GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 251 - 275 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Signaling by ERBB2
  • Btc
  • Cdc37
  • Dtr
  • Egf
  • Egfr
  • Erbb2
  • Erbb3
  • Ereg
  • Fyn
  • Hbegf
  • Hegfl
  • Hsp86
  • Hsp90aa1
  • Hspca
  • Ndf
  • Neu
  • Nrg1
  • Nrg2
  • Nrg3
  • Ntak
  • Src
  • Yes1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Prostanoid ligand receptors
  • Crth2
  • Gpr44
  • Ptgdr
  • Ptgdr2
  • Ptgdrl
  • Ptger1
  • Ptger2
  • Ptger3
  • Ptger4
  • Ptgfr
  • Ptgir
  • Tbxa2r
Rattus norvegicus (Norway rat)
G alpha (q) signalling events
  • 5ht1c
  • A4
  • AD1
  • Adra1a
  • Adra1b
  • Adra1c
  • Adra1d
  • Adrbk1
  • Agt
  • Agtr1
  • Agtr1a
  • Anx1
  • Anxa1
  • App
  • Arhgef25
  • At1a
  • Avp
  • Avpr1a
  • B1bkr
  • Bdkrb1
  • Bdkrb2
  • Bkr
  • Blt
  • Brs3
  • Btk
  • Bv8
  • Casr
  • Cck
  • Cckar
  • Cckbr
  • Ccl6
  • Ccl9
  • Chrm-1
  • Chrm-3
  • Chrm-5
  • Chrm1
  • Chrm3
  • Chrm5
  • Cyslt1
  • Cyslt2
  • Cysltr1
  • Cysltr2
  • Duo
  • Edg2
  • Edg7
  • Edn1
  • Edn2
  • Edn3
  • Ednra
  • Ednrb
  • F2
  • F2r
  • F2rl1
  • F2rl2
  • F2rl3
  • Ffar1
  • Ffar2
  • Ffar3
  • Ffar4
  • Fpr2
  • Gaip
  • Gas
  • Gast
  • Gcg
  • Gcgr
  • Geft
  • Ghrl
  • Ghsr
  • Gna11
  • Gna14
  • Gna15
  • Gnaq
  • Gnb1
  • Gnb2
  • Gnb3
  • Gnb4
  • Gnb5
  • Gng10-ps1
  • Gng11
  • Gng12
  • Gng3
  • Gng4
  • Gng5
  • Gng5-ps4
  • Gng7
  • Gng8
  • Gng9
  • Gngt1
  • Gngt11
  • Gngt5
  • Gngt7
  • Gngt9
  • Gnrh
  • Gnrh1
  • Gnrhr
  • Gpcr91
  • Gpr120
  • Gpr132
  • Gpr14
  • Gpr143
  • Gpr147
  • Gpr154
  • Gpr17
  • Gpr24
  • Gpr39
  • Gpr4
  • Gpr40
  • Gpr41
  • Gpr43
  • Gpr54
  • Gpr65
  • Gpr66
  • Gpr68
  • Gpr73
  • Gpr73l1
  • Gpr74
  • Gprc1a
  • Gprc1e
  • Gprc2a
  • Gprc6a
  • Grk2
  • Grm1
  • Grm5
  • Grp
  • Grpr
  • Hapip
  • Hcrt
  • Hcrtr1
  • Hcrtr2
  • Hrh1
  • Htr1c
  • Htr2
  • Htr2a
  • Htr2b
  • Htr2c
  • Kalrn
  • Kiss1
  • Kiss1r
  • Kng
  • Kng1
  • Lpa1
  • Lpa3
  • Lpar1
  • Lpar2
  • Lpar3
  • Lpar4
  • Lpar5
  • Lpar6
  • Ltb4r
  • Ltb4r2
  • Ltn
  • Mch
  • Mchr1
  • Mglur1
  • Mglur5
  • Nka
  • Nkna
  • Nknb
  • Nmb
  • Nmbr
  • Nms
  • Nmu
  • Nmur1
  • Nmur2
  • Npff
  • Npff1
  • Npff2
  • Npffr1
  • Npffr2
  • Npgpr
  • Nps
  • Npsr1
  • Ntr2
  • Nts
  • Ntsr
  • Ntsr1
  • Ntsr2
  • O3far1
  • Opn4
  • Ot
  • Otr
  • Ox
  • Oxt
  • Oxtr
  • P2ru1
  • P2ry1
  • P2ry10
  • P2ry2
  • P2ry5
  • P2ry6
  • P2y5
  • P518
  • Par1
  • Par2
  • Par3
  • Par4
  • Pcar1
  • Pik3ca
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Pik3r3
  • Pkr1
  • Pkr2
  • Plcb1
  • Plcb2
  • Plcb3
  • Plcb4
  • Pmch
  • Ppox
  • Prok1
  • Prok2
  • Prokr1
  • Prokr2
  • Ptafr
  • Ptger1
  • Ptgfr
  • Qrfp
  • Qrfprl
  • RGD1560028
  • Rgs1
  • Rgs13
  • Rgs16
  • Rgs17
  • Rgs18
  • Rgs19
  • Rgs2
  • Rgs21
  • Rgs3
  • Rgs4
  • Rgs5
  • Rgsl1
  • Rgsr
  • Scyc1
  • Senr
  • Serpina8
  • Slc1
  • Srl
  • Tac1
  • Tac1r
  • Tac2
  • Tac2r
  • Tac3
  • Tac3r
  • Tacr1
  • Tacr2
  • Tacr3
  • Tbxa2r
  • Tgr1
  • Trh
  • Trhr
  • Trio
  • Urp
  • Uts2
  • Uts2b
  • Uts2d
  • Uts2r
  • XCR1
  • Xcl1
  • Xcr1
Rattus norvegicus (Norway rat)
FGFR1c and Klotho ligand binding and activation
  • Fgf23
  • Fgfr1
  • Flg
  • Kl
Rattus norvegicus (Norway rat)
Hormone ligand-binding receptors
  • Cga
  • Cga1
  • Fshb
  • Fshr
  • Gnrh
  • Gnrh1
  • Gnrhr
  • Gpa2
  • Gpb5
  • Gpha2
  • Gphb5
  • Lhb
  • Lhcgr
  • Tshb
  • Tshr
  • Zsig51
Rattus norvegicus (Norway rat)
Synthesis of PI
  • Cdipt
  • Cds
  • Cds1
  • Nir2
  • Pis1
  • Pitpnm
  • Pitpnm1
  • Pitpnm2
  • Pitpnm3
Rattus norvegicus (Norway rat)
GPVI-mediated activation cascade
  • Arha
  • Arha2
  • Arhb
  • Cdc42
  • Clec1b
  • Fce1g
  • Fcer1g
  • Fyn
  • G6b
  • Gp6
  • Lat
  • Lck
  • Lcp2
  • Lyn
  • Mpig6b
  • Pdk1
  • Pdpk1
  • Pdpn
  • Pik3ca
  • Pik3cb
  • Pik3cg
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Pik3r3
  • Pik3r5
  • Pik3r6
  • Plcg2
  • Ptph6
  • Ptpn11
  • Ptpn6
  • Rac
  • Rac1
  • Rac2
  • Rhoa
  • Rhob
  • Rhog
  • Syk
  • Vav
  • Vav1
  • Vav2
  • Vav3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Glycosphingolipid biosynthesis
  • A4galt
  • B3galnt1
  • B3galt3
  • B3galt4
  • B3gnt5
  • B4galnt1
  • B4galt5
  • B4galt6
  • Cerk
  • Cgt
  • Fta
  • Ftb
  • Fut1
  • Fut2
  • Gal3st1
  • Galgt
  • Galgt1
  • Sec1
  • Siat4b
  • Siat5
  • Siat6
  • Siat8e
  • Siat9
  • St3gal2
  • St3gal3
  • St3gal5
  • St6galnac5
  • St6galnac6
  • St8sia5
  • St8siav
  • Ugcg
  • Ugt4
  • Ugt8
Rattus norvegicus (Norway rat)
G alpha (s) signalling events
  • Adrb2
  • Adrb2r
  • Adrbk1
  • Adrbk2
  • Arrb1
  • Arrb2
  • Dpde1
  • Gprk5
  • Gprk6
  • Grk2
  • Grk3
  • Grk5
  • Grk6
  • Pde10a
  • Pde11a
  • Pde1a
  • Pde1b
  • Pde1b1
  • Pde2a
  • Pde3a
  • Pde3b
  • Pde4a
  • Pde4c
  • Pde4d
  • Pde7a
  • Pde7b
  • Pde8a
  • Pde8b
  • RNPDE8A
Rattus norvegicus (Norway rat)
IRS-related events triggered by IGF1R
  • Igf-1
  • Igf-2
  • Igf1
  • Igf1r
  • Igf2
  • Irs-1
  • Irs1
  • Irs2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Inhibition of TSC complex formation by PKB
  • Akt2
  • Tsc1
  • Tsc2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Synaptic adhesion-like molecules
  • Dlg1
  • Dlg3
  • Dlg4
  • Dlgh1
  • Dlgh3
  • Dlgh4
  • Flot1
  • Flot2
  • GluA1
  • GluA3
  • GluN2D
  • Glur1
  • Glur3
  • Glur4
  • Gria1
  • Gria3
  • Gria4
  • Grin1
  • Grin2a
  • Grin2b
  • Grin2c
  • Grin2d
  • Lar
  • Lrfn1
  • Lrfn2
  • Lrfn3
  • Lrfn4
  • Nmdar1
  • Psd95
  • Ptprd
  • Ptprf
  • Ptprs
  • Reg1
  • Reg2
  • Rtn3
  • Salm1
  • Salm2
  • Salm3
  • Salm4
Rattus norvegicus (Norway rat)
Regulation of FZD by ubiquitination
  • Fzd4
  • Fzd5
  • Fzd6
  • Fzd8
  • LOC100360645
  • Lgr5
  • Lgr6
  • Lrp5
  • Lrp6
  • R-spondin2
  • Rnf43
  • Rps27a
  • Rspo1
  • Rspo2
  • Rspo3
  • Rspo4
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Usp8
  • Wnt3a
  • Znrf3
Rattus norvegicus (Norway rat)
RNA polymerase II transcribes snRNA genes
  • AABR07064983.1
  • AC109542.1
  • Cak
  • Cak1
  • Cbp20
  • Cbp80
  • Ccnk
  • Ccnt1
  • Ccnt2
  • Cdk7
  • Cdk9
  • Cpsf3l
  • Ell
  • Ell2
  • Ell3
  • Gtf2a1
  • Gtf2a2
  • Gtf2b
  • Gtf2e1
  • Gtf2e2
  • Gtf2f1
  • Gtf2f2
  • Ice1
  • Ice2
  • Ints1
  • Ints10
  • Ints11
  • Ints12
  • Ints13
  • Ints14
  • Ints2
  • Ints3
  • Ints4
  • Ints5
  • Ints6
  • Ints7
  • Ints8
  • Ints9
  • LOC120098305
  • Mo15
  • Nabp1
  • Nabp2
  • Narg2
  • Ncbp1
  • Ncbp2
  • Obfc2a
  • Obfc2b
  • Oct-1
  • Otf-1
  • Otf1
  • Pcf11
  • Phax
  • Phf22
  • Polr2a
  • Polr2b
  • Polr2c
  • Polr2d
  • Polr2e
  • Polr2f
  • Polr2g
  • Polr2i
  • Polr2j
  • Pou2f1
  • Pou2f2
  • RGD1562299
  • Rap30
  • Rnuxa
  • Rpap2
  • Rprd1a
  • Rprd1b
  • Rprd2
  • Snapc1
  • Snapc2
  • Snapc3
  • Snapc4
  • Sp1
  • Srrt
  • Ssb1
  • Ssb2
  • Ssu72
  • Supt4h1
  • Supt5h
  • Taf11
  • Taf13
  • Taf2e
  • Taf2g
  • Taf5
  • Taf6
  • Taf8l1
  • Taf9
  • Tafii31
  • Tbp
  • Vwa9
  • Zc3h8
Rattus norvegicus (Norway rat)
Acrosome Reaction and Sperm:Oocyte Membrane Binding
  • Acr
  • Cd9
  • Izumo1
  • Izumo2
  • Izumo3
  • Izumo4
Rattus norvegicus (Norway rat)
Sodium/Calcium exchangers
  • CaMIII
  • Calm3
  • Cam3
  • Camc
  • Nckx1
  • Nckx2
  • Nckx3
  • Nckx6
  • Nclx
  • Ncx1
  • Ncx2
  • Ncx3
  • Slc24a1
  • Slc24a2
  • Slc24a3
  • Slc24a4
  • Slc24a5
  • Slc24a6
  • Slc8a1
  • Slc8a2
  • Slc8a3
  • Slc8b1
  • Sri
Rattus norvegicus (Norway rat)
YAP1- and WWTR1 (TAZ)-stimulated gene expression
  • Kat2b
  • Tbx5
  • Tead1
  • Tead2
  • Tead3
  • Tead4
  • Wwtr1
  • Yap
  • Yap1
  • Yap65
Rattus norvegicus (Norway rat)
Metabolism of steroid hormones
  • Sts
Rattus norvegicus (Norway rat)
Downregulation of TGF-beta receptor signaling
  • Bambi
  • LOC100360645
  • Madh2
  • Madh3
  • Madh7
  • Mtmr4
  • Pmepa1
  • Rps27a
  • Smad2
  • Smad3
  • Smad7
  • Smurf2
  • Strap
  • Tgfb1
  • Tgfbr1
  • Tgfbr2
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Unrip
Rattus norvegicus (Norway rat)
MAPK3 (ERK1) activation
  • Cdc2
  • Cdc2a
  • Cdk1
  • Cdkn1
  • Erk1
  • Il-6
  • Il6
  • Il6r
  • Il6ra
  • Il6st
  • Jak1
  • Jak2
  • Map2k1
  • Mapk3
  • Mek1
  • Prkm3
  • Prkmk1
  • Ptpn11
  • Tyk2
Rattus norvegicus (Norway rat)
ATF6B (ATF6-beta) activates chaperones
  • Atf6b
  • Mbtps1
  • S1p
  • Ski1
Rattus norvegicus (Norway rat)
The canonical retinoid cycle in rods (twilight vision)
  • Cyp4v2
  • Cyp4v3
  • Lrat
  • Myo7a
  • Rbp-1
  • Rbp1
  • Rbp3
  • Rbp4
  • Rdh10
  • Rdh11
  • Rdh12
  • Rho
  • Rlbp1
  • Rpe65
  • Stra6
  • Tt
  • Ttr
Rattus norvegicus (Norway rat)
Nuclear signaling by ERBB4
  • AABR07043897.1
  • Aph1a
  • Esr
  • Esr1
  • Estr
  • Mgf
  • Ncstn
  • Nr3a1
  • Ps2
  • Psen1
  • Psen2
  • Psenen
  • Psnl1
  • Psnl2
  • Src
  • Stat5a
  • Wwox
  • Yap
  • Yap1
  • Yap65
Rattus norvegicus (Norway rat)
PD-1 signaling
  • AABR07044416.1
  • Arrb2-ps
  • Cd247
  • Cd274
  • Cd3d
  • Cd3e
  • Cd3g
  • Cd4
  • Csk
  • DA1
  • Db2
  • ENSRNOG00000065769
  • ENSRNOG00000065908
  • ENSRNOG00000065955
  • ENSRNOG00000070909
  • H2-Ea
  • Hla-dma
  • Hla-dmb
  • LOC100911800
  • Lck
  • Pdcd1
  • Pdcd1lg2
  • Psmb9
  • Ptph6
  • Ptpn11
  • Ptpn6
  • RT1-Ba
  • RT1-Bb
  • RT1-DOb
  • RT1-Da
  • RT1-Db1
  • RT1-Db2
  • RT1-Ha
  • RT1-Hb-ps1
  • T3d
  • Tap1
  • Tap2
  • Tesb
  • Trbv16
Rattus norvegicus (Norway rat)
Biosynthesis of DHA-derived SPMs
  • Alox12
  • Alox12l
  • Alox15
  • Cox-2
  • Cox2
  • Ptgs2
Rattus norvegicus (Norway rat)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024