GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 26 - 50 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▲ Organism GlyTouCan ID
Intrinsic Pathway of Fibrin Clot Formation
  • A2m
  • A2m1
  • C1qbp
  • Cf9
  • F10
  • F11
  • F12
  • F2
  • F8
  • F9
  • Gc1qbp
  • Gp1ba
  • Gp1bb
  • Gp5
  • Gp9
  • Hcf2
  • Klk3
  • Klkb1
  • Kng
  • Kng1
  • Pi7
  • Pk
  • Pn1
  • Prcp
  • Proc
  • Pros
  • Pros1
  • Serpina5
  • Serpinc1
  • Serpind1
  • Serpine2
  • Serping1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Mitochondrial protein degradation
  • A4
  • AABR07056686.1
  • AC094055.1
  • AD1
  • Acad8
  • Acadsb
  • Acat1
  • Aco2
  • Acot1
  • Acot2
  • Acot3
  • Acot5
  • Afg3l2
  • Alas1
  • Aldh18a1
  • Aldh1b1
  • Aldh2
  • Aldhx
  • Ant2
  • App
  • Arg2
  • Atp5a1
  • Atp5b
  • Atp5c
  • Atp5c1
  • Atp5f1a
  • Atp5f1b
  • Atp5f1c
  • Atp5h
  • Atp5j
  • Atp5jd
  • Atp5l
  • Atp5mg
  • Atp5o
  • Atp5pd
  • Atp5pf
  • Atp5po
  • Atp6
  • Atpase6
  • Bdh
  • Bdh1
  • Clpp
  • Clpx
  • Coi
  • Cox5a
  • Cox5b
  • Cs
  • Cte1
  • Dbt
  • Dci
  • Dld
  • Ech1
  • Eci1
  • Erab
  • Fech
  • Fh
  • Fh1
  • Glud
  • Glud1
  • Grp75
  • Had
  • Hadh
  • Hadh2
  • Hadhsc
  • Hmgcs2
  • Hsd17b10
  • Hsp60
  • Hspa9
  • Hspa9a
  • Hspd1
  • Htra2
  • Iars2
  • Idh2
  • Idh3a
  • LOC100911483
  • Ldhd
  • Lon
  • Lonp1
  • Mdh2
  • Me2
  • Mnadk
  • Mor1
  • Mppa
  • Mrpl12
  • Mrpl32
  • Mrps10
  • Mrps2
  • Mt-atp6
  • Mt-co1
  • Mtatp6
  • Mtco1
  • Mte1
  • Nadk2
  • Nadkd1
  • Ndufa13
  • Ndufa2
  • Ndufs1
  • Ndufs3
  • Ndufv1
  • Ndufv3
  • Ogdh
  • Ogdhl
  • Oxct
  • Oxct1
  • Oxsm
  • Pccb
  • Pdh
  • Pdha1l1
  • Pdhb
  • Pdk1
  • Peo1
  • Pmpca
  • Prkaca
  • Prss15
  • Qpc
  • SUCLG2
  • Schad
  • Scot
  • Shmt2
  • Slc25a5
  • Smdt1
  • Spg7
  • Ssbp
  • Ssbp1
  • Star
  • Suclg2
  • Tfam
  • Twnk
  • Uqcrc2
  • Uqcrq
Rattus norvegicus (Norway rat)
Lysosome Vesicle Biogenesis
  • A4
  • AD1
  • Adtb1
  • Ap1b1
  • Ap1g1
  • Ap1g2
  • Ap1m1
  • Ap1m2
  • Ap1s1
  • Ap1s2
  • Ap1s3
  • Ap4b1
  • Ap4e1
  • Ap4m1
  • Ap4s1
  • App
  • Arf1
  • Arrb1
  • Bloc1s1
  • Chmp2a
  • Clta
  • Cltb
  • Cltc
  • Clvs1
  • Clvs2
  • Ctsy
  • Ctsz
  • Dnajc6
  • Dnase2
  • Dnase2a
  • Dnl2
  • Dnm2
  • Dyn2
  • Gns
  • Hgs
  • Hrs
  • Hrs2
  • Hsc70
  • Hsc73
  • Hspa8
  • M6pr
  • Rlbp1l1
  • Rlbp1l2
  • Sh3d2a
  • Sh3gl2
  • Sh3p4
  • Syb2
  • Sybl1
  • Txndc5
  • Vamp2
  • Vamp7
  • Vamp8
Rattus norvegicus (Norway rat)
Advanced glycosylation endproduct receptor signaling
  • A4
  • AD1
  • Ager
  • App
  • Capza1
  • Capza2
  • Hmg-1
  • Hmg1
  • Hmgb1
  • Hmgb1-ps33
  • Hmgb1-ps4
  • Hmgb1l1
  • Hmgb1l2
  • Hmgb1l3
  • Hmgb1l5
  • LOC108349189
  • LOC108350839
  • Rage
  • S100b
Rattus norvegicus (Norway rat)
TRAF6 mediated NF-kB activation
  • A4
  • AD1
  • Ager
  • App
  • Chuk
  • Hmg-1
  • Hmg1
  • Hmgb1
  • Hmgb1-ps33
  • Hmgb1-ps4
  • Hmgb1l1
  • Hmgb1l2
  • Hmgb1l3
  • Hmgb1l5
  • Ikba
  • Ikbb
  • Ikbkb
  • Ikbkg
  • Ikkb
  • LOC108349189
  • LOC108350839
  • Nemo
  • Nfkb2
  • Nfkbia
  • Nfkbib
  • Nkiras1
  • Nkiras2
  • Rage
  • Rela
  • S100b
Rattus norvegicus (Norway rat)
TAK1-dependent IKK and NF-kappa-B activation
  • A4
  • AD1
  • Ager
  • App
  • Chuk
  • Hmg-1
  • Hmg1
  • Hmgb1
  • Hmgb1-ps33
  • Hmgb1-ps4
  • Hmgb1l1
  • Hmgb1l2
  • Hmgb1l3
  • Hmgb1l5
  • Ikba
  • Ikbb
  • Ikbkb
  • Ikbkg
  • Ikkb
  • LOC108349189
  • LOC108350839
  • Nemo
  • Nfkb2
  • Nfkbia
  • Nfkbib
  • Nkiras1
  • Nkiras2
  • Rage
  • Rela
  • S100b
Rattus norvegicus (Norway rat)
Insertion of tail-anchored proteins into the endoplasmic reticulum membrane
  • A4
  • AD1
  • Aldh3a2
  • Aldh4
  • App
  • Cyb5
  • Cyb5a
  • Emd
  • Hmox1
  • Prn
  • Prnp
  • Prp
  • Ramp4
  • Sap
  • Sec61b
  • Sec61g
  • Serp1
  • Sgt
  • Sgt1
  • Sgta
  • Stg
  • Stx1a
  • Stx5
  • Stx5a
  • Syb2
  • Ube2j2
  • Vamp2
  • Vap33
  • Vapa
Rattus norvegicus (Norway rat)
Formyl peptide receptors bind formyl peptides and many other ligands
  • A4
  • AD1
  • Anx1
  • Anxa1
  • App
  • Ccl6
  • Ccl9
  • Fpr1
  • Fpr2
  • Fpr2l3
  • Hebp1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Glycosphingolipid biosynthesis
  • A4galt
  • B3galnt1
  • B3galt3
  • B3galt4
  • B3gnt5
  • B4galnt1
  • B4galt5
  • B4galt6
  • Cerk
  • Cgt
  • Fta
  • Ftb
  • Fut1
  • Fut2
  • Gal3st1
  • Galgt
  • Galgt1
  • Sec1
  • Siat4b
  • Siat5
  • Siat6
  • Siat8e
  • Siat9
  • St3gal2
  • St3gal3
  • St3gal5
  • St6galnac5
  • St6galnac6
  • St8sia5
  • St8siav
  • Ugcg
  • Ugt4
  • Ugt8
Rattus norvegicus (Norway rat)
O-linked glycosylation of mucins
  • A4gnt
  • AC096792.1
  • B3gnt2
  • B3gnt3
  • B3gnt4
  • B3gnt5
  • B3gnt6
  • B3gnt7
  • B3gnt8
  • B3gnt9
  • B3gntl1
  • B4galt5
  • B4galt6
  • C1galt1
  • C1galt1c1
  • Chst4
  • Galnt1
  • Galnt10
  • Galnt11
  • Galnt12
  • Galnt13
  • Galnt15
  • Galnt16
  • Galnt17
  • Galnt18
  • Galnt2
  • Galnt5
  • Galnt6
  • Galnt7
  • Galnt9
  • Galntl5
  • Galntl6
  • Gcnt1
  • Gcnt3
  • Gcnt4
  • Gcnt7
  • LOC102550196
  • Muc1
  • Muc13
  • Muc15
  • Muc19
  • Muc2
  • Muc20
  • Muc4
  • Muc5ac
  • Muc5b
  • Muc6
  • Qtgal
  • Smc
  • gcnt
Rattus norvegicus (Norway rat)
MHC class II antigen presentation
  • AABR07000222.1
  • AABR07044416.1
  • Actr10
  • Actr1a
  • Actr1b
  • Adtab
  • Adtb1
  • Ap17
  • Ap1b1
  • Ap1g1
  • Ap1m1
  • Ap1m2
  • Ap1s1
  • Ap1s2
  • Ap1s3
  • Ap2a1
  • Ap2a2
  • Ap2b1
  • Ap2m1
  • Ap2s1
  • Arf1
  • Arrb2-ps
  • Canx
  • Capza1
  • Capza2
  • Capza3
  • Capzb
  • Cd74
  • Cenpe
  • Clapb1
  • Claps2
  • Clta
  • Cltc
  • Ctrn1
  • Cts7l2
  • Ctsa
  • Ctsb
  • Ctsc
  • Ctsd
  • Ctse
  • Ctsf
  • Ctsh
  • Ctsk
  • Ctsl
  • Ctsl1
  • Ctsll3
  • Ctso
  • Ctss
  • DA1
  • DOb
  • Db2
  • Dctn1
  • Dctn2
  • Dctn3l1
  • Dctn4
  • Dctn5
  • Dctn6
  • Dhc1
  • Dlc2
  • Dnch1
  • Dnchc1
  • Dnci1
  • Dnci2
  • Dncic1
  • Dncic2
  • Dncl1
  • Dnclc1
  • Dncli1
  • Dncli2
  • Dnec1
  • Dnm
  • Dnm1
  • Dnm2
  • Dnm3
  • Dyhc
  • Dyn2
  • Dyn3
  • Dync1h1
  • Dync1i1
  • Dync1i2
  • Dync1li1
  • Dync1li2
  • Dynll1
  • Dynll2
  • H2-Ea
  • Hla-dma
  • Hla-dmb
  • Ifi30
  • Khc
  • Kif11
  • Kif15
  • Kif18a
  • Kif2
  • Kif22
  • Kif23
  • Kif26a
  • Kif2a
  • Kif2b
  • Kif2c
  • Kif3a
  • Kif3b
  • Kif3c
  • Kif4a
  • Kif4b
  • Kif5a
  • Kif5b
  • Kifap3
  • Klc
  • Klc1
  • Klc2
  • Klc3
  • Klc4
  • Klp2
  • Kns2
  • Knsl8
  • Krp2
  • LOC100911800
  • Lag3
  • Lgmn
  • Map1c
  • Orp1
  • Osbpl1a
  • Pin
  • Prsc1
  • Psmb9
  • RGD1308751
  • RT1-Ba
  • RT1-Bb
  • RT1-DMa
  • RT1-DMb
  • RT1-DOb
  • RT1-Da
  • RT1-Db1
  • RT1-Db2
  • RT1-Ha
  • RT1-Hb-ps1
  • Rab7
  • Rab7a
  • Racgap1
  • Rilp
  • Sar1b
  • Sec13
  • Sec13l1
  • Sec23a
  • Sec24a
  • Sec24b
  • Sec24c
  • Sec24d
  • Sec31a
  • Sec31l1
  • Sh3d2a
  • Sh3gl2
  • Sh3p4
  • Spnb3
  • Sptbn2
  • Tap1
  • Tap2
  • Tesb
  • Vap1
Rattus norvegicus (Norway rat)
COPI-independent Golgi-to-ER retrograde traffic
  • AABR07000222.1
  • Actr10
  • Actr1a
  • Agpat3
  • Bicd1
  • Bicd2
  • Capza1
  • Capza2
  • Capza3
  • Capzb
  • Cpla2
  • Ctrn1
  • Dctn1
  • Dctn2
  • Dctn3l1
  • Dctn4
  • Dctn5
  • Dctn6
  • Dhc1
  • Dlc2
  • Dnch1
  • Dnchc1
  • Dnci1
  • Dnci2
  • Dncic1
  • Dncic2
  • Dncl1
  • Dnclc1
  • Dncli1
  • Dncli2
  • Dnec1
  • Dyhc
  • Dync1h1
  • Dync1i1
  • Dync1i2
  • Dync1li1
  • Dync1li2
  • Dynll1
  • Dynll2
  • Galnt1
  • Galnt2
  • Lis-1
  • Lis1
  • Map1c
  • Pafah1b1
  • Pafah1b2
  • Pafah1b3
  • Pafaha
  • Pafahb
  • Pafahg
  • Pin
  • Pla2g4
  • Pla2g4a
  • Pla2g6
  • Pnpla9
  • Rab18
  • Rab3gap
  • Rab3gap1
  • Rab3gap2
  • Rab6
  • Rab6a
  • Rab6b
Rattus norvegicus (Norway rat)
COPI-mediated anterograde transport
  • AABR07000222.1
  • Actr10
  • Actr1a
  • Ank1
  • Arcn1
  • Arf1
  • Arf1gap
  • Arf3
  • Arf4
  • Arf5
  • Arfgap1
  • Arfgap2
  • Arfgap3
  • Bet1
  • Bet1l
  • Capza1
  • Capza2
  • Capza3
  • Capzb
  • Cd55
  • Cd59
  • Cog1
  • Cog2
  • Cog3
  • Cog4
  • Cog5
  • Cog6
  • Cog7
  • Copa
  • Copb
  • Copb1
  • Copb2
  • Copd
  • Cope
  • Copg
  • Copg1
  • Copg2
  • Copz1
  • Copz2
  • Ctrn1
  • Dctn1
  • Dctn2
  • Dctn3l1
  • Dctn4
  • Dctn5
  • Dctn6
  • Dhc1
  • Dlc2
  • Dnch1
  • Dnchc1
  • Dnci1
  • Dnci2
  • Dncic1
  • Dncic2
  • Dncl1
  • Dnclc1
  • Dncli1
  • Dncli2
  • Dnec1
  • Dyhc
  • Dync1h1
  • Dync1i1
  • Dync1i2
  • Dync1li1
  • Dync1li2
  • Dynll1
  • Dynll2
  • Erg1
  • Folr1
  • Gbf1
  • Golga2
  • Golgb1
  • Gorasp1
  • Gosr1
  • Gosr2
  • Grasp65
  • Gs15
  • Gs27
  • Gs28
  • Ins-1
  • Ins1
  • Kdelr1
  • Kdelr2
  • Kdelr3
  • Map1c
  • Napa
  • Napb
  • Napg
  • Nsf
  • Pin
  • Rab1
  • Rab1A
  • Rab1b
  • Rnp24
  • Snap
  • Snapa
  • Snapb
  • Spna2
  • Spnb3
  • Spta1
  • Spta2
  • Sptan1
  • Sptb
  • Sptbn1
  • Sptbn2
  • Sptbn4
  • Sptbn5
  • Stx5
  • Stx5a
  • Tmed10
  • Tmed2
  • Tmed3
  • Tmed7
  • Tmed9
  • Tmem115
  • Tmp21
  • Uso1
  • Vdp
  • Ykt6
  • Zfp289
  • Znf289
Rattus norvegicus (Norway rat)
HSP90 chaperone cycle for SHRs
  • AABR07000222.1
  • Actr10
  • Actr1a
  • Ar
  • Capza1
  • Capza2
  • Capza3
  • Capzb
  • Ctrn1
  • Dctn1
  • Dctn2
  • Dctn3l1
  • Dctn4
  • Dctn5
  • Dctn6
  • Dhc1
  • Dlc2
  • Dnaja1
  • Dnaja2
  • Dnaja4
  • Dnajb1
  • Dnch1
  • Dnchc1
  • Dnci1
  • Dnci2
  • Dncic1
  • Dncic2
  • Dncl1
  • Dnclc1
  • Dncli1
  • Dncli2
  • Dnec1
  • Dyhc
  • Dync1h1
  • Dync1i1
  • Dync1i2
  • Dync1li1
  • Dync1li2
  • Dynll1
  • Dynll2
  • Fkbp4
  • Fkbp5
  • Fkbp52
  • Grl
  • Hop
  • Hsc70
  • Hsc73
  • Hsj2
  • Hsp70-1
  • Hsp70-2
  • Hsp70-3
  • Hsp84
  • Hsp86
  • Hsp90aa1
  • Hsp90ab1
  • Hspa1
  • Hspa1a
  • Hspa1b
  • Hspa1l
  • Hspa2
  • Hspa8
  • Hspc3
  • Hspca
  • Hspcb
  • Hst70
  • Map1c
  • Mlr
  • Nr3c1
  • Nr3c2
  • Nr3c3
  • Nr3c4
  • Pgr
  • Pin
  • Ptges3
  • Rdj1
  • Stip1
  • Tebp
Rattus norvegicus (Norway rat)
Anchoring of the basal body to the plasma membrane
  • AABR07000222.1
  • Actr1a
  • Ahi1
  • Akap9
  • Alms1
  • Azi1
  • B9d1
  • B9d2
  • C2cd3
  • Cc2d2a
  • Ccdc41
  • Ccdc5
  • Ccp110
  • Cdc2
  • Cdc2a
  • Cdk1
  • Cdk5rap2
  • Cdkn1
  • Cenpj
  • Cep131
  • Cep135
  • Cep152
  • Cep162
  • Cep164
  • Cep192
  • Cep250
  • Cep290
  • Cep41
  • Cep43
  • Cep57
  • Cep63
  • Cep70
  • Cep72
  • Cep76
  • Cep78
  • Cep83
  • Cep89
  • Cep97
  • Cetn2
  • Ck1e-2
  • Ckap5
  • Clasp1
  • Csnk1d
  • Csnk1e
  • Ctrn1
  • Dctn1
  • Dctn2
  • Dctn3l1
  • Dhc1
  • Dnch1
  • Dnchc1
  • Dnci2
  • Dncic2
  • Dncl1
  • Dnclc1
  • Dnec1
  • Dyhc
  • Dync1h1
  • Dync1i2
  • Dynll1
  • Eppb9
  • Fbf1
  • Fgfr1op
  • Haus1
  • Haus4
  • Haus5
  • Haus6
  • Haus7
  • Haus8
  • Hckid
  • Hice1
  • Hsp86
  • Hsp90aa1
  • Hspca
  • Iqcb1
  • Kif24
  • LOC309692
  • Lis-1
  • Lis1
  • Map1c
  • Mapre1
  • Mark4
  • Mks1
  • Mks3
  • Nde1
  • Nedd1
  • Nek2l1
  • Ninl
  • Nphp1
  • Nphp4
  • Nude
  • Nude1
  • Ny-sar-48
  • Odf2
  • Odf84
  • Ofd1
  • Pafah1b1
  • Pafaha
  • Pcm1
  • Pcnt
  • Pin
  • Plk
  • Plk1
  • Plk4
  • Ppp2r1a
  • Prkaca
  • Prkar2b
  • Qn1
  • Rab11
  • Rab11a
  • Rab3ip
  • Rab8
  • Rab8a
  • Rabin3
  • Rabin8
  • Rpgrip1l
  • Sak
  • Sap1
  • Sclt1
  • Sdccag8
  • Sept2
  • Septin2
  • Sfi1
  • Ssna1
  • Tctn1
  • Tctn2
  • Tctn3
  • Tect2
  • Tmem216
  • Tmem67
  • Tsga14
  • Ttbk2
  • Tuba1
  • Tuba1a
  • Tuba4
  • Tuba4a
  • Tubb2c
  • Tubb4b
  • Tubb5
  • Tubg
  • Tubg1
  • Vesp11
  • Wpk
  • Ywhae
  • Ywhag
Rattus norvegicus (Norway rat)
Regulation of PLK1 Activity at G2/M Transition
  • AABR07000222.1
  • Actr1a
  • Aik
  • Airk1
  • Ajuba
  • Akap9
  • Alms1
  • Ark1
  • Aura
  • Aurka
  • Ayk1
  • Azi1
  • Bora
  • Btak
  • Btrc
  • Ccdc5
  • Ccnb1
  • Ccnb2
  • Ccnb2-ps2
  • Ccp110
  • Cdc2
  • Cdc2a
  • Cdk1
  • Cdk5rap2
  • Cdkn1
  • Cenpj
  • Cep131
  • Cep135
  • Cep152
  • Cep164
  • Cep192
  • Cep250
  • Cep290
  • Cep41
  • Cep43
  • Cep57
  • Cep63
  • Cep70
  • Cep72
  • Cep76
  • Cep78
  • Cetn2
  • Ck1e-2
  • Ckap5
  • Clasp1
  • Csnk1d
  • Csnk1e
  • Ctrn1
  • Cul1
  • Dctn1
  • Dctn2
  • Dctn3l1
  • Dhc1
  • Dnch1
  • Dnchc1
  • Dnci2
  • Dncic2
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Rattus norvegicus (Norway rat)
AURKA Activation by TPX2
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Rattus norvegicus (Norway rat)
Recruitment of mitotic centrosome proteins and complexes
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Rattus norvegicus (Norway rat)
Recruitment of NuMA to mitotic centrosomes
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  • Nude1
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Rattus norvegicus (Norway rat)
Loss of Nlp from mitotic centrosomes
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  • Ywhag
Rattus norvegicus (Norway rat)
Loss of proteins required for interphase microtubule organization from the centrosome
  • AABR07000222.1
  • Actr1a
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  • Alms1
  • Azi1
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  • Dync1h1
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  • Hice1
  • Hsp86
  • Hsp90aa1
  • Hspca
  • LOC309692
  • Lis-1
  • Lis1
  • Map1c
  • Mapre1
  • Nde1
  • Nedd1
  • Nek2l1
  • Ninl
  • Nude
  • Nude1
  • Ny-sar-48
  • Odf2
  • Odf84
  • Ofd1
  • Pafah1b1
  • Pafaha
  • Pcm1
  • Pcnt
  • Pin
  • Plk
  • Plk1
  • Plk4
  • Ppp2r1a
  • Prkaca
  • Prkar2b
  • Sak
  • Sdccag8
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  • Ssna1
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  • Tuba1a
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  • Tuba4a
  • Tubb2c
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  • Tubg1
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  • Ywhag
Rattus norvegicus (Norway rat)
Keratinization
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  • Dsc3
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  • Kb9
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Rattus norvegicus (Norway rat)
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  • Psmb3
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  • Vhl
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  • Wdr42a
  • Wdr5
  • Wdtc1
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  • Zbtb16
  • Zfp145
Rattus norvegicus (Norway rat)
Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation
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Rattus norvegicus (Norway rat)
Rap1 signalling
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Rattus norvegicus (Norway rat)

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Last updated: August 19, 2024