GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 26 - 50 of 2090 in total
Pathway Name ▲ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
ARL13B-mediated ciliary trafficking of INPP5E
  • ARL13B
  • ARL2L1
  • INPP5E
  • PDE6D
  • PDED
Homo sapiens (human)
ARMS-mediated activation
  • ARMS
  • BRAF
  • BRAF1
  • CRK
  • KIAA1250
  • KIDINS220
  • KREV1
  • MTC
  • NGF
  • NGFB
  • NTRK1
  • RAFB1
  • RAP1A
  • TRK
  • TRKA
  • YWHAB
Homo sapiens (human)
ASP-3026-resistant ALK mutants
  • ALK
Homo sapiens (human)
ATF4 activates genes in response to endoplasmic reticulum stress
  • ASNS
  • ATF3
  • ATF4
  • ATF6
  • CCL2
  • CEBPB
  • CEBPG
  • CHOP
  • CHOP10
  • CML28
  • CREB2
  • CSL4
  • CXCL8
  • DAN
  • DCP2
  • DDIT3
  • DIS3
  • EXOSC1
  • EXOSC2
  • EXOSC3
  • EXOSC4
  • EXOSC5
  • EXOSC6
  • EXOSC7
  • EXOSC8
  • EXOSC9
  • FUBP2
  • GADD153
  • HAP3
  • HERP
  • HERPUD1
  • IBP1
  • IGFBP1
  • IL8
  • KHSRP
  • KIAA0025
  • KIAA0116
  • KIAA1008
  • MCP1
  • MIF1
  • MTR3
  • NFYA
  • NFYB
  • NFYC
  • NUDT20
  • OIP2
  • PARN
  • PMSCL1
  • RRP4
  • RRP40
  • RRP41
  • RRP42
  • RRP43
  • RRP44
  • RRP46
  • SCYA2
  • SKI6
  • TCF5
  • TS11
  • TXREB
Homo sapiens (human)
ATF6 (ATF6-alpha) activates chaperone genes
  • ATF4
  • ATF6
  • CALR
  • CHOP
  • CHOP10
  • CREB2
  • CRTC
  • DDIT3
  • GADD153
  • GRP78
  • GRP94
  • HAP3
  • HSP90B1
  • HSPA5
  • HSPC4
  • NFYA
  • NFYB
  • NFYC
  • TRA1
  • TXREB
Homo sapiens (human)
ATF6 (ATF6-alpha) activates chaperones
  • ATF6
  • GRP78
  • HSPA5
  • KIAA0091
  • MBTPS1
  • MBTPS2
  • S1P
  • S2P
  • SKI1
Homo sapiens (human)
ATF6B (ATF6-beta) activates chaperones
  • ATF6B
  • CREBL1
  • G13
  • GRP78
  • HSPA5
  • KIAA0091
  • MBTPS1
  • MBTPS2
  • S1P
  • S2P
  • SKI1
Homo sapiens (human)
ATP sensitive Potassium channels
  • ABCC8
  • ABCC9
  • HRINS
  • KCNJ11
  • KCNJ8
  • SUR
  • SUR1
  • SUR2
Homo sapiens (human)
AUF1 (hnRNP D0) binds and destabilizes mRNA
  • C7orf76
  • DSS1
  • EIF4F
  • EIF4G
  • EIF4G1
  • EIF4GI
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSC70
  • HSP27
  • HSP28
  • HSP72
  • HSP73
  • HSPA1
  • HSPA10
  • HSPA1A
  • HSPA8
  • HSPB1
  • HSPC
  • HSX70
  • IFI5111
  • KIAA0072
  • KIAA0077
  • KIAA0107
  • LMP10
  • LMP2
  • LMP7
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MCB1
  • MECL1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NU
  • PAB1
  • PABP
  • PABP1
  • PABPC1
  • PABPC2
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA7L
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB11
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB5i
  • PSMB6
  • PSMB6i
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD10
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSME4
  • PSMF1
  • RING10
  • RING12
  • RPS27A
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • X
  • Y
  • Y2
  • Z
Homo sapiens (human)
AURKA Activation by TPX2
  • ACTR1A
  • AIK
  • AIRK1
  • AKAP350
  • AKAP450
  • AKAP9
  • ALMS1
  • ARK1
  • AURA
  • AURKA
  • AYK1
  • AZI1
  • BBS14
  • BITE
  • BTAK
  • C14orf94
  • C15orf25
  • C18orf9
  • C20orf1
  • C20orf2
  • C4orf15
  • C9orf81
  • CALT
  • CCCAP
  • CCDC5
  • CCP110
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDK5RAP2
  • CDKN1
  • CEN2
  • CENPJ
  • CEP1
  • CEP110
  • CEP131
  • CEP135
  • CEP152
  • CEP164
  • CEP192
  • CEP2
  • CEP215
  • CEP250
  • CEP27
  • CEP290
  • CEP4
  • CEP41
  • CEP43
  • CEP57
  • CEP63
  • CEP70
  • CEP72
  • CEP76
  • CEP78
  • CETN2
  • CKAP5
  • CLASP1
  • CNAP1
  • CNTRL
  • CP110
  • CPAP
  • CSNK1D
  • CSNK1E
  • CTRN1
  • CXorf5
  • DCTN2
  • DCTN22
  • DCTN3
  • DCTN50
  • DGT6
  • DHC1
  • DIL2
  • DLC1
  • DNCH1
  • DNCI2
  • DNCIC2
  • DNCL
  • DNCL1
  • DNCLC1
  • DNECL
  • DYHC
  • DYNC1H1
  • DYNC1I2
  • DYNLL1
  • FAM29A
  • FGFR1OP
  • FOP
  • HAUS1
  • HAUS2
  • HAUS3
  • HAUS4
  • HAUS5
  • HAUS6
  • HAUS7
  • HAUS8
  • HCA519
  • HCKID
  • HDLC1
  • HEIC
  • HICE1
  • HMMR
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPC1
  • HSPCA
  • IAK1
  • IHABP
  • KIAA0092
  • KIAA0097
  • KIAA0325
  • KIAA0328
  • KIAA0373
  • KIAA0402
  • KIAA0419
  • KIAA0542
  • KIAA0622
  • KIAA0635
  • KIAA0803
  • KIAA0841
  • KIAA0912
  • KIAA0980
  • KIAA1052
  • KIAA1118
  • KIAA1519
  • KIAA1569
  • KIAA1574
  • KIAA1633
  • LAP
  • LIP1
  • LIS1
  • MAPRE1
  • MAST1
  • MDCR
  • MDS
  • NA14
  • NDE1
  • NEDD1
  • NEK2
  • NEK2A
  • NINL
  • NLK1
  • NLP
  • NPHP10
  • NPHP15
  • NPHP6
  • NUDE
  • ODF2
  • OFD1
  • P34CDC2
  • PAFAH1B1
  • PAFAHA
  • PCM1
  • PCNT
  • PCNT2
  • PKACA
  • PLK
  • PLK1
  • PLK4
  • PPP2R1A
  • PRKACA
  • PRKAR2B
  • RHAMM
  • SAK
  • SDCCAG8
  • SFI1
  • SSNA1
  • STK15
  • STK18
  • STK6
  • TPX2
  • TSGA14
  • TSP57
  • TUBA1
  • TUBA1A
  • TUBA3
  • TUBA4A
  • TUBB
  • TUBB2C
  • TUBB4
  • TUBB4A
  • TUBB4B
  • TUBB5
  • TUBG
  • TUBG1
  • UCHL5IP
  • UIP1
  • YWHAE
  • YWHAG
Homo sapiens (human)
AXIN missense mutants destabilize the destruction complex
  • AMER1
  • APC
  • AXIN
  • AXIN1
  • CSNK1A1
  • DP2.5
  • FAM123B
  • GSK3B
  • KIAA0044
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • WTX
Homo sapiens (human)
Abacavir metabolism
  • ADAL
  • ADAL1
  • ADH1
  • ADH1A
  • NT5B
  • NT5C2
  • NT5CP
  • PCK1
  • PEPCK1
  • PNT5
Homo sapiens (human)
Abacavir transmembrane transport
  • ABCB1
  • ABCG2
  • ABCP
  • BCRP
  • BCRP1
  • EMTH
  • MDR1
  • MXR
  • OCT1
  • OCT2
  • OCT3
  • PGY1
  • SLC22A1
  • SLC22A2
  • SLC22A3
Homo sapiens (human)
Abasic sugar-phosphate removal via the single-nucleotide replacement pathway
  • APE
  • APE1
  • APEX
  • APEX1
  • APX
  • HAP1
  • POLB
  • REF1
Homo sapiens (human)
Aberrant regulation of mitotic exit in cancer due to RB1 defects
  • ANAPC1
  • ANAPC10
  • ANAPC11
  • ANAPC12
  • ANAPC15
  • ANAPC16
  • ANAPC2
  • ANAPC3
  • ANAPC4
  • ANAPC5
  • ANAPC6
  • ANAPC7
  • ANAPC8
  • APC10
  • APC2
  • APC4
  • APC5
  • APC7
  • C10orf104
  • C11orf51
  • C9orf17
  • CDC16
  • CDC23
  • CDC26
  • CDC27
  • CDH1
  • CENP-27
  • D0S1430E
  • D17S978E
  • E2EPF
  • FBXL1
  • FYR
  • FZR
  • FZR1
  • KIAA1242
  • KIAA1406
  • RB1
  • SFT
  • SKP2
  • TSG24
  • UBC5A
  • UBCH10
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH6
  • UBE2C
  • UBE2D1
  • UBE2E1
  • UBE2S
Homo sapiens (human)
Abnormal conversion of 2-oxoglutarate to 2-hydroxyglutarate
  • IDH1
  • PICD
Homo sapiens (human)
Abortive elongation of HIV-1 transcript in the absence of Tat
  • CBP20
  • CBP80
  • COBRA1
  • CTDP1
  • FCP1
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • KIAA1182
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • NELFA
  • NELFB
  • NELFCD
  • NELFD
  • NELFE
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • RAP30
  • RAP74
  • RD
  • RDBP
  • RPB7
  • SPT4H
  • SPT5
  • SPT5H
  • SUPT4H
  • SUPT4H1
  • SUPT5H
  • TH1
  • TH1L
  • WHSC2
Homo sapiens (human)
Acetylation
  • AAC1
  • AAC2
  • NAT1
  • NAT2
Homo sapiens (human)
Acetylcholine Neurotransmitter Release Cycle
  • BZRAP1
  • CHAT
  • CHT1
  • CPLX1
  • KIAA0340
  • KIAA0612
  • KIAA0654
  • KIAA0897
  • LIP1
  • PPFIA1
  • PPFIA2
  • PPFIA3
  • PPFIA4
  • RAB3A
  • RAB3IP2
  • RBP1
  • RIM1
  • RIMBP1
  • RIMS1
  • SLC18A3
  • SLC5A7
  • SNAP
  • SNAP25
  • STX1
  • STX1A
  • SVP65
  • SYB2
  • SYT
  • SYT1
  • TSPOAP1
  • UNC13
  • UNC13B
  • VACHT
  • VAMP2
Homo sapiens (human)
Acetylcholine inhibits contraction of outer hair cells
  • CHRNA10
  • CHRNA9
  • KCNMA
  • KCNMA1
  • KCNMB1
  • KCNN2
  • NACHRA10
  • NACHRA9
  • SLO
Homo sapiens (human)
Acetylcholine regulates insulin secretion
  • CHRM3
  • GA11
  • GAQ
  • GNA11
  • GNA14
  • GNA15
  • GNA16
  • GNAQ
  • KIAA0581
  • MACS
  • MARCKS
  • PKCA
  • PLCB1
  • PLCB2
  • PLCB3
  • PRKACA
  • PRKCA
  • PRKCSL
Homo sapiens (human)
Acrosome Reaction and Sperm:Oocyte Membrane Binding
  • ACR
  • ACRS
  • C19orf36
  • C19orf41
  • C9orf134
  • CD9
  • IZUMO1
  • IZUMO2
  • IZUMO3
  • IZUMO4
  • MIC3
  • SCRL
  • TSPAN29
Homo sapiens (human)
Activated NOTCH1 Transmits Signal to the Nucleus
  • AD3
  • AD4
  • ADAM10
  • ADAM17
  • APH1A
  • APH1B
  • ARB2
  • ARR1
  • ARR2
  • ARRB1
  • ARRB2
  • BET
  • C14orf41
  • CNTN1
  • CSVP
  • DIP1
  • DLK
  • DLK1
  • DLL1
  • DLL4
  • DNER
  • DTX1
  • DTX2
  • DTX4
  • ITCH
  • JAG1
  • JAG2
  • JAGL1
  • KIAA0253
  • KIAA0937
  • KIAA1323
  • KIAA1528
  • KUZ
  • MADM
  • MIB1
  • MIB2
  • NCSTN
  • NEURL
  • NEURL1
  • NEURL1A
  • NEURL1B
  • NEURL3
  • NOTCH1
  • NUMB
  • PEN2
  • PS1
  • PS2
  • PSEN1
  • PSEN2
  • PSENEN
  • PSF
  • PSFL
  • PSNL1
  • PSNL2
  • RNF155
  • RNF58
  • RNF67
  • RPS27A
  • SKD
  • STM2
  • TACE
  • TAN1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • ZZANK1
  • ZZANK2
Homo sapiens (human)
Activated NTRK2 signals through CDK5
  • BDNF
  • CDK5
  • CDK5R
  • CDK5R1
  • CDKN5
  • NCK5A
  • NTRK2
  • PSSALRE
  • RAC1
  • TC25
  • TIAM1
  • TRKB
Homo sapiens (human)
Activated NTRK2 signals through FRS2 and FRS3
  • BDNF
  • FRS2
  • FRS3
  • HRAS
  • HRAS1
  • NRAS
  • NTF4
  • NTF5
  • NTRK2
  • PTP2C
  • PTPN11
  • SHPTP2
  • SOS1
  • TRKB
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


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Last updated: August 19, 2024