GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 201 - 225 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▲ Organism GlyTouCan ID
RAS processing
  • Abhd17a
  • Abhd17b
  • Abhd17c
  • Apt1
  • Arl184
  • Arl2
  • Bcl2l1
  • Bclx
  • Blc2l
  • CaMIII
  • Calm3
  • Cam3
  • Camc
  • ENSRNOG00000064803
  • ENSRNOG00000067432
  • Fnta
  • Fntb
  • Golga7
  • Hras
  • Hras1
  • Icmt
  • Kras
  • Kras2
  • LOC100910107
  • LOC120097921
  • LOC120098474
  • Lypla1
  • Nras
  • Pde6d
  • Pkcq
  • Prkcq
  • Prkg2
  • Rce1
  • Usp17l
  • Usp17l8
  • Usp17la
  • Usp17la2
  • Usp17lh
  • Usp17li
  • Zdhhc9
Rattus norvegicus (Norway rat)
Synthesis of PC
  • Abhd3
  • Aytl2
  • Cctb
  • Cd92
  • Cdw92
  • Cept1
  • Chat
  • Chetk
  • Chk
  • Chka
  • Chkb
  • Chkl
  • Chpt1
  • Ck2n
  • Ckr
  • Cpt1
  • Csnk2a1
  • Csnk2a2
  • Csnk2b
  • Ctl1
  • Ctl2
  • Ctl3
  • Ctl4
  • Ctpct
  • Lpcat1
  • Lpin1
  • Lpin2
  • Lpin3
  • Mfsd2a
  • Ng22
  • Pctp
  • Pcyt1
  • Pcyt1a
  • Pcyt1b
  • Pempt
  • Pemt
  • Phospho1
  • Slc44a1
  • Slc44a2
  • Slc44a3
  • Slc44a4
  • Slc44a5
  • Stard10
  • Stard2
  • Stard7
  • TPPT1
Rattus norvegicus (Norway rat)
RHO GTPases Activate WASPs and WAVEs
  • Abi1
  • Abi2
  • Abl1
  • Actb
  • Actg
  • Actg1
  • Actr2
  • Actr3
  • Arp2
  • Arp3
  • Arpc1a
  • Arpc1b
  • Arpc2
  • Arpc3
  • Arpc4
  • Arpc5
  • Ash
  • Baiap2
  • Brk1
  • Btk
  • Cdc42
  • Cr16
  • Cyfip1
  • Cyfip2
  • Erk1
  • Erk2
  • Fak
  • Fak1
  • Grb2
  • Hem2
  • Mapk
  • Mapk1
  • Mapk3
  • Nap1
  • Nck1
  • Nckap1
  • Nckap1l
  • Nckipsd
  • Prkm1
  • Prkm3
  • Ptk2
  • Rac
  • Rac1
  • Wasf1
  • Wasf2
  • Wasf3
  • Waspip
  • Wave1
  • Wip
  • Wipf1
  • Wipf3
Rattus norvegicus (Norway rat)
VEGFA-VEGFR2 Pathway
  • Abi1
  • Abi2
  • Arha
  • Arha2
  • Axl
  • Baiap2
  • Bcar1
  • Brk1
  • Cas
  • Cdc42
  • Crk
  • Crkas
  • Crko
  • Csbp1
  • Csbp2
  • Cyba
  • Cybb
  • Cyfip1
  • Cyfip2
  • Elmo1
  • Elmo2
  • Fak
  • Fak1
  • Fak2
  • Flk1
  • Fyn
  • Hem2
  • Hsp27
  • Hsp86
  • Hsp90aa1
  • Hspb1
  • Hspca
  • Itgav
  • Itgb3
  • Kdr
  • Mapk11
  • Mapk12
  • Mapk13
  • Mapk14
  • Mapkapk2
  • Mapkapk3
  • Nap1
  • Ncf1
  • Ncf2
  • Ncf4
  • Nck1
  • Nck2
  • Nckap1
  • Nckap1l
  • Pak2
  • Pik3ca
  • Pik3cb
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Pkacb
  • Prkaca
  • Prkacb
  • Ptk2
  • Ptk2b
  • Pxn
  • Pyk2
  • Rac
  • Rac1
  • Rhoa
  • Rock1
  • Rock2
  • Sapk3
  • Sck
  • Sh2d2a
  • Shb
  • Shc2
  • Src
  • Vav
  • Vav1
  • Vav2
  • Vav3
  • Vegf
  • Vegfa
  • Wasf1
  • Wasf2
  • Wasf3
  • Wave1
Rattus norvegicus (Norway rat)
RUNX1 regulates transcription of genes involved in differentiation of HSCs
  • Abl1
  • Aml1
  • Cak
  • Cak1
  • Cbfa2
  • Cbfb
  • Ccnh
  • Cdk7
  • Gata1
  • Gata2
  • Itch
  • Kmt2a
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • Ldb1
  • Lmo2
  • Lmo3
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mecl1
  • Mll
  • Mll1
  • Mnat1
  • Mo15
  • Mss1
  • Pan
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Ptf1c
  • Ring12
  • Rps27a
  • Runx1
  • Sug1
  • Tal1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Tcf12
  • Tcf3
  • Tcfe2a
  • Tp73
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Yap
  • Yap1
  • Yap65
Rattus norvegicus (Norway rat)
Myogenesis
  • Abl1
  • Bnip2
  • Boc
  • Catnb
  • Cdc42
  • Cdh15
  • Cdh2
  • Cdo
  • Cdon
  • Csbp1
  • Csbp2
  • Ctnna2
  • Ctnnb1
  • Itf2
  • Mapk11
  • Mapk12
  • Mapk14
  • Mef2a
  • Mef2b
  • Mef2c
  • Mef2d
  • Mrf4
  • Myf5
  • Myf6
  • Myod
  • Myod1
  • Myog
  • Pan
  • Ptf1c
  • Sapk3
  • Sef2
  • Spag9
  • Tcf12
  • Tcf3
  • Tcf4
  • Tcfe2a
Rattus norvegicus (Norway rat)
Cyclin D associated events in G1
  • Abl1
  • Cak
  • Cak1
  • Ccnd1
  • Ccnd2
  • Ccnd3
  • Ccne
  • Ccne1
  • Ccne2
  • Ccnh
  • Cdk2
  • Cdk4
  • Cdk6
  • Cdk7
  • Cdkn1a
  • Cdkn1b
  • Cdkn1c
  • Cdkn2
  • Cdkn2b
  • Cdkn2d
  • Cks1b
  • Cks1l
  • Cul1
  • E2f1
  • E2f2
  • E2f3
  • E2f4
  • E2f5
  • Ink4
  • Jak2
  • LOC100360645
  • LOC682033
  • LOC684111
  • Lyn
  • MGC112830
  • Mnat1
  • Mo15
  • Ppp2ca
  • Ppp2cb
  • Ppp2r1a
  • Ppp2r1b
  • Ppp2r2a
  • Ppp2r3b
  • Ptk6
  • RGD1561797
  • Rb-1
  • Rb1
  • Rbl1
  • Rbl2
  • Rps27a
  • Skp1
  • Skp1a
  • Skp2
  • Src
  • Tfdp1
  • Tfdp2
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Vin-1
  • p27Kip1
Rattus norvegicus (Norway rat)
ABO blood group biosynthesis
  • Abo2
  • Fta
  • Ftb
  • Fut1
  • Fut2
  • Sec1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Formation of WDR5-containing histone-modifying complexes
  • Abp10
  • Ada3
  • Akap8l
  • Ash2l
  • Bod1l1
  • Ccdc101
  • Csrp2bp
  • Cxxc1
  • Dr1
  • Hcfc1
  • Hcfc2
  • Kansl1
  • Kansl2
  • Kansl3
  • Kat14
  • Kat2a
  • Kat2b
  • Kat8
  • Kmt2a
  • Kmt2b
  • Kmt2c
  • Ledgf
  • Mbip
  • Mcrs1
  • Men1
  • Mll
  • Mll1
  • Myst1
  • Nsl2
  • Nsl3
  • Ogt
  • Pagr1
  • Paxip1
  • Phf20
  • Phf20l1
  • Psip1
  • Rbbp5
  • Setd1a
  • Setd1b
  • Sgf29
  • Tada2a
  • Tada2l
  • Tada3
  • Tada3l
  • Wdr5
  • Wdr82
  • Yeats2
  • Zzz3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Cell-extracellular matrix interactions
  • Abpl
  • Actp
  • Fblim1
  • Fermt2
  • Fln2
  • Flna
  • Flnc
  • ILK1
  • ILK2
  • Ilk
  • Lims1
  • Lims2
  • Parva
  • Parvb
  • Vasp
Rattus norvegicus (Norway rat)
RHOB GTPase cycle
  • Abr
  • Actc
  • Actc1
  • Akap13
  • Anln
  • Arhb
  • Arhgap1
  • Arhgap21
  • Arhgap26
  • Arhgap32
  • Arhgap35
  • Arhgap5
  • Arhgap7
  • Arhgdig
  • Arhgef1
  • Arhgef10
  • Arhgef10l
  • Arhgef11
  • Arhgef12
  • Arhgef17
  • Arhgef2
  • Arhgef25
  • Arhgef28
  • Arhgef3
  • Arhgef5
  • Bcr
  • CRIK
  • Cav
  • Cav1
  • Cavin1
  • Cit
  • Daam1
  • Depdc1b
  • Diap1
  • Diaph1
  • Diaph3
  • Dlc1
  • Ect2
  • Flot1
  • Flot2
  • Geft
  • Grlf1
  • Iqgap3
  • Jup
  • Lsc
  • Mcam
  • Mcf2
  • Mcf2l
  • Muc18
  • Myo9a
  • Myo9b
  • Myr5
  • Myr7
  • Net1
  • Ophn1
  • Ost
  • P190A
  • Pak2
  • Pcdh7
  • Pg
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Pkn
  • Pkn1
  • Pkn2
  • Prex1
  • Prk1
  • Prk2
  • Prkcl1
  • Prkcl2
  • Ptrf
  • RGD1565043
  • Racgap1
  • Reg1
  • Reg2
  • Rgnef
  • Rhob
  • Rhogap
  • Rhpn2
  • Rock1
  • Rock2
  • Rt13
  • Rtkn
  • Sk2
  • Slk
  • Snap23
  • Sowahc
  • Stard12
  • Stard13
  • Stard8
  • Stk10
  • Stom
  • Syb3
  • Tfrc
  • Tjp2
  • Trfr
  • Vamp3
  • Vangl1
  • Vav2
  • p190ARHOGAP
Rattus norvegicus (Norway rat)
G alpha (12/13) signalling events
  • Abr
  • Adra1a
  • Adra1b
  • Adra1c
  • Adra1d
  • Akap13
  • Arha
  • Arha2
  • Arhb
  • Arhgef1
  • Arhgef10
  • Arhgef10l
  • Arhgef11
  • Arhgef12
  • Arhgef15
  • Arhgef16
  • Arhgef17
  • Arhgef19
  • Arhgef2
  • Arhgef25
  • Arhgef26
  • Arhgef3
  • Arhgef33
  • Arhgef37
  • Arhgef38
  • Arhgef39
  • Arhgef5
  • Arhgef6
  • Arhgef7
  • Arhgef9
  • Btk
  • Duo
  • Ect2
  • Ehsh1
  • Fgd1
  • Fgd2
  • Fgd3
  • Fgd4
  • Geft
  • Gna12
  • Gna13
  • Grf2
  • Hapip
  • Itsn
  • Itsn1
  • Kalrn
  • LOC687105
  • Lsc
  • Mcf2
  • Mcf2l
  • Net1
  • Ngef
  • Obscn
  • Ost
  • Pak3bp
  • Pixb
  • Plekhg2
  • Plekhg5
  • Plxnb1
  • Prex1
  • RGD1565043
  • Rasgrf2
  • Rhoa
  • Rhob
  • Rock1
  • Rock2
  • Rt13
  • Sos1
  • Sos2
  • Tbxa2r
  • Tech
  • Tiam1
  • Tiam2
  • Trio
  • Vav
  • Vav1
  • Vav2
  • Vav3
Rattus norvegicus (Norway rat)
NRAGE signals death through JNK
  • Abr
  • Akap13
  • Arhgef1
  • Arhgef10
  • Arhgef10l
  • Arhgef11
  • Arhgef12
  • Arhgef15
  • Arhgef16
  • Arhgef17
  • Arhgef19
  • Arhgef2
  • Arhgef25
  • Arhgef26
  • Arhgef3
  • Arhgef33
  • Arhgef37
  • Arhgef38
  • Arhgef39
  • Arhgef5
  • Arhgef6
  • Arhgef7
  • Arhgef9
  • Bad
  • Bcl2l11
  • Bim
  • Bod
  • Duo
  • Ect2
  • Ehsh1
  • Fgd1
  • Fgd2
  • Fgd3
  • Fgd4
  • Geft
  • Gna13
  • Grf2
  • Hapip
  • Itsn
  • Itsn1
  • Jnk1
  • Kalrn
  • LOC687105
  • Lsc
  • Mapk8
  • Mcf2
  • Mcf2l
  • Net1
  • Ngef
  • Obscn
  • Ost
  • Pak3bp
  • Pixb
  • Plekhg2
  • Plekhg5
  • Prex1
  • Prkm8
  • RGD1565043
  • Rac
  • Rac1
  • Rasgrf2
  • Rt13
  • Sos1
  • Sos2
  • Tech
  • Tiam1
  • Tiam2
  • Trio
  • Vav
  • Vav1
  • Vav2
  • Vav3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Biotin transport and metabolism
  • Acac
  • Acaca
  • Acacb
  • Btd
  • Hlcs
  • Mcca
  • Mccc1
  • Mccc2
  • Pc
  • Pcca
  • Pccb
  • Pdzd11
  • Slc5a6
  • Smvt
Rattus norvegicus (Norway rat)
Fatty acyl-CoA biosynthesis
  • Acac
  • Acaca
  • Acly
  • Acsvl1
  • Cbr4
  • Cln1
  • Facvl1
  • Fasn
  • Fatp2
  • Hsd17b8
  • Morc2
  • Ppt
  • Ppt1
  • Ppt2
  • Rpp14
  • Scd2
  • Slc27a2
  • Vlacs
  • Vlcs
Rattus norvegicus (Norway rat)
Branched-chain amino acid catabolism
  • Acad8
  • Acadsb
  • Acat1
  • Aldh6a1
  • Auh
  • Bcat1
  • Bcat2
  • Bcatm
  • Bckdha
  • Bckdhb
  • Bckdk
  • Dbt
  • Dld
  • Eca40
  • Echs1
  • Erab
  • Hadh2
  • Hibadh
  • Hibch
  • Hsd17b10
  • Ivd
  • Mcca
  • Mccc1
  • Mccc2
  • Mmsdh
Rattus norvegicus (Norway rat)
Beta oxidation of lauroyl-CoA to decanoyl-CoA-CoA
  • Acadl
  • Echs1
  • Had
  • Hadh
  • Hadha
  • Hadhb
  • Hadhsc
  • Schad
Rattus norvegicus (Norway rat)
Beta oxidation of myristoyl-CoA to lauroyl-CoA
  • Acadl
  • Hadha
  • Hadhb
Rattus norvegicus (Norway rat)
mitochondrial fatty acid beta-oxidation of unsaturated fatty acids
  • Acadm
  • Dci
  • Decr
  • Decr1
  • Eci1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Beta oxidation of decanoyl-CoA to octanoyl-CoA-CoA
  • Acadm
  • Echs1
  • Had
  • Hadh
  • Hadha
  • Hadhb
  • Hadhsc
  • Mecr
  • Nrbf1
  • Schad
Rattus norvegicus (Norway rat)
Beta oxidation of octanoyl-CoA to hexanoyl-CoA
  • Acadm
  • Echs1
  • Had
  • Hadh
  • Hadha
  • Hadhb
  • Hadhsc
  • Schad
Rattus norvegicus (Norway rat)
Beta oxidation of hexanoyl-CoA to butanoyl-CoA
  • Acads
  • Echs1
  • Had
  • Hadh
  • Hadha
  • Hadhb
  • Hadhsc
  • Schad
Rattus norvegicus (Norway rat)
Beta oxidation of butanoyl-CoA to acetyl-CoA
  • Acads
  • Echs1
  • Had
  • Hadh
  • Hadhsc
  • Schad
Rattus norvegicus (Norway rat)
Beta oxidation of palmitoyl-CoA to myristoyl-CoA
  • Acadvl
  • Hadha
  • Hadhb
Rattus norvegicus (Norway rat)
Keratan sulfate biosynthesis
  • Acan
  • Agc
  • Agc1
  • B3gnt2
  • B3gnt3
  • B3gnt4
  • B3gnt7
  • B4galt2
  • B4galt3
  • B4galt4
  • B4galt5
  • B4galt6
  • Chst1
  • Chst2
  • Chst5
  • Fmod
  • Kera
  • Lcn
  • Ldc
  • Lum
  • Omd
  • Prelp
  • Siat10
  • Siat4b
  • Siat4c
  • Siat5
  • Siat6
  • Slc35d2
  • St3gal1
  • St3gal2
  • St3gal3
  • St3gal4
  • St3gal6
Rattus norvegicus (Norway rat)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

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Last updated: August 19, 2024