GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 726 - 750 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name ▼ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Unblocking of NMDA receptors, glutamate binding and activation
  • Actn2
  • CaMIII
  • Calm3
  • Cam3
  • Camc
  • Camk2a
  • Camk2b
  • Camk2d
  • Camk2g
  • Dlg1
  • Dlg2
  • Dlg3
  • Dlg4
  • Dlgh1
  • Dlgh2
  • Dlgh3
  • Dlgh4
  • GluA1
  • GluA2
  • GluA3
  • GluN2D
  • Glur1
  • Glur2
  • Glur3
  • Glur4
  • Gria1
  • Gria2
  • Gria3
  • Gria4
  • Grin1
  • Grin2a
  • Grin2b
  • Grin2c
  • Grin2d
  • Lap1
  • Lrrc7
  • Nefl
  • Nf68
  • Nfl
  • Nmdar1
  • Psd95
Rattus norvegicus (Norway rat)
RAF/MAP kinase cascade
  • Actn2
  • Angpt1
  • Areg
  • Artn
  • Ash
  • Btc
  • CaMIII
  • Calm3
  • Cam3
  • Camc
  • Camk2a
  • Camk2b
  • Camk2d
  • Camk2g
  • Csf2
  • Csf2rb
  • Csfgm
  • Dlg1
  • Dlg2
  • Dlg3
  • Dlg4
  • Dlgh1
  • Dlgh2
  • Dlgh3
  • Dlgh4
  • Dtr
  • Egf
  • Egfr
  • Erbb2
  • Erbb3
  • Ereg
  • Erk1
  • Erk2
  • FGF15
  • FGF22
  • FGF6
  • Fak
  • Fak1
  • Fgf-1
  • Fgf-2
  • Fgf-5
  • Fgf-7
  • Fgf-9
  • Fgf1
  • Fgf10
  • Fgf16
  • Fgf17
  • Fgf18
  • Fgf19
  • Fgf2
  • Fgf20
  • Fgf22
  • Fgf23
  • Fgf3
  • Fgf4
  • Fgf5
  • Fgf5c
  • Fgf5d
  • Fgf6
  • Fgf7
  • Fgf7a
  • Fgf7b
  • Fgf8
  • Fgf8a
  • Fgf9
  • Fgfa
  • Fgfr1
  • Fgfr2
  • Fgfr3
  • Fgfr4
  • Flg
  • Flt3
  • Frs2
  • Frs3
  • Fyn
  • Gdnf
  • Gdnfra
  • Gfra1
  • Gfra2
  • Gfra3
  • Gfra4
  • GluN2D
  • Grb2
  • Grf2
  • Grin1
  • Grin2b
  • Grin2d
  • Hbegf
  • Hegfl
  • Hgf
  • Hras
  • Hras1
  • Il-2
  • Il-3
  • Il-5
  • Il2
  • Il2ra
  • Il2rb
  • Il3
  • Il3ra
  • Il5
  • Irs-1
  • Irs1
  • Irs2
  • Jak1
  • Jak2
  • Jak3
  • KIT
  • Kgf
  • Kit
  • Kitl
  • Kitlg
  • Kl
  • Klb
  • Kras
  • Kras2
  • Lap1
  • Lat
  • Lrp
  • Lrrc7
  • Mapk
  • Mapk1
  • Mapk3
  • Met
  • Mgf
  • Ncam
  • Ncam1
  • Ndf
  • Nefl
  • Neu
  • Nf68
  • Nfl
  • Nmdar1
  • Nras
  • Nrg1
  • Nrg2
  • Nrg3
  • Nrtn
  • Nshc
  • Ntak
  • Pdgfa
  • Pdgfb
  • Pdgfr
  • Pdgfr1
  • Pdgfra
  • Pdgfrb
  • Pdzgef1
  • Pea15
  • Pik3ca
  • Pik3cb
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Prkm1
  • Prkm3
  • Psd95
  • Pspn
  • Ptk2
  • Ptpra
  • Ralgds
  • Ralgdsl1
  • Ralgdsl2
  • Ranbp9
  • Rapgef2
  • Rasgef1a
  • Rasgrf1
  • Rasgrf2
  • Rasgrp
  • Rasgrp1
  • Rasgrp3
  • Rasgrp4
  • Ret
  • Retl1
  • Rgl1
  • Rgl2
  • Rpa1
  • Sck
  • Sdgf
  • Shc1
  • Shc2
  • Shc3
  • Shcc
  • Snt2
  • Sos1
  • Spna2
  • Spnb3
  • Spta1
  • Spta2
  • Sptan1
  • Sptb
  • Sptbn1
  • Sptbn2
  • Sptbn4
  • Sptbn5
  • Tek
  • Tgfa
  • Trnr1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Striated Muscle Contraction
  • Actn2
  • Actn3
  • Alpha-tm
  • Ctni
  • Des
  • Dmd
  • Fang2
  • Mlc1v
  • Mlc2
  • Mybpc2
  • Mybpc3
  • Myh3
  • Myh6
  • Myl1
  • Myl2
  • Myl3
  • Myl4
  • Neb
  • Ntmod
  • Tcap
  • Tmod
  • Tmod1
  • Tmod2
  • Tmod3
  • Tmod4
  • Tni
  • Tnnc1
  • Tnnc2
  • Tnni1
  • Tnni2
  • Tnni3
  • Tnnt1
  • Tnnt2
  • Tnnt3
  • Tpm1
  • Tpm2
  • Tpm4
  • Tpma
  • Trp1
  • Vim
Rattus norvegicus (Norway rat)
RHOBTB2 GTPase cycle
  • Actg
  • Actg1
  • Actn1
  • Bat1
  • Bat1a
  • Cct2
  • Cct6a
  • Cct7
  • Cctb
  • Cdc37
  • Cul3
  • Ddx39b
  • Hnrnpc
  • Hnrpc
  • Hsp84
  • Hsp86
  • Hsp90aa1
  • Hsp90ab1
  • Hspc3
  • Hspca
  • Hspcb
  • Msi2
  • Myo6
  • Phip
  • Ptk9
  • Rbmx
  • Rbmxrt
  • Rhobtb2
  • Sfrs10
  • Srrm1
  • Stk38
  • Tmod3
  • Tra2b
  • Trp
  • Twf1
  • Txnl1
  • Uap56
Rattus norvegicus (Norway rat)
B-WICH complex positively regulates rRNA expression
  • AC109542.1
  • Actb
  • Baz1b
  • Cd3eap
  • Ddx21
  • Ddx21a
  • Dek
  • ENSRNOG00000062927
  • ENSRNOG00000064540
  • ENSRNOG00000066901
  • ENSRNOG00000068034
  • Ep300
  • Ercc6
  • Gsk3b
  • H2ab3
  • H2ac10
  • H2ac18
  • H2ac4
  • H2afb3
  • H2afx
  • H2aj
  • H2ax
  • H2az2
  • H2bc1
  • H2bc12l1
  • H2bc6
  • H2bcl1
  • H2bcl2
  • H2bu1
  • H3-3b
  • H3.3b
  • H3c13
  • H3f3b
  • H4c16
  • H4c2
  • H4f16
  • H4ft
  • Hist1h2ba
  • Hist1h2bc
  • Hist1h2bg
  • Hist1h2bo
  • Hist1h2bq
  • Hist1h4b
  • Hist1h4m
  • Hist2h2aa3
  • Hist2h3c2
  • Hist4
  • Hist4h4
  • Josd3
  • Kat2a
  • Kat2b
  • LOC100365043
  • LOC100910200
  • LOC120097726
  • LOC120098305
  • LOC684797
  • Mybbp1a
  • Myo1c
  • Myr2
  • Polr1a
  • Polr1b
  • Polr1e
  • Polr1f
  • Polr1g
  • Polr1h
  • Polr2e
  • Polr2f
  • Rpa1
  • Rpa2
  • Rpo1-2
  • Rpo1-4
  • Sf3b1
  • Smarca5
  • Taf1a
  • Taf1b
  • Taf1c
  • Taf1d
  • Tbp
  • Th2b
  • Twistnb
  • Znrd1
Rattus norvegicus (Norway rat)
DNA Damage Recognition in GG-NER
  • Actb
  • Actl6a
  • Actr5
  • Actr8
  • Adprt
  • Amida
  • Ccdc95
  • Cetn2
  • Cops1
  • Cops2
  • Cops3
  • Cops4
  • Cops5
  • Cops6
  • Cops7a
  • Cops7b
  • Cops8
  • Csn1
  • Csn2
  • Csn3
  • Csn4
  • Csn8
  • Cul4a
  • Cul4b
  • Ddb1
  • Ddb2
  • Gps1
  • Ino80
  • Ino80b
  • Ino80c
  • Ino80d
  • Ino80e
  • LOC100360645
  • Mcrs1
  • Nfrkb
  • Parp1
  • Parp2
  • Rad23a
  • Rad23b
  • Rbx1
  • Rps27a
  • Ruvbl1
  • Tfpt
  • Tip49
  • Tip49a
  • Trip15
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Xpc
  • Yy1
  • yy1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Smooth Muscle Contraction
  • Acta2
  • Acta3
  • Actg2
  • Actsa
  • Actsg
  • Actvs
  • Aldh2
  • Alpha-tm
  • CaMIII
  • Cald1
  • Calm3
  • Cam3
  • Camc
  • Guc1a1
  • Guc1b3
  • Gucy1a1
  • Gucy1a2
  • Gucy1a3
  • Gucy1b1
  • Gucy1b2
  • Gucy1b3
  • Itga1
  • Itgb5
  • LOC685883
  • Lmod1
  • Mrlc2
  • Mrlcb
  • Myl10
  • Myl11
  • Myl12b
  • Myl6
  • Myl7
  • Myl9
  • Mylc2b
  • Mylk
  • Mylpf
  • Myrl2
  • Pak1
  • Pak2
  • Pde5
  • Pde5a
  • Pxn
  • Rlc-a
  • Tln1
  • Tpm1
  • Tpm2
  • Tpm4
  • Tpma
  • Vcl
Rattus norvegicus (Norway rat)
EPHB-mediated forward signaling
  • Actb
  • Actg
  • Actg1
  • Actr2
  • Actr3
  • Arha
  • Arha2
  • Arhgef28
  • Arp2
  • Arp3
  • Arpc1a
  • Arpc1b
  • Arpc2
  • Arpc3
  • Arpc4
  • Arpc5
  • Cdc42
  • Duo
  • Ehsh1
  • Fak
  • Fak1
  • Fyn
  • Grin1
  • Grin2b
  • Hapip
  • Hras
  • Hras1
  • Hspg1
  • Itsn
  • Itsn1
  • Kalrn
  • Lyn
  • Nmdar1
  • Pak1
  • Ptk2
  • Rac
  • Rac1
  • Rasa
  • Rasa1
  • Rgnef
  • Rhoa
  • Rock1
  • Rock2
  • Sdc2
  • Src
  • Synd2
  • Tiam1
  • Yes1
Rattus norvegicus (Norway rat)
HSP90 chaperone cycle for SHRs
  • AABR07000222.1
  • Actr10
  • Actr1a
  • Ar
  • Capza1
  • Capza2
  • Capza3
  • Capzb
  • Ctrn1
  • Dctn1
  • Dctn2
  • Dctn3l1
  • Dctn4
  • Dctn5
  • Dctn6
  • Dhc1
  • Dlc2
  • Dnaja1
  • Dnaja2
  • Dnaja4
  • Dnajb1
  • Dnch1
  • Dnchc1
  • Dnci1
  • Dnci2
  • Dncic1
  • Dncic2
  • Dncl1
  • Dnclc1
  • Dncli1
  • Dncli2
  • Dnec1
  • Dyhc
  • Dync1h1
  • Dync1i1
  • Dync1i2
  • Dync1li1
  • Dync1li2
  • Dynll1
  • Dynll2
  • Fkbp4
  • Fkbp5
  • Fkbp52
  • Grl
  • Hop
  • Hsc70
  • Hsc73
  • Hsj2
  • Hsp70-1
  • Hsp70-2
  • Hsp70-3
  • Hsp84
  • Hsp86
  • Hsp90aa1
  • Hsp90ab1
  • Hspa1
  • Hspa1a
  • Hspa1b
  • Hspa1l
  • Hspa2
  • Hspa8
  • Hspc3
  • Hspca
  • Hspcb
  • Hst70
  • Map1c
  • Mlr
  • Nr3c1
  • Nr3c2
  • Nr3c3
  • Nr3c4
  • Pgr
  • Pin
  • Ptges3
  • Rdj1
  • Stip1
  • Tebp
Rattus norvegicus (Norway rat)
Acrosome Reaction and Sperm:Oocyte Membrane Binding
  • Acr
  • Cd9
  • Izumo1
  • Izumo2
  • Izumo3
  • Izumo4
Rattus norvegicus (Norway rat)
Citric acid cycle (TCA cycle)
  • Aco2
  • Cs
  • Fh
  • Fh1
  • Hsp75
  • Hspc5
  • Idh2
  • Idh3B
  • Idh3a
  • Idh3g
  • Mdh2
  • Mor1
  • Nnt
  • SUCLA2
  • SUCLG2
  • Sdh1
  • Sdha
  • Sdhb
  • Sdhc
  • Sdhd
  • Sucla2
  • Suclg1
  • Suclg2
  • Trap1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Digestion of dietary carbohydrate
  • Chia
  • Chit1
  • LOC120100609
  • Lct
  • Lph
  • Si
Rattus norvegicus (Norway rat)
HuR (ELAVL1) binds and stabilizes mRNA
  • Anp32a
  • Crm1
  • Elavl1
  • Hur
  • Lanp
  • Nup214
  • Pkca
  • Pkcd
  • Prkca
  • Prkcd
  • Set
  • Tnfsf13
  • Xpo1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Stimuli-sensing channels
  • Accn1
  • Accn2
  • Accn3
  • Accn4
  • Accn5
  • Ano1
  • Ano10
  • Ano2
  • Ano3
  • Ano4
  • Ano5
  • Ano6
  • Ano7
  • Ano8
  • Ano9
  • Asic1
  • Asic2
  • Asic3
  • Asic4
  • Asic5
  • Asph
  • Best1
  • Best2
  • Best3
  • Best4
  • Blinac
  • Bnac1
  • Bnac2
  • Bsnd
  • CaMIII
  • Calm3
  • Cam3
  • Camc
  • Cisk
  • Clca1
  • Clca2
  • Clca4
  • Clca6
  • Clcn1
  • Clcn2
  • Clcn4
  • Clcn4-2
  • Clcn5
  • Clcn6
  • Clcn7
  • Clcnk1
  • Clcnka
  • Clcnkb
  • Clic2
  • Drasic
  • Fkbp1b
  • LOC100360645
  • LOC689103
  • Mdeg
  • Nalcn
  • Nca
  • Nedd4l
  • Ngep
  • Ostm1
  • Prp3
  • Raf
  • Raf1
  • Rb21
  • Renac
  • Rps27a
  • Ryr1
  • Ryr2
  • Scnn1a
  • Scnn1b
  • Scnn1g
  • Sgk
  • Sgk1
  • Sgk2
  • Sgk3
  • Sgkl
  • Slc17a3
  • Spasic
  • Sri
  • Stom
  • Stoml3
  • Tmem16g
  • Tpc1
  • Tpcn1
  • Tpcn2
  • Trdn
  • Ttyh1
  • Ttyh2
  • Ttyh3
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Unc79
  • Unc80
  • Vgcnl1
  • Wwp1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Glycosphingolipid catabolism
  • AABR07013255.1
  • Arsa
  • Arsb
  • Arse
  • Arsg
  • Arsi
  • Arsj
  • Arsk
  • Arsl
  • Asah1
  • Asah2
  • Cca1
  • Ctsa
  • Enpp7
  • Galc
  • Gba
  • Gba1
  • Gba2
  • Gba3
  • Gla
  • Glb1
  • Glb1l
  • Glb1l2
  • Glb1l3
  • Gm2a
  • Hexa
  • Hexb
  • M6pr
  • Neu1
  • Neu2
  • Neu3
  • Neu4
  • Psap
  • Sgp1
  • Smpd1
  • Smpd2
  • Smpd3
  • Smpd4
  • Sts
  • Sumf1
  • Sumf2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Highly sodium permeable postsynaptic acetylcholine nicotinic receptors
  • Achre
  • Achrg
  • Acra3
  • Acra4
  • Acrb2
  • Acrb4
  • Acrd
  • Chrna3
  • Chrna4
  • Chrnb2
  • Chrnb4
  • Chrnd
  • Chrne
  • Chrng
Rattus norvegicus (Norway rat)
Highly calcium permeable nicotinic acetylcholine receptors
  • Acra
  • Acra2
  • Acra3
  • Acra4
  • Acra5
  • Acra6
  • Acrb2
  • Acrb3
  • Acrb4
  • Chrna1
  • Chrna2
  • Chrna3
  • Chrna4
  • Chrna5
  • Chrna6
  • Chrnb2
  • Chrnb3
  • Chrnb4
Rattus norvegicus (Norway rat)
Highly calcium permeable postsynaptic nicotinic acetylcholine receptors
  • Acra
  • Acra2
  • Acra3
  • Acra4
  • Acra5
  • Acra6
  • Acra7
  • Acra9
  • Acrb2
  • Acrb3
  • Acrb4
  • Chrna1
  • Chrna2
  • Chrna3
  • Chrna4
  • Chrna5
  • Chrna6
  • Chrna7
  • Chrna9
  • Chrnb2
  • Chrnb3
  • Chrnb4
Rattus norvegicus (Norway rat)
Transport of vitamins, nucleosides, and related molecules
  • Acatn
  • Pdzd11
  • Slc33a1
  • Slc5a6
  • Smvt
Rattus norvegicus (Norway rat)
Ethanol oxidation
  • Acss1
  • Acss2
  • Adh-1
  • Adh-2
  • Adh1
  • Adh2
  • Adh4
  • Adh5
  • Adh6
  • Adh7
  • Aldh
  • Aldh1a1
  • Aldh1b1
  • Aldh2
  • Aldhx
Rattus norvegicus (Norway rat)
Biotin transport and metabolism
  • Acac
  • Acaca
  • Acacb
  • Btd
  • Hlcs
  • Mcca
  • Mccc1
  • Mccc2
  • Pc
  • Pcca
  • Pccb
  • Pdzd11
  • Slc5a6
  • Smvt
Rattus norvegicus (Norway rat)
Ketone body catabolism
  • Acat1
  • Bdh
  • Bdh1
  • Oxct
  • Oxct1
  • Oxct2a
  • Scot
Rattus norvegicus (Norway rat)
Maturation of TCA enzymes and regulation of TCA cycle
  • Acat1
  • Aco2
  • Fxn
  • Idh2
  • Pgl2
  • Sdh5
  • Sdha
  • Sdhaf2
  • Sirt3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Common Pathway of Fibrin Clot Formation
  • Cd177
  • Cxcl4
  • F10
  • F13a
  • F13a1
  • F13b
  • F2
  • F2r
  • F8
  • Fga
  • Fgb
  • Fgg
  • Hcf2
  • Par1
  • Pf4
  • Pi7
  • Pn1
  • Proc
  • Procr
  • Pros
  • Pros1
  • Prtn3
  • Scyb4
  • Serpina5
  • Serpinc1
  • Serpind1
  • Serpine2
  • Thbd
Rattus norvegicus (Norway rat)
Intrinsic Pathway of Fibrin Clot Formation
  • A2m
  • A2m1
  • C1qbp
  • Cf9
  • F10
  • F11
  • F12
  • F2
  • F8
  • F9
  • Gc1qbp
  • Gp1ba
  • Gp1bb
  • Gp5
  • Gp9
  • Hcf2
  • Klk3
  • Klkb1
  • Kng
  • Kng1
  • Pi7
  • Pk
  • Pn1
  • Prcp
  • Proc
  • Pros
  • Pros1
  • Serpina5
  • Serpinc1
  • Serpind1
  • Serpine2
  • Serping1
Rattus norvegicus (Norway rat)

About Release Notes Help Feedback

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GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

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Last updated: August 19, 2024