GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 426 - 450 of 1070 in total
Pathway Name ▼ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
PI3K/AKT Signaling
  • Ailim
  • Akt1
  • Akt2
  • Akt3
  • Areg
  • Ash
  • Btc
  • Cd19
  • Cd28
  • Cd80
  • Cd86
  • Dtr
  • Egf
  • Egfr
  • Erbb2
  • Erbb3
  • Erbeta
  • Ereg
  • Esr
  • Esr1
  • Esr2
  • Estr
  • FGF15
  • FGF22
  • FGF6
  • Fgf-1
  • Fgf-2
  • Fgf-5
  • Fgf-7
  • Fgf-9
  • Fgf1
  • Fgf10
  • Fgf16
  • Fgf17
  • Fgf18
  • Fgf19
  • Fgf2
  • Fgf20
  • Fgf22
  • Fgf23
  • Fgf3
  • Fgf4
  • Fgf5
  • Fgf5c
  • Fgf5d
  • Fgf6
  • Fgf7
  • Fgf7a
  • Fgf7b
  • Fgf8
  • Fgf8a
  • Fgf9
  • Fgfa
  • Fgfr1
  • Fgfr2
  • Fgfr3
  • Fgfr4
  • Fit1
  • Flg
  • Flt3
  • Frap1
  • Frs2
  • Fyn
  • Gab1
  • Gab2
  • Gbl
  • Grb2
  • Hbegf
  • Hegfl
  • Hgf
  • Icos
  • Il1rap
  • Il1rl1
  • Il33
  • Irak1
  • Irak4
  • Irs-1
  • Irs1
  • Irs2
  • KIT
  • Kgf
  • Kit
  • Kitl
  • Kitlg
  • Kl
  • Klb
  • LOC100361758
  • Lck
  • Lst8
  • Mapkap1
  • Met
  • Mgf
  • Mip1
  • Mlst8
  • Mtor
  • Myd88
  • Ndf
  • Neu
  • Nipk
  • Nr3a1
  • Nr3a2
  • Nrg1
  • Nrg2
  • Nrg3
  • Ntak
  • Pdgfa
  • Pdgfb
  • Pdgfr
  • Pdgfr1
  • Pdgfra
  • Pdgfrb
  • Pdk1
  • Pdpk1
  • Pik3ap1
  • Pik3ca
  • Pik3cb
  • Pik3cd
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Pik3r3
  • Protor1
  • Prr5
  • Ptpn11
  • Rac
  • Rac1
  • Rac2
  • Raft1
  • Rhog
  • Rictor
  • Rpa1
  • Sdgf
  • Sgk
  • Sgk1
  • Sin1
  • Src
  • Strn
  • Tgfa
  • Them4
  • Traf6
  • Trat1
  • Trib3
  • Vav
  • Vav1
Rattus norvegicus (Norway rat)
PI3K events in ERBB4 signaling
  • Btc
  • Dtr
  • Ereg
  • Hbegf
  • Hegfl
  • Ndf
  • Nrg1
  • Nrg2
  • Nrg3
  • Ntak
  • Pik3ca
  • Pik3r1
Rattus norvegicus (Norway rat)
PI3K events in ERBB2 signaling
  • Ash
  • Btc
  • Dtr
  • Egf
  • Egfr
  • Erbb2
  • Erbb3
  • Ereg
  • Gab1
  • Grb2
  • Hbegf
  • Hegfl
  • Ndf
  • Neu
  • Nrg1
  • Nrg2
  • Nrg3
  • Ntak
  • Pik3ca
  • Pik3r1
Rattus norvegicus (Norway rat)
PI3K Cascade
  • Ash
  • FGF15
  • FGF22
  • FGF6
  • Fgf-1
  • Fgf-2
  • Fgf-5
  • Fgf-7
  • Fgf-9
  • Fgf1
  • Fgf10
  • Fgf16
  • Fgf17
  • Fgf18
  • Fgf19
  • Fgf2
  • Fgf20
  • Fgf22
  • Fgf23
  • Fgf3
  • Fgf4
  • Fgf5
  • Fgf5c
  • Fgf5d
  • Fgf6
  • Fgf7
  • Fgf7a
  • Fgf7b
  • Fgf8
  • Fgf8a
  • Fgf9
  • Fgfa
  • Fgfr1
  • Fgfr2
  • Fgfr3
  • Fgfr4
  • Flg
  • Flt3
  • Frs2
  • Gab1
  • Gab2
  • Grb2
  • Irs-1
  • Irs1
  • Irs2
  • Kgf
  • Kl
  • Klb
  • Pik3c3
  • Pik3ca
  • Pik3cb
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Pik3r4
  • Ptpn11
  • Tlr9
  • Vps34
Rattus norvegicus (Norway rat)
PI-3K cascade:FGFR4
  • Ash
  • FGF15
  • FGF6
  • Fgf-1
  • Fgf-2
  • Fgf-9
  • Fgf1
  • Fgf16
  • Fgf17
  • Fgf18
  • Fgf19
  • Fgf2
  • Fgf20
  • Fgf23
  • Fgf4
  • Fgf6
  • Fgf7a
  • Fgf7b
  • Fgf8
  • Fgf8a
  • Fgf9
  • Fgfa
  • Fgfr4
  • Frs2
  • Gab1
  • Grb2
  • Klb
  • Pik3ca
  • Pik3r1
  • Ptpn11
Rattus norvegicus (Norway rat)
PI-3K cascade:FGFR3
  • Ash
  • Fgf-1
  • Fgf-2
  • Fgf-5
  • Fgf-9
  • Fgf1
  • Fgf16
  • Fgf17
  • Fgf18
  • Fgf2
  • Fgf20
  • Fgf23
  • Fgf4
  • Fgf5
  • Fgf7a
  • Fgf8
  • Fgf9
  • Fgfa
  • Fgfr3
  • Frs2
  • Gab1
  • Grb2
  • Pik3ca
  • Pik3r1
  • Ptpn11
Rattus norvegicus (Norway rat)
PI-3K cascade:FGFR2
  • Ash
  • FGF22
  • FGF6
  • Fgf-1
  • Fgf-2
  • Fgf-5
  • Fgf-7
  • Fgf-9
  • Fgf1
  • Fgf10
  • Fgf16
  • Fgf17
  • Fgf18
  • Fgf2
  • Fgf20
  • Fgf22
  • Fgf23
  • Fgf3
  • Fgf4
  • Fgf5
  • Fgf5c
  • Fgf5d
  • Fgf6
  • Fgf7
  • Fgf7a
  • Fgf7b
  • Fgf8
  • Fgf9
  • Fgfa
  • Fgfr2
  • Frs2
  • Gab1
  • Grb2
  • Kgf
  • Pik3ca
  • Pik3r1
  • Ptpn11
Rattus norvegicus (Norway rat)
PI-3K cascade:FGFR1
  • Ash
  • FGF22
  • FGF6
  • Fgf-1
  • Fgf-2
  • Fgf-5
  • Fgf-9
  • Fgf1
  • Fgf10
  • Fgf17
  • Fgf2
  • Fgf20
  • Fgf22
  • Fgf23
  • Fgf3
  • Fgf4
  • Fgf5
  • Fgf5c
  • Fgf5d
  • Fgf6
  • Fgf7a
  • Fgf7b
  • Fgf8
  • Fgf9
  • Fgfa
  • Fgfr1
  • Flg
  • Frs2
  • Gab1
  • Grb2
  • Kl
  • Pik3ca
  • Pik3r1
  • Ptpn11
Rattus norvegicus (Norway rat)
PI Metabolism
  • Tnfaip8
  • Tnfaip8l1
  • Tnfaip8l2
  • Tnfaip8l3
Rattus norvegicus (Norway rat)
PERK regulates gene expression
  • Eif2a
  • Eif2ak3
  • Eif2g
  • Eif2s1
  • Eif2s2
  • Eif2s3
  • Eif2s3x
  • Pek
  • Perk
Rattus norvegicus (Norway rat)
PECAM1 interactions
  • Fyn
  • Inpp5d
  • Itgav
  • Itgb3
  • Lck
  • Lyn
  • Pecam
  • Pecam1
  • Plcg1
  • Ptph6
  • Ptpn11
  • Ptpn6
  • Ship
  • Ship1
  • Src
  • Yes1
Rattus norvegicus (Norway rat)
PDH complex synthesizes acetyl-CoA from PYR
  • Dlat
  • Dld
  • LOC311254
  • Pdha1
  • Pdha1l1
  • Pdha2
  • Pdhb
  • Pdhx
Rattus norvegicus (Norway rat)
PD-1 signaling
  • AABR07044416.1
  • Arrb2-ps
  • Cd247
  • Cd274
  • Cd3d
  • Cd3e
  • Cd3g
  • Cd4
  • Csk
  • DA1
  • Db2
  • ENSRNOG00000065769
  • ENSRNOG00000065908
  • ENSRNOG00000065955
  • ENSRNOG00000070909
  • H2-Ea
  • Hla-dma
  • Hla-dmb
  • LOC100911800
  • Lck
  • Pdcd1
  • Pdcd1lg2
  • Psmb9
  • Ptph6
  • Ptpn11
  • Ptpn6
  • RT1-Ba
  • RT1-Bb
  • RT1-DOb
  • RT1-Da
  • RT1-Db1
  • RT1-Db2
  • RT1-Ha
  • RT1-Hb-ps1
  • T3d
  • Tap1
  • Tap2
  • Tesb
  • Trbv16
Rattus norvegicus (Norway rat)
PCP/CE pathway
  • Arha
  • Arha2
  • Daam1
  • Dvl1
  • Dvl2
  • Dvl3
  • Fzd1
  • Fzd3
  • Fzd6
  • Fzd7
  • LOC100361515
  • Pfn1
  • Rac
  • Rac1
  • Rac2
  • Rhoa
  • Wnt-4
  • Wnt-5a
  • Wnt1
  • Wnt11
  • Wnt4
  • Wnt5a
  • Wnt5b
Rattus norvegicus (Norway rat)
P2Y receptors
  • Gpr105
  • Gpr17
  • Lpar4
  • Lpar6
  • P2ru1
  • P2ry1
  • P2ry10
  • P2ry12
  • P2ry13
  • P2ry14
  • P2ry2
  • P2ry4
  • P2ry5
  • P2ry6
  • P2y12
  • P2y4
  • P2y5
Rattus norvegicus (Norway rat)
Oxygen-dependent proline hydroxylation of Hypoxia-inducible Factor Alpha
  • Ajuba
  • Cul2
  • Egln1
  • Egln2
  • Egln3
  • Elob
  • Eloc
  • Epas1
  • Hif1a
  • Hif2a
  • Hif3a
  • Jub
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • Limd1
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mecl1
  • Mss1
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Rbx1
  • Ring12
  • Rps27a
  • Sm20
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Tceb1
  • Tceb2
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubc4
  • Ubcep1
  • Ubch4
  • Ubch5b
  • Ubcl1
  • Ube2d1
  • Ube2d2
  • Ube2d3
  • Vhl
  • Wtip
Rattus norvegicus (Norway rat)
Oxidative Stress Induced Senescence
  • Cbx2
  • Cbx4
  • Cbx6
  • Cbx8
  • Cdk4
  • Cdk6
  • Cdkn2b
  • Cdkn2d
  • Csbp1
  • Csbp2
  • ENSRNOG00000062927
  • ENSRNOG00000064540
  • ENSRNOG00000066901
  • ENSRNOG00000068034
  • Eed
  • Erk1
  • Erk2
  • Ezh2
  • Fos
  • H2ab3
  • H2ac10
  • H2ac18
  • H2ac4
  • H2afb3
  • H2afx
  • H2aj
  • H2ax
  • H2az2
  • H2bc1
  • H2bc12l1
  • H2bc6
  • H2bcl1
  • H2bcl2
  • H2bu1
  • H3-3b
  • H3.3b
  • H3c13
  • H3f3b
  • H4c16
  • H4c2
  • H4f16
  • H4ft
  • Hist1h2ba
  • Hist1h2bc
  • Hist1h2bg
  • Hist1h2bo
  • Hist1h2bq
  • Hist1h4b
  • Hist1h4m
  • Hist2h2aa3
  • Hist2h3c2
  • Hist4
  • Hist4h4
  • Ink4
  • Jnk1
  • Jnk2
  • Jnk3
  • Jun
  • Kdm6b
  • LOC100360645
  • LOC100365043
  • LOC100910200
  • LOC120097726
  • LOC684797
  • Map2k3
  • Map2k4
  • Map2k6
  • Map2k7
  • Map3k5
  • Map4k4
  • Map4k6
  • Mapk
  • Mapk1
  • Mapk10
  • Mapk11
  • Mapk14
  • Mapk3
  • Mapk8
  • Mapk9
  • Mapkapk2
  • Mapkapk3
  • Mapkapk5
  • Mdm2
  • Mdm4
  • Mdmx
  • Mink
  • Mink1
  • Mkk6
  • P53
  • Phc1
  • Phc2
  • Phc3
  • Prkm1
  • Prkm10
  • Prkm3
  • Prkm8
  • Prkm9
  • Rbbp4
  • Rbbp7
  • Ring1
  • Ring1b
  • Rjg-9
  • Rnf1
  • Rnf2
  • Rps27a
  • Scml2
  • Suz12
  • Th2b
  • Tnik
  • Tp53
  • Txn
  • Txn1
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Ovarian tumor domain proteases
  • Apc
  • Arha
  • Arha2
  • Cdc2
  • Cdc2a
  • Cdk1
  • Cdkn1
  • Esr
  • Esr1
  • Estr
  • Hshin7
  • Ikbkg
  • LOC100360606
  • LOC100360645
  • Nemo
  • Nod1
  • Nod2
  • Nr3a1
  • Otub1
  • Otub2
  • Otud3
  • Otud7a
  • Otud7b
  • P53
  • Pten
  • Rhoa
  • Ripk1
  • Ripk2
  • Rnf128
  • Rps27a
  • Tnfaip3
  • Tnip1
  • Tnip2
  • Tp53
  • Traf3
  • Traf6
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Ube2d1
  • Vcip135
  • Vcp
  • Vcpip1
  • Yod1
  • Zranb1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Other semaphorin interactions
  • Cd72
  • Dap12
  • Plxna1
  • Plxnb3
  • Plxnc1
  • Plxnd1
  • Ptprc
  • Sema3e
  • Sema4a
  • Sema4d
  • Sema5a
  • Sema6d
  • Sema7a
  • Trem2
  • Tyrobp
Rattus norvegicus (Norway rat)
Other interleukin signaling
  • Casp3
  • Cd4
  • Cpp32
  • Csf1
  • Csf1r
  • Csfm
  • Csfmr
  • Fms
  • IL16
  • Il16
  • Il34
  • Ptprz
  • Ptprz1
  • Ptpz
  • Sap
  • Sdc1
  • Snap
  • Snap25
  • Stx1a
  • Stx3
  • Stx3a
  • Stx4
  • Stx4a
  • Stxbp2
  • Syb2
  • Synd1
  • Txlna
  • Unc18b
  • Vamp2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Organic cation transport
  • Aml1
  • Cbfa2
  • Oct1
  • Oct2
  • Oct3
  • Octn1
  • Octn2
  • Orctl2
  • Runx1
  • Slc22a1
  • Slc22a15
  • Slc22a16
  • Slc22a18
  • Slc22a2
  • Slc22a3
  • Slc22a4
  • Slc22a5
  • Tssc5
Rattus norvegicus (Norway rat)
Organic anion transporters
  • Bnpi
  • Dnpi
  • Gc1
  • Nis
  • Npt1
  • Slc17a1
  • Slc17a6
  • Slc17a7
  • Slc17a8
  • Slc20a3
  • Slc20a4
  • Slc25a1
  • Slc25a10
  • Slc25a11
  • Slc25a18
  • Slc25a22
  • Slc5a5
  • Slc5a8
  • Vglut1
  • Vglut2
  • Vglut3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Organic anion transport
  • Nlt
  • Oat1
  • Oat2
  • Oat3
  • Slc22a12
  • Slc22a6
  • Slc22a7
  • Slc22a8
  • Urat1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Orexin and neuropeptides FF and QRFP bind to their respective receptors
  • Gpr147
  • Gpr74
  • Hcrt
  • Hcrtr1
  • Hcrtr2
  • Npff
  • Npff1
  • Npff2
  • Npffr1
  • Npffr2
  • Npgpr
  • Ox
  • P518
  • Ppox
  • Qrfp
  • Qrfprl
  • RGD1560028
Rattus norvegicus (Norway rat)
Orc1 removal from chromatin
  • Ccna1
  • Ccna2
  • Cdc6
  • Cdk2
  • Cdkn2
  • Cdt1
  • Cul1
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mcm2
  • Mcm3
  • Mcm4
  • Mcm5
  • Mcm8
  • Mecl1
  • Mss1
  • Orc1
  • Orc1l
  • Orc2
  • Orc2l
  • Orc3
  • Orc3l
  • Orc4
  • Orc4l
  • Orc5
  • Orc6
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Rbx1
  • Ring12
  • Rps27a
  • Skp1
  • Skp1a
  • Skp2
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Last updated: August 19, 2024