GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1001 - 1025 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▼
GTP hydrolysis and joining of the 60S ribosomal subunit
  • AABR07029195.1
  • AABR07031505.1
  • AABR07060610.1
  • AABR07064810.1
  • AABR07071986.1
  • AABR07072260.1
  • Arbp
  • ENSRNOG00000068086
  • Eif5b
  • Fau
  • Fte-1
  • Fte1
  • If2
  • LOC100360645
  • LOC100361060
  • LOC100361854
  • LOC100361933
  • LOC100910714
  • LOC102550668
  • LOC103692829
  • LOC108351255
  • LOC120093247
  • LOC120094652
  • LOC120097744
  • LOC120099964
  • LOC120103572
  • Lamr1
  • RGD1562402
  • RGD1563956
  • RGD1564606
  • Rig
  • Rp2
  • Rpl1
  • Rpl10
  • Rpl10a
  • Rpl10l
  • Rpl10l1
  • Rpl11
  • Rpl12
  • Rpl12-ps2
  • Rpl12l2
  • Rpl13
  • Rpl13a
  • Rpl14
  • Rpl15
  • Rpl17
  • Rpl18
  • Rpl18a
  • Rpl19
  • Rpl21
  • Rpl21-ps26
  • Rpl21l2
  • Rpl21l3
  • Rpl21l5
  • Rpl22
  • Rpl23
  • Rpl23al1
  • Rpl24
  • Rpl26
  • Rpl27
  • Rpl27a
  • Rpl27al3
  • Rpl28
  • Rpl29
  • Rpl3
  • Rpl30
  • Rpl31
  • Rpl32
  • Rpl34
  • Rpl34-ps1
  • Rpl34l1
  • Rpl34l2
  • Rpl35
  • Rpl35al8
  • Rpl36a
  • Rpl36al-ps5
  • Rpl36al1
  • Rpl36l3
  • Rpl37
  • Rpl37l4
  • Rpl38
  • Rpl39
  • Rpl39l1
  • Rpl3l
  • Rpl4
  • Rpl44
  • Rpl5
  • Rpl6
  • Rpl7
  • Rpl7a
  • Rpl8
  • Rpl9
  • Rpl9l2
  • Rplp0
  • Rplp1
  • Rplp2
  • Rps10
  • Rps11
  • Rps12l8
  • Rps13
  • Rps14
  • Rps15
  • Rps15a
  • Rps16
  • Rps17
  • Rps18
  • Rps19
  • Rps2
  • Rps20
  • Rps21
  • Rps23
  • Rps24
  • Rps25
  • Rps26
  • Rps26-ps13
  • Rps26l2
  • Rps26l4
  • Rps26l6
  • Rps27
  • Rps27a
  • Rps27l
  • Rps28
  • Rps29
  • Rps3
  • Rps3a
  • Rps4
  • Rps4x
  • Rps4y2
  • Rps5
  • Rps6
  • Rps7
  • Rps7-ps23
  • Rps8
  • Rps9
  • Rpsa
  • S27-1
  • Uba80
  • Ubbl1
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Mitochondrial protein import
  • Atp5b
  • Atp5f1b
  • Atp5g3
  • Atp5mc3
  • Coq2
  • Fxn
  • Hscb
  • Hsp60
  • Hspd1
  • Ldhd
  • Ndufb8
  • Otc
  • Pitrm1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Ligand-independent caspase activation via DCC
  • Appl1
  • Casp3
  • Casp9
  • Cpp32
  • Dcc
  • RNCASP9
Rattus norvegicus (Norway rat)
RHOH GTPase cycle
  • Arhgdia
  • Arhgdib
  • Arhgdig
  • Cav
  • Cav1
  • Csk
  • Dbt
  • Fam91a1
  • Garnl1
  • Gbas
  • Jup
  • LOC498174
  • Lamtor1
  • Lck
  • Mtr
  • Nbc
  • Nbc2
  • Nbc3
  • Nbcn1
  • Nipsnap2
  • Nsfl1c
  • Pak1
  • Pak2
  • Pak4
  • Pak5
  • Pak6
  • Pak7
  • Pg
  • RGD1310313
  • Rab7
  • Rab7a
  • Ralgapa1
  • Rhoh
  • Rock1
  • Rock2
  • Slc1a5
  • Slc4a7
  • Stom
  • Syb3
  • Tfrc
  • Tmem59
  • Trfr
  • Tuba1b
  • Tuba2
  • Tulip1
  • Uaca
  • Vamp3
  • Vangl1
  • Vcp
  • Wdr11
  • Zap70
Rattus norvegicus (Norway rat)
Keratinization
  • AABR07001416.1
  • Dsc1
  • Dsc2
  • Dsc3
  • Dsg1
  • Dsg2
  • Dsg3
  • Dsg4
  • Dsp
  • ENSRNOG00000071041
  • Jup
  • Ka10
  • Ka12
  • Ka13
  • Ka14
  • Ka15
  • Ka17
  • Ka19
  • Ka24
  • Ka31
  • Ka35
  • Ka36
  • Ka38
  • Ka40
  • Kb1
  • Kb18
  • Kb2
  • Kb20
  • Kb23
  • Kb25
  • Kb26
  • Kb35
  • Kb36
  • Kb39
  • Kb4
  • Kb7
  • Kb9
  • Krt1
  • Krt1-12
  • Krt1-14
  • Krt1-18
  • Krt1-19
  • Krt1-5
  • Krt1-9
  • Krt10
  • Krt12
  • Krt13
  • Krt14
  • Krt15
  • Krt17
  • Krt18
  • Krt19
  • Krt1b
  • Krt2
  • Krt2-5
  • Krt2-7
  • Krt2-8
  • Krt20
  • Krt21
  • Krt23
  • Krt24
  • Krt25
  • Krt25a
  • Krt26
  • Krt27
  • Krt28
  • Krt2a
  • Krt32
  • Krt33a
  • Krt35
  • Krt36
  • Krt39
  • Krt4
  • Krt40
  • Krt5
  • Krt6a
  • Krt7
  • Krt71
  • Krt72
  • Krt73
  • Krt75
  • Krt76
  • Krt77
  • Krt78
  • Krt79
  • Krt8
  • Krt80
  • Krt81
  • Krt82
  • Krt83
  • Krt84
  • Krt85
  • Krt86
  • Krt87
  • Krt9
  • Krtap1-1
  • Krtap1-3
  • Krtap1-5l1
  • Krtap10-9
  • Krtap11-1
  • Krtap13-1
  • Krtap16-5
  • Krtap2-1
  • Krtap2-4
  • Krtap2-4l
  • Krtap2-4l1
  • Krtap24-1
  • Krtap29-1
  • Krtap3-1
  • Krtap3-2
  • Krtap3-3
  • Krtap3-3l1
  • Krtap31-1
  • Krtap31-2
  • Krtap5-8
  • Krtap8-1
  • Krtap9-5l
  • LOC100359886
  • LOC100363184
  • LOC100364550
  • LOC100364862
  • LOC100365213
  • LOC100365588
  • LOC100910814
  • LOC102551003
  • LOC102551168
  • LOC102551304
  • LOC102551406
  • LOC102551497
  • LOC102552244
  • LOC102553726
  • LOC120093742
  • LOC680428
  • LOC681126
  • LOC690478
  • Pg
  • Pkp1
  • Pkp2
  • Pkp3
  • Pkp4
  • RGD1561281
Rattus norvegicus (Norway rat)
Negative regulation of FGFR2 signaling
  • Ash
  • Cbl
  • Erk1
  • Erk2
  • FGF22
  • FGF6
  • Fgf-1
  • Fgf-2
  • Fgf-5
  • Fgf-7
  • Fgf-9
  • Fgf1
  • Fgf10
  • Fgf16
  • Fgf17
  • Fgf18
  • Fgf2
  • Fgf20
  • Fgf22
  • Fgf23
  • Fgf3
  • Fgf4
  • Fgf5
  • Fgf5c
  • Fgf5d
  • Fgf6
  • Fgf7
  • Fgf7a
  • Fgf7b
  • Fgf8
  • Fgf9
  • Fgfa
  • Fgfr2
  • Frs2
  • Grb2
  • Kgf
  • LOC100360645
  • Mapk
  • Mapk1
  • Mapk3
  • Prkm1
  • Prkm3
  • Ptpn11
  • Rps27a
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
SHC1 events in ERBB4 signaling
  • Ash
  • Btc
  • Dtr
  • Ereg
  • Grb2
  • Hbegf
  • Hegfl
  • Hras
  • Hras1
  • Kras
  • Kras2
  • Ndf
  • Nras
  • Nrg1
  • Nrg2
  • Nrg3
  • Ntak
  • Shc1
  • Sos1
Rattus norvegicus (Norway rat)
ATF6 (ATF6-alpha) activates chaperones
  • Atf6
  • Mbtps1
  • S1p
  • Ski1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Scavenging of heme from plasma
  • AABR07034730.2
  • AABR07058479.1
  • AABR07060971.1
  • AABR07061001.1
  • AABR07065782.1
  • AABR07065808.1
  • AABR07065812.2
  • AABR07065813.1
  • Alb
  • Ambp
  • Apoa1
  • Apol11a
  • Apol2
  • Apol7a
  • Apol7b
  • Apol9a
  • Cd163
  • ENSRNOG00000062324
  • ENSRNOG00000062682
  • ENSRNOG00000062762
  • ENSRNOG00000062853
  • ENSRNOG00000062915
  • ENSRNOG00000062976
  • ENSRNOG00000063148
  • ENSRNOG00000063329
  • ENSRNOG00000063340
  • ENSRNOG00000063341
  • ENSRNOG00000063422
  • ENSRNOG00000063550
  • ENSRNOG00000063572
  • ENSRNOG00000063707
  • ENSRNOG00000063791
  • ENSRNOG00000064041
  • ENSRNOG00000064061
  • ENSRNOG00000064085
  • ENSRNOG00000064245
  • ENSRNOG00000064481
  • ENSRNOG00000064582
  • ENSRNOG00000065160
  • ENSRNOG00000065181
  • ENSRNOG00000065191
  • ENSRNOG00000065237
  • ENSRNOG00000065406
  • ENSRNOG00000065564
  • ENSRNOG00000065629
  • ENSRNOG00000065670
  • ENSRNOG00000065675
  • ENSRNOG00000065690
  • ENSRNOG00000065855
  • ENSRNOG00000066010
  • ENSRNOG00000066072
  • ENSRNOG00000066203
  • ENSRNOG00000066380
  • ENSRNOG00000066406
  • ENSRNOG00000066431
  • ENSRNOG00000066785
  • ENSRNOG00000066812
  • ENSRNOG00000066814
  • ENSRNOG00000066904
  • ENSRNOG00000066922
  • ENSRNOG00000066926
  • ENSRNOG00000066971
  • ENSRNOG00000067010
  • ENSRNOG00000067025
  • ENSRNOG00000067233
  • ENSRNOG00000067273
  • ENSRNOG00000067516
  • ENSRNOG00000067603
  • ENSRNOG00000067643
  • ENSRNOG00000067679
  • ENSRNOG00000067883
  • ENSRNOG00000068055
  • ENSRNOG00000068059
  • ENSRNOG00000068381
  • ENSRNOG00000068499
  • ENSRNOG00000068847
  • ENSRNOG00000069193
  • ENSRNOG00000069427
  • ENSRNOG00000069491
  • ENSRNOG00000069766
  • ENSRNOG00000069828
  • ENSRNOG00000069901
  • ENSRNOG00000069940
  • ENSRNOG00000070091
  • ENSRNOG00000070192
  • ENSRNOG00000070244
  • ENSRNOG00000070247
  • ENSRNOG00000070810
  • ENSRNOG00000070812
  • ENSRNOG00000070816
  • ENSRNOG00000070832
  • ENSRNOG00000070933
  • ENSRNOG00000071049
  • ENSRNOG00000071091
  • Hba-a1
  • Hba1
  • Hbb
  • Hp
  • Hpx
  • Igkv2-112l1
  • Igkv8-30l1
  • Igkvl-ps6
  • Igkvl10
  • Igkvl12
  • Igkvl13
  • Igkvl2
  • Iglc1
  • Igll1
  • Itil
  • Jchain
  • LOC100363522
  • LOC100365500
  • LOC100911032
  • LOC102551948
  • LOC120093819
  • LOC503164
  • LOC690813
  • Lrp1
  • RGD1309808
  • RGD1561722
  • RGD1564696
Rattus norvegicus (Norway rat)
Neurotransmitter release cycle
  • Asahl
  • Naaa
Rattus norvegicus (Norway rat)
Intra-Golgi traffic
  • Akp3
  • Alpi
  • Alpp
  • Arf1
  • Bet1l
  • Cog1
  • Cog2
  • Cog3
  • Cog4
  • Cog5
  • Cog6
  • Cog7
  • Cyth1
  • Cyth2
  • Cyth3
  • Cyth4
  • Erg1
  • Gosr1
  • Gosr2
  • Gs15
  • Gs27
  • Gs28
  • Napa
  • Napb
  • Napg
  • Nsf
  • Pscd1
  • Pscd2
  • Pscd3
  • RGD1310016
  • Rab30
  • Rab33b
  • Rab36
  • Rab39a
  • Rgp1
  • Ric1
  • Sec7a
  • Sec7b
  • Sec7c
  • Snap
  • Snap29
  • Snapa
  • Snapb
  • Stx16
  • Stx5
  • Stx5a
  • Stx6
  • Trip11
  • Vps45
  • Vps45a
  • Vti1a
  • Vti1l2
  • Ykt6
Rattus norvegicus (Norway rat)
NPAS4 regulates expression of target genes
  • Arnt
  • Arnt2
  • Arntl
  • Bmal1
  • Maged1
  • Npas4
  • Nrage
  • Nxf
  • Tic
Rattus norvegicus (Norway rat)
Aromatic amines can be N-hydroxylated or N-dealkylated by CYP1A2
  • Cyp1a-2
  • Cyp1a2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Synthesis of active ubiquitin: roles of E1 and E2 enzymes
  • AABR07041109.1
  • Cdc34
  • Fam105b
  • Hausp
  • LOC100360645
  • LOC100362554
  • LOC100366017
  • LOC64038
  • NEWGENE_1308361
  • Otulin
  • Rad6b
  • Rps27a
  • Uba1
  • Uba6
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubc4
  • Ubc7
  • Ubcep1
  • Ubch4
  • Ubch5b
  • Ubcl1
  • Ube1
  • Ube2a
  • Ube2b
  • Ube2c
  • Ube2d1
  • Ube2d2
  • Ube2e1
  • Ube2e3
  • Ube2g
  • Ube2g1
  • Ube2g2
  • Ube2h
  • Ube2k
  • Ube2l3
  • Ube2q2
  • Ube2r2
  • Ube2s
  • Ube2t
  • Ube2w
  • Ube2z
  • Uchl3
  • Usp5
  • Usp7
Rattus norvegicus (Norway rat)
Interleukin-2 signaling
  • Fak2
  • Il-2
  • Il2
  • Il2ra
  • Il2rb
  • Jak1
  • Jak3
  • Lck
  • Mgf
  • Ptk2b
  • Pyk2
  • Shc1
  • Stat5a
  • Stat5b
  • Syk
Rattus norvegicus (Norway rat)
Cyclin A:Cdk2-associated events at S phase entry
  • Akt1
  • Akt2
  • Akt3
  • Cables1
  • Cak
  • Cak1
  • Ccna1
  • Ccna2
  • Ccnh
  • Cdc25a
  • Cdc25b
  • Cdk2
  • Cdk7
  • Cdkn1a
  • Cdkn1b
  • Cdkn2
  • Fzr1
  • Mnat1
  • Mo15
  • Rb-1
  • Rb1
  • Wee1
  • p27Kip1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Interleukin-4 and Interleukin-13 signaling
  • Grp94
  • Hsp90b1
  • Hspc4
  • Il-13
  • Il-4
  • Il13
  • Il13ra1
  • Il13ra1-ps1
  • Il13ra2
  • Il4
  • Il4r
  • Il4ra
  • Jak1
  • Jak2
  • Jak3
  • LOC100360218
  • Socs1
  • Socs5
  • Stat1
  • Stat3
  • Stat4
  • Stat6
  • Tra1
  • Tyk2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Class I peroxisomal membrane protein import
  • Abcd1
  • Abcd2
  • Abcd3
  • Acbd5
  • Aldh3a2
  • Aldh4
  • Aldr
  • Aldrp
  • Atad1
  • Fis1
  • Gdap1
  • Npg6
  • Paf1
  • Paf3
  • Pex11b
  • Pex12
  • Pex14
  • Pex16
  • Pex19
  • Pex2
  • Pex3
  • Pmp22
  • Pmp24
  • Pmp35
  • Pmp70
  • Pxf
  • Pxmp1
  • Pxmp2
  • Pxmp3
  • Pxmp4
  • Ttc11
Rattus norvegicus (Norway rat)
GRB2 events in ERBB2 signaling
  • Ash
  • Btc
  • Dtr
  • Erbb2
  • Ereg
  • Grb2
  • Hbegf
  • Hegfl
  • Hras
  • Hras1
  • Kras
  • Kras2
  • Ndf
  • Neu
  • Nras
  • Nrg1
  • Nrg2
  • Nrg3
  • Ntak
  • Sos1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Interleukin-15 signaling
  • Ash
  • Grb2
  • Il15
  • Il15ra
  • Il2rb
  • Jak1
  • Jak3
  • Mgf
  • Shc1
  • Sos1
  • Sos2
  • Stat3
  • Stat5a
  • Stat5b
Rattus norvegicus (Norway rat)
TFAP2 (AP-2) family regulates transcription of growth factors and their receptors
  • Atad2
  • Cga
  • Cga1
  • Esr
  • Esr1
  • Estr
  • Lhb
  • Nr3a1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Dopamine Neurotransmitter Release Cycle
  • Apba1
  • Bzrap1
  • Cask
  • Cplx1
  • Lin7a
  • Lin7b
  • Lin7c
  • Mals1
  • Mals2
  • Mals3
  • Mint1
  • Ppfia1
  • Ppfia2
  • Ppfia3
  • Ppfia4
  • Rab3a
  • Rbp1
  • Rim1
  • Rims1
  • Sap
  • Slc18a2
  • Snap
  • Snap25
  • Stx1a
  • Stxbp1
  • Svat
  • Syb2
  • Syn1
  • Syn2
  • Syn3
  • Syt1
  • Tspoap1
  • Unc13b
  • Unc13h2
  • Unc18a
  • Vamp2
  • Veli1
  • Veli1a
  • Veli2
  • Veli3
  • Vmat2
  • X11
Rattus norvegicus (Norway rat)
Regulation of TP53 Activity through Association with Co-factors
  • Akt1
  • Akt2
  • Akt3
  • Brn-3
  • Brn3
  • Brn3a
  • Brn3b
  • Ket
  • P53
  • P63
  • Phf20
  • Pou4f1
  • Pou4f2
  • Ppp1r13b
  • Ppp1r13l
  • Tp53
  • Tp53bp2
  • Tp63
  • Tp73
  • Tp73l
  • Trp63
  • Zfp385a
Rattus norvegicus (Norway rat)
Glutathione synthesis and recycling
  • Botch
  • Chac1
  • Chac2
  • Cndp2
  • Gclc
  • Gclm
  • Ggct
  • Ggt
  • Ggt1
  • Ggt5
  • Ggt6
  • Ggt7
  • Ggtl3
  • Ggtla1
  • Glclc
  • Glclr
  • Gss
  • Npg7
  • Oplah
Rattus norvegicus (Norway rat)
Hedgehog ligand biogenesis
  • Derl2
  • Dhh
  • Erlec1
  • Hhat
  • Ihh
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • LOC100910831
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mecl1
  • Mss1
  • Os9
  • P4hb
  • Pdia1
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Ring12
  • Rps27a
  • Sel1h
  • Sel1l
  • Shh
  • Sug1
  • Syvn1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Vcp
  • Vhh-1
Rattus norvegicus (Norway rat)

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Last updated: August 19, 2024