GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 501 - 525 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID ▲ Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Translation initiation complex formation
  • AABR07029195.1
  • EIF3EIP
  • EIF3F
  • EIF3K
  • EIF3L
  • EIF3M
  • EIF3S12
  • EIF3S5
  • EIF3S6IP
  • Eif1a
  • Eif2a
  • Eif2g
  • Eif2s1
  • Eif2s2
  • Eif2s3
  • Eif2s3x
  • Eif3a
  • Eif3b
  • Eif3c
  • Eif3d
  • Eif3e
  • Eif3f
  • Eif3g
  • Eif3h
  • Eif3i
  • Eif3j
  • Eif3k
  • Eif3l
  • Eif3m
  • Eif3s1
  • Eif3s10
  • Eif3s2
  • Eif3s3
  • Eif3s4
  • Eif3s6
  • Eif3s7
  • Eif3s8
  • Eif3s9
  • Eif4a1
  • Eif4a2
  • Eif4e
  • Eif4g1
  • Eif4h
  • Fau
  • Fte-1
  • Fte1
  • Int6
  • LOC100361854
  • LOC100361933
  • Lamr1
  • Pabp1
  • Pabpc1
  • Rig
  • Rps10
  • Rps11
  • Rps12l8
  • Rps13
  • Rps14
  • Rps15
  • Rps15a
  • Rps16
  • Rps17
  • Rps18
  • Rps19
  • Rps2
  • Rps20
  • Rps21
  • Rps23
  • Rps24
  • Rps25
  • Rps26
  • Rps26-ps13
  • Rps26l2
  • Rps26l4
  • Rps26l6
  • Rps27
  • Rps27a
  • Rps27l
  • Rps28
  • Rps29
  • Rps3
  • Rps3a
  • Rps4
  • Rps4x
  • Rps4y2
  • Rps5
  • Rps6
  • Rps7
  • Rps7-ps23
  • Rps8
  • Rps9
  • Rpsa
  • S27-1
  • Uba80
  • Ubcep1
  • Wbscr1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Formation of the ternary complex, and subsequently, the 43S complex
  • AABR07029195.1
  • EIF3EIP
  • EIF3F
  • EIF3K
  • EIF3L
  • EIF3M
  • EIF3S12
  • EIF3S5
  • EIF3S6IP
  • Eif1a
  • Eif2a
  • Eif2g
  • Eif2s1
  • Eif2s2
  • Eif2s3
  • Eif2s3x
  • Eif3a
  • Eif3b
  • Eif3c
  • Eif3d
  • Eif3e
  • Eif3f
  • Eif3g
  • Eif3h
  • Eif3i
  • Eif3j
  • Eif3k
  • Eif3l
  • Eif3m
  • Eif3s1
  • Eif3s10
  • Eif3s2
  • Eif3s3
  • Eif3s4
  • Eif3s6
  • Eif3s7
  • Eif3s8
  • Eif3s9
  • Fau
  • Fte-1
  • Fte1
  • Int6
  • LOC100361854
  • LOC100361933
  • Lamr1
  • Rig
  • Rps10
  • Rps11
  • Rps12l8
  • Rps13
  • Rps14
  • Rps15
  • Rps15a
  • Rps16
  • Rps17
  • Rps18
  • Rps19
  • Rps2
  • Rps20
  • Rps21
  • Rps23
  • Rps24
  • Rps25
  • Rps26
  • Rps26-ps13
  • Rps26l2
  • Rps26l4
  • Rps26l6
  • Rps27
  • Rps27a
  • Rps27l
  • Rps28
  • Rps29
  • Rps3
  • Rps3a
  • Rps4
  • Rps4x
  • Rps4y2
  • Rps5
  • Rps6
  • Rps7
  • Rps7-ps23
  • Rps8
  • Rps9
  • Rpsa
  • S27-1
  • Uba80
  • Ubcep1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Vitamin B2 (riboflavin) metabolism
  • AABR07053065.1
  • Acp5
  • Enpp1
  • Flad1
  • Gpr172a
  • Gpr172b
  • Npps
  • Pc1
  • Pdnp1
  • Rfk
  • Rft1
  • Rft2
  • Slc52a2
  • Slc52a3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Transport of bile salts and organic acids, metal ions and amine compounds
  • Cd92
  • Cdw92
  • Cht1
  • Ctl1
  • Ctl2
  • Ctl3
  • Ctl4
  • Mate1
  • Ng22
  • Slc10a6
  • Slc14a1
  • Slc14a2
  • Slc44a1
  • Slc44a2
  • Slc44a3
  • Slc44a4
  • Slc44a5
  • Slc47a1
  • Slc5a7
  • Soat
  • TPPT1
  • UT11
  • UT3
  • Ut2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Glutathione conjugation
  • AC097845.1
  • Akr1a1
  • Alr
  • Esd
  • Gst12
  • Gsta1
  • Gsta2
  • Gsta3
  • Gsta5
  • Gsta6
  • Gstk1
  • Gstm1
  • Gstm2
  • Gstm3
  • Gstm4
  • Gstm5
  • Gstm7
  • Gsto1
  • Gsto2
  • Gstp1
  • Gsts
  • Gstt1
  • Gstt2
  • Gstyc1
  • Gstyc2
  • Gstz1
  • Hpgds
  • Mgst1
  • Mgst2
  • Mgst3
  • Mgst3l1
  • Pgds
  • Ptgds2
Rattus norvegicus (Norway rat)
HDL assembly
  • A2m
  • A2m1
  • Abca1
  • Apoa1
  • Bmp1
  • LOC100364821
  • Pkacb
  • Prkaca
  • Prkacb
  • Zdhhc8
Rattus norvegicus (Norway rat)
Inactivation, recovery and regulation of the phototransduction cascade
  • CNCG2
  • CNCG3L
  • CNCG4
  • CaMIII
  • Calm3
  • Cam3
  • Camc
  • Camkmt
  • Clnmt
  • Cncg
  • Cncg1
  • Cnga1
  • Cngb1
  • Fnta
  • Fntb
  • Gnat1
  • Gnb5
  • Gngt1
  • Gprk2l
  • Grk1
  • Grk4
  • Guc2e
  • Guc2f
  • Guca1a
  • Guca1b
  • Gucy2d
  • Gucy2e
  • Gucy2f
  • Metap1
  • Metap2
  • Mnpep
  • Nmt1
  • Nmt2
  • P67eif2
  • Pde6a
  • Pde6b
  • Pde6g
  • Ppef1
  • RCNC2
  • Rcvrn
  • Rgs9
  • Rgs9bp
  • Rho
  • Rhok
  • Sag
Rattus norvegicus (Norway rat)
Beta-catenin phosphorylation cascade
  • Amer1
  • Apc
  • Axin
  • Axin1
  • Catnb
  • Csnk1a1
  • Ctnnb1
  • Frat1
  • Frat2
  • Gsk3b
  • LOC100909468
  • LOC679110
  • Ppp2ca
  • Ppp2cb
  • Ppp2r1a
  • Ppp2r1b
  • Ppp2r5a
  • Ppp2r5b
  • Ppp2r5c
  • Ppp2r5d
  • Ppp2r5e
Rattus norvegicus (Norway rat)
Platelet sensitization by LDL
  • Apob
  • Cpla2
  • Csbp1
  • Csbp2
  • Fgr
  • LOC100909468
  • Lrp8
  • Mapk14
  • Pecam
  • Pecam1
  • Pla2g4
  • Pla2g4a
  • Ppp2ca
  • Ppp2cb
  • Ppp2r1a
  • Ppp2r1b
  • Ppp2r5a
  • Ppp2r5b
  • Ppp2r5c
  • Ppp2r5d
  • Ppp2r5e
  • Ptph6
  • Ptpn11
  • Ptpn6
Rattus norvegicus (Norway rat)
Organic cation transport
  • Aml1
  • Cbfa2
  • Oct1
  • Oct2
  • Oct3
  • Octn1
  • Octn2
  • Orctl2
  • Runx1
  • Slc22a1
  • Slc22a15
  • Slc22a16
  • Slc22a18
  • Slc22a2
  • Slc22a3
  • Slc22a4
  • Slc22a5
  • Tssc5
Rattus norvegicus (Norway rat)
RAS processing
  • Abhd17a
  • Abhd17b
  • Abhd17c
  • Apt1
  • Arl184
  • Arl2
  • Bcl2l1
  • Bclx
  • Blc2l
  • CaMIII
  • Calm3
  • Cam3
  • Camc
  • ENSRNOG00000064803
  • ENSRNOG00000067432
  • Fnta
  • Fntb
  • Golga7
  • Hras
  • Hras1
  • Icmt
  • Kras
  • Kras2
  • LOC100910107
  • LOC120097921
  • LOC120098474
  • Lypla1
  • Nras
  • Pde6d
  • Pkcq
  • Prkcq
  • Prkg2
  • Rce1
  • Usp17l
  • Usp17l8
  • Usp17la
  • Usp17la2
  • Usp17lh
  • Usp17li
  • Zdhhc9
Rattus norvegicus (Norway rat)
Chemokine receptors bind chemokines
  • Acc1
  • Ackr2
  • Ackr3
  • Ackr4
  • Blr1
  • Ccbp2
  • Ccl1
  • Ccl11
  • Ccl12
  • Ccl17
  • Ccl19
  • Ccl20
  • Ccl25
  • Ccl27
  • Ccl3
  • Ccl4
  • Ccl5
  • Ccr10
  • Ccr10rr
  • Ccr3
  • Ccr4
  • Ccr5
  • Ccr6
  • Ccr7
  • Ccr8
  • Ccr9
  • Ccrl1
  • Ccrl2
  • Cinc1
  • Cinc2
  • Cinc3
  • Cmkar4
  • Cmkbr3
  • Cmkbr5
  • Cmkor1
  • Cx3cl1
  • Cx3cr1
  • Cxcl1
  • Cxcl10
  • Cxcl11
  • Cxcl12
  • Cxcl13
  • Cxcl16
  • Cxcl2
  • Cxcl3
  • Cxcl4
  • Cxcl5
  • Cxcl9
  • Cxcr1
  • Cxcr2
  • Cxcr3
  • Cxcr4
  • Cxcr5
  • Cxcr6
  • Cxcr7
  • D6
  • Fkn
  • Gro
  • Il8ra
  • Il8rb
  • Inp10
  • Ltn
  • Mig
  • Mip-2
  • Mip1a
  • Mip1b
  • Mip2
  • Mob1
  • Pf4
  • Rbs11
  • Rdc1
  • Scya11
  • Scya20
  • Scya3
  • Scya4
  • Scya5
  • Scyb1
  • Scyb10
  • Scyb2
  • Scyb4
  • Scyb5
  • Scyc1
  • Scyd1
  • St38
  • XCR1
  • Xcl1
  • Xcr1
Rattus norvegicus (Norway rat)
RIP-mediated NFkB activation via ZBP1
  • Chuk
  • Dhx9
  • Ikba
  • Ikbb
  • Ikbkb
  • Ikbkg
  • Ikkb
  • Myd88
  • Nemo
  • Nfkb2
  • Nfkbia
  • Nfkbib
  • Nkiras1
  • Nkiras2
  • Rela
Rattus norvegicus (Norway rat)
SUMOylation of immune response proteins
  • Ikba
  • Ikbke
  • Ikbkg
  • Nemo
  • Nfkb2
  • Nfkbia
  • Pias3
  • Pias4
  • Rela
  • Sumo1
  • Sumo3
  • Topors
  • Ubce9
  • Ube2i
Rattus norvegicus (Norway rat)
Activation of the phototransduction cascade
  • CNCG2
  • CNCG3L
  • CNCG4
  • Cncg
  • Cncg1
  • Cnga1
  • Cngb1
  • Gnat1
  • Gnb1
  • Gngt1
  • Pde6a
  • Pde6b
  • Pde6g
  • RCNC2
  • Rho
Rattus norvegicus (Norway rat)
Striated Muscle Contraction
  • Actn2
  • Actn3
  • Alpha-tm
  • Ctni
  • Des
  • Dmd
  • Fang2
  • Mlc1v
  • Mlc2
  • Mybpc2
  • Mybpc3
  • Myh3
  • Myh6
  • Myl1
  • Myl2
  • Myl3
  • Myl4
  • Neb
  • Ntmod
  • Tcap
  • Tmod
  • Tmod1
  • Tmod2
  • Tmod3
  • Tmod4
  • Tni
  • Tnnc1
  • Tnnc2
  • Tnni1
  • Tnni2
  • Tnni3
  • Tnnt1
  • Tnnt2
  • Tnnt3
  • Tpm1
  • Tpm2
  • Tpm4
  • Tpma
  • Trp1
  • Vim
Rattus norvegicus (Norway rat)
Unblocking of NMDA receptors, glutamate binding and activation
  • Actn2
  • CaMIII
  • Calm3
  • Cam3
  • Camc
  • Camk2a
  • Camk2b
  • Camk2d
  • Camk2g
  • Dlg1
  • Dlg2
  • Dlg3
  • Dlg4
  • Dlgh1
  • Dlgh2
  • Dlgh3
  • Dlgh4
  • GluA1
  • GluA2
  • GluA3
  • GluN2D
  • Glur1
  • Glur2
  • Glur3
  • Glur4
  • Gria1
  • Gria2
  • Gria3
  • Gria4
  • Grin1
  • Grin2a
  • Grin2b
  • Grin2c
  • Grin2d
  • Lap1
  • Lrrc7
  • Nefl
  • Nf68
  • Nfl
  • Nmdar1
  • Psd95
Rattus norvegicus (Norway rat)
ROS and RNS production in phagocytes
  • Aif1
  • Atp6b2
  • Atp6c
  • Atp6l
  • Atp6n1
  • Atp6s14
  • Atp6v0a1
  • Atp6v0a4
  • Atp6v0b
  • Atp6v0c
  • Atp6v0d1
  • Atp6v0d2
  • Atp6v0e
  • Atp6v0e1
  • Atp6v0e2
  • Atp6v1a
  • Atp6v1b1
  • Atp6v1b2
  • Atp6v1c1
  • Atp6v1c2
  • Atp6v1d
  • Atp6v1e1
  • Atp6v1e2
  • Atp6v1f
  • Atp6v1g1
  • Atp6v1g2
  • Atp6v1g3
  • Atp6v1h
  • Atpl
  • Bat1a
  • Bcg
  • Bnos
  • Cdk2ap1-ps2
  • Cdk2ap1-ps3
  • Cdk2ap1-ps4
  • Cdk2ap1-ps5
  • Cdk2ap1-ps6
  • Cyba
  • Cybb
  • Dsr1
  • E230034O05Rik
  • Hvcn1
  • LOC224733l-3
  • LOC224733l-4
  • LOC224733l-5
  • LOC224733l-6
  • LOC224733l-7
  • LOC224733l-8
  • Lst1
  • Ncf1
  • Ncf2
  • Ncf4
  • Nos1
  • Nos2
  • Nos3
  • Nramp1
  • RT1-CE12
  • RT1-CE3
  • RT1-CE5
  • RT1-CE6
  • RT1-CE8
  • RT1-CE9
  • Rac2
  • Sacm2l-ps3
  • Sacm2l-ps4
  • Sacm2l-ps5
  • Sacm2l-ps6
  • Sacm2l-ps7
  • Slc11a1
  • Tcirg1
  • Tnf
  • Vat2
  • Vatf
  • Vpp1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Transferrin endocytosis and recycling
  • Aif1
  • Atp6ap1
  • Atp6b2
  • Atp6c
  • Atp6ip1
  • Atp6l
  • Atp6n1
  • Atp6s1
  • Atp6s14
  • Atp6v0a1
  • Atp6v0a4
  • Atp6v0b
  • Atp6v0c
  • Atp6v0d1
  • Atp6v0d2
  • Atp6v0e
  • Atp6v0e1
  • Atp6v0e2
  • Atp6v1a
  • Atp6v1b1
  • Atp6v1b2
  • Atp6v1c1
  • Atp6v1c2
  • Atp6v1d
  • Atp6v1e1
  • Atp6v1e2
  • Atp6v1f
  • Atp6v1g1
  • Atp6v1g2
  • Atp6v1g3
  • Atp6v1h
  • Atpl
  • Bat1a
  • Cdk2ap1-ps2
  • Cdk2ap1-ps3
  • Cdk2ap1-ps4
  • Cdk2ap1-ps5
  • Cdk2ap1-ps6
  • Dsr1
  • E230034O05Rik
  • Hfe
  • LOC224733l-3
  • LOC224733l-4
  • LOC224733l-5
  • LOC224733l-6
  • LOC224733l-7
  • LOC224733l-8
  • Lst1
  • Mcoln1
  • RT1-CE12
  • RT1-CE3
  • RT1-CE5
  • RT1-CE6
  • RT1-CE8
  • RT1-CE9
  • Sacm2l-ps3
  • Sacm2l-ps4
  • Sacm2l-ps5
  • Sacm2l-ps6
  • Sacm2l-ps7
  • Steap3
  • Steap4
  • Tcirg1
  • Tf
  • Tfr2
  • Tfrc
  • Tnf
  • Trfr
  • Trfr2
  • Vat2
  • Vatf
  • Vpp1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Insulin receptor recycling
  • Aif1
  • Atp6ap1
  • Atp6b2
  • Atp6c
  • Atp6ip1
  • Atp6l
  • Atp6n1
  • Atp6s1
  • Atp6s14
  • Atp6v0a1
  • Atp6v0a4
  • Atp6v0b
  • Atp6v0c
  • Atp6v0d1
  • Atp6v0d2
  • Atp6v0e
  • Atp6v0e1
  • Atp6v0e2
  • Atp6v1a
  • Atp6v1b1
  • Atp6v1b2
  • Atp6v1c1
  • Atp6v1c2
  • Atp6v1d
  • Atp6v1e1
  • Atp6v1e2
  • Atp6v1f
  • Atp6v1g1
  • Atp6v1g2
  • Atp6v1g3
  • Atp6v1h
  • Atpl
  • Bat1a
  • Cdk2ap1-ps2
  • Cdk2ap1-ps3
  • Cdk2ap1-ps4
  • Cdk2ap1-ps5
  • Cdk2ap1-ps6
  • Ctsd
  • Dsr1
  • E230034O05Rik
  • Ide
  • Ins-1
  • Ins1
  • Insr
  • LOC224733l-3
  • LOC224733l-4
  • LOC224733l-5
  • LOC224733l-6
  • LOC224733l-7
  • LOC224733l-8
  • Lar
  • Lst1
  • Ptpn1
  • Ptprf
  • RT1-CE12
  • RT1-CE3
  • RT1-CE5
  • RT1-CE6
  • RT1-CE8
  • RT1-CE9
  • Sacm2l-ps3
  • Sacm2l-ps4
  • Sacm2l-ps5
  • Sacm2l-ps6
  • Sacm2l-ps7
  • Tcirg1
  • Tnf
  • Vat2
  • Vatf
  • Vpp1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Ion channel transport
  • Aif1
  • Atp6ap1
  • Atp6b2
  • Atp6c
  • Atp6ip1
  • Atp6l
  • Atp6n1
  • Atp6s1
  • Atp6s14
  • Atp6v0a1
  • Atp6v0a4
  • Atp6v0b
  • Atp6v0c
  • Atp6v0d1
  • Atp6v0d2
  • Atp6v0e
  • Atp6v0e1
  • Atp6v0e2
  • Atp6v1a
  • Atp6v1b1
  • Atp6v1b2
  • Atp6v1c1
  • Atp6v1c2
  • Atp6v1d
  • Atp6v1e1
  • Atp6v1e2
  • Atp6v1f
  • Atp6v1g1
  • Atp6v1g2
  • Atp6v1g3
  • Atp6v1h
  • Atpl
  • Bat1a
  • Cdk2ap1-ps2
  • Cdk2ap1-ps3
  • Cdk2ap1-ps4
  • Cdk2ap1-ps5
  • Cdk2ap1-ps6
  • Dsr1
  • E230034O05Rik
  • LOC224733l-3
  • LOC224733l-4
  • LOC224733l-5
  • LOC224733l-6
  • LOC224733l-7
  • LOC224733l-8
  • Lst1
  • RT1-CE12
  • RT1-CE3
  • RT1-CE5
  • RT1-CE6
  • RT1-CE8
  • RT1-CE9
  • Sacm2l-ps3
  • Sacm2l-ps4
  • Sacm2l-ps5
  • Sacm2l-ps6
  • Sacm2l-ps7
  • Tcirg1
  • Tnf
  • Vat2
  • Vatf
  • Vpp1
Rattus norvegicus (Norway rat)
RHO GTPases Activate NADPH Oxidases
  • Csbp1
  • Csbp2
  • Cyba
  • Cybb
  • Erk1
  • Erk2
  • Mapk
  • Mapk1
  • Mapk11
  • Mapk14
  • Mapk3
  • Mox1
  • Mrp14
  • Mrp8
  • Ncf1
  • Ncf2
  • Ncf4
  • Noh1
  • Nox1
  • Nox3
  • Noxa1
  • Noxo1
  • Pik3c3
  • Pik3r4
  • Pin1
  • Pkca
  • Pkcb
  • Pkcd
  • Pkcz
  • Prkca
  • Prkcb
  • Prkcb1
  • Prkcd
  • Prkcz
  • Prkm1
  • Prkm3
  • Rac
  • Rac1
  • Rac2
  • S100a8
  • S100a9
  • Vps34
Rattus norvegicus (Norway rat)
Cross-presentation of particulate exogenous antigens (phagosomes)
  • Cd36
  • Cyba
  • Cybb
  • Fat
  • Itgav
  • Itgb5
  • Ncf1
  • Ncf2
  • Ncf4
Rattus norvegicus (Norway rat)
Detoxification of Reactive Oxygen Species
  • AC128290.1
  • Aipla2
  • Aop2
  • Cas1
  • Cat
  • Ccs
  • Cyba
  • Cybb
  • Cycs
  • Cycsl2
  • Cycsl3
  • Ero1a
  • Ero1l
  • Giig11
  • Gpx1
  • Gpx2
  • Gpx3
  • Gpx5
  • Gpx6
  • Gpx7
  • Gpx8
  • Gsr
  • Gstp1
  • Kox
  • LOC690675
  • Ncf1
  • Ncf2
  • Ncf4
  • Nox4
  • Nudt2
  • P4hb
  • Pdia1
  • Prdx1
  • Prdx2
  • Prdx3
  • Prdx5
  • Prdx6
  • RGD1562558
  • Sod-3
  • Sod1
  • Sod2
  • Sod3
  • Tdpx1
  • Tdpx2
  • Trx2
  • Trxr1
  • Trxr2
  • Tsa
  • Txn
  • Txn1
  • Txn2
  • Txnrd1
  • Txnrd2
Rattus norvegicus (Norway rat)
IL-6-type cytokine receptor ligand interactions
  • Clcf1
  • Cntf
  • Cntfr
  • Crlf1
  • Ctf1
  • Il11
  • Il11ra1
  • Il31
  • Il31ra
  • Il6st
  • Jak1
  • Jak2
  • Lif
  • Lifr
  • Osm
  • Osmr
  • Osmrb
  • Tyk2
Rattus norvegicus (Norway rat)

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Last updated: August 19, 2024