GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 876 - 900 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▼ Organism GlyTouCan ID
HDL remodeling
  • Abcg1
  • Alb
  • Apoa1
  • Apoc2
  • Apoc3
  • Apoe
  • Lcat
  • Lipg
  • Pltp
Rattus norvegicus (Norway rat)
Interferon alpha/beta signaling
  • Abce1
  • Cish3
  • ENSRNOG00000065554
  • If1ai1
  • If1ai2
  • If1ai3
  • Ifna1
  • Ifna12l
  • Ifna4
  • Ifna4l1
  • Ifnar1
  • Ifnar2
  • Ifnb
  • Ifnb1
  • Irf9
  • Jak1
  • Kpna1
  • Kpnb1
  • LOC100360645
  • LOC100911527
  • LOC120103158
  • LOC120103159
  • LOC120103160
  • LOC120103161
  • LOC120103162
  • LOC120103163
  • LOC120103164
  • RGD1560539
  • Rnasel
  • Rps27a
  • Socs1
  • Socs3
  • Stat1
  • Stat2
  • Stat4
  • Tyk2
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Linoleic acid (LA) metabolism
  • Abcd1
  • Acs1
  • Acsl1
  • Acsl2
  • ELOVL1
  • ELOVL3
  • Elovl1
  • Elovl2
  • Elovl3
  • Elovl5
  • Facl2
  • Fads1
  • Fads2
  • Fadsd6
  • Ssc2
Rattus norvegicus (Norway rat)
alpha-linolenic acid (ALA) metabolism
  • Abcd1
  • Acaa1
  • Acaa1b
  • Acot8
  • Acox
  • Acox1
  • Acs1
  • Acsl1
  • Acsl2
  • ELOVL1
  • ELOVL3
  • Edh17b4
  • Elovl1
  • Elovl2
  • Elovl3
  • Elovl5
  • Facl2
  • Fads1
  • Fads2
  • Fadsd6
  • Hsd17b4
  • Pte1
  • Scp-2
  • Scp2
  • Ssc2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Beta-oxidation of very long chain fatty acids
  • Abcd1
  • Acaa1
  • Acaa1b
  • Acot4
  • Acot6
  • Acot8
  • Acox
  • Acox1
  • Decr2
  • Eci2
  • Edh17b4
  • Ehhadh
  • Hsd17b4
  • Mfe1
  • Mlycd
  • Peci
  • Pte1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Class I peroxisomal membrane protein import
  • Abcd1
  • Abcd2
  • Abcd3
  • Acbd5
  • Aldh3a2
  • Aldh4
  • Aldr
  • Aldrp
  • Atad1
  • Fis1
  • Gdap1
  • Npg6
  • Paf1
  • Paf3
  • Pex11b
  • Pex12
  • Pex14
  • Pex16
  • Pex19
  • Pex2
  • Pex3
  • Pmp22
  • Pmp24
  • Pmp35
  • Pmp70
  • Pxf
  • Pxmp1
  • Pxmp2
  • Pxmp3
  • Pxmp4
  • Ttc11
Rattus norvegicus (Norway rat)
Ion homeostasis
  • Abcc9
  • Ahcyl1
  • Asph
  • Atp1a1
  • Atp1a2
  • Atp1a3
  • Atp1a4
  • Atp1al2
  • Atp1b1
  • Atp1b2
  • Atp1b3
  • Atp1c
  • Atp1g1
  • Atp2a1
  • Atp2a2
  • Atp2a3
  • Atp2b1
  • Atp2b3
  • Atp2b4
  • Bnos
  • CaMIII
  • Calm3
  • Cam3
  • Camc
  • Camk2a
  • Camk2b
  • Camk2d
  • Camk2g
  • Clic2
  • Ctni
  • Dmpk
  • Fkbp1b
  • Fxyd1
  • Fxyd2
  • Fxyd3
  • Fxyd4
  • Fxyd6
  • Fxyd7
  • Insp3r
  • Irbit
  • Itpr1
  • Itpr2
  • Itpr3
  • Kcnj11
  • Ncx1
  • Ncx2
  • Ncx3
  • Nos1
  • Php
  • Plm
  • Pln
  • Pmca3
  • Prkaca
  • Ryr1
  • Ryr2
  • Sim
  • Slc8a1
  • Slc8a2
  • Slc8a3
  • Sri
  • Stim1
  • Sur2
  • Tni
  • Tnni3
  • Trdn
  • Trp1
  • Trpc1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Regulation of insulin secretion
  • Abcc8
  • Cach2
  • Cach3
  • Cach4
  • Cach6
  • Cacn2
  • Cacn3
  • Cacn4
  • Cacna1a
  • Cacna1c
  • Cacna1d
  • Cacna1e
  • Cacna2d2
  • Cacnb2
  • Cacnb3
  • Cacnl1a1
  • Cacnl1a2
  • Cacnl1a4
  • Cacnl1a6
  • Cacnlb2
  • Cacnlb3
  • Cchl1a1
  • Cchl1a2
  • Cgef2
  • Epac
  • Epac1
  • Epac2
  • Glut1
  • Glut2
  • Kcnj11
  • Pkacb
  • Prkaca
  • Prkacb
  • Rapgef3
  • Rapgef4
  • Slc2a1
  • Slc2a2
  • Sur
  • Sur1
Rattus norvegicus (Norway rat)
ATP sensitive Potassium channels
  • Abcc8
  • Abcc9
  • Kcnj11
  • Kcnj8
  • Sur
  • Sur1
  • Sur2
Rattus norvegicus (Norway rat)
RHO GTPases regulate CFTR trafficking
  • Abcc7
  • Cftr
  • Gopc
  • Rhoq
  • Tc10
Rattus norvegicus (Norway rat)
Aggrephagy
  • Abcc7
  • Arl13b
  • Cap1
  • Cetn1
  • Cftr
  • Dhc1
  • Dlc2
  • Dnch1
  • Dnchc1
  • Dnci1
  • Dnci2
  • Dncic1
  • Dncic2
  • Dncl1
  • Dnclc1
  • Dncli1
  • Dncli2
  • Dnec1
  • Dyhc
  • Dync1h1
  • Dync1i1
  • Dync1i2
  • Dync1li1
  • Dync1li2
  • Dynll1
  • Dynll2
  • ENSRNOG00000067007
  • Ift88
  • LOC100360645
  • LOC309692
  • Map1c
  • Park2
  • Park7
  • Pcnt
  • Pin
  • Prkn
  • Rps27a
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
RHOQ GTPase cycle
  • Abcc7
  • Arhgap1
  • Arhgap17
  • Arhgap21
  • Arhgap26
  • Arhgap32
  • Arhgap33
  • Arhgap35
  • Arhgap5
  • Arhgap7
  • Arhgef7
  • Arhgef9
  • Arl13b
  • Borg1
  • Borg5
  • Cav
  • Cav1
  • Cdc42
  • Cdc42bpa
  • Cdc42bpb
  • Cdc42ep1
  • Cdc42ep2
  • Cdc42ep4
  • Cep2
  • Cftr
  • Cip4
  • Cpne8
  • Cxn-43
  • Depdc1b
  • Diaph3
  • Dlc1
  • Ehsh1
  • Fbp17
  • Fnbp1
  • Gfod1
  • Git1
  • Git2
  • Gja1
  • Gopc
  • Grlf1
  • Iqgap1
  • Iqgap3
  • Itsn
  • Itsn1
  • Jup
  • Lamtor1
  • Mpp7
  • Nbc
  • Nbc2
  • Nbc3
  • Nbcn1
  • Obscn
  • Ophn1
  • P190A
  • Pak1
  • Pak2
  • Pak3bp
  • Pak4
  • Pg
  • Pixb
  • Pk428
  • Plekhg3
  • Prex1
  • Rab7
  • Rab7a
  • Rhogap
  • Rhoq
  • Scrib
  • Slc1a5
  • Slc4a7
  • Snap23
  • Srgap2
  • Stard12
  • Steap3
  • Stom
  • Stp
  • Syb3
  • Syde1
  • Tc10
  • Tfrc
  • Trfr
  • Trip10
  • Vamp3
  • Vangl1
  • Wwp2
  • p190ARHOGAP
Rattus norvegicus (Norway rat)
Ub-specific processing proteases
  • Abcc7
  • Ada3
  • Adrb2
  • Adrb2r
  • Adrm1
  • Ar
  • Arrb1
  • Arrb2
  • Atxn7
  • Axin
  • Axin1
  • Axin2
  • Becn1
  • Birc2
  • Birc3
  • Ccna1
  • Ccna2
  • Ccp110
  • Cdc20
  • Cdc25a
  • Cftr
  • Clspn
  • Cyld
  • Cyld1
  • Ddb2
  • Dn7
  • ENSRNOG00000062927
  • ENSRNOG00000064803
  • ENSRNOG00000067432
  • Fkbp8
  • Foxo4
  • Gp110
  • H2ac10
  • H2ac18
  • H2ac25
  • H2ac4
  • H2aj
  • Hausp
  • Hgs
  • Hif1a
  • Hist2h2aa3
  • Hist3h2a
  • Hrs
  • Hrs2
  • Ide
  • Ifih1
  • Ikba
  • Ikbkg
  • Il33
  • Inrf2
  • Kat2a
  • Keap1
  • Kpc1
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • LOC100910107
  • LOC120097726
  • LOC120097921
  • LOC120098474
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mad1
  • Madh1
  • Madh2
  • Madh3
  • Madh7
  • Map3k7
  • Mat2b
  • Mdm2
  • Mdm4
  • Mdmx
  • Mecl1
  • Mss1
  • Mul1
  • Myc
  • Nemo
  • Nfkbia
  • Nr3c4
  • Otub1
  • P53
  • Polb
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Pten
  • Ptrh2
  • Rce1
  • Rig1
  • Ring12
  • Ripk1
  • Rnf123
  • Rnf128
  • Rnf146
  • Rps27a
  • Ruvbl1
  • Siah2
  • Skp2
  • Smad1
  • Smad2
  • Smad3
  • Smad7
  • Smurf2
  • Snx3
  • Stam2
  • Suds3
  • Sug1
  • Tab1
  • Tada2b
  • Tada3
  • Tada3l
  • Taf9b
  • Taf9l
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Tgfbr1
  • Tip49
  • Tip49a
  • Tnks
  • Tnks2
  • Tomm20
  • Tomm70
  • Tomm70a
  • Tp53
  • Traf2
  • Traf6
  • Trrap
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Ubp41
  • Ubp69
  • Ufd1
  • Ufd1l
  • Usp10
  • Usp11
  • Usp12
  • Usp13
  • Usp14
  • Usp15
  • Usp16
  • Usp17l
  • Usp17l8
  • Usp17la
  • Usp17la2
  • Usp17lh
  • Usp17li
  • Usp18
  • Usp19
  • Usp2
  • Usp20
  • Usp21
  • Usp22
  • Usp24
  • Usp25
  • Usp26
  • Usp28
  • Usp29
  • Usp3
  • Usp30
  • Usp33
  • Usp34
  • Usp37
  • Usp4
  • Usp42
  • Usp44
  • Usp47
  • Usp48
  • Usp5
  • Usp7
  • Usp8
  • Vdac1
  • Vdac2
  • Vdac3
  • Wdr20
  • Wdr48
  • ubp109
  • usp12
Rattus norvegicus (Norway rat)
Hyaluronan biosynthesis and export
  • Abcc5
  • Cemip
  • HAS1
  • HAS3
  • Has1
  • Has2
  • Has3
  • LOC282821
  • Mrp5
  • RGD1305254
Rattus norvegicus (Norway rat)
Azathioprine ADME
  • Abcc4
  • Abcc5
  • Cnt2
  • Cnt3
  • Ent1
  • Ent2
  • Gmps
  • Gsta1
  • Gsta2
  • Gsta3
  • Gsta5
  • Gsta6
  • Gstm2
  • Gstyc1
  • Gstyc2
  • Guk1
  • Hprt
  • Hprt1
  • Impdh1
  • Impdh2
  • Mrp4
  • Mrp5
  • Nme1
  • Nme2
  • Nudt15
  • Rac
  • Rac1
  • Slc28a2
  • Slc28a3
  • Slc29a1
  • Slc29a2
  • Spnt
  • Tpmt
  • Vav
  • Vav1
  • Vav2
  • Vav3
  • Xdh
Rattus norvegicus (Norway rat)
Aspirin ADME
  • Abcc2
  • Abcc3
  • Acsm2
  • Acsm4
  • Acsm5
  • Alb
  • Bche
  • Bsg
  • Ces1d
  • Ces2b
  • Ces3
  • Cmoat
  • Cmoat2
  • Cmrp
  • Cyp2c66
  • Cyp2d-18
  • Cyp2d-4
  • Cyp2d18
  • Cyp2d4
  • Cyp2e
  • Cyp2e-1
  • Cyp2e1
  • Cyp3a-1
  • Cyp3a-2
  • Cyp3a1
  • Cyp3a11
  • Cyp3a13
  • Cyp3a18
  • Cyp3a2
  • Cyp3a62
  • Cyp3a9
  • Glyat
  • Glyatl3
  • Ks
  • LOC100912265
  • LOC679149
  • Macs3
  • Mct1
  • Mlp2
  • Mrp2
  • Mrp3
  • Nlt
  • Oat2
  • Oatp2b1
  • Omacs
  • RGD1559459
  • Slc16a1
  • Slc21a9
  • Slc22a7
  • Slco2b1
  • Udpgtr2
  • Ugt1
  • Ugt1a1
  • Ugt1a2
  • Ugt1a3
  • Ugt1a5
  • Ugt1a6
  • Ugt1a7
  • Ugt1a7c
  • Ugt1a8
  • Ugt2a-1
  • Ugt2a1
  • Ugt2b
  • Ugt2b1
  • Ugt2b12
  • Ugt2b15
  • Ugt2b17
  • Ugt2b2
  • Ugt2b3
  • Ugt2b34l1
  • Ugt2b36
  • Ugt2b37
  • Ugt2b4
  • Ugt2b5
  • Ugt2b6
  • Ugt2b7
  • Ugt2b8
  • Ugt3a1
  • Ugt3a2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Transport of RCbl within the body
  • Abcc1
  • Arh
  • Cd320
  • Ldlrap1
  • Lrp2
  • Mrp1
  • Tcn2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Synthesis of Leukotrienes (LT) and Eoxins (EX)
  • Abcc1
  • Alox12l
  • Alox15
  • Alox5
  • Alox5ap
  • Cyp4a-1
  • Cyp4a-2
  • Cyp4a-3
  • Cyp4a-8
  • Cyp4a1
  • Cyp4a10
  • Cyp4a11
  • Cyp4a12
  • Cyp4a14
  • Cyp4a2
  • Cyp4a3
  • Cyp4a8
  • Cyp4b-1
  • Cyp4b1
  • Cyp4f-1
  • Cyp4f1
  • Cyp4f18
  • Cyp4f2
  • Cyp4f3
  • Cyp4f4
  • Cyp4f40
  • Dpep1
  • Dpep2
  • Dpep3
  • Flap
  • Ggt
  • Ggt1
  • Ggt5
  • Ggtla1
  • Lta4h
  • Ltc4s
  • Mapkapk2
  • Mrp1
  • Rdp
Rattus norvegicus (Norway rat)
Sphingolipid de novo biosynthesis
  • Abcc1
  • Abcg2
  • Bcrp1
  • Cers2
  • Cers3
  • Cers4
  • Cers5
  • Cers6
  • Cyb5b
  • Cyb5m
  • Degs
  • Degs1
  • Degs2
  • Des1
  • Des2
  • Fa2h
  • Faah
  • Kdsr
  • Lass2
  • Lass3
  • Lcb1
  • Lcb2
  • Mfsd2b
  • Mob
  • Mrp1
  • Omb5
  • Ormdl1
  • Ormdl2
  • Ormdl3
  • Pomt2
  • Samd8
  • Sgms1
  • Sgms2
  • Sphk1
  • Spns2
  • Sptlc1
  • Sptlc2
  • Sptlc3
  • Sptssa
  • Ssspta
  • Tmem23
Rattus norvegicus (Norway rat)
Heme degradation
  • Abcc1
  • Abcc2
  • Abcg2
  • Alb
  • Bcrp1
  • Blvr
  • Blvra
  • Cmoat
  • Cmrp
  • ENSRNOG00000064875
  • Fabp1
  • Gsta1
  • Gsta2
  • Gsta3
  • Gsta5
  • Gsta6
  • Gstyc1
  • Gstyc2
  • Hmox1
  • Hmox2
  • Mrp1
  • Mrp2
  • Oatp1b2
  • Oatp2b1
  • Slc21a10
  • Slc21a9
  • Slco1b2
  • Slco2b1
  • Ugt1
  • Ugt1a1
  • Ugt1a2
  • Ugt1a3
  • Ugt1a5
Rattus norvegicus (Norway rat)
Synthesis of bile acids and bile salts via 7alpha-hydroxycholesterol
  • Abcb11
  • Acot8
  • Acox2
  • Acsb
  • Acsvl1
  • Akr1c1
  • Akr1c21
  • Akr1d1
  • Amacr
  • Baat
  • Bar
  • Bsep
  • Cca2
  • Cyp27
  • Cyp27a1
  • Cyp7
  • Cyp7a1
  • Cyp7b1
  • Cyp8
  • Cyp8b1
  • Edh17b4
  • Facvl1
  • Fatp2
  • Fatp5
  • Fxr
  • Hsd17b4
  • Hsd17b5
  • Hsd3b7
  • Ncoa1
  • Ncoa2
  • Nr1h4
  • Nr2b1
  • Pte1
  • Ptgis
  • Rip14
  • Rxra
  • Scp-2
  • Scp2
  • Slc27a2
  • Slc27a5
  • Spgp
  • Thcox
  • Tif2
  • Vlacs
  • Vlacsr
  • Vlcs
Rattus norvegicus (Norway rat)
Recycling of bile acids and salts
  • Abcb11
  • Abcc3
  • Acsb
  • Alb
  • Baat
  • Bar
  • Bsep
  • Cmoat2
  • Fabp6
  • Fatp5
  • Fxr
  • Ilbp
  • Illbp
  • Mlp2
  • Mrp3
  • Ncoa1
  • Ncoa2
  • Nr1h4
  • Nr2b1
  • Ntcp
  • Ntcp2
  • Oatp1a4
  • Oatp1b2
  • Oatp2
  • Rip14
  • Rxra
  • Slc10a1
  • Slc10a2
  • Slc21a10
  • Slc21a5
  • Slc27a5
  • Slc51a
  • Slc51b
  • Slco1a4
  • Slco1b2
  • Spgp
  • Stard5
  • Tif2
  • Vlacsr
Rattus norvegicus (Norway rat)
Prednisone ADME
  • Abcb1
  • Akr1c1
  • Akr1c21
  • Alb
  • Cbg
  • Cyp3a-1
  • Cyp3a-2
  • Cyp3a1
  • Cyp3a11
  • Cyp3a13
  • Cyp3a18
  • Cyp3a2
  • Cyp3a62
  • Cyp3a9
  • Hsd11
  • Hsd11b1
  • Hsd11b2
  • Hsd11k
  • Hsd17b5
  • Mdr1
  • Mdr1b
  • Pgy1
  • RGD1559459
  • Serpina6
  • Udpgtr2
  • Ugt1
  • Ugt1a2
  • Ugt1a3
  • Ugt1a5
  • Ugt2b
  • Ugt2b1
  • Ugt2b12
  • Ugt2b15
  • Ugt2b17
  • Ugt2b2
  • Ugt2b3
  • Ugt2b34l1
  • Ugt2b36
  • Ugt2b37
  • Ugt2b4
  • Ugt2b5
  • Ugt2b6
  • Ugt2b7
  • Ugt2b8
Rattus norvegicus (Norway rat)
Atorvastatin ADME
  • Abcb1
  • Abcc2
  • Cmoat
  • Cmrp
  • Cyp3a-1
  • Cyp3a-2
  • Cyp3a1
  • Cyp3a11
  • Cyp3a13
  • Cyp3a18
  • Cyp3a2
  • Cyp3a62
  • Cyp3a9
  • Mdr1
  • Mdr1b
  • Mrp2
  • Oatp1b2
  • Oatp2b1
  • Pgy1
  • Pon
  • Pon1
  • Pon3
  • Slc21a10
  • Slc21a9
  • Slco1b2
  • Slco2b1
  • Ugt1
  • Ugt1a2
  • Ugt1a3
  • Ugt1a5
Rattus norvegicus (Norway rat)
Surfactant metabolism
  • Abca3
  • Adgrf5
  • Adora2a
  • Adora2b
  • Adra2a
  • Adra2c
  • Ccdc59
  • Ckap4
  • Ctsh
  • Gata6
  • Gpr116
  • Gprhep
  • Lmcd1
  • Napsa
  • P2ru1
  • P2ry2
  • Sftp-1
  • Sftp1
  • Sftp2
  • Sftp3
  • Sftp4
  • Sftpa
  • Sftpa1
  • Sftpb
  • Sftpc
  • Sftpd
  • Slc17a2
  • Slc34a1
  • Slc34a2
  • Srec
  • Ttf1
  • Zdhhc2
Rattus norvegicus (Norway rat)

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Last updated: August 19, 2024