GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 826 - 850 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name ▼ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Recycling pathway of L1
  • Adtab
  • Ap17
  • Ap2a1
  • Ap2a2
  • Ap2b1
  • Ap2m1
  • Ap2s1
  • Caml1
  • Clapb1
  • Claps2
  • Clta
  • Cltc
  • Dnm
  • Dnm1
  • Dnm2
  • Dnm3
  • Dpysl2
  • Dyn2
  • Dyn3
  • Erk2
  • Ezr
  • Kif4a
  • Kif4b
  • L1cam
  • Mapk
  • Mapk1
  • Msn
  • Numb
  • Prkm1
  • Rdx
  • Sh3d2a
  • Sh3gl2
  • Sh3p4
  • Src
  • Vil2
Rattus norvegicus (Norway rat)
WNT5A-dependent internalization of FZD2, FZD5 and ROR2
  • Adtab
  • Ap17
  • Ap2a1
  • Ap2a2
  • Ap2b1
  • Ap2m1
  • Ap2s1
  • Clapb1
  • Claps2
  • Clta
  • Cltb
  • Cltc
  • Fzd2
  • Fzd5
  • Ror1
  • Ror2
  • Wnt-5a
  • Wnt5a
Rattus norvegicus (Norway rat)
Retrograde neurotrophin signalling
  • Adtab
  • Ap17
  • Ap2a1
  • Ap2a2
  • Ap2b1
  • Ap2m1
  • Ap2s1
  • Clapb1
  • Claps2
  • Clta
  • Cltc
  • Dnal4
  • Ngf
  • Ngfb
  • Ntrk1
  • Sh3d2a
  • Sh3gl2
  • Sh3p4
  • Trk
  • Trka
Rattus norvegicus (Norway rat)
WNT5A-dependent internalization of FZD4
  • Adtab
  • Ap17
  • Ap2a1
  • Ap2a2
  • Ap2b1
  • Ap2m1
  • Ap2s1
  • Arrb2
  • Clapb1
  • Claps2
  • Clta
  • Cltb
  • Cltc
  • Dvl2
  • Fzd4
  • LOC100361515
  • Pkca
  • Pkcb
  • Pkcc
  • Pkcg
  • Prkca
  • Prkcb
  • Prkcb1
  • Prkcc
  • Prkcg
  • Wnt-5a
  • Wnt5a
Rattus norvegicus (Norway rat)
LDL clearance
  • Aadacl1
  • Acact
  • Acat
  • Acat2
  • Adtab
  • Ap17
  • Ap2a1
  • Ap2a2
  • Ap2b1
  • Ap2m1
  • Ap2s1
  • Apob
  • Arh
  • Clapb1
  • Claps2
  • Clta
  • Cltc
  • Lal
  • Ldlr
  • Ldlrap1
  • Lip1
  • Lipa
  • Narc1
  • Nceh1
  • Npc1
  • Npc2
  • Pcsk9
  • Soat1
  • Soat2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Cargo recognition for clathrin-mediated endocytosis
  • Aak1
  • Abcc7
  • Adrb2
  • Adrb2r
  • Adrbk1
  • Adrbk2
  • Adtab
  • Agfg1
  • Agfg1-ps1
  • Agtr1
  • Agtr1a
  • Ap17
  • Ap2a1
  • Ap2a2
  • Ap2b1
  • Ap2m1
  • Ap2s1
  • Apob
  • Areg
  • Arh
  • Arrb1
  • Arrb2
  • Ash
  • At1a
  • Avp
  • Avpr2
  • Btc
  • Calm
  • Cbl
  • Cd36l2
  • Cd3d
  • Cd3g
  • Cd4
  • Cftr
  • Chrm-2
  • Chrm2
  • Clapb1
  • Claps2
  • Clta
  • Cltb
  • Cltc
  • Cops1
  • Cops2
  • Cops3
  • Cops4
  • Cops5
  • Cops6
  • Cops7a
  • Cops7b
  • Cops8
  • Csn1
  • Csn2
  • Csn3
  • Csn4
  • Csn8
  • Da41
  • Dab2
  • Doc2
  • Dtr
  • Dvl2
  • Dyt1
  • Egf
  • Egfr
  • Ehsh1
  • Epn1
  • Epn2
  • Eps15
  • Eps15l1
  • Ereg
  • Fcho1
  • Fcho2
  • Fzd4
  • Glut8
  • Glutx1
  • Gps1
  • Grb2
  • Grk2
  • Grk3
  • Hbegf
  • Hegfl
  • Hgs
  • Hrb
  • Hrs
  • Hrs2
  • Igf2r
  • Il7r
  • Itsn
  • Itsn1
  • Itsn2
  • LOC100360645
  • LOC100361515
  • Ldlr
  • Ldlrap1
  • Limpii
  • Lrp2
  • M6pr
  • Necap1
  • Necap2
  • Nedd8
  • Picalm
  • Plic1
  • Reps1
  • Reps2
  • Rip
  • Rps27a
  • Ruk
  • Scarb2
  • Sdgf
  • Seta
  • Sh3d2a
  • Sh3d2c1
  • Sh3gl1
  • Sh3gl2
  • Sh3gl3
  • Sh3kbp1
  • Sh3p13
  • Sh3p4
  • Sh3p8
  • Slc18a3
  • Slc2a8
  • Snap91
  • Stam
  • Stam2
  • Ston1
  • Ston2
  • Syb2
  • Syb3
  • Sybl1
  • Syt1
  • Syt11
  • Syt2
  • Syt5
  • Syt8
  • Syt9
  • T3d
  • Tac1r
  • Tacr1
  • Tf
  • Tfrc
  • Tgfa
  • Tor1a
  • Trfr
  • Trip15
  • Ttgn1
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Ubqln1
  • Ubqln2
  • Vacht
  • Vamp2
  • Vamp3
  • Vamp4
  • Vamp7
  • Vamp8
  • Vat
  • Wnt-5a
  • Wnt5a
Rattus norvegicus (Norway rat)
Purine salvage
  • Ada
  • Adk
  • Ampd1
  • Ampd2
  • Ampd3
  • Aprt
  • Dck
  • Dguok
  • GMPR
  • Gmpr
  • Gmpr1
  • Gmpr2
  • Hprt
  • Hprt1
  • Np
  • Pnp
Rattus norvegicus (Norway rat)
Signaling by LTK
  • Ack1
  • Alkal1
  • Alkal2
  • Ash
  • Fam150a
  • Grb2
  • Irs-1
  • Irs1
  • LOC100910984
  • Ltk
  • Pik3ca
  • Pik3cb
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Shc1
  • Sos1
  • Tnk2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Biosynthesis of the N-glycan precursor (dolichol lipid-linked oligosaccharide, LLO) and transfer to a nascent protein
  • Alg1
  • Alg12
  • Alg13
  • Alg14
  • Alg2
  • Alg3
  • Alg6
  • Alg8
  • Alg9
  • Dpagt1
  • Mpdu1
Rattus norvegicus (Norway rat)
AKT phosphorylates targets in the cytosol
  • Akt1
  • Akt1s1
  • Akt2
  • Akt3
  • Casp9
  • Cdkn1a
  • Cdkn1b
  • Chuk
  • Mdm2
  • Mkrn1
  • RNCASP9
  • Tsc2
  • p27Kip1
Rattus norvegicus (Norway rat)
HSF1-dependent transactivation
  • Akt1s1
  • Camk2a
  • Camk2b
  • Camk2d
  • Camk2g
  • Cryab
  • Cryac
  • Dnajb1
  • Frap1
  • Gbl
  • Hsbp1
  • Hsc70
  • Hsc73
  • Hsf1
  • Hsp22
  • Hsp70-1
  • Hsp70-2
  • Hsp70-3
  • Hsp84
  • Hsp86
  • Hsp90aa1
  • Hsp90ab1
  • Hspa1
  • Hspa1a
  • Hspa1b
  • Hspa1l
  • Hspa2
  • Hspa8
  • Hspb8
  • Hspc3
  • Hspca
  • Hspcb
  • Lst8
  • Mlst8
  • Mtor
  • Raft1
  • Rptor
Rattus norvegicus (Norway rat)
Aryl hydrocarbon receptor signalling
  • Ahr
  • Ahrr
  • Aip
  • Arnt
  • Arnt2
  • Hsp84
  • Hsp90ab1
  • Hspc3
  • Hspcb
  • Ptges3
  • Tebp
  • Xap2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Processing of SMDT1
  • Afg3l2
  • Bcap37
  • Cbara1
  • Efha1
  • Maip1
  • Mcu
  • Mcub
  • Micu1
  • Micu2
  • Micu3
  • Mppa
  • Mppb
  • Parl
  • Phb
  • Phb1
  • Phb2
  • Pmpca
  • Pmpcb
  • Psarl
  • Smdt1
  • Smhs2
  • Spg7
  • Stoml2
  • Yme1l1
Rattus norvegicus (Norway rat)
PRC2 methylates histones and DNA
  • Aebp2
  • Dnmt1
  • Dnmt3a
  • Dnmt3b
  • ENSRNOG00000062927
  • ENSRNOG00000064540
  • ENSRNOG00000066901
  • ENSRNOG00000068034
  • Eed
  • Ezh2
  • H2ab3
  • H2ac10
  • H2ac18
  • H2ac4
  • H2afb3
  • H2afx
  • H2aj
  • H2ax
  • H2az2
  • H2bc1
  • H2bc12l1
  • H2bc6
  • H2bcl1
  • H2bcl2
  • H2bu1
  • H3-3b
  • H3.3b
  • H3c13
  • H3f3b
  • H4c16
  • H4c2
  • H4f16
  • H4ft
  • Hist1h2ba
  • Hist1h2bc
  • Hist1h2bg
  • Hist1h2bo
  • Hist1h2bq
  • Hist1h4b
  • Hist1h4m
  • Hist2h2aa3
  • Hist2h3c2
  • Hist4
  • Hist4h4
  • Jarid2
  • LOC100365043
  • LOC100910200
  • LOC120097726
  • LOC681740
  • LOC684797
  • Mtf2
  • Phf1
  • Phf19
  • Rbbp4
  • Rbbp7
  • Suz12
  • Th2b
Rattus norvegicus (Norway rat)
PKMTs methylate histone lysines
  • Aebp2
  • Ash1l
  • Ash2l
  • Atf7ip
  • Dot1l
  • Eed
  • Ehmt1
  • Ehmt2
  • Ezh2
  • H3c13
  • H4c16
  • H4c2
  • H4f16
  • H4ft
  • Hist1h4b
  • Hist1h4m
  • Hist2h3c2
  • Hist4
  • Hist4h4
  • Kmt2a
  • Kmt2b
  • Kmt2c
  • Kmt5a
  • Kmt5b
  • Kmt5c
  • LOC120093163
  • LOC498295
  • Mll
  • Mll1
  • Nfkb2
  • Nsd1
  • Nsd2
  • Nsd3
  • Prdm16
  • Prdm9
  • Rbbp4
  • Rbbp5
  • Rbbp7
  • Rela
  • Setd1a
  • Setd1b
  • Setd2
  • Setd3
  • Setd6
  • Setd7
  • Setdb1
  • Setdb2
  • Smyd2
  • Smyd3
  • Suv39h1
  • Suv39h2
  • Suv420h1
  • Suv420h2
  • Suz12
  • Wdr5
  • Whsc1
  • Whsc1l1
Rattus norvegicus (Norway rat)
BBSome-mediated cargo-targeting to cilium
  • Arl6
  • Bbs1
  • Bbs2
  • Bbs4
  • Bbs7
  • Bbs9
  • Gpr24
  • Lztfl1
  • Mchr1
  • Rab3ip
  • Rabin3
  • Rabin8
  • Slc1
  • Smo
  • Smoh
  • Sstr3
  • Ttc8
Rattus norvegicus (Norway rat)
Transport of nucleosides and free purine and pyrimidine bases across the plasma membrane
  • Aac1
  • Ant1
  • Ant2
  • Arl184
  • Arl2
  • Arl2bp
  • Bart
  • Bart1
  • Cnt1
  • Cnt2
  • Cnt3
  • Ent1
  • Ent2
  • Ent3
  • Slc25a4
  • Slc25a5
  • Slc28a1
  • Slc28a2
  • Slc28a3
  • Slc29a1
  • Slc29a2
  • Slc29a3
  • Slc29a4
  • Spnt
Rattus norvegicus (Norway rat)
RAS processing
  • Abhd17a
  • Abhd17b
  • Abhd17c
  • Apt1
  • Arl184
  • Arl2
  • Bcl2l1
  • Bclx
  • Blc2l
  • CaMIII
  • Calm3
  • Cam3
  • Camc
  • ENSRNOG00000064803
  • ENSRNOG00000067432
  • Fnta
  • Fntb
  • Golga7
  • Hras
  • Hras1
  • Icmt
  • Kras
  • Kras2
  • LOC100910107
  • LOC120097921
  • LOC120098474
  • Lypla1
  • Nras
  • Pde6d
  • Pkcq
  • Prkcq
  • Prkg2
  • Rce1
  • Usp17l
  • Usp17l8
  • Usp17la
  • Usp17la2
  • Usp17lh
  • Usp17li
  • Zdhhc9
Rattus norvegicus (Norway rat)
Retrograde transport at the Trans-Golgi-Network
  • Are1
  • Arf7
  • Arfip2
  • Arfrp1
  • Arl1
  • Arp1
  • Cog1
  • Cog2
  • Cog3
  • Cog4
  • Cog5
  • Cog6
  • Cog7
  • Dbndd2
  • Erg1
  • Gcc1
  • Gcc185
  • Gcc2
  • Golga1
  • Golga4
  • Igf2r
  • M6pr
  • Napa
  • Napb
  • Napg
  • Nsf
  • RGD1310016
  • Rab43
  • Rab6
  • Rab6a
  • Rab6b
  • Rab9
  • Rab9a
  • Rab9b
  • Rabepk
  • Rgp1
  • Rhobtb3
  • Ric1
  • Sacm2l
  • Scoc
  • Scoco
  • Snap
  • Snapa
  • Snapb
  • Stx16
  • Stx6
  • Syb3
  • Sys1
  • Tmf1
  • Ttgn1
  • Usp6nl
  • Vamp3
  • Vamp4
  • Vps51
  • Vps52
  • Vps53
  • Vps54
  • Vps54l
  • Vti1a
  • Vti1l2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Aggrephagy
  • Abcc7
  • Arl13b
  • Cap1
  • Cetn1
  • Cftr
  • Dhc1
  • Dlc2
  • Dnch1
  • Dnchc1
  • Dnci1
  • Dnci2
  • Dncic1
  • Dncic2
  • Dncl1
  • Dnclc1
  • Dncli1
  • Dncli2
  • Dnec1
  • Dyhc
  • Dync1h1
  • Dync1i1
  • Dync1i2
  • Dync1li1
  • Dync1li2
  • Dynll1
  • Dynll2
  • ENSRNOG00000067007
  • Ift88
  • LOC100360645
  • LOC309692
  • Map1c
  • Park2
  • Park7
  • Pcnt
  • Pin
  • Prkn
  • Rps27a
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
RHOQ GTPase cycle
  • Abcc7
  • Arhgap1
  • Arhgap17
  • Arhgap21
  • Arhgap26
  • Arhgap32
  • Arhgap33
  • Arhgap35
  • Arhgap5
  • Arhgap7
  • Arhgef7
  • Arhgef9
  • Arl13b
  • Borg1
  • Borg5
  • Cav
  • Cav1
  • Cdc42
  • Cdc42bpa
  • Cdc42bpb
  • Cdc42ep1
  • Cdc42ep2
  • Cdc42ep4
  • Cep2
  • Cftr
  • Cip4
  • Cpne8
  • Cxn-43
  • Depdc1b
  • Diaph3
  • Dlc1
  • Ehsh1
  • Fbp17
  • Fnbp1
  • Gfod1
  • Git1
  • Git2
  • Gja1
  • Gopc
  • Grlf1
  • Iqgap1
  • Iqgap3
  • Itsn
  • Itsn1
  • Jup
  • Lamtor1
  • Mpp7
  • Nbc
  • Nbc2
  • Nbc3
  • Nbcn1
  • Obscn
  • Ophn1
  • P190A
  • Pak1
  • Pak2
  • Pak3bp
  • Pak4
  • Pg
  • Pixb
  • Pk428
  • Plekhg3
  • Prex1
  • Rab7
  • Rab7a
  • Rhogap
  • Rhoq
  • Scrib
  • Slc1a5
  • Slc4a7
  • Snap23
  • Srgap2
  • Stard12
  • Steap3
  • Stom
  • Stp
  • Syb3
  • Syde1
  • Tc10
  • Tfrc
  • Trfr
  • Trip10
  • Vamp3
  • Vangl1
  • Wwp2
  • p190ARHOGAP
Rattus norvegicus (Norway rat)
MET receptor recycling
  • Arf6
  • Ash
  • Crk
  • Crkl
  • Crko
  • Gab1
  • Gga3
  • Grb2
  • Hgf
  • Met
  • Rab4
  • Rab4a
  • Rab4b
Rattus norvegicus (Norway rat)
Clathrin-mediated endocytosis
  • Aak1
  • Abcc7
  • Actr2
  • Actr3
  • Adrb2
  • Adrb2r
  • Adtab
  • Agfg1
  • Agfg1-ps1
  • Agtr1
  • Agtr1a
  • Amph
  • Amph1
  • Amph2
  • Amphl
  • Ap17
  • Ap2a1
  • Ap2a2
  • Ap2b1
  • Ap2m1
  • Ap2s1
  • Apob
  • Areg
  • Arf1gap
  • Arf6
  • Arfgap1
  • Arh
  • Arp2
  • Arp3
  • Arpc1a
  • Arpc2
  • Arpc3
  • Arpc4
  • Arpc5
  • Arrb1
  • Arrb2
  • Ash
  • At1a
  • Avp
  • Avpr2
  • Bin1
  • Btc
  • Calm
  • Cbl
  • Cd36l2
  • Cd3d
  • Cd3g
  • Cd4
  • Cftr
  • Chrm-2
  • Chrm2
  • Cip4
  • Clapb1
  • Claps2
  • Clta
  • Cltb
  • Cltc
  • Dab2
  • Dnajc6
  • Dnm
  • Dnm1
  • Dnm2
  • Dnm3
  • Doc2
  • Dtr
  • Dvl2
  • Dyn2
  • Dyn3
  • Egf
  • Egfr
  • Ehsh1
  • Epn1
  • Epn2
  • Eps15
  • Eps15l1
  • Ereg
  • Fbp17
  • Fcho1
  • Fcho2
  • Fnbp1
  • Fnbp1l
  • Fzd4
  • Gak
  • Gapvd1
  • Glut8
  • Glutx1
  • Grb2
  • Hbegf
  • Hegfl
  • Hgs
  • Hip1
  • Hip1r
  • Hrb
  • Hrs
  • Hrs2
  • Hsc70
  • Hsc73
  • Hspa8
  • Igf2r
  • Il7r
  • Itsn
  • Itsn1
  • Itsn2
  • LOC100360645
  • LOC100361515
  • Ldlr
  • Ldlrap1
  • Limpii
  • Lrp2
  • M6pr
  • Necap1
  • Necap2
  • Ocrl
  • Pacsin1
  • Pacsin2
  • Pacsin3
  • Picalm
  • Pik3c2a
  • Pip5k1c
  • Rab5a
  • Rab5b
  • Rab5c
  • Reps1
  • Reps2
  • Rip
  • Rps27a
  • Ruk
  • Scarb2
  • Sdgf
  • Seta
  • Sh3d2a
  • Sh3d2c1
  • Sh3gl1
  • Sh3gl2
  • Sh3gl3
  • Sh3kbp1
  • Sh3p13
  • Sh3p4
  • Sh3p8
  • Slc18a3
  • Slc2a8
  • Snap91
  • Snx18
  • Snx9
  • Stam
  • Stam2
  • Ston1
  • Ston2
  • Stp
  • Syb2
  • Syb3
  • Sybl1
  • Synj1
  • Synj2
  • Syt1
  • Syt11
  • Syt2
  • Syt5
  • Syt8
  • Syt9
  • T3d
  • Tac1r
  • Tacr1
  • Tf
  • Tfrc
  • Tgfa
  • Toca1
  • Trfr
  • Trip10
  • Ttgn1
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Vacht
  • Vamp2
  • Vamp3
  • Vamp4
  • Vamp7
  • Vamp8
  • Vat
  • Wnt-5a
  • Wnt5a
Rattus norvegicus (Norway rat)
VxPx cargo-targeting to cilium
  • Arf4
  • Asap1
  • CNCG2
  • CNCG3L
  • CNCG4
  • Cgn2
  • Cncg2
  • Cnga2
  • Cnga4
  • Cngb1
  • Ddef1
  • Exo70
  • Exo84
  • Exoc1
  • Exoc2
  • Exoc3
  • Exoc4
  • Exoc5
  • Exoc6
  • Exoc7
  • Exoc8
  • Gbf1
  • Pkd1
  • Pkd2
  • RCNC2
  • Rab11
  • Rab11a
  • Rab3ip
  • Rab8
  • Rab8a
  • Rabin3
  • Rabin8
  • Rho
  • Sec10l1
  • Sec15
  • Sec15a
  • Sec15l1
  • Sec5
  • Sec5l1
  • Sec6
  • Sec6l1
  • Sec8
  • Sec8l1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Synthesis of PIPs at the plasma membrane
  • Arf1
  • Bmx
  • Fapp2
  • Inpp4a
  • Inpp4b
  • Inpp5d
  • Inpp5j
  • Inpp5k
  • Inppl1
  • Mtm1
  • Mtmr1
  • Mtmr14
  • Mtmr3
  • Mtmr6
  • Ocrl
  • Pepp1
  • Pi4k2a
  • Pi4k2b
  • Pi4kii
  • Pib5pa
  • Pik3c2a
  • Pik3c2b
  • Pik3c2g
  • Pik3ca
  • Pik3cb
  • Pik3cd
  • Pik3cg
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Pik3r3
  • Pik3r5
  • Pik3r6
  • Pip4k2a
  • Pip4k2b
  • Pip4k2c
  • Pip4ka
  • Pip5k1a
  • Pip5k1b
  • Pip5k1c
  • Pip5k2a
  • Pip5k2b
  • Pip5k2c
  • Pipp
  • Plekha1
  • Plekha2
  • Plekha3
  • Plekha4
  • Plekha5
  • Plekha6
  • Plekha8
  • Pten
  • Ptpn13
  • Rab14
  • Rab4
  • Rab4a
  • Rab5a
  • Rufy1
  • Ship
  • Ship1
  • Ship2
  • Synj1
  • Synj2
Rattus norvegicus (Norway rat)

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Last updated: August 19, 2024