GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 26 - 50 of 1070 in total
Pathway Name ▼ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Voltage gated Potassium channels
  • Ckbeta2
  • Ckbeta3
  • Eag
  • Eag2
  • Elk1
  • Elk2
  • Elk3
  • Erg
  • Erg2
  • Erg3
  • Kcna1
  • Kcna10
  • Kcna2
  • Kcna3
  • Kcna4
  • Kcna5
  • Kcna6
  • Kcna7
  • Kcna9
  • Kcnab1
  • Kcnab2
  • Kcnab3
  • Kcnb1
  • Kcnb2
  • Kcnb3
  • Kcnc1
  • Kcnc2
  • Kcnc3
  • Kcnc4
  • Kcnd1
  • Kcnd2
  • Kcnd3
  • Kcnf1
  • Kcng1
  • Kcng2
  • Kcng3
  • Kcng4
  • Kcnh1
  • Kcnh2
  • Kcnh3
  • Kcnh4
  • Kcnh5
  • Kcnh6
  • Kcnh7
  • Kcnh8
  • Kcnq1
  • Kcnq5
  • Kcns1
  • Kcns2
  • Kcns3
  • Kcnv1
  • Kcnv2
  • Kvb1
  • Kvlqt1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Vitamin D (calciferol) metabolism
  • Arh
  • Cubn
  • Cyp24
  • Cyp24a1
  • Cyp27b
  • Cyp27b1
  • Cyp2r1
  • Dbp
  • Gc
  • Ifcr
  • Ldlrap1
  • Lgmn
  • Lrp2
  • Nr1i1
  • Pias4
  • Prsc1
  • Smt3a
  • Smt3h2
  • Sumo2
  • Ubce9
  • Ube2i
  • Vdr
Rattus norvegicus (Norway rat)
Vitamin C (ascorbate) metabolism
  • Cyb5
  • Cyb5a
  • Cyb5r3
  • Dia1
  • Glut1
  • Glut3
  • Gsto1
  • Gsto2
  • Slc23a1
  • Slc23a2
  • Slc2a1
  • Slc2a3
  • Svct1
  • Svct2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Vitamin B5 (pantothenate) metabolism
  • Aasdhppt
  • Fang1
  • Fasn
  • Gda
  • Pank4
  • Pdzd11
  • Slc25a16
  • Slc25a42
  • Slc5a6
  • Smvt
  • Vnn1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Vitamin B2 (riboflavin) metabolism
  • AABR07053065.1
  • Acp5
  • Enpp1
  • Flad1
  • Gpr172a
  • Gpr172b
  • Npps
  • Pc1
  • Pdnp1
  • Rfk
  • Rft1
  • Rft2
  • Slc52a2
  • Slc52a3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Vasopressin-like receptors
  • Avp
  • Avpr1a
  • Avpr2
  • Ot
  • Otr
  • Oxt
  • Oxtr
Rattus norvegicus (Norway rat)
Vasopressin regulates renal water homeostasis via Aquaporins
  • Aqp1
  • Aqp2
  • Aqp3
  • Aqp4
  • Avp
  • Avpr2
  • Chip28
  • Gnas
  • Gnas1
  • Gnb1
  • Gnb2
  • Gnb3
  • Gnb4
  • Gnb5
  • Gng10-ps1
  • Gng11
  • Gng12
  • Gng3
  • Gng4
  • Gng5
  • Gng5-ps4
  • Gng7
  • Gng8
  • Gng9
  • Gngt1
  • Gngt11
  • Gngt5
  • Gngt7
  • Gngt9
  • Myo5b
  • Pkacb
  • Prkaca
  • Prkacb
  • Prkar1a
  • Prkar1b
  • Prkar2a
  • Prkar2b
  • Rab11
  • Rab11a
  • Rab11fip2
Rattus norvegicus (Norway rat)
VLDLR internalisation and degradation
  • Adtab
  • Ap17
  • Ap2a1
  • Ap2a2
  • Ap2b1
  • Ap2m1
  • Ap2s1
  • Clapb1
  • Claps2
  • Clta
  • Cltc
  • LOC100360645
  • Lxra
  • Lxrb
  • Mylip
  • Narc1
  • Nr1h2
  • Nr1h3
  • Pcsk9
  • Rps27a
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Vldlr
Rattus norvegicus (Norway rat)
VLDL clearance
  • Apob
  • Apobr
  • Apoc1
  • Apoc4
  • Ecl
  • Vldlr
Rattus norvegicus (Norway rat)
VLDL assembly
  • Apob
  • Apoc1
  • Apoc4
  • Ecl
  • Mtp
  • Mttp
  • P4hb
  • Pdia1
Rattus norvegicus (Norway rat)
VEGFR2 mediated vascular permeability
  • Akt1
  • Akt2
  • Akt3
  • CaMIII
  • Calm3
  • Cam3
  • Camc
  • Catnb
  • Cav
  • Cav1
  • Cdh5
  • Ctnnb1
  • Ctnnd1
  • Frap1
  • Gbl
  • Hsp86
  • Hsp90aa1
  • Hspca
  • Jup
  • Lst8
  • Mapkap1
  • Mip1
  • Mlst8
  • Mtor
  • Nipk
  • Nos3
  • Pak1
  • Pak2
  • Pak3
  • Pdk1
  • Pdpk1
  • Pg
  • Protor1
  • Prr5
  • Rac
  • Rac1
  • Raft1
  • Rictor
  • Sin1
  • Them4
  • Trib3
  • Vav
  • Vav1
  • Vav2
  • Vav3
Rattus norvegicus (Norway rat)
VEGFR2 mediated cell proliferation
  • Flk1
  • Hras
  • Hras1
  • Kdr
  • Kras
  • Kras2
  • Nras
  • Pdk1
  • Pdpk1
  • Pkca
  • Pkcb
  • Pkcd
  • Pkcz
  • Plcg1
  • Prkca
  • Prkcb
  • Prkcb1
  • Prkcd
  • Prkcz
  • Rasa
  • Rasa1
  • Sphk1
  • Src
  • Vegf
  • Vegfa
Rattus norvegicus (Norway rat)
VEGFA-VEGFR2 Pathway
  • Abi1
  • Abi2
  • Arha
  • Arha2
  • Axl
  • Baiap2
  • Bcar1
  • Brk1
  • Cas
  • Cdc42
  • Crk
  • Crkas
  • Crko
  • Csbp1
  • Csbp2
  • Cyba
  • Cybb
  • Cyfip1
  • Cyfip2
  • Elmo1
  • Elmo2
  • Fak
  • Fak1
  • Fak2
  • Flk1
  • Fyn
  • Hem2
  • Hsp27
  • Hsp86
  • Hsp90aa1
  • Hspb1
  • Hspca
  • Itgav
  • Itgb3
  • Kdr
  • Mapk11
  • Mapk12
  • Mapk13
  • Mapk14
  • Mapkapk2
  • Mapkapk3
  • Nap1
  • Ncf1
  • Ncf2
  • Ncf4
  • Nck1
  • Nck2
  • Nckap1
  • Nckap1l
  • Pak2
  • Pik3ca
  • Pik3cb
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Pkacb
  • Prkaca
  • Prkacb
  • Ptk2
  • Ptk2b
  • Pxn
  • Pyk2
  • Rac
  • Rac1
  • Rhoa
  • Rock1
  • Rock2
  • Sapk3
  • Sck
  • Sh2d2a
  • Shb
  • Shc2
  • Src
  • Vav
  • Vav1
  • Vav2
  • Vav3
  • Vegf
  • Vegfa
  • Wasf1
  • Wasf2
  • Wasf3
  • Wave1
Rattus norvegicus (Norway rat)
VEGF ligand-receptor interactions
  • Figf
  • Pgf
  • Plgf
  • Vegf
  • Vegfa
  • Vegfb
  • Vegfc
  • Vegfd
  • Vrf
Rattus norvegicus (Norway rat)
VEGF binds to VEGFR leading to receptor dimerization
  • Figf
  • Flk1
  • Flt-1
  • Flt-4
  • Flt1
  • Flt4
  • Kdr
  • Pgf
  • Plgf
  • Vegf
  • Vegfa
  • Vegfb
  • Vegfc
  • Vegfd
  • Vegfr1
  • Vegfr3
  • Vrf
Rattus norvegicus (Norway rat)
Urea cycle
  • Arg1
  • Arg2
  • Asl
  • Cps1
  • Nags
  • Otc
  • Slc25a15
  • Slc25a2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Uptake of dietary cobalamins into enterocytes
  • Amn
  • Cblif
  • Cubn
  • Gif
  • Ifcr
Rattus norvegicus (Norway rat)
Unblocking of NMDA receptors, glutamate binding and activation
  • Actn2
  • CaMIII
  • Calm3
  • Cam3
  • Camc
  • Camk2a
  • Camk2b
  • Camk2d
  • Camk2g
  • Dlg1
  • Dlg2
  • Dlg3
  • Dlg4
  • Dlgh1
  • Dlgh2
  • Dlgh3
  • Dlgh4
  • GluA1
  • GluA2
  • GluA3
  • GluN2D
  • Glur1
  • Glur2
  • Glur3
  • Glur4
  • Gria1
  • Gria2
  • Gria3
  • Gria4
  • Grin1
  • Grin2a
  • Grin2b
  • Grin2c
  • Grin2d
  • Lap1
  • Lrrc7
  • Nefl
  • Nf68
  • Nfl
  • Nmdar1
  • Psd95
Rattus norvegicus (Norway rat)
Ubiquitin-dependent degradation of Cyclin D
  • Ccnd1
  • Cdk4
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mecl1
  • Mss1
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Ring12
  • Rps27a
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Ubiquitin Mediated Degradation of Phosphorylated Cdc25A
  • Cdc25a
  • Chek1
  • Chk1
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mecl1
  • Mss1
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Ring12
  • Rps27a
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Ubiquinol biosynthesis
  • Adck3
  • Adck4
  • Cabc1
  • Coq2
  • Coq3
  • Coq4
  • Coq5
  • Coq6
  • Coq7
  • Coq8a
  • Coq8b
  • Coq9
  • Dlp1
  • LOC100364990
  • Pdss1
  • Pdss2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Ub-specific processing proteases
  • Abcc7
  • Ada3
  • Adrb2
  • Adrb2r
  • Adrm1
  • Ar
  • Arrb1
  • Arrb2
  • Atxn7
  • Axin
  • Axin1
  • Axin2
  • Becn1
  • Birc2
  • Birc3
  • Ccna1
  • Ccna2
  • Ccp110
  • Cdc20
  • Cdc25a
  • Cftr
  • Clspn
  • Cyld
  • Cyld1
  • Ddb2
  • Dn7
  • ENSRNOG00000062927
  • ENSRNOG00000064803
  • ENSRNOG00000067432
  • Fkbp8
  • Foxo4
  • Gp110
  • H2ac10
  • H2ac18
  • H2ac25
  • H2ac4
  • H2aj
  • Hausp
  • Hgs
  • Hif1a
  • Hist2h2aa3
  • Hist3h2a
  • Hrs
  • Hrs2
  • Ide
  • Ifih1
  • Ikba
  • Ikbkg
  • Il33
  • Inrf2
  • Kat2a
  • Keap1
  • Kpc1
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • LOC100910107
  • LOC120097726
  • LOC120097921
  • LOC120098474
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mad1
  • Madh1
  • Madh2
  • Madh3
  • Madh7
  • Map3k7
  • Mat2b
  • Mdm2
  • Mdm4
  • Mdmx
  • Mecl1
  • Mss1
  • Mul1
  • Myc
  • Nemo
  • Nfkbia
  • Nr3c4
  • Otub1
  • P53
  • Polb
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Pten
  • Ptrh2
  • Rce1
  • Rig1
  • Ring12
  • Ripk1
  • Rnf123
  • Rnf128
  • Rnf146
  • Rps27a
  • Ruvbl1
  • Siah2
  • Skp2
  • Smad1
  • Smad2
  • Smad3
  • Smad7
  • Smurf2
  • Snx3
  • Stam2
  • Suds3
  • Sug1
  • Tab1
  • Tada2b
  • Tada3
  • Tada3l
  • Taf9b
  • Taf9l
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Tgfbr1
  • Tip49
  • Tip49a
  • Tnks
  • Tnks2
  • Tomm20
  • Tomm70
  • Tomm70a
  • Tp53
  • Traf2
  • Traf6
  • Trrap
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Ubp41
  • Ubp69
  • Ufd1
  • Ufd1l
  • Usp10
  • Usp11
  • Usp12
  • Usp13
  • Usp14
  • Usp15
  • Usp16
  • Usp17l
  • Usp17l8
  • Usp17la
  • Usp17la2
  • Usp17lh
  • Usp17li
  • Usp18
  • Usp19
  • Usp2
  • Usp20
  • Usp21
  • Usp22
  • Usp24
  • Usp25
  • Usp26
  • Usp28
  • Usp29
  • Usp3
  • Usp30
  • Usp33
  • Usp34
  • Usp37
  • Usp4
  • Usp42
  • Usp44
  • Usp47
  • Usp48
  • Usp5
  • Usp7
  • Usp8
  • Vdac1
  • Vdac2
  • Vdac3
  • Wdr20
  • Wdr48
  • ubp109
  • usp12
Rattus norvegicus (Norway rat)
UCH proteinases
  • Actb
  • Actl6a
  • Actr5
  • Actr8
  • Adrm1
  • Amida
  • Asxl1
  • Asxl2
  • Bap1
  • Bard1
  • Ccdc95
  • ENSRNOG00000062927
  • Foxk1
  • Foxk2
  • Gp110
  • H2ac10
  • H2ac18
  • H2ac25
  • H2ac4
  • H2aj
  • Hcfc1
  • Hist2h2aa3
  • Hist3h2a
  • Ino80
  • Ino80b
  • Ino80c
  • Ino80d
  • Ino80e
  • Kdm1b
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • LOC120097726
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mbd5
  • Mbd6
  • Mcrs1
  • Mecl1
  • Mss1
  • Nedd8
  • Nfrkb
  • Ogt
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Ring12
  • Rps27a
  • Ruvbl1
  • Senp8
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Tfpt
  • Tip49
  • Tip49a
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Uchl1
  • Uchl3
  • Uchl5
  • Yy1
  • yy1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Type II Na+/Pi cotransporters
  • Slc17a2
  • Slc34a1
  • Slc34a2
  • Slc34a3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Type I hemidesmosome assembly
  • Cd151
  • Col17a1
  • Dst
  • Egfl3
  • Itga6
  • Itgb4
  • Megf6
  • Peta3
  • Plec
  • Plec1
Rattus norvegicus (Norway rat)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Last updated: August 19, 2024