ubc-2
  • ubia
  • ubib
  • ubl-1
  • ubq-1
  • ubq-2
  • vhl-1
Caenorhabditis elegans
P2Y receptors
  • gnrr-4
Caenorhabditis elegans
PAOs oxidise polyamines to amines
  • hpo-15
Caenorhabditis elegans
PCP/CE pathway
  • CELE_Y71H2AM.12
  • ced-10
  • cwn-1
  • cwn-2
  • daam-1
  • dsh-1
  • dsh-2
  • lin-44
  • mig-5
  • mom-2
  • mom-5
  • rac-1
  • rac-2
  • rho-1
  • rhoa
  • wnt-1
  • wnt-2
Caenorhabditis elegans
PERK regulates gene expression
  • CELE_Y38E10A.8
  • eif-2alpha
  • eif-2beta
  • eif-2gamma
  • iftb-1
  • pek-1
Caenorhabditis elegans

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Last updated: August 19, 2024