GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 326 - 350 of 2090 in total
Pathway Name ▼ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Stimuli-sensing channels
  • ACCN
  • ACCN1
  • ACCN2
  • ACCN3
  • ACCN4
  • ACCN5
  • ANO1
  • ANO10
  • ANO2
  • ANO3
  • ANO4
  • ANO5
  • ANO6
  • ANO7
  • ANO8
  • ANO9
  • ASIC1
  • ASIC2
  • ASIC3
  • ASIC4
  • ASIC5
  • ASPH
  • BAH
  • BART
  • BEST1
  • BEST2
  • BEST3
  • BEST4
  • BNAC1
  • BNAC2
  • BND7
  • BSND
  • C11orf25
  • C12orf3
  • C17orf29
  • C2orf21
  • CACC1
  • CACC3
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CISK
  • CLC1
  • CLCA1
  • CLCA2
  • CLCA3
  • CLCA3P
  • CLCA4
  • CLCK2
  • CLCN1
  • CLCN2
  • CLCN3
  • CLCN4
  • CLCN5
  • CLCN6
  • CLCN7
  • CLCNKA
  • CLCNKB
  • CLIC2
  • CaCC2
  • DNACH
  • DOG1
  • DSIPI
  • EPB72
  • FKBP12.6
  • FKBP1B
  • FKBP1L
  • FKBP9
  • GDD1
  • GILZ
  • GL
  • HBRR
  • HINAC
  • HSN2
  • KDP
  • KIAA0046
  • KIAA0344
  • KIAA0439
  • KIAA1169
  • KIAA1409
  • KIAA1566
  • KIAA1623
  • KIAA1691
  • KIAA1760
  • KIAA1843
  • MDEG
  • NALCN
  • NEDD4L
  • NEDL3
  • NGEP
  • NHA1
  • NHA2
  • NHEDC1
  • NHEDC2
  • NPT4
  • ORAOV2
  • OSTM1
  • OTK4
  • PCANAP5
  • PIG5
  • PRKWNK1
  • PRKWNK2
  • PRKWNK3
  • PRKWNK4
  • RAF
  • RAF1
  • RPS27A
  • RYDR
  • RYR1
  • RYR2
  • RYR3
  • SCNN1
  • SCNN1A
  • SCNN1B
  • SCNN1D
  • SCNN1G
  • SDCCAG43
  • SGK
  • SGK1
  • SGK2
  • SGK3
  • SGKL
  • SLC17A3
  • SLC9A10
  • SLC9A11
  • SLC9B1
  • SLC9B2
  • SLC9C1
  • SLC9C2
  • SLNAC1
  • SRI
  • STOM
  • STOML3
  • TAOS2
  • TMEM16A
  • TMEM16B
  • TMEM16C
  • TMEM16D
  • TMEM16E
  • TMEM16F
  • TMEM16G
  • TMEM16H
  • TMEM16J
  • TMEM16K
  • TNAC1
  • TP53I5
  • TPC1
  • TPC2
  • TPCN1
  • TPCN2
  • TRDN
  • TSC22D3
  • TTYH2
  • TTYH3
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UNC79
  • UNC80
  • VGCNL1
  • VMD2
  • VMD2L1
  • VMD2L2
  • VMD2L3
  • WNK1
  • WNK2
  • WNK3
  • WNK4
  • WWP1
Homo sapiens (human)
Stimulation of the cell death response by PAK-2p34
  • CASP3
  • CPP32
  • PAK2
Homo sapiens (human)
Stabilization of p53
  • ATM
  • C20orf104
  • CDKN2
  • CDKN2A
  • CDS1
  • CHEK2
  • CHK2
  • GLEA2
  • HCA58
  • MDM2
  • MDM4
  • MDMX
  • MLM
  • NZF
  • P53
  • PHF20
  • RAD53
  • RPS27A
  • TP53
  • TZP
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Spry regulation of FGF signaling
  • BRAF
  • BRAF1
  • CBL
  • CBL2
  • ERK1
  • ERK2
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MKNK1
  • MNK1
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PTP2C
  • PTPN11
  • RAFB1
  • RNF55
  • RPS27A
  • SHPTP2
  • SPRY2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Sphingolipid de novo biosynthesis
  • ABCC1
  • ABCG2
  • ABCP
  • ADMP
  • BCRP
  • BCRP1
  • C14orf147
  • C14orf66
  • C20orf38
  • C3orf57
  • CERS1
  • CERS2
  • CERS3
  • CERS4
  • CERS5
  • CERS6
  • CK1G2
  • CSNK1G2
  • CYB5B
  • CYB5M
  • DEGS1
  • DEGS2
  • DES1
  • EPK2
  • FA2H
  • FAAH
  • FAXDC1
  • FVT1
  • KDSR
  • KIAA0526
  • LAG1
  • LASS1
  • LASS2
  • LASS3
  • LASS4
  • LASS5
  • LASS6
  • LCB1
  • LCB2
  • MFSD2B
  • MLD
  • MOB
  • MRP
  • MRP1
  • MXR
  • OMB5
  • ORMDL1
  • ORMDL2
  • ORMDL3
  • OSBP
  • OSBP1
  • PKD
  • PKD1
  • PKD2
  • PP2CE
  • PPM1L
  • PRKCM
  • PRKCN
  • PRKD1
  • PRKD2
  • PRKD3
  • SAMD8
  • SDR35C1
  • SGMS1
  • SGMS2
  • SK1
  • SK2
  • SMS1
  • SMS2
  • SPHK
  • SPHK1
  • SPHK2
  • SPK
  • SPNS2
  • SPTLC1
  • SPTLC2
  • SPTLC2L
  • SPTLC3
  • SPTSSA
  • SPTSSB
  • SSSPTA
  • SSSPTB
  • TMEM23
  • TMSG1
  • UOG1
  • VAP33
  • VAPA
  • VAPB
Homo sapiens (human)
Sphingolipid catabolism
  • ACER1
  • ACER2
  • ACER3
  • ALDH3B1
  • ALDH3B2
  • ALDH7
  • ALDH8
  • APHC
  • ASAH3
  • ASAH3L
  • KIAA1252
  • LPP1
  • LPP2
  • LPP3
  • PHCA
  • PLPP1
  • PLPP2
  • PLPP3
  • PPAP2A
  • PPAP2B
  • PPAP2C
  • SGPL1
  • SGPP1
  • SGPP2
  • SPP1
Homo sapiens (human)
Sperm Motility And Taxes
  • C14orf161
  • C19orf15
  • CATSPER1
  • CATSPER2
  • CATSPER3
  • CATSPER4
  • CATSPERB
  • CATSPERD
  • CATSPERG
  • HVCN1
  • KCNMA3
  • KCNMC1
  • KCNU1
  • SLO3
  • TMEM146
  • VSOP
Homo sapiens (human)
Specification of the neural plate border
  • AP2TF
  • BMP2B
  • BMP4
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • DLX5
  • DVR4
  • FGF4
  • GBX2
  • HOX7
  • HST
  • HSTF1
  • HUP1
  • HUP2
  • KS3
  • MSX1
  • MYB
  • OCT3
  • OCT4
  • OTF3
  • PAX3
  • PAX7
  • POU5F1
  • SOX2
  • TCF3
  • TCF7L1
  • TFAP2
  • TFAP2A
  • TFAP2B
  • TFAP2C
  • WNT3A
  • ZIC
  • ZIC1
  • ZNF201
Homo sapiens (human)
Specification of primordial germ cells
  • BLIMP1
  • BMP2B
  • BMP4
  • CBFA2T2
  • CXCR4
  • DVR4
  • EHT
  • EOMES
  • GP36
  • KIAA1546
  • MTGR1
  • NANOG
  • NANOS3
  • NOS3
  • OCT3
  • OCT4
  • OTF3
  • PDPN
  • POU5F1
  • PRDM1
  • SOX17
  • TBR2
  • TET2
  • TFAP2C
Homo sapiens (human)
Sorafenib-resistant PDGFR mutants
  • PDGFR2
  • PDGFRA
  • RHEPDGFRA
Homo sapiens (human)
Sorafenib-resistant KIT mutants
  • KIT
  • SCFR
Homo sapiens (human)
Somitogenesis
  • BHLHB37
  • BHLHC6
  • C6orf159
  • C7orf76
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • DLL1
  • DLL3
  • DSS1
  • EPHA4
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HEK8
  • HES7
  • HSPC
  • IFI5111
  • IGKJRB
  • IGKJRB1
  • KIAA0072
  • KIAA0107
  • LEF1
  • LFNG
  • LMP10
  • LMP2
  • LMP7
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MCB1
  • MECL1
  • MESP2
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSGN1
  • MSS1
  • NOTCH1
  • NU
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB5i
  • PSMB6
  • PSMB6i
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD10
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSMF1
  • RBPJ
  • RBPJK
  • RBPSUH
  • RING10
  • RING12
  • RIPPLY2
  • SCDO2
  • SEK
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SUG1
  • SUG2
  • TAN1
  • TBP1
  • TBP7
  • TBX6
  • TRAP2
  • TYRO1
  • X
  • Y
  • Y2
  • Z
Homo sapiens (human)
Sodium/Proton exchangers
  • APNH1
  • KIAA0267
  • KIAA0939
  • NHE1
  • NHE2
  • NHE3
  • NHE4
  • NHE5
  • NHE6
  • NHE7
  • NHE8
  • NHE9
  • SLC9A1
  • SLC9A2
  • SLC9A3
  • SLC9A4
  • SLC9A5
  • SLC9A6
  • SLC9A7
  • SLC9A8
  • SLC9A9
Homo sapiens (human)
Sodium/Calcium exchangers
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CNC
  • JSX
  • KIAA0702
  • KIAA1087
  • NCKX1
  • NCKX2
  • NCKX3
  • NCKX4
  • NCKX5
  • NCKX6
  • NCLX
  • NCX1
  • NCX2
  • NCX3
  • SLC24A1
  • SLC24A2
  • SLC24A3
  • SLC24A4
  • SLC24A5
  • SLC24A6
  • SLC8A1
  • SLC8A2
  • SLC8A3
  • SLC8B1
  • SRI
Homo sapiens (human)
Sodium-coupled sulphate, di- and tri-carboxylate transporters
  • NACT
  • NADC1
  • NADC3
  • NAS1
  • NASI1
  • SDCT1
  • SDCT2
  • SLC13A1
  • SLC13A2
  • SLC13A3
  • SLC13A4
  • SLC13A5
  • SUT1
Homo sapiens (human)
Sodium-coupled phosphate cotransporters
  • GLVR1
  • GLVR2
  • PIT1
  • PIT2
  • SLC20A1
  • SLC20A2
Homo sapiens (human)
Smooth Muscle Contraction
  • ACTA2
  • ACTA3
  • ACTG2
  • ACTL3
  • ACTSA
  • ACTSG
  • ACTVS
  • ALDH2
  • ALDM
  • ANX1
  • ANX2
  • ANX2L4
  • ANX6
  • ANXA1
  • ANXA2
  • ANXA6
  • C15orf13
  • CACNA1G
  • CACNA1H
  • CACNA1I
  • CAD
  • CAL1H
  • CALD1
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAV3
  • CDM
  • DYSF
  • FER1L1
  • GUC1A2
  • GUC1A3
  • GUC1B3
  • GUCSA2
  • GUCSA3
  • GUCSB3
  • GUCY1A1
  • GUCY1A2
  • GUCY1A3
  • GUCY1B1
  • GUCY1B2
  • GUCY1B3
  • HSRLC
  • ITGA1
  • ITGB5
  • KIAA0866
  • KIAA0894
  • KIAA1027
  • KIAA1120
  • KIAA1123
  • KIAA1296
  • LMOD1
  • LPC1
  • LPC2D
  • MG53
  • MLC1SA
  • MLC2
  • MLCB
  • MLCK
  • MLCK1
  • MRLC1
  • MRLC2
  • MRLC3
  • MYH11
  • MYL10
  • MYL11
  • MYL12A
  • MYL12B
  • MYL2A
  • MYL5
  • MYL6
  • MYL6B
  • MYL7
  • MYL9
  • MYLC2A
  • MYLC2B
  • MYLC2PL
  • MYLK
  • MYLK1
  • MYLPF
  • MYRL2
  • PAK1
  • PAK2
  • PDE5
  • PDE5A
  • PLRLC
  • PXN
  • RLC
  • SCAM1
  • SH3D5
  • SORBS1
  • SORBS3
  • TLN
  • TLN1
  • TMSA
  • TMSB
  • TPM1
  • TPM2
  • TPM3
  • TPM4
  • TRIM72
  • VCL
Homo sapiens (human)
Small interfering RNA (siRNA) biogenesis
  • AGO1
  • AGO2
  • AGO3
  • AGO4
  • DICER
  • DICER1
  • EIF2C1
  • EIF2C2
  • EIF2C3
  • EIF2C4
  • HERNA
  • KIAA0928
  • KIAA1567
  • PACT
  • PRKRA
  • RAX
  • TARBP2
  • TRAX
  • TRBP
  • TSN
  • TSNAX
Homo sapiens (human)
Signalling to p38 via RIT and RIN
  • BRAF
  • BRAF1
  • MTC
  • NGF
  • NGFB
  • NTRK1
  • RAFB1
  • RIBB
  • RIN
  • RIT
  • RIT1
  • RIT2
  • ROC1
  • ROC2
  • TRK
  • TRKA
Homo sapiens (human)
Signalling to STAT3
  • APRF
  • MTC
  • NGF
  • NGFB
  • NTRK1
  • STAT3
  • TRK
  • TRKA
Homo sapiens (human)
Signalling to RAS
  • HRAS
  • HRAS1
  • MTC
  • NGF
  • NGFB
  • NRAS
  • NSHC
  • NTRK1
  • SCK
  • SHC
  • SHC1
  • SHC2
  • SHC3
  • SHCA
  • SHCB
  • SHCC
  • SOS1
  • TRK
  • TRKA
Homo sapiens (human)
Signalling to ERK5
  • BMK1
  • ERK5
  • MAP2K5
  • MAPK7
  • MEK5
  • MKK5
  • PRKM7
  • PRKMK5
Homo sapiens (human)
Signaling downstream of RAS mutants
  • APBB1IP
  • ARAF
  • ARAF1
  • ARB2
  • ARR1
  • ARR2
  • ARRB1
  • ARRB2
  • BRAF
  • BRAF1
  • BRAP
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • CNK1
  • CNK2
  • CNKSR1
  • CNKSR2
  • CSK
  • CTAK1
  • EMK2
  • ERK1
  • ERK2
  • F8VWF
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • FN
  • FN1
  • GP2B
  • GP3A
  • HRAS
  • HRAS1
  • IQGAP1
  • ITGA2B
  • ITGAB
  • ITGB3
  • JAK2
  • KIAA0051
  • KIAA0902
  • KIAA0968
  • KIAA1027
  • KRAS
  • KRAS2
  • KREV1
  • KSR
  • KSR1
  • KSR2
  • MAP2K1
  • MAP2K2
  • MAP3K11
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MARK3
  • MEK1
  • MEK2
  • MKK2
  • MLK3
  • NRAS
  • PBP
  • PEBP
  • PEBP1
  • PHB
  • PHB1
  • PKS
  • PKS2
  • PREL1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PRKMK1
  • PRKMK2
  • PTK1
  • RAF
  • RAF1
  • RAFB1
  • RAP1A
  • RAP1B
  • RARP1
  • RASK2
  • RIAM
  • RNF52
  • SPRK
  • SRC
  • SRC1
  • TLN
  • TLN1
  • VCL
  • VWF
  • YWHAB
Homo sapiens (human)
Signaling by plasma membrane FGFR1 fusions
  • BAG4
  • BFGFR
  • C8orf2
  • CEK
  • ERLIN2
  • FGFBR
  • FGFR1
  • FLG
  • FLT2
  • HBGFR
  • SODD
  • SPFH2
Homo sapiens (human)
Signaling by phosphorylated juxtamembrane, extracellular and kinase domain KIT mutants
  • APRF
  • FYN
  • GRB1
  • HRAS
  • HRAS1
  • JAK2
  • JTK8
  • KIT
  • LCK
  • LYN
  • NRAS
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • SCFR
  • SOS1
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT5
  • STAT5A
  • STAT5B
  • YES
  • YES1
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

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Last updated: August 19, 2024