GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1901 - 1925 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▼ GlyTouCan ID
RHO GTPases Activate Rhotekin and Rhophilins
  • ARH12
  • ARH6
  • ARH9
  • ARHA
  • ARHB
  • ARHC
  • KIAA1929
  • LIN7B
  • MALS2
  • RHO12
  • RHOA
  • RHOB
  • RHOC
  • RHPN1
  • RHPN2
  • ROPN1
  • ROPN1A
  • RTKN
  • RTKN1
  • TAX1BP3
  • TIP1
  • VELI2
Homo sapiens (human)
TRAF6 mediated induction of NFkB and MAP kinases upon TLR7/8 or 9 activation
  • ECSIT
  • IRAK
  • IRAK1
  • IRAK2
  • IRAK4
  • MAP3K1
  • MAPKKK1
  • MEKK
  • MEKK1
  • MYD88
  • RNF85
  • TLR7
  • TLR9
  • TRAF6
Homo sapiens (human)
RPIA deficiency: failed conversion of R5P to RU5P
  • RPI
  • RPIA
Homo sapiens (human)
CD209 (DC-SIGN) signaling
  • CBP
  • CD209
  • CLEC4L
  • CREBBP
  • EP300
  • FYN
  • HRAS
  • HRAS1
  • ICAM2
  • ICAM3
  • JTK8
  • LYN
  • MSK1
  • NFKB1
  • NFKB3
  • NRAS
  • OPHN3
  • P300
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK3
  • PKACA
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • RAF
  • RAF1
  • RELA
  • RELB
  • RPS6KA5
Homo sapiens (human)
Assembly and cell surface presentation of NMDA receptors
  • ACTN2
  • APBA1
  • BCL8B
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • CASK
  • DLG1
  • DLG2
  • DLG3
  • DLG4
  • GRIN1
  • GRIN2A
  • GRIN2B
  • GRIN2C
  • GRIN2D
  • GRIN3A
  • GRIN3B
  • GluN2D
  • KIAA0968
  • KIAA1232
  • KIAA1365
  • KIAA1405
  • KIAA1544
  • KIAA1973
  • KIF17
  • KIF3X
  • LAP1
  • LIN2
  • LIN7A
  • LIN7B
  • LIN7C
  • LRRC7
  • LYST2
  • MALS1
  • MALS2
  • MALS3
  • MINT1
  • NBEA
  • NEFL
  • NF68
  • NFL
  • NMDAR1
  • NMDAR2A
  • NMDAR2B
  • NMDAR2C
  • NMDAR2D
  • PSD95
  • VELI1
  • VELI2
  • VELI3
  • X11
Homo sapiens (human)
Interleukin-36 pathway
  • FIL1D
  • FIL1E
  • FIL1T
  • IL1E
  • IL1F10
  • IL1F5
  • IL1F6
  • IL1F8
  • IL1F9
  • IL1H1
  • IL1H2
  • IL1HY1
  • IL1HY2
  • IL1L1
  • IL1RL2
  • IL1RP2
  • IL1RP3
  • IL1RRP2
  • IL36A
  • IL36B
  • IL36G
  • IL36RN
  • IL38
Homo sapiens (human)
Class A/1 (Rhodopsin-like receptors)
  • CB2A
  • CB2B
  • CHEMR23
  • CMKLR1
  • CNR
  • CNR1
  • CNR2
  • DEZ
  • EBI2
  • G2A
  • GPBAR1
  • GPCRW
  • GPR109A
  • GPR132
  • GPR18
  • GPR183
  • GPR35
  • GPR39
  • GPR4
  • GPR55
  • GPR65
  • GPR68
  • GPR80
  • GPR91
  • GPR99
  • HCA2
  • HCAR2
  • HM74A
  • MTNR1A
  • MTNR1B
  • NIACR1
  • OGR1
  • OXGR1
  • P2RY15
  • P2Y15
  • PAFR
  • PTAFR
  • SUCNR1
  • TDAG8
  • TGR5
Homo sapiens (human)
Collagen degradation
  • ADAM10
  • ADAM17
  • ADAM9
  • AGXT2L2
  • BP180
  • BPAG2
  • CLG
  • CLG1
  • CLG4A
  • CLG4B
  • COL12A1
  • COL12A1L
  • COL13A1
  • COL14A1
  • COL15A1
  • COL16A1
  • COL17A1
  • COL18A1
  • COL19A1
  • COL23A1
  • COL25A1
  • COL26A1
  • COL9A1
  • COL9A2
  • COL9A3
  • CPSB
  • CPSD
  • CSVP
  • CTSB
  • CTSD
  • CTSK
  • CTSL
  • CTSL1
  • CTSO
  • CTSO2
  • ELA2
  • ELANE
  • EMID2
  • EMU2
  • FUR
  • FURIN
  • HME
  • KIAA0021
  • KUZ
  • MADM
  • MCMP
  • MDC9
  • MLTNG
  • MMP1
  • MMP10
  • MMP11
  • MMP12
  • MMP13
  • MMP14
  • MMP15
  • MMP18
  • MMP19
  • MMP2
  • MMP20
  • MMP3
  • MMP7
  • MMP8
  • MMP9
  • MPSL1
  • PACE
  • PCSK3
  • PHYKPL
  • PRSS2
  • PUMP1
  • RASI
  • STMY1
  • STMY2
  • STMY3
  • TACE
  • TMPRSS6
  • TRY2
  • TRYP2
  • UND
Homo sapiens (human)
Post-transcriptional silencing by small RNAs
  • AGO1
  • AGO2
  • AGO3
  • AGO4
  • CAGH26
  • EIF2C1
  • EIF2C2
  • EIF2C3
  • EIF2C4
  • KIAA1093
  • KIAA1460
  • KIAA1567
  • KIAA1582
  • TNRC6
  • TNRC6A
  • TNRC6B
  • TNRC6C
Homo sapiens (human)
Synthesis of IPs in the ER lumen
  • MINPP1
  • MIPP
Homo sapiens (human)
Formation of tubulin folding intermediates by CCT/TriC
  • 99D8.1
  • C21orf112
  • CCT1
  • CCT2
  • CCT3
  • CCT4
  • CCT5
  • CCT6
  • CCT6A
  • CCT6B
  • CCT7
  • CCT8
  • CCTA
  • CCTB
  • CCTD
  • CCTE
  • CCTG
  • CCTH
  • CCTQ
  • CCTZ
  • KIAA0002
  • KIAA0098
  • NIP7-1
  • SRB
  • TCP1
  • TRIC5
  • TUBA1
  • TUBA1A
  • TUBA1B
  • TUBA1C
  • TUBA2
  • TUBA3
  • TUBA3C
  • TUBA3D
  • TUBA3E
  • TUBA4
  • TUBA4A
  • TUBA4B
  • TUBA6
  • TUBA8
  • TUBAL2
  • TUBAL3
  • TUBB1
  • TUBB2
  • TUBB2A
  • TUBB2B
  • TUBB2C
  • TUBB3
  • TUBB4
  • TUBB4A
  • TUBB4B
  • TUBB5
  • TUBB6
Homo sapiens (human)
Defective ABCB4 causes PFIC3, ICP3 and GBD1
  • ABCB4
  • MDR3
  • PGY3
Homo sapiens (human)
Transport of the SLBP independent Mature mRNA
  • AAAS
  • ADRACALA
  • ALY
  • ALYREF
  • BEF
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CBP20
  • CBP80
  • CG1
  • D3S1231E
  • EIF4E
  • EIF4EL1
  • EIF4F
  • KIAA0023
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • MP44
  • MRNP41
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • NDC1
  • NPAP60L
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • NXF1
  • PCNT1
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • RAE1
  • RANBP2
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • TAP
  • THOC4
  • TMEM48
  • TPR
Homo sapiens (human)
Formation of the Early Elongation Complex
  • BTF2
  • BTF2P44
  • C6orf175
  • CAK
  • CAK1
  • CAP35
  • CBP20
  • CBP80
  • CCNH
  • CDK7
  • CDKN7
  • COBRA1
  • CTDP1
  • ERCC2
  • ERCC3
  • FCP1
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • GTF2H1
  • GTF2H2
  • GTF2H3
  • GTF2H4
  • GTF2H5
  • KIAA1182
  • MAT1
  • MNAT1
  • MO15
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • NELFA
  • NELFB
  • NELFCD
  • NELFD
  • NELFE
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • RAP30
  • RAP74
  • RD
  • RDBP
  • RNF66
  • RPB7
  • SPT4H
  • SPT5
  • SPT5H
  • STK1
  • SUPT4H
  • SUPT4H1
  • SUPT5H
  • TH1
  • TH1L
  • TTDA
  • WHSC2
  • XPB
  • XPBC
  • XPD
  • XPDC
Homo sapiens (human)
Telomere C-strand (Lagging Strand) Synthesis
  • ACD
  • DRIP5
  • KIAA0039
  • PCNA
  • PIN2
  • PIP1
  • POLD
  • POLD1
  • POLD2
  • POLD3
  • POLD4
  • POLDS
  • POT1
  • PTOP
  • RAP1
  • TERF1
  • TERF2
  • TERF2IP
  • TIN2
  • TINF2
  • TINT1
  • TPP1
  • TRBF1
  • TRBF2
  • TRF
  • TRF1
  • TRF2
Homo sapiens (human)
Sphingolipid catabolism
  • ACER1
  • ACER2
  • ACER3
  • ALDH3B1
  • ALDH3B2
  • ALDH7
  • ALDH8
  • APHC
  • ASAH3
  • ASAH3L
  • KIAA1252
  • LPP1
  • LPP2
  • LPP3
  • PHCA
  • PLPP1
  • PLPP2
  • PLPP3
  • PPAP2A
  • PPAP2B
  • PPAP2C
  • SGPL1
  • SGPP1
  • SGPP2
  • SPP1
Homo sapiens (human)
Defective factor IX causes thrombophilia
  • F10
  • F8
  • F8C
  • F9
Homo sapiens (human)
Mineralocorticoid biosynthesis
  • 3BH
  • CGA
  • CYP11B2
  • CYP21
  • CYP21A2
  • CYP21B
  • HSD3B1
  • HSD3B2
  • HSDB3A
  • HSDB3B
  • LHB
Homo sapiens (human)
Pyrimidine salvage
  • CDA
  • CDD
  • DCK
  • DXF68S1E
  • ECGF1
  • FAM16AX
  • GS1
  • HDHD1
  • HDHD1A
  • PUDP
  • TK1
  • TK2
  • TYMP
  • UCK1
  • UCK2
  • UCKL1
  • UMPK
  • UP
  • UPP1
  • UPP2
  • URK1
  • URKL1
Homo sapiens (human)
MPS VII - Sly syndrome
  • GUSB
Homo sapiens (human)
GSD 0 (muscle)
  • GYG
  • GYG1
  • GYS
  • GYS1
Homo sapiens (human)
Nef mediated downregulation of MHC class I complex cell surface expression
  • ADTB1
  • ADTG
  • AP19
  • AP1B1
  • AP1G1
  • AP1M1
  • AP1M2
  • AP1S1
  • AP1S2
  • AP1S3
  • B2M
  • BAM22
  • CLAPB2
  • CLAPG1
  • CLAPS1
  • CLTNM
  • HLA-A
  • HLAA
  • KIAA1175
  • PACS1
  • nef
Homo sapiens (human)
Deregulated CDK5 triggers multiple neurodegenerative pathways in Alzheimer's disease models
  • A4
  • AD1
  • APP
  • APT1LG1
  • BCL2L11
  • BIM
  • CANPL1
  • CANPL2
  • CAPN1
  • CAPN2
  • CAPN4
  • CAPNS
  • CAPNS1
  • CAPNS2
  • CAST
  • CD95L
  • CDC25A
  • CDC25B
  • CDC25C
  • CDC25HU2
  • CDK5
  • CDK5R
  • CDK5R1
  • CDKN5
  • FASL
  • FASLG
  • FKHRL1
  • FOXO3
  • FOXO3A
  • GOLGA2
  • JUN
  • LMN2
  • LMNB
  • LMNB1
  • NCK5A
  • NKEFB
  • PAGA
  • PAGB
  • PRDX1
  • PRDX2
  • PSSALRE
  • SOD2
  • TDPX1
  • TDPX2
  • TNFSF6
  • YWHAE
Homo sapiens (human)
Proton-coupled neutral amino acid transporters
  • PAT1
  • PAT2
  • SLC36A1
  • SLC36A2
  • TRAMD1
Homo sapiens (human)
Elastic fibre formation
  • DANCE
  • ELN
  • FBLN5
  • FBN
  • FBN1
  • FBN2
  • FBN3
  • FNRA
  • FNRB
  • FUR
  • FURIN
  • GP3A
  • ITGA5
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB3
  • ITGB6
  • KIAA1776
  • LOX
  • LOXC
  • LOXL
  • LOXL1
  • LOXL2
  • LOXL3
  • LOXL4
  • MAGP1
  • MAGP2
  • MDF2
  • MFAP2
  • MFAP5
  • MSK12
  • MSK8
  • PACE
  • PCSK3
  • VNRA
  • VTNR
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024