GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 2076 - 2090 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▼
Pexophagy
  • 1A13B
  • ATM
  • BHLHE73
  • EPAS1
  • HIF2A
  • KIAA0049
  • M17S2
  • MAP1ALC3
  • MAP1LC3B
  • MOP2
  • NBR1
  • ORCA
  • OSIL
  • PASD2
  • PEX5
  • PXR1
  • RPS27A
  • SQSTM1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • USP30
Homo sapiens (human)
Gamma carboxylation, hypusinylation, hydroxylation, and arylsulfatase activation
  • F8
  • F8C
  • FN3K
  • FN3KRP
  • ICMT
  • PCCMT
  • TPST1
  • TPST2
Homo sapiens (human)
Synthesis of glycosylphosphatidylinositol (GPI)
  • DCRC
  • DPM2
  • DSCR5
  • DSCRC
  • GPI2
  • GPI7
  • MCD4
  • PIGA
  • PIGB
  • PIGC
  • PIGF
  • PIGG
  • PIGH
  • PIGL
  • PIGM
  • PIGN
  • PIGO
  • PIGP
  • PIGV
  • PIGW
  • PIGX
  • PIGY
  • PIGZ
  • SMP3
Homo sapiens (human)
Degradation of beta-catenin by the destruction complex
  • AMER1
  • APC
  • AXIN
  • AXIN1
  • BTRC
  • BTRCP
  • C7orf76
  • CSNK1A1
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • CUL1
  • DP2.5
  • DSS1
  • EMC19
  • FAM123B
  • FBW1A
  • FBXW1A
  • GSK3B
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • IFI5111
  • KIAA0044
  • KIAA0072
  • KIAA0077
  • KIAA0107
  • LMP10
  • LMP2
  • LMP7
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MCB1
  • MECL1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NU
  • OCP2
  • PFAAP4
  • POH1
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA7L
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB11
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB5i
  • PSMB6
  • PSMB6i
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD10
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSME4
  • PSMF1
  • RBX1
  • RING10
  • RING12
  • RNF75
  • ROC1
  • RPS27A
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SKP1
  • SKP1A
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • TCEB1L
  • TRABID
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • WTX
  • X
  • Y
  • Y2
  • Z
  • ZRANB1
Homo sapiens (human)
Defective SLC6A3 causes Parkinsonism-dystonia infantile (PKDYS)
  • DAT1
  • SLC6A3
Homo sapiens (human)
Rev-mediated nuclear export of HIV RNA
  • AAAS
  • ADRACALA
  • ARA24
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CG1
  • CHC1
  • CRM1
  • D3S1231E
  • KIAA0023
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • KIAA1835
  • MP44
  • MRNP41
  • NDC1
  • NPAP60L
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • PCNT1
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • RAE1
  • RAN
  • RANBP1
  • RANBP2
  • RANGAP1
  • RCC1
  • SD
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • TMEM48
  • TPR
  • XPO1
  • rev
Homo sapiens (human)
GTP hydrolysis and joining of the 60S ribosomal subunit
  • BBC1
  • CCG2
  • D11S2243E
  • D6S218E
  • DDX2A
  • DDX2B
  • DXS648E
  • EC45
  • EIF1A
  • EIF1AX
  • EIF2A
  • EIF2B
  • EIF2G
  • EIF2S1
  • EIF2S2
  • EIF2S3
  • EIF3A
  • EIF3B
  • EIF3C
  • EIF3D
  • EIF3E
  • EIF3EIP
  • EIF3F
  • EIF3G
  • EIF3H
  • EIF3I
  • EIF3J
  • EIF3K
  • EIF3L
  • EIF3M
  • EIF3S1
  • EIF3S10
  • EIF3S12
  • EIF3S2
  • EIF3S3
  • EIF3S4
  • EIF3S5
  • EIF3S6
  • EIF3S6IP
  • EIF3S7
  • EIF3S8
  • EIF3S9
  • EIF4A
  • EIF4A1
  • EIF4A2
  • EIF4B
  • EIF4C
  • EIF4E
  • EIF4EL1
  • EIF4F
  • EIF4G
  • EIF4G1
  • EIF4GI
  • EIF4H
  • EIF5
  • EIF5B
  • FAU
  • FTE1
  • HFLB5
  • IF2
  • INT6
  • KIAA0038
  • KIAA0139
  • KIAA0741
  • LAMBR
  • LAMR1
  • MFTL
  • MPS1
  • NEDD6
  • PCID1
  • QM
  • RIG
  • RPL1
  • RPL10
  • RPL10A
  • RPL10L
  • RPL11
  • RPL12
  • RPL13
  • RPL13A
  • RPL14
  • RPL15
  • RPL17
  • RPL18
  • RPL18A
  • RPL19
  • RPL21
  • RPL22
  • RPL22L1
  • RPL23
  • RPL23A
  • RPL24
  • RPL26
  • RPL26L1
  • RPL26P1
  • RPL27
  • RPL27A
  • RPL28
  • RPL29
  • RPL3
  • RPL30
  • RPL31
  • RPL32
  • RPL34
  • RPL35
  • RPL35A
  • RPL36
  • RPL36A
  • RPL36AL
  • RPL37
  • RPL37A
  • RPL38
  • RPL39
  • RPL39L
  • RPL39L1
  • RPL3L
  • RPL4
  • RPL41
  • RPL44
  • RPL5
  • RPL6
  • RPL7
  • RPL7A
  • RPL8
  • RPL9
  • RPL9P7
  • RPL9P8
  • RPL9P9
  • RPLP0
  • RPLP1
  • RPLP2
  • RPP2
  • RPS10
  • RPS11
  • RPS12
  • RPS13
  • RPS14
  • RPS15
  • RPS15A
  • RPS16
  • RPS17
  • RPS17L
  • RPS18
  • RPS19
  • RPS2
  • RPS20
  • RPS21
  • RPS23
  • RPS24
  • RPS25
  • RPS26
  • RPS27
  • RPS27A
  • RPS27L
  • RPS28
  • RPS29
  • RPS3
  • RPS3A
  • RPS4
  • RPS4X
  • RPS4Y
  • RPS4Y1
  • RPS4Y2
  • RPS4Y2P
  • RPS5
  • RPS6
  • RPS7
  • RPS8
  • RPS9
  • RPSA
  • RRP1
  • SCAR
  • SURF-3
  • SURF3
  • TRIP1
  • TXREB1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • WBSCR1
  • WSCR1
Homo sapiens (human)
brigatinib-resistant ALK mutants
  • ALK
Homo sapiens (human)
Cellular response to hypoxia
  • BHLHE73
  • BHLHE78
  • EPAS1
  • FIH1
  • HIF1A
  • HIF1AN
  • HIF2A
  • MOP1
  • MOP2
  • PASD2
  • PASD8
Homo sapiens (human)
Long-term potentiation
  • ACTN2
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • DLG1
  • DLG2
  • DLG3
  • DLG4
  • GGF
  • GLUA1
  • GLUH1
  • GLUR1
  • GLUR2
  • GRIA1
  • GRIA2
  • GRIN1
  • GRIN2A
  • GRIN2B
  • GRIN2C
  • GRIN2D
  • GluA2
  • GluN2D
  • HGL
  • HRGA
  • KIAA0968
  • KIAA1232
  • KIAA1365
  • LAP1
  • LRRC7
  • NDF
  • NEFL
  • NF68
  • NFL
  • NMDAR1
  • NMDAR2A
  • NMDAR2B
  • NMDAR2C
  • NMDAR2D
  • NRG1
  • NRGN
  • PSD95
  • SMDF
  • SRC
  • SRC1
Homo sapiens (human)
Antigen activates B Cell Receptor (BCR) leading to generation of second messengers
  • AGMX1
  • AHCYL1
  • ATK
  • B29
  • BAM32
  • BASH
  • BCAP
  • BLK
  • BLNK
  • BPK
  • BTK
  • C7orf19
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CBCIP2
  • CD19
  • CD22
  • CD79A
  • CD79B
  • CIN85
  • CRACM1
  • DAPP1
  • DCAL
  • FYN
  • GOK
  • GRB1
  • HCP
  • IGA
  • IGB
  • IGHD
  • IGHM
  • IGHV
  • IGHV1-2
  • IGHV1-46
  • IGHV1-69
  • IGHV2-5
  • IGHV2-70
  • IGHV3-11
  • IGHV3-13
  • IGHV3-23
  • IGHV3-30
  • IGHV3-33
  • IGHV3-48
  • IGHV3-53
  • IGHV3-7
  • IGHV3-9
  • IGHV4-34
  • IGHV4-39
  • IGHV4-59
  • IGHV7-81
  • IGKC
  • IGKV1-12
  • IGKV1-16
  • IGKV1-17
  • IGKV1-33
  • IGKV1-39
  • IGKV1-5
  • IGKV1D-12
  • IGKV1D-16
  • IGKV1D-33
  • IGKV1D-39
  • IGKV2-28
  • IGKV2-29
  • IGKV2-30
  • IGKV2D-28
  • IGKV2D-30
  • IGKV2D-40
  • IGKV3-11
  • IGKV3-15
  • IGKV3-20
  • IGKV3D-20
  • IGKV4-1
  • IGKV5-2
  • IGLC1
  • IGLC2
  • IGLC3
  • IGLC6
  • IGLC7
  • IGLV
  • IGLV1-40
  • IGLV1-44
  • IGLV1-47
  • IGLV1-51
  • IGLV2-11
  • IGLV2-14
  • IGLV2-23
  • IGLV2-8
  • IGLV3-1
  • IGLV3-19
  • IGLV3-21
  • IGLV3-25
  • IGLV3-27
  • IGLV6-57
  • IGLV7-43
  • INSP3R1
  • IRBIT
  • ITPR1
  • ITPR2
  • ITPR3
  • JTK8
  • LYN
  • MB1
  • NCK
  • NCK1
  • ORAI1
  • ORAI2
  • PIK3AP1
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PLCG2
  • PTP1C
  • PTPN6
  • SH3KBP1
  • SIGLEC2
  • SLP65
  • SOS1
  • STIM1
  • SYK
  • TMEM142A
  • TMEM142B
  • TRP1
  • TRPC1
  • VAV
  • VAV1
  • XPVKONA
Homo sapiens (human)
Frs2-mediated activation
  • BRAF
  • BRAF1
  • CRKL
  • ERK1
  • ERK2
  • FRS2
  • GRF2
  • KREV1
  • MAP2K1
  • MAP2K2
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MEK1
  • MEK2
  • MKK2
  • NGF
  • NGFB
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PRKMK1
  • PRKMK2
  • RAFB1
  • RAP1A
  • RAPGEF1
  • YWHAB
Homo sapiens (human)
POU5F1 (OCT4), SOX2, NANOG activate genes related to proliferation
  • APRF
  • CRIPTO
  • CRIPTO-1
  • DPPA4
  • EPH
  • EPHA1
  • EPHT
  • EPHT1
  • FGF2
  • FGFB
  • FOXD3
  • HFH2
  • NANOG
  • OCT3
  • OCT4
  • OTF3
  • POU5F1
  • SAL1
  • SALL1
  • SALL4
  • SOX2
  • STAT3
  • TDGF1
  • ZIC3
  • ZNF203
  • ZNF794
  • ZNF797
Homo sapiens (human)
Mitochondrial protein degradation
  • 15E1.1
  • AAC2
  • AAC3
  • ACAD8
  • ACADSB
  • ACAT
  • ACAT1
  • ACO2
  • ACOT2
  • AFG3L2
  • ALAS1
  • ALAS3
  • ALASH
  • ALDH18A1
  • ALDH1B1
  • ALDH2
  • ALDH5
  • ALDHX
  • ALDM
  • ANT2
  • ANT3
  • ARC42
  • ARG2
  • ATP5A
  • ATP5A1
  • ATP5AL2
  • ATP5B
  • ATP5C
  • ATP5C1
  • ATP5CL1
  • ATP5F1A
  • ATP5F1B
  • ATP5F1C
  • ATP5H
  • ATP5J
  • ATP5L
  • ATP5MG
  • ATP5O
  • ATP5PD
  • ATP5PF
  • ATP5PO
  • ATP6
  • ATPASE6
  • ATPM
  • ATPMB
  • ATPO
  • ATPSB
  • BCATE2
  • BCKDHE2
  • BDH
  • BDH1
  • C10orf2
  • C22orf32
  • C5orf33
  • C7orf17
  • CAR
  • CHCHD2
  • CLPP
  • CLPX
  • CMAR
  • COI
  • COII
  • COX2
  • COX4
  • COX4I1
  • COX5A
  • COX5B
  • COXI
  • COXII
  • CS
  • DBT
  • DCI
  • DLD
  • ECH1
  • ECI1
  • EFHA1
  • EMRE
  • ERAB
  • FECH
  • FH
  • FTSH1
  • GCSL
  • GLUD
  • GLUD1
  • GRIM19
  • GRP75
  • GSAS
  • GTT1
  • HAD
  • HAD1
  • HADH
  • HADH2
  • HADHSC
  • HMGCS2
  • HSD17B10
  • HSP60
  • HSPA9
  • HSPA9B
  • HSPD1
  • HTRA2
  • IARS2
  • IBD
  • IDH2
  • IDH3A
  • INPP5E
  • KIAA0123
  • KIAA0567
  • LAD
  • LDHD
  • LONP1
  • MAT
  • MDH2
  • ME2
  • MICU2
  • MIMT17
  • MNADK
  • MPPA
  • MPRP1
  • MRPL12
  • MRPL32
  • MRPL7
  • MRPP2
  • MRPS10
  • MRPS2
  • MT-ATP6
  • MT-CO1
  • MT-CO2
  • MT-ND1
  • MT-ND2
  • MT-ND5
  • MT-ND6
  • MTATP6
  • MTCO1
  • MTCO2
  • MTND1
  • MTND2
  • MTND5
  • MTND6
  • NADH1
  • NADH2
  • NADH5
  • NADH6
  • NADK2
  • NADKD1
  • ND1
  • ND2
  • ND5
  • ND6
  • NDUFA13
  • NDUFA2
  • NDUFB6
  • NDUFS1
  • NDUFS3
  • NDUFV1
  • NDUFV3
  • OGDH
  • OMA1
  • OMI
  • OPA1
  • OXCT
  • OXCT1
  • OXSM
  • P5CS
  • PCCB
  • PDHA1
  • PDHB
  • PDHK1
  • PDK1
  • PEO1
  • PGN
  • PHE1A
  • PHE1B
  • PHE3
  • PKACA
  • PMPCA
  • PRELI
  • PRELID1
  • PRKACA
  • PRSS15
  • PRSS25
  • PTE2
  • PTE2A
  • PYCS
  • RPML12
  • SCHAD
  • SCOT
  • SDR5C1
  • SDR9C1
  • SHMT2
  • SLC25A5
  • SLC25A6
  • SMDT1
  • SPG7
  • SSBP
  • SSBP1
  • STAR
  • STARD1
  • STARD7
  • SUCLG2
  • TCF6
  • TCF6L2
  • TEX4
  • TFAM
  • TIM10
  • TIM17
  • TIM17A
  • TIM22
  • TIM9
  • TIM9A
  • TIMM10
  • TIMM17
  • TIMM17A
  • TIMM22
  • TIMM9
  • TIMM9A
  • TRIAP1
  • TWNK
  • UQCRC2
  • UQCRQ
  • UQOR1
  • XH98G2
  • YME1L
  • YME1L1
  • mt-HSP70
Homo sapiens (human)
Beta oxidation of butanoyl-CoA to acetyl-CoA
  • ACADS
  • ACSM3
  • ACSM6
  • C10orf129
  • ECHS1
  • HAD
  • HAD1
  • HADH
  • HADHSC
  • SAH
  • SCHAD
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024