GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1376 - 1400 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▼ Organism GlyTouCan ID
Biosynthesis of E-series 18(S)-resolvins
  • ALOX15
  • ALOX5
  • HPGD
  • LOG15
  • LOG5
  • LTA4
  • LTA4H
  • PGDH1
  • SDR36C1
Homo sapiens (human)
Synthesis of 15-eicosatetraenoic acid derivatives
  • ALOX15
  • ALOX15B
  • COX2
  • GPX1
  • GPX2
  • GPX4
  • LOG15
  • PTGS2
Homo sapiens (human)
Suppression of apoptosis
  • ALO17
  • C17orf27
  • CTSG
  • ERK1
  • ERK2
  • GSK3A
  • KIAA1554
  • KIAA1618
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MYSTR
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PSF
  • RFP
  • RNF213
  • RNF76
  • Rv3364c
  • Rv3654c
  • Rv3655c
  • SFPQ
  • TRIM27
  • lprM
  • mce3E
  • mptpA
  • ptpA
Homo sapiens (human)
Transcriptional regulation of granulopoiesis
  • ALL1
  • AML1
  • APRF
  • BHLHA17
  • BHLHE39
  • BTEB2
  • CAP20
  • CBFA2
  • CBFB
  • CDK2
  • CDK4
  • CDKN1
  • CDKN1A
  • CDKN2
  • CEBP
  • CEBPA
  • CEBPB
  • CEBPE
  • CIP1
  • CKLF
  • CSF3R
  • CXXC7
  • DEK
  • DP1
  • DP2
  • E2F1
  • EP300
  • FLI1
  • GATA2
  • GCSFR
  • GFI1
  • H2AB1
  • H2AC14
  • H2AC18
  • H2AC19
  • H2AC20
  • H2AC4
  • H2AC6
  • H2AC7
  • H2AC8
  • H2AFA
  • H2AFB1
  • H2AFE
  • H2AFG
  • H2AFJ
  • H2AFL
  • H2AFM
  • H2AFO
  • H2AFQ
  • H2AFV
  • H2AFX
  • H2AJ
  • H2AV
  • H2AX
  • H2AZ2
  • H2BC1
  • H2BC10
  • H2BC11
  • H2BC12
  • H2BC12L
  • H2BC13
  • H2BC14
  • H2BC15
  • H2BC17
  • H2BC21
  • H2BC26
  • H2BC3
  • H2BC4
  • H2BC5
  • H2BC6
  • H2BC7
  • H2BC8
  • H2BC9
  • H2BFA
  • H2BFB
  • H2BFC
  • H2BFD
  • H2BFE
  • H2BFF
  • H2BFG
  • H2BFH
  • H2BFJ
  • H2BFK
  • H2BFL
  • H2BFN
  • H2BFQ
  • H2BFR
  • H2BFS
  • H2BFT
  • H2BS1
  • H2BU1
  • H3-3A
  • H3-3B
  • H3.3A
  • H3.3B
  • H3C1
  • H3C10
  • H3C11
  • H3C12
  • H3C13
  • H3C14
  • H3C15
  • H3C2
  • H3C3
  • H3C4
  • H3C6
  • H3C7
  • H3C8
  • H3F2
  • H3F3
  • H3F3A
  • H3F3B
  • H3FA
  • H3FB
  • H3FC HIST1H3C
  • H3FD
  • H3FF
  • H3FH
  • H3FI
  • H3FJ
  • H3FK
  • H3FL
  • H3FM
  • H4-16
  • H4/A
  • H4/B
  • H4/C
  • H4/D
  • H4/E
  • H4/G
  • H4/H
  • H4/I
  • H4/J
  • H4/K
  • H4/M
  • H4/N
  • H4/O
  • H4C1
  • H4C11
  • H4C12
  • H4C13
  • H4C14
  • H4C15
  • H4C16
  • H4C2
  • H4C3
  • H4C4
  • H4C5
  • H4C6
  • H4C8
  • H4C9
  • H4F2
  • H4FA
  • H4FB
  • H4FC
  • H4FD
  • H4FE
  • H4FG
  • H4FH
  • H4FI
  • H4FJ
  • H4FK
  • H4FM
  • H4FN
  • H4FO
  • HIRIP1
  • HIRIP2
  • HIST1H2AB
  • HIST1H2AC
  • HIST1H2AD
  • HIST1H2AE
  • HIST1H2AJ
  • HIST1H2BA
  • HIST1H2BB
  • HIST1H2BC
  • HIST1H2BD
  • HIST1H2BE
  • HIST1H2BF
  • HIST1H2BG
  • HIST1H2BH
  • HIST1H2BI
  • HIST1H2BJ
  • HIST1H2BK
  • HIST1H2BL
  • HIST1H2BM
  • HIST1H2BN
  • HIST1H2BO
  • HIST1H3A
  • HIST1H3B
  • HIST1H3D
  • HIST1H3E
  • HIST1H3F
  • HIST1H3G
  • HIST1H3H
  • HIST1H3I
  • HIST1H3J
  • HIST1H4A
  • HIST1H4B
  • HIST1H4C
  • HIST1H4D
  • HIST1H4E
  • HIST1H4F
  • HIST1H4H
  • HIST1H4I
  • HIST1H4J
  • HIST1H4K
  • HIST1H4L
  • HIST2H2AA
  • HIST2H2AA3
  • HIST2H2AA4
  • HIST2H2AC
  • HIST2H2BE
  • HIST2H3A
  • HIST2H3C
  • HIST2H3D
  • HIST2H4
  • HIST2H4A
  • HIST2H4B
  • HIST3H2BB
  • HIST4H4
  • HRX
  • HTRX
  • IKLF
  • IL6R
  • KLF5
  • KMT2A
  • LEF1
  • MDA6
  • MLL
  • MLL1
  • MYB
  • MYC
  • NR1B1
  • NR2B1
  • P300
  • PIC1
  • RARA
  • RBBP3
  • RUNX1
  • RXRA
  • SCL
  • SDI1
  • SPI1
  • STAT3
  • TAL1
  • TCF5
  • TCL5
  • TFDP1
  • TFDP2
  • TRX1
  • TSH2B
  • WAF1
  • ZNF163
Homo sapiens (human)
TGFBR2 Kinase Domain Mutants in Cancer
  • ALK5
  • SKR4
  • TGFB
  • TGFB1
  • TGFBR1
  • TGFBR2
Homo sapiens (human)
SMAD2/3 Phosphorylation Motif Mutants in Cancer
  • ALK5
  • MADH2
  • MADH3
  • MADR2
  • SKR4
  • SMAD2
  • SMAD3
  • TGFB
  • TGFB1
  • TGFBR1
  • TGFBR2
Homo sapiens (human)
TGFBR1 KD Mutants in Cancer
  • ALK5
  • MADH2
  • MADH3
  • MADR2
  • SKR4
  • SMAD2
  • SMAD3
  • TGFB
  • TGFB1
  • TGFBR1
  • TGFBR2
Homo sapiens (human)
TGFBR1 LBD Mutants in Cancer
  • ALK5
  • FKBP1
  • FKBP12
  • FKBP1A
  • SKR4
  • TGFB
  • TGFB1
  • TGFBR1
  • TGFBR2
Homo sapiens (human)
TGF-beta receptor signaling activates SMADs
  • ALK5
  • C14orf141
  • CBL
  • CBL2
  • DPC4
  • FKBP1
  • FKBP12
  • FKBP1A
  • FNRB
  • FUR
  • FURIN
  • GP3A
  • ITGA8
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB3
  • ITGB5
  • ITGB6
  • ITGB8
  • LTBP1
  • LTBP2
  • LTBP3
  • LTBP4
  • MADH2
  • MADH3
  • MADH4
  • MADR2
  • MDF2
  • MSK12
  • MSK8
  • NEDD8
  • PACE
  • PCSK3
  • RNF55
  • SKR4
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD4
  • TGFB
  • TGFB1
  • TGFB2
  • TGFB3
  • TGFBR1
  • TGFBR2
  • TGFBR3
  • UBC12
  • UBE2M
  • VNRA
  • VTNR
Homo sapiens (human)
Downregulation of TGF-beta receptor signaling
  • ALK5
  • BAMBI
  • CHIP
  • CRM1
  • GADD34
  • KIAA0439
  • KIAA0529
  • KIAA0647
  • KIAA1625
  • MADH2
  • MADH3
  • MADH7
  • MADH8
  • MADR2
  • MAWD
  • MTMR4
  • NEDD4L
  • NEDL3
  • NMA
  • PMEPA1
  • PPP1A
  • PPP1CA
  • PPP1CB
  • PPP1CC
  • PPP1R15A
  • RPS27A
  • SKR4
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD7
  • SMURF1
  • SMURF2
  • STAG1
  • STRAP
  • STUB1
  • TGFB
  • TGFB1
  • TGFBR1
  • TGFBR2
  • TMEPAI
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UCH37
  • UCHL5
  • UNRIP
  • USP15
  • XPO1
  • ZFYVE11
Homo sapiens (human)
TGF-beta receptor signaling in EMT (epithelial to mesenchymal transition)
  • ALK5
  • ARH12
  • ARHA
  • ARHGEF18
  • CGN
  • F11R
  • FKBP1
  • FKBP12
  • FKBP1A
  • JAM1
  • JCAM
  • KIAA0521
  • KIAA1319
  • KIAA1625
  • PAR3
  • PAR3A
  • PAR6A
  • PARD3
  • PARD6A
  • PKC2
  • PRKCZ
  • RHO12
  • RHOA
  • RPS27A
  • SKR4
  • SMURF1
  • TGFB
  • TGFB1
  • TGFBR1
  • TGFBR2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
alectinib-resistant ALK mutants
  • ALK
Homo sapiens (human)
NVP-TAE684-resistant ALK mutants
  • ALK
Homo sapiens (human)
lorlatinib-resistant ALK mutants
  • ALK
Homo sapiens (human)
crizotinib-resistant ALK mutants
  • ALK
Homo sapiens (human)
ASP-3026-resistant ALK mutants
  • ALK
Homo sapiens (human)
ceritinib-resistant ALK mutants
  • ALK
Homo sapiens (human)
brigatinib-resistant ALK mutants
  • ALK
Homo sapiens (human)
MDK and PTN in ALK signaling
  • ALK
  • HBNF1
  • HTPZP2
  • MDK
  • MK1
  • NEGF1
  • NEGF2
  • PTN
  • PTPRZ
  • PTPRZ1
  • PTPRZ2
  • PTPZ
Homo sapiens (human)
ALK mutants bind TKIs
  • ALK
  • BCL11A
  • BIRC6
  • C2orf2
  • CLH17
  • CLTC
  • CLTCL2
  • CTIP1
  • EIF2AK3
  • EMAPL4
  • EML4
  • EVI9
  • FN
  • FN1
  • HIP1
  • KIAA0034
  • KIAA1289
  • KIAA1809
  • NPM
  • NPM1
  • PEK
  • PERK
  • PKR1
  • PP2CB
  • PPM1B
  • PRKAR1
  • PRKAR1A
  • STRN
  • TSE1
  • ZNF856
Homo sapiens (human)
Signaling by ALK fusions and activated point mutants
  • ALK
  • ALO17
  • APRF
  • ASH
  • ATIC
  • BCL11A
  • BCL2L3
  • BIRC6
  • C17orf27
  • C2orf2
  • C2orf44
  • CAP20
  • CARS
  • CARS1
  • CDKN1
  • CDKN1A
  • CIP1
  • CLH17
  • CLTC
  • CLTCL2
  • CTIP1
  • DCTN1
  • EEF1G
  • EF1G
  • EIF2AK3
  • EMAPL4
  • EML4
  • EVI9
  • FBX20
  • FBXO20
  • FN
  • FN1
  • FRS2
  • FRS3
  • GCC2
  • GRB1
  • GRB2
  • HIP1
  • IL10
  • IL22
  • ILTIF
  • IRS1
  • JNK1
  • JNK2
  • JUN
  • KIAA0034
  • KIAA0336
  • KIAA0858
  • KIAA0905
  • KIAA1230
  • KIAA1289
  • KIAA1398
  • KIAA1554
  • KIAA1618
  • KIAA1809
  • KIF5B
  • KLC
  • KLC1
  • KNS
  • KNS1
  • KNS2
  • LMO7
  • MAPK8
  • MAPK9
  • MCL1
  • MDA6
  • MDM2
  • MSN
  • MYH9
  • MYSTR
  • NPM
  • NPM1
  • NUP358
  • ORCA
  • OSIL
  • P53
  • PEK
  • PERK
  • PIC1
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PKR1
  • PLC1
  • PLCG1
  • PP2CB
  • PPFIBP1
  • PPM1B
  • PRKAR1
  • PRKAR1A
  • PRKM8
  • PRKM9
  • PURH
  • RANBP2
  • RANBP2L4
  • RNF213
  • RPS27A
  • RRBP1
  • SAPK1
  • SAPK1A
  • SAPK1C
  • SDI1
  • SEC31A
  • SEC31L1
  • SQSTM1
  • STAT1
  • STAT3
  • STRN
  • TFG
  • TP53
  • TPM3
  • TPM4
  • TPR
  • TSE1
  • TYK2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VCL
  • WAF1
  • WDCP
  • ZCYTO18
  • ZNF856
Homo sapiens (human)
Signaling by ALK
  • ALK
  • ALKAL1
  • ALKAL2
  • APRF
  • BHLHE37
  • BHLHE39
  • FAM150A
  • FAM150B
  • FRS2
  • GRB1
  • HBNF1
  • HCP
  • IRS1
  • JAK3
  • MDK
  • MK1
  • MYC
  • MYCN
  • NEGF1
  • NEGF2
  • NMYC
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PLC1
  • PLCG1
  • PTN
  • PTP1C
  • PTPN6
  • STAT3
Homo sapiens (human)
Defective ALG9 causes CDG-1l
  • ALG9
  • DIBD1
Homo sapiens (human)
Synthesis of dolichyl-phosphate-glucose
  • ALG5
  • NUDT14
  • UGPP
Homo sapiens (human)
Defective ALG14 causes ALG14-CMS
  • ALG13
  • ALG14
  • CXorf45
  • GLT28D1
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Last updated: August 19, 2024