GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 376 - 400 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name ▲ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Sulfur amino acid metabolism
  • Ahcy
  • Ams1
  • Bhmt
  • Bhmt2
  • Mat1a
  • Mtr
  • Mtrr
Rattus norvegicus (Norway rat)
Bicarbonate transporters
  • Ae1
  • Ae2
  • Ae3
  • Ae4
  • Ahcyl2
  • B3rp2
  • B3rp3
  • Nbc
  • Nbc1
  • Nbc2
  • Nbc3
  • Nbce1
  • Nbcn1
  • Ncbe
  • Ndcbe1
  • Rnbc1
  • Slc4a1
  • Slc4a10
  • Slc4a2
  • Slc4a3
  • Slc4a4
  • Slc4a5
  • Slc4a7
  • Slc4a8
  • Slc4a9
Rattus norvegicus (Norway rat)
G alpha (z) signalling events
  • Adcy1
  • Adcy2
  • Adcy3
  • Adcy4
  • Adcy5
  • Adcy6
  • Adcy7
  • Adcy8
  • Adcy9
  • Adra2a
  • Adra2b
  • Adra2c
  • Gnaz
  • Gnb1
  • Gnb2
  • Gnb3
  • Gnb4
  • Gnb5
  • Gng10-ps1
  • Gng11
  • Gng12
  • Gng3
  • Gng4
  • Gng5
  • Gng5-ps4
  • Gng7
  • Gng8
  • Gng9
  • Gngt1
  • Gngt11
  • Gngt5
  • Gngt7
  • Gngt9
  • Rgs16
  • Rgs17
  • Rgs20
  • Rgsr
Rattus norvegicus (Norway rat)
PKA activation
  • Adcy1
  • Adcy2
  • Adcy3
  • Adcy4
  • Adcy5
  • Adcy6
  • Adcy7
  • Adcy8
  • Adcy9
  • CaMIII
  • Calm3
  • Cam3
  • Camc
  • Pkacb
  • Prkaca
  • Prkacb
  • Prkar1a
  • Prkar1b
  • Prkar2a
  • Prkar2b
Rattus norvegicus (Norway rat)
Adenylate cyclase inhibitory pathway
  • Adcy1
  • Adcy2
  • Adcy3
  • Adcy4
  • Adcy5
  • Adcy6
  • Adcy7
  • Adcy8
  • Adcy9
  • Gnai-1
  • Gnai-2
  • Gnai-3
  • Gnai1
  • Gnai2
  • Gnai3
  • Gnal
  • Gnat-3
  • Gnat3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Adenylate cyclase activating pathway
  • Adcy1
  • Adcy2
  • Adcy3
  • Adcy4
  • Adcy5
  • Adcy6
  • Adcy7
  • Adcy8
  • Adcy9
  • Gnal
Rattus norvegicus (Norway rat)
Hedgehog 'off' state
  • Adcy1
  • Adcy10
  • Adcy2
  • Adcy3
  • Adcy4
  • Adcy5
  • Adcy6
  • Adcy7
  • Adcy8
  • Adcy9
  • Dhc1b
  • Dlp4
  • Dnch2
  • Dnchc2
  • Dync2h1
  • Fuz
  • Gli1
  • Gli2
  • Gli3
  • Gpr161
  • Ift122
  • Ift140
  • Ift172
  • Ift52
  • Ift57
  • Ift88
  • Intu
  • Kif3a
  • Kif7
  • LOC100364088
  • Mks1
  • Ofd1
  • Pdzd6
  • Pkacb
  • Prkaca
  • Prkacb
  • Prkar1a
  • Prkar1b
  • Prkar2a
  • Prkar2b
  • Ptch
  • Ptch1
  • Rpgrip1l
  • Sac
  • Slb
  • Smo
  • Smoh
  • Sufu
  • Ttc21b
  • Tulp3
  • Wdr19
  • Wdr35
Rattus norvegicus (Norway rat)
Adrenaline,noradrenaline inhibits insulin secretion
  • Adcy5
  • Adcy6
  • Adra2a
  • Adra2c
  • Gnai-1
  • Gnai-2
  • Gnai1
  • Gnai2
  • Gnb1
  • Gnb2
  • Gnb3
  • Gnb4
  • Gnb5
  • Gng10-ps1
  • Gng11
  • Gng12
  • Gng3
  • Gng4
  • Gng5
  • Gng5-ps4
  • Gng7
  • Gng8
  • Gng9
  • Gngt1
  • Gngt11
  • Gngt5
  • Gngt7
  • Gngt9
Rattus norvegicus (Norway rat)
Interconversion of nucleotide di- and triphosphates
  • Ak1
  • Ak2
  • Ak3l1
  • Ak4
  • Ak5
  • Ak6
  • Ak7
  • Ak8
  • Ak9
  • Akd2
  • Cinap
  • Cmpk
  • Cmpk1
  • Ctps1
  • Ctps2
  • Dctd
  • Dtymk
  • Dut
  • Dutp
  • Glrx
  • Glrx1
  • Grx
  • Gsr
  • Guk1
  • Nme1
  • Nme2
  • Nme3
  • Nudt13
  • RGD1559879
  • Rrm1
  • Rrm2
  • Rrm2b
  • Trxr1
  • Txn
  • Txn1
  • Txnrd1
  • Tyms
Rattus norvegicus (Norway rat)
Class B/2 (Secretin family receptors)
  • Adgre1
  • Adgre5
  • Cd55
  • Crf2r
  • Crh
  • Crhbp
  • Crhr
  • Crhr1
  • Crhr2
  • Emr1
  • Pth
  • Pth1r
  • Pth2
  • Pth2r
  • Pthlh
  • Pthr
  • Pthr1
  • Pthr2
  • Pthrp
  • Tip39
  • Tipf39
  • Ucn
  • Ucn2
  • Ucn3
Rattus norvegicus (Norway rat)
DNA Damage/Telomere Stress Induced Senescence
  • Acd
  • Atm
  • Ccna1
  • Ccna2
  • Ccne
  • Ccne1
  • Ccne2
  • Cdk2
  • Cdkn1a
  • Cdkn1b
  • Cdkn2
  • ENSRNOG00000062927
  • ENSRNOG00000064540
  • ENSRNOG00000066901
  • ENSRNOG00000068034
  • Ep400
  • H2ab3
  • H2ac10
  • H2ac18
  • H2ac4
  • H2afb3
  • H2afx
  • H2aj
  • H2ax
  • H2az2
  • H2bc1
  • H2bc12l1
  • H2bc6
  • H2bcl1
  • H2bcl2
  • H2bu1
  • H4c16
  • H4c2
  • H4f16
  • H4ft
  • Hist1h2ba
  • Hist1h2bc
  • Hist1h2bg
  • Hist1h2bo
  • Hist1h2bq
  • Hist1h4b
  • Hist1h4m
  • Hist2h2aa3
  • Hist4
  • Hist4h4
  • Htatip
  • Kat5
  • LOC100365043
  • LOC100910200
  • LOC120097726
  • LOC684797
  • Mre11
  • Mre11a
  • Nbn
  • Nbs1
  • P53
  • Pot1
  • Rad50
  • Rap1
  • Terf2
  • Terf2ip
  • Th2b
  • Tip60
  • Tip60b
  • Tp53
  • p27Kip1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Recognition and association of DNA glycosylase with site containing an affected purine
  • Acd
  • ENSRNOG00000062927
  • ENSRNOG00000064540
  • ENSRNOG00000066901
  • ENSRNOG00000068034
  • H2ab3
  • H2ac10
  • H2ac18
  • H2ac4
  • H2afb3
  • H2afx
  • H2aj
  • H2ax
  • H2az2
  • H2bc1
  • H2bc12l1
  • H2bc6
  • H2bcl1
  • H2bcl2
  • H2bu1
  • H4c16
  • H4c2
  • H4f16
  • H4ft
  • Hist1h2ba
  • Hist1h2bc
  • Hist1h2bg
  • Hist1h2bo
  • Hist1h2bq
  • Hist1h4b
  • Hist1h4m
  • Hist2h2aa3
  • Hist4
  • Hist4h4
  • LOC100365043
  • LOC100910200
  • LOC120097726
  • LOC684797
  • Mmh
  • Neil3
  • Ogg1
  • Ogh1
  • Pot1
  • Rap1
  • Terf2
  • Terf2ip
  • Th2b
Rattus norvegicus (Norway rat)
Peptide ligand-binding receptors
  • Agt
  • Agtr1
  • Agtr1a
  • Agtr2
  • Agtrl1
  • Apel
  • Apj
  • Apln
  • Aplnr
  • At1a
  • B1bkr
  • Bdkrb1
  • Bdkrb2
  • Bkr
  • Brs3
  • Bv8
  • C3
  • C3ar1
  • C5
  • C5ar1
  • C5ar2
  • C5l2
  • C5r1
  • Cck
  • Cckar
  • Cckbr
  • Cmkrl2
  • Ece1
  • Ece2
  • Edn1
  • Edn2
  • Edn3
  • Ednra
  • Ednrb
  • Etbrlp2
  • F2
  • F2r
  • F2rl1
  • F2rl2
  • F2rl3
  • Gal
  • Galn
  • Galnr
  • Galnr1
  • Galnr2
  • Galnr3
  • Galr1
  • Galr2
  • Galr3
  • Gper
  • Gper1
  • Gpr10
  • Gpr14
  • Gpr154
  • Gpr24
  • Gpr30
  • Gpr37
  • Gpr37l1
  • Gpr41
  • Gpr54
  • Gpr66
  • Gpr7
  • Gpr73
  • Gpr73l1
  • Gpr77
  • Grp
  • Grpr
  • Kel
  • Kiss1
  • Kiss1r
  • Kng
  • Kng1
  • Mc1r
  • Mc2r
  • Mc3r
  • Mc4r
  • Mc5r
  • Mch
  • Mchr1
  • Nln
  • Nmb
  • Nmbr
  • Nms
  • Nmu
  • Nmur1
  • Nmur2
  • Npb
  • Npbwr1
  • Nps
  • Npsr1
  • Npw
  • Npy
  • Npy1r
  • Npy4r
  • Npy5r
  • Npyr5
  • Ntr2
  • Nts
  • Ntsr
  • Ntsr1
  • Ntsr2
  • Oor
  • Oprd1
  • Oprk1
  • Oprl
  • Oprl1
  • Oprm1
  • Par1
  • Par2
  • Par3
  • Par4
  • Pdyn
  • Penk
  • Penk-rs
  • Penk1
  • Pkr1
  • Pkr2
  • Pmch
  • Pnoc
  • Pomc
  • Pomc2
  • Ppl8
  • Ppy
  • Ppyr1
  • Prh
  • Prlh
  • Prlhr
  • Prok1
  • Prok2
  • Prokr1
  • Prokr2
  • Psap
  • Pyy
  • Ror-a
  • Ror-b
  • Ror-d
  • Senr
  • Serpina8
  • Sgp1
  • Slc1
  • Smst
  • Sst
  • Sstr1
  • Sstr2
  • Sstr3
  • Sstr4
  • Sstr5
  • Tgr1
  • Trh
  • Trhr
  • Urp
  • Uts2
  • Uts2b
  • Uts2d
  • Uts2r
  • Xk
  • Xkh
  • Xkr1
  • Xrg1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Advanced glycosylation endproduct receptor signaling
  • A4
  • AD1
  • Ager
  • App
  • Capza1
  • Capza2
  • Hmg-1
  • Hmg1
  • Hmgb1
  • Hmgb1-ps33
  • Hmgb1-ps4
  • Hmgb1l1
  • Hmgb1l2
  • Hmgb1l3
  • Hmgb1l5
  • LOC108349189
  • LOC108350839
  • Rage
  • S100b
Rattus norvegicus (Norway rat)
TRAF6 mediated NF-kB activation
  • A4
  • AD1
  • Ager
  • App
  • Chuk
  • Hmg-1
  • Hmg1
  • Hmgb1
  • Hmgb1-ps33
  • Hmgb1-ps4
  • Hmgb1l1
  • Hmgb1l2
  • Hmgb1l3
  • Hmgb1l5
  • Ikba
  • Ikbb
  • Ikbkb
  • Ikbkg
  • Ikkb
  • LOC108349189
  • LOC108350839
  • Nemo
  • Nfkb2
  • Nfkbia
  • Nfkbib
  • Nkiras1
  • Nkiras2
  • Rage
  • Rela
  • S100b
Rattus norvegicus (Norway rat)
TAK1-dependent IKK and NF-kappa-B activation
  • A4
  • AD1
  • Ager
  • App
  • Chuk
  • Hmg-1
  • Hmg1
  • Hmgb1
  • Hmgb1-ps33
  • Hmgb1-ps4
  • Hmgb1l1
  • Hmgb1l2
  • Hmgb1l3
  • Hmgb1l5
  • Ikba
  • Ikbb
  • Ikbkb
  • Ikbkg
  • Ikkb
  • LOC108349189
  • LOC108350839
  • Nemo
  • Nfkb2
  • Nfkbia
  • Nfkbib
  • Nkiras1
  • Nkiras2
  • Rage
  • Rela
  • S100b
Rattus norvegicus (Norway rat)
Adherens junctions interactions
  • Af6
  • Afdn
  • Ang
  • Ang2
  • Cad7
  • Cadm1
  • Cadm2
  • Cadm3
  • Cdh1
  • Cdh10
  • Cdh11
  • Cdh12
  • Cdh13
  • Cdh15
  • Cdh17
  • Cdh18
  • Cdh2
  • Cdh24
  • Cdh3
  • Cdh5
  • Cdh6
  • Cdh7
  • Cdh8
  • Cdh9
  • Igsf4b
  • Igsf4d
  • Kcad
  • Mllt4
  • Necl1
  • Necl3
  • Nectin1
  • Nectin2
  • Nectin3
  • Nectin4
  • Pvrl1
  • Pvrl2
  • Raa2
  • SynCam1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Aflatoxin activation and detoxification
  • Acy1
  • Acy1a
  • Acy3
  • Afar
  • Afar2
  • Aiar
  • Akr7a1
  • Akr7a2
  • Akr7a3
  • Cyp1a-2
  • Cyp1a2
  • Cyp2a-3
  • Cyp2a3
  • Cyp2a3a
  • Cyp3a-1
  • Cyp3a-2
  • Cyp3a1
  • Cyp3a11
  • Cyp3a13
  • Cyp3a18
  • Cyp3a2
  • Cyp3a62
  • Cyp3a9
  • Dpep1
  • Dpep2
  • Dpep3
  • Ggt
  • Ggt1
  • Ggt5
  • Ggt6
  • Ggt7
  • Ggtl3
  • Ggtla1
  • Gst12
  • Mgst1
  • Mgst2
  • Mgst3
  • Mgst3l1
  • Rdp
Rattus norvegicus (Norway rat)
Keratan sulfate biosynthesis
  • Acan
  • Agc
  • Agc1
  • B3gnt2
  • B3gnt3
  • B3gnt4
  • B3gnt7
  • B4galt2
  • B4galt3
  • B4galt4
  • B4galt5
  • B4galt6
  • Chst1
  • Chst2
  • Chst5
  • Fmod
  • Kera
  • Lcn
  • Ldc
  • Lum
  • Omd
  • Prelp
  • Siat10
  • Siat4b
  • Siat4c
  • Siat5
  • Siat6
  • Slc35d2
  • St3gal1
  • St3gal2
  • St3gal3
  • St3gal4
  • St3gal6
Rattus norvegicus (Norway rat)
Keratan sulfate degradation
  • Acan
  • Agc
  • Agc1
  • Fmod
  • Glb1
  • Glb1l
  • Glb1l2
  • Glb1l3
  • Gns
  • Hexa
  • Hexb
  • Kera
  • Lcn
  • Ldc
  • Lum
  • Omd
  • Prelp
Rattus norvegicus (Norway rat)
Retinoid metabolism and transport
  • Agrin
  • Agrn
  • Akr1b10
  • Akr1c1
  • Akr1c21
  • Apoa1
  • Apoa2
  • Apoa4
  • Apob
  • Apoc2
  • Apoc3
  • Apoe
  • Apom
  • Bcdo
  • Bcdo1
  • Bcmo1
  • Bco1
  • Bco2
  • Clps
  • Crbpii
  • Gpc1
  • Gpc2
  • Gpc3
  • Gpc4
  • Gpc5
  • Gpc6
  • Gpihbp1
  • Hsd17b5
  • Hspg1
  • Lpl
  • Lrat
  • Lrp1
  • Lrp10
  • Lrp12
  • Lrp2
  • Lrp8
  • Phlpb
  • Plb1
  • Pnlip
  • Rbp-1
  • Rbp1
  • Rbp2
  • Rbp4
  • Rdh11
  • Sdc1
  • Sdc2
  • Sdc3
  • Sdc4
  • Synd1
  • Synd2
  • Synd3
  • Synd4
  • Tt
  • Ttr
Rattus norvegicus (Norway rat)
HS-GAG degradation
  • Agrin
  • Agrn
  • Glb1
  • Glb1l
  • Glb1l2
  • Glb1l3
  • Gpc1
  • Gpc2
  • Gpc3
  • Gpc4
  • Gpc5
  • Gpc6
  • Gus
  • Gusb
  • Hep
  • Hpse
  • Hpse2
  • Hspg1
  • Ids
  • Idua
  • LOC100363795
  • Naglu
  • Sdc1
  • Sdc2
  • Sdc3
  • Sdc4
  • Sgsh
  • Synd1
  • Synd2
  • Synd3
  • Synd4
Rattus norvegicus (Norway rat)
A tetrasaccharide linker sequence is required for GAG synthesis
  • Agrin
  • Agrn
  • B3galt6
  • B3gat1
  • B3gat2
  • B4galt7
  • Bcan
  • Behab
  • Bgn
  • Caleb
  • Cspg2
  • Cspg3
  • Cspg4
  • Cspg5
  • Dcn
  • Glcats
  • Gpc1
  • Gpc2
  • Gpc3
  • Gpc4
  • Gpc5
  • Gpc6
  • Hspg1
  • Ncan
  • Ng2
  • Ngc
  • Sdc1
  • Sdc2
  • Sdc3
  • Sdc4
  • Synd1
  • Synd2
  • Synd3
  • Synd4
  • Vcan
  • Xylt1
  • Xylt2
Rattus norvegicus (Norway rat)
HS-GAG biosynthesis
  • 3ost
  • 3ost1
  • 3ost2
  • Agrin
  • Agrn
  • Ext1
  • Ext2
  • Gpc1
  • Gpc2
  • Gpc3
  • Gpc4
  • Gpc5
  • Gpc6
  • Hs2st1
  • Hs3st1
  • Hs3st2
  • Hs3st3a1
  • Hs3st3b1
  • Hs3st4
  • Hs3st5
  • Hs3st6
  • Hs6st1
  • Hs6st2
  • Hs6st3
  • Hspg1
  • Hsst
  • Hsst1
  • Ndst1
  • Ndst2
  • Ndst3
  • Ndst4
  • Sdc1
  • Sdc2
  • Sdc3
  • Sdc4
  • Slc35d2
  • Synd1
  • Synd2
  • Synd3
  • Synd4
Rattus norvegicus (Norway rat)
Transport of Mature mRNA Derived from an Intronless Transcript
  • Aaas
  • Alyref
  • Cbp20
  • Cbp80
  • Cpsf1
  • Cpsf2
  • Cpsf3
  • Cpsf4
  • Eif4e
  • Fip1l1
  • Gp210
  • LOC683983
  • Mrnp41
  • Ncbp1
  • Ncbp2
  • Ndc1
  • Npap60
  • Nup107
  • Nup121
  • Nup133
  • Nup153
  • Nup155
  • Nup160
  • Nup188
  • Nup205
  • Nup210
  • Nup214
  • Nup35
  • Nup37
  • Nup42
  • Nup43
  • Nup50
  • Nup53
  • Nup54
  • Nup58
  • Nup62
  • Nup84
  • Nup85
  • Nup88
  • Nup93
  • Nup98
  • Nupl1
  • Nupl2
  • Nxf1
  • Pcnt1
  • Pom121
  • Pom210
  • Rae1
  • Ranbp2
  • Sec13
  • Sec13l1
  • Sympk
  • Tap
  • Tmem48
  • Tpr
Rattus norvegicus (Norway rat)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

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Last updated: August 19, 2024