GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 451 - 475 of 2090 in total
Pathway Name ▼ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
SUMO is conjugated to E1 (UBA2:SAE1)
  • AOS1
  • SAE1
  • SAE2
  • SMT3A
  • SMT3B
  • SMT3C
  • SMT3H1
  • SMT3H2
  • SMT3H3
  • SUA1
  • SUMO1
  • SUMO2
  • SUMO3
  • UBA2
  • UBL1
  • UBLE1A
  • UBLE1B
Homo sapiens (human)
STING mediated induction of host immune responses
  • ABS
  • C6orf150
  • CGAS
  • DDX41
  • ERIS
  • IFI16
  • IFNGIP1
  • MB21D1
  • MITA
  • RNF81
  • RO52
  • SSA1
  • STING
  • STING1
  • TMEM173
  • TRIM21
Homo sapiens (human)
STAT6-mediated induction of chemokines
  • ERIS
  • MITA
  • NAK
  • STAT6
  • STING
  • STING1
  • TBK1
  • TMEM173
Homo sapiens (human)
STAT5 activation downstream of FLT3 ITD mutants
  • ASH
  • BCL2L
  • BCL2L1
  • BCLX
  • CAP20
  • CD135
  • CDKN1
  • CDKN1A
  • CIP1
  • FLK2
  • FLT3
  • GAB2
  • GRB2
  • KIAA0571
  • MDA6
  • NOX4
  • PIC1
  • PIM1
  • PTP2C
  • PTPN11
  • RENOX
  • SDI1
  • SHPTP2
  • STAT5
  • STAT5A
  • STAT5B
  • STK1
  • WAF1
Homo sapiens (human)
STAT5 Activation
  • CD135
  • FLK2
  • FLT3
  • FLT3LG
  • GAB2
  • KIAA0571
  • PTP2C
  • PTPN11
  • SHPTP2
  • STAT5
  • STAT5A
  • STAT5B
  • STK1
Homo sapiens (human)
STAT3 nuclear events downstream of ALK signaling
  • AIM
  • APRF
  • B7H1
  • BHLHE78
  • BLIMP1
  • CD274
  • CXXC9
  • DNMT
  • DNMT1
  • EP300
  • HDAC1
  • HDAC2
  • HDAC3
  • HIF1A
  • IL2RG
  • MOP1
  • P300
  • PASD8
  • PDCD1L1
  • PDCD1LG1
  • PDL1
  • PRDM1
  • RPD3L1
  • SIN3A
  • STAT3
Homo sapiens (human)
SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
  • BBC1
  • CCG2
  • D11S2243E
  • D6S218E
  • DDOST
  • DXS648E
  • EC45
  • FAU
  • FTE1
  • KIAA0102
  • KIAA0115
  • LAMBR
  • LAMR1
  • MFTL
  • MPS1
  • NEDD6
  • OST48
  • QM
  • RIG
  • RPL1
  • RPL10
  • RPL10A
  • RPL10L
  • RPL11
  • RPL12
  • RPL13
  • RPL13A
  • RPL14
  • RPL15
  • RPL17
  • RPL18
  • RPL18A
  • RPL19
  • RPL21
  • RPL22
  • RPL22L1
  • RPL23
  • RPL23A
  • RPL24
  • RPL26
  • RPL26L1
  • RPL26P1
  • RPL27
  • RPL27A
  • RPL28
  • RPL29
  • RPL3
  • RPL30
  • RPL31
  • RPL32
  • RPL34
  • RPL35
  • RPL35A
  • RPL36
  • RPL36A
  • RPL36AL
  • RPL37
  • RPL37A
  • RPL38
  • RPL39
  • RPL39L
  • RPL39L1
  • RPL3L
  • RPL4
  • RPL41
  • RPL44
  • RPL5
  • RPL6
  • RPL7
  • RPL7A
  • RPL8
  • RPL9
  • RPL9P7
  • RPL9P8
  • RPL9P9
  • RPLP0
  • RPLP1
  • RPLP2
  • RPN1
  • RPN2
  • RPP2
  • RPS10
  • RPS11
  • RPS12
  • RPS13
  • RPS14
  • RPS15
  • RPS15A
  • RPS16
  • RPS17
  • RPS17L
  • RPS18
  • RPS19
  • RPS2
  • RPS20
  • RPS21
  • RPS23
  • RPS24
  • RPS25
  • RPS26
  • RPS27
  • RPS27A
  • RPS27L
  • RPS28
  • RPS29
  • RPS3
  • RPS3A
  • RPS4
  • RPS4X
  • RPS4Y
  • RPS4Y1
  • RPS4Y2
  • RPS4Y2P
  • RPS5
  • RPS6
  • RPS7
  • RPS8
  • RPS9
  • RPSA
  • RRP1
  • SCAR
  • SEC11A
  • SEC11C
  • SEC11L1
  • SEC11L3
  • SEC61A
  • SEC61A1
  • SEC61A2
  • SEC61B
  • SEC61G
  • SPC12
  • SPC18
  • SPC21
  • SPC22
  • SPC25
  • SPCS1
  • SPCS2
  • SPCS3
  • SPCS4A
  • SPCS4C
  • SRP14
  • SRP19
  • SRP54
  • SRP68
  • SRP72
  • SRP9
  • SRPR
  • SRPRA
  • SRPRB
  • SSR1
  • SSR2
  • SSR3
  • SSR4
  • SURF-3
  • SURF3
  • TRAM
  • TRAM1
  • TRAPA
  • TRAPB
  • TRAPD
  • TRAPG
  • TXREB1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
SOS-mediated signalling
  • HRAS
  • HRAS1
  • IRS1
  • IRS2
  • NRAS
  • SOS1
Homo sapiens (human)
SMAD4 MH2 Domain Mutants in Cancer
  • DPC4
  • MADH2
  • MADH3
  • MADH4
  • MADR2
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD4
Homo sapiens (human)
SMAD2/SMAD3:SMAD4 heterotrimer regulates transcription
  • BHLHE39
  • CCNC
  • CCNK
  • CCNT1
  • CCNT2
  • CDC2L4
  • CDK8
  • CDK9
  • CDKN2B
  • COL1A2
  • CPR4
  • DP1
  • DP2
  • DPC4
  • E2F4
  • E2F5
  • EP300
  • ERK1
  • ERK2
  • FUR
  • FURIN
  • HDAC1
  • JUNB
  • MADH2
  • MADH3
  • MADH4
  • MADH7
  • MADH8
  • MADR2
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MEN1
  • MTS2
  • MYC
  • NSEP1
  • P300
  • PACE
  • PAI1
  • PCSK3
  • PLANH1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • RBL1
  • RNF111
  • RPD3L1
  • RPS27A
  • SCG2
  • SERPINE1
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD4
  • SMAD7
  • SP1
  • TAK
  • TAZ
  • TFDP1
  • TFDP2
  • TGIF
  • TGIF1
  • TGIF2
  • TSFP1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • WWTR1
  • YB1
  • YBX1
Homo sapiens (human)
SMAD2/3 Phosphorylation Motif Mutants in Cancer
  • ALK5
  • MADH2
  • MADH3
  • MADR2
  • SKR4
  • SMAD2
  • SMAD3
  • TGFB
  • TGFB1
  • TGFBR1
  • TGFBR2
Homo sapiens (human)
SMAD2/3 MH2 Domain Mutants in Cancer
  • DPC4
  • MADH2
  • MADH3
  • MADH4
  • MADR2
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD4
Homo sapiens (human)
SMAC, XIAP-regulated apoptotic response
  • API3
  • BIRC4
  • CASP3
  • CASP7
  • CPP32
  • DIABLO
  • IAP3
  • MCH3
  • SMAC
  • XIAP
Homo sapiens (human)
SMAC(DIABLO)-mediated dissociation of IAP:caspase complexes
  • APAF1
  • API3
  • BIRC4
  • CASP3
  • CASP7
  • CASP9
  • CPP32
  • CYC
  • CYCS
  • DIABLO
  • IAP3
  • KIAA0413
  • MCH3
  • MCH6
  • SMAC
  • XIAP
Homo sapiens (human)
SMAC (DIABLO) binds to IAPs
  • APAF1
  • API3
  • BIRC4
  • CASP3
  • CASP7
  • CASP9
  • CPP32
  • CYC
  • CYCS
  • DIABLO
  • IAP3
  • KIAA0413
  • MCH3
  • MCH6
  • SMAC
  • XIAP
Homo sapiens (human)
SLIT2:ROBO1 increases RHOA activity
  • ARH12
  • ARHA
  • DUTT1
  • MYO9B
  • MYR5
  • RHO12
  • RHOA
  • ROBO1
  • SLIL3
  • SLIT2
Homo sapiens (human)
SLBP independent Processing of Histone Pre-mRNAs
  • CBP20
  • CBP80
  • COD
  • KIAA1141
  • LSM10
  • LSM11
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • PBSCF
  • PBSCG
  • SNRPB
  • SNRPB1
  • SNRPD3
  • SNRPE
  • SNRPF
  • SNRPG
  • ZFP100
  • ZNF473
Homo sapiens (human)
SLBP Dependent Processing of Replication-Dependent Histone Pre-mRNAs
  • CBP20
  • CBP80
  • COD
  • HBP
  • KIAA1141
  • LSM10
  • LSM11
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • PBSCF
  • PBSCG
  • SLBP
  • SNRPB
  • SNRPB1
  • SNRPD3
  • SNRPE
  • SNRPF
  • SNRPG
  • ZFP100
  • ZNF473
Homo sapiens (human)
SIRT1 negatively regulates rRNA expression
  • GTF2D1
  • H2AB1
  • H2AC14
  • H2AC18
  • H2AC19
  • H2AC20
  • H2AC4
  • H2AC6
  • H2AC7
  • H2AC8
  • H2AFA
  • H2AFB1
  • H2AFE
  • H2AFG
  • H2AFJ
  • H2AFL
  • H2AFM
  • H2AFO
  • H2AFQ
  • H2AFV
  • H2AFX
  • H2AJ
  • H2AV
  • H2AX
  • H2AZ2
  • H2BC1
  • H2BC10
  • H2BC11
  • H2BC12
  • H2BC12L
  • H2BC13
  • H2BC14
  • H2BC15
  • H2BC17
  • H2BC21
  • H2BC26
  • H2BC3
  • H2BC4
  • H2BC5
  • H2BC6
  • H2BC7
  • H2BC8
  • H2BC9
  • H2BFA
  • H2BFB
  • H2BFC
  • H2BFD
  • H2BFE
  • H2BFF
  • H2BFG
  • H2BFH
  • H2BFJ
  • H2BFK
  • H2BFL
  • H2BFN
  • H2BFQ
  • H2BFR
  • H2BFS
  • H2BFT
  • H2BS1
  • H2BU1
  • H3-3A
  • H3-3B
  • H3.3A
  • H3.3B
  • H3C1
  • H3C10
  • H3C11
  • H3C12
  • H3C13
  • H3C14
  • H3C15
  • H3C2
  • H3C3
  • H3C4
  • H3C6
  • H3C7
  • H3C8
  • H3F2
  • H3F3
  • H3F3A
  • H3F3B
  • H3FA
  • H3FB
  • H3FC HIST1H3C
  • H3FD
  • H3FF
  • H3FH
  • H3FI
  • H3FJ
  • H3FK
  • H3FL
  • H3FM
  • H4-16
  • H4/A
  • H4/B
  • H4/C
  • H4/D
  • H4/E
  • H4/G
  • H4/H
  • H4/I
  • H4/J
  • H4/K
  • H4/M
  • H4/N
  • H4/O
  • H4C1
  • H4C11
  • H4C12
  • H4C13
  • H4C14
  • H4C15
  • H4C16
  • H4C2
  • H4C3
  • H4C4
  • H4C5
  • H4C6
  • H4C8
  • H4C9
  • H4F2
  • H4FA
  • H4FB
  • H4FC
  • H4FD
  • H4FE
  • H4FG
  • H4FH
  • H4FI
  • H4FJ
  • H4FK
  • H4FM
  • H4FN
  • H4FO
  • HIRIP1
  • HIRIP2
  • HIST1H2AB
  • HIST1H2AC
  • HIST1H2AD
  • HIST1H2AE
  • HIST1H2AJ
  • HIST1H2BA
  • HIST1H2BB
  • HIST1H2BC
  • HIST1H2BD
  • HIST1H2BE
  • HIST1H2BF
  • HIST1H2BG
  • HIST1H2BH
  • HIST1H2BI
  • HIST1H2BJ
  • HIST1H2BK
  • HIST1H2BL
  • HIST1H2BM
  • HIST1H2BN
  • HIST1H2BO
  • HIST1H3A
  • HIST1H3B
  • HIST1H3D
  • HIST1H3E
  • HIST1H3F
  • HIST1H3G
  • HIST1H3H
  • HIST1H3I
  • HIST1H3J
  • HIST1H4A
  • HIST1H4B
  • HIST1H4C
  • HIST1H4D
  • HIST1H4E
  • HIST1H4F
  • HIST1H4H
  • HIST1H4I
  • HIST1H4J
  • HIST1H4K
  • HIST1H4L
  • HIST2H2AA
  • HIST2H2AA3
  • HIST2H2AA4
  • HIST2H2AC
  • HIST2H2BE
  • HIST2H3A
  • HIST2H3C
  • HIST2H3D
  • HIST2H4
  • HIST2H4A
  • HIST2H4B
  • HIST3H2BB
  • HIST4H4
  • JOSD3
  • KIAA0409
  • KMT1A
  • NML
  • RRP8
  • SIR2L1
  • SIRT1
  • SUV39H
  • SUV39H1
  • TAF1A
  • TAF1B
  • TAF1C
  • TAF1D
  • TBP
  • TF2D
  • TFIID
  • TSH2B
Homo sapiens (human)
SHOC2 M1731 mutant abolishes MRAS complex function
  • ARAF
  • ARAF1
  • BRAF
  • BRAF1
  • KIAA0862
  • MRAS
  • PKS
  • PKS2
  • PPP1CB
  • PPP1CC
  • RAF
  • RAF1
  • RAFB1
  • RRAS3
  • SHOC2
  • YWHAB
Homo sapiens (human)
SHC1 events in ERBB4 signaling
  • BTC
  • DTR
  • DTS
  • EREG
  • GGF
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HGL
  • HRAS
  • HRAS1
  • HRGA
  • NDF
  • NRAS
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • NRG4
  • NTAK
  • SHC
  • SHC1
  • SHCA
  • SMDF
  • SOS1
Homo sapiens (human)
SHC1 events in ERBB2 signaling
  • BTC
  • DTR
  • DTS
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB
  • ERBB1
  • ERBB2
  • EREG
  • GGF
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HER1
  • HER2
  • HGL
  • HRAS
  • HRAS1
  • HRGA
  • MLN19
  • NDF
  • NEU
  • NGL
  • NRAS
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • NRG4
  • NTAK
  • PKCA
  • PKCD
  • PKCE
  • PRKACA
  • PRKCA
  • PRKCD
  • PRKCE
  • PTPN12
  • SHC
  • SHC1
  • SHCA
  • SMDF
  • SOS1
Homo sapiens (human)
SHC1 events in EGFR signaling
  • AREG
  • AREGB
  • BTC
  • DTR
  • DTS
  • EGF
  • EGFR
  • EPGN
  • ERBB
  • ERBB1
  • EREG
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HER1
  • HRAS
  • HRAS1
  • NRAS
  • SDGF
  • SHC
  • SHC1
  • SHCA
  • SOS1
  • TGFA
Homo sapiens (human)
SHC-related events triggered by IGF1R
  • HRAS
  • HRAS1
  • IBP1
  • IGF1
  • IGF1R
  • IGF2
  • NRAS
  • SOS1
Homo sapiens (human)
SHC-mediated cascade:FGFR4
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FGFR4
  • HRAS
  • HRAS1
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • JTK2
  • KLB
  • KS3
  • NRAS
  • SOS1
  • TKF
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024