GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 2026 - 2050 of 2090 in total
Pathway Name ▲ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
WNT ligand biogenesis and trafficking
  • C1orf139
  • GPR177
  • INT1
  • INT1L1
  • INT4
  • IRP
  • MEM3
  • MG61
  • PORC
  • PORCN
  • PPN
  • SNX3
  • TMED5
  • VPS26
  • VPS26A
  • VPS29
  • VPS35
  • WLS
  • WNT1
  • WNT10A
  • WNT10B
  • WNT11
  • WNT12
  • WNT13
  • WNT14
  • WNT14B
  • WNT15
  • WNT16
  • WNT2
  • WNT2B
  • WNT3
  • WNT3A
  • WNT4
  • WNT5A
  • WNT5B
  • WNT6
  • WNT7A
  • WNT7B
  • WNT8A
  • WNT8B
  • WNT8D
  • WNT9A
  • WNT9B
Homo sapiens (human)
WNT mediated activation of DVL
  • CK2A1
  • CK2A2
  • CK2N
  • CSNK1E
  • CSNK2A1
  • CSNK2A2
  • CSNK2B
  • DVL1
  • DVL2
  • DVL3
  • G5A
  • KIAA0208
  • PIP5K1B
  • STM7
Homo sapiens (human)
WNT5:FZD7-mediated leishmania damping
  • CYBA
  • DVL1
  • DVL2
  • DVL3
  • FZD7
  • JNK1
  • JUN
  • KIAA0208
  • MAPK8
  • MOX1
  • NOH1
  • NOX1
  • NOXA1
  • NOXO1
  • P41NOX
  • P51NOX
  • PRKM8
  • RAC1
  • SAPK1
  • SAPK1C
  • SH3PXD5
  • TC25
  • WNT5A
Homo sapiens (human)
WNT5A-dependent internalization of FZD2, FZD5 and ROR2
  • ADTAA
  • ADTAB
  • ADTB2
  • AP17
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • C2orf31
  • CLAPA1
  • CLAPA2
  • CLAPB1
  • CLAPM1
  • CLAPS2
  • CLH17
  • CLTA
  • CLTB
  • CLTC
  • CLTCL2
  • FZD2
  • FZD5
  • HIP9
  • HYPJ
  • KIAA0034
  • KIAA0109
  • KIAA0899
  • NTRKR1
  • NTRKR2
  • ROR1
  • ROR2
  • WNT5A
Homo sapiens (human)
WNT5A-dependent internalization of FZD4
  • ADTAA
  • ADTAB
  • ADTB2
  • AP17
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • ARB2
  • ARR2
  • ARRB2
  • CLAPA1
  • CLAPA2
  • CLAPB1
  • CLAPM1
  • CLAPS2
  • CLH17
  • CLTA
  • CLTB
  • CLTC
  • CLTCL2
  • DVL2
  • FZD4
  • HIP9
  • HYPJ
  • KIAA0034
  • KIAA0109
  • KIAA0899
  • PKCA
  • PKCB
  • PKCG
  • PRKACA
  • PRKCA
  • PRKCB
  • PRKCB1
  • PRKCG
  • WNT5A
Homo sapiens (human)
XAV939 stabilizes AXIN
  • PARP5A
  • PARP5B
  • PARPL
  • TANK2
  • TIN1
  • TINF1
  • TNKL
  • TNKS
  • TNKS1
  • TNKS2
Homo sapiens (human)
XBP1(S) activates chaperone genes
  • 54TM
  • ACADVL
  • ADD1
  • ADDA
  • ARF1GAP
  • ARFGAP1
  • ATP6D
  • ATP6V0D1
  • C19orf10
  • CDA1
  • CFP1
  • CGBP
  • CHL1
  • CHLR1
  • CLN2
  • CTDSP2
  • CUL7
  • CXXC1
  • DCTN1
  • DDX11
  • DENTT
  • DNAJB11
  • DNAJB9
  • DNAJC3
  • EDEM
  • EDEM1
  • EDJ
  • ERD23
  • ERJ3
  • ERP5
  • EXTL
  • EXTL1
  • EXTL1L
  • EXTL2
  • EXTL3
  • EXTR1
  • EXTR2
  • FKBP14
  • FKBP22
  • GFAT
  • GFPT
  • GFPT1
  • GOSR2
  • GRP170
  • GS27
  • GSK3A
  • HDGF
  • HDJ9
  • HMG1L2
  • HRD1
  • HSPH4
  • HYIF1P
  • HYOU1
  • KDELR3
  • KIAA0076
  • KIAA0212
  • KIAA0218
  • KIAA0519
  • KIAA0905
  • KIAA1027
  • KIAA1810
  • KLHDC3
  • KRG2
  • LMN1
  • LMNA
  • MDG1
  • MIZ1
  • MYDGF
  • NIF2
  • ORP150
  • OS4
  • P5
  • P58IPK
  • PCCX1
  • PDIA5
  • PDIA6
  • PDIR
  • PEAS
  • PHF18
  • PLA2G4B
  • PPP2R5B
  • PREB
  • PRKRI
  • RAMP4
  • SCP2
  • SEC12
  • SEC31A
  • SEC31L1
  • SERP1
  • SHC
  • SHC1
  • SHCA
  • SRPR
  • SRPRA
  • SRPRB
  • SSR1
  • STM
  • SULT1A3
  • SYVN1
  • TATDN2
  • TLN
  • TLN1
  • TPP1
  • TRAPA
  • TSPX
  • TSPYL2
  • TXNDC7
  • VLCAD
  • VPATPD
  • WFS1
  • WIPI1
  • WIPI49
  • YIF1
  • YIF1A
  • ZBTB17
  • ZNF151
  • ZNF60
Homo sapiens (human)
Xenobiotics
  • AHR
  • AHRR
  • ARNT
  • ARNT2
  • BHLHE1
  • BHLHE2
  • BHLHE76
  • BHLHE77
  • CYP1A1
  • CYP2A13
  • CYP2A3
  • CYP2A6
  • CYP2A7
  • CYP2B6
  • CYP2C10
  • CYP2C18
  • CYP2C19
  • CYP2C8
  • CYP2C9
  • CYP2D6
  • CYP2DL1
  • CYP2E
  • CYP2E1
  • CYP2F1
  • CYP2J2
  • CYP2S1
  • CYP2W1
  • CYP3A3
  • CYP3A4
  • CYP3A43
  • CYP3A5
  • CYP3A7
  • KIAA0307
  • KIAA1234
Homo sapiens (human)
YAP1- and WWTR1 (TAZ)-stimulated gene expression
  • ANP
  • CCN2
  • CSX
  • CTGF
  • GATA4
  • HCS24
  • HIPK1
  • HIPK2
  • IGFBP8
  • KAT2B
  • KIAA0630
  • MYAK
  • NBAK2
  • NKX2-5
  • NKX2.5
  • NKX2E
  • NPPA
  • PCAF
  • PND
  • RTEF1
  • TAZ
  • TBX5
  • TCF13
  • TCF13L1
  • TEAD1
  • TEAD2
  • TEAD3
  • TEAD4
  • TEAD5
  • TEF1
  • TEF3
  • TEF4
  • TEF5
  • WWTR1
  • YAP1
  • YAP65
Homo sapiens (human)
Z-decay: degradation of maternal mRNAs by zygotically expressed factors
  • DDX2A
  • DDX2B
  • DDX48
  • DIS3L2
  • EIF4A
  • EIF4A1
  • EIF4A2
  • EIF4A3
  • EIF4B
  • EIF4E
  • EIF4EL1
  • EIF4F
  • EIF4G
  • EIF4G1
  • EIF4GI
  • FAM6A
  • HS2
  • KIAA0111
  • KIAA0191
  • KIAA1711
  • PAB1
  • PAB2
  • PABP
  • PABP1
  • PABP2
  • PABPC1
  • PABPC2
  • PABPN1
  • PAIP1
  • TUT4
  • TUT7
  • ZCCHC11
  • ZCCHC6
Homo sapiens (human)
ZBP1(DAI) mediated induction of type I IFNs
  • C20orf183
  • DLM1
  • ZBP1
Homo sapiens (human)
Zinc efflux and compartmentalization by the SLC30 family
  • SLC30A1
  • SLC30A2
  • SLC30A3
  • SLC30A5
  • SLC30A8
  • ZNT1
  • ZNT2
  • ZNT3
  • ZNT5
  • ZNT8
  • ZNTL1
  • ZTL1
Homo sapiens (human)
Zinc influx into cells by the SLC39 gene family
  • BIGM103
  • HKE4
  • IRT1
  • KIAA0062
  • KIAA1265
  • LIV1
  • RING5
  • SLC39A1
  • SLC39A10
  • SLC39A14
  • SLC39A2
  • SLC39A3
  • SLC39A4
  • SLC39A5
  • SLC39A6
  • SLC39A7
  • SLC39A8
  • ZIP1
  • ZIP10
  • ZIP14
  • ZIP2
  • ZIP3
  • ZIP4
  • ZIP5
  • ZIP6
  • ZIP8
  • ZIRTL
Homo sapiens (human)
Zygotic genome activation (ZGA)
  • CBP
  • CREBBP
  • DPPA2
  • DPPA4
  • DUX10
  • DUX4
  • DUXA
  • DUXB
  • EP300
  • HS2
  • KDM4DL
  • KDM4E
  • KIAA0191
  • KIAA1711
  • LEUTX
  • P300
  • P53
  • PESCRG1
  • RTEF1
  • TCF13L1
  • TEAD4
  • TEF3
  • TP53
  • TPRX1
  • TPRX2
  • TPRXL
  • TUT4
  • TUT7
  • YAP1
  • YAP65
  • ZCCHC11
  • ZCCHC6
  • ZNF494
  • ZSCAN4
Homo sapiens (human)
activated TAK1 mediates p38 MAPK activation
  • BLU
  • CARD15
  • CARD4
  • CARDIAK
  • CROC1
  • CSBP
  • CSBP1
  • CSBP2
  • CSPB1
  • FIP3
  • IKBKG
  • IRAK
  • IRAK1
  • IRAK2
  • KIAA0733
  • MAP2K3
  • MAP2K6
  • MAP3K7
  • MAP3K7IP1
  • MAP3K7IP2
  • MAP3K7IP3
  • MAPK11
  • MAPK14
  • MAPKAPK2
  • MAPKAPK3
  • MEK3
  • MEK6
  • MKK3
  • MKK6
  • MXI2
  • NEMO
  • NOD1
  • NOD2
  • PRKM11
  • PRKMK3
  • PRKMK6
  • RICK
  • RIP2
  • RIPK2
  • RNF85
  • SAPK2
  • SAPK2A
  • SAPK2B
  • SKK2
  • SKK3
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1
  • TRAF6
  • UBE2N
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UEV1
Homo sapiens (human)
alectinib-resistant ALK mutants
  • ALK
Homo sapiens (human)
alpha-linolenic acid (ALA) metabolism
  • ABCD1
  • ACAA
  • ACAA1
  • ACOT8
  • ACSL1
  • ACTEIII
  • ALD
  • CIG30
  • EDH17B4
  • ELG3
  • ELOVL1
  • ELOVL2
  • ELOVL3
  • ELOVL5
  • FACL1
  • FACL2
  • FADS1
  • FADS2
  • FADSD5
  • HSD17B4
  • LACS
  • LACS1
  • LACS2
  • PTE1
  • PTHIO
  • SCP2
  • SDR8C1
  • SSC1
  • SSC2
Homo sapiens (human)
betaKlotho-mediated ligand binding
  • FGF19
  • FGFR4
  • JTK2
  • KLB
  • TKF
Homo sapiens (human)
brigatinib-resistant ALK mutants
  • ALK
Homo sapiens (human)
cGMP effects
  • INSP3R1
  • IRAG
  • IRAG1
  • ITPR1
  • JAW1L
  • KCNMA
  • KCNMA1
  • KCNMB1
  • KCNMB2
  • KCNMB3
  • KCNMB4
  • KCNMBL
  • MRVI1
  • PDE10A
  • PDE11A
  • PDE1A
  • PDE1B
  • PDE2A
  • PDE5
  • PDE5A
  • PDE9A
  • PDES1B
  • PRKG2
  • PRKGR2
  • SLO
Homo sapiens (human)
cell division
  • KIF20A
  • KIF23
  • KNSL5
  • MKLP1
  • MKLP2
  • PLK
  • PLK1
  • RAB6KIFL
Homo sapiens (human)
ceritinib-resistant ALK mutants
  • ALK
Homo sapiens (human)
crenolanib-resistant FLT3 mutants
  • CD135
  • FLK2
  • FLT3
  • STK1
Homo sapiens (human)
crizotinib-resistant ALK mutants
  • ALK
Homo sapiens (human)
eNOS activation
  • AKT1
  • APT1
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAV
  • CAV1
  • CYGB
  • DDAH
  • DDAH1
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPC1
  • HSPCA
  • LPL1
  • LYPLA1
  • NOS3
  • PKB
  • RAC
  • SPR
  • STAP
  • ZDHHC21
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024