GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 351 - 375 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID ▲ Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
GAB1 signalosome
  • Areg
  • Ash
  • Btc
  • Cbp
  • Csk
  • Dtr
  • Egf
  • Egfr
  • Ereg
  • Gab1
  • Grb2
  • Hbegf
  • Hegfl
  • Pag
  • Pag1
  • Pik3ca
  • Pik3r1
  • Ptpn11
  • Pxn
  • Sdgf
  • Src
  • Tgfa
Rattus norvegicus (Norway rat)
Extra-nuclear estrogen signaling
  • Akt1
  • Areg
  • Btc
  • CaMIII
  • Calm3
  • Cam3
  • Camc
  • Cav
  • Cav1
  • Cav2
  • Dtr
  • Egf
  • Egfr
  • Erbeta
  • Ereg
  • Esr
  • Esr1
  • Esr2
  • Estr
  • Fak
  • Fak1
  • Gnai-1
  • Gnai-2
  • Gnai-3
  • Gnai1
  • Gnai2
  • Gnai3
  • Gnat-3
  • Gnat3
  • Hbegf
  • Hegfl
  • Hrmt1l2
  • Hsp86
  • Hsp90aa1
  • Hspca
  • Igf1r
  • Mmp-7
  • Mmp2
  • Mmp3
  • Mmp7
  • Mmp9
  • Nos3
  • Nr3a1
  • Nr3a2
  • Pik3ca
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Pik3r3
  • Prmt1
  • Ptk2
  • S1pr3
  • Sdgf
  • Serz
  • Shc1
  • Sphk1
  • Src
  • Strn
  • Tgfa
  • Zdhhc7
Rattus norvegicus (Norway rat)
Costimulation by the CD28 family
  • Ailim
  • Ash
  • Btla
  • Grb2
  • Icos
  • Icoslg
  • Pik3ca
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Pik3r3
  • Ptph6
  • Ptpn11
  • Ptpn6
  • Tnfrsf14
Rattus norvegicus (Norway rat)
PI-3K cascade:FGFR4
  • Ash
  • FGF15
  • FGF6
  • Fgf-1
  • Fgf-2
  • Fgf-9
  • Fgf1
  • Fgf16
  • Fgf17
  • Fgf18
  • Fgf19
  • Fgf2
  • Fgf20
  • Fgf23
  • Fgf4
  • Fgf6
  • Fgf7a
  • Fgf7b
  • Fgf8
  • Fgf8a
  • Fgf9
  • Fgfa
  • Fgfr4
  • Frs2
  • Gab1
  • Grb2
  • Klb
  • Pik3ca
  • Pik3r1
  • Ptpn11
Rattus norvegicus (Norway rat)
PI-3K cascade:FGFR2
  • Ash
  • FGF22
  • FGF6
  • Fgf-1
  • Fgf-2
  • Fgf-5
  • Fgf-7
  • Fgf-9
  • Fgf1
  • Fgf10
  • Fgf16
  • Fgf17
  • Fgf18
  • Fgf2
  • Fgf20
  • Fgf22
  • Fgf23
  • Fgf3
  • Fgf4
  • Fgf5
  • Fgf5c
  • Fgf5d
  • Fgf6
  • Fgf7
  • Fgf7a
  • Fgf7b
  • Fgf8
  • Fgf9
  • Fgfa
  • Fgfr2
  • Frs2
  • Gab1
  • Grb2
  • Kgf
  • Pik3ca
  • Pik3r1
  • Ptpn11
Rattus norvegicus (Norway rat)
PI-3K cascade:FGFR1
  • Ash
  • FGF22
  • FGF6
  • Fgf-1
  • Fgf-2
  • Fgf-5
  • Fgf-9
  • Fgf1
  • Fgf10
  • Fgf17
  • Fgf2
  • Fgf20
  • Fgf22
  • Fgf23
  • Fgf3
  • Fgf4
  • Fgf5
  • Fgf5c
  • Fgf5d
  • Fgf6
  • Fgf7a
  • Fgf7b
  • Fgf8
  • Fgf9
  • Fgfa
  • Fgfr1
  • Flg
  • Frs2
  • Gab1
  • Grb2
  • Kl
  • Pik3ca
  • Pik3r1
  • Ptpn11
Rattus norvegicus (Norway rat)
Signaling by LTK
  • Ack1
  • Alkal1
  • Alkal2
  • Ash
  • Fam150a
  • Grb2
  • Irs-1
  • Irs1
  • LOC100910984
  • Ltk
  • Pik3ca
  • Pik3cb
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Shc1
  • Sos1
  • Tnk2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Signaling by ALK
  • Alk
  • Alkal1
  • Alkal2
  • Fam150a
  • Irs-1
  • Irs1
  • Jak3
  • LOC100910984
  • Mdk
  • Pik3ca
  • Pik3cb
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Plcg1
  • Ptn
  • Ptph6
  • Ptpn6
  • Shc1
  • Stat3
Rattus norvegicus (Norway rat)
MET activates PI3K/AKT signaling
  • Ash
  • Gab1
  • Grb2
  • Hgf
  • Met
  • Pik3ca
  • Pik3r1
Rattus norvegicus (Norway rat)
PI3K/AKT activation
  • Arha
  • Arha2
  • Irs-1
  • Irs1
  • Irs2
  • Ngf
  • Ngfb
  • Ntrk1
  • Pik3ca
  • Pik3cb
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Rhoa
  • Trk
  • Trka
Rattus norvegicus (Norway rat)
IRS-mediated signalling
  • Irs-1
  • Irs1
  • Irs2
  • Pik3ca
  • Pik3cb
  • Pik3r1
  • Pik3r2
Rattus norvegicus (Norway rat)
WNT ligand biogenesis and trafficking
  • Gpr177
  • Snx3
  • Tmed5
  • Vps26
  • Vps26a
  • Vps29
  • Vps35
  • Wls
  • Wnt-4
  • Wnt-5a
  • Wnt1
  • Wnt10a
  • Wnt10b
  • Wnt11
  • Wnt16
  • Wnt2b
  • Wnt3
  • Wnt3a
  • Wnt4
  • Wnt5a
  • Wnt5b
  • Wnt6
  • Wnt7a
  • Wnt7b
  • Wnt8a
  • Wnt8b
  • Wnt9a
  • Wnt9b
Rattus norvegicus (Norway rat)
MET activates RAP1 and RAC1
  • Ash
  • Crk
  • Crkl
  • Crko
  • Dock7
  • Gab1
  • Grb2
  • Hgf
  • Krev1
  • Met
  • Rac
  • Rac1
  • Rap1a
  • Rap1b
  • Rapgef1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Keratan sulfate biosynthesis
  • Acan
  • Agc
  • Agc1
  • B3gnt2
  • B3gnt3
  • B3gnt4
  • B3gnt7
  • B4galt2
  • B4galt3
  • B4galt4
  • B4galt5
  • B4galt6
  • Chst1
  • Chst2
  • Chst5
  • Fmod
  • Kera
  • Lcn
  • Ldc
  • Lum
  • Omd
  • Prelp
  • Siat10
  • Siat4b
  • Siat4c
  • Siat5
  • Siat6
  • Slc35d2
  • St3gal1
  • St3gal2
  • St3gal3
  • St3gal4
  • St3gal6
Rattus norvegicus (Norway rat)
N-Glycan antennae elongation
  • B4galt2
  • B4galt3
  • B4galt4
  • B4galt5
  • B4galt6
  • Mgat4a
  • Mgat4b
  • Mgat4c
  • Mgat5
  • Siat1
  • Siat4c
  • Siat8b
  • St3gal4
  • St6gal1
  • St8sia2
  • St8sia3
  • Stx
Rattus norvegicus (Norway rat)
Glycosphingolipid biosynthesis
  • A4galt
  • B3galnt1
  • B3galt3
  • B3galt4
  • B3gnt5
  • B4galnt1
  • B4galt5
  • B4galt6
  • Cerk
  • Cgt
  • Fta
  • Ftb
  • Fut1
  • Fut2
  • Gal3st1
  • Galgt
  • Galgt1
  • Sec1
  • Siat4b
  • Siat5
  • Siat6
  • Siat8e
  • Siat9
  • St3gal2
  • St3gal3
  • St3gal5
  • St6galnac5
  • St6galnac6
  • St8sia5
  • St8siav
  • Ugcg
  • Ugt4
  • Ugt8
Rattus norvegicus (Norway rat)
SUMOylation of DNA replication proteins
  • Aaas
  • Aik2
  • Aim1
  • Airk2
  • Ark2
  • Aurkb
  • Birc5
  • Cdca8
  • Gp210
  • Incenp
  • LOC683983
  • Mrnp41
  • Ndc1
  • Npap60
  • Nup107
  • Nup121
  • Nup133
  • Nup153
  • Nup155
  • Nup160
  • Nup188
  • Nup205
  • Nup210
  • Nup214
  • Nup35
  • Nup37
  • Nup42
  • Nup43
  • Nup50
  • Nup53
  • Nup54
  • Nup58
  • Nup62
  • Nup84
  • Nup85
  • Nup88
  • Nup93
  • Nup98
  • Nupl1
  • Nupl2
  • Pcna
  • Pcnt1
  • Pias3
  • Pias4
  • Pom121
  • Pom210
  • Rae1
  • Ranbp2
  • Rangap1
  • Smt3a
  • Smt3h2
  • Stk1
  • Stk12
  • Stk5
  • Sumo1
  • Sumo2
  • Sumo3
  • Tmem48
  • Top-2
  • Top1
  • Top2
  • Top2a
  • Top2b
  • Tpr
  • Ubce9
  • Ube2i
Rattus norvegicus (Norway rat)
snRNP Assembly
  • Aaas
  • Clns1a
  • Ddx20
  • Fam51a1
  • Gemin2
  • Gemin4
  • Gemin5
  • Gemin6
  • Gemin7
  • Gemin7l1
  • Gemin8
  • Gp210
  • Icln
  • LOC683983
  • LOC687679
  • Mep50
  • Mrnp41
  • Ncoa6ip
  • Ndc1
  • Npap60
  • Nup107
  • Nup121
  • Nup133
  • Nup153
  • Nup155
  • Nup160
  • Nup188
  • Nup205
  • Nup210
  • Nup214
  • Nup35
  • Nup37
  • Nup42
  • Nup43
  • Nup50
  • Nup53
  • Nup54
  • Nup58
  • Nup62
  • Nup84
  • Nup85
  • Nup88
  • Nup93
  • Nup98
  • Nupl1
  • Nupl2
  • Pcnt1
  • Pimt
  • Pom121
  • Pom210
  • Prmt5
  • Rae1
  • Ranbp2
  • Rcl1
  • Rnut1
  • SNRPD2
  • SNRPD3
  • Sec13
  • Sec13l1
  • Sip1
  • Smn
  • Smn1
  • Snrpb
  • Snrpd2
  • Snrpd3
  • Snrpe
  • Snrpepl2
  • Snrpf
  • Snrpg
  • Snrpgl1
  • Snupn
  • Tgs1
  • Tmem48
  • Tpr
  • Wdr77
Rattus norvegicus (Norway rat)
Nuclear Pore Complex (NPC) Disassembly
  • Aaas
  • Ccnb1
  • Ccnb2
  • Ccnb2-ps2
  • Cdc2
  • Cdc2a
  • Cdk1
  • Cdkn1
  • Gp210
  • LOC683983
  • Mrnp41
  • Ndc1
  • Npap60
  • Nup107
  • Nup121
  • Nup133
  • Nup153
  • Nup155
  • Nup160
  • Nup188
  • Nup205
  • Nup210
  • Nup214
  • Nup35
  • Nup37
  • Nup42
  • Nup43
  • Nup50
  • Nup53
  • Nup54
  • Nup58
  • Nup62
  • Nup84
  • Nup85
  • Nup88
  • Nup93
  • Nup98
  • Nupl1
  • Nupl2
  • Pcnt1
  • Pom121
  • Pom210
  • Rae1
  • Ranbp2
  • Sec13
  • Sec13l1
  • Tmem48
  • Tpr
Rattus norvegicus (Norway rat)
SUMOylation of ubiquitinylation proteins
  • Aaas
  • Gp210
  • LOC683983
  • Mdm2
  • Miz1
  • Mrnp41
  • Ndc1
  • Npap60
  • Nup107
  • Nup121
  • Nup133
  • Nup153
  • Nup155
  • Nup160
  • Nup188
  • Nup205
  • Nup210
  • Nup214
  • Nup35
  • Nup37
  • Nup42
  • Nup43
  • Nup50
  • Nup53
  • Nup54
  • Nup58
  • Nup62
  • Nup84
  • Nup85
  • Nup88
  • Nup93
  • Nup98
  • Nupl1
  • Nupl2
  • Pcnt1
  • Pias1
  • Pias2
  • Pias4
  • Piasx
  • Pml
  • Pom121
  • Pom210
  • Rae1
  • Ranbp2
  • Sec13
  • Sec13l1
  • Sumo1
  • Tmem48
  • Tpr
  • Trim27
  • Ubce9
  • Ube2i
  • Vhl
Rattus norvegicus (Norway rat)
SUMOylation of SUMOylation proteins
  • Aaas
  • Gp210
  • LOC683983
  • Mrnp41
  • Ndc1
  • Npap60
  • Nup107
  • Nup121
  • Nup133
  • Nup153
  • Nup155
  • Nup160
  • Nup188
  • Nup205
  • Nup210
  • Nup214
  • Nup35
  • Nup37
  • Nup42
  • Nup43
  • Nup50
  • Nup53
  • Nup54
  • Nup58
  • Nup62
  • Nup84
  • Nup85
  • Nup88
  • Nup93
  • Nup98
  • Nupl1
  • Nupl2
  • Pcnt1
  • Pias4
  • Pom121
  • Pom210
  • Rae1
  • Ranbp2
  • Sec13
  • Sec13l1
  • Smt3a
  • Smt3h2
  • Sumo1
  • Sumo2
  • Tmem48
  • Topors
  • Tpr
  • Ubce9
  • Ube2i
Rattus norvegicus (Norway rat)
Transport of the SLBP Dependant Mature mRNA
  • Aaas
  • Alyref
  • Cbp20
  • Cbp80
  • Eif4e
  • Gp210
  • LOC683983
  • Mrnp41
  • Ncbp1
  • Ncbp2
  • Ndc1
  • Npap60
  • Nup107
  • Nup121
  • Nup133
  • Nup153
  • Nup155
  • Nup160
  • Nup188
  • Nup205
  • Nup210
  • Nup214
  • Nup35
  • Nup37
  • Nup42
  • Nup43
  • Nup50
  • Nup53
  • Nup54
  • Nup58
  • Nup62
  • Nup84
  • Nup85
  • Nup88
  • Nup93
  • Nup98
  • Nupl1
  • Nupl2
  • Nxf1
  • Pcnt1
  • Pom121
  • Pom210
  • Rae1
  • Ranbp2
  • Sec13
  • Sec13l1
  • Slbp
  • Tap
  • Tmem48
  • Tpr
Rattus norvegicus (Norway rat)
Transport of the SLBP independent Mature mRNA
  • Aaas
  • Alyref
  • Cbp20
  • Cbp80
  • Eif4e
  • Gp210
  • LOC683983
  • Mrnp41
  • Ncbp1
  • Ncbp2
  • Ndc1
  • Npap60
  • Nup107
  • Nup121
  • Nup133
  • Nup153
  • Nup155
  • Nup160
  • Nup188
  • Nup205
  • Nup210
  • Nup214
  • Nup35
  • Nup37
  • Nup42
  • Nup43
  • Nup50
  • Nup53
  • Nup54
  • Nup58
  • Nup62
  • Nup84
  • Nup85
  • Nup88
  • Nup93
  • Nup98
  • Nupl1
  • Nupl2
  • Nxf1
  • Pcnt1
  • Pom121
  • Pom210
  • Rae1
  • Ranbp2
  • Sec13
  • Sec13l1
  • Tap
  • Tmem48
  • Tpr
Rattus norvegicus (Norway rat)
Regulation of Glucokinase by Glucokinase Regulatory Protein
  • Aaas
  • Gck
  • Gckr
  • Gp210
  • LOC683983
  • Mrnp41
  • Ndc1
  • Npap60
  • Nup107
  • Nup121
  • Nup133
  • Nup153
  • Nup155
  • Nup160
  • Nup188
  • Nup205
  • Nup210
  • Nup214
  • Nup35
  • Nup37
  • Nup42
  • Nup43
  • Nup50
  • Nup53
  • Nup54
  • Nup58
  • Nup62
  • Nup84
  • Nup85
  • Nup88
  • Nup93
  • Nup98
  • Nupl1
  • Nupl2
  • Pcnt1
  • Pom121
  • Pom210
  • Rae1
  • Ranbp2
  • Sec13
  • Sec13l1
  • Tmem48
  • Tpr
Rattus norvegicus (Norway rat)
TFAP2 (AP-2) family regulates transcription of cell cycle factors
  • Kdm5b
  • Myc
  • Tfap2c
Rattus norvegicus (Norway rat)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Last updated: August 19, 2024