GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 501 - 525 of 1070 in total
Pathway Name ▲ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Ligand-receptor interactions
  • Cdo
  • Cdon
  • Dhh
  • Hhip
  • Ihh
  • Ptch
  • Ptch1
  • Shh
  • Vhh-1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Linoleic acid (LA) metabolism
  • Abcd1
  • Acs1
  • Acsl1
  • Acsl2
  • ELOVL1
  • ELOVL3
  • Elovl1
  • Elovl2
  • Elovl3
  • Elovl5
  • Facl2
  • Fads1
  • Fads2
  • Fadsd6
  • Ssc2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Localization of the PINCH-ILK-PARVIN complex to focal adhesions
  • Actp
  • ILK1
  • ILK2
  • Ilk
  • Itgb1
  • Parva
  • Pxn
Rattus norvegicus (Norway rat)
Loss of Nlp from mitotic centrosomes
  • AABR07000222.1
  • Actr1a
  • Akap9
  • Alms1
  • Azi1
  • Ccdc5
  • Ccp110
  • Cdc2
  • Cdc2a
  • Cdk1
  • Cdk5rap2
  • Cdkn1
  • Cenpj
  • Cep131
  • Cep135
  • Cep152
  • Cep164
  • Cep192
  • Cep250
  • Cep290
  • Cep41
  • Cep43
  • Cep57
  • Cep63
  • Cep70
  • Cep72
  • Cep76
  • Cep78
  • Cetn2
  • Ck1e-2
  • Ckap5
  • Clasp1
  • Csnk1d
  • Csnk1e
  • Ctrn1
  • Dctn1
  • Dctn2
  • Dctn3l1
  • Dhc1
  • Dnch1
  • Dnchc1
  • Dnci2
  • Dncic2
  • Dncl1
  • Dnclc1
  • Dnec1
  • Dyhc
  • Dync1h1
  • Dync1i2
  • Dynll1
  • Fgfr1op
  • Haus1
  • Haus4
  • Haus5
  • Haus6
  • Haus7
  • Haus8
  • Hckid
  • Hice1
  • Hsp86
  • Hsp90aa1
  • Hspca
  • LOC309692
  • Lis-1
  • Lis1
  • Map1c
  • Mapre1
  • Nde1
  • Nedd1
  • Nek2l1
  • Ninl
  • Nude
  • Nude1
  • Ny-sar-48
  • Odf2
  • Odf84
  • Ofd1
  • Pafah1b1
  • Pafaha
  • Pcm1
  • Pcnt
  • Pin
  • Plk
  • Plk1
  • Plk4
  • Ppp2r1a
  • Prkaca
  • Prkar2b
  • Sak
  • Sdccag8
  • Sfi1
  • Ssna1
  • Tsga14
  • Tuba1
  • Tuba1a
  • Tuba4
  • Tuba4a
  • Tubb2c
  • Tubb4b
  • Tubb5
  • Tubg
  • Tubg1
  • Ywhae
  • Ywhag
Rattus norvegicus (Norway rat)
Loss of proteins required for interphase microtubule organization from the centrosome
  • AABR07000222.1
  • Actr1a
  • Akap9
  • Alms1
  • Azi1
  • Ccdc5
  • Ccp110
  • Cdc2
  • Cdc2a
  • Cdk1
  • Cdk5rap2
  • Cdkn1
  • Cenpj
  • Cep131
  • Cep135
  • Cep152
  • Cep164
  • Cep192
  • Cep250
  • Cep290
  • Cep41
  • Cep43
  • Cep57
  • Cep63
  • Cep70
  • Cep72
  • Cep76
  • Cep78
  • Cetn2
  • Ck1e-2
  • Ckap5
  • Clasp1
  • Csnk1d
  • Csnk1e
  • Ctrn1
  • Dctn1
  • Dctn2
  • Dctn3l1
  • Dhc1
  • Dnch1
  • Dnchc1
  • Dnci2
  • Dncic2
  • Dncl1
  • Dnclc1
  • Dnec1
  • Dyhc
  • Dync1h1
  • Dync1i2
  • Dynll1
  • Fgfr1op
  • Haus1
  • Haus4
  • Haus5
  • Haus6
  • Haus7
  • Haus8
  • Hckid
  • Hice1
  • Hsp86
  • Hsp90aa1
  • Hspca
  • LOC309692
  • Lis-1
  • Lis1
  • Map1c
  • Mapre1
  • Nde1
  • Nedd1
  • Nek2l1
  • Ninl
  • Nude
  • Nude1
  • Ny-sar-48
  • Odf2
  • Odf84
  • Ofd1
  • Pafah1b1
  • Pafaha
  • Pcm1
  • Pcnt
  • Pin
  • Plk
  • Plk1
  • Plk4
  • Ppp2r1a
  • Prkaca
  • Prkar2b
  • Sak
  • Sdccag8
  • Sfi1
  • Ssna1
  • Tsga14
  • Tuba1
  • Tuba1a
  • Tuba4
  • Tuba4a
  • Tubb2c
  • Tubb4b
  • Tubb5
  • Tubg
  • Tubg1
  • Ywhae
  • Ywhag
Rattus norvegicus (Norway rat)
Lysine catabolism
  • Aadat
  • Aass
  • Ald7a1
  • Aldh7a1
  • Crym
  • Dhtkd1
  • Dld
  • Dlst
  • Gcdh
  • Hykk
  • Kat2
  • LOC103690164
  • Odc
  • Phykpl
  • Pipox
  • Slc25a21
Rattus norvegicus (Norway rat)
Lysosomal oligosaccharide catabolism
  • Man2b1
  • Man2b2
  • Man2c1
  • Manba
  • Mrfap1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Lysosome Vesicle Biogenesis
  • A4
  • AD1
  • Adtb1
  • Ap1b1
  • Ap1g1
  • Ap1g2
  • Ap1m1
  • Ap1m2
  • Ap1s1
  • Ap1s2
  • Ap1s3
  • Ap4b1
  • Ap4e1
  • Ap4m1
  • Ap4s1
  • App
  • Arf1
  • Arrb1
  • Bloc1s1
  • Chmp2a
  • Clta
  • Cltb
  • Cltc
  • Clvs1
  • Clvs2
  • Ctsy
  • Ctsz
  • Dnajc6
  • Dnase2
  • Dnase2a
  • Dnl2
  • Dnm2
  • Dyn2
  • Gns
  • Hgs
  • Hrs
  • Hrs2
  • Hsc70
  • Hsc73
  • Hspa8
  • M6pr
  • Rlbp1l1
  • Rlbp1l2
  • Sh3d2a
  • Sh3gl2
  • Sh3p4
  • Syb2
  • Sybl1
  • Txndc5
  • Vamp2
  • Vamp7
  • Vamp8
Rattus norvegicus (Norway rat)
Lysosphingolipid and LPA receptors
  • Edg1
  • Edg2
  • Edg5
  • Edg7
  • Edg8
  • Gpcr91
  • Lpa1
  • Lpa3
  • Lpar1
  • Lpar2
  • Lpar3
  • Lpar5
  • Lppr1
  • Lppr2
  • Lppr3
  • Lppr4
  • Nrg1
  • Php1
  • Plppr1
  • Plppr2
  • Plppr3
  • Plppr4
  • Plppr5
  • Prg1
  • Prg2
  • Prg3
  • Prg4
  • S1pr1
  • S1pr2
  • S1pr3
  • S1pr4
  • S1pr5
Rattus norvegicus (Norway rat)
MAP2K and MAPK activation
  • A-raf
  • Apbb1ip
  • Araf
  • Araf1
  • Arrb1
  • Arrb2
  • Braf
  • Cnksr1
  • Cnksr2
  • Csk
  • ENSRNOG00000066475
  • Erk1
  • Erk2
  • Fga
  • Fgb
  • Fgg
  • Fn1
  • Hras
  • Hras1
  • Il17rd
  • Iqgap1
  • Itga2b
  • Itgb3
  • Kras
  • Kras2
  • Krev1
  • Ksr1
  • Ksr2
  • Lamtor3
  • Map2k1
  • Map2k1ip1
  • Map2k2
  • Mapk
  • Mapk1
  • Mapk3
  • Mark3
  • Mek1
  • Mek2
  • Mkk2
  • Morg1
  • Nras
  • Pbp
  • Pebp
  • Pebp1
  • Prkm1
  • Prkm3
  • Prkmk1
  • Prkmk2
  • RGD1562674
  • Raf
  • Raf1
  • Rap1a
  • Rap1b
  • Src
  • Tln1
  • Vcl
  • Wdr83
  • Ywhab
Rattus norvegicus (Norway rat)
MAPK1 (ERK2) activation
  • Erk2
  • Il-6
  • Il6
  • Il6r
  • Il6ra
  • Il6st
  • Jak1
  • Jak2
  • Map2k2
  • Mapk
  • Mapk1
  • Mek2
  • Mkk2
  • Prkm1
  • Prkmk2
  • Ptpn11
  • Tyk2
Rattus norvegicus (Norway rat)
MAPK3 (ERK1) activation
  • Cdc2
  • Cdc2a
  • Cdk1
  • Cdkn1
  • Erk1
  • Il-6
  • Il6
  • Il6r
  • Il6ra
  • Il6st
  • Jak1
  • Jak2
  • Map2k1
  • Mapk3
  • Mek1
  • Prkm3
  • Prkmk1
  • Ptpn11
  • Tyk2
Rattus norvegicus (Norway rat)
MAPK6/MAPK4 signaling
  • Aib1
  • Borg1
  • Ccnd3
  • Cdc10
  • Cdc14a
  • Cdc14b
  • Cdc2
  • Cdc2a
  • Cdc42
  • Cdc42ep2
  • Cdk1
  • Cdkn1
  • Cep2
  • Crm1
  • Dnajb1
  • Duo
  • Erk3
  • Etv4
  • Foxo1
  • Foxo1a
  • Foxo3
  • Hapip
  • Hsp27
  • Hspb1
  • Kalrn
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mapk4
  • Mapk6
  • Mapkapk5
  • Mecl1
  • Mss1
  • Ncoa3
  • Pak1
  • Pak2
  • Pak3
  • Pkacb
  • Prkaca
  • Prkacb
  • Prkm4
  • Prkm6
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Rac
  • Rac1
  • Ring12
  • Rps27a
  • Sept7
  • Septin7
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Xpo1
Rattus norvegicus (Norway rat)
MDK and PTN in ALK signaling
  • Alk
  • Mdk
  • Ptn
  • Ptprz
  • Ptprz1
  • Ptpz
Rattus norvegicus (Norway rat)
MET Receptor Activation
  • Hgf
  • Hgfac
  • Hpn
  • Met
  • Spint1
  • Spint2
Rattus norvegicus (Norway rat)
MET activates PI3K/AKT signaling
  • Ash
  • Gab1
  • Grb2
  • Hgf
  • Met
  • Pik3ca
  • Pik3r1
Rattus norvegicus (Norway rat)
MET activates PTK2 signaling
  • Egfl3
  • Fak
  • Fak1
  • Hgf
  • ITGA3B
  • Itga2
  • Itga3
  • Itgb1
  • Lama4
  • Megf6
  • Met
  • Ptk2
  • Src
Rattus norvegicus (Norway rat)
MET activates PTPN11
  • Ash
  • Gab1
  • Grb2
  • Hgf
  • Met
  • Ptpn11
Rattus norvegicus (Norway rat)
MET activates RAP1 and RAC1
  • Ash
  • Crk
  • Crkl
  • Crko
  • Dock7
  • Gab1
  • Grb2
  • Hgf
  • Krev1
  • Met
  • Rac
  • Rac1
  • Rap1a
  • Rap1b
  • Rapgef1
Rattus norvegicus (Norway rat)
MET activates RAS signaling
  • Ash
  • Grb2
  • Hgf
  • Hras
  • Hras1
  • Kras
  • Kras2
  • Met
  • Muc20
  • Nras
  • Ranbp10
  • Ranbp9
  • Shc1
  • Sos1
Rattus norvegicus (Norway rat)
MET activates STAT3
  • Hgf
  • Met
  • Stat3
Rattus norvegicus (Norway rat)
MET interacts with TNS proteins
  • Hgf
  • Itgb1
  • Met
  • Tns3
  • Tns4
Rattus norvegicus (Norway rat)
MET receptor recycling
  • Arf6
  • Ash
  • Crk
  • Crkl
  • Crko
  • Gab1
  • Gga3
  • Grb2
  • Hgf
  • Met
  • Rab4
  • Rab4a
  • Rab4b
Rattus norvegicus (Norway rat)
MHC class II antigen presentation
  • AABR07000222.1
  • AABR07044416.1
  • Actr10
  • Actr1a
  • Actr1b
  • Adtab
  • Adtb1
  • Ap17
  • Ap1b1
  • Ap1g1
  • Ap1m1
  • Ap1m2
  • Ap1s1
  • Ap1s2
  • Ap1s3
  • Ap2a1
  • Ap2a2
  • Ap2b1
  • Ap2m1
  • Ap2s1
  • Arf1
  • Arrb2-ps
  • Canx
  • Capza1
  • Capza2
  • Capza3
  • Capzb
  • Cd74
  • Cenpe
  • Clapb1
  • Claps2
  • Clta
  • Cltc
  • Ctrn1
  • Cts7l2
  • Ctsa
  • Ctsb
  • Ctsc
  • Ctsd
  • Ctse
  • Ctsf
  • Ctsh
  • Ctsk
  • Ctsl
  • Ctsl1
  • Ctsll3
  • Ctso
  • Ctss
  • DA1
  • DOb
  • Db2
  • Dctn1
  • Dctn2
  • Dctn3l1
  • Dctn4
  • Dctn5
  • Dctn6
  • Dhc1
  • Dlc2
  • Dnch1
  • Dnchc1
  • Dnci1
  • Dnci2
  • Dncic1
  • Dncic2
  • Dncl1
  • Dnclc1
  • Dncli1
  • Dncli2
  • Dnec1
  • Dnm
  • Dnm1
  • Dnm2
  • Dnm3
  • Dyhc
  • Dyn2
  • Dyn3
  • Dync1h1
  • Dync1i1
  • Dync1i2
  • Dync1li1
  • Dync1li2
  • Dynll1
  • Dynll2
  • H2-Ea
  • Hla-dma
  • Hla-dmb
  • Ifi30
  • Khc
  • Kif11
  • Kif15
  • Kif18a
  • Kif2
  • Kif22
  • Kif23
  • Kif26a
  • Kif2a
  • Kif2b
  • Kif2c
  • Kif3a
  • Kif3b
  • Kif3c
  • Kif4a
  • Kif4b
  • Kif5a
  • Kif5b
  • Kifap3
  • Klc
  • Klc1
  • Klc2
  • Klc3
  • Klc4
  • Klp2
  • Kns2
  • Knsl8
  • Krp2
  • LOC100911800
  • Lag3
  • Lgmn
  • Map1c
  • Orp1
  • Osbpl1a
  • Pin
  • Prsc1
  • Psmb9
  • RGD1308751
  • RT1-Ba
  • RT1-Bb
  • RT1-DMa
  • RT1-DMb
  • RT1-DOb
  • RT1-Da
  • RT1-Db1
  • RT1-Db2
  • RT1-Ha
  • RT1-Hb-ps1
  • Rab7
  • Rab7a
  • Racgap1
  • Rilp
  • Sar1b
  • Sec13
  • Sec13l1
  • Sec23a
  • Sec24a
  • Sec24b
  • Sec24c
  • Sec24d
  • Sec31a
  • Sec31l1
  • Sh3d2a
  • Sh3gl2
  • Sh3p4
  • Spnb3
  • Sptbn2
  • Tap1
  • Tap2
  • Tesb
  • Vap1
Rattus norvegicus (Norway rat)
MTOR signalling
  • Akt1
  • Akt1s1
  • ENSRNOG00000066475
  • Frap1
  • Gbl
  • Lamtor1
  • Lamtor3
  • Lamtor4
  • Lamtor5
  • Lst8
  • Map2k1ip1
  • Mlst8
  • Mtor
  • Raft1
  • Rheb
  • Rptor
  • RragB
  • Rraga
  • Rragc
  • Rragc_predicted
  • Rragd
  • Slc38a9
  • Ywhab
Rattus norvegicus (Norway rat)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024