GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 251 - 275 of 1070 in total
Pathway Name ▲ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Downregulation of TGF-beta receptor signaling
  • Bambi
  • LOC100360645
  • Madh2
  • Madh3
  • Madh7
  • Mtmr4
  • Pmepa1
  • Rps27a
  • Smad2
  • Smad3
  • Smad7
  • Smurf2
  • Strap
  • Tgfb1
  • Tgfbr1
  • Tgfbr2
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Unrip
Rattus norvegicus (Norway rat)
Downstream TCR signaling
  • AABR07044416.1
  • Arrb2-ps
  • Bcl10
  • Card11
  • Cd247
  • Cd3d
  • Cd3e
  • Cd3g
  • Cd4
  • Chuk
  • DA1
  • Db2
  • ENSRNOG00000065769
  • ENSRNOG00000065908
  • ENSRNOG00000065955
  • ENSRNOG00000070909
  • H2-Ea
  • Hla-dma
  • Hla-dmb
  • Ikbkb
  • Ikbkg
  • Ikkb
  • Inpp5d
  • LOC100911800
  • Lck
  • Malt1
  • Map3k7
  • Map3k7ip2
  • Nemo
  • Pdk1
  • Pdpk1
  • Pik3ca
  • Pik3cb
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Pkcq
  • Prkcq
  • Psmb9
  • Pten
  • RT1-Ba
  • RT1-Bb
  • RT1-DOb
  • RT1-Da
  • RT1-Db1
  • RT1-Db2
  • RT1-Ha
  • RT1-Hb-ps1
  • Ripk2
  • Ship
  • Ship1
  • T3d
  • Tab2
  • Tap1
  • Tap2
  • Tesb
  • Traf6
  • Trat1
  • Trbv16
Rattus norvegicus (Norway rat)
Downstream signal transduction
  • Ash
  • Bcar1
  • Cas
  • Crk
  • Crkas
  • Crkl
  • Crko
  • Grb2
  • Grb7
  • Hras
  • Hras1
  • Kras
  • Kras2
  • Mgf
  • Nck1
  • Nck2
  • Nras
  • Pdgfa
  • Pdgfb
  • Pdgfr
  • Pdgfr1
  • Pdgfra
  • Pdgfrb
  • Pik3ca
  • Pik3cb
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Plcg1
  • Ptpn11
  • Rapgef1
  • Rasa
  • Rasa1
  • Rpa1
  • Sos1
  • Src
  • Stat1
  • Stat3
  • Stat4
  • Stat5a
  • Stat5b
  • Stat6
Rattus norvegicus (Norway rat)
Downstream signaling of activated FGFR1
  • FGF22
  • FGF6
  • Fgf-1
  • Fgf-2
  • Fgf-5
  • Fgf-9
  • Fgf1
  • Fgf10
  • Fgf17
  • Fgf2
  • Fgf20
  • Fgf22
  • Fgf23
  • Fgf3
  • Fgf4
  • Fgf5
  • Fgf5c
  • Fgf5d
  • Fgf6
  • Fgf7a
  • Fgf7b
  • Fgf8
  • Fgf9
  • Fgfa
  • Fgfr1
  • Flg
  • Flrt1
  • Flrt2
  • Flrt3
  • Kl
Rattus norvegicus (Norway rat)
Drug-mediated inhibition of ERBB2 signaling
  • Cdc37
  • Erbb2
  • Hsp86
  • Hsp90aa1
  • Hspca
  • Neu
Rattus norvegicus (Norway rat)
Drug-mediated inhibition of MET activation
  • Hgf
  • Met
Rattus norvegicus (Norway rat)
E3 ubiquitin ligases ubiquitinate target proteins
  • Bcl10
  • Bre1b
  • Cdc73
  • Ctr9
  • ENSRNOG00000064540
  • ENSRNOG00000066901
  • ENSRNOG00000068034
  • H2bc1
  • H2bc12l1
  • H2bc6
  • H2bcl1
  • H2bcl2
  • Hist1h2ba
  • Hist1h2bc
  • Hist1h2bg
  • Hist1h2bo
  • Hist1h2bq
  • Hrpt2
  • LOC100360645
  • LOC100365043
  • LOC100366017
  • LOC100910200
  • LOC684797
  • Leo1
  • NEWGENE_1308361
  • Paf1
  • Paf3
  • Pex10
  • Pex12
  • Pex14
  • Pex2
  • Pex5
  • Pex5_predicted
  • Pmp35
  • Prkdc
  • Pxmp3
  • RGD1562407
  • Rad6b
  • Rnf144a
  • Rnf181
  • Rnf20
  • Rnf40
  • Rps27a
  • Skic8
  • Th2b
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubc4
  • Ubcep1
  • Ubch4
  • Ubch5b
  • Ubcl1
  • Ube2a
  • Ube2b
  • Ube2d1
  • Ube2d2
  • Ube2d3
  • Ube2e1
  • Ube2l3
  • WAC
  • Wac
  • Wdr61
Rattus norvegicus (Norway rat)
ECM proteoglycans
  • AABR07044388.2
  • Acan
  • Agc
  • Agc1
  • Agrin
  • Agrn
  • Bcan
  • Behab
  • Bgn
  • Comp
  • Crtl1
  • Cspg2
  • Cspg3
  • Dcn
  • Dmp1
  • Dspp
  • Hapln1
  • Itga2
  • Itga2b
  • Itga7
  • Itga8
  • Itga9
  • Itgav
  • Itgax
  • Itgb1
  • Itgb3
  • Itgb5
  • Itgb6
  • Matn1
  • Matn3
  • Matn4
  • Ncan
  • Pai1
  • Planh1
  • Rdsp2
  • Serpine1
  • Sparc
  • Tnc
  • Tnn
  • Tnr
  • Tnxb
  • Vcan
  • Vtn
Rattus norvegicus (Norway rat)
EGFR Transactivation by Gastrin
  • Ash
  • Dtr
  • Egfr
  • Grb2
  • Hbegf
  • Hegfl
  • Hras
  • Hras1
  • Kras
  • Kras2
  • Mmp3
  • Nras
  • Pkca
  • Prkca
  • Sos1
Rattus norvegicus (Norway rat)
EGFR downregulation
  • Areg
  • Arhgef7
  • Ash
  • Btc
  • Cbl
  • Cdc42
  • Dtr
  • Egf
  • Egfr
  • Epn1
  • Eps15
  • Eps15l1
  • Ereg
  • Grb2
  • Hbegf
  • Hegfl
  • Hgs
  • Hrs
  • Hrs2
  • LOC100360645
  • Pak3bp
  • Pixb
  • Ptpn12
  • Ptpn3
  • Rps27a
  • Ruk
  • Sdgf
  • Seta
  • Sh3d2a
  • Sh3d2c1
  • Sh3gl1
  • Sh3gl2
  • Sh3gl3
  • Sh3kbp1
  • Sh3p13
  • Sh3p4
  • Sh3p8
  • Spry1
  • Spry2
  • Stam
  • Stam2
  • Tgfa
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
EGFR interacts with phospholipase C-gamma
  • Areg
  • Btc
  • Dtr
  • Egf
  • Egfr
  • Ereg
  • Hbegf
  • Hegfl
  • Plcg1
  • Sdgf
  • Tgfa
Rattus norvegicus (Norway rat)
EML4 and NUDC in mitotic spindle formation
  • Ahctf1
  • Aik2
  • Aim1
  • Airk2
  • Ark2
  • Aurkb
  • B9d2
  • Birc5
  • Bub1
  • Bub1b
  • Ccdc99
  • Cdc20
  • Cdca1
  • Cdca8
  • Cenpc
  • Cenpc1
  • Cenpe
  • Cenpf
  • Cenph
  • Cenpi
  • Cenpk
  • Cenpl
  • Cenpm
  • Cenpn
  • Cenpo
  • Cenpp
  • Cenpq
  • Cenpr
  • Cenpt
  • Cenpu
  • Ckap5
  • Clasp1
  • Clasp2
  • Clip1
  • Crm1
  • Cyln1
  • Dhc1
  • Dlc2
  • Dnch1
  • Dnchc1
  • Dnci1
  • Dnci2
  • Dncic1
  • Dncic2
  • Dncl1
  • Dnclc1
  • Dncli1
  • Dncli2
  • Dnec1
  • Dsn1
  • Dyhc
  • Dync1h1
  • Dync1i1
  • Dync1i2
  • Dync1li1
  • Dync1li2
  • Dynll1
  • Dynll2
  • Eml4
  • Ercc6l
  • Fam33a
  • Fshprh1
  • Incenp
  • Itgb3bp
  • Kif18a
  • Kif2
  • Kif2a
  • Kif2b
  • Kif2c
  • Knl1
  • Kntc1
  • Krp2
  • LOC100909468
  • LOC102555739
  • LOC679342
  • LOC681185
  • LOC683983
  • Lis-1
  • Lis1
  • Lrpr1
  • Mad1l1
  • Mad2l1
  • Map1c
  • Mapre1
  • Mis12
  • Mlf1ip
  • Ndc80
  • Nde1
  • Ndel1
  • Nrif3
  • Nsl1
  • Nudc
  • Nude
  • Nude1
  • Nude2
  • Nudel
  • Nuf2
  • Nup107
  • Nup133
  • Nup160
  • Nup37
  • Nup43
  • Nup85
  • Nup98
  • Pafah1b1
  • Pafaha
  • Pcnt1
  • Pin
  • Plk
  • Plk1
  • Pmf1
  • Ppp1cc
  • Ppp2ca
  • Ppp2cb
  • Ppp2r1a
  • Ppp2r1b
  • Ppp2r5a
  • Ppp2r5b
  • Ppp2r5c
  • Ppp2r5d
  • Ppp2r5e
  • Ranbp2
  • Rangap1
  • Rcc2
  • Rps27
  • Rsn
  • S27-1
  • Sec13
  • Sec13l1
  • Sgo1
  • Sgo2
  • Sip30
  • Ska1
  • Ska2
  • Ska2l1
  • Spbc25
  • Spc24
  • Spc24-ps1
  • Spc25
  • Spdl1
  • Stk1
  • Stk12
  • Stk5
  • Tao1
  • Taok1
  • Xpo1
  • Zw10
  • Zwilch
  • Zwint
Rattus norvegicus (Norway rat)
EPH-Ephrin signaling
  • Efna1
  • Efna2
  • Efna3
  • Efna4
  • Efna5
  • Efnb1
  • Efnb3
  • Ehk-1
  • Ehk-2
  • Ehk-3
  • Ehk2
  • Ehk3
  • Ekh1
  • Elk
  • Epgl1
  • Epha1
  • Epha10
  • Epha2
  • Epha3
  • Epha4
  • Epha5
  • Epha6
  • Epha7
  • Ephb1
  • Ephb2
  • Ephb3
  • Ephb4
  • Ephb6
  • Eplg2
  • Eplg7
  • Epth2
  • LOC686310
  • Lerk1
  • Lerk2
  • Lerk7
  • Rek4
  • Rek7
  • Tyro4
Rattus norvegicus (Norway rat)
EPH-ephrin mediated repulsion of cells
  • Aph1a
  • Efnb1
  • Efnb3
  • Elk
  • Ephb1
  • Ephb2
  • Ephb3
  • Ephb4
  • Ephb6
  • Eplg2
  • Epth2
  • Fyn
  • LOC686310
  • Lerk2
  • Lyn
  • Mmp2
  • Mmp9
  • Ncstn
  • Ps2
  • Psen1
  • Psen2
  • Psenen
  • Psnl1
  • Psnl2
  • Rac
  • Rac1
  • Src
  • Tiam1
  • Vav2
  • Vav3
  • Yes1
Rattus norvegicus (Norway rat)
EPHB-mediated forward signaling
  • Actb
  • Actg
  • Actg1
  • Actr2
  • Actr3
  • Arha
  • Arha2
  • Arhgef28
  • Arp2
  • Arp3
  • Arpc1a
  • Arpc1b
  • Arpc2
  • Arpc3
  • Arpc4
  • Arpc5
  • Cdc42
  • Duo
  • Ehsh1
  • Fak
  • Fak1
  • Fyn
  • Grin1
  • Grin2b
  • Hapip
  • Hras
  • Hras1
  • Hspg1
  • Itsn
  • Itsn1
  • Kalrn
  • Lyn
  • Nmdar1
  • Pak1
  • Ptk2
  • Rac
  • Rac1
  • Rasa
  • Rasa1
  • Rgnef
  • Rhoa
  • Rock1
  • Rock2
  • Sdc2
  • Src
  • Synd2
  • Tiam1
  • Yes1
Rattus norvegicus (Norway rat)
ER-Phagosome pathway
  • 1700031A10Rik
  • 2781a1
  • 2788a1a2
  • 2795a1
  • 2800a1a2
  • 2812a1a2
  • 2824a1
  • 2829a1a2
  • 2846a1a2
  • 2860a1
  • 2865a2
  • 2869a1a2
  • 2879a1
  • 2886a1-a1a2
  • 2901a1a2
  • 2906a1
  • 2920a1a2
  • 2927a1
  • 2941a1a2
  • 2945a1a2
  • 2950a1
  • 2953a1a2
  • 2959a1
  • 2976a1
  • 2981a1a2
  • 2984a1a2
  • 2994a1
  • 3082ex4-5
  • 3252a3
  • 3258a2
  • 3281a3
  • 3298a3
  • AABR07044308.2
  • AABR07044362.1
  • AABR07072807.1
  • AC120486.1
  • Abcb2
  • Abcb3
  • B2m
  • Calr
  • ENSRNOG00000064836
  • ENSRNOG00000069480
  • Erp60
  • Grp58
  • H2-M10.6
  • H2-M10.6l
  • LOC102546590
  • LOC120093125
  • Mtp1
  • Mtp2
  • Nerg-ps11
  • Nerg-ps12
  • Nerg-ps13
  • Nerg-ps14
  • Nerg-ps15
  • Pbp-ps
  • Pdia3
  • Ppid-ps
  • Ppp1cb-ps
  • RT1-A1
  • RT1-A2
  • RT1-CE1
  • RT1-CE11
  • RT1-CE14
  • RT1-CE16
  • RT1-CE2
  • RT1-M1-1
  • RT1-M1-2
  • RT1-M1-3
  • RT1-M1-4
  • RT1-M1-5
  • RT1-M10-1
  • RT1-M10-2
  • RT1-M10-3
  • RT1-M10-4
  • RT1-M2
  • RT1-M3-1
  • RT1-M5
  • RT1-M7
  • RT1-M8
  • RT1-N3
  • RT1-O1l1
  • RT1-P2
  • RT1-S3
  • Rcrg1-ps25
  • Rcrg1-ps26
  • Rcrg1-ps27
  • Rcrg1-ps28
  • Rcrg1-ps29
  • Rcrg1-ps30
  • Rcrg1-ps31
  • Rcrg1-ps32
  • Rcrg1-ps33
  • Rcrg1-ps34
  • Rcrg1-ps35
  • Rcrg1-ps36
  • Rcrg1-ps37
  • Rcrg1-ps38
  • Rcrg1-ps39
  • Rcrg1-ps40
  • Rpl39-ps
  • Sec22b
  • Sec22l1
  • Snap23
  • Stx4
  • Stx4a
  • Syb3
  • Tap1
  • Tap2
  • Tapbp
  • Trim15
  • Trim31
  • Trim39-ps
  • Vamp3
  • Vamp8
Rattus norvegicus (Norway rat)
ERBB2 Activates PTK6 Signaling
  • Btc
  • Dtr
  • Egf
  • Egfr
  • Erbb2
  • Erbb3
  • Ereg
  • Hbegf
  • Hegfl
  • Ndf
  • Neu
  • Nrg1
  • Nrg2
  • Nrg3
  • Ntak
  • Ptk6
Rattus norvegicus (Norway rat)
ERBB2 Regulates Cell Motility
  • Arha
  • Arha2
  • Btc
  • Diap1
  • Diaph1
  • Dtr
  • Egf
  • Egfr
  • Erbb2
  • Erbb3
  • Ereg
  • Hbegf
  • Hegfl
  • Memo1
  • Ndf
  • Neu
  • Nrg1
  • Nrg2
  • Nrg3
  • Ntak
  • Rhoa
Rattus norvegicus (Norway rat)
ERK/MAPK targets
  • Bmk1
  • Csbp1
  • Csbp2
  • Erk1
  • Erk2
  • Erk5
  • Mapk
  • Mapk1
  • Mapk11
  • Mapk14
  • Mapk3
  • Mapk7
  • Mapkapk1a
  • Ppp2ca
  • Ppp2cb
  • Ppp2r1a
  • Ppp2r1b
  • Ppp2r5d
  • Prkm1
  • Prkm3
  • Rps6ka1
  • Rps6ka2
  • Rps6ka3
  • Rps6ka5
  • Rsk1
Rattus norvegicus (Norway rat)
ERKs are inactivated
  • Bmk1
  • Dusp3
  • Dusp4
  • Dusp6
  • Dusp7
  • Erk1
  • Erk2
  • Erk5
  • Mapk
  • Mapk1
  • Mapk3
  • Mapk7
  • Mkp2
  • Mkp3
  • Mkpx
  • Ppp2ca
  • Ppp2cb
  • Ppp2r1a
  • Ppp2r1b
  • Ppp2r5d
  • Prkm1
  • Prkm3
  • Vrk3
Rattus norvegicus (Norway rat)
ESR-mediated signaling
  • Erbeta
  • Esr
  • Esr1
  • Esr2
  • Estr
  • Fkbp4
  • Fkbp5
  • Fkbp52
  • Hsp84
  • Hsp86
  • Hsp90aa1
  • Hsp90ab1
  • Hspc3
  • Hspca
  • Hspcb
  • Nr3a1
  • Nr3a2
  • Ppp5c
  • Ptges3
  • Tebp
Rattus norvegicus (Norway rat)
Effects of PIP2 hydrolysis
  • Dagk
  • Dagk1
  • Dagk2
  • Dagk3
  • Dagk6
  • Dgka
  • Dgkb
  • Dgkd
  • Dgke
  • Dgkg
  • Dgkh
  • Dgki
  • Dgkk
  • Dgkq
  • Dgkz
  • Insp3r
  • Itpr1
  • Itpr2
  • Itpr3
  • Pkcd
  • Pkce
  • Pkch
  • Pkcq
  • Prkcd
  • Prkce
  • Prkch
  • Prkcq
  • Trpc3
  • Trpc7
  • Trrp3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Elastic fibre formation
  • Dance
  • Eln
  • Fbln5
  • Fbn1
  • Fur
  • Furin
  • Itga5
  • Itgav
  • Itgb1
  • Itgb3
  • Itgb6
  • Lox
  • Loxl1
  • Loxl2
  • Loxl3
  • Loxl4
  • Mfap2
  • Mfap5
  • Pcsk3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Electric Transmission Across Gap Junctions
  • Gja10
  • Gja7
  • Gja9
  • Gjc1
  • Gjd2
  • Panx1
  • Panx2
  • Px1
  • Px2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Elevation of cytosolic Ca2+ levels
  • Insp3r
  • Itpr1
  • Itpr2
  • Itpr3
  • P2rx1
  • P2rx2
  • P2rx3
  • P2rx4
  • P2rx5
  • P2rx6
  • P2rx7
  • P2rxl1
  • Trpc3
  • Trpc7
  • Trrp3
Rattus norvegicus (Norway rat)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

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Last updated: August 19, 2024