GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1151 - 1175 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▼ Organism GlyTouCan ID
COPI-dependent Golgi-to-ER retrograde traffic
  • ARCN1
  • ARF1
  • ARF1GAP
  • ARF2
  • ARF3
  • ARF4
  • ARF5
  • ARFGAP1
  • ARFGAP2
  • ARFGAP3
  • ATSV
  • BNIP1
  • C15orf22
  • C20orf23
  • C2orf20
  • C6orf102
  • CENPE
  • COPA
  • COPB
  • COPB1
  • COPB2
  • COPD
  • COPE
  • COPG
  • COPG1
  • COPG2
  • COPZ
  • COPZ1
  • COPZ2
  • EG5
  • ERD2.1
  • ERD2.2
  • ERD23
  • GAKIN
  • GBF1
  • GP25L2
  • HSET
  • KDELR1
  • KDELR2
  • KDELR3
  • KIAA0248
  • KIAA0359
  • KIAA0449
  • KIAA0591
  • KIAA0639
  • KIAA0706
  • KIAA1236
  • KIAA1448
  • KIAA1478
  • KIAA1590
  • KIAA1708
  • KID
  • KIF11
  • KIF12
  • KIF13B
  • KIF15
  • KIF16B
  • KIF18A
  • KIF18B
  • KIF19
  • KIF1A
  • KIF1B
  • KIF1C
  • KIF2
  • KIF20A
  • KIF20B
  • KIF21A
  • KIF21B
  • KIF22
  • KIF23
  • KIF25
  • KIF26A
  • KIF26B
  • KIF27
  • KIF28P
  • KIF2A
  • KIF2B
  • KIF2C
  • KIF3
  • KIF3A
  • KIF3AP
  • KIF3B
  • KIF3C
  • KIF4
  • KIF4A
  • KIF4B
  • KIF5A
  • KIF5B
  • KIF5C
  • KIF6
  • KIF9
  • KIFAP3
  • KIFC1
  • KIFC2
  • KLC
  • KLC1
  • KLC2
  • KLC2L
  • KLC3
  • KLC4
  • KLP2
  • KLP6
  • KNS
  • KNS1
  • KNS2
  • KNSL1
  • KNSL2
  • KNSL3
  • KNSL4
  • KNSL5
  • KNSL6
  • KNSL7
  • KNSL8
  • KRMP1
  • MGCRACGAP
  • MKLP1
  • MKLP2
  • MPHOSPH1
  • NAG
  • NAPA
  • NAPB
  • NAPG
  • NBAS
  • NIP1
  • NKHC1
  • NSF
  • RAB1
  • RAB1A
  • RAB1B
  • RAB6KIFL
  • RACGAP1
  • RINT1
  • RNP24
  • SEC20L
  • SEC22B
  • SEC22L1
  • SMAP
  • SNAPA
  • SNAPB
  • SNAPG
  • SNX23
  • STX18
  • SURF-4
  • SURF4
  • TMED10
  • TMED2
  • TMED3
  • TMED7
  • TMED9
  • TMP21
  • TRIP5
  • USE1
  • USE1L
  • ZNF289
  • ZW10
Homo sapiens (human)
Thrombin signalling through proteinase activated receptors (PARs)
  • ARB2
  • ARR1
  • ARR2
  • ARRB1
  • ARRB2
  • CF2R
  • ERK1
  • ERK2
  • F2
  • F2R
  • F2RL2
  • F2RL3
  • GA11
  • GAQ
  • GNA11
  • GNA12
  • GNA13
  • GNA14
  • GNA15
  • GNA16
  • GNAQ
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT1
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNGT9
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PAR1
  • PAR3
  • PAR4
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • TR
Homo sapiens (human)
SHOC2 M1731 mutant abolishes MRAS complex function
  • ARAF
  • ARAF1
  • BRAF
  • BRAF1
  • KIAA0862
  • MRAS
  • PKS
  • PKS2
  • PPP1CB
  • PPP1CC
  • RAF
  • RAF1
  • RAFB1
  • RRAS3
  • SHOC2
  • YWHAB
Homo sapiens (human)
Gain-of-function MRAS complexes activate RAF signaling
  • ARAF
  • ARAF1
  • BRAF
  • BRAF1
  • KIAA0862
  • MRAS
  • PKS
  • PKS2
  • PPP1CB
  • PPP1CC
  • RAF
  • RAF1
  • RAFB1
  • RRAS3
  • SHOC2
  • YWHAB
Homo sapiens (human)
RAF activation
  • ARAF
  • ARAF1
  • BRAF
  • BRAF1
  • BRAP
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • CTAK1
  • EMK2
  • HRAS
  • HRAS1
  • JAK2
  • KIAA0044
  • KIAA0862
  • KIAA0968
  • KSR
  • KSR1
  • MAP2K1
  • MAP2K2
  • MAP3K11
  • MARK3
  • MEK1
  • MEK2
  • MKK2
  • MLK3
  • MRAS
  • NRAS
  • PHB
  • PHB1
  • PKS
  • PKS2
  • PPP1CB
  • PPP1CC
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • PRKMK1
  • PRKMK2
  • PTK1
  • RAF
  • RAF1
  • RAFB1
  • RNF52
  • RRAS3
  • SHOC2
  • SPRK
  • SRC
  • SRC1
  • YWHAB
Homo sapiens (human)
Negative regulation of MAPK pathway
  • ARAF
  • ARAF1
  • BRAF
  • BRAF1
  • BRAP
  • C11orf81
  • CL100
  • CTAK1
  • DUSP1
  • DUSP10
  • DUSP16
  • DUSP2
  • DUSP4
  • DUSP5
  • DUSP6
  • DUSP7
  • DUSP8
  • DUSP9
  • EMK2
  • ERK1
  • ERK2
  • ERK6
  • HRAS
  • HRAS1
  • KIAA0044
  • KIAA1700
  • KSR
  • KSR1
  • MAPK1
  • MAPK12
  • MAPK3
  • MARK3
  • MKP1
  • MKP2
  • MKP3
  • MKP4
  • MKP5
  • MKP7
  • NRAS
  • PAC1
  • PAQR3
  • PBP
  • PEBP
  • PEBP1
  • PKS
  • PKS2
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • PPP5
  • PPP5C
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PTPH1
  • PTPN10
  • PTPN3
  • PTPN7
  • PYST1
  • PYST2
  • RAF
  • RAF1
  • RAFB1
  • RNF52
  • RPS27A
  • SAPK3
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VH1
  • VH2
  • VH3
  • VH5
  • YWHAB
Homo sapiens (human)
Regulation of cholesterol biosynthesis by SREBP (SREBF)
  • ARA24
  • BHLHD2
  • INSIG1
  • INSIG2
  • KIAA0079
  • KIAA0091
  • KIAA0199
  • KIAA0755
  • KPNB1
  • MBTPS1
  • MBTPS2
  • NTF97
  • RAN
  • S1P
  • S2P
  • SAR1B
  • SARA2
  • SARB
  • SCAP
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SKI1
  • SREBF2
  • SREBP2
Homo sapiens (human)
Formation of TC-NER Pre-Incision Complex
  • AQR
  • BTF2
  • BTF2P44
  • C6orf175
  • CAK
  • CAK1
  • CAP35
  • CCDC16
  • CCNH
  • CDK7
  • CDKN7
  • CKN1
  • COPS1
  • COPS2
  • COPS3
  • COPS4
  • COPS5
  • COPS6
  • COPS7A
  • COPS7B
  • COPS8
  • CSA
  • CSB
  • CSN1
  • CSN2
  • CSN3
  • CSN4
  • CSN5
  • CSN6
  • CSN7A
  • CSN7B
  • CSN8
  • CUL4A
  • CUL4B
  • CYP33
  • DDB1
  • DERP10
  • ERCC2
  • ERCC3
  • ERCC6
  • ERCC8
  • GPS1
  • GTF2H1
  • GTF2H2
  • GTF2H3
  • GTF2H4
  • GTF2H5
  • GTF2S
  • HAUSP
  • HCNP
  • HVIP
  • ISY1
  • JAB1
  • KIAA0560
  • KIAA0695
  • KIAA1160
  • KIAA1177
  • KIAA1530
  • MAT1
  • MNAT1
  • MO15
  • NMP200
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • PPIE
  • PRP19
  • PRPF19
  • RBX1
  • RNF66
  • RNF75
  • ROC1
  • RPB7
  • RPS27A
  • SNEV
  • STK1
  • SYF1
  • TCEA1
  • TFIIS
  • TRIP15
  • TTDA
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • USP7
  • UVSSA
  • XAB2
  • XAP1
  • XPA
  • XPAC
  • XPB
  • XPBC
  • XPD
  • XPDC
  • ZNF830
Homo sapiens (human)
Gap-filling DNA repair synthesis and ligation in TC-NER
  • AQR
  • BTF2
  • BTF2P44
  • C6orf175
  • CAK
  • CAK1
  • CAP35
  • CCDC16
  • CCNH
  • CDK7
  • CDKN7
  • CHRAC17
  • CKN1
  • CSA
  • CSB
  • CUL4A
  • CUL4B
  • CYP33
  • DDB1
  • DINB1
  • DPE2
  • ERCC2
  • ERCC3
  • ERCC6
  • ERCC8
  • GTF2H1
  • GTF2H2
  • GTF2H3
  • GTF2H4
  • GTF2H5
  • GTF2S
  • HAUSP
  • HCNP
  • ISY1
  • KIAA0039
  • KIAA0560
  • KIAA0695
  • KIAA1160
  • KIAA1177
  • KIAA1530
  • LIG1
  • LIG3
  • MAT1
  • MNAT1
  • MO15
  • NMP200
  • PCNA
  • POLD
  • POLD1
  • POLD2
  • POLD3
  • POLD4
  • POLDS
  • POLE
  • POLE1
  • POLE2
  • POLE3
  • POLE4
  • POLK
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • PPIE
  • PRP19
  • PRPF19
  • RBX1
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • RFC1
  • RFC140
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • RNF66
  • RNF75
  • ROC1
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • RPB7
  • RPS27A
  • SNEV
  • STK1
  • SYF1
  • TCEA1
  • TFIIS
  • TTDA
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • USP7
  • UVSSA
  • XAB2
  • XAP1
  • XPB
  • XPBC
  • XPD
  • XPDC
  • XRCC1
  • ZNF830
Homo sapiens (human)
Dual incision in TC-NER
  • AQR
  • BTF2
  • BTF2P44
  • C6orf175
  • CAK
  • CAK1
  • CAP35
  • CCDC16
  • CCNH
  • CDK7
  • CDKN7
  • CHRAC17
  • CKN1
  • CSA
  • CSB
  • CUL4A
  • CUL4B
  • CYP33
  • DDB1
  • DINB1
  • DPE2
  • ERCC1
  • ERCC11
  • ERCC2
  • ERCC3
  • ERCC4
  • ERCC5
  • ERCC6
  • ERCC8
  • ERCM2
  • GTF2H1
  • GTF2H2
  • GTF2H3
  • GTF2H4
  • GTF2H5
  • GTF2S
  • HAUSP
  • HCNP
  • ISY1
  • KIAA0039
  • KIAA0560
  • KIAA0695
  • KIAA1160
  • KIAA1177
  • KIAA1530
  • MAT1
  • MNAT1
  • MO15
  • NMP200
  • PCNA
  • POLD
  • POLD1
  • POLD2
  • POLD3
  • POLD4
  • POLDS
  • POLE
  • POLE1
  • POLE2
  • POLE3
  • POLE4
  • POLK
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • PPIE
  • PRP19
  • PRPF19
  • RBX1
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • RFC1
  • RFC140
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • RNF66
  • RNF75
  • ROC1
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • RPB7
  • RPS27A
  • SNEV
  • STK1
  • SYF1
  • TCEA1
  • TFIIS
  • TTDA
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • USP7
  • UVSSA
  • XAB2
  • XAP1
  • XPA
  • XPAC
  • XPB
  • XPBC
  • XPD
  • XPDC
  • XPF
  • XPG
  • XPGC
  • ZNF830
Homo sapiens (human)
Transcription-Coupled Nucleotide Excision Repair (TC-NER)
  • AQR
  • BTF2
  • BTF2P44
  • C19orf17
  • C6orf175
  • CAK
  • CAK1
  • CAP35
  • CCDC16
  • CCNH
  • CDK7
  • CDKN7
  • CKN1
  • CSA
  • CSB
  • CUL4A
  • CUL4B
  • CYP33
  • DDB1
  • ELL
  • ERCC2
  • ERCC3
  • ERCC6
  • ERCC8
  • GTF2H1
  • GTF2H2
  • GTF2H3
  • GTF2H4
  • GTF2H5
  • GTF2S
  • HAUSP
  • HCNP
  • ISY1
  • KIAA0560
  • KIAA0695
  • KIAA1160
  • KIAA1177
  • KIAA1530
  • MAT1
  • MNAT1
  • MO15
  • NMP200
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • PPIE
  • PRP19
  • PRPF19
  • RBX1
  • RNF66
  • RNF75
  • ROC1
  • RPB7
  • RPS27A
  • SNEV
  • STK1
  • SYF1
  • TCEA1
  • TFIIS
  • TTDA
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • USP7
  • UVSSA
  • XAB2
  • XAP1
  • XPB
  • XPBC
  • XPD
  • XPDC
  • ZNF830
Homo sapiens (human)
Passive transport by Aquaporins
  • AQP0
  • AQP1
  • AQP10
  • AQP11
  • AQP12
  • AQP12A
  • AQP2
  • AQP2L
  • AQP3
  • AQP4
  • AQP5
  • AQP6
  • AQP7
  • AQP7L
  • AQP8
  • AQP9
  • AQPX1
  • AQPX2
  • CHIP28
  • MIP
  • SSC1
Homo sapiens (human)
Fc epsilon receptor (FCERI) signaling
  • APY
  • FCE1A
  • FCER1A
  • FCER1B
  • FCER1G
  • IGER
  • IGHE
  • IGHV
  • IGHV1-2
  • IGHV1-46
  • IGHV1-69
  • IGHV2-5
  • IGHV2-70
  • IGHV3-11
  • IGHV3-13
  • IGHV3-23
  • IGHV3-30
  • IGHV3-33
  • IGHV3-48
  • IGHV3-53
  • IGHV3-7
  • IGHV3-9
  • IGHV4-34
  • IGHV4-39
  • IGHV4-59
  • IGHV7-81
  • IGKC
  • IGKV1-12
  • IGKV1-16
  • IGKV1-17
  • IGKV1-33
  • IGKV1-39
  • IGKV1-5
  • IGKV1D-12
  • IGKV1D-16
  • IGKV1D-33
  • IGKV1D-39
  • IGKV2-28
  • IGKV2-29
  • IGKV2-30
  • IGKV2D-28
  • IGKV2D-30
  • IGKV2D-40
  • IGKV3-11
  • IGKV3-15
  • IGKV3-20
  • IGKV3D-20
  • IGKV4-1
  • IGKV5-2
  • IGLC1
  • IGLC2
  • IGLC3
  • IGLC6
  • IGLC7
  • IGLV
  • IGLV1-40
  • IGLV1-44
  • IGLV1-47
  • IGLV1-51
  • IGLV2-11
  • IGLV2-14
  • IGLV2-23
  • IGLV2-8
  • IGLV3-1
  • IGLV3-19
  • IGLV3-21
  • IGLV3-25
  • IGLV3-27
  • IGLV6-57
  • IGLV7-43
  • JTK8
  • LYN
  • MS4A2
  • SYK
  • V1-11
  • V1-13
  • V1-16
  • V1-20
  • V1-3
  • V1-5
  • V1-7
  • V1-9
  • V2-11
  • V2-15
  • V2-17
  • V2-19
  • V2-8
  • V3-2
  • V3-3
  • V3-4
  • V4-1
  • V4-2
  • V4-6
  • V5-1
  • V5-4
  • V5-6
Homo sapiens (human)
FasL/ CD95L signaling
  • APT1
  • APT1LG1
  • CASP10
  • CASP8
  • CD95L
  • FADD
  • FAS
  • FAS1
  • FASL
  • FASLG
  • MCH4
  • MCH5
  • MORT1
  • TNFRSF6
  • TNFSF6
Homo sapiens (human)
Synthesis of pyrophosphates in the cytosol
  • APS1
  • APS2
  • C9orf12
  • DIPP
  • DIPP1
  • DIPP2
  • DIPP3A
  • DIPP3B
  • HISPPD1
  • HISPPD2A
  • IHPK1
  • IHPK3
  • IP6K
  • IP6K1
  • IP6K3
  • IPPK
  • IPS1
  • ITPK1
  • KIAA0263
  • KIAA0377
  • KIAA0433
  • KIAA0487
  • NUDT10
  • NUDT11
  • NUDT3
  • NUDT4
  • PPIP5K1
  • PPIP5K2
  • VIP1
  • VIP2
Homo sapiens (human)
Regulation of KIT signaling
  • APS
  • CBL
  • CBL2
  • CIS4
  • FYN
  • HCP
  • JTK8
  • KIT
  • LCK
  • LNK
  • LYN
  • PKCA
  • PRKACA
  • PRKCA
  • PTP1C
  • PTPN6
  • RNF55
  • SCFR
  • SH2B2
  • SH2B3
  • SOCS1
  • SOCS4
  • SOCS6
  • SOS1
  • SSI1
  • TIP3
  • YES
  • YES1
Homo sapiens (human)
Defective APRT disrupts adenine salvage
  • APRT
Homo sapiens (human)
Cohesin Loading onto Chromatin
  • APRIN
  • AS3
  • BAM
  • BMH
  • CSPG6
  • DXS423E
  • FOE
  • HR21
  • IDN3
  • KIAA0078
  • KIAA0178
  • KIAA0261
  • KIAA0648
  • KIAA0892
  • KIAA0979
  • MAU2
  • NIPBL
  • NXP1
  • PDS5
  • PDS5A
  • PDS5B
  • RAD21
  • SA1
  • SA2
  • SB1.8
  • SCC1
  • SCC2
  • SCC3
  • SCC4
  • SMC1
  • SMC1A
  • SMC1L1
  • SMC3
  • SMC3L1
  • STAG1
  • STAG2
  • WAPAL
  • WAPL
Homo sapiens (human)
Establishment of Sister Chromatid Cohesion
  • APRIN
  • AS3
  • BAM
  • BMH
  • CDCA5
  • CSPG6
  • DXS423E
  • EFO1
  • ESCO1
  • ESCO2
  • FOE
  • HR21
  • KIAA0078
  • KIAA0178
  • KIAA0261
  • KIAA0648
  • KIAA0979
  • KIAA1911
  • NXP1
  • PDS5
  • PDS5A
  • PDS5B
  • RAD21
  • SA1
  • SA2
  • SB1.8
  • SCC1
  • SCC3
  • SMC1
  • SMC1A
  • SMC1L1
  • SMC3
  • SMC3L1
  • STAG1
  • STAG2
  • WAPAL
  • WAPL
Homo sapiens (human)
Signalling to STAT3
  • APRF
  • MTC
  • NGF
  • NGFB
  • NTRK1
  • STAT3
  • TRK
  • TRKA
Homo sapiens (human)
Interleukin-9 signaling
  • APRF
  • IL2RG
  • IL9
  • IL9R
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK3
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT5
  • STAT5A
  • STAT5B
Homo sapiens (human)
Interleukin-21 signaling
  • APRF
  • IL21
  • IL21R
  • IL2RG
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK3
  • NILR
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT4
  • STAT5
  • STAT5A
  • STAT5B
Homo sapiens (human)
MET activates STAT3
  • APRF
  • HGF
  • HPTA
  • MET
  • STAT3
Homo sapiens (human)
Signaling by PDGFRA extracellular domain mutants
  • APRF
  • GRB1
  • HRAS
  • HRAS1
  • NRAS
  • PDGFR2
  • PDGFRA
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • RHEPDGFRA
  • SOS1
  • STAT1
  • STAT3
Homo sapiens (human)
Signaling by PDGFRA transmembrane, juxtamembrane and kinase domain mutants
  • APRF
  • GRB1
  • HRAS
  • HRAS1
  • NRAS
  • PDGFR2
  • PDGFRA
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • RHEPDGFRA
  • SOS1
  • STAT1
  • STAT3
Homo sapiens (human)

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Last updated: August 19, 2024