GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 726 - 750 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
Recruitment of NuMA to mitotic centrosomes
  • AABR07000222.1
  • Actr1a
  • Akap9
  • Alms1
  • Azi1
  • Ccdc5
  • Ccp110
  • Cdc2
  • Cdc2a
  • Cdk1
  • Cdk5rap2
  • Cdkn1
  • Cenpj
  • Cep131
  • Cep135
  • Cep152
  • Cep164
  • Cep192
  • Cep250
  • Cep290
  • Cep41
  • Cep43
  • Cep57
  • Cep63
  • Cep70
  • Cep72
  • Cep76
  • Cep78
  • Cetn2
  • Ck1e-2
  • Ckap5
  • Clasp1
  • Csnk1d
  • Csnk1e
  • Ctrn1
  • Dctn1
  • Dctn2
  • Dctn3l1
  • Dhc1
  • Dnch1
  • Dnchc1
  • Dnci2
  • Dncic2
  • Dncl1
  • Dnclc1
  • Dnec1
  • Dyhc
  • Dync1h1
  • Dync1i2
  • Dynll1
  • Fgfr1op
  • Haus1
  • Haus4
  • Haus5
  • Haus6
  • Haus7
  • Haus8
  • Hckid
  • Hice1
  • Hsp86
  • Hsp90aa1
  • Hspca
  • LOC309692
  • Lis-1
  • Lis1
  • Map1c
  • Mapre1
  • Mzt1
  • Mzt2b
  • Nde1
  • Nedd1
  • Nek2l1
  • Ninl
  • Nme7
  • Nude
  • Nude1
  • Numa1
  • Ny-sar-48
  • Odf2
  • Odf84
  • Ofd1
  • Pafah1b1
  • Pafaha
  • Pcm1
  • Pcnt
  • Pin
  • Plk
  • Plk1
  • Plk4
  • Ppp2r1a
  • Prkaca
  • Prkar2b
  • Sak
  • Sdccag8
  • Sfi1
  • Ssna1
  • Tsga14
  • Tuba1
  • Tuba1a
  • Tuba4
  • Tuba4a
  • Tubb2c
  • Tubb4b
  • Tubb5
  • Tubg
  • Tubg1
  • Tubg2
  • Tubgcp3
  • Tubgcp4
  • Tubgcp5
  • Tubgcp6
  • Ywhae
  • Ywhag
Rattus norvegicus (Norway rat)
Signaling by SCF-KIT
  • Ash
  • Chek1
  • Chk1
  • Cma1
  • Fer
  • Fert2
  • Fes
  • Flk
  • Fyn
  • Gab2
  • Grap
  • Grap2
  • Grb10
  • Grb2
  • Grb7
  • Hras
  • Hras1
  • Jak2
  • KIT
  • Kit
  • Kitl
  • Kitlg
  • Kras
  • Kras2
  • Lck
  • Lyn
  • Mcpt3
  • Mgf
  • Mmp9
  • Nras
  • Pik3ca
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Pik3r3
  • Pkca
  • Prkca
  • Ptpn11
  • Ptpru
  • Rac
  • Rac1
  • Sos1
  • Src
  • Stat1
  • Stat3
  • Stat4
  • Stat5a
  • Stat5b
  • Tec
  • Vav
  • Vav1
  • Yes1
Rattus norvegicus (Norway rat)
AKT phosphorylates targets in the cytosol
  • Akt1
  • Akt1s1
  • Akt2
  • Akt3
  • Casp9
  • Cdkn1a
  • Cdkn1b
  • Chuk
  • Mdm2
  • Mkrn1
  • RNCASP9
  • Tsc2
  • p27Kip1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Depolymerization of the Nuclear Lamina
  • Ccnb1
  • Cdc2
  • Cdc2a
  • Cdk1
  • Cdkn1
  • Cnep1r1
  • Ctdnep1
  • Dullard
  • Emd
  • Lmn1
  • Lmna
  • Lmnb1
  • Lpin1
  • Lpin2
  • Lpin3
  • Pkca
  • Pkcb
  • Prkca
  • Prkcb
  • Prkcb1
  • Rbm39
  • Tmem188
Rattus norvegicus (Norway rat)
Negative regulation of MET activity
  • Ash
  • Cbl
  • Eps15
  • Grb2
  • Hgf
  • Hgs
  • Hrs
  • Hrs2
  • LOC100360645
  • Lrig1
  • Met
  • Ptpn1
  • Ptpn2
  • Ptprj
  • Rps27a
  • Ruk
  • Seta
  • Sh3d2a
  • Sh3d2c1
  • Sh3gl1
  • Sh3gl2
  • Sh3gl3
  • Sh3kbp1
  • Sh3p13
  • Sh3p4
  • Sh3p8
  • Stam
  • Stam2
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Usp8
Rattus norvegicus (Norway rat)
Hydrolysis of LPC
  • Cpla2
  • Lypla3
  • Pla2g15
  • Pla2g4
  • Pla2g4a
  • Pla2g4b
  • Pla2g4c
  • Pla2g4d
  • Pla2g4e
  • Pla2g4f
  • Plbd1
Rattus norvegicus (Norway rat)
NOSIP mediated eNOS trafficking
  • Nos3
  • Nosip
Rattus norvegicus (Norway rat)
Glycine degradation
  • AC132020.1
  • Amt
  • Dld
  • Dlst
  • Gcsh
  • Gldc
  • Kgd4
  • Mrps36
  • Ogdh
  • Ogdhl
Rattus norvegicus (Norway rat)
Mitotic Prophase
  • Ccnb1
  • Cdc2
  • Cdc2a
  • Cdk1
  • Cdkn1
  • Numa1
Rattus norvegicus (Norway rat)
CD28 dependent PI3K/Akt signaling
  • Akt1
  • Akt2
  • Akt3
  • Cd28
  • Cd80
  • Cd86
  • Frap1
  • Fyn
  • Gbl
  • Lck
  • Lst8
  • Map3k14
  • Map3k8
  • Mapkap1
  • Mip1
  • Mlst8
  • Mtor
  • Nipk
  • Pdk1
  • Pdpk1
  • Pik3ca
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Pik3r3
  • Protor1
  • Prr5
  • Raft1
  • Rictor
  • Sin1
  • Them4
  • Tpl2
  • Trib3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Acetylcholine Neurotransmitter Release Cycle
  • Bzrap1
  • Chat
  • Cht1
  • Cplx1
  • Ppfia1
  • Ppfia2
  • Ppfia3
  • Ppfia4
  • Rab3a
  • Rbp1
  • Rim1
  • Rims1
  • Sap
  • Slc18a3
  • Slc5a7
  • Snap
  • Snap25
  • Stx1a
  • Stxbp1
  • Syb2
  • Syt1
  • Tspoap1
  • Unc13b
  • Unc13h2
  • Unc18a
  • Vacht
  • Vamp2
  • Vat
Rattus norvegicus (Norway rat)
Thyroxine biosynthesis
  • Cga
  • Cga1
  • Dehal1
  • Duox1
  • Duox2
  • Iyd
  • Lnox2
  • Nis
  • Slc5a5
  • Thox2
  • Tpo
  • Tshb
Rattus norvegicus (Norway rat)
Role of phospholipids in phagocytosis
  • AABR07034730.2
  • AABR07060971.1
  • AABR07061001.1
  • AABR07065782.1
  • AABR07065808.1
  • AABR07065812.2
  • AABR07065813.1
  • Cd247
  • Cd3g
  • ENSRNOG00000062324
  • ENSRNOG00000062682
  • ENSRNOG00000062762
  • ENSRNOG00000062853
  • ENSRNOG00000062915
  • ENSRNOG00000062976
  • ENSRNOG00000063148
  • ENSRNOG00000063329
  • ENSRNOG00000063340
  • ENSRNOG00000063341
  • ENSRNOG00000063422
  • ENSRNOG00000063550
  • ENSRNOG00000063572
  • ENSRNOG00000063707
  • ENSRNOG00000063791
  • ENSRNOG00000064041
  • ENSRNOG00000064061
  • ENSRNOG00000064085
  • ENSRNOG00000064245
  • ENSRNOG00000064481
  • ENSRNOG00000064582
  • ENSRNOG00000065160
  • ENSRNOG00000065181
  • ENSRNOG00000065191
  • ENSRNOG00000065237
  • ENSRNOG00000065406
  • ENSRNOG00000065564
  • ENSRNOG00000065629
  • ENSRNOG00000065670
  • ENSRNOG00000065675
  • ENSRNOG00000065690
  • ENSRNOG00000065855
  • ENSRNOG00000066010
  • ENSRNOG00000066072
  • ENSRNOG00000066203
  • ENSRNOG00000066380
  • ENSRNOG00000066406
  • ENSRNOG00000066431
  • ENSRNOG00000066785
  • ENSRNOG00000066812
  • ENSRNOG00000066814
  • ENSRNOG00000066904
  • ENSRNOG00000066922
  • ENSRNOG00000066926
  • ENSRNOG00000066971
  • ENSRNOG00000067010
  • ENSRNOG00000067025
  • ENSRNOG00000067233
  • ENSRNOG00000067273
  • ENSRNOG00000067516
  • ENSRNOG00000067603
  • ENSRNOG00000067643
  • ENSRNOG00000067679
  • ENSRNOG00000067883
  • ENSRNOG00000068055
  • ENSRNOG00000068059
  • ENSRNOG00000068381
  • ENSRNOG00000068499
  • ENSRNOG00000068847
  • ENSRNOG00000069193
  • ENSRNOG00000069427
  • ENSRNOG00000069491
  • ENSRNOG00000069766
  • ENSRNOG00000069828
  • ENSRNOG00000069901
  • ENSRNOG00000069940
  • ENSRNOG00000070091
  • ENSRNOG00000070192
  • ENSRNOG00000070244
  • ENSRNOG00000070247
  • ENSRNOG00000070810
  • ENSRNOG00000070812
  • ENSRNOG00000070816
  • ENSRNOG00000070832
  • ENSRNOG00000070933
  • ENSRNOG00000071049
  • ENSRNOG00000071091
  • Fcgr1a
  • Fcgr2
  • Fcgr2b
  • Fcgr3a
  • Fcgr4
  • Igkv2-112l1
  • Igkv8-30l1
  • Igkvl-ps6
  • Igkvl10
  • Igkvl12
  • Igkvl13
  • Igkvl2
  • Iglc1
  • Igll1
  • LOC100363522
  • LOC100365500
  • LOC100911032
  • LOC102551948
  • LOC690813
  • Pik3ca
  • Pik3cb
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Pkcd
  • Pkce
  • Pla2g6
  • Plcg1
  • Plcg2
  • Pld1
  • Pld2
  • Pld3
  • Pld4
  • Plpp4
  • Plpp5
  • Pnpla9
  • Ppapdc1a
  • Prkcd
  • Prkce
  • RGD1561722
  • RGD1564696
  • Syk
Rattus norvegicus (Norway rat)
Ion influx/efflux at host-pathogen interface
  • Atox1
  • Atp7a
  • Bcg
  • Mnk
  • Nramp1
  • Pdzd11
  • Rah1
  • Slc11a1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Neurexins and neuroligins
  • Argbp2
  • Cask
  • Dap2
  • Dap3
  • Dap4
  • Dlg2
  • Dlg3
  • Dlg4
  • Dlgap1
  • Dlgap2
  • Dlgap3
  • Dlgap4
  • Dlgh2
  • Dlgh3
  • Dlgh4
  • Epb4.1l1
  • Epb4.1l5
  • Epb41
  • Epb41l1
  • Epb41l2
  • Epb41l5
  • Gkap
  • Gprc1a
  • Gprc1e
  • Grm1
  • Grm5
  • Homer
  • Homer1
  • Homer2
  • Homer3
  • Lrrtm1
  • Lrrtm2
  • Lrrtm3
  • Lrrtm4
  • Mglur1
  • Mglur5
  • Nlgn1
  • Nlgn2
  • Nlgn3
  • Nrxn1
  • Nrxn2
  • Nrxn3
  • Prosap2
  • Psd95
  • Sapap4
  • Shank1
  • Shank3
  • Sorbs2
  • Vesl
  • Vesl2
  • Vesl3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Beta-oxidation of very long chain fatty acids
  • Abcd1
  • Acaa1
  • Acaa1b
  • Acot4
  • Acot6
  • Acot8
  • Acox
  • Acox1
  • Decr2
  • Eci2
  • Edh17b4
  • Ehhadh
  • Hsd17b4
  • Mfe1
  • Mlycd
  • Peci
  • Pte1
Rattus norvegicus (Norway rat)
VLDL assembly
  • Apob
  • Apoc1
  • Apoc4
  • Ecl
  • Mtp
  • Mttp
  • P4hb
  • Pdia1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Interleukin-6 signaling
  • Cbl
  • Cish3
  • Il-6
  • Il6
  • Il6r
  • Il6ra
  • Il6st
  • Jak1
  • Jak2
  • Ptpn11
  • Socs3
  • Stat1
  • Stat3
  • Stat4
  • Tyk2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Beta-catenin phosphorylation cascade
  • Amer1
  • Apc
  • Axin
  • Axin1
  • Catnb
  • Csnk1a1
  • Ctnnb1
  • Frat1
  • Frat2
  • Gsk3b
  • LOC100909468
  • LOC679110
  • Ppp2ca
  • Ppp2cb
  • Ppp2r1a
  • Ppp2r1b
  • Ppp2r5a
  • Ppp2r5b
  • Ppp2r5c
  • Ppp2r5d
  • Ppp2r5e
Rattus norvegicus (Norway rat)
Translocation of ZAP-70 to Immunological synapse
  • AABR07044416.1
  • Arrb2-ps
  • Cd247
  • Cd3d
  • Cd3e
  • Cd3g
  • Cd4
  • DA1
  • Db2
  • ENSRNOG00000065769
  • ENSRNOG00000065908
  • ENSRNOG00000065955
  • ENSRNOG00000070909
  • H2-Ea
  • Hla-dma
  • Hla-dmb
  • LOC100911800
  • Lck
  • Psmb9
  • Ptpn22
  • RT1-Ba
  • RT1-Bb
  • RT1-DOb
  • RT1-Da
  • RT1-Db1
  • RT1-Db2
  • RT1-Ha
  • RT1-Hb-ps1
  • T3d
  • Tap1
  • Tap2
  • Tesb
  • Trbv16
  • Zap70
Rattus norvegicus (Norway rat)
Cytosolic sulfonation of small molecules
  • Abhd14b
  • Bpnt1
  • Bpnt2
  • Impa3
  • Impad1
  • Podxl2
  • Sal3
  • Smp2a
  • St1a1
  • St1b1
  • St2a1
  • St2a2
  • Sult1a1
  • Sult1b1
  • Sult1c2
  • Sult2a1
  • Sult2a2
  • Sult2a6
  • Sult2b1
  • Sult4a1
  • Sult6b1
  • Sultk1
  • Sultx3
  • Tpst1
  • Tpst2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Ubiquitin-dependent degradation of Cyclin D
  • Ccnd1
  • Cdk4
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mecl1
  • Mss1
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Ring12
  • Rps27a
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Amine ligand-binding receptors
  • Gpr143
  • Gpr58
  • Ta1
  • Ta10
  • Ta11
  • Ta3
  • Ta4
  • Taar1
  • Taar2
  • Taar3
  • Taar5
  • Taar6
  • Taar8a
  • Taar8c
  • Taar9
  • Tar1
  • Tar10
  • Tar11
  • Tar3
  • Tar4
  • Trar1
  • Trar10
  • Trar11
  • Trar3
  • Trar4
Rattus norvegicus (Norway rat)
GLI3 is processed to GLI3R by the proteasome
  • Btrc
  • Csnk1a1
  • Cul1
  • Gli3
  • Gsk3b
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mecl1
  • Mss1
  • Pkacb
  • Prkaca
  • Prkacb
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Rbx1
  • Ring12
  • Rps27a
  • Skp1
  • Skp1a
  • Sufu
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
ALPK1 signaling pathway
  • Alpk1
  • LOC100360645
  • Map3k7
  • Map3k7ip2
  • Rps27a
  • Tab1
  • Tab2
  • Tab3
  • Tifa
  • Traf6
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Last updated: August 19, 2024