GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 651 - 675 of 1070 in total
Pathway Name ▲ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
PKA-mediated phosphorylation of key metabolic factors
  • Mlxipl
  • Wbscr14
Rattus norvegicus (Norway rat)
PKMTs methylate histone lysines
  • Aebp2
  • Ash1l
  • Ash2l
  • Atf7ip
  • Dot1l
  • Eed
  • Ehmt1
  • Ehmt2
  • Ezh2
  • H3c13
  • H4c16
  • H4c2
  • H4f16
  • H4ft
  • Hist1h4b
  • Hist1h4m
  • Hist2h3c2
  • Hist4
  • Hist4h4
  • Kmt2a
  • Kmt2b
  • Kmt2c
  • Kmt5a
  • Kmt5b
  • Kmt5c
  • LOC120093163
  • LOC498295
  • Mll
  • Mll1
  • Nfkb2
  • Nsd1
  • Nsd2
  • Nsd3
  • Prdm16
  • Prdm9
  • Rbbp4
  • Rbbp5
  • Rbbp7
  • Rela
  • Setd1a
  • Setd1b
  • Setd2
  • Setd3
  • Setd6
  • Setd7
  • Setdb1
  • Setdb2
  • Smyd2
  • Smyd3
  • Suv39h1
  • Suv39h2
  • Suv420h1
  • Suv420h2
  • Suz12
  • Wdr5
  • Whsc1
  • Whsc1l1
Rattus norvegicus (Norway rat)
PKR-mediated signaling
  • Adar
  • Arih1
  • Cdc2
  • Cdc2a
  • Cdk1
  • Cdkn1
  • Chuk
  • Dhx9
  • Dnajc3
  • Dsrad
  • Eif2ak2
  • Faap100
  • Faap20
  • Faap24
  • Facc
  • Fanca
  • Fancb
  • Fancc
  • Fance
  • Fancf
  • Fancg
  • Fancl
  • Fancm
  • Hsc70
  • Hsc73
  • Hsp70-1
  • Hsp70-2
  • Hsp70-3
  • Hspa1
  • Hspa1a
  • Hspa1b
  • Hspa1l
  • Hspa2
  • Hspa8
  • Hst70
  • Ikbkb
  • Ikbkg
  • Ikkb
  • Ilf2
  • Ilf3
  • Ips1
  • Isg15
  • Map2k6
  • Mapt
  • Mavs
  • Mkk6
  • Mtapt
  • Nck1
  • Nemo
  • Npm1
  • P53
  • P58ipk
  • Ppp2ca
  • Ppp2cb
  • Ppp2r1a
  • Ppp2r1b
  • Ppp2r5a
  • Prkr
  • Prkra
  • Ptpn2
  • RGD1564719
  • Snca
  • Sphk1
  • Stat1
  • Stat3
  • Stat4
  • Tarbp2
  • Tau
  • Tp53
  • Trim25
  • Ube2l6
  • Visa
Rattus norvegicus (Norway rat)
PLC beta mediated events
  • Gna11
  • Gna14
  • Gna15
  • Gnaq
  • Plcb1
  • Plcb2
  • Plcb3
  • Plcb4
Rattus norvegicus (Norway rat)
PRC2 methylates histones and DNA
  • Aebp2
  • Dnmt1
  • Dnmt3a
  • Dnmt3b
  • ENSRNOG00000062927
  • ENSRNOG00000064540
  • ENSRNOG00000066901
  • ENSRNOG00000068034
  • Eed
  • Ezh2
  • H2ab3
  • H2ac10
  • H2ac18
  • H2ac4
  • H2afb3
  • H2afx
  • H2aj
  • H2ax
  • H2az2
  • H2bc1
  • H2bc12l1
  • H2bc6
  • H2bcl1
  • H2bcl2
  • H2bu1
  • H3-3b
  • H3.3b
  • H3c13
  • H3f3b
  • H4c16
  • H4c2
  • H4f16
  • H4ft
  • Hist1h2ba
  • Hist1h2bc
  • Hist1h2bg
  • Hist1h2bo
  • Hist1h2bq
  • Hist1h4b
  • Hist1h4m
  • Hist2h2aa3
  • Hist2h3c2
  • Hist4
  • Hist4h4
  • Jarid2
  • LOC100365043
  • LOC100910200
  • LOC120097726
  • LOC681740
  • LOC684797
  • Mtf2
  • Phf1
  • Phf19
  • Rbbp4
  • Rbbp7
  • Suz12
  • Th2b
Rattus norvegicus (Norway rat)
PRPP biosynthesis
  • ENSRNOG00000063771
  • LOC314140
  • Prps1
  • Prps1l1
  • Prps1l3
  • Prps2
Rattus norvegicus (Norway rat)
PTK6 Regulates Cell Cycle
  • Ccnd1
  • Ccne
  • Ccne1
  • Cdk2
  • Cdk4
  • Cdkn1b
  • Cdkn2
  • Ptk6
  • p27Kip1
Rattus norvegicus (Norway rat)
PTK6 Regulates RHO GTPases, RAS GTPase and MAP kinases
  • Arha
  • Arha2
  • Arhgap35
  • Bcar1
  • Cas
  • Crk
  • Crkas
  • Crko
  • Elmo1
  • Elmo2
  • Grlf1
  • Hras
  • Hras1
  • Kras
  • Kras2
  • Nras
  • P190A
  • Ptk6
  • Pxn
  • Rac
  • Rac1
  • Rasa
  • Rasa1
  • Rhoa
  • p190ARHOGAP
Rattus norvegicus (Norway rat)
PTK6 Regulates RTKs and Their Effectors AKT1 and DOK1
  • Akt1
  • Arap1
  • Cbl
  • Dok1
  • LOC100360645
  • Ptk6
  • Rps27a
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
PTK6 promotes HIF1A stabilization
  • Dtr
  • Egfr
  • Gpnmb
  • Hbegf
  • Hegfl
  • Hif1a
  • Lrrk2
  • Ptk6
Rattus norvegicus (Norway rat)
Passive transport by Aquaporins
  • Aqp1
  • Aqp10
  • Aqp11
  • Aqp12a
  • Aqp2
  • Aqp3
  • Aqp4
  • Aqp5
  • Aqp7
  • Aqp8
  • Aqp9
  • Chip28
  • LOC686596
  • Mip
Rattus norvegicus (Norway rat)
Pentose phosphate pathway
  • Dera
  • G6pd
  • G6pdx
  • Pgd
  • Pgls
  • Pgm2
  • RBKS
  • Rbks
  • Rpe
  • Rpia
  • Taldo1
  • Tkt
Rattus norvegicus (Norway rat)
Peptide chain elongation
  • Eef2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Peptide hormone biosynthesis
  • Bdp
  • Nec-1
  • Nec1
  • Pcsk1
  • Pomc
  • Pomc2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Peptide ligand-binding receptors
  • Agt
  • Agtr1
  • Agtr1a
  • Agtr2
  • Agtrl1
  • Apel
  • Apj
  • Apln
  • Aplnr
  • At1a
  • B1bkr
  • Bdkrb1
  • Bdkrb2
  • Bkr
  • Brs3
  • Bv8
  • C3
  • C3ar1
  • C5
  • C5ar1
  • C5ar2
  • C5l2
  • C5r1
  • Cck
  • Cckar
  • Cckbr
  • Cmkrl2
  • Ece1
  • Ece2
  • Edn1
  • Edn2
  • Edn3
  • Ednra
  • Ednrb
  • Etbrlp2
  • F2
  • F2r
  • F2rl1
  • F2rl2
  • F2rl3
  • Gal
  • Galn
  • Galnr
  • Galnr1
  • Galnr2
  • Galnr3
  • Galr1
  • Galr2
  • Galr3
  • Gper
  • Gper1
  • Gpr10
  • Gpr14
  • Gpr154
  • Gpr24
  • Gpr30
  • Gpr37
  • Gpr37l1
  • Gpr41
  • Gpr54
  • Gpr66
  • Gpr7
  • Gpr73
  • Gpr73l1
  • Gpr77
  • Grp
  • Grpr
  • Kel
  • Kiss1
  • Kiss1r
  • Kng
  • Kng1
  • Mc1r
  • Mc2r
  • Mc3r
  • Mc4r
  • Mc5r
  • Mch
  • Mchr1
  • Nln
  • Nmb
  • Nmbr
  • Nms
  • Nmu
  • Nmur1
  • Nmur2
  • Npb
  • Npbwr1
  • Nps
  • Npsr1
  • Npw
  • Npy
  • Npy1r
  • Npy4r
  • Npy5r
  • Npyr5
  • Ntr2
  • Nts
  • Ntsr
  • Ntsr1
  • Ntsr2
  • Oor
  • Oprd1
  • Oprk1
  • Oprl
  • Oprl1
  • Oprm1
  • Par1
  • Par2
  • Par3
  • Par4
  • Pdyn
  • Penk
  • Penk-rs
  • Penk1
  • Pkr1
  • Pkr2
  • Pmch
  • Pnoc
  • Pomc
  • Pomc2
  • Ppl8
  • Ppy
  • Ppyr1
  • Prh
  • Prlh
  • Prlhr
  • Prok1
  • Prok2
  • Prokr1
  • Prokr2
  • Psap
  • Pyy
  • Ror-a
  • Ror-b
  • Ror-d
  • Senr
  • Serpina8
  • Sgp1
  • Slc1
  • Smst
  • Sst
  • Sstr1
  • Sstr2
  • Sstr3
  • Sstr4
  • Sstr5
  • Tgr1
  • Trh
  • Trhr
  • Urp
  • Uts2
  • Uts2b
  • Uts2d
  • Uts2r
  • Xk
  • Xkh
  • Xkr1
  • Xrg1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Peroxisomal lipid metabolism
  • Acbd4
  • Acbd5
  • Hao2
  • Hao3
  • Haox2
  • Nudt19
Rattus norvegicus (Norway rat)
Peroxisomal protein import
  • 2hpcl
  • AC094055.1
  • Acaa1
  • Acaa1b
  • Acot1
  • Acot2
  • Acot3
  • Acot4
  • Acot5
  • Acot8
  • Acox
  • Acox1
  • Acox2
  • Acox3
  • Acsvl1
  • Ads
  • Agps
  • Agt1
  • Agxt
  • Amacr
  • Baat
  • Cas1
  • Cat
  • Cot
  • Crat
  • Crot
  • Cte1
  • Dao
  • Dao1
  • Ddo
  • Decr2
  • Dhrs4
  • Ech1
  • Eci2
  • Edh17b4
  • Ehhadh
  • Ephx2
  • Facvl1
  • Fatp2
  • Gnpat
  • Gstk1
  • Hacl1
  • Hao1
  • Hao2
  • Hao3
  • Haox2
  • Hmgcl
  • Hpcl2
  • Hsd17b4
  • Ide
  • Idh1
  • LOC100360645
  • LOC100911156
  • Lonp2
  • Mfe1
  • Mlycd
  • Mpv17
  • Mpv17l
  • Mte1
  • Nos2
  • Nudt19
  • Nudt7
  • Paf1
  • Paf3
  • Paox
  • Peci
  • Pecr
  • Pex1
  • Pex10
  • Pex12
  • Pex14
  • Pex2
  • Pex5
  • Pex5_predicted
  • Pex6
  • Pex7
  • Phyh
  • Phyh2
  • Pipox
  • Pmp35
  • Prcox
  • Pte1
  • Pxmp3
  • Rps27a
  • Scp-2
  • Scp2
  • Slc27a2
  • Thcox
  • Tysnd1
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubc4
  • Ubcep1
  • Ubch4
  • Ubch5b
  • Ubcl1
  • Ube2d1
  • Ube2d2
  • Ube2d3
  • Vlacs
  • Vlcs
  • Za20d3
  • Zfand6
Rattus norvegicus (Norway rat)
Phase 0 - rapid depolarisation
  • Cach2
  • Cacn2
  • Cacna1c
  • Cacna2d2
  • Cacnb1
  • Cacnb2
  • Cacng4
  • Cacng6
  • Cacng7
  • Cacng8
  • Cacnl1a1
  • Cacnlb1
  • Cacnlb2
  • Cchl1a1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Phase 2 - plateau phase
  • Akap9
  • Cach2
  • Cacn2
  • Cacna1c
  • Cacna2d2
  • Cacnb1
  • Cacnb2
  • Cacng4
  • Cacng6
  • Cacng7
  • Cacng8
  • Cacnl1a1
  • Cacnlb1
  • Cacnlb2
  • Cchl1a1
  • Kcna9
  • Kcne1l
  • Kcne2
  • Kcne3
  • Kcne4
  • Kcne5
  • Kcnq1
  • Kvlqt1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Phase 3 - rapid repolarisation
  • Akap9
  • Erg
  • Kcna5
  • Kcna9
  • Kcne1l
  • Kcne2
  • Kcne3
  • Kcne4
  • Kcne5
  • Kcnh2
  • Kcnq1
  • Kvlqt1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Phase 4 - resting membrane potential
  • Irk1
  • Irk2
  • Irk3
  • Irk4
  • Kcnj12
  • Kcnj14
  • Kcnj2
  • Kcnj4
  • Kcnk1
  • Kcnk10
  • Kcnk12
  • Kcnk13
  • Kcnk15
  • Kcnk16
  • Kcnk18
  • Kcnk2
  • Kcnk3
  • Kcnk4
  • Kcnk5
  • Kcnk6
  • Kcnk7
  • Kcnk9
  • LOC364241
  • Task
  • Task1
  • Task3
  • Task5
  • Trek
  • Trek2
  • Tresk-2
  • Tresk2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Phase I - Functionalization of compounds
  • Aada
  • Aadac
  • Abp1
  • Ahr
  • Ahrr
  • Aldd
  • Aldh3
  • Aldh3a1
  • Aoc1
  • Aoc3
  • Arnt
  • Arnt2
  • Bphl
  • Cbr3
  • Ces1d
  • Ces2b
  • Ces3
  • Cmbl
  • Cyb5b
  • Cyb5m
  • Cyb5r3
  • Cyp2b21
  • Cyp3a-1
  • Cyp3a-2
  • Cyp3a1
  • Cyp3a11
  • Cyp3a13
  • Cyp3a18
  • Cyp3a2
  • Cyp3a62
  • Cyp3a9
  • Dia1
  • Eph-1
  • Ephx1
  • LOC679149
  • Marc2
  • Mg87
  • Mosc2
  • Mtarc2
  • Nqo2
  • Omb5
Rattus norvegicus (Norway rat)
Phosphate bond hydrolysis by NTPDase proteins
  • Cd39
  • Cd39l1
  • Cd39l2
  • Entpd1
  • Entpd2
  • Entpd3
  • Entpd4
  • Entpd5
  • Entpd6
  • Entpd7
  • Entpd8
Rattus norvegicus (Norway rat)
Phospholipase C-mediated cascade: FGFR1
  • FGF22
  • FGF6
  • Fgf-1
  • Fgf-2
  • Fgf-5
  • Fgf-9
  • Fgf1
  • Fgf10
  • Fgf17
  • Fgf2
  • Fgf20
  • Fgf22
  • Fgf23
  • Fgf3
  • Fgf4
  • Fgf5
  • Fgf5c
  • Fgf5d
  • Fgf6
  • Fgf7a
  • Fgf7b
  • Fgf8
  • Fgf9
  • Fgfa
  • Fgfr1
  • Flg
  • Kl
  • Plcg1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR2
  • FGF22
  • FGF6
  • Fgf-1
  • Fgf-2
  • Fgf-5
  • Fgf-7
  • Fgf-9
  • Fgf1
  • Fgf10
  • Fgf16
  • Fgf17
  • Fgf18
  • Fgf2
  • Fgf20
  • Fgf22
  • Fgf23
  • Fgf3
  • Fgf4
  • Fgf5
  • Fgf5c
  • Fgf5d
  • Fgf6
  • Fgf7
  • Fgf7a
  • Fgf7b
  • Fgf8
  • Fgf9
  • Fgfa
  • Fgfr2
  • Kgf
  • Plcg1
Rattus norvegicus (Norway rat)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


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Last updated: August 19, 2024