GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1526 - 1550 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name ▼ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Transport and synthesis of PAPS
  • ATPSK1
  • ATPSK2
  • C6orf196
  • DTD
  • DTDST
  • PAPSS
  • PAPSS1
  • PAPSS2
  • PAPST1
  • PAPST2
  • SAT1
  • SLC26A1
  • SLC26A2
  • SLC35B2
  • SLC35B3
Homo sapiens (human)
APC truncation mutants are not K63 polyubiquitinated
  • APC
  • DP2.5
Homo sapiens (human)
Apoptotic cleavage of cellular proteins
  • ACIN1
  • ACINUS
  • APC
  • API1
  • BAP31
  • BCAP31
  • BIRC2
  • BMX
  • CASP3
  • CASP6
  • CASP7
  • CASP8
  • CLSPN
  • CPP32
  • DP2.5
  • DXS1357E
  • FAK
  • FAK1
  • FNTA
  • KIAA0670
  • MASK
  • MCH2
  • MCH3
  • MCH5
  • MIHB
  • MST3
  • MST4
  • PKCD
  • PRKCD
  • PRKCQ
  • PRKCT
  • PTK2
  • RNF48
  • ROCK1
  • SATB1
  • STK24
  • STK26
  • STK3
Homo sapiens (human)
Ovarian tumor domain proteases
  • ABIN2
  • ABIN3
  • APC
  • ARH12
  • ARHA
  • C14orf137
  • C15orf16
  • CAP-1
  • CARD15
  • CARD4
  • CARDIAK
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • CEZANNE2
  • CRAF1
  • DDX58
  • DP2.5
  • DUBA8
  • EFP
  • ESR
  • ESR1
  • FIP3
  • FLIP1
  • HEL-220
  • HEL-S-70
  • HIN7
  • IFIH1
  • IKBKG
  • IPS1
  • KIAA0113
  • KIAA0459
  • KIAA1271
  • KIAA1850
  • LIND
  • MAVS
  • MDA5
  • MMAC1
  • NAF1
  • NEMO
  • NOD1
  • NOD2
  • NR3A1
  • OTB1
  • OTB2
  • OTU1
  • OTU2
  • OTUB1
  • OTUB2
  • OTUD2
  • OTUD3
  • OTUD5
  • OTUD7
  • OTUD7A
  • OTUD7B
  • OTUD7C
  • P34CDC2
  • P53
  • PTEN
  • RH116
  • RHO12
  • RHOA
  • RICK
  • RIGI
  • RIP
  • RIP1
  • RIP2
  • RIPK1
  • RIPK2
  • RNF128
  • RNF135
  • RNF147
  • RNF85
  • RNF87
  • RPS27A
  • SFT
  • TEP1
  • TNFAIP3
  • TNIP1
  • TNIP2
  • TNIP3
  • TP53
  • TRABID
  • TRAF3
  • TRAF6
  • TRAFAMN
  • TRIM25
  • TRIM4
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC5A
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBE2D1
  • VCIP135
  • VCP
  • VCPIP1
  • VISA
  • YOD1
  • ZA20D1
  • ZNF147
  • ZRANB1
Homo sapiens (human)
Defective APRT disrupts adenine salvage
  • APRT
Homo sapiens (human)
MET activates RAP1 and RAC1
  • CRK
  • CRKL
  • DOCK7
  • GAB1
  • GRF2
  • HGF
  • HPTA
  • KIAA1771
  • KREV1
  • MET
  • RAC1
  • RAP1A
  • RAP1B
  • RAPGEF1
  • TC25
Homo sapiens (human)
PTK6 Regulates RHO GTPases, RAS GTPase and MAP kinases
  • ARH12
  • ARHA
  • ARHGAP35
  • BCAR1
  • BRK
  • CAS
  • CASS1
  • CED12A
  • CRK
  • CRKAS
  • DOCK1
  • ELMO1
  • ELMO2
  • GAP
  • GRF1
  • GRLF1
  • HRAS
  • HRAS1
  • KIAA0281
  • KIAA1722
  • KIAA1834
  • NRAS
  • P190A
  • PTK6
  • PXN
  • RAC1
  • RASA
  • RASA1
  • RHO12
  • RHOA
  • TC25
  • p190ARHOGAP
Homo sapiens (human)
Regulation of signaling by CBL
  • BASH
  • BLNK
  • CBL
  • CBL2
  • CRK
  • CRKL
  • FYN
  • GRB1
  • GRF2
  • HCK
  • JTK8
  • LYN
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • RAPGEF1
  • RNF55
  • SLP65
  • SYK
  • VAV
  • VAV1
  • YES
  • YES1
Homo sapiens (human)
p130Cas linkage to MAPK signaling for integrins
  • APBB1IP
  • BCAR1
  • CAS
  • CASS1
  • CRK
  • CRKAS
  • F8VWF
  • FAK
  • FAK1
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • FN
  • FN1
  • GP2B
  • GP3A
  • ITGA2B
  • ITGAB
  • ITGB3
  • KIAA1027
  • KREV1
  • PREL1
  • PTK2
  • RAP1A
  • RAP1B
  • RARP1
  • RIAM
  • SRC
  • SRC1
  • TLN
  • TLN1
  • VWF
Homo sapiens (human)
Glycerophospholipid biosynthesis
  • AGK
  • CPN1
  • CPN3
  • CPNE1
  • CPNE3
  • CPNE6
  • CPNE7
  • KIAA0636
  • MULK
Homo sapiens (human)
Eukaryotic Translation Termination
  • APEH
  • BBC1
  • C21orf127
  • CCG2
  • D11S2243E
  • D3F15S2
  • D3S48E
  • D6S218E
  • DNF15S2
  • DXS648E
  • EC45
  • ERF1
  • ERF3A
  • ERF3B
  • ETF1
  • FAU
  • FTE1
  • GSPT1
  • GSPT2
  • HEMK2
  • KMT9
  • LAMBR
  • LAMR1
  • MFTL
  • MPS1
  • N6AMT1
  • NEDD6
  • PRED28
  • QM
  • RF1
  • RIG
  • RPL1
  • RPL10
  • RPL10A
  • RPL10L
  • RPL11
  • RPL12
  • RPL13
  • RPL13A
  • RPL14
  • RPL15
  • RPL17
  • RPL18
  • RPL18A
  • RPL19
  • RPL21
  • RPL22
  • RPL22L1
  • RPL23
  • RPL23A
  • RPL24
  • RPL26
  • RPL26L1
  • RPL26P1
  • RPL27
  • RPL27A
  • RPL28
  • RPL29
  • RPL3
  • RPL30
  • RPL31
  • RPL32
  • RPL34
  • RPL35
  • RPL35A
  • RPL36
  • RPL36A
  • RPL36AL
  • RPL37
  • RPL37A
  • RPL38
  • RPL39
  • RPL39L
  • RPL39L1
  • RPL3L
  • RPL4
  • RPL41
  • RPL44
  • RPL5
  • RPL6
  • RPL7
  • RPL7A
  • RPL8
  • RPL9
  • RPL9P7
  • RPL9P8
  • RPL9P9
  • RPLP0
  • RPLP1
  • RPLP2
  • RPP2
  • RPS10
  • RPS11
  • RPS12
  • RPS13
  • RPS14
  • RPS15
  • RPS15A
  • RPS16
  • RPS17
  • RPS17L
  • RPS18
  • RPS19
  • RPS2
  • RPS20
  • RPS21
  • RPS23
  • RPS24
  • RPS25
  • RPS26
  • RPS27
  • RPS27A
  • RPS27L
  • RPS28
  • RPS29
  • RPS3
  • RPS3A
  • RPS4
  • RPS4X
  • RPS4Y
  • RPS4Y1
  • RPS4Y2
  • RPS4Y2P
  • RPS5
  • RPS6
  • RPS7
  • RPS8
  • RPS9
  • RPSA
  • RRP1
  • SCAR
  • SUP45L1
  • SURF-3
  • SURF3
  • TRMT112
  • TXREB1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
L1CAM interactions
  • ALCAM
  • APT2
  • AXT
  • CAML1
  • CD24
  • CD24A
  • CNTN1
  • CNTN2
  • CSPG3
  • DRT
  • EPHB2
  • EPHT3
  • EPTH3
  • ERK
  • GAP43
  • HEK5
  • L1CAM
  • LAMA
  • LAMA1
  • LAMB1
  • LAMB2
  • LAMC1
  • LYPLA2
  • MEMD
  • MIC5
  • NCAN
  • NEUR
  • RANBP9
  • RANBPM
  • TAG1
  • TAX1
  • TYRO5
Homo sapiens (human)
eNOS activation
  • AKT1
  • APT1
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAV
  • CAV1
  • CYGB
  • DDAH
  • DDAH1
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPC1
  • HSPCA
  • LPL1
  • LYPLA1
  • NOS3
  • PKB
  • RAC
  • SPR
  • STAP
  • ZDHHC21
Homo sapiens (human)
Negative regulation of the PI3K/AKT network
  • AKT1
  • AKT2
  • AKT3
  • C20orf97
  • CTMP
  • KIAA0606
  • KIAA0931
  • MMAC1
  • NIPK
  • PHLPP
  • PHLPP1
  • PHLPP2
  • PHLPPL
  • PKB
  • PKBG
  • PLEKHE1
  • PTEN
  • RAC
  • SCOP
  • SKIP3
  • TEP1
  • THEM4
  • TRB3
  • TRIB3
Homo sapiens (human)
Beta oxidation of butanoyl-CoA to acetyl-CoA
  • ACADS
  • ACSM3
  • ACSM6
  • C10orf129
  • ECHS1
  • HAD
  • HAD1
  • HADH
  • HADHSC
  • SAH
  • SCHAD
Homo sapiens (human)
Conjugation of salicylate with glycine
  • ACGNAT
  • ACSM2
  • ACSM2A
  • ACSM2B
  • ACSM4
  • ACSM5
  • C6orf140
  • CAT
  • GAT
  • GLYAT
  • GLYATL1
  • GLYATL2
  • GLYATL3
  • GNAT
  • MACS2
  • MACS3
Homo sapiens (human)
Conjugation of phenylacetate with glutamine
  • ACSM1
  • ACSM2
  • ACSM2B
  • BUCS1
  • LAE
  • MACS1
Homo sapiens (human)
Conjugation of benzoate with glycine
  • ACGNAT
  • ACSM1
  • ACSM2
  • ACSM2B
  • BUCS1
  • C6orf140
  • CAT
  • GAT
  • GLYAT
  • GLYATL1
  • GLYATL2
  • GLYATL3
  • GNAT
  • LAE
  • MACS1
Homo sapiens (human)
Beta-oxidation of pristanoyl-CoA
  • ACOT8
  • ACOX2
  • ACOX3
  • ACOXL
  • ACTEIII
  • AMACR
  • BRCOX
  • CAT1
  • COT
  • CRAT
  • CROT
  • EDH17B4
  • HSD17B4
  • PRCOX
  • PTE1
  • SDR8C1
Homo sapiens (human)
Acyl chain remodelling of PG
  • AGPAT7
  • AYTL2
  • AYTL3
  • C20orf155
  • CLEC13C
  • CLS1
  • CPLA2
  • CRLS1
  • FAM34A
  • KIAA0205
  • LPCAT1
  • LPCAT4
  • LPEAT2
  • LPGAT1
  • PFAAP3
  • PLA2
  • PLA2A
  • PLA2B
  • PLA2G10
  • PLA2G12
  • PLA2G12A
  • PLA2G1B
  • PLA2G2A
  • PLA2G2D
  • PLA2G2E
  • PLA2G2F
  • PLA2G3
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
  • PLA2G4B
  • PLA2G4D
  • PLA2G4F
  • PLA2G5
  • PLA2L
  • PLA2R1
  • PPLA2
  • RASF-A
  • SPLASH
Homo sapiens (human)
The retinoid cycle in cones (daylight vision)
  • AWAT2
  • BCP
  • CRALBP
  • DC4
  • DGAT2L4
  • DHRS3
  • GCP
  • MFAT
  • OPN1LW
  • OPN1MW
  • OPN1SW
  • RBP3
  • RCP
  • RDH17
  • RLBP1
  • SDR16C1
  • WS
Homo sapiens (human)
Arachidonic acid metabolism
  • AMDD
  • AWAT1
  • CPLA2
  • DGA2
  • DGAT2L3
  • FAAH
  • FAAH1
  • FAAH2
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
Homo sapiens (human)
Respiratory electron transport
  • C12orf62
  • C14orf112
  • C16orf51
  • C7orf44
  • CCDC44
  • COA1
  • COB
  • COI
  • COII
  • COIII
  • COQ10A
  • COQ10B
  • COX11
  • COX14
  • COX16
  • COX18
  • COX19
  • COX2
  • COX20
  • COX4
  • COX4I1
  • COX5A
  • COX5B
  • COX6A1
  • COX6AL
  • COX6B
  • COX6B1
  • COX6C
  • COX7A2L
  • COX7AR
  • COX7B
  • COX7C
  • COX7RP
  • COX8
  • COX8A
  • COX8L
  • COXI
  • COXII
  • COXIII
  • CYB560
  • CYC
  • CYC1
  • CYCS
  • CYTB
  • DAP13
  • ETFA
  • ETFB
  • ETFDH
  • FAM36A
  • GRIM19
  • HSP75
  • HSPC5
  • LRP130
  • LRPPRC
  • LYRM3
  • LYRM6
  • MITRAC15
  • MT-CO1
  • MT-CO2
  • MT-CO3
  • MT-CYB
  • MT-ND1
  • MT-ND2
  • MT-ND3
  • MT-ND4
  • MT-ND5
  • MT-ND6
  • MTCO1
  • MTCO2
  • MTCO3
  • MTCYB
  • MTND1
  • MTND2
  • MTND3
  • MTND4
  • MTND5
  • MTND6
  • NADH1
  • NADH2
  • NADH3
  • NADH4
  • NADH5
  • NADH6
  • NADHB14
  • ND1
  • ND2
  • ND3
  • ND4
  • ND5
  • ND6
  • NDUFA1
  • NDUFA10
  • NDUFA11
  • NDUFA12
  • NDUFA13
  • NDUFA2
  • NDUFA3
  • NDUFA4
  • NDUFA5
  • NDUFA6
  • NDUFA7
  • NDUFA8
  • NDUFA9
  • NDUFAB1
  • NDUFB1
  • NDUFB10
  • NDUFB11
  • NDUFB2
  • NDUFB3
  • NDUFB4
  • NDUFB5
  • NDUFB6
  • NDUFB7
  • NDUFB8
  • NDUFB9
  • NDUFC1
  • NDUFC2
  • NDUFS1
  • NDUFS2
  • NDUFS2L
  • NDUFS3
  • NDUFS4
  • NDUFS5
  • NDUFS6
  • NDUFS7
  • NDUFS8
  • NDUFV1
  • NDUFV2
  • NDUFV3
  • OXA1L2
  • SCO1
  • SCO2
  • SCOD1
  • SDH
  • SDH1
  • SDH2
  • SDH3
  • SDH4
  • SDHA
  • SDHB
  • SDHC
  • SDHD
  • SDHF
  • SURF-1
  • SURF1
  • TACO1
  • TMEM186
  • TRAP1
  • UCRC
  • UQBP
  • UQCR
  • UQCR10
  • UQCR11
  • UQCRB
  • UQCRC1
  • UQCRC2
  • UQCRFS1
  • UQCRH
  • UQCRQ
  • UQOR1
  • UQOR22
Homo sapiens (human)
Complex I biogenesis
  • ACAD9
  • C14orf127
  • C16orf51
  • C20orf7
  • C2orf56
  • C3orf1
  • C3orf60
  • C6orf66
  • C7orf44
  • C8orf38
  • CIA30
  • COA1
  • DAP13
  • ECSIT
  • GRIM19
  • HRPAP20
  • LYRM3
  • LYRM6
  • MITRAC15
  • MT-ND1
  • MT-ND2
  • MT-ND3
  • MT-ND4
  • MT-ND5
  • MT-ND6
  • MTND1
  • MTND2
  • MTND3
  • MTND4
  • MTND5
  • MTND6
  • NADH1
  • NADH2
  • NADH3
  • NADH4
  • NADH5
  • NADH6
  • NADHB14
  • ND1
  • ND2
  • ND3
  • ND4
  • ND5
  • ND6
  • NDUFA1
  • NDUFA10
  • NDUFA11
  • NDUFA12
  • NDUFA12L
  • NDUFA13
  • NDUFA2
  • NDUFA3
  • NDUFA5
  • NDUFA6
  • NDUFA7
  • NDUFA8
  • NDUFA9
  • NDUFAB1
  • NDUFAF1
  • NDUFAF2
  • NDUFAF3
  • NDUFAF4
  • NDUFAF5
  • NDUFAF6
  • NDUFAF7
  • NDUFB1
  • NDUFB10
  • NDUFB11
  • NDUFB2
  • NDUFB3
  • NDUFB4
  • NDUFB5
  • NDUFB6
  • NDUFB7
  • NDUFB8
  • NDUFB9
  • NDUFC1
  • NDUFC2
  • NDUFS1
  • NDUFS2
  • NDUFS2L
  • NDUFS3
  • NDUFS4
  • NDUFS5
  • NDUFS6
  • NDUFS7
  • NDUFS8
  • NDUFV1
  • NDUFV2
  • NDUFV3
  • NUBPL
  • TIMMDC1
  • TMEM126B
  • TMEM186
  • UQOR1
  • UQOR22
Homo sapiens (human)
Protein lipoylation
  • ADX
  • BCATE2
  • BCKDHE2
  • DBT
  • DLAT
  • DLST
  • DLTA
  • DLTS
  • FDX1
  • GCSH
  • HIRIP5
  • LAS
  • LIAS
  • LIPT1
  • LIPT2
  • NDUFAB1
  • NFU1
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

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GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024