GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1151 - 1175 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name ▲ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Maturation of nucleoprotein
  • ADPRTL1
  • ARTD15
  • BAL
  • BAL1
  • BAL2
  • C15orf30
  • CSNK1A1
  • GSK3A
  • GSK3B
  • HMT2
  • HRMT1L2
  • IR1B4
  • KIAA0177
  • KIAA1268
  • N
  • PARP10
  • PARP14
  • PARP16
  • PARP4
  • PARP6
  • PARP8
  • PARP9
  • PARPL
  • PRMT1
  • SMT3C
  • SMT3H3
  • SRPK1
  • SRPK2
  • SUMO1
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBE2I
  • UBL1
Homo sapiens (human)
WNT mediated activation of DVL
  • CK2A1
  • CK2A2
  • CK2N
  • CSNK1E
  • CSNK2A1
  • CSNK2A2
  • CSNK2B
  • DVL1
  • DVL2
  • DVL3
  • G5A
  • KIAA0208
  • PIP5K1B
  • STM7
Homo sapiens (human)
Condensation of Prometaphase Chromosomes
  • BRRN
  • BRRN1
  • CAPC
  • CAPD2
  • CAPE
  • CAPG
  • CAPH
  • CCNB
  • CCNB1
  • CCNB2
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • CK2A1
  • CK2A2
  • CK2N
  • CNAP1
  • CSNK2A1
  • CSNK2A2
  • CSNK2B
  • G5A
  • KIAA0074
  • KIAA0159
  • NCAPD2
  • NCAPG
  • NCAPH
  • NYMEL3
  • P34CDC2
  • SMC2
  • SMC2L1
  • SMC4
  • SMC4L1
Homo sapiens (human)
Signal transduction by L1
  • CAML1
  • CK2A1
  • CK2A2
  • CK2N
  • CSNK2A1
  • CSNK2A2
  • CSNK2B
  • EGFR
  • ERBB
  • ERBB1
  • ERK1
  • ERK2
  • FNRA
  • FNRB
  • G5A
  • GP2B
  • GP3A
  • HER1
  • ITGA2B
  • ITGA5
  • ITGA9
  • ITGAB
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB3
  • L1CAM
  • MAP2K1
  • MAP2K2
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MDF2
  • MEK1
  • MEK2
  • MIC5
  • MKK2
  • MSK12
  • MSK8
  • NCAM
  • NCAM1
  • NRP
  • NRP1
  • PAK1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PRKMK1
  • PRKMK2
  • RAC1
  • TC25
  • VAV2
  • VEGF165R
  • VNRA
  • VTNR
Homo sapiens (human)
Maturation of hRSV A proteins
  • 1B
  • 1C
  • CK2A1
  • CK2A2
  • CK2N
  • CRM1
  • CSNK2A1
  • CSNK2A2
  • CSNK2B
  • F
  • FUR
  • FURIN
  • G5A
  • Impnb
  • KIAA0102
  • Kpnb1
  • L
  • M
  • M2-1
  • N
  • NS1
  • NS2
  • P
  • PACE
  • PCSK3
  • PPP1A
  • PPP1CA
  • PPP1CB
  • PPP1CC
  • SEC11A
  • SEC11C
  • SEC11L1
  • SEC11L3
  • SPC12
  • SPC18
  • SPC21
  • SPC22
  • SPC25
  • SPCS1
  • SPCS2
  • SPCS3
  • SPCS4A
  • SPCS4C
  • XPO1
Homo sapiens (human)
Cooperation of PDCL (PhLP1) and TRiC/CCT in G-protein beta folding
  • 99D8.1
  • C21orf112
  • CCT1
  • CCT2
  • CCT3
  • CCT4
  • CCT5
  • CCT6
  • CCT6A
  • CCT6B
  • CCT7
  • CCT8
  • CCTA
  • CCTB
  • CCTD
  • CCTE
  • CCTG
  • CCTH
  • CCTQ
  • CCTZ
  • CK2A1
  • CK2A2
  • CK2N
  • CSNK2A1
  • CSNK2A2
  • CSNK2B
  • G5A
  • GA11
  • GAQ
  • GNA11
  • GNA14
  • GNA15
  • GNA16
  • GNAQ
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT1
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNGT9
  • KIAA0002
  • KIAA0098
  • NIP7-1
  • PDCL
  • PHLOP1
  • PhLP1
  • RGS11
  • RGS6
  • RGS7
  • RGS9
  • SRB
  • TCP1
  • TRIC5
Homo sapiens (human)
Interleukin-1 processing
  • CASP1
  • CTSG
  • DFNA5L
  • GSDMD
  • GSDMDC1
  • IGIF
  • IL18
  • IL1A
  • IL1B
  • IL1BC
  • IL1BCE
  • IL1F1
  • IL1F2
  • IL1F4
  • LYT10
  • NFKB1
  • NFKB2
  • NFKB3
  • RELA
Homo sapiens (human)
Interleukin-37 signaling
  • APRF
  • BDP1
  • CASP1
  • FIL1Z
  • HCP
  • IL18BP
  • IL18R1
  • IL1BC
  • IL1BCE
  • IL1F7
  • IL1H4
  • IL1RP1
  • IL1RRP
  • IL37
  • KIAA1471
  • MADH3
  • NAK
  • PEZ
  • PNP1
  • PTP1C
  • PTP1E
  • PTP2C
  • PTPD2
  • PTPL1
  • PTPN11
  • PTPN12
  • PTPN13
  • PTPN14
  • PTPN18
  • PTPN2
  • PTPN20
  • PTPN20A
  • PTPN20B
  • PTPN23
  • PTPN4
  • PTPN5
  • PTPN6
  • PTPN7
  • PTPN9
  • PTPT
  • SHPTP2
  • SIGIRR
  • SMAD3
  • STAT3
  • TBK1
Homo sapiens (human)
FasL/ CD95L signaling
  • APT1
  • APT1LG1
  • CASP10
  • CASP8
  • CD95L
  • FADD
  • FAS
  • FAS1
  • FASL
  • FASLG
  • MCH4
  • MCH5
  • MORT1
  • TNFRSF6
  • TNFSF6
Homo sapiens (human)
SMAC, XIAP-regulated apoptotic response
  • API3
  • BIRC4
  • CASP3
  • CASP7
  • CPP32
  • DIABLO
  • IAP3
  • MCH3
  • SMAC
  • XIAP
Homo sapiens (human)
Ligand-independent caspase activation via DCC
  • APPL
  • APPL1
  • CASP3
  • CASP9
  • CPP32
  • DAPK
  • DAPK1
  • DAPK2
  • DAPK3
  • DCC
  • DIP13A
  • IGDCC1
  • KIAA1428
  • KIAA1976
  • MAGED1
  • MCH6
  • NRAGE
  • P53RDL1
  • UNC5A
  • UNC5B
  • UNC5H1
  • UNC5H2
  • ZIPK
Homo sapiens (human)
Apoptosis induced DNA fragmentation
  • CAD
  • CASP3
  • CPP32
  • DFF1
  • DFF2
  • DFF40
  • DFF45
  • DFFA
  • DFFB
  • H1-0
  • H1-1
  • H1-2
  • H1-3
  • H1-4
  • H1-5
  • H1F0
  • H1F1
  • H1F2
  • H1F3
  • H1F4
  • H1F5
  • H1FV
  • HIST1H1A
  • HIST1H1B
  • HIST1H1C
  • HIST1H1D
  • HIST1H1E
  • HMG1
  • HMG2
  • HMGB1
  • HMGB2
  • KPNA1
  • KPNB1
  • NTF97
  • RCH2
Homo sapiens (human)
Stimulation of the cell death response by PAK-2p34
  • CASP3
  • CPP32
  • PAK2
Homo sapiens (human)
Breakdown of the nuclear lamina
  • CASP6
  • LMN2
  • LMNB
  • LMNB1
  • MCH2
Homo sapiens (human)
Regulation of NF-kappa B signaling
  • CASP8
  • CHUK
  • FIP3
  • IKBIP
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKIP
  • IKKA
  • IKKB
  • ISG43
  • KIAA0014
  • KIAA0615
  • LRRC14
  • MCH5
  • N4BP1
  • NEMO
  • NLRC5
  • NLRX1
  • NOD27
  • NOD4
  • NOD5
  • NOD9
  • P53
  • RNF85
  • RPS27A
  • TCF16
  • TGT
  • TP53
  • TRAF2
  • TRAF6
  • TRAP3
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • USP14
  • USP18
Homo sapiens (human)
Ligand-dependent caspase activation
  • APO2
  • APO2L
  • APT1
  • APT1LG1
  • CASP8
  • CD14
  • CD95L
  • DR4
  • DR5
  • ESOP1
  • FADD
  • FAS
  • FAS1
  • FASL
  • FASLG
  • KILLER
  • LY96
  • MC159L
  • MCH5
  • MD2
  • MORT1
  • ORF71
  • PRVTIRB
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • TICAM1
  • TICAM2
  • TIRAP3
  • TIRP
  • TLR4
  • TNFRSF10A
  • TNFRSF10B
  • TNFRSF6
  • TNFSF10
  • TNFSF6
  • TRADD
  • TRAF2
  • TRAIL
  • TRAILR1
  • TRAILR2
  • TRAM
  • TRAP3
  • TRICK2
  • TRIF
  • ZTNFR9
Homo sapiens (human)
TRIF-mediated programmed cell death
  • CASP8
  • CD14
  • ESOP1
  • FADD
  • LY96
  • MCH5
  • MD2
  • MORT1
  • PRVTIRB
  • RIP
  • RIP1
  • RIP3
  • RIPK1
  • RIPK3
  • TICAM1
  • TICAM2
  • TIRAP3
  • TIRP
  • TLR4
  • TRAM
  • TRIF
Homo sapiens (human)
TLR3-mediated TICAM1-dependent programmed cell death
  • CASP8
  • FADD
  • MCH5
  • MORT1
  • PRVTIRB
  • RIP
  • RIP1
  • RIP3
  • RIPK1
  • RIPK3
  • TICAM1
  • TLR3
  • TRIF
Homo sapiens (human)
CASP8 activity is inhibited
  • APO2
  • APO2L
  • APT1
  • APT1LG1
  • CASP8
  • CD95L
  • DR4
  • DR5
  • FADD
  • FAS
  • FAS1
  • FASL
  • FASLG
  • KILLER
  • MCH5
  • MORT1
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • TNFRSF10A
  • TNFRSF10B
  • TNFRSF6
  • TNFSF10
  • TNFSF6
  • TRADD
  • TRAF2
  • TRAIL
  • TRAILR1
  • TRAILR2
  • TRAP3
  • TRICK2
  • ZTNFR9
Homo sapiens (human)
Regulation by c-FLIP
  • APO2
  • APO2L
  • APT1
  • APT1LG1
  • CASP8
  • CD95L
  • DR4
  • DR5
  • FADD
  • FAS
  • FAS1
  • FASL
  • FASLG
  • KILLER
  • MCH5
  • MORT1
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • TNFRSF10A
  • TNFRSF10B
  • TNFRSF6
  • TNFSF10
  • TNFSF6
  • TRADD
  • TRAF2
  • TRAIL
  • TRAILR1
  • TRAILR2
  • TRAP3
  • TRICK2
  • ZTNFR9
Homo sapiens (human)
Dimerization of procaspase-8
  • APO2
  • APO2L
  • APT1
  • APT1LG1
  • CASP8
  • CD95L
  • DR4
  • DR5
  • FADD
  • FAS
  • FAS1
  • FASL
  • FASLG
  • KILLER
  • MCH5
  • MORT1
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • TNFRSF10A
  • TNFRSF10B
  • TNFRSF6
  • TNFSF10
  • TNFSF6
  • TRADD
  • TRAF2
  • TRAIL
  • TRAILR1
  • TRAILR2
  • TRAP3
  • TRICK2
  • ZTNFR9
Homo sapiens (human)
Defective RIPK1-mediated regulated necrosis
  • CASP8
  • FADD
  • MCH5
  • MORT1
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • TRADD
  • TRAF2
  • TRAP3
Homo sapiens (human)
Microbial modulation of RIPK1-mediated regulated necrosis
  • 3a
  • CASP8
  • ICP6
  • MCH5
  • MLKL
  • NS
  • OPG199
  • RIP
  • RIP1
  • RIP3
  • RIPK1
  • RIPK3
  • RIR1
  • SPI-2
  • UL36
Homo sapiens (human)
Regulation of MITF-M-dependent genes involved in cell cycle and proliferation
  • BCL1
  • CAP20
  • CCNB
  • CCNB1
  • CCND1
  • CDK2
  • CDKN1
  • CDKN1A
  • CDKN2
  • CDKN2A
  • CIP1
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • LEF1
  • MDA6
  • MET
  • MTS1
  • PIC1
  • PLK
  • PLK1
  • PRAD1
  • SDI1
  • TBX2
  • TCF1
  • TCF3
  • TCF4
  • TCF7
  • TCF7L1
  • TCF7L2
  • WAF1
Homo sapiens (human)
Synthesis, secretion, and inactivation of Glucagon-like Peptide-1 (GLP-1)
  • ADCP2
  • AN2
  • CD26
  • CDX2
  • CDX3
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • DPP4
  • FFAR1
  • FFAR4
  • GCG
  • GNAT3
  • GNB1
  • GNB3
  • GNG13
  • GPR119
  • GPR120
  • GPR129
  • GPR40
  • GRP
  • KIAA0102
  • LEP
  • NEC1
  • O3FAR1
  • OB
  • OBS
  • PAX6
  • PCSK1
  • PGR4
  • SEC11A
  • SEC11C
  • SEC11L1
  • SEC11L3
  • SPC12
  • SPC18
  • SPC21
  • SPC22
  • SPC25
  • SPCS1
  • SPCS2
  • SPCS3
  • SPCS4A
  • SPCS4C
  • TCF4
  • TCF7L2
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024