GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 451 - 475 of 1070 in total
Pathway Name ▼ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Opsins
  • Bcp
  • Gcp
  • Opn1mw
  • Opn1sw
  • Opn3
  • Opn4
  • Opn5
  • Rgr
  • Rho
  • Rrh
Rattus norvegicus (Norway rat)
Opioid Signalling
  • Oprm1
  • Pdyn
  • Pomc
  • Pomc2
  • Ror-b
Rattus norvegicus (Norway rat)
Oncogene Induced Senescence
  • Cdk4
  • Cdk6
  • Cdkn2b
  • Cdkn2d
  • Erf
  • Erk1
  • Erk2
  • Ets-1
  • Ets1
  • Ets2
  • Id-1
  • Id1
  • Ink4
  • LOC100360645
  • Mapk
  • Mapk1
  • Mapk3
  • Mdm2
  • Mdm4
  • Mdmx
  • P53
  • Prkm1
  • Prkm3
  • Rps27a
  • Tp53
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
O-linked glycosylation of mucins
  • A4gnt
  • AC096792.1
  • B3gnt2
  • B3gnt3
  • B3gnt4
  • B3gnt5
  • B3gnt6
  • B3gnt7
  • B3gnt8
  • B3gnt9
  • B3gntl1
  • B4galt5
  • B4galt6
  • C1galt1
  • C1galt1c1
  • Chst4
  • Galnt1
  • Galnt10
  • Galnt11
  • Galnt12
  • Galnt13
  • Galnt15
  • Galnt16
  • Galnt17
  • Galnt18
  • Galnt2
  • Galnt5
  • Galnt6
  • Galnt7
  • Galnt9
  • Galntl5
  • Galntl6
  • Gcnt1
  • Gcnt3
  • Gcnt4
  • Gcnt7
  • LOC102550196
  • Muc1
  • Muc13
  • Muc15
  • Muc19
  • Muc2
  • Muc20
  • Muc4
  • Muc5ac
  • Muc5b
  • Muc6
  • Qtgal
  • Smc
  • gcnt
Rattus norvegicus (Norway rat)
O-linked glycosylation
  • Ago61
  • B3galnt2
  • Dag1
  • Gtdc2
  • Gyltl1b
  • Large1
  • Large2
  • Pomgnt1
  • Pomgnt2
  • Pomk
  • Pomt1
  • Pomt2
  • Sgk196
Rattus norvegicus (Norway rat)
O-glycosylation of TSR domain-containing proteins
  • Adamts1
  • Adamts10
  • Adamts12
  • Adamts13
  • Adamts14
  • Adamts15
  • Adamts16
  • Adamts17
  • Adamts18
  • Adamts19
  • Adamts2
  • Adamts20
  • Adamts3
  • Adamts4
  • Adamts5
  • Adamts6
  • Adamts7
  • Adamts8
  • Adamts9
  • Adamtsl1
  • Adamtsl2
  • Adamtsl3
  • Adamtsl4
  • Adamtsl5
  • B3glct
  • Pofut2
  • Rpesp
  • Sbspon
  • Sema5a
  • Sema5b
  • Spon1
  • Spon2
  • Sponf
  • Sspo
  • Thbs1
  • Thbs2
  • Thsd1
  • Thsd4
  • Thsd7a
  • Thsd7b
Rattus norvegicus (Norway rat)
Nucleotide catabolism
  • Samhd1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Nuclear signaling by ERBB4
  • AABR07043897.1
  • Aph1a
  • Esr
  • Esr1
  • Estr
  • Mgf
  • Ncstn
  • Nr3a1
  • Ps2
  • Psen1
  • Psen2
  • Psenen
  • Psnl1
  • Psnl2
  • Src
  • Stat5a
  • Wwox
  • Yap
  • Yap1
  • Yap65
Rattus norvegicus (Norway rat)
Nuclear events mediated by NFE2L2
  • Cbp
  • Crebbp
  • Ep300
  • Nfe2l2
  • Nrf2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Nuclear Receptor transcription pathway
  • Ahch
  • Ar
  • Bar
  • C-erba-alpha
  • Car
  • Dax1
  • Ear2
  • Erba2
  • Erbal2
  • Erbeta
  • Err2
  • Errg
  • Esr
  • Esr1
  • Esr2
  • Esrl2
  • Esrra
  • Esrrb
  • Esrrg
  • Estr
  • Ftzf1
  • Fxr
  • Grl
  • Hmr
  • Hnf-4
  • Hnf4
  • Hnf4a
  • Hnf4g
  • Hzf-3
  • LOC100365683
  • Lxra
  • Lxrb
  • Med1
  • Mlr
  • Ncor2
  • Ngfib
  • Nor1
  • Nr0b1
  • Nr0b2
  • Nr1a1
  • Nr1a2
  • Nr1c1
  • Nr1c3
  • Nr1d1
  • Nr1d2
  • Nr1f2
  • Nr1h2
  • Nr1h3
  • Nr1h4
  • Nr1i1
  • Nr1i2
  • Nr1i3
  • Nr2a1
  • Nr2b1
  • Nr2b2
  • Nr2b3
  • Nr2c1
  • Nr2c2
  • Nr2e1
  • Nr2e3
  • Nr2f1
  • Nr2f6
  • Nr3a1
  • Nr3a2
  • Nr3b1
  • Nr3b2
  • Nr3b3
  • Nr3c1
  • Nr3c2
  • Nr3c3
  • Nr3c4
  • Nr4a1
  • Nr4a2
  • Nr4a3
  • Nr5a1
  • Nr5a2
  • Nr6a1
  • Nrbf2
  • Nurr1
  • Pgr
  • Ppar
  • Ppara
  • Pparg
  • Pxr
  • Rara
  • Rarb
  • Rarg
  • Rcor-1
  • Rip14
  • Rnr1
  • Rora
  • Rorb
  • Rorc
  • Rxra
  • Rxrb
  • Rxrg
  • Rzrb
  • Shp
  • Tcf14
  • Thra
  • Thrb
  • Tr2
  • Tr4
  • Vdr
Rattus norvegicus (Norway rat)
Nuclear Pore Complex (NPC) Disassembly
  • Aaas
  • Ccnb1
  • Ccnb2
  • Ccnb2-ps2
  • Cdc2
  • Cdc2a
  • Cdk1
  • Cdkn1
  • Gp210
  • LOC683983
  • Mrnp41
  • Ndc1
  • Npap60
  • Nup107
  • Nup121
  • Nup133
  • Nup153
  • Nup155
  • Nup160
  • Nup188
  • Nup205
  • Nup210
  • Nup214
  • Nup35
  • Nup37
  • Nup42
  • Nup43
  • Nup50
  • Nup53
  • Nup54
  • Nup58
  • Nup62
  • Nup84
  • Nup85
  • Nup88
  • Nup93
  • Nup98
  • Nupl1
  • Nupl2
  • Pcnt1
  • Pom121
  • Pom210
  • Rae1
  • Ranbp2
  • Sec13
  • Sec13l1
  • Tmem48
  • Tpr
Rattus norvegicus (Norway rat)
Nuclear Envelope Breakdown
  • Baf
  • Banf1
  • Emd
  • L2bp1
  • Rbm39
  • Vrk1
  • Vrk2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Notch-HLH transcription pathway
  • Cbp
  • Crebbp
  • HDAC9
  • Hdac1
  • Hdac10
  • Hdac11
  • Hdac2
  • Hdac3
  • Hdac4
  • Hdac5
  • Hdac8
  • Hdac9
  • Kat2a
  • Kat2b
  • LOC687001
  • Maml1
  • Maml2
  • Maml3
  • Ncor2
  • Notch3
  • Rbpj
  • Snw1
  • Tbl1x
  • Tbl1xr1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Norepinephrine Neurotransmitter Release Cycle
  • Bzrap1
  • Cplx1
  • Maoa
  • Oct1
  • Oct2
  • Ppfia1
  • Ppfia2
  • Ppfia3
  • Ppfia4
  • Rab3a
  • Rbp1
  • Rim1
  • Rims1
  • Sap
  • Slc18a2
  • Slc22a1
  • Slc22a2
  • Snap
  • Snap25
  • Stx1a
  • Stxbp1
  • Svat
  • Syb2
  • Syt1
  • Tspoap1
  • Unc13b
  • Unc13h2
  • Unc18a
  • Vamp2
  • Vmat2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Nonsense Mediated Decay (NMD) independent of the Exon Junction Complex (EJC)
  • AABR07029195.1
  • AABR07031505.1
  • AABR07060610.1
  • AABR07064810.1
  • AABR07071986.1
  • AABR07072260.1
  • Arbp
  • Cbp20
  • Cbp80
  • ENSRNOG00000068086
  • Eif4g1
  • Etf1
  • Fau
  • Fte-1
  • Fte1
  • Gspt1
  • Gspt2
  • LOC100360645
  • LOC100361060
  • LOC100361854
  • LOC100361933
  • LOC100910714
  • LOC102550668
  • LOC103692829
  • LOC108351255
  • LOC120093247
  • LOC120094652
  • LOC120097744
  • LOC120099964
  • LOC120103572
  • Lamr1
  • Ncbp1
  • Ncbp2
  • Pabp1
  • Pabpc1
  • RGD1562402
  • RGD1563956
  • RGD1564606
  • Rig
  • Rp2
  • Rpl1
  • Rpl10
  • Rpl10a
  • Rpl10l
  • Rpl10l1
  • Rpl11
  • Rpl12
  • Rpl12-ps2
  • Rpl12l2
  • Rpl13
  • Rpl13a
  • Rpl14
  • Rpl15
  • Rpl17
  • Rpl18
  • Rpl18a
  • Rpl19
  • Rpl21
  • Rpl21-ps26
  • Rpl21l2
  • Rpl21l3
  • Rpl21l5
  • Rpl22
  • Rpl23
  • Rpl23al1
  • Rpl24
  • Rpl26
  • Rpl27
  • Rpl27a
  • Rpl27al3
  • Rpl28
  • Rpl29
  • Rpl3
  • Rpl30
  • Rpl31
  • Rpl32
  • Rpl34
  • Rpl34-ps1
  • Rpl34l1
  • Rpl34l2
  • Rpl35
  • Rpl35al8
  • Rpl36a
  • Rpl36al-ps5
  • Rpl36al1
  • Rpl36l3
  • Rpl37
  • Rpl37l4
  • Rpl38
  • Rpl39
  • Rpl39l1
  • Rpl3l
  • Rpl4
  • Rpl44
  • Rpl5
  • Rpl6
  • Rpl7
  • Rpl7a
  • Rpl8
  • Rpl9
  • Rpl9l2
  • Rplp0
  • Rplp1
  • Rplp2
  • Rps10
  • Rps11
  • Rps12l8
  • Rps13
  • Rps14
  • Rps15
  • Rps15a
  • Rps16
  • Rps17
  • Rps18
  • Rps19
  • Rps2
  • Rps20
  • Rps21
  • Rps23
  • Rps24
  • Rps25
  • Rps26
  • Rps26-ps13
  • Rps26l2
  • Rps26l4
  • Rps26l6
  • Rps27
  • Rps27a
  • Rps27l
  • Rps28
  • Rps29
  • Rps3
  • Rps3a
  • Rps4
  • Rps4x
  • Rps4y2
  • Rps5
  • Rps6
  • Rps7
  • Rps7-ps23
  • Rps8
  • Rps9
  • Rpsa
  • S27-1
  • Uba80
  • Ubbl1
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Upf1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Nonsense Mediated Decay (NMD) enhanced by the Exon Junction Complex (EJC)
  • AABR07029195.1
  • AABR07031505.1
  • AABR07060610.1
  • AABR07064810.1
  • AABR07071986.1
  • AABR07072260.1
  • Arbp
  • Casc3
  • Cbp20
  • Cbp80
  • Dcp1a
  • Ddx48
  • ENSRNOG00000068086
  • Eif4a3
  • Eif4g1
  • Etf1
  • Fau
  • Fte-1
  • Fte1
  • Gspt1
  • Gspt2
  • LOC100360645
  • LOC100361060
  • LOC100361854
  • LOC100361933
  • LOC100910714
  • LOC102550668
  • LOC103692829
  • LOC108351255
  • LOC120093247
  • LOC120094652
  • LOC120097744
  • LOC120099964
  • LOC120103572
  • Lamr1
  • Magoh
  • Magohb
  • Mln51
  • Ncbp1
  • Ncbp2
  • Pabp1
  • Pabpc1
  • Pnrc2
  • Ppp2ca
  • Ppp2r1a
  • Ppp2r2a
  • RGD1562402
  • RGD1563956
  • RGD1564606
  • Rbm8
  • Rbm8a
  • Rig
  • Rnps1
  • Rp2
  • Rpl1
  • Rpl10
  • Rpl10a
  • Rpl10l
  • Rpl10l1
  • Rpl11
  • Rpl12
  • Rpl12-ps2
  • Rpl12l2
  • Rpl13
  • Rpl13a
  • Rpl14
  • Rpl15
  • Rpl17
  • Rpl18
  • Rpl18a
  • Rpl19
  • Rpl21
  • Rpl21-ps26
  • Rpl21l2
  • Rpl21l3
  • Rpl21l5
  • Rpl22
  • Rpl23
  • Rpl23al1
  • Rpl24
  • Rpl26
  • Rpl27
  • Rpl27a
  • Rpl27al3
  • Rpl28
  • Rpl29
  • Rpl3
  • Rpl30
  • Rpl31
  • Rpl32
  • Rpl34
  • Rpl34-ps1
  • Rpl34l1
  • Rpl34l2
  • Rpl35
  • Rpl35al8
  • Rpl36a
  • Rpl36al-ps5
  • Rpl36al1
  • Rpl36l3
  • Rpl37
  • Rpl37l4
  • Rpl38
  • Rpl39
  • Rpl39l1
  • Rpl3l
  • Rpl4
  • Rpl44
  • Rpl5
  • Rpl6
  • Rpl7
  • Rpl7a
  • Rpl8
  • Rpl9
  • Rpl9l2
  • Rplp0
  • Rplp1
  • Rplp2
  • Rps10
  • Rps11
  • Rps12l8
  • Rps13
  • Rps14
  • Rps15
  • Rps15a
  • Rps16
  • Rps17
  • Rps18
  • Rps19
  • Rps2
  • Rps20
  • Rps21
  • Rps23
  • Rps24
  • Rps25
  • Rps26
  • Rps26-ps13
  • Rps26l2
  • Rps26l4
  • Rps26l6
  • Rps27
  • Rps27a
  • Rps27l
  • Rps28
  • Rps29
  • Rps3
  • Rps3a
  • Rps4
  • Rps4x
  • Rps4y2
  • Rps5
  • Rps6
  • Rps7
  • Rps7-ps23
  • Rps8
  • Rps9
  • Rpsa
  • S27-1
  • Smg1
  • Smg5
  • Smg6
  • Smg7
  • Smg8
  • Smg9
  • Uba80
  • Ubbl1
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Upf1
  • Upf2
  • Upf3a
  • Upf3b
Rattus norvegicus (Norway rat)
Nonhomologous End-Joining (NHEJ)
  • ABRAXAS1
  • Abra1
  • Atm
  • Babam1
  • Babam2
  • Bard1
  • Brca1
  • Brcc3
  • Brcc36
  • Bre
  • Ccdc98
  • Dclre1c
  • ENSRNOG00000064540
  • ENSRNOG00000066901
  • ENSRNOG00000068034
  • Fam175a
  • H2afx
  • H2ax
  • H2bc1
  • H2bc12l1
  • H2bc6
  • H2bcl1
  • H2bcl2
  • H2bu1
  • H4c16
  • H4c2
  • H4f16
  • H4ft
  • Herc2
  • Hist1h2ba
  • Hist1h2bc
  • Hist1h2bg
  • Hist1h2bo
  • Hist1h2bq
  • Hist1h4b
  • Hist1h4m
  • Hist4
  • Hist4h4
  • Htatip
  • Kat5
  • LOC100365043
  • LOC100910200
  • LOC684797
  • Lig4
  • Mdc1
  • Merit40
  • Mms2
  • Mre11
  • Mre11a
  • Nba1
  • Nbn
  • Nbs1
  • Nhej1
  • Nsd2
  • Paxip1
  • Pias4
  • Poll
  • Polm
  • Prkdc
  • Rad50
  • Rap80
  • Rif1
  • Rnf168
  • Rnf8
  • Snm1l
  • Tdp1
  • Tdp2
  • Th2b
  • Tip60
  • Tip60b
  • Tp53bp1
  • Ttrap
  • Ube2v2
  • Uev2
  • Uimc1
  • Whsc1
  • Xlf
  • Xrcc4
  • Xrcc5
  • Xrcc6
Rattus norvegicus (Norway rat)
Noncanonical activation of NOTCH3
  • Aph1a
  • Ncstn
  • Notch3
  • Ps2
  • Psen1
  • Psen2
  • Psenen
  • Psnl1
  • Psnl2
  • Yb1
  • Ybx1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Non-integrin membrane-ECM interactions
  • Ddr1
  • Ddr2
  • Eddr1
  • Ptk3
Rattus norvegicus (Norway rat)
NoRC negatively regulates rRNA expression
  • ENSRNOG00000062927
  • ENSRNOG00000064540
  • ENSRNOG00000066901
  • ENSRNOG00000068034
  • H2ab3
  • H2ac10
  • H2ac18
  • H2ac4
  • H2afb3
  • H2afx
  • H2aj
  • H2ax
  • H2az2
  • H2bc1
  • H2bc12l1
  • H2bc6
  • H2bcl1
  • H2bcl2
  • H2bu1
  • H3-3b
  • H3.3b
  • H3c13
  • H3f3b
  • H4c16
  • H4c2
  • H4f16
  • H4ft
  • Hist1h2ba
  • Hist1h2bc
  • Hist1h2bg
  • Hist1h2bo
  • Hist1h2bq
  • Hist1h4b
  • Hist1h4m
  • Hist2h2aa3
  • Hist2h3c2
  • Hist4
  • Hist4h4
  • LOC100365043
  • LOC100910200
  • LOC120097726
  • LOC684797
  • Mbd2
  • Th2b
Rattus norvegicus (Norway rat)
Nitric oxide stimulates guanylate cyclase
  • Bnos
  • Nos1
  • Nos2
  • Nos3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Nicotinate metabolism
  • Bst1
  • Cd38
  • Mnadk
  • Nadk
  • Nadk2
  • Nadkd1
  • Nadsyn1
  • Nmnat1
  • Nmnat2
  • Nmnat3
  • Nmrk1
  • Nrk1
  • Nt5
  • Nt5e
  • Nte
  • Qns1
  • Qprt
Rattus norvegicus (Norway rat)
Nicotinamide salvaging
  • Aibp
  • Apoa1bp
  • Artd15
  • Carkd
  • Cox-2
  • Cox2
  • Cyp8
  • Cyp8b1
  • LOC120094289
  • Nampt
  • Naprt
  • Naprt1
  • Naxd
  • Naxe
  • Nnmt
  • Nudt12
  • Parp10
  • Parp14
  • Parp16
  • Parp6
  • Parp8
  • Parp9
  • Pbef1
  • Ptgis
  • Ptgs2
  • Rnls
  • Slc22a13
  • Slc5a8
Rattus norvegicus (Norway rat)
Neutrophil degranulation
  • 1700031A10Rik
  • 25dx
  • 2781a1
  • 2788a1a2
  • 2795a1
  • 2800a1a2
  • 2812a1a2
  • 2824a1
  • 2829a1a2
  • 2846a1a2
  • 2860a1
  • 2865a2
  • 2869a1a2
  • 2879a1
  • 2886a1-a1a2
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Last updated: August 19, 2024