GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 951 - 975 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
Regulation of TP53 Degradation
  • Akt1
  • Akt2
  • Akt3
  • Atm
  • Ccna1
  • Ccna2
  • Ccng
  • Ccng1
  • Cdc2
  • Cdc2a
  • Cdk1
  • Cdk2
  • Cdkn1
  • Cdkn2
  • Daxx
  • Frap1
  • Gbl
  • Hausp
  • LOC100360645
  • Lst8
  • Mapkap1
  • Mdm2
  • Mdm4
  • Mdmx
  • Mip1
  • Mlst8
  • Mtor
  • P53
  • Pdk1
  • Pdpk1
  • Phf20
  • Ppp2ca
  • Ppp2cb
  • Ppp2r1a
  • Ppp2r1b
  • Ppp2r5c
  • Protor1
  • Prr5
  • Raft1
  • Rffl
  • Rictor
  • Rnf34
  • Rps27a
  • Sgk
  • Sgk1
  • Sin1
  • Tp53
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Ubp41
  • Ubp69
  • Usp2
  • Usp7
Rattus norvegicus (Norway rat)
Glutathione conjugation
  • AC097845.1
  • Akr1a1
  • Alr
  • Esd
  • Gst12
  • Gsta1
  • Gsta2
  • Gsta3
  • Gsta5
  • Gsta6
  • Gstk1
  • Gstm1
  • Gstm2
  • Gstm3
  • Gstm4
  • Gstm5
  • Gstm7
  • Gsto1
  • Gsto2
  • Gstp1
  • Gsts
  • Gstt1
  • Gstt2
  • Gstyc1
  • Gstyc2
  • Gstz1
  • Hpgds
  • Mgst1
  • Mgst2
  • Mgst3
  • Mgst3l1
  • Pgds
  • Ptgds2
Rattus norvegicus (Norway rat)
ECM proteoglycans
  • AABR07044388.2
  • Acan
  • Agc
  • Agc1
  • Agrin
  • Agrn
  • Bcan
  • Behab
  • Bgn
  • Comp
  • Crtl1
  • Cspg2
  • Cspg3
  • Dcn
  • Dmp1
  • Dspp
  • Hapln1
  • Itga2
  • Itga2b
  • Itga7
  • Itga8
  • Itga9
  • Itgav
  • Itgax
  • Itgb1
  • Itgb3
  • Itgb5
  • Itgb6
  • Matn1
  • Matn3
  • Matn4
  • Ncan
  • Pai1
  • Planh1
  • Rdsp2
  • Serpine1
  • Sparc
  • Tnc
  • Tnn
  • Tnr
  • Tnxb
  • Vcan
  • Vtn
Rattus norvegicus (Norway rat)
Mitotic Prometaphase
  • Ahctf1
  • Aik2
  • Aim1
  • Airk2
  • Ark2
  • Aurkb
  • B9d2
  • Birc5
  • Bub1
  • Bub1b
  • Ccdc99
  • Cdc20
  • Cdca1
  • Cdca8
  • Cenpc
  • Cenpc1
  • Cenpe
  • Cenpf
  • Cenph
  • Cenpi
  • Cenpk
  • Cenpl
  • Cenpm
  • Cenpn
  • Cenpo
  • Cenpp
  • Cenpq
  • Cenpr
  • Cenpt
  • Cenpu
  • Ckap5
  • Clasp1
  • Clasp2
  • Clip1
  • Crm1
  • Cyln1
  • Dhc1
  • Dlc2
  • Dnch1
  • Dnchc1
  • Dnci1
  • Dnci2
  • Dncic1
  • Dncic2
  • Dncl1
  • Dnclc1
  • Dncli1
  • Dncli2
  • Dnec1
  • Dsn1
  • Dyhc
  • Dync1h1
  • Dync1i1
  • Dync1i2
  • Dync1li1
  • Dync1li2
  • Dynll1
  • Dynll2
  • Ercc6l
  • Fam33a
  • Fshprh1
  • Incenp
  • Itgb3bp
  • Kif18a
  • Kif2
  • Kif2a
  • Kif2b
  • Kif2c
  • Knl1
  • Kntc1
  • Krp2
  • LOC100909468
  • LOC102555739
  • LOC679342
  • LOC681185
  • LOC683983
  • Lis-1
  • Lis1
  • Lrpr1
  • Mad1l1
  • Mad2l1
  • Map1c
  • Mapre1
  • Mis12
  • Mlf1ip
  • Ndc80
  • Nde1
  • Ndel1
  • Nrif3
  • Nsl1
  • Nudc
  • Nude
  • Nude1
  • Nude2
  • Nudel
  • Nuf2
  • Nup107
  • Nup133
  • Nup160
  • Nup37
  • Nup43
  • Nup85
  • Nup98
  • Pafah1b1
  • Pafaha
  • Pcnt1
  • Pin
  • Plk
  • Plk1
  • Pmf1
  • Ppp1cc
  • Ppp2ca
  • Ppp2cb
  • Ppp2r1a
  • Ppp2r1b
  • Ppp2r5a
  • Ppp2r5b
  • Ppp2r5c
  • Ppp2r5d
  • Ppp2r5e
  • Ranbp2
  • Rangap1
  • Rcc2
  • Rps27
  • Rsn
  • S27-1
  • Sec13
  • Sec13l1
  • Sgo1
  • Sgo2
  • Sip30
  • Ska1
  • Ska2
  • Ska2l1
  • Spbc25
  • Spc24
  • Spc24-ps1
  • Spc25
  • Spdl1
  • Stk1
  • Stk12
  • Stk5
  • Tao1
  • Taok1
  • Xpo1
  • Zw10
  • Zwilch
  • Zwint
Rattus norvegicus (Norway rat)
Regulation of TLR by endogenous ligand
  • Apob
  • Cd14
  • Cd36
  • Fat
  • Fga
  • Fgb
  • Fgg
  • Gsdmd
  • Gsdme
  • Hmg-1
  • Hmg1
  • Hmgb1
  • Hmgb1-ps33
  • Hmgb1-ps4
  • Hmgb1l1
  • Hmgb1l2
  • Hmgb1l3
  • Hmgb1l5
  • LOC108349189
  • LOC108350839
  • Lbp
  • Ly96
  • Mrp14
  • Mrp8
  • S100a1
  • S100a8
  • S100a9
  • Tlr1
  • Tlr2
  • Tlr4
  • Tlr6
  • Tlr7
Rattus norvegicus (Norway rat)
Negative regulators of RIG-I/MDA5 signaling
  • Cyld
  • Cyld1
  • Ikbke
  • Ips1
  • Irf3
  • LOC100360645
  • Mavs
  • Nlrx1
  • Pin1
  • Rig1
  • Rps27a
  • Tax1bp1
  • Tbk1
  • Tnfaip3
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Visa
Rattus norvegicus (Norway rat)
Clathrin-mediated endocytosis
  • Aak1
  • Abcc7
  • Actr2
  • Actr3
  • Adrb2
  • Adrb2r
  • Adtab
  • Agfg1
  • Agfg1-ps1
  • Agtr1
  • Agtr1a
  • Amph
  • Amph1
  • Amph2
  • Amphl
  • Ap17
  • Ap2a1
  • Ap2a2
  • Ap2b1
  • Ap2m1
  • Ap2s1
  • Apob
  • Areg
  • Arf1gap
  • Arf6
  • Arfgap1
  • Arh
  • Arp2
  • Arp3
  • Arpc1a
  • Arpc2
  • Arpc3
  • Arpc4
  • Arpc5
  • Arrb1
  • Arrb2
  • Ash
  • At1a
  • Avp
  • Avpr2
  • Bin1
  • Btc
  • Calm
  • Cbl
  • Cd36l2
  • Cd3d
  • Cd3g
  • Cd4
  • Cftr
  • Chrm-2
  • Chrm2
  • Cip4
  • Clapb1
  • Claps2
  • Clta
  • Cltb
  • Cltc
  • Dab2
  • Dnajc6
  • Dnm
  • Dnm1
  • Dnm2
  • Dnm3
  • Doc2
  • Dtr
  • Dvl2
  • Dyn2
  • Dyn3
  • Egf
  • Egfr
  • Ehsh1
  • Epn1
  • Epn2
  • Eps15
  • Eps15l1
  • Ereg
  • Fbp17
  • Fcho1
  • Fcho2
  • Fnbp1
  • Fnbp1l
  • Fzd4
  • Gak
  • Gapvd1
  • Glut8
  • Glutx1
  • Grb2
  • Hbegf
  • Hegfl
  • Hgs
  • Hip1
  • Hip1r
  • Hrb
  • Hrs
  • Hrs2
  • Hsc70
  • Hsc73
  • Hspa8
  • Igf2r
  • Il7r
  • Itsn
  • Itsn1
  • Itsn2
  • LOC100360645
  • LOC100361515
  • Ldlr
  • Ldlrap1
  • Limpii
  • Lrp2
  • M6pr
  • Necap1
  • Necap2
  • Ocrl
  • Pacsin1
  • Pacsin2
  • Pacsin3
  • Picalm
  • Pik3c2a
  • Pip5k1c
  • Rab5a
  • Rab5b
  • Rab5c
  • Reps1
  • Reps2
  • Rip
  • Rps27a
  • Ruk
  • Scarb2
  • Sdgf
  • Seta
  • Sh3d2a
  • Sh3d2c1
  • Sh3gl1
  • Sh3gl2
  • Sh3gl3
  • Sh3kbp1
  • Sh3p13
  • Sh3p4
  • Sh3p8
  • Slc18a3
  • Slc2a8
  • Snap91
  • Snx18
  • Snx9
  • Stam
  • Stam2
  • Ston1
  • Ston2
  • Stp
  • Syb2
  • Syb3
  • Sybl1
  • Synj1
  • Synj2
  • Syt1
  • Syt11
  • Syt2
  • Syt5
  • Syt8
  • Syt9
  • T3d
  • Tac1r
  • Tacr1
  • Tf
  • Tfrc
  • Tgfa
  • Toca1
  • Trfr
  • Trip10
  • Ttgn1
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Vacht
  • Vamp2
  • Vamp3
  • Vamp4
  • Vamp7
  • Vamp8
  • Vat
  • Wnt-5a
  • Wnt5a
Rattus norvegicus (Norway rat)
COPI-dependent Golgi-to-ER retrograde traffic
  • Arcn1
  • Arf1
  • Arf1gap
  • Arf3
  • Arf4
  • Arf5
  • Arfgap1
  • Arfgap2
  • Arfgap3
  • Bnip1
  • Cenpe
  • Copa
  • Copb
  • Copb1
  • Copb2
  • Copd
  • Cope
  • Copg
  • Copg1
  • Copg2
  • Copz1
  • Copz2
  • Erg1
  • Gbf1
  • Kdelr1
  • Kdelr2
  • Kdelr3
  • Khc
  • Kif11
  • Kif12
  • Kif13b
  • Kif15
  • Kif16b
  • Kif18a
  • Kif18b
  • Kif19
  • Kif19a
  • Kif1a
  • Kif1b
  • Kif1c
  • Kif1d
  • Kif2
  • Kif20b
  • Kif21a
  • Kif21b
  • Kif22
  • Kif23
  • Kif26a
  • Kif26b
  • Kif27
  • Kif28p
  • Kif2a
  • Kif2b
  • Kif2c
  • Kif3a
  • Kif3b
  • Kif3c
  • Kif4a
  • Kif4b
  • Kif5a
  • Kif5b
  • Kif6
  • Kif9
  • Kifap3
  • Kifc1
  • Kifc2
  • Klc
  • Klc1
  • Klc2
  • Klc3
  • Klc4
  • Klp2
  • Klp6
  • Kns2
  • Knsl8
  • Krp1
  • Krp2
  • Napa
  • Napb
  • Napg
  • Nbas
  • Nsf
  • Rab1
  • Rab1A
  • Rab1b
  • Racgap1
  • Rint1
  • Rnp24
  • Sec20l
  • Sec22b
  • Sec22l1
  • Snap
  • Snapa
  • Snapb
  • Stx18
  • Tmed10
  • Tmed2
  • Tmed3
  • Tmed7
  • Tmed9
  • Tmp21
  • Use1
  • Zfp289
  • Znf289
  • Zw10
Rattus norvegicus (Norway rat)
MyD88:MAL(TIRAP) cascade initiated on plasma membrane
  • Ecsit
  • Map3k1
  • Mekk
  • Mekk1
  • Tirap
  • Traf6
Rattus norvegicus (Norway rat)
Nuclear Pore Complex (NPC) Disassembly
  • Aaas
  • Ccnb1
  • Ccnb2
  • Ccnb2-ps2
  • Cdc2
  • Cdc2a
  • Cdk1
  • Cdkn1
  • Gp210
  • LOC683983
  • Mrnp41
  • Ndc1
  • Npap60
  • Nup107
  • Nup121
  • Nup133
  • Nup153
  • Nup155
  • Nup160
  • Nup188
  • Nup205
  • Nup210
  • Nup214
  • Nup35
  • Nup37
  • Nup42
  • Nup43
  • Nup50
  • Nup53
  • Nup54
  • Nup58
  • Nup62
  • Nup84
  • Nup85
  • Nup88
  • Nup93
  • Nup98
  • Nupl1
  • Nupl2
  • Pcnt1
  • Pom121
  • Pom210
  • Rae1
  • Ranbp2
  • Sec13
  • Sec13l1
  • Tmem48
  • Tpr
Rattus norvegicus (Norway rat)
Interleukin-38 signaling
  • Il1f10
  • Il1rapl1
  • Il1rl2
  • Jnk1
  • Mapk8
  • Prkm8
Rattus norvegicus (Norway rat)
Mitochondrial Fatty Acid Beta-Oxidation
  • AC094055.1
  • Acaa2
  • Acad11
  • Acbd6
  • Acot1
  • Acot11
  • Acot12
  • Acot13
  • Acot2
  • Acot3
  • Acot5
  • Acot7
  • Acot9
  • Acsf2
  • Bach
  • Cach
  • Cach1
  • Cte1
  • Dbi
  • Mcat
  • Mte1
  • Ndufab1
  • Pctp
  • Stard2
  • Them4
  • Them5
Rattus norvegicus (Norway rat)
Inactivation of APC/C via direct inhibition of the APC/C complex
  • Anapc1
  • Anapc15
  • Anapc16
  • Anapc2
  • Anapc4
  • Anapc5
  • Anapc7
  • Bub1b
  • Cdc16
  • Cdc20
  • Cdc23
  • Cdc26
  • Cdc27
  • LOC100366017
  • Mad2l1
  • Ube2c
  • Ube2d1
  • Ube2e1
  • Ube2s
Rattus norvegicus (Norway rat)
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR4
  • FGF15
  • FGF6
  • Fgf-1
  • Fgf-2
  • Fgf-9
  • Fgf1
  • Fgf16
  • Fgf17
  • Fgf18
  • Fgf19
  • Fgf2
  • Fgf20
  • Fgf23
  • Fgf4
  • Fgf6
  • Fgf7a
  • Fgf7b
  • Fgf8
  • Fgf8a
  • Fgf9
  • Fgfa
  • Fgfr4
  • Klb
  • Plcg1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Ketone body catabolism
  • Acat1
  • Bdh
  • Bdh1
  • Oxct
  • Oxct1
  • Oxct2a
  • Scot
Rattus norvegicus (Norway rat)
GTP hydrolysis and joining of the 60S ribosomal subunit
  • AABR07029195.1
  • AABR07031505.1
  • AABR07060610.1
  • AABR07064810.1
  • AABR07071986.1
  • AABR07072260.1
  • Arbp
  • ENSRNOG00000068086
  • Eif5b
  • Fau
  • Fte-1
  • Fte1
  • If2
  • LOC100360645
  • LOC100361060
  • LOC100361854
  • LOC100361933
  • LOC100910714
  • LOC102550668
  • LOC103692829
  • LOC108351255
  • LOC120093247
  • LOC120094652
  • LOC120097744
  • LOC120099964
  • LOC120103572
  • Lamr1
  • RGD1562402
  • RGD1563956
  • RGD1564606
  • Rig
  • Rp2
  • Rpl1
  • Rpl10
  • Rpl10a
  • Rpl10l
  • Rpl10l1
  • Rpl11
  • Rpl12
  • Rpl12-ps2
  • Rpl12l2
  • Rpl13
  • Rpl13a
  • Rpl14
  • Rpl15
  • Rpl17
  • Rpl18
  • Rpl18a
  • Rpl19
  • Rpl21
  • Rpl21-ps26
  • Rpl21l2
  • Rpl21l3
  • Rpl21l5
  • Rpl22
  • Rpl23
  • Rpl23al1
  • Rpl24
  • Rpl26
  • Rpl27
  • Rpl27a
  • Rpl27al3
  • Rpl28
  • Rpl29
  • Rpl3
  • Rpl30
  • Rpl31
  • Rpl32
  • Rpl34
  • Rpl34-ps1
  • Rpl34l1
  • Rpl34l2
  • Rpl35
  • Rpl35al8
  • Rpl36a
  • Rpl36al-ps5
  • Rpl36al1
  • Rpl36l3
  • Rpl37
  • Rpl37l4
  • Rpl38
  • Rpl39
  • Rpl39l1
  • Rpl3l
  • Rpl4
  • Rpl44
  • Rpl5
  • Rpl6
  • Rpl7
  • Rpl7a
  • Rpl8
  • Rpl9
  • Rpl9l2
  • Rplp0
  • Rplp1
  • Rplp2
  • Rps10
  • Rps11
  • Rps12l8
  • Rps13
  • Rps14
  • Rps15
  • Rps15a
  • Rps16
  • Rps17
  • Rps18
  • Rps19
  • Rps2
  • Rps20
  • Rps21
  • Rps23
  • Rps24
  • Rps25
  • Rps26
  • Rps26-ps13
  • Rps26l2
  • Rps26l4
  • Rps26l6
  • Rps27
  • Rps27a
  • Rps27l
  • Rps28
  • Rps29
  • Rps3
  • Rps3a
  • Rps4
  • Rps4x
  • Rps4y2
  • Rps5
  • Rps6
  • Rps7
  • Rps7-ps23
  • Rps8
  • Rps9
  • Rpsa
  • S27-1
  • Uba80
  • Ubbl1
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Mitochondrial protein import
  • Atp5b
  • Atp5f1b
  • Atp5g3
  • Atp5mc3
  • Coq2
  • Fxn
  • Hscb
  • Hsp60
  • Hspd1
  • Ldhd
  • Ndufb8
  • Otc
  • Pitrm1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Ligand-independent caspase activation via DCC
  • Appl1
  • Casp3
  • Casp9
  • Cpp32
  • Dcc
  • RNCASP9
Rattus norvegicus (Norway rat)
RHOH GTPase cycle
  • Arhgdia
  • Arhgdib
  • Arhgdig
  • Cav
  • Cav1
  • Csk
  • Dbt
  • Fam91a1
  • Garnl1
  • Gbas
  • Jup
  • LOC498174
  • Lamtor1
  • Lck
  • Mtr
  • Nbc
  • Nbc2
  • Nbc3
  • Nbcn1
  • Nipsnap2
  • Nsfl1c
  • Pak1
  • Pak2
  • Pak4
  • Pak5
  • Pak6
  • Pak7
  • Pg
  • RGD1310313
  • Rab7
  • Rab7a
  • Ralgapa1
  • Rhoh
  • Rock1
  • Rock2
  • Slc1a5
  • Slc4a7
  • Stom
  • Syb3
  • Tfrc
  • Tmem59
  • Trfr
  • Tuba1b
  • Tuba2
  • Tulip1
  • Uaca
  • Vamp3
  • Vangl1
  • Vcp
  • Wdr11
  • Zap70
Rattus norvegicus (Norway rat)
Keratinization
  • AABR07001416.1
  • Dsc1
  • Dsc2
  • Dsc3
  • Dsg1
  • Dsg2
  • Dsg3
  • Dsg4
  • Dsp
  • ENSRNOG00000071041
  • Jup
  • Ka10
  • Ka12
  • Ka13
  • Ka14
  • Ka15
  • Ka17
  • Ka19
  • Ka24
  • Ka31
  • Ka35
  • Ka36
  • Ka38
  • Ka40
  • Kb1
  • Kb18
  • Kb2
  • Kb20
  • Kb23
  • Kb25
  • Kb26
  • Kb35
  • Kb36
  • Kb39
  • Kb4
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  • Pg
  • Pkp1
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  • Pkp3
  • Pkp4
  • RGD1561281
Rattus norvegicus (Norway rat)
Negative regulation of FGFR2 signaling
  • Ash
  • Cbl
  • Erk1
  • Erk2
  • FGF22
  • FGF6
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  • Fgf-9
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  • Fgf6
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  • Mapk
  • Mapk1
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  • Prkm1
  • Prkm3
  • Ptpn11
  • Rps27a
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
SHC1 events in ERBB4 signaling
  • Ash
  • Btc
  • Dtr
  • Ereg
  • Grb2
  • Hbegf
  • Hegfl
  • Hras
  • Hras1
  • Kras
  • Kras2
  • Ndf
  • Nras
  • Nrg1
  • Nrg2
  • Nrg3
  • Ntak
  • Shc1
  • Sos1
Rattus norvegicus (Norway rat)
ATF6 (ATF6-alpha) activates chaperones
  • Atf6
  • Mbtps1
  • S1p
  • Ski1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Scavenging of heme from plasma
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  • Lrp1
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  • RGD1561722
  • RGD1564696
Rattus norvegicus (Norway rat)
Neurotransmitter release cycle
  • Asahl
  • Naaa
Rattus norvegicus (Norway rat)

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Acknowledgements

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Last updated: August 19, 2024