GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 2001 - 2025 of 2090 in total
Pathway Name ▲ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
VLDL assembly
  • APOB
  • APOC1
  • APOC4
  • ERBA2L
  • MTP
  • MTTP
  • P4HB
  • PDI
  • PDIA1
  • PO4DB
Homo sapiens (human)
VLDL clearance
  • APOB
  • APOB48R
  • APOBR
  • APOC1
  • APOC4
  • ILDR3
  • LISCH
  • LSR
  • VLDLR
Homo sapiens (human)
VLDLR internalisation and degradation
  • ADTAA
  • ADTAB
  • ADTB2
  • AP17
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • BZF1
  • CLAPA1
  • CLAPA2
  • CLAPB1
  • CLAPM1
  • CLAPS2
  • CLH17
  • CLTA
  • CLTC
  • CLTCL2
  • HIP9
  • HYPJ
  • IDOL
  • KIAA0034
  • KIAA0109
  • KIAA0899
  • LXRA
  • LXRB
  • MYLIP
  • NARC1
  • NER
  • NR1H2
  • NR1H3
  • PCSK9
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UNR
  • VLDLR
Homo sapiens (human)
Variant SLC6A14 may confer susceptibility towards obesity
  • SLC6A14
Homo sapiens (human)
Variant SLC6A20 contributes towards hyperglycinuria (HG) and iminoglycinuria (IG)
  • SIT1
  • SLC6A20
  • XT3
  • XTRP3
Homo sapiens (human)
Variant SLC6A20 contributes towards hyperglycinuria (HG) and iminoglycinuria (IG)
  • SIT1
  • SLC6A20
  • XT3
  • XTRP3
Homo sapiens (human)
Vasopressin regulates renal water homeostasis via Aquaporins
  • ADCY1
  • ADCY2
  • ADCY3
  • ADCY4
  • ADCY5
  • ADCY6
  • ADCY7
  • ADCY8
  • ADCY9
  • ADHR
  • AQP1
  • AQP2
  • AQP3
  • AQP4
  • ARVP
  • AVP
  • AVPR2
  • CHIP28
  • DIR
  • DIR3
  • GNAS
  • GNAS1
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT1
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNGT9
  • GSP
  • KIAA0037
  • KIAA0422
  • KIAA0511
  • KIAA0520
  • KIAA0941
  • KIAA1060
  • KIAA1119
  • MYO5B
  • PKACA
  • PKR1
  • PKR2
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • PRKAR1
  • PRKAR1A
  • PRKAR1B
  • PRKAR2
  • PRKAR2A
  • PRKAR2B
  • RAB11
  • RAB11A
  • RAB11FIP2
  • TSE1
  • V2R
  • VP
Homo sapiens (human)
Vasopressin-like receptors
  • ADHR
  • ARVP
  • AVP
  • AVPR1
  • AVPR1A
  • AVPR1B
  • AVPR2
  • AVPR3
  • DIR
  • DIR3
  • OT
  • OXT
  • OXTR
  • V2R
  • VP
  • VPR3
Homo sapiens (human)
Vif-mediated degradation of APOBEC3G
  • C7orf76
  • CUL5
  • DSS1
  • ELOB
  • ELOC
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • IFI5111
  • KIAA0072
  • KIAA0077
  • KIAA0107
  • LMP10
  • LMP2
  • LMP7
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MCB1
  • MECL1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NU
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA7L
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB11
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB5i
  • PSMB6
  • PSMB6i
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD10
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSME4
  • PSMF1
  • RBX1
  • RING10
  • RING12
  • RNF75
  • ROC1
  • RPS27A
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • TCEB1
  • TCEB2
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VACM1
  • X
  • Y
  • Y2
  • Z
  • vif
Homo sapiens (human)
Viral Messenger RNA Synthesis
  • AAAS
  • ADRACALA
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CG1
  • D3S1231E
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • KIAA0023
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • MP44
  • MRNP41
  • NDC1
  • NP
  • NPAP60L
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • PA
  • PB1
  • PB2
  • PCNT1
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • RAE1
  • RANBP2
  • RAP30
  • RAP74
  • RPB7
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • TMEM48
  • TPR
Homo sapiens (human)
Viral RNP Complexes in the Host Cell Nucleus
  • HSP72
  • HSPA1
  • HSPA1A
  • HSX70
  • M
  • NP
  • NS
  • PA
  • PB1
  • PB2
Homo sapiens (human)
Viral mRNA Translation
  • BBC1
  • CCG2
  • D11S2243E
  • D6S218E
  • DNAJC3
  • DXS648E
  • EC45
  • FAU
  • FTE1
  • GRSF1
  • HA
  • LAMBR
  • LAMR1
  • M
  • MFTL
  • MPS1
  • NA
  • NEDD6
  • NP
  • NS
  • P58IPK
  • PA
  • PB1
  • PB2
  • PRKRI
  • QM
  • RIG
  • RPL1
  • RPL10
  • RPL10A
  • RPL10L
  • RPL11
  • RPL12
  • RPL13
  • RPL13A
  • RPL14
  • RPL15
  • RPL17
  • RPL18
  • RPL18A
  • RPL19
  • RPL21
  • RPL22
  • RPL22L1
  • RPL23
  • RPL23A
  • RPL24
  • RPL26
  • RPL26L1
  • RPL26P1
  • RPL27
  • RPL27A
  • RPL28
  • RPL29
  • RPL3
  • RPL30
  • RPL31
  • RPL32
  • RPL34
  • RPL35
  • RPL35A
  • RPL36
  • RPL36A
  • RPL36AL
  • RPL37
  • RPL37A
  • RPL38
  • RPL39
  • RPL39L
  • RPL39L1
  • RPL3L
  • RPL4
  • RPL41
  • RPL44
  • RPL5
  • RPL6
  • RPL7
  • RPL7A
  • RPL8
  • RPL9
  • RPL9P7
  • RPL9P8
  • RPL9P9
  • RPLP0
  • RPLP1
  • RPLP2
  • RPP2
  • RPS10
  • RPS11
  • RPS12
  • RPS13
  • RPS14
  • RPS15
  • RPS15A
  • RPS16
  • RPS17
  • RPS17L
  • RPS18
  • RPS19
  • RPS2
  • RPS20
  • RPS21
  • RPS23
  • RPS24
  • RPS25
  • RPS26
  • RPS27
  • RPS27A
  • RPS27L
  • RPS28
  • RPS29
  • RPS3
  • RPS3A
  • RPS4
  • RPS4X
  • RPS4Y
  • RPS4Y1
  • RPS4Y2
  • RPS4Y2P
  • RPS5
  • RPS6
  • RPS7
  • RPS8
  • RPS9
  • RPSA
  • RRP1
  • SCAR
  • SURF-3
  • SURF3
  • TXREB1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Virion Assembly and Release
  • 3a
  • 7a
  • E
  • M
  • N
  • S
Homo sapiens (human)
Virion Assembly and Release
  • 3a
  • 7a
  • E
  • M
  • N
  • S
  • sM
Homo sapiens (human)
Vitamin B1 (thiamin) metabolism
  • DNC
  • MUP1
  • SLC19A2
  • SLC19A3
  • SLC25A19
  • THT1
  • THTPA
  • TPK1
  • TRMA
Homo sapiens (human)
Vitamin B2 (riboflavin) metabolism
  • ACP5
  • C20orf54
  • ENPP1
  • FLAD1
  • GPR172A
  • GPR172B
  • M6S1
  • NPPS
  • PAR1
  • PAR2
  • PC1
  • PDNP1
  • RFK
  • RFT1
  • RFT2
  • RFT3
  • RFVT3
  • SLC52A1
  • SLC52A2
  • SLC52A3
Homo sapiens (human)
Vitamin B5 (pantothenate) metabolism
  • AASDHPPT
  • AIPP1
  • ATX
  • ENPP1
  • ENPP2
  • ENPP3
  • FAS
  • FASN
  • GDA
  • M6S1
  • NPPS
  • NUDT8
  • PANK4
  • PC1
  • PDNP1
  • PDNP2
  • PDNP3
  • PDZD11
  • PDZK11
  • PISP
  • SLC25A16
  • SLC25A42
  • SLC5A6
  • SMVT
  • VNN1
  • VNN2
Homo sapiens (human)
Vitamin B6 activation to pyridoxal phosphate
  • AO
  • AOX1
  • C21orf124
  • C21orf97
  • PDXK
  • PKH
  • PNK
  • PNPO
Homo sapiens (human)
Vitamin C (ascorbate) metabolism
  • CYB5
  • CYB5A
  • CYB5R3
  • DIA1
  • GLUT1
  • GLUT3
  • GSTO1
  • GSTO2
  • GSTTLP28
  • KIAA0238
  • NBTL1
  • SLC23A1
  • SLC23A2
  • SLC2A1
  • SLC2A3
  • SVCT1
  • SVCT2
  • YSPL2
  • YSPL3
Homo sapiens (human)
Vitamin D (calciferol) metabolism
  • ARH
  • CUBN
  • CYP1ALPHA
  • CYP24
  • CYP24A1
  • CYP27B
  • CYP27B1
  • CYP2R1
  • GC
  • IFCR
  • LDLRAP1
  • LGMN
  • LRP2
  • NR1I1
  • PIAS4
  • PIASG
  • PRSC1
  • SMT3B
  • SMT3H2
  • SUMO2
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBE2I
  • VDR
Homo sapiens (human)
Voltage gated Potassium channels
  • C1orf30
  • EAG
  • EAG1
  • EAG2
  • ERG
  • ERG1
  • ERG2
  • ERG3
  • HERG
  • HGK5
  • KCNA1
  • KCNA10
  • KCNA1B
  • KCNA2
  • KCNA2B
  • KCNA3
  • KCNA3B
  • KCNA4
  • KCNA4L
  • KCNA5
  • KCNA6
  • KCNA7
  • KCNA8
  • KCNA9
  • KCNAB1
  • KCNAB2
  • KCNAB3
  • KCNB1
  • KCNB2
  • KCNC1
  • KCNC2
  • KCNC3
  • KCNC4
  • KCND1
  • KCND2
  • KCND3
  • KCNF1
  • KCNF2
  • KCNG1
  • KCNG2
  • KCNG3
  • KCNG4
  • KCNH1
  • KCNH2
  • KCNH3
  • KCNH4
  • KCNH5
  • KCNH6
  • KCNH7
  • KCNH8
  • KCNK2
  • KCNQ1
  • KCNQ2
  • KCNQ3
  • KCNQ4
  • KCNQ5
  • KCNS1
  • KCNS2
  • KCNS3
  • KCNV1
  • KCNV2
  • KIAA1044
  • KIAA1144
  • KIAA1282
  • KVLQT1
Homo sapiens (human)
Vpr-mediated induction of apoptosis by mitochondrial outer membrane permeabilization
  • AAC1
  • AAC2
  • AAC3
  • ANT1
  • ANT2
  • ANT3
  • SLC25A4
  • SLC25A5
  • SLC25A6
  • vpr
Homo sapiens (human)
Vpr-mediated nuclear import of PICs
  • AAAS
  • ADRACALA
  • BAF
  • BANF1
  • BCRG1
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CG1
  • D3S1231E
  • DFS70
  • HMGA1
  • HMGIY
  • KIAA0023
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • KPNA1
  • LEDGF
  • MP44
  • MRNP41
  • NDC1
  • NPAP60L
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • PCNT1
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • PSIP1
  • PSIP2
  • RAE1
  • RANBP2
  • RCH2
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • TMEM48
  • TPR
  • gag
  • gag-pol
  • rev
  • vif
  • vpr
  • vpu
Homo sapiens (human)
Vpu mediated degradation of CD4
  • BTRC
  • BTRCP
  • C7orf76
  • CD4
  • DSS1
  • EMC19
  • FBW1A
  • FBXW1A
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • IFI5111
  • KIAA0072
  • KIAA0077
  • KIAA0107
  • LMP10
  • LMP2
  • LMP7
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MCB1
  • MECL1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NU
  • OCP2
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA7L
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB11
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB5i
  • PSMB6
  • PSMB6i
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD10
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSME4
  • PSMF1
  • RING10
  • RING12
  • RPS27A
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SKP1
  • SKP1A
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • TCEB1L
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • X
  • Y
  • Y2
  • Z
  • vpu
Homo sapiens (human)
VxPx cargo-targeting to cilium
  • ARF2
  • ARF4
  • ARFO1
  • ASAP1
  • CNCA
  • CNCA1
  • CNCG2
  • CNCG3L
  • CNCG4
  • CNGA2
  • CNGA4
  • CNGB1
  • DDEF1
  • EXO70
  • EXOC1
  • EXOC2
  • EXOC3
  • EXOC4
  • EXOC5
  • EXOC6
  • EXOC7
  • EXOC8
  • GBF1
  • KIAA0248
  • KIAA0665
  • KIAA1067
  • KIAA1249
  • KIAA1699
  • MEL
  • OPN2
  • PAG2
  • PKD1
  • PKD2
  • RAB11
  • RAB11A
  • RAB11FIP3
  • RAB3IP
  • RAB8
  • RAB8A
  • RABIN8
  • RCNC2
  • RHO
  • SEC10
  • SEC10L1
  • SEC15A
  • SEC15L
  • SEC15L1
  • SEC3
  • SEC3L1
  • SEC5
  • SEC5L1
  • SEC6
  • SEC6L1
  • SEC8
  • SEC8L1
  • TRPP2
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024