GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 126 - 150 of 2090 in total
Pathway Name ▼ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Transport of inorganic cations/anions and amino acids/oligopeptides
  • CTNS
  • EAAC1
  • EAAT1
  • EAAT2
  • EAAT3
  • EAAT4
  • EAAT5
  • GLAST
  • GLAST1
  • GLT1
  • HEAAC1
  • SAMC
  • SLC1A1
  • SLC1A2
  • SLC1A3
  • SLC1A6
  • SLC1A7
  • SLC25A26
  • SLC32A1
  • VGAT
  • VIAAT
Homo sapiens (human)
Transport of gamma-carboxylated protein precursors from the endoplasmic reticulum to the Golgi apparatus
  • AXLLG
  • BGLAP
  • F10
  • F2
  • F7
  • F9
  • GAS6
  • PROC
  • PROS
  • PROS1
  • PROZ
Homo sapiens (human)
Transport of fatty acids
  • ACSVL2
  • ACSVL4
  • ACSVL5
  • APOD
  • FACVL2
  • FATP1
  • FATP4
  • FATP6
  • LCN1
  • LCN12
  • LCN15
  • LCN9
  • SLC27A1
  • SLC27A4
  • SLC27A6
  • VEGP
Homo sapiens (human)
Transport of connexons to the plasma membrane
  • GJB2
Homo sapiens (human)
Transport of connexins along the secretory pathway
  • CX32
  • GJA1
  • GJAL
  • GJB1
  • GJB2
Homo sapiens (human)
Transport of bile salts and organic acids, metal ions and amine compounds
  • C6orf29
  • CD92
  • CDW92
  • CHT1
  • CTL1
  • CTL2
  • CTL3
  • CTL4
  • CTL5
  • HUT11
  • HUT2
  • JK
  • MATE1
  • MATE2
  • NG22
  • RACH1
  • SLC10A6
  • SLC14A1
  • SLC14A2
  • SLC44A1
  • SLC44A2
  • SLC44A3
  • SLC44A4
  • SLC44A5
  • SLC47A1
  • SLC47A2
  • SLC5A7
  • SOAT
  • TPPT1
  • UT1
  • UT2
  • UTE
Homo sapiens (human)
Transport of Ribonucleoproteins into the Host Nucleus
  • AAAS
  • ADRACALA
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CG1
  • D3S1231E
  • KIAA0023
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • KPNA1
  • KPNB1
  • MP44
  • MRNP41
  • NDC1
  • NP
  • NPAP60L
  • NTF97
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • PA
  • PB1
  • PB2
  • PCNT1
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • RAE1
  • RANBP2
  • RCH2
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • TMEM48
  • TPR
Homo sapiens (human)
Transport of RCbl within the body
  • 8D6A
  • ABCC1
  • ABCD4
  • ARH
  • C6orf209
  • CD320
  • LDLRAP1
  • LMBRD1
  • LRP2
  • MRP
  • MRP1
  • NESI
  • PXMP1L
  • TC1
  • TC2
  • TCN1
  • TCN2
Homo sapiens (human)
Transport of Mature mRNA derived from an Intron-Containing Transcript
  • AAAS
  • ADRACALA
  • ALY
  • ALYREF
  • ASF
  • BAT1
  • BEF
  • C1orf77
  • C22orf19
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CASC3
  • CBP20
  • CBP80
  • CDC40
  • CG1
  • CHTOP
  • CXorf3
  • D3S1231E
  • DDX38
  • DDX39
  • DDX39A
  • DDX39B
  • DDX48
  • DHX38
  • EHB3
  • EIF4A3
  • FOP
  • FYTTD1
  • GLE1
  • GLE1L
  • HCC1
  • HPR1
  • HRS
  • KIAA0023
  • KIAA0095
  • KIAA0111
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0224
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0663
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • KIAA0983
  • KIAA1649
  • LDC2
  • LUZP4
  • MAGOH
  • MAGOH2
  • MAGOHA
  • MAGOHB
  • MLN51
  • MP44
  • MRNP41
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • NDC1
  • NIF3L1BP1
  • NPAP60L
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • NXF1
  • NXF2
  • NXF2B
  • NXT1
  • PCNT1
  • PDIP46
  • POLDIP3
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • PRP16
  • PRP17
  • PRPF17
  • RAE1
  • RANBP2
  • RBM8
  • RBM8A
  • RENT3B
  • RNPS1
  • SARNP
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • SF2
  • SF2P33
  • SFRS1
  • SFRS11
  • SFRS2
  • SFRS3
  • SFRS4
  • SFRS5
  • SFRS6
  • SFRS7
  • SFRS9
  • SLU7
  • SRM160
  • SRP20
  • SRP30C
  • SRP40
  • SRP55
  • SRP75
  • SRRM1
  • SRSF1
  • SRSF11
  • SRSF2
  • SRSF3
  • SRSF4
  • SRSF5
  • SRSF6
  • SRSF7
  • SRSF9
  • TAP
  • TAPL2
  • THOC1
  • THOC2
  • THOC3
  • THOC4
  • THOC5
  • THOC6
  • THOC7
  • TMEM48
  • TPR
  • U2AF1
  • U2AF1-RS3
  • U2AF1L3
  • U2AF1L4
  • U2AF2
  • U2AF35
  • U2AF65
  • U2AFBP
  • UAP56
  • UIF
  • UPF3B
  • UPF3X
  • WDR58
  • ZC3H11A
  • ZC3HDC11A
Homo sapiens (human)
Transport of Mature mRNA Derived from an Intronless Transcript
  • AAAS
  • ADRACALA
  • ALY
  • ALYREF
  • BEF
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CBP20
  • CBP80
  • CG1
  • CPSF1
  • CPSF100
  • CPSF160
  • CPSF2
  • CPSF3
  • CPSF30
  • CPSF4
  • CPSF73
  • D3S1231E
  • EIF4E
  • EIF4EL1
  • EIF4F
  • FIP1
  • FIP1L1
  • KIAA0023
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • KIAA1367
  • MP44
  • MRNP41
  • NAR
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • NDC1
  • NEB1
  • NPAP60L
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • NXF1
  • PCNT1
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • RAE1
  • RANBP2
  • RHE
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • SPK
  • SYMPK
  • TAP
  • THOC4
  • TMEM48
  • TPR
  • WDC146
  • WDR33
Homo sapiens (human)
Transport of HA trimer, NA tetramer and M2 tetramer from the endoplasmic reticulum to the Golgi Apparatus
  • HA
  • M
  • NA
Homo sapiens (human)
Transport and synthesis of PAPS
  • ATPSK1
  • ATPSK2
  • C6orf196
  • DTD
  • DTDST
  • PAPSS
  • PAPSS1
  • PAPSS2
  • PAPST1
  • PAPST2
  • SAT1
  • SLC26A1
  • SLC26A2
  • SLC35B2
  • SLC35B3
Homo sapiens (human)
Translocation of ZAP-70 to Immunological synapse
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • HLA-DP1A
  • HLA-DP1B
  • HLA-DPA1
  • HLA-DPB1
  • HLA-DQA1
  • HLA-DQA2
  • HLA-DQB
  • HLA-DQB1
  • HLA-DQB2
  • HLA-DRA
  • HLA-DRA1
  • HLA-DRB1
  • HLA-DRB3
  • HLA-DRB4
  • HLA-DRB5
  • HLA-DXA
  • HLA-DXB
  • HLASB
  • LCK
  • PTPN22
  • PTPN8
  • SRK
  • T3D
  • T3E
  • T3G
  • TCRA
  • TCRBV12S3
  • TCRBV8S1
  • TRAC
  • TRAV19
  • TRAV29DV5
  • TRAV8-4
  • TRBC1
  • TRBV12-3
  • TRBV7-9
  • ZAP70
Homo sapiens (human)
Translocation of SLC2A4 (GLUT4) to the plasma membrane
  • AKT1
  • AKT2
  • AMPK
  • AMPK2
  • AMPKG3
  • ARHQ
  • AS160
  • ASPL
  • ASPSCR1
  • C20orf74
  • C2CD5
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CDP138
  • EXO70
  • EXOC1
  • EXOC2
  • EXOC3
  • EXOC4
  • EXOC5
  • EXOC6
  • EXOC7
  • EXOC8
  • GLUT4
  • HME1
  • KIAA0359
  • KIAA0528
  • KIAA0603
  • KIAA1067
  • KIAA1108
  • KIAA1219
  • KIAA1272
  • KIAA1699
  • KIF3
  • KIF3A
  • KIF3AP
  • KIF3B
  • KIFAP3
  • LNPEP
  • MEL
  • MYH12
  • MYH9
  • MYO1C
  • MYO5A
  • OTASE
  • PKB
  • PRKAA2
  • PRKAB1
  • PRKAB2
  • PRKAG1
  • PRKAG2
  • PRKAG3
  • RAB10
  • RAB11
  • RAB11A
  • RAB13
  • RAB14
  • RAB4
  • RAB4A
  • RAB8
  • RAB8A
  • RAC
  • RAC1
  • RAL
  • RALA
  • RALGAPA2
  • RALGAPB
  • RASL7A
  • RCC17
  • RHOQ
  • SEC10
  • SEC10L1
  • SEC15A
  • SEC15L
  • SEC15L1
  • SEC3
  • SEC3L1
  • SEC5
  • SEC5L1
  • SEC6
  • SEC6L1
  • SEC8
  • SEC8L1
  • SFN
  • SLC2A4
  • SMAP
  • SNAP23
  • STX4
  • STX4A
  • STXBP3
  • SYB2
  • TBC1D1
  • TBC1D4
  • TC10
  • TC25
  • TUG
  • UBXD9
  • UBXN9
  • VAMP2
  • YWHA1
  • YWHAB
  • YWHAE
  • YWHAG
  • YWHAH
  • YWHAQ
  • YWHAZ
Homo sapiens (human)
Translesion synthesis by REV1
  • MAD2B
  • MAD2L2
  • PCNA
  • POLZ
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • REV1
  • REV1L
  • REV3
  • REV3L
  • REV7
  • RFC1
  • RFC140
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Translesion synthesis by POLK
  • DINB1
  • MAD2B
  • MAD2L2
  • PCNA
  • POLK
  • POLZ
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • REV1
  • REV1L
  • REV3
  • REV3L
  • REV7
  • RFC1
  • RFC140
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Translesion synthesis by POLI
  • MAD2B
  • MAD2L2
  • PCNA
  • POLI
  • POLZ
  • RAD30B
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • REV1
  • REV1L
  • REV3
  • REV3L
  • REV7
  • RFC1
  • RFC140
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Translesion Synthesis by POLH
  • ARNIP
  • C1orf124
  • CHIMP
  • DVC1
  • HEL-220
  • HEL-S-70
  • KIAA1499
  • NPL4
  • NPLOC4
  • PCNA
  • PIRH2
  • POLH
  • RAD30
  • RAD30A
  • RCHY1
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • RFC1
  • RFC140
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • RNF199
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • RPS27A
  • SPRTN
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UFD1
  • UFD1L
  • VCP
  • XPV
  • ZNF363
Homo sapiens (human)
Translation of respiratory syncytial virus mRNAs
  • 1B
  • 1C
  • F
  • L
  • M
  • M2-1
  • M2-2
  • N
  • NS1
  • NS2
  • P
Homo sapiens (human)
Translation of Structural Proteins
  • 3a
  • E
  • M
  • N
  • S
Homo sapiens (human)
Translation of Structural Proteins
  • 3a
  • E
  • M
  • N
  • S
  • sM
Homo sapiens (human)
Translation of Replicase and Assembly of the Replication Transcription Complex
  • 1a
  • 8b
  • 9b
  • BC2
  • BECN1
  • C14orf123
  • C20orf178
  • CGI149
  • CHMP2
  • CHMP2A
  • CHMP2B
  • CHMP3
  • CHMP4A
  • CHMP4B
  • CHMP4C
  • CHMP6
  • CHMP7
  • GT197
  • MAP1ALC3
  • MAP1LC3B
  • NEDF
  • PIK3C3
  • PIK3R4
  • SHAX1
  • SHAX2
  • SHAX3
  • UVRAG
  • VPS15
  • VPS20
  • VPS24
  • VPS34
  • rep
Homo sapiens (human)
Translation of Replicase and Assembly of the Replication Transcription Complex
  • BC2
  • BECN1
  • C14orf123
  • C20orf178
  • CGI149
  • CHMP2
  • CHMP2A
  • CHMP2B
  • CHMP3
  • CHMP4A
  • CHMP4B
  • CHMP4C
  • CHMP6
  • CHMP7
  • GT197
  • MAP1ALC3
  • MAP1LC3B
  • NEDF
  • PIK3C3
  • PIK3R4
  • SHAX1
  • SHAX2
  • SHAX3
  • UVRAG
  • VPS15
  • VPS20
  • VPS24
  • VPS34
  • rep
Homo sapiens (human)
Translation of Accessory Proteins
  • 6
  • 7a
  • 8
  • 9b
Homo sapiens (human)
Translation initiation complex formation
  • CCG2
  • D6S218E
  • DDX2A
  • DDX2B
  • EIF1A
  • EIF1AX
  • EIF2A
  • EIF2B
  • EIF2G
  • EIF2S1
  • EIF2S2
  • EIF2S3
  • EIF3A
  • EIF3B
  • EIF3C
  • EIF3D
  • EIF3E
  • EIF3EIP
  • EIF3F
  • EIF3G
  • EIF3H
  • EIF3I
  • EIF3J
  • EIF3K
  • EIF3L
  • EIF3M
  • EIF3S1
  • EIF3S10
  • EIF3S12
  • EIF3S2
  • EIF3S3
  • EIF3S4
  • EIF3S5
  • EIF3S6
  • EIF3S6IP
  • EIF3S7
  • EIF3S8
  • EIF3S9
  • EIF4A
  • EIF4A1
  • EIF4A2
  • EIF4B
  • EIF4C
  • EIF4E
  • EIF4EL1
  • EIF4F
  • EIF4G
  • EIF4G1
  • EIF4GI
  • EIF4H
  • FAU
  • FTE1
  • HFLB5
  • INT6
  • KIAA0038
  • KIAA0139
  • LAMBR
  • LAMR1
  • MFTL
  • MPS1
  • PAB1
  • PABP
  • PABP1
  • PABPC1
  • PABPC2
  • PCID1
  • RIG
  • RPS10
  • RPS11
  • RPS12
  • RPS13
  • RPS14
  • RPS15
  • RPS15A
  • RPS16
  • RPS17
  • RPS17L
  • RPS18
  • RPS19
  • RPS2
  • RPS20
  • RPS21
  • RPS23
  • RPS24
  • RPS25
  • RPS26
  • RPS27
  • RPS27A
  • RPS27L
  • RPS28
  • RPS29
  • RPS3
  • RPS3A
  • RPS4
  • RPS4X
  • RPS4Y
  • RPS4Y1
  • RPS4Y2
  • RPS4Y2P
  • RPS5
  • RPS6
  • RPS7
  • RPS8
  • RPS9
  • RPSA
  • SCAR
  • TRIP1
  • UBA80
  • UBCEP1
  • WBSCR1
  • WSCR1
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


Logo License Policies Site Map

Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024