GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 301 - 325 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▲ Organism GlyTouCan ID
WNT5A-dependent internalization of FZD4
  • Adtab
  • Ap17
  • Ap2a1
  • Ap2a2
  • Ap2b1
  • Ap2m1
  • Ap2s1
  • Arrb2
  • Clapb1
  • Claps2
  • Clta
  • Cltb
  • Cltc
  • Dvl2
  • Fzd4
  • LOC100361515
  • Pkca
  • Pkcb
  • Pkcc
  • Pkcg
  • Prkca
  • Prkcb
  • Prkcb1
  • Prkcc
  • Prkcg
  • Wnt-5a
  • Wnt5a
Rattus norvegicus (Norway rat)
Recycling pathway of L1
  • Adtab
  • Ap17
  • Ap2a1
  • Ap2a2
  • Ap2b1
  • Ap2m1
  • Ap2s1
  • Caml1
  • Clapb1
  • Claps2
  • Clta
  • Cltc
  • Dnm
  • Dnm1
  • Dnm2
  • Dnm3
  • Dpysl2
  • Dyn2
  • Dyn3
  • Erk2
  • Ezr
  • Kif4a
  • Kif4b
  • L1cam
  • Mapk
  • Mapk1
  • Msn
  • Numb
  • Prkm1
  • Rdx
  • Sh3d2a
  • Sh3gl2
  • Sh3p4
  • Src
  • Vil2
Rattus norvegicus (Norway rat)
WNT5A-dependent internalization of FZD2, FZD5 and ROR2
  • Adtab
  • Ap17
  • Ap2a1
  • Ap2a2
  • Ap2b1
  • Ap2m1
  • Ap2s1
  • Clapb1
  • Claps2
  • Clta
  • Cltb
  • Cltc
  • Fzd2
  • Fzd5
  • Ror1
  • Ror2
  • Wnt-5a
  • Wnt5a
Rattus norvegicus (Norway rat)
Retrograde neurotrophin signalling
  • Adtab
  • Ap17
  • Ap2a1
  • Ap2a2
  • Ap2b1
  • Ap2m1
  • Ap2s1
  • Clapb1
  • Claps2
  • Clta
  • Cltc
  • Dnal4
  • Ngf
  • Ngfb
  • Ntrk1
  • Sh3d2a
  • Sh3gl2
  • Sh3p4
  • Trk
  • Trka
Rattus norvegicus (Norway rat)
VLDLR internalisation and degradation
  • Adtab
  • Ap17
  • Ap2a1
  • Ap2a2
  • Ap2b1
  • Ap2m1
  • Ap2s1
  • Clapb1
  • Claps2
  • Clta
  • Cltc
  • LOC100360645
  • Lxra
  • Lxrb
  • Mylip
  • Narc1
  • Nr1h2
  • Nr1h3
  • Pcsk9
  • Rps27a
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Vldlr
Rattus norvegicus (Norway rat)
Trafficking of GluR2-containing AMPA receptors
  • Adtab
  • Ap17
  • Ap2a1
  • Ap2a2
  • Ap2b1
  • Ap2m1
  • Ap2s1
  • Clapb1
  • Claps2
  • Erg1
  • GluA1
  • GluA2
  • GluA3
  • Glur1
  • Glur2
  • Glur3
  • Glur4
  • Gria1
  • Gria2
  • Gria3
  • Gria4
  • Grip1
  • Grip2
  • Nsf
  • Pick1
  • Pkca
  • Pkcb
  • Pkcc
  • Pkcg
  • Prkca
  • Prkcabp
  • Prkcb
  • Prkcb1
  • Prkcc
  • Prkcg
  • Tspan7
Rattus norvegicus (Norway rat)
Bicarbonate transporters
  • Ae1
  • Ae2
  • Ae3
  • Ae4
  • Ahcyl2
  • B3rp2
  • B3rp3
  • Nbc
  • Nbc1
  • Nbc2
  • Nbc3
  • Nbce1
  • Nbcn1
  • Ncbe
  • Ndcbe1
  • Rnbc1
  • Slc4a1
  • Slc4a10
  • Slc4a2
  • Slc4a3
  • Slc4a4
  • Slc4a5
  • Slc4a7
  • Slc4a8
  • Slc4a9
Rattus norvegicus (Norway rat)
Erythrocytes take up carbon dioxide and release oxygen
  • Ae1
  • Aqp1
  • Ca1
  • Ca2
  • Ca4
  • Car1
  • Chip28
  • Cyb5r1
  • Cyb5r2
  • Cyb5r4
  • Cyb5rl
  • Hba-a1
  • Hba1
  • Hbb
  • Ncb5or
  • Rh50
  • Rhag
  • Slc4a1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Erythrocytes take up oxygen and release carbon dioxide
  • Ae1
  • Aqp1
  • Ca1
  • Ca2
  • Ca4
  • Car1
  • Chip28
  • Hba-a1
  • Hba1
  • Hbb
  • Rh50
  • Rhag
  • Slc4a1
Rattus norvegicus (Norway rat)
PKMTs methylate histone lysines
  • Aebp2
  • Ash1l
  • Ash2l
  • Atf7ip
  • Dot1l
  • Eed
  • Ehmt1
  • Ehmt2
  • Ezh2
  • H3c13
  • H4c16
  • H4c2
  • H4f16
  • H4ft
  • Hist1h4b
  • Hist1h4m
  • Hist2h3c2
  • Hist4
  • Hist4h4
  • Kmt2a
  • Kmt2b
  • Kmt2c
  • Kmt5a
  • Kmt5b
  • Kmt5c
  • LOC120093163
  • LOC498295
  • Mll
  • Mll1
  • Nfkb2
  • Nsd1
  • Nsd2
  • Nsd3
  • Prdm16
  • Prdm9
  • Rbbp4
  • Rbbp5
  • Rbbp7
  • Rela
  • Setd1a
  • Setd1b
  • Setd2
  • Setd3
  • Setd6
  • Setd7
  • Setdb1
  • Setdb2
  • Smyd2
  • Smyd3
  • Suv39h1
  • Suv39h2
  • Suv420h1
  • Suv420h2
  • Suz12
  • Wdr5
  • Whsc1
  • Whsc1l1
Rattus norvegicus (Norway rat)
PRC2 methylates histones and DNA
  • Aebp2
  • Dnmt1
  • Dnmt3a
  • Dnmt3b
  • ENSRNOG00000062927
  • ENSRNOG00000064540
  • ENSRNOG00000066901
  • ENSRNOG00000068034
  • Eed
  • Ezh2
  • H2ab3
  • H2ac10
  • H2ac18
  • H2ac4
  • H2afb3
  • H2afx
  • H2aj
  • H2ax
  • H2az2
  • H2bc1
  • H2bc12l1
  • H2bc6
  • H2bcl1
  • H2bcl2
  • H2bu1
  • H3-3b
  • H3.3b
  • H3c13
  • H3f3b
  • H4c16
  • H4c2
  • H4f16
  • H4ft
  • Hist1h2ba
  • Hist1h2bc
  • Hist1h2bg
  • Hist1h2bo
  • Hist1h2bq
  • Hist1h4b
  • Hist1h4m
  • Hist2h2aa3
  • Hist2h3c2
  • Hist4
  • Hist4h4
  • Jarid2
  • LOC100365043
  • LOC100910200
  • LOC120097726
  • LOC681740
  • LOC684797
  • Mtf2
  • Phf1
  • Phf19
  • Rbbp4
  • Rbbp7
  • Suz12
  • Th2b
Rattus norvegicus (Norway rat)
Adherens junctions interactions
  • Af6
  • Afdn
  • Ang
  • Ang2
  • Cad7
  • Cadm1
  • Cadm2
  • Cadm3
  • Cdh1
  • Cdh10
  • Cdh11
  • Cdh12
  • Cdh13
  • Cdh15
  • Cdh17
  • Cdh18
  • Cdh2
  • Cdh24
  • Cdh3
  • Cdh5
  • Cdh6
  • Cdh7
  • Cdh8
  • Cdh9
  • Igsf4b
  • Igsf4d
  • Kcad
  • Mllt4
  • Necl1
  • Necl3
  • Nectin1
  • Nectin2
  • Nectin3
  • Nectin4
  • Pvrl1
  • Pvrl2
  • Raa2
  • SynCam1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Processing of SMDT1
  • Afg3l2
  • Bcap37
  • Cbara1
  • Efha1
  • Maip1
  • Mcu
  • Mcub
  • Micu1
  • Micu2
  • Micu3
  • Mppa
  • Mppb
  • Parl
  • Phb
  • Phb1
  • Phb2
  • Pmpca
  • Pmpcb
  • Psarl
  • Smdt1
  • Smhs2
  • Spg7
  • Stoml2
  • Yme1l1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Creatine metabolism
  • Agat
  • Ckb
  • Ckbb
  • Ckm
  • Ckmm
  • Ckmt
  • Ckmt1
  • Ckmt2
  • Gabt3
  • Gamt
  • Gat-3
  • Gat-b
  • Gatm
  • Prot
  • Slc6a11
  • Slc6a12
  • Slc6a7
  • Slc6a8
Rattus norvegicus (Norway rat)
Glycerophospholipid biosynthesis
  • Agk
  • Cpne1
  • Cpne3
  • Cpne6
  • Cpne7
Rattus norvegicus (Norway rat)
O-linked glycosylation
  • Ago61
  • B3galnt2
  • Dag1
  • Gtdc2
  • Gyltl1b
  • Large1
  • Large2
  • Pomgnt1
  • Pomgnt2
  • Pomk
  • Pomt1
  • Pomt2
  • Sgk196
Rattus norvegicus (Norway rat)
Tie2 Signaling
  • Agpt2
  • Angpt1
  • Angpt2
  • Angpt4
  • Ash
  • Dok2
  • Grb14
  • Grb2
  • Grb7
  • Hras
  • Hras1
  • Kras
  • Kras2
  • Nras
  • Pik3ca
  • Pik3cb
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Ptpn11
  • Shc1
  • Sos1
  • Tek
Rattus norvegicus (Norway rat)
Retinoid metabolism and transport
  • Agrin
  • Agrn
  • Akr1b10
  • Akr1c1
  • Akr1c21
  • Apoa1
  • Apoa2
  • Apoa4
  • Apob
  • Apoc2
  • Apoc3
  • Apoe
  • Apom
  • Bcdo
  • Bcdo1
  • Bcmo1
  • Bco1
  • Bco2
  • Clps
  • Crbpii
  • Gpc1
  • Gpc2
  • Gpc3
  • Gpc4
  • Gpc5
  • Gpc6
  • Gpihbp1
  • Hsd17b5
  • Hspg1
  • Lpl
  • Lrat
  • Lrp1
  • Lrp10
  • Lrp12
  • Lrp2
  • Lrp8
  • Phlpb
  • Plb1
  • Pnlip
  • Rbp-1
  • Rbp1
  • Rbp2
  • Rbp4
  • Rdh11
  • Sdc1
  • Sdc2
  • Sdc3
  • Sdc4
  • Synd1
  • Synd2
  • Synd3
  • Synd4
  • Tt
  • Ttr
Rattus norvegicus (Norway rat)
A tetrasaccharide linker sequence is required for GAG synthesis
  • Agrin
  • Agrn
  • B3galt6
  • B3gat1
  • B3gat2
  • B4galt7
  • Bcan
  • Behab
  • Bgn
  • Caleb
  • Cspg2
  • Cspg3
  • Cspg4
  • Cspg5
  • Dcn
  • Glcats
  • Gpc1
  • Gpc2
  • Gpc3
  • Gpc4
  • Gpc5
  • Gpc6
  • Hspg1
  • Ncan
  • Ng2
  • Ngc
  • Sdc1
  • Sdc2
  • Sdc3
  • Sdc4
  • Synd1
  • Synd2
  • Synd3
  • Synd4
  • Vcan
  • Xylt1
  • Xylt2
Rattus norvegicus (Norway rat)
HS-GAG degradation
  • Agrin
  • Agrn
  • Glb1
  • Glb1l
  • Glb1l2
  • Glb1l3
  • Gpc1
  • Gpc2
  • Gpc3
  • Gpc4
  • Gpc5
  • Gpc6
  • Gus
  • Gusb
  • Hep
  • Hpse
  • Hpse2
  • Hspg1
  • Ids
  • Idua
  • LOC100363795
  • Naglu
  • Sdc1
  • Sdc2
  • Sdc3
  • Sdc4
  • Sgsh
  • Synd1
  • Synd2
  • Synd3
  • Synd4
Rattus norvegicus (Norway rat)
Peptide ligand-binding receptors
  • Agt
  • Agtr1
  • Agtr1a
  • Agtr2
  • Agtrl1
  • Apel
  • Apj
  • Apln
  • Aplnr
  • At1a
  • B1bkr
  • Bdkrb1
  • Bdkrb2
  • Bkr
  • Brs3
  • Bv8
  • C3
  • C3ar1
  • C5
  • C5ar1
  • C5ar2
  • C5l2
  • C5r1
  • Cck
  • Cckar
  • Cckbr
  • Cmkrl2
  • Ece1
  • Ece2
  • Edn1
  • Edn2
  • Edn3
  • Ednra
  • Ednrb
  • Etbrlp2
  • F2
  • F2r
  • F2rl1
  • F2rl2
  • F2rl3
  • Gal
  • Galn
  • Galnr
  • Galnr1
  • Galnr2
  • Galnr3
  • Galr1
  • Galr2
  • Galr3
  • Gper
  • Gper1
  • Gpr10
  • Gpr14
  • Gpr154
  • Gpr24
  • Gpr30
  • Gpr37
  • Gpr37l1
  • Gpr41
  • Gpr54
  • Gpr66
  • Gpr7
  • Gpr73
  • Gpr73l1
  • Gpr77
  • Grp
  • Grpr
  • Kel
  • Kiss1
  • Kiss1r
  • Kng
  • Kng1
  • Mc1r
  • Mc2r
  • Mc3r
  • Mc4r
  • Mc5r
  • Mch
  • Mchr1
  • Nln
  • Nmb
  • Nmbr
  • Nms
  • Nmu
  • Nmur1
  • Nmur2
  • Npb
  • Npbwr1
  • Nps
  • Npsr1
  • Npw
  • Npy
  • Npy1r
  • Npy4r
  • Npy5r
  • Npyr5
  • Ntr2
  • Nts
  • Ntsr
  • Ntsr1
  • Ntsr2
  • Oor
  • Oprd1
  • Oprk1
  • Oprl
  • Oprl1
  • Oprm1
  • Par1
  • Par2
  • Par3
  • Par4
  • Pdyn
  • Penk
  • Penk-rs
  • Penk1
  • Pkr1
  • Pkr2
  • Pmch
  • Pnoc
  • Pomc
  • Pomc2
  • Ppl8
  • Ppy
  • Ppyr1
  • Prh
  • Prlh
  • Prlhr
  • Prok1
  • Prok2
  • Prokr1
  • Prokr2
  • Psap
  • Pyy
  • Ror-a
  • Ror-b
  • Ror-d
  • Senr
  • Serpina8
  • Sgp1
  • Slc1
  • Smst
  • Sst
  • Sstr1
  • Sstr2
  • Sstr3
  • Sstr4
  • Sstr5
  • Tgr1
  • Trh
  • Trhr
  • Urp
  • Uts2
  • Uts2b
  • Uts2d
  • Uts2r
  • Xk
  • Xkh
  • Xkr1
  • Xrg1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Glyoxylate metabolism and glycine degradation
  • Agt1
  • Agt2
  • Agxt
  • Agxt2
  • Aldh4a1
  • Dao
  • Dao1
  • Ddo
  • Fbp-cII
  • Gnmt
  • Got2
  • Grhpr
  • Hao1
  • Hoga1
  • Hypdh
  • LOC100911156
  • Maat
  • Prodh2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Nuclear Receptor transcription pathway
  • Ahch
  • Ar
  • Bar
  • C-erba-alpha
  • Car
  • Dax1
  • Ear2
  • Erba2
  • Erbal2
  • Erbeta
  • Err2
  • Errg
  • Esr
  • Esr1
  • Esr2
  • Esrl2
  • Esrra
  • Esrrb
  • Esrrg
  • Estr
  • Ftzf1
  • Fxr
  • Grl
  • Hmr
  • Hnf-4
  • Hnf4
  • Hnf4a
  • Hnf4g
  • Hzf-3
  • LOC100365683
  • Lxra
  • Lxrb
  • Med1
  • Mlr
  • Ncor2
  • Ngfib
  • Nor1
  • Nr0b1
  • Nr0b2
  • Nr1a1
  • Nr1a2
  • Nr1c1
  • Nr1c3
  • Nr1d1
  • Nr1d2
  • Nr1f2
  • Nr1h2
  • Nr1h3
  • Nr1h4
  • Nr1i1
  • Nr1i2
  • Nr1i3
  • Nr2a1
  • Nr2b1
  • Nr2b2
  • Nr2b3
  • Nr2c1
  • Nr2c2
  • Nr2e1
  • Nr2e3
  • Nr2f1
  • Nr2f6
  • Nr3a1
  • Nr3a2
  • Nr3b1
  • Nr3b2
  • Nr3b3
  • Nr3c1
  • Nr3c2
  • Nr3c3
  • Nr3c4
  • Nr4a1
  • Nr4a2
  • Nr4a3
  • Nr5a1
  • Nr5a2
  • Nr6a1
  • Nrbf2
  • Nurr1
  • Pgr
  • Ppar
  • Ppara
  • Pparg
  • Pxr
  • Rara
  • Rarb
  • Rarg
  • Rcor-1
  • Rip14
  • Rnr1
  • Rora
  • Rorb
  • Rorc
  • Rxra
  • Rxrb
  • Rxrg
  • Rzrb
  • Shp
  • Tcf14
  • Thra
  • Thrb
  • Tr2
  • Tr4
  • Vdr
Rattus norvegicus (Norway rat)
Separation of Sister Chromatids
  • Ahctf1
  • Aik2
  • Aim1
  • Airk2
  • Anapc1
  • Anapc15
  • Anapc16
  • Anapc2
  • Anapc4
  • Anapc5
  • Anapc7
  • Aprin
  • Ark2
  • As3
  • Aurkb
  • B9d2
  • Bam
  • Birc5
  • Bmh
  • Bub1
  • Bub1b
  • Ccdc99
  • Cdc16
  • Cdc20
  • Cdc23
  • Cdc26
  • Cdc27
  • Cdca1
  • Cdca5
  • Cdca8
  • Cenpc
  • Cenpc1
  • Cenpe
  • Cenpf
  • Cenph
  • Cenpi
  • Cenpk
  • Cenpl
  • Cenpm
  • Cenpn
  • Cenpo
  • Cenpp
  • Cenpq
  • Cenpr
  • Cenpt
  • Cenpu
  • Ckap5
  • Clasp1
  • Clasp2
  • Clip1
  • Crm1
  • Cspg6
  • Cyln1
  • Dhc1
  • Dlc2
  • Dnch1
  • Dnchc1
  • Dnci1
  • Dnci2
  • Dncic1
  • Dncic2
  • Dncl1
  • Dnclc1
  • Dncli1
  • Dncli2
  • Dnec1
  • Dsn1
  • Dyhc
  • Dync1h1
  • Dync1i1
  • Dync1i2
  • Dync1li1
  • Dync1li2
  • Dynll1
  • Dynll2
  • Ercc6l
  • Espl1
  • Fam33a
  • Fshprh1
  • Hdac8
  • Incenp
  • Itgb3bp
  • Kif18a
  • Kif2
  • Kif2a
  • Kif2b
  • Kif2c
  • Knl1
  • Kntc1
  • Krp2
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • LOC100366017
  • LOC100909468
  • LOC100910252
  • LOC102555739
  • LOC679342
  • LOC681185
  • LOC683983
  • LOC684771
  • Lis-1
  • Lis1
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Lrpr1
  • Mad1l1
  • Mad2l1
  • Map1c
  • Mapre1
  • Mecl1
  • Mis12
  • Mlf1ip
  • Mss1
  • Ndc80
  • Nde1
  • Ndel1
  • Nrif3
  • Nsl1
  • Nudc
  • Nude
  • Nude1
  • Nude2
  • Nudel
  • Nuf2
  • Nup107
  • Nup133
  • Nup160
  • Nup37
  • Nup43
  • Nup85
  • Nup98
  • Pafah1b1
  • Pafaha
  • Pcnt1
  • Pds5a
  • Pds5b
  • Pin
  • Plk
  • Plk1
  • Pmf1
  • Ppp1cc
  • Ppp2ca
  • Ppp2cb
  • Ppp2r1a
  • Ppp2r1b
  • Ppp2r5a
  • Ppp2r5b
  • Ppp2r5c
  • Ppp2r5d
  • Ppp2r5e
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
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Rattus norvegicus (Norway rat)
Resolution of Sister Chromatid Cohesion
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Last updated: August 19, 2024