GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 51 - 75 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▲ Organism GlyTouCan ID
cGMP effects
  • AABR07006724.1
  • Insp3r
  • Irag1
  • Itpr1
  • Mrvi1
  • Pde10a
  • Pde11a
  • Pde1a
  • Pde1b
  • Pde1b1
  • Pde2a
  • Pde5
  • Pde5a
  • Pde9a
  • Prkg1
  • Prkg2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Signal regulatory protein family interactions
  • AABR07008876.1
  • Ash
  • Bit
  • Cd47
  • Dap12
  • Fak2
  • Fyb
  • Fyb1
  • Grb2
  • LOC100909964
  • Mfr
  • Ptk2b
  • Ptpns1
  • Pyk2
  • Scap2
  • Shps1
  • Sirp
  • Sirpa
  • Sirpal1
  • Sirpb2
  • Sirpd
  • Skap2
  • Skap55r
  • Tyrobp
Rattus norvegicus (Norway rat)
Glycosphingolipid catabolism
  • AABR07013255.1
  • Arsa
  • Arsb
  • Arse
  • Arsg
  • Arsi
  • Arsj
  • Arsk
  • Arsl
  • Asah1
  • Asah2
  • Cca1
  • Ctsa
  • Enpp7
  • Galc
  • Gba
  • Gba1
  • Gba2
  • Gba3
  • Gla
  • Glb1
  • Glb1l
  • Glb1l2
  • Glb1l3
  • Gm2a
  • Hexa
  • Hexb
  • M6pr
  • Neu1
  • Neu2
  • Neu3
  • Neu4
  • Psap
  • Sgp1
  • Smpd1
  • Smpd2
  • Smpd3
  • Smpd4
  • Sts
  • Sumf1
  • Sumf2
Rattus norvegicus (Norway rat)
The activation of arylsulfatases
  • AABR07013255.1
  • Arsa
  • Arsb
  • Arse
  • Arsg
  • Arsi
  • Arsj
  • Arsk
  • Arsl
  • Sts
  • Sumf1
  • Sumf2
Rattus norvegicus (Norway rat)
CASP8 activity is inhibited
  • AABR07018323.1
  • Apt1
  • Apt1Lg1
  • Casp8
  • Cd95l
  • Cflar
  • Fadd
  • Fas
  • Fasl
  • Faslg
  • Ripk1
  • Tnfrsf10b
  • Tnfrsf6
  • Tnfsf10
  • Tnfsf6
  • Tnlg6a
  • Tradd
  • Traf2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Dimerization of procaspase-8
  • AABR07018323.1
  • Apt1
  • Apt1Lg1
  • Casp8
  • Cd95l
  • Cflar
  • Fadd
  • Fas
  • Fasl
  • Faslg
  • Ripk1
  • Tnfrsf10b
  • Tnfrsf6
  • Tnfsf10
  • Tnfsf6
  • Tnlg6a
  • Tradd
  • Traf2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Regulation by c-FLIP
  • AABR07018323.1
  • Apt1
  • Apt1Lg1
  • Casp8
  • Cd95l
  • Cflar
  • Fadd
  • Fas
  • Fasl
  • Faslg
  • Ripk1
  • Tnfrsf10b
  • Tnfrsf6
  • Tnfsf10
  • Tnfsf6
  • Tnlg6a
  • Tradd
  • Traf2
Rattus norvegicus (Norway rat)
RAC1 GTPase cycle
  • AABR07021955.1
  • AABR07032856.1
  • Abi1
  • Abi2
  • Abl2
  • Abr
  • Ali1
  • Als2
  • Amigo2
  • Arap1
  • Arap2
  • Arap3
  • Arg357
  • Arhgap1
  • Arhgap10
  • Arhgap12
  • Arhgap15
  • Arhgap17
  • Arhgap20
  • Arhgap21
  • Arhgap22
  • Arhgap23
  • Arhgap24
  • Arhgap25
  • Arhgap26
  • Arhgap27
  • Arhgap29
  • Arhgap3
  • Arhgap30
  • Arhgap31
  • Arhgap32
  • Arhgap33
  • Arhgap35
  • Arhgap4
  • Arhgap42
  • Arhgap44
  • Arhgap45
  • Arhgap5
  • Arhgap7
  • Arhgap9
  • Arhgdia
  • Arhgdib
  • Arhgef10
  • Arhgef11
  • Arhgef15
  • Arhgef19
  • Arhgef25
  • Arhgef39
  • Arhgef5
  • Arhgef6
  • Arhgef7
  • Baiap2
  • Baiap2l1
  • Bch
  • Bcr
  • Borg5
  • Brk1
  • CRIK
  • Camgap1
  • Cav
  • Cav1
  • Cdc42
  • Cdc42bpa
  • Cdc42ep1
  • Cdc42ep4
  • Chn2
  • Cit
  • Cyba
  • Cybb
  • Cyfip1
  • Cyfip2
  • Def6
  • Depdc1b
  • Diaph3
  • Dlc1
  • Dock10
  • Dock11
  • Dock2
  • Dock3
  • Dock4
  • Dock5
  • Dock6
  • Dock7
  • Dock8
  • Duo
  • Ect2
  • Emd
  • Epha2
  • Esyt1
  • Fam13a
  • Fam13b
  • Fam62a
  • Farp1
  • Farp2
  • Fermt2
  • Fgd5
  • Fmnl1
  • Garre1
  • Geft
  • Git1
  • Git2
  • Gmip
  • Gna13
  • Grf2
  • Grlf1
  • Hapip
  • Hem2
  • Iqgap1
  • Iqgap2
  • Iqgap3
  • Itgb1
  • Jag1
  • Jik
  • Kalrn
  • Ktn1
  • Lamtor1
  • Lbr
  • Mbc2
  • Mcam
  • Mcf2
  • Mcf2l
  • Mox1
  • Mpp7
  • Muc18
  • Myo9b
  • Myr5
  • Nap1
  • Ncf1
  • Ncf2
  • Ncf4
  • Nckap1
  • Nckap1l
  • Ngef
  • Nhs
  • Nisch
  • Noh1
  • Nox1
  • Nox3
  • Noxa1
  • Noxo1
  • Ophn1
  • Ost
  • P190A
  • Pak1
  • Pak2
  • Pak3
  • Pak3bp
  • Pak4
  • Pak5
  • Pak6
  • Pak7
  • Par-6a
  • Par6a
  • Pard6a
  • Pik3ca
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Pik3r3
  • Pixb
  • Pk428
  • Pkn
  • Pkn1
  • Pkn2
  • Pld1
  • Pld2
  • Plekhg1
  • Plekhg2
  • Plekhg3
  • Plekhg6
  • Prex1
  • Prex2
  • Prk1
  • Prk2
  • Prkcl1
  • Prkcl2
  • RGD1565043
  • Rab7
  • Rab7a
  • Rac
  • Rac1
  • Racgap1
  • Ralbp1
  • Rasgrf2
  • Rbm39
  • Rhogap
  • Rich2
  • Sh3bp1
  • Slc1a5
  • Snap23
  • Sos1
  • Sos2
  • Spata13
  • Srgap1
  • Srgap2
  • Srgap3
  • Stard12
  • Swap70
  • Syb3
  • Syde2
  • Tagap
  • Taok3
  • Tfrc
  • Tiam1
  • Tiam2
  • Trfr
  • Trio
  • Vamp3
  • Vangl1
  • Vav
  • Vav1
  • Vav2
  • Vav3
  • Vrk2
  • Wasf1
  • Wasf2
  • Wasf3
  • Wave1
  • Ykt6
  • p190ARHOGAP
Rattus norvegicus (Norway rat)
CDC42 GTPase cycle
  • AABR07021955.1
  • AABR07032856.1
  • Abr
  • Arap1
  • Arap2
  • Arap3
  • Arhgap1
  • Arhgap10
  • Arhgap17
  • Arhgap20
  • Arhgap21
  • Arhgap22
  • Arhgap24
  • Arhgap26
  • Arhgap27
  • Arhgap29
  • Arhgap30
  • Arhgap31
  • Arhgap32
  • Arhgap33
  • Arhgap35
  • Arhgap4
  • Arhgap40
  • Arhgap42
  • Arhgap44
  • Arhgap45
  • Arhgap5
  • Arhgap7
  • Arhgap9
  • Arhgdia
  • Arhgdib
  • Arhgdig
  • Arhgef10
  • Arhgef11
  • Arhgef12
  • Arhgef15
  • Arhgef16
  • Arhgef19
  • Arhgef25
  • Arhgef26
  • Arhgef5
  • Arhgef6
  • Arhgef9
  • Bcr
  • Camgap1
  • Cav
  • Cav1
  • Cdc42
  • Def6
  • Depdc1b
  • Dlc1
  • Dnmbp
  • Dock10
  • Dock11
  • Dock6
  • Dock7
  • Dock8
  • Ect2
  • Ehsh1
  • Fam13b
  • Farp1
  • Fgd1
  • Fgd2
  • Fgd3
  • Fgd4
  • Geft
  • Gmip
  • Gna13
  • Grf2
  • Grlf1
  • Itsn
  • Itsn1
  • Ktn1
  • LOC687105
  • Lbr
  • Mcf2
  • Mcf2l
  • Myo9b
  • Myr5
  • Ngef
  • Ophn1
  • Ost
  • P190A
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Plekhg1
  • Plekhg2
  • Plekhg3
  • Prex1
  • Prex2
  • RGD1565043
  • Racgap1
  • Ralbp1
  • Rasgrf2
  • Rhogap
  • Rich2
  • Spata13
  • Srgap1
  • Srgap2
  • Srgap3
  • Stard12
  • Stard13
  • Stard8
  • Syde1
  • Tagap
  • Tiam1
  • Trio
  • Tuba
  • Vav2
  • Vav3
  • Ykt6
  • p190ARHOGAP
Rattus norvegicus (Norway rat)
RHOA GTPase cycle
  • AABR07021955.1
  • Aaas
  • Abcd3
  • Abr
  • Acbd5
  • Actc
  • Actc1
  • Akap13
  • Anln
  • Arap1
  • Arap2
  • Arap3
  • Arha
  • Arha2
  • Arhgap1
  • Arhgap10
  • Arhgap11a
  • Arhgap18
  • Arhgap19
  • Arhgap20
  • Arhgap21
  • Arhgap22
  • Arhgap23
  • Arhgap24
  • Arhgap26
  • Arhgap28
  • Arhgap29
  • Arhgap30
  • Arhgap31
  • Arhgap32
  • Arhgap35
  • Arhgap4
  • Arhgap40
  • Arhgap42
  • Arhgap44
  • Arhgap45
  • Arhgap5
  • Arhgap6
  • Arhgap7
  • Arhgap8
  • Arhgap9
  • Arhgdia
  • Arhgdib
  • Arhgef1
  • Arhgef10
  • Arhgef10l
  • Arhgef11
  • Arhgef12
  • Arhgef15
  • Arhgef17
  • Arhgef19
  • Arhgef2
  • Arhgef25
  • Arhgef28
  • Arhgef3
  • Arhgef5
  • Arhgef7
  • Atp6ap1
  • Atp6ip1
  • Atp6s1
  • Bcap31
  • Bcr
  • C1qbp
  • CRIK
  • Cav
  • Cav1
  • Cavin1
  • Ccdc115
  • Cit
  • Daam1
  • Ddrgk1
  • Def6
  • Depdc1b
  • Diap1
  • Diaph1
  • Diaph3
  • Dlc1
  • Dock2
  • Duo
  • Ect2
  • Emc3
  • Ergic53
  • Faf2
  • Fam13a
  • Farp1
  • Flot1
  • Flot2
  • Fmnl3
  • Gc1qbp
  • Geft
  • Gmip
  • Grf2
  • Grlf1
  • Hapip
  • Hmox2
  • Iqgap1
  • Iqgap3
  • Jup
  • Kalrn
  • Ktn1
  • LOC679082
  • Lbr
  • Lman1
  • Lsc
  • Maco1
  • Mcam
  • Mcf2
  • Mcf2l
  • Muc18
  • Myo9a
  • Myo9b
  • Myr5
  • Myr7
  • Net1
  • Ngef
  • Obscn
  • Ophn1
  • Ost
  • P190A
  • Pak2
  • Pak3bp
  • Pcdh7
  • Pg
  • Pgrmc2
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Pixb
  • Pkn
  • Pkn1
  • Pkn2
  • Pld1
  • Plekhg3
  • Plekhg5
  • Plekhg6
  • Pmp70
  • Prex1
  • Prex2
  • Prk1
  • Prk2
  • Prkcl1
  • Prkcl2
  • Ptrf
  • Pxmp1
  • RGD1565043
  • Ra410
  • Racgap1
  • Rasgrf2
  • Reg1
  • Reg2
  • Rgnef
  • Rhoa
  • Rhogap
  • Rhpn1
  • Rhpn2
  • Rich2
  • Rock1
  • Rock2
  • Rt13
  • Rtkn
  • Scfd1
  • Sk2
  • Slk
  • Sly1
  • Snap23
  • Sowahc
  • Srgap1
  • Stard12
  • Stard13
  • Stard8
  • Stbd1
  • Stk10
  • Stom
  • Stx5
  • Stx5a
  • Stxbp1l2
  • Syb3
  • Tagap
  • Tech
  • Tex2
  • Tfrc
  • Tiam1
  • Tjp2
  • Tmem111
  • Tmem57
  • Tmem87a
  • Trfr
  • Trio
  • Ubxd8
  • Vamp3
  • Vangl1
  • Vapb
  • Vav
  • Vav1
  • Vav2
  • Vav3
  • Ykt6
  • p190ARHOGAP
Rattus norvegicus (Norway rat)
RAC2 GTPase cycle
  • AABR07021955.1
  • Abi1
  • Abi2
  • Abr
  • Ankle2
  • Arg357
  • Arhgap1
  • Arhgap17
  • Arhgap21
  • Arhgap26
  • Arhgap32
  • Arhgap35
  • Arhgap42
  • Arhgdia
  • Armcx3
  • Baiap2l1
  • Bcr
  • Borg5
  • Brk1
  • Cav
  • Cav1
  • Cdc42
  • Cdc42ep1
  • Cdc42ep4
  • Cyba
  • Cybb
  • Cyfip1
  • Def6
  • Depdc1b
  • Diaph3
  • Dock10
  • Dock2
  • Dock3
  • Dock4
  • Dsg2
  • Emd
  • Epha2
  • Ergic53
  • Esyt1
  • Fam62a
  • Garre1
  • Git1
  • Git2
  • Grlf1
  • Hem2
  • Iqgap1
  • Itgb1
  • Jik
  • Lamtor1
  • Lbr
  • Lem4
  • Lman1
  • Mbc2
  • Mcam
  • Mcf2
  • Mpp7
  • Mtx1
  • Muc18
  • Nap1
  • Ncf1
  • Ncf2
  • Ncf4
  • Nckap1
  • Nckap1l
  • Nhs
  • Ophn1
  • P190A
  • Pak1
  • Pak2
  • Pak4
  • Pgrmc2
  • Pik3ca
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Pik3r3
  • Pld2
  • Prex1
  • Rab7
  • Rab7a
  • Rac2
  • Racgap1
  • Rbm39
  • Samm50
  • Slitrk5
  • Stbd1
  • Swap70
  • Syb3
  • Syde1
  • Taok3
  • Tfrc
  • Tiam1
  • Trfr
  • Trio
  • Vamp3
  • Vangl1
  • Vapb
  • Vav
  • Vav1
  • Vav2
  • Vav3
  • Vrk2
  • Wasf2
  • p190ARHOGAP
Rattus norvegicus (Norway rat)
Cholesterol biosynthesis
  • AABR07021955.1
  • Acat2
  • Arv1
  • Cyp51
  • Cyp51a1
  • Dhcr24
  • Erg1
  • Fdft1
  • Fdps
  • Ggps1
  • Hmgcr
  • Hmgcs
  • Hmgcs1
  • Hsd17b7
  • Idi1
  • Idi2l3
  • Lbr
  • Lss
  • Mpd
  • Msmo1
  • Mvd
  • Mvk
  • Nsdhl
  • Osc
  • Plpp6
  • Pmvk
  • RGD1564999
  • Sc4mol
  • Sqle
  • Srebf1
  • Srebf2
  • Srebp1
Rattus norvegicus (Norway rat)
RHOD GTPase cycle
  • AABR07021955.1
  • Actn1
  • Add3
  • Akap12
  • Ankfy1
  • Arhgap1
  • Arhgap12
  • Arhgap17
  • Arhgap21
  • Arhgap26
  • Arhgap32
  • Arhgap35
  • Arhgap5
  • Capzb
  • Cav
  • Cav1
  • Cpne8
  • Depdc1b
  • Diap1
  • Diaph1
  • Diaph3
  • Efhd2
  • Emd
  • Ergic53
  • Esyt1
  • Fam62a
  • Filip1
  • Golga2
  • Grlf1
  • Hint2
  • Lbr
  • Lman1
  • Lmnb1
  • Mbc2
  • Mcam
  • Mospd2
  • Muc18
  • Nbc
  • Nbc2
  • Nbc3
  • Nbcn1
  • P190A
  • Pak5
  • Pak6
  • Pak7
  • Pgrmc2
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Plxna1
  • Plxnb1
  • Rab7
  • Rab7a
  • Racgap1
  • Rbm39
  • Rhod
  • Slc4a7
  • Stbd1
  • Steap3
  • Sws1
  • Syb3
  • Tor1aip1
  • Vamp3
  • Vangl1
  • Vapb
  • Vrk2
  • Whamm
  • p190ARHOGAP
Rattus norvegicus (Norway rat)
RHOG GTPase cycle
  • AABR07021955.1
  • Ankle2
  • Arfgap3
  • Arhgap1
  • Arhgap21
  • Arhgap32
  • Arhgap35
  • Arhgap5
  • Arhgdia
  • Arhgdib
  • Arhgdig
  • Arhgef16
  • Arhgef26
  • Arhgef5
  • Borg5
  • Cav
  • Cav1
  • Cdc42
  • Cdc42ep1
  • Cyfip1
  • Depdc1b
  • Diaph3
  • Dock2
  • Dock3
  • Dock4
  • Dock5
  • Dsg2
  • Duo
  • Ehsh1
  • Elmo2
  • Emd
  • Epha2
  • Ergic53
  • Esyt1
  • Fam62a
  • Garre1
  • Grlf1
  • Hapip
  • Hspe1
  • Iqgap2
  • Itgb1
  • Itsn
  • Itsn1
  • Kalrn
  • Ktn1
  • LOC687105
  • Lamtor1
  • Lbr
  • Lem4
  • Letm1
  • Lman1
  • Map3k11
  • Mbc2
  • Mcam
  • Mcf2
  • Mcf2l
  • Mlk3
  • Mpp7
  • Muc18
  • Ndufa5
  • Ndufs3
  • Ophn1
  • Ost
  • P190A
  • Pak2
  • Pak4
  • Pgrmc2
  • Pik3r1
  • Pld1
  • Plekhg3
  • Prex1
  • Rab7
  • Rab7a
  • Rbm39
  • Rhog
  • Shmt2
  • Stbd1
  • Stx5
  • Stx5a
  • Syb3
  • Tfrc
  • Trfr
  • Trio
  • Vamp3
  • Vangl1
  • Vapb
  • Vav
  • Vav1
  • Vav2
  • Vav3
  • Vrk2
  • Ykt6
  • p190ARHOGAP
Rattus norvegicus (Norway rat)
Initiation of Nuclear Envelope (NE) Reformation
  • AABR07021955.1
  • Ankle2
  • Baf
  • Banf1
  • Ccnb1
  • Ccnb2
  • Ccnb2-ps2
  • Cdc2
  • Cdc2a
  • Cdk1
  • Cdkn1
  • Emd
  • Kpnb1
  • L2bp1
  • Lbr
  • Lem4
  • Lmn1
  • Lmna
  • Lmnb1
  • Ppp2ca
  • Ppp2r1a
  • Ppp2r2a
  • Rbm39
  • Sir2l2
  • Sirt2
  • Vrk1
  • Vrk2
Rattus norvegicus (Norway rat)
pre-mRNA splicing
  • AABR07026797.1
  • AABR07029847.1
  • AABR07065078.1
  • AC109542.1
  • Acin1
  • Alyref
  • Ath55
  • Auf1
  • Bat1
  • Bat1a
  • Bcas2
  • Bud13
  • Bud31
  • Bwd
  • C3h9orf78
  • Cactin
  • Casc3
  • Cbp20
  • Cbp80
  • Ccdc12
  • Ccdc16
  • Ccdc55
  • Cdc40
  • Cdc5l
  • Cherp
  • Cl-4
  • Crn
  • Crnkl1
  • Ctnnbl1
  • Cwc15
  • Cwc22
  • Cwc25
  • Cyp10l
  • Ddx23
  • Ddx39b
  • Ddx42
  • Ddx46
  • Ddx48
  • Ddx5
  • Dhx15
  • Dhx35
  • Dhx38
  • Dhx8
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  • Yju2
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Rattus norvegicus (Norway rat)
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA
  • AABR07026797.1
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  • Ybx1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Transport of Mature mRNA derived from an Intron-Containing Transcript
  • AABR07026797.1
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  • wdr58
Rattus norvegicus (Norway rat)
RNA Polymerase II Transcription Termination
  • AABR07026797.1
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  • Bat1a
  • Casc3
  • Cbp20
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  • Cdc40
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  • Fop
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  • Hrs
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  • Magohb
  • Mln51
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  • Uap56
  • Uif
  • Upf3b
  • Zfp473
  • wdr58
Rattus norvegicus (Norway rat)
mRNA 3'-end processing
  • AABR07026797.1
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  • Bat1a
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  • Magoh
  • Magohb
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  • Srsf11
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  • Srsf5
  • Srsf7
  • Srsf9
  • Sympk
  • Thoc2
  • Thoc5
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  • Thoc7
  • U2af1
  • U2af1l4
  • U2af2
  • Uap56
  • Uif
  • Upf3b
  • wdr58
Rattus norvegicus (Norway rat)
Major pathway of rRNA processing in the nucleolus and cytosol
  • AABR07029195.1
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  • AABR07064810.1
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  • AABR07072260.1
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  • Csnk1e
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  • Fte1
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Rattus norvegicus (Norway rat)
Nonsense Mediated Decay (NMD) enhanced by the Exon Junction Complex (EJC)
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  • Fte1
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Rattus norvegicus (Norway rat)
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Rattus norvegicus (Norway rat)
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Rattus norvegicus (Norway rat)

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Last updated: August 19, 2024