GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 351 - 375 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▼
TFAP2 (AP-2) family regulates transcription of cell cycle factors
  • Kdm5b
  • Myc
  • Tfap2c
Rattus norvegicus (Norway rat)
Degradation of GLI1 by the proteasome
  • Btrc
  • Cul1
  • Gli1
  • Itch
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mecl1
  • Mss1
  • Numb
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Rbx1
  • Ring12
  • Rps27a
  • Skp1
  • Skp1a
  • Sufu
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
TNFR2 non-canonical NF-kB pathway
  • Birc2
  • Birc3
  • Cd40
  • Cd40l
  • Cd40lg
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Lta
  • Ltb
  • Ltbr
  • Map3k14
  • Mecl1
  • Mss1
  • Opgl
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Rankl
  • Ring12
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Tnf
  • Tnfa
  • Tnfb
  • Tnfr2
  • Tnfrsf11a
  • Tnfrsf12a
  • Tnfrsf13c
  • Tnfrsf1b
  • Tnfsf1
  • Tnfsf11
  • Tnfsf12
  • Tnfsf13b
  • Tnfsf14
  • Tnfsf2
  • Tnfsf5
  • Tnlg1d
  • Tnlg4a
  • Traf2
  • Traf3
  • Trance
Rattus norvegicus (Norway rat)
Tie2 Signaling
  • Agpt2
  • Angpt1
  • Angpt2
  • Angpt4
  • Ash
  • Dok2
  • Grb14
  • Grb2
  • Grb7
  • Hras
  • Hras1
  • Kras
  • Kras2
  • Nras
  • Pik3ca
  • Pik3cb
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Ptpn11
  • Shc1
  • Sos1
  • Tek
Rattus norvegicus (Norway rat)
Sphingolipid de novo biosynthesis
  • Abcc1
  • Abcg2
  • Bcrp1
  • Cers2
  • Cers3
  • Cers4
  • Cers5
  • Cers6
  • Cyb5b
  • Cyb5m
  • Degs
  • Degs1
  • Degs2
  • Des1
  • Des2
  • Fa2h
  • Faah
  • Kdsr
  • Lass2
  • Lass3
  • Lcb1
  • Lcb2
  • Mfsd2b
  • Mob
  • Mrp1
  • Omb5
  • Ormdl1
  • Ormdl2
  • Ormdl3
  • Pomt2
  • Samd8
  • Sgms1
  • Sgms2
  • Sphk1
  • Spns2
  • Sptlc1
  • Sptlc2
  • Sptlc3
  • Sptssa
  • Ssspta
  • Tmem23
Rattus norvegicus (Norway rat)
G beta:gamma signalling through PI3Kgamma
  • Akt1
  • Akt2
  • Akt3
  • Arha
  • Arha2
  • Gnb1
  • Gnb2
  • Gnb3
  • Gnb4
  • Gnb5
  • Gng10-ps1
  • Gng11
  • Gng12
  • Gng3
  • Gng4
  • Gng5
  • Gng5-ps4
  • Gng7
  • Gng8
  • Gng9
  • Gngt1
  • Gngt11
  • Gngt5
  • Gngt7
  • Gngt9
  • Pdk1
  • Pdpk1
  • Pik3cg
  • Pik3r5
  • Pik3r6
  • Rhoa
Rattus norvegicus (Norway rat)
Caspase-mediated cleavage of cytoskeletal proteins
  • Add1
  • Argbp2
  • Casp3
  • Casp6
  • Casp7
  • Casp8
  • Cpp32
  • Gas2
  • Gsn
  • Mapt
  • Mch2
  • Mtapt
  • Plec
  • Plec1
  • Sorbs2
  • Spna2
  • Spta2
  • Sptan1
  • Tau
  • Vim
Rattus norvegicus (Norway rat)
Basigin interactions
  • Asc1
  • Atp1b1
  • Atp1b2
  • Atp1b3
  • Bat1
  • Bsg
  • Caml1
  • Cav
  • Cav1
  • ITGA3B
  • Itga3
  • Itga6
  • Itgb1
  • L1cam
  • Lat1
  • Lat2
  • Lat4
  • Mag
  • Mct1
  • Mct3
  • Mct4
  • Mmp1
  • Mmp1a
  • Mpe16
  • Ppia
  • Ppil2
  • Slc16a1
  • Slc16a3
  • Slc16a8
  • Slc3a2
  • Slc7a10
  • Slc7a11
  • Slc7a5
  • Slc7a6
  • Slc7a7
  • Slc7a8
  • Slc7a9
  • Spn
  • Ta1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Chondroitin sulfate biosynthesis
  • Bcan
  • Behab
  • Bgn
  • Caleb
  • Chpf
  • Chpf2
  • Chst11
  • Chst12
  • Chst13
  • Chst15
  • Chst3
  • Chst7
  • Chst9
  • Chsy1
  • Chsy3
  • Csgalnact1
  • Csgalnact2
  • Cspg2
  • Cspg3
  • Cspg4
  • Cspg5
  • Dcn
  • Galnac4s6st
  • Ncan
  • Ng2
  • Ngc
  • Vcan
Rattus norvegicus (Norway rat)
Organic cation transport
  • Aml1
  • Cbfa2
  • Oct1
  • Oct2
  • Oct3
  • Octn1
  • Octn2
  • Orctl2
  • Runx1
  • Slc22a1
  • Slc22a15
  • Slc22a16
  • Slc22a18
  • Slc22a2
  • Slc22a3
  • Slc22a4
  • Slc22a5
  • Tssc5
Rattus norvegicus (Norway rat)
Signaling by Insulin receptor
  • Ins-1
  • Ins1
  • Insr
Rattus norvegicus (Norway rat)
Activation of the mRNA upon binding of the cap-binding complex and eIFs, and subsequent binding to 43S
  • Eif4a1
  • Eif4a2
  • Eif4e
  • Eif4ebp1
  • Eif4g1
Rattus norvegicus (Norway rat)
MET activates PTK2 signaling
  • Egfl3
  • Fak
  • Fak1
  • Hgf
  • ITGA3B
  • Itga2
  • Itga3
  • Itgb1
  • Lama4
  • Megf6
  • Met
  • Ptk2
  • Src
Rattus norvegicus (Norway rat)
Separation of Sister Chromatids
  • Ahctf1
  • Aik2
  • Aim1
  • Airk2
  • Anapc1
  • Anapc15
  • Anapc16
  • Anapc2
  • Anapc4
  • Anapc5
  • Anapc7
  • Aprin
  • Ark2
  • As3
  • Aurkb
  • B9d2
  • Bam
  • Birc5
  • Bmh
  • Bub1
  • Bub1b
  • Ccdc99
  • Cdc16
  • Cdc20
  • Cdc23
  • Cdc26
  • Cdc27
  • Cdca1
  • Cdca5
  • Cdca8
  • Cenpc
  • Cenpc1
  • Cenpe
  • Cenpf
  • Cenph
  • Cenpi
  • Cenpk
  • Cenpl
  • Cenpm
  • Cenpn
  • Cenpo
  • Cenpp
  • Cenpq
  • Cenpr
  • Cenpt
  • Cenpu
  • Ckap5
  • Clasp1
  • Clasp2
  • Clip1
  • Crm1
  • Cspg6
  • Cyln1
  • Dhc1
  • Dlc2
  • Dnch1
  • Dnchc1
  • Dnci1
  • Dnci2
  • Dncic1
  • Dncic2
  • Dncl1
  • Dnclc1
  • Dncli1
  • Dncli2
  • Dnec1
  • Dsn1
  • Dyhc
  • Dync1h1
  • Dync1i1
  • Dync1i2
  • Dync1li1
  • Dync1li2
  • Dynll1
  • Dynll2
  • Ercc6l
  • Espl1
  • Fam33a
  • Fshprh1
  • Hdac8
  • Incenp
  • Itgb3bp
  • Kif18a
  • Kif2
  • Kif2a
  • Kif2b
  • Kif2c
  • Knl1
  • Kntc1
  • Krp2
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • LOC100366017
  • LOC100909468
  • LOC100910252
  • LOC102555739
  • LOC679342
  • LOC681185
  • LOC683983
  • LOC684771
  • Lis-1
  • Lis1
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Lrpr1
  • Mad1l1
  • Mad2l1
  • Map1c
  • Mapre1
  • Mecl1
  • Mis12
  • Mlf1ip
  • Mss1
  • Ndc80
  • Nde1
  • Ndel1
  • Nrif3
  • Nsl1
  • Nudc
  • Nude
  • Nude1
  • Nude2
  • Nudel
  • Nuf2
  • Nup107
  • Nup133
  • Nup160
  • Nup37
  • Nup43
  • Nup85
  • Nup98
  • Pafah1b1
  • Pafaha
  • Pcnt1
  • Pds5a
  • Pds5b
  • Pin
  • Plk
  • Plk1
  • Pmf1
  • Ppp1cc
  • Ppp2ca
  • Ppp2cb
  • Ppp2r1a
  • Ppp2r1b
  • Ppp2r5a
  • Ppp2r5b
  • Ppp2r5c
  • Ppp2r5d
  • Ppp2r5e
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Pttg
  • Pttg1
  • Rad21
  • Ranbp2
  • Rangap1
  • Rcc2
  • Ring12
  • Rps27
  • Rps27a
  • Rsn
  • S27-1
  • Sec13
  • Sec13l1
  • Sgo1
  • Sgo2
  • Sip30
  • Ska1
  • Ska2
  • Ska2l1
  • Smc1
  • Smc1a
  • Smc1l1
  • Smc3
  • Smc3l1
  • Spbc25
  • Spc24
  • Spc24-ps1
  • Spc25
  • Spdl1
  • Stag1
  • Stag2
  • Stk1
  • Stk12
  • Stk5
  • Sug1
  • Tao1
  • Taok1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Ube2c
  • Ube2d1
  • Ube2e1
  • Ube2s
  • Wapl
  • Xpo1
  • Zw10
  • Zwilch
  • Zwint
Rattus norvegicus (Norway rat)
TRAF6 mediated NF-kB activation
  • A4
  • AD1
  • Ager
  • App
  • Chuk
  • Hmg-1
  • Hmg1
  • Hmgb1
  • Hmgb1-ps33
  • Hmgb1-ps4
  • Hmgb1l1
  • Hmgb1l2
  • Hmgb1l3
  • Hmgb1l5
  • Ikba
  • Ikbb
  • Ikbkb
  • Ikbkg
  • Ikkb
  • LOC108349189
  • LOC108350839
  • Nemo
  • Nfkb2
  • Nfkbia
  • Nfkbib
  • Nkiras1
  • Nkiras2
  • Rage
  • Rela
  • S100b
Rattus norvegicus (Norway rat)
Arachidonate production from DAG
  • Abhd12
  • Abhd6
  • Dagla
  • Daglb
  • Mgl2
  • Mgll
  • Nsddr
Rattus norvegicus (Norway rat)
Acyl chain remodelling of PI
  • Cpla2
  • H-rev107
  • Hrasls3
  • Hrev107
  • Pla2g10
  • Pla2g12a
  • Pla2g16
  • Pla2g1b
  • Pla2g2a
  • Pla2g2d
  • Pla2g2f
  • Pla2g4
  • Pla2g4a
  • Pla2g4c
  • Pla2g4d
  • Pla2g4e
  • Pla2g4f
  • Pla2g5
  • Pla2r1
  • Plaat3
  • Plbd1
  • Rlp-3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Type I hemidesmosome assembly
  • Cd151
  • Col17a1
  • Dst
  • Egfl3
  • Itga6
  • Itgb4
  • Megf6
  • Peta3
  • Plec
  • Plec1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Trafficking of GluR2-containing AMPA receptors
  • Adtab
  • Ap17
  • Ap2a1
  • Ap2a2
  • Ap2b1
  • Ap2m1
  • Ap2s1
  • Clapb1
  • Claps2
  • Erg1
  • GluA1
  • GluA2
  • GluA3
  • Glur1
  • Glur2
  • Glur3
  • Glur4
  • Gria1
  • Gria2
  • Gria3
  • Gria4
  • Grip1
  • Grip2
  • Nsf
  • Pick1
  • Pkca
  • Pkcb
  • Pkcc
  • Pkcg
  • Prkca
  • Prkcabp
  • Prkcb
  • Prkcb1
  • Prkcc
  • Prkcg
  • Tspan7
Rattus norvegicus (Norway rat)
Chemokine receptors bind chemokines
  • Acc1
  • Ackr2
  • Ackr3
  • Ackr4
  • Blr1
  • Ccbp2
  • Ccl1
  • Ccl11
  • Ccl12
  • Ccl17
  • Ccl19
  • Ccl20
  • Ccl25
  • Ccl27
  • Ccl3
  • Ccl4
  • Ccl5
  • Ccr10
  • Ccr10rr
  • Ccr3
  • Ccr4
  • Ccr5
  • Ccr6
  • Ccr7
  • Ccr8
  • Ccr9
  • Ccrl1
  • Ccrl2
  • Cinc1
  • Cinc2
  • Cinc3
  • Cmkar4
  • Cmkbr3
  • Cmkbr5
  • Cmkor1
  • Cx3cl1
  • Cx3cr1
  • Cxcl1
  • Cxcl10
  • Cxcl11
  • Cxcl12
  • Cxcl13
  • Cxcl16
  • Cxcl2
  • Cxcl3
  • Cxcl4
  • Cxcl5
  • Cxcl9
  • Cxcr1
  • Cxcr2
  • Cxcr3
  • Cxcr4
  • Cxcr5
  • Cxcr6
  • Cxcr7
  • D6
  • Fkn
  • Gro
  • Il8ra
  • Il8rb
  • Inp10
  • Ltn
  • Mig
  • Mip-2
  • Mip1a
  • Mip1b
  • Mip2
  • Mob1
  • Pf4
  • Rbs11
  • Rdc1
  • Scya11
  • Scya20
  • Scya3
  • Scya4
  • Scya5
  • Scyb1
  • Scyb10
  • Scyb2
  • Scyb4
  • Scyb5
  • Scyc1
  • Scyd1
  • St38
  • XCR1
  • Xcl1
  • Xcr1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Aryl hydrocarbon receptor signalling
  • Ahr
  • Ahrr
  • Aip
  • Arnt
  • Arnt2
  • Hsp84
  • Hsp90ab1
  • Hspc3
  • Hspcb
  • Ptges3
  • Tebp
  • Xap2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Activation of Na-permeable kainate receptors
  • Glur5
  • Glur6
  • Grik1
  • Grik2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Estrogen-stimulated signaling through PRKCZ
  • Erk2
  • Hras
  • Hras1
  • Kras
  • Kras2
  • Mapk
  • Mapk1
  • Nras
  • Pdk1
  • Pdpk1
  • Pkcz
  • Prkcz
  • Prkm1
Rattus norvegicus (Norway rat)
GRB2:SOS provides linkage to MAPK signaling for Integrins
  • Apbb1ip
  • Ash
  • Fak
  • Fak1
  • Fga
  • Fgb
  • Fgg
  • Fn1
  • Grb2
  • Itga2b
  • Itgb3
  • Krev1
  • Ptk2
  • Rap1a
  • Rap1b
  • Sos1
  • Src
  • Tln1
Rattus norvegicus (Norway rat)
RA biosynthesis pathway
  • Adh-1
  • Adh1
  • Adh2
  • Adh4
  • Akr1c1
  • Akr1c21
  • Aldh
  • Aldh1a1
  • Aldh1a2
  • Aldh1a3
  • Aldh6
  • Aldh8a1
  • Crabp1
  • Cyp26a1
  • Cyp26b1
  • Cyp26c1
  • Dhrs4
  • Dhrs9
  • Hsd17b5
  • LOC683474
  • Raldh2
  • Raldh3
  • Rdh10
  • Rdh11
  • Rdh13
  • Rdh14
  • Rdh3
  • Rdh7
  • Sdr16c5
  • eRolDH
Rattus norvegicus (Norway rat)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


Logo License Policies Site Map

Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024