GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 451 - 475 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
Chylomicron assembly
  • Apoa1
  • Apoa2
  • Apoa4
  • Apob
  • Apoc2
  • Apoc3
  • Apoe
  • Mtp
  • Mttp
  • P4hb
  • Pdia1
  • Sar1b
Rattus norvegicus (Norway rat)
Fc epsilon receptor (FCERI) signaling
  • AABR07034730.2
  • AABR07060971.1
  • AABR07061001.1
  • AABR07065782.1
  • AABR07065808.1
  • AABR07065812.2
  • AABR07065813.1
  • ENSRNOG00000062324
  • ENSRNOG00000062682
  • ENSRNOG00000062762
  • ENSRNOG00000062853
  • ENSRNOG00000062915
  • ENSRNOG00000062976
  • ENSRNOG00000063148
  • ENSRNOG00000063329
  • ENSRNOG00000063340
  • ENSRNOG00000063341
  • ENSRNOG00000063422
  • ENSRNOG00000063550
  • ENSRNOG00000063572
  • ENSRNOG00000063707
  • ENSRNOG00000063791
  • ENSRNOG00000064041
  • ENSRNOG00000064061
  • ENSRNOG00000064085
  • ENSRNOG00000064245
  • ENSRNOG00000064481
  • ENSRNOG00000064582
  • ENSRNOG00000065160
  • ENSRNOG00000065181
  • ENSRNOG00000065191
  • ENSRNOG00000065237
  • ENSRNOG00000065406
  • ENSRNOG00000065564
  • ENSRNOG00000065629
  • ENSRNOG00000065670
  • ENSRNOG00000065675
  • ENSRNOG00000065690
  • ENSRNOG00000065855
  • ENSRNOG00000066010
  • ENSRNOG00000066072
  • ENSRNOG00000066203
  • ENSRNOG00000066380
  • ENSRNOG00000066406
  • ENSRNOG00000066431
  • ENSRNOG00000066785
  • ENSRNOG00000066812
  • ENSRNOG00000066814
  • ENSRNOG00000066904
  • ENSRNOG00000066922
  • ENSRNOG00000066926
  • ENSRNOG00000066971
  • ENSRNOG00000067010
  • ENSRNOG00000067025
  • ENSRNOG00000067233
  • ENSRNOG00000067273
  • ENSRNOG00000067516
  • ENSRNOG00000067603
  • ENSRNOG00000067643
  • ENSRNOG00000067679
  • ENSRNOG00000067883
  • ENSRNOG00000068055
  • ENSRNOG00000068059
  • ENSRNOG00000068381
  • ENSRNOG00000068499
  • ENSRNOG00000068847
  • ENSRNOG00000069193
  • ENSRNOG00000069427
  • ENSRNOG00000069491
  • ENSRNOG00000069766
  • ENSRNOG00000069828
  • ENSRNOG00000069901
  • ENSRNOG00000069940
  • ENSRNOG00000070091
  • ENSRNOG00000070192
  • ENSRNOG00000070244
  • ENSRNOG00000070247
  • ENSRNOG00000070810
  • ENSRNOG00000070812
  • ENSRNOG00000070816
  • ENSRNOG00000070832
  • ENSRNOG00000070933
  • ENSRNOG00000070986
  • ENSRNOG00000071049
  • ENSRNOG00000071091
  • Fce1a
  • Fce1b
  • Fce1g
  • Fcer1a
  • Fcer1b
  • Fcer1g
  • Igkv2-112l1
  • Igkv8-30l1
  • Igkvl-ps6
  • Igkvl10
  • Igkvl12
  • Igkvl13
  • Igkvl2
  • Iglc1
  • Igll1
  • LOC100363522
  • LOC100365500
  • LOC100911032
  • LOC102551948
  • LOC690813
  • Lat
  • Lyn
  • Ms4a2
  • RGD1561722
  • RGD1564696
  • Syk
Rattus norvegicus (Norway rat)
Regulation of Complement cascade
  • AABR07034730.2
  • AABR07060971.1
  • AABR07061001.1
  • AABR07065782.1
  • AABR07065808.1
  • AABR07065812.2
  • AABR07065813.1
  • C1qa
  • C1qb
  • C1qc
  • C1qg
  • C1r
  • C1s
  • C2
  • C3
  • C3ar1
  • C4
  • C4a
  • C4b
  • C5
  • C5ar1
  • C5ar2
  • C5l2
  • C5r1
  • C9
  • Cd19
  • Cd46
  • Cd55
  • Cd81
  • Cfb
  • Cfh
  • Cfhr2
  • Cfi
  • Clu
  • Cpb2
  • Cpn1
  • Cpn2
  • Cr1l
  • Cr2
  • Crry
  • ENSRNOG00000062324
  • ENSRNOG00000062682
  • ENSRNOG00000062762
  • ENSRNOG00000062853
  • ENSRNOG00000062915
  • ENSRNOG00000062976
  • ENSRNOG00000063148
  • ENSRNOG00000063329
  • ENSRNOG00000063340
  • ENSRNOG00000063341
  • ENSRNOG00000063422
  • ENSRNOG00000063550
  • ENSRNOG00000063572
  • ENSRNOG00000063707
  • ENSRNOG00000063791
  • ENSRNOG00000064041
  • ENSRNOG00000064061
  • ENSRNOG00000064085
  • ENSRNOG00000064245
  • ENSRNOG00000064481
  • ENSRNOG00000064582
  • ENSRNOG00000065160
  • ENSRNOG00000065181
  • ENSRNOG00000065191
  • ENSRNOG00000065237
  • ENSRNOG00000065406
  • ENSRNOG00000065564
  • ENSRNOG00000065629
  • ENSRNOG00000065670
  • ENSRNOG00000065675
  • ENSRNOG00000065690
  • ENSRNOG00000065855
  • ENSRNOG00000066010
  • ENSRNOG00000066072
  • ENSRNOG00000066203
  • ENSRNOG00000066380
  • ENSRNOG00000066406
  • ENSRNOG00000066431
  • ENSRNOG00000066785
  • ENSRNOG00000066812
  • ENSRNOG00000066814
  • ENSRNOG00000066867
  • ENSRNOG00000066904
  • ENSRNOG00000066922
  • ENSRNOG00000066926
  • ENSRNOG00000066971
  • ENSRNOG00000067010
  • ENSRNOG00000067025
  • ENSRNOG00000067233
  • ENSRNOG00000067273
  • ENSRNOG00000067516
  • ENSRNOG00000067603
  • ENSRNOG00000067643
  • ENSRNOG00000067679
  • ENSRNOG00000067883
  • ENSRNOG00000068055
  • ENSRNOG00000068059
  • ENSRNOG00000068381
  • ENSRNOG00000068499
  • ENSRNOG00000068847
  • ENSRNOG00000069193
  • ENSRNOG00000069427
  • ENSRNOG00000069491
  • ENSRNOG00000069766
  • ENSRNOG00000069828
  • ENSRNOG00000069901
  • ENSRNOG00000069940
  • ENSRNOG00000070091
  • ENSRNOG00000070192
  • ENSRNOG00000070244
  • ENSRNOG00000070247
  • ENSRNOG00000070810
  • ENSRNOG00000070812
  • ENSRNOG00000070816
  • ENSRNOG00000070832
  • ENSRNOG00000070933
  • ENSRNOG00000071049
  • ENSRNOG00000071091
  • Elane
  • F2
  • Gpr77
  • If
  • Igkv2-112l1
  • Igkv8-30l1
  • Igkvl-ps6
  • Igkvl10
  • Igkvl12
  • Igkvl13
  • Igkvl2
  • Iglc1
  • Igll1
  • LOC100363522
  • LOC100365500
  • LOC100911032
  • LOC102551948
  • LOC690813
  • Mcp
  • RGD1561722
  • RGD1564696
  • Serping1
  • Tapa1
  • r-gsp
Rattus norvegicus (Norway rat)
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR3
  • Fgf-1
  • Fgf-2
  • Fgf-5
  • Fgf-9
  • Fgf1
  • Fgf16
  • Fgf17
  • Fgf18
  • Fgf2
  • Fgf20
  • Fgf23
  • Fgf4
  • Fgf5
  • Fgf7a
  • Fgf8
  • Fgf9
  • Fgfa
  • Fgfr3
  • Plcg1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Dectin-1 mediated noncanonical NF-kB signaling
  • Btrc
  • Chuk
  • Cul1
  • Fbxw11
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Map3k14
  • Mecl1
  • Mss1
  • Nfkb2
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Relb
  • Ring12
  • Rps27a
  • Skp1
  • Skp1a
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Uba3
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Ube1c
  • Ube2m
Rattus norvegicus (Norway rat)
Downstream TCR signaling
  • AABR07044416.1
  • Arrb2-ps
  • Bcl10
  • Card11
  • Cd247
  • Cd3d
  • Cd3e
  • Cd3g
  • Cd4
  • Chuk
  • DA1
  • Db2
  • ENSRNOG00000065769
  • ENSRNOG00000065908
  • ENSRNOG00000065955
  • ENSRNOG00000070909
  • H2-Ea
  • Hla-dma
  • Hla-dmb
  • Ikbkb
  • Ikbkg
  • Ikkb
  • Inpp5d
  • LOC100911800
  • Lck
  • Malt1
  • Map3k7
  • Map3k7ip2
  • Nemo
  • Pdk1
  • Pdpk1
  • Pik3ca
  • Pik3cb
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Pkcq
  • Prkcq
  • Psmb9
  • Pten
  • RT1-Ba
  • RT1-Bb
  • RT1-DOb
  • RT1-Da
  • RT1-Db1
  • RT1-Db2
  • RT1-Ha
  • RT1-Hb-ps1
  • Ripk2
  • Ship
  • Ship1
  • T3d
  • Tab2
  • Tap1
  • Tap2
  • Tesb
  • Traf6
  • Trat1
  • Trbv16
Rattus norvegicus (Norway rat)
Negative regulation of FGFR4 signaling
  • Ash
  • Cbl
  • Erk1
  • Erk2
  • FGF15
  • FGF6
  • Fgf-1
  • Fgf-2
  • Fgf-9
  • Fgf1
  • Fgf16
  • Fgf17
  • Fgf18
  • Fgf19
  • Fgf2
  • Fgf20
  • Fgf23
  • Fgf4
  • Fgf6
  • Fgf7a
  • Fgf7b
  • Fgf8
  • Fgf8a
  • Fgf9
  • Fgfa
  • Fgfr4
  • Frs2
  • Grb2
  • Klb
  • LOC100360645
  • Mapk
  • Mapk1
  • Mapk3
  • Prkm1
  • Prkm3
  • Ptpn11
  • Rps27a
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
FGFR2c ligand binding and activation
  • FGF6
  • Fgf-1
  • Fgf-2
  • Fgf-5
  • Fgf-9
  • Fgf1
  • Fgf16
  • Fgf17
  • Fgf18
  • Fgf2
  • Fgf20
  • Fgf23
  • Fgf4
  • Fgf5
  • Fgf6
  • Fgf7a
  • Fgf7b
  • Fgf8
  • Fgf9
  • Fgfa
  • Fgfr2
Rattus norvegicus (Norway rat)
p75NTR recruits signalling complexes
  • Ikbkb
  • Ikkb
  • Irak1
  • LOC100360645
  • Myd88
  • Ngf
  • Ngfb
  • Ngfr
  • Pkcl
  • Prkci
  • Ripk2
  • Rps27a
  • Sqstm1
  • Tnfrsf16
  • Traf6
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Zip
Rattus norvegicus (Norway rat)
Interleukin-12 signaling
  • IL12B
  • Il12a
  • Il12b
  • Il12rb1
  • Il12rb2
  • Jak1
  • Jak2
  • P4hb
  • Pdia1
  • Sybl1
  • Tyk2
  • Vamp7
Rattus norvegicus (Norway rat)
Choline catabolism
  • Ald7a1
  • Aldh7a1
  • Bhmt
  • Cd92
  • Cdw92
  • Chdh
  • Ctl1
  • Dmgdh
  • Sardh
  • Slc44a1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Calmodulin induced events
  • Adrbk1
  • CaMIII
  • Calm3
  • Cam3
  • Camc
  • Grk2
  • Pkca
  • Pkcc
  • Pkcd
  • Pkcg
  • Prkca
  • Prkcc
  • Prkcd
  • Prkcg
Rattus norvegicus (Norway rat)
TNFR1-induced NF-kappa-B signaling pathway
  • Api3
  • Birc2
  • Birc3
  • Birc4
  • Chuk
  • Cyld
  • Cyld1
  • Gnb2l1
  • Ikbkb
  • Ikbkg
  • Ikkb
  • Map3k7
  • Map3k7ip2
  • Nemo
  • Optn
  • Otud1
  • Otud7b
  • Pd1
  • Pkcbpb15
  • Rack1
  • Rbck
  • Rbck1
  • Ripk1
  • Rnf31
  • Spata2
  • Tab1
  • Tab2
  • Tab3
  • Tnf
  • Tnfa
  • Tnfaip3
  • Tnfr-1
  • Tnfr1
  • Tnfrsf1a
  • Tnfsf2
  • Tradd
  • Traf1
  • Traf2
  • Ubce7ip3
  • Ubp41
  • Ubp69
  • Usp2
  • Usp21
  • Usp4
  • Xiap
Rattus norvegicus (Norway rat)
FGFR2 alternative splicing
  • AC109542.1
  • Cbp20
  • Cbp80
  • Gtf2f1
  • Gtf2f2
  • Hnrnpa1
  • Hnrpa1
  • LOC120098305
  • Ncbp1
  • Ncbp2
  • Polr2a
  • Polr2b
  • Polr2c
  • Polr2d
  • Polr2e
  • Polr2f
  • Polr2g
  • Polr2i
  • Polr2j
  • Ptb
  • Ptbp1
  • Pybp
  • Rap30
  • Tbfii
Rattus norvegicus (Norway rat)
Ephrin signaling
  • Arhgef7
  • Efnb1
  • Efnb3
  • Elk
  • Ephb1
  • Ephb2
  • Ephb3
  • Ephb4
  • Ephb6
  • Eplg2
  • Epth2
  • Fyn
  • Git1
  • LOC686310
  • Lerk2
  • Nck2
  • Pak1
  • Pak2
  • Pak3
  • Pak3bp
  • Pixb
  • Rac
  • Rac1
  • Rlc-a
  • Sdcbp
  • Src
Rattus norvegicus (Norway rat)
EPH-ephrin mediated repulsion of cells
  • Aph1a
  • Efnb1
  • Efnb3
  • Elk
  • Ephb1
  • Ephb2
  • Ephb3
  • Ephb4
  • Ephb6
  • Eplg2
  • Epth2
  • Fyn
  • LOC686310
  • Lerk2
  • Lyn
  • Mmp2
  • Mmp9
  • Ncstn
  • Ps2
  • Psen1
  • Psen2
  • Psenen
  • Psnl1
  • Psnl2
  • Rac
  • Rac1
  • Src
  • Tiam1
  • Vav2
  • Vav3
  • Yes1
Rattus norvegicus (Norway rat)
HDMs demethylate histones
  • Arid5b
  • H3c13
  • H4c16
  • H4c2
  • H4f16
  • H4ft
  • Hist1h4b
  • Hist1h4m
  • Hist2h3c2
  • Hist4
  • Hist4h4
  • Jhdm2a
  • Jhdm3d
  • Jmjd1a
  • Jmjd2d
  • Jmjd6
  • Kdm1a
  • Kdm1b
  • Kdm2a
  • Kdm2b
  • Kdm3a
  • Kdm3b
  • Kdm4a
  • Kdm4b
  • Kdm4c
  • Kdm4d
  • Kdm5a
  • Kdm5b
  • Kdm5c
  • Kdm5d
  • Kdm6a
  • Kdm6b
  • Kdm7a
  • Mina
  • Mina53
  • Phf2
  • Phf8
  • Ptdsr
  • Riox2
  • Tsga
  • Uty
Rattus norvegicus (Norway rat)
Synthesis of bile acids and bile salts
  • Bar
  • Ch25h
  • Cyp7
  • Cyp7a1
  • Cyp7b1
  • Fxr
  • Ncoa1
  • Ncoa2
  • Nr1h4
  • Nr2b1
  • Orp1
  • Osbp
  • Osbpl1a
  • Osbpl2
  • Osbpl3
  • Osbpl6
  • Osbpl7
  • Osbpl9
  • Rip14
  • Rxra
  • Tif2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Orc1 removal from chromatin
  • Ccna1
  • Ccna2
  • Cdc6
  • Cdk2
  • Cdkn2
  • Cdt1
  • Cul1
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mcm2
  • Mcm3
  • Mcm4
  • Mcm5
  • Mcm8
  • Mecl1
  • Mss1
  • Orc1
  • Orc1l
  • Orc2
  • Orc2l
  • Orc3
  • Orc3l
  • Orc4
  • Orc4l
  • Orc5
  • Orc6
  • Psma1
  • Psma2
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  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
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  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
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  • Psmd14
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  • Psmd9
  • Psme1
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  • Rbx1
  • Ring12
  • Rps27a
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  • Sug1
  • Tbp1
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  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
G2/M Checkpoints
  • Gtse1
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mecl1
  • Mss1
  • P53
  • Psma1
  • Psma2
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  • Rps27a
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Tp53
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
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  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
ROS and RNS production in phagocytes
  • Aif1
  • Atp6b2
  • Atp6c
  • Atp6l
  • Atp6n1
  • Atp6s14
  • Atp6v0a1
  • Atp6v0a4
  • Atp6v0b
  • Atp6v0c
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  • Atp6v1f
  • Atp6v1g1
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  • Atp6v1h
  • Atpl
  • Bat1a
  • Bcg
  • Bnos
  • Cdk2ap1-ps2
  • Cdk2ap1-ps3
  • Cdk2ap1-ps4
  • Cdk2ap1-ps5
  • Cdk2ap1-ps6
  • Cyba
  • Cybb
  • Dsr1
  • E230034O05Rik
  • Hvcn1
  • LOC224733l-3
  • LOC224733l-4
  • LOC224733l-5
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  • LOC224733l-7
  • LOC224733l-8
  • Lst1
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  • Nos1
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  • Nos3
  • Nramp1
  • RT1-CE12
  • RT1-CE3
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  • RT1-CE6
  • RT1-CE8
  • RT1-CE9
  • Rac2
  • Sacm2l-ps3
  • Sacm2l-ps4
  • Sacm2l-ps5
  • Sacm2l-ps6
  • Sacm2l-ps7
  • Slc11a1
  • Tcirg1
  • Tnf
  • Vat2
  • Vatf
  • Vpp1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Phase 3 - rapid repolarisation
  • Akap9
  • Erg
  • Kcna5
  • Kcna9
  • Kcne1l
  • Kcne2
  • Kcne3
  • Kcne4
  • Kcne5
  • Kcnh2
  • Kcnq1
  • Kvlqt1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Mineralocorticoid biosynthesis
  • Cga
  • Cga1
  • Cyp11b-2
  • Cyp11b2
  • Cyp21
  • Cyp21a1
  • Hsd3b
  • Hsd3b1
  • Hsd3b5
  • Hsd3b5-ps1
  • Hsd3b6
  • Lhb
Rattus norvegicus (Norway rat)
Oxidative Stress Induced Senescence
  • Cbx2
  • Cbx4
  • Cbx6
  • Cbx8
  • Cdk4
  • Cdk6
  • Cdkn2b
  • Cdkn2d
  • Csbp1
  • Csbp2
  • ENSRNOG00000062927
  • ENSRNOG00000064540
  • ENSRNOG00000066901
  • ENSRNOG00000068034
  • Eed
  • Erk1
  • Erk2
  • Ezh2
  • Fos
  • H2ab3
  • H2ac10
  • H2ac18
  • H2ac4
  • H2afb3
  • H2afx
  • H2aj
  • H2ax
  • H2az2
  • H2bc1
  • H2bc12l1
  • H2bc6
  • H2bcl1
  • H2bcl2
  • H2bu1
  • H3-3b
  • H3.3b
  • H3c13
  • H3f3b
  • H4c16
  • H4c2
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  • H4ft
  • Hist1h2ba
  • Hist1h2bc
  • Hist1h2bg
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  • Hist1h2bq
  • Hist1h4b
  • Hist1h4m
  • Hist2h2aa3
  • Hist2h3c2
  • Hist4
  • Hist4h4
  • Ink4
  • Jnk1
  • Jnk2
  • Jnk3
  • Jun
  • Kdm6b
  • LOC100360645
  • LOC100365043
  • LOC100910200
  • LOC120097726
  • LOC684797
  • Map2k3
  • Map2k4
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  • Map2k7
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  • Mapk
  • Mapk1
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  • Mapk9
  • Mapkapk2
  • Mapkapk3
  • Mapkapk5
  • Mdm2
  • Mdm4
  • Mdmx
  • Mink
  • Mink1
  • Mkk6
  • P53
  • Phc1
  • Phc2
  • Phc3
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  • Rnf1
  • Rnf2
  • Rps27a
  • Scml2
  • Suz12
  • Th2b
  • Tnik
  • Tp53
  • Txn
  • Txn1
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Biosynthesis of DPAn-3 SPMs
  • Cox-2
  • Cox2
  • Ptgs2
Rattus norvegicus (Norway rat)

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Last updated: August 19, 2024