GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1176 - 1200 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▲ Organism GlyTouCan ID
Activated NTRK2 signals through RAS
  • BDNF
  • HRAS
  • HRAS1
  • NRAS
  • NTF4
  • NTF5
  • NTRK2
  • SOS1
  • TRKB
Homo sapiens (human)
Activated NTRK2 signals through PLCG1
  • BDNF
  • NTF4
  • NTF5
  • NTRK2
  • PLC1
  • PLCG1
  • TRKB
Homo sapiens (human)
BDNF activates NTRK2 (TRKB) signaling
  • BDNF
  • NTRK2
  • TRKB
Homo sapiens (human)
RNA Polymerase III Abortive And Retractive Initiation
  • BDP1
  • BN51
  • BN51T
  • BRF
  • BRF1
  • BRF2
  • BRFU
  • C6orf51
  • CRCP
  • GTF2D1
  • GTF3A
  • GTF3B
  • GTF3C1
  • GTF3C2
  • GTF3C3
  • GTF3C4
  • GTF3C5
  • GTF3C6
  • KIAA0011
  • KIAA1241
  • KIAA1439
  • KIAA1452
  • KIAA1665
  • KIAA1689
  • NFI
  • NFIA
  • NFIB
  • NFIC
  • NFIX
  • OCT1
  • OTF1
  • POLR1C
  • POLR1D
  • POLR1E
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2H
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLR3A
  • POLR3B
  • POLR3C
  • POLR3D
  • POLR3E
  • POLR3F
  • POLR3G
  • POLR3GL
  • POLR3H
  • POLR3K
  • POLRF
  • POU2F1
  • RPC11
  • RPC8
  • SBF
  • SNAP19
  • SNAP190
  • SNAP43
  • SNAP45
  • SNAP50
  • SNAPC1
  • SNAPC2
  • SNAPC3
  • SNAPC4
  • SNAPC5
  • SSB
  • STAF
  • TAF3B2
  • TAF3C
  • TBP
  • TF2D
  • TFIID
  • TFNR
  • ZNF143
Homo sapiens (human)
RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 1 Promoter
  • BDP1
  • BN51
  • BN51T
  • BRF
  • BRF1
  • C6orf51
  • CRCP
  • GTF2D1
  • GTF3A
  • GTF3B
  • GTF3C1
  • GTF3C2
  • GTF3C3
  • GTF3C4
  • GTF3C5
  • GTF3C6
  • KIAA0011
  • KIAA1241
  • KIAA1452
  • KIAA1665
  • KIAA1689
  • POLR1C
  • POLR1D
  • POLR1E
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2H
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLR3A
  • POLR3B
  • POLR3C
  • POLR3D
  • POLR3E
  • POLR3F
  • POLR3G
  • POLR3GL
  • POLR3H
  • POLR3K
  • POLRF
  • RPC11
  • RPC8
  • TAF3B2
  • TAF3C
  • TBP
  • TF2D
  • TFIID
  • TFNR
Homo sapiens (human)
RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 2 Promoter
  • BDP1
  • BN51
  • BN51T
  • BRF
  • BRF1
  • C6orf51
  • CRCP
  • GTF2D1
  • GTF3B
  • GTF3C1
  • GTF3C2
  • GTF3C3
  • GTF3C4
  • GTF3C5
  • GTF3C6
  • KIAA0011
  • KIAA1241
  • KIAA1452
  • KIAA1665
  • KIAA1689
  • POLR1C
  • POLR1D
  • POLR1E
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2H
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLR3A
  • POLR3B
  • POLR3C
  • POLR3D
  • POLR3E
  • POLR3F
  • POLR3G
  • POLR3GL
  • POLR3H
  • POLR3K
  • POLRF
  • RPC11
  • RPC8
  • TAF3B2
  • TAF3C
  • TBP
  • TF2D
  • TFIID
  • TFNR
Homo sapiens (human)
RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 3 Promoter
  • BDP1
  • BN51
  • BN51T
  • BRF2
  • BRFU
  • CRCP
  • GTF2D1
  • KIAA1241
  • KIAA1452
  • KIAA1665
  • KIAA1689
  • OCT1
  • OTF1
  • POLR1C
  • POLR1D
  • POLR1E
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2H
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLR3A
  • POLR3B
  • POLR3C
  • POLR3D
  • POLR3E
  • POLR3F
  • POLR3G
  • POLR3GL
  • POLR3H
  • POLR3K
  • POLRF
  • POU2F1
  • RPC11
  • RPC8
  • SBF
  • SNAP19
  • SNAP190
  • SNAP43
  • SNAP45
  • SNAP50
  • SNAPC1
  • SNAPC2
  • SNAPC3
  • SNAPC4
  • SNAPC5
  • STAF
  • TBP
  • TF2D
  • TFIID
  • TFNR
  • ZNF143
Homo sapiens (human)
Downregulation of ERBB2 signaling
  • BDP1
  • BTC
  • CDC37
  • CDC37A
  • CHIP
  • CTK
  • CUL5
  • DTR
  • DTS
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB
  • ERBB1
  • ERBB2
  • ERBB2IP
  • ERBIN
  • EREG
  • GGF
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HER1
  • HER2
  • HGL
  • HRGA
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPC1
  • HSPCA
  • HYL
  • KIAA1225
  • LAP2
  • MATK
  • MLN19
  • NDF
  • NEU
  • NGL
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • NRG4
  • NTAK
  • PTPN12
  • PTPN18
  • RPS27A
  • SMDF
  • STUB1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VACM1
Homo sapiens (human)
Signaling by FGFR2 IIIa TM
  • BEK
  • CBP20
  • CBP80
  • FGF1
  • FGF2
  • FGFA
  • FGFB
  • FGFR2
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • KGFR
  • KSAM
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • RAP30
  • RAP74
  • RPB7
Homo sapiens (human)
Signaling by FGFR2 in disease
  • BEK
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF7
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FGFR2
  • FRS2
  • GAB1
  • GRB1
  • HRAS
  • HRAS1
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • INT2
  • KGF
  • KGFR
  • KS3
  • KSAM
  • NRAS
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PLC1
  • PLCG1
  • SOS1
Homo sapiens (human)
Activated point mutants of FGFR2
  • BEK
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF7
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FGFR2
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • INT2
  • KGF
  • KGFR
  • KS3
  • KSAM
Homo sapiens (human)
Signaling by FGFR2 amplification mutants
  • BEK
  • FGFR2
  • KGFR
  • KSAM
Homo sapiens (human)
Signaling by FGFR2 fusions
  • BEK
  • FGFR2
  • KGFR
  • KSAM
Homo sapiens (human)
NADE modulates death signalling
  • BEX3
  • CASP2
  • CASP3
  • CPP32
  • DXS6984E
  • ICH1
  • NADE
  • NEDD2
  • NGF
  • NGFB
  • NGFR
  • NGFRAP1
  • TNFRSF16
  • YWHAE
Homo sapiens (human)
Activation of C3 and C5
  • BF
  • BFD
  • C2
  • C3
  • C4A
  • C4B
  • C4B_2
  • C5
  • CFB
  • CO4
  • CPAMD1
  • CPAMD2
  • CPAMD3
  • CPAMD4
Homo sapiens (human)
Alternative complement activation
  • BF
  • BFD
  • C3
  • CFB
  • CFD
  • CPAMD1
  • DF
  • GZMM
  • MET1
  • PFD
Homo sapiens (human)
Formation of paraxial mesoderm
  • BFGFR
  • BMP2B
  • BMP4
  • CBP
  • CEK
  • CG1
  • CREBBP
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • CXorf6
  • DLL1
  • DLL3
  • DVR4
  • EP300
  • FGFBR
  • FGFR1
  • FLG
  • FLT2
  • GCN5
  • GCN5L2
  • HBGFR
  • IGKJRB
  • IGKJRB1
  • KAT2A
  • KAT2B
  • KIAA0200
  • KIAA1816
  • KIAA1819
  • LEF1
  • MAML1
  • MAML2
  • MAML3
  • MAMLD1
  • MSGN1
  • NOG
  • NOTCH1
  • P300
  • PCAF
  • RBPJ
  • RBPJK
  • RBPSUH
  • SKIIP
  • SKIP
  • SNW1
  • T
  • TAN1
  • TBX6
  • TBXT
  • WNT3A
Homo sapiens (human)
Epithelial-Mesenchymal Transition (EMT) during gastrulation
  • BFGFR
  • CEK
  • EOMES
  • FGFBR
  • FGFR1
  • FLG
  • FLT2
  • HBGFR
  • SNAH
  • SNAI1
  • T
  • TBR2
  • TBXT
Homo sapiens (human)
Signaling by activated point mutants of FGFR1
  • BFGFR
  • CEK
  • FGF1
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FGFBR
  • FGFR1
  • FLG
  • FLT2
  • HBGFR
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • KS3
Homo sapiens (human)
Fibronectin matrix formation
  • BGP
  • BGP1
  • CEACAM1
  • CEACAM6
  • CEACAM8
  • CGM6
  • FN
  • FN1
  • FNRA
  • FNRB
  • ITGA5
  • ITGB1
  • MDF2
  • MSK12
  • NCA
Homo sapiens (human)
Regulation of MITF-M dependent genes involved in invasion
  • BGP
  • BGP1
  • CEACAM1
  • DIAP1
  • DIAPH1
  • GMPR
  • GMPR1
Homo sapiens (human)
Reuptake of GABA
  • BGT1
  • GABATR
  • GABT1
  • GABT3
  • GAT1
  • GAT2
  • GAT3
  • SLC6A1
  • SLC6A11
  • SLC6A12
  • SLC6A13
Homo sapiens (human)
Regulation of gene expression in early pancreatic precursor cells
  • BHLHA29
  • FGF10
  • HNF1B
  • HNF6
  • HNF6A
  • IPF1
  • NKX6-1
  • NKX6A
  • ONECUT1
  • ONECUT3
  • PDX1
  • PTF1A
  • PTF1P48
  • STF1
  • TCF2
Homo sapiens (human)
Formation of the nephric duct
  • BHLHB27
  • BMP2B
  • BMP4
  • CDHF12
  • CDHR16
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • DVR4
  • EGFL6L
  • EMX2
  • EVI1
  • FGF2
  • FGFB
  • GATA3
  • HE4
  • HOX1B
  • HOX2F
  • HOXA6
  • HOXB4
  • ID4
  • KIAA1313
  • LHX1
  • LIM-1
  • LIM1
  • MDS1
  • MECOM
  • NPNT
  • ODD
  • OSR1
  • PAX2
  • PAX8
  • PCDH19
  • PLAC8
  • POEM
  • PRDM3
  • PTC
  • RET
  • WAP5
  • WFDC2
Homo sapiens (human)
NOTCH3 Intracellular Domain Regulates Transcription
  • BHLHB31
  • BHLHB32
  • BHLHB33
  • BHLHB38
  • BHLHB39
  • BLBP
  • CBP
  • CG1
  • CHF1
  • CHF2
  • CREBBP
  • CXorf6
  • DLG7
  • DLGAP5
  • EP300
  • FABP7
  • FABPB
  • GCN5
  • GCN5L2
  • GRL
  • HERP
  • HERP1
  • HERP2
  • HES1
  • HES5
  • HESR1
  • HEY1
  • HEY2
  • HEYL
  • HL
  • HRT1
  • HRT2
  • HRT3
  • HRY
  • IGKJRB
  • IGKJRB1
  • KAT2A
  • KAT2B
  • KIAA0008
  • KIAA0200
  • KIAA0620
  • KIAA0869
  • KIAA1816
  • KIAA1819
  • KIBRA
  • MAML1
  • MAML2
  • MAML3
  • MAMLD1
  • MRG
  • NOTCH1
  • NOTCH3
  • P300
  • PBX1
  • PCAF
  • PLXND1
  • PRL
  • PTCRA
  • RBPJ
  • RBPJK
  • RBPSUH
  • SKIIP
  • SKIP
  • SNW1
  • STAT1
  • TAN1
  • WWC1
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024