GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1726 - 1750 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▲ GlyTouCan ID
Transport of nucleosides and free purine and pyrimidine bases across the plasma membrane
  • AAC1
  • AAC2
  • AAC3
  • ANT1
  • ANT2
  • ANT3
  • ARL2
  • ARL2BP
  • BART
  • BART1
  • CNT1
  • CNT2
  • CNT3
  • DER12
  • ENT1
  • ENT2
  • ENT3
  • ENT4
  • HNP36
  • PMAT
  • SLC25A4
  • SLC25A5
  • SLC25A6
  • SLC28A1
  • SLC28A2
  • SLC28A3
  • SLC29A1
  • SLC29A2
  • SLC29A3
  • SLC29A4
Homo sapiens (human)
Chk1/Chk2(Cds1) mediated inactivation of Cyclin B:Cdk1 complex
  • CCNB
  • CCNB1
  • CDC2
  • CDC25C
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • CDS1
  • CHEK1
  • CHEK2
  • CHK1
  • CHK2
  • HME1
  • P34CDC2
  • RAD53
  • SFN
  • WEE1
  • YWHA1
  • YWHAB
  • YWHAE
  • YWHAG
  • YWHAH
  • YWHAQ
  • YWHAZ
Homo sapiens (human)
PTK6 Regulates Proteins Involved in RNA Processing
  • BRK
  • KHDRBS1
  • KHDRBS2
  • KHDRBS3
  • PSF
  • PTK6
  • SALP
  • SAM68
  • SFPQ
  • SLM1
  • SLM2
Homo sapiens (human)
Intestinal infectious diseases
  • GUC2C
  • GUCY2C
  • IKEPP
  • NHERF4
  • PDZD3
  • PDZK2
  • STAR
  • sta1
Homo sapiens (human)
Transport of connexons to the plasma membrane
  • GJB2
Homo sapiens (human)
Passive transport by Aquaporins
  • AQP0
  • AQP1
  • AQP10
  • AQP11
  • AQP12
  • AQP12A
  • AQP2
  • AQP2L
  • AQP3
  • AQP4
  • AQP5
  • AQP6
  • AQP7
  • AQP7L
  • AQP8
  • AQP9
  • AQPX1
  • AQPX2
  • CHIP28
  • MIP
  • SSC1
Homo sapiens (human)
HDL assembly
  • A2M
  • ABC1
  • ABCA1
  • APOA1
  • CERP
  • CPAMD5
  • KIAA1292
  • PKACA
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • ZDHHC8
  • ZDHHCL1
  • ZNF378
Homo sapiens (human)
Hyaluronan biosynthesis and export
  • ABCC5
  • CEMIP
  • HAS
  • HAS1
  • HAS2
  • HAS3
  • HYBID
  • KIAA1199
  • MRP5
Homo sapiens (human)
Synthesis and processing of ENV and VPU
  • FUR
  • FURIN
  • PACE
  • PCSK3
  • env
  • vpu
Homo sapiens (human)
Transport of gamma-carboxylated protein precursors from the endoplasmic reticulum to the Golgi apparatus
  • AXLLG
  • BGLAP
  • F10
  • F2
  • F7
  • F9
  • GAS6
  • PROC
  • PROS
  • PROS1
  • PROZ
Homo sapiens (human)
Defective Inhibition of DNA Recombination at Telomere Due to ATRX Mutations
  • ATRX
  • BING2
  • DAP6
  • DAXX
  • RAD54L
  • XH2
Homo sapiens (human)
Defective SLCO1B1 causes hyperbilirubinemia, Rotor type (HBLRR)
  • LST1
  • OATP1B1
  • OATP2
  • OATPC
  • SLC21A6
  • SLCO1B1
Homo sapiens (human)
Major pathway of rRNA processing in the nucleolus and cytosol
  • 3'EXO
  • ART4
  • BAP28
  • BBC1
  • BING4
  • BMS1
  • BMS1L
  • BOP1
  • BUD23
  • BXDC4
  • BYSL
  • C14orf111
  • C15orf12
  • C17orf40
  • C1D
  • C1orf107
  • C2F
  • C4orf9
  • C6orf11
  • C6orf135
  • C6orf153
  • C6orf93
  • CAT60
  • CCG2
  • CIRH1A
  • CML28
  • CRLZ1
  • CSL4
  • CSNK1D
  • CSNK1E
  • D11S2243E
  • D21S2056E
  • D6S218E
  • DCAF13
  • DDX21
  • DDX37
  • DDX47
  • DDX49
  • DDX52
  • DEF
  • DHX37
  • DIEXF
  • DIS3
  • DOB1
  • DRIM
  • DXS648E
  • E2IG3
  • EBNA1BP2
  • EBP2
  • EC45
  • EMG1
  • ENP1
  • ERI1
  • EXOSC1
  • EXOSC10
  • EXOSC2
  • EXOSC3
  • EXOSC4
  • EXOSC5
  • EXOSC6
  • EXOSC7
  • EXOSC8
  • EXOSC9
  • FAU
  • FBL
  • FCF1
  • FIB1
  • FLRN
  • FTE1
  • FTSJ3
  • GNL3
  • HCA66
  • HCKID
  • HEATR1
  • HMX3
  • HRB2
  • IMP3
  • IMP4
  • ISG20L2
  • KIAA0007
  • KIAA0052
  • KIAA0116
  • KIAA0124
  • KIAA0185
  • KIAA0187
  • KIAA0266
  • KIAA1008
  • KIAA1401
  • KIAA1517
  • KIAA1988
  • KRR1
  • LAMBR
  • LAMR1
  • LAS1L
  • LTV1
  • MERM1
  • MFTL
  • MHAT
  • MNAR
  • MPHOSPH10
  • MPHOSPH6
  • MPP10
  • MPP6
  • MPS1
  • MRPS4
  • MTR3
  • MTR4
  • MTREX
  • NCL
  • NEDD6
  • NHP2L1
  • NIP7
  • NNP1
  • NOB1
  • NOB1P
  • NOC4L
  • NOL11
  • NOL12
  • NOL14
  • NOL5
  • NOL5A
  • NOL6
  • NOL9
  • NOP14
  • NOP5
  • NOP52
  • NOP56
  • NOP58
  • NS
  • OIP2
  • PDCD11
  • PELP1
  • PES1
  • PMSCL
  • PMSCL1
  • PMSCL2
  • PNO1
  • PSMD8BP1
  • PWP2
  • PWP2H
  • QM
  • RBM28
  • RCL1
  • RIG
  • RIO1
  • RIO2
  • RIOK1
  • RIOK2
  • RIOK3
  • RNAC
  • RNASEP1
  • RNASEP2
  • RNU3IP2
  • ROK1
  • RPC2
  • RPCL1
  • RPL1
  • RPL10
  • RPL10A
  • RPL10L
  • RPL11
  • RPL12
  • RPL13
  • RPL13A
  • RPL14
  • RPL15
  • RPL17
  • RPL18
  • RPL18A
  • RPL19
  • RPL21
  • RPL22
  • RPL22L1
  • RPL23
  • RPL23A
  • RPL24
  • RPL26
  • RPL26L1
  • RPL26P1
  • RPL27
  • RPL27A
  • RPL28
  • RPL29
  • RPL3
  • RPL30
  • RPL31
  • RPL32
  • RPL34
  • RPL35
  • RPL35A
  • RPL36
  • RPL36A
  • RPL36AL
  • RPL37
  • RPL37A
  • RPL38
  • RPL39
  • RPL39L
  • RPL39L1
  • RPL3L
  • RPL4
  • RPL41
  • RPL44
  • RPL5
  • RPL6
  • RPL7
  • RPL7A
  • RPL8
  • RPL9
  • RPL9P7
  • RPL9P8
  • RPL9P9
  • RPLP0
  • RPLP1
  • RPLP2
  • RPP14
  • RPP2
  • RPP21
  • RPP25
  • RPP30
  • RPP38
  • RPP40
  • RPS10
  • RPS11
  • RPS12
  • RPS13
  • RPS14
  • RPS15
  • RPS15A
  • RPS16
  • RPS17
  • RPS17L
  • RPS18
  • RPS19
  • RPS2
  • RPS20
  • RPS21
  • RPS23
  • RPS24
  • RPS25
  • RPS26
  • RPS27
  • RPS27A
  • RPS27L
  • RPS28
  • RPS29
  • RPS3
  • RPS3A
  • RPS4
  • RPS4X
  • RPS4Y
  • RPS4Y1
  • RPS4Y2
  • RPS4Y2P
  • RPS5
  • RPS6
  • RPS7
  • RPS8
  • RPS9
  • RPSA
  • RRP1
  • RRP1A
  • RRP36
  • RRP4
  • RRP40
  • RRP41
  • RRP42
  • RRP43
  • RRP44
  • RRP46
  • RRP6
  • RRP7A
  • RRP9
  • RTC2
  • SAS10
  • SAZD
  • SCAR
  • SDCCAG16
  • SENP3
  • SKI6
  • SKIV2L2
  • SNU13
  • SSP3
  • SUDD
  • SURF-3
  • SURF3
  • SUSP3
  • TBL3
  • TEX10
  • THEX1
  • TSR1
  • TXREB1
  • U355K
  • UBA52
  • UBA80
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UTP10
  • UTP11
  • UTP11L
  • UTP14A
  • UTP14C
  • UTP15
  • UTP17
  • UTP18
  • UTP20
  • UTP25
  • UTP3
  • UTP4
  • UTP5
  • UTP6
  • WBSCR22
  • WDR12
  • WDR18
  • WDR3
  • WDR36
  • WDR43
  • WDR46
  • WDR50
  • WDR75
  • WDSOF1
  • XRN2
  • cPERP-E
Homo sapiens (human)
Small interfering RNA (siRNA) biogenesis
  • AGO1
  • AGO2
  • AGO3
  • AGO4
  • DICER
  • DICER1
  • EIF2C1
  • EIF2C2
  • EIF2C3
  • EIF2C4
  • HERNA
  • KIAA0928
  • KIAA1567
  • PACT
  • PRKRA
  • RAX
  • TARBP2
  • TRAX
  • TRBP
  • TSN
  • TSNAX
Homo sapiens (human)
TICAM1-dependent activation of IRF3/IRF7
  • CAP-1
  • CRAF1
  • FIP2
  • GLC1E
  • HIP7
  • HYPL
  • IKBKE
  • IKKE
  • IKKI
  • IRF3
  • IRF7
  • ITRAF
  • KIAA0151
  • NAK
  • NRP
  • OPTN
  • PRVTIRB
  • RPS27A
  • TANK
  • TBK1
  • TICAM1
  • TLR3
  • TRAF2
  • TRAF3
  • TRAFAMN
  • TRIF
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Protein hydroxylation
  • ASPH
  • BAH
  • C14orf169
  • DFRP1
  • DFRP2
  • DRG1
  • DRG2
  • ERF1
  • ETF1
  • F9
  • JMJD4
  • JMJD5
  • JMJD6
  • JMJD7
  • KDM8
  • KIAA0585
  • KIAA1612
  • LEREPO4
  • MAPJD
  • MDIG
  • MINA
  • MINA53
  • NEDD3
  • NO52
  • NO66
  • OGFOD1
  • PSR
  • PTDSR
  • RCCD1
  • RF1
  • RIOX1
  • RIOX2
  • RPL27A
  • RPL8
  • RPS23
  • RPS6
  • RWDD1
  • SUP45L1
  • TPA1
  • U2AF2
  • U2AF65
  • ZC3H15
Homo sapiens (human)
lestaurtinib-resistant FLT3 mutants
  • CD135
  • FLK2
  • FLT3
  • STK1
Homo sapiens (human)
Tandem of pore domain in a weak inwardly rectifying K+ channels (TWIK)
  • HOHO1
  • KCNK1
  • KCNK6
  • KCNK7
  • KCNO1
  • TOSS
  • TWIK1
  • TWIK2
Homo sapiens (human)
Defective SLC7A9 causes cystinuria (CSNU)
  • BAT1
  • NBAT
  • SLC3A1
  • SLC7A9
Homo sapiens (human)
Defective ALG11 causes CDG-1p
  • ALG11
  • GT8
Homo sapiens (human)
Purine salvage
  • ADA
  • ADA1
  • ADAL
  • ADAL1
  • ADK
  • AMPD1
  • AMPD2
  • AMPD3
  • APRT
  • DCK
  • DGK
  • DGUOK
  • GMPR
  • GMPR1
  • GMPR2
  • HPRT
  • HPRT1
  • NP
  • PNP
Homo sapiens (human)
Translation of Replicase and Assembly of the Replication Transcription Complex
  • BC2
  • BECN1
  • C14orf123
  • C20orf178
  • CGI149
  • CHMP2
  • CHMP2A
  • CHMP2B
  • CHMP3
  • CHMP4A
  • CHMP4B
  • CHMP4C
  • CHMP6
  • CHMP7
  • GT197
  • MAP1ALC3
  • MAP1LC3B
  • NEDF
  • PIK3C3
  • PIK3R4
  • SHAX1
  • SHAX2
  • SHAX3
  • UVRAG
  • VPS15
  • VPS20
  • VPS24
  • VPS34
  • rep
Homo sapiens (human)
WNT5A-dependent internalization of FZD2, FZD5 and ROR2
  • ADTAA
  • ADTAB
  • ADTB2
  • AP17
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • C2orf31
  • CLAPA1
  • CLAPA2
  • CLAPB1
  • CLAPM1
  • CLAPS2
  • CLH17
  • CLTA
  • CLTB
  • CLTC
  • CLTCL2
  • FZD2
  • FZD5
  • HIP9
  • HYPJ
  • KIAA0034
  • KIAA0109
  • KIAA0899
  • NTRKR1
  • NTRKR2
  • ROR1
  • ROR2
  • WNT5A
Homo sapiens (human)
Activated NTRK2 signals through FYN
  • BDNF
  • GRIN2B
  • NMDAR2B
  • NTRK2
  • SRC
  • SRC1
  • TRKB
Homo sapiens (human)
Glycosphingolipid transport
  • ARF1
  • BTS
  • CLN3
  • CPTP
  • ESYT1
  • ESYT2
  • ESYT3
  • FAM62A
  • FAM62B
  • FAM62C
  • FAPP2
  • GLTP
  • GLTPD1
  • KIAA0747
  • KIAA1228
  • MBC2
  • PLEKHA8
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024