GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1726 - 1750 of 2090 in total
Pathway Name ▲ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Signaling by Retinoic Acid
  • CPT1
  • CPT1A
  • CPT1B
  • CRABP2
  • DLAT
  • DLD
  • DLTA
  • FABP5
  • GCSL
  • HAP
  • KIAA1670
  • LAD
  • NR1B1
  • NR1B2
  • NR1B3
  • NR1C2
  • NR2B1
  • NR2B2
  • NR2B3
  • PDHA1
  • PDHA2
  • PDHAL
  • PDHB
  • PDHK1
  • PDHK2
  • PDHK3
  • PDHK4
  • PDHX
  • PDK1
  • PDK2
  • PDK3
  • PDK4
  • PDX1
  • PHE1A
  • PHE1B
  • PHE3
  • PPARB
  • PPARD
  • RARA
  • RARB
  • RARG
  • RXRA
  • RXRB
  • RXRG
Homo sapiens (human)
Signaling by SCF-KIT
  • APRF
  • CHEK1
  • CHK1
  • CLG4B
  • CMA1
  • CYH
  • CYM
  • FER
  • FES
  • FMI
  • FPS
  • FYN
  • GAB2
  • GADS
  • GRAP
  • GRAP2
  • GRB1
  • GRB10
  • GRB2L
  • GRB7
  • GRBIR
  • GRID
  • HRAS
  • HRAS1
  • JAK2
  • JTK8
  • KIAA0207
  • KIAA0571
  • KIT
  • LCK
  • LYN
  • MMP9
  • NRAS
  • PCP2
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PKCA
  • PRKACA
  • PRKCA
  • PSCTK4
  • PTP2C
  • PTPN11
  • PTPRO
  • PTPRU
  • RAC1
  • SCFR
  • SHPTP2
  • SOS1
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT5
  • STAT5A
  • STAT5B
  • TC25
  • TEC
  • TYK3
  • VAV
  • VAV1
  • YES
  • YES1
Homo sapiens (human)
Signaling by TCF7L2 mutants
  • CTBP
  • CTBP1
  • CTBP2
  • TCF4
  • TCF7L2
Homo sapiens (human)
Signaling by Type 1 Insulin-like Growth Factor 1 Receptor (IGF1R)
  • CILP
  • IBP1
  • IGF1
  • IGF1R
  • IGF2
Homo sapiens (human)
Signaling by VEGF
  • AAMP
  • VEGF
  • VEGFA
Homo sapiens (human)
Signaling by activated point mutants of FGFR1
  • BFGFR
  • CEK
  • FGF1
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FGFBR
  • FGFR1
  • FLG
  • FLT2
  • HBGFR
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • KS3
Homo sapiens (human)
Signaling by activated point mutants of FGFR3
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FGFR3
  • HST
  • HSTF1
  • HYPF
  • JTK4
  • KS3
Homo sapiens (human)
Signaling by cytosolic FGFR1 fusion mutants
  • APRF
  • BCR
  • BCR1
  • CD245
  • CEP43
  • CFIM68
  • CPSF6
  • CUTL1
  • CUX1
  • D22S11
  • FGFR1OP
  • FGFR1OP2
  • FIM
  • FOP
  • GAB2
  • GCF2
  • GRB1
  • KIAA0216
  • KIAA0571
  • LRRFIP1
  • MYO18A
  • MYSPDZ
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • RAMP
  • RNF82
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT5
  • STAT5A
  • STAT5B
  • TIAF1
  • TIF1
  • TIF1A
  • TRIM24
  • TRIP
  • ZMYM2
  • ZNF198
Homo sapiens (human)
Signaling by cytosolic PDGFRA and PDGFRB fusion proteins
  • FIP1
  • FIP1L1
  • KIAA1449
  • RHE
  • STRN
  • UAF1
  • WDR48
Homo sapiens (human)
Signaling by extracellular domain mutants of KIT
  • KIT
  • SCFR
Homo sapiens (human)
Signaling by high-kinase activity BRAF mutants
  • APBB1IP
  • ARAF
  • ARAF1
  • ARB2
  • ARR1
  • ARR2
  • ARRB1
  • ARRB2
  • BRAF
  • BRAF1
  • CNK1
  • CNK2
  • CNKSR1
  • CNKSR2
  • CSK
  • CTAK1
  • EMK2
  • ERK1
  • ERK2
  • F8VWF
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • FN
  • FN1
  • GP2B
  • GP3A
  • HRAS
  • HRAS1
  • IQGAP1
  • ITGA2B
  • ITGAB
  • ITGB3
  • KIAA0051
  • KIAA0902
  • KIAA1027
  • KREV1
  • KSR
  • KSR1
  • KSR2
  • MAP2K1
  • MAP2K2
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MARK3
  • MEK1
  • MEK2
  • MKK2
  • NRAS
  • PBP
  • PEBP
  • PEBP1
  • PKS
  • PKS2
  • PREL1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PRKMK1
  • PRKMK2
  • RAF
  • RAF1
  • RAFB1
  • RAP1A
  • RAP1B
  • RARP1
  • RIAM
  • SRC
  • SRC1
  • TLN
  • TLN1
  • VCL
  • VWF
  • YWHAB
Homo sapiens (human)
Signaling by juxtamembrane domain KIT mutants
  • KIT
  • SCFR
Homo sapiens (human)
Signaling by kinase domain mutants of KIT
  • KIT
  • SCFR
Homo sapiens (human)
Signaling by membrane-tethered fusions of PDGFRA or PDGFRB
  • ANKRD15
  • BIN2
  • BRAP1
  • ETV6
  • FLK1
  • GOLGA4
  • KANK
  • KANK1
  • KDR
  • KIAA0172
  • TEL
  • TEL1
  • VEGFR2
Homo sapiens (human)
Signaling by moderate kinase activity BRAF mutants
  • APBB1IP
  • ARAF
  • ARAF1
  • ARB2
  • ARR1
  • ARR2
  • ARRB1
  • ARRB2
  • BRAF
  • BRAF1
  • BRAP
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • CNK1
  • CNK2
  • CNKSR1
  • CNKSR2
  • CSK
  • CTAK1
  • EMK2
  • ERK1
  • ERK2
  • F8VWF
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • FN
  • FN1
  • GP2B
  • GP3A
  • HRAS
  • HRAS1
  • IQGAP1
  • ITGA2B
  • ITGAB
  • ITGB3
  • JAK2
  • KIAA0051
  • KIAA0902
  • KIAA0968
  • KIAA1027
  • KRAS
  • KRAS2
  • KREV1
  • KSR
  • KSR1
  • KSR2
  • MAP2K1
  • MAP2K2
  • MAP3K11
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MARK3
  • MEK1
  • MEK2
  • MKK2
  • MLK3
  • NRAS
  • PBP
  • PEBP
  • PEBP1
  • PHB
  • PHB1
  • PKS
  • PKS2
  • PREL1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PRKMK1
  • PRKMK2
  • PTK1
  • RAF
  • RAF1
  • RAFB1
  • RAP1A
  • RAP1B
  • RARP1
  • RASK2
  • RIAM
  • RNF52
  • SPRK
  • SRC
  • SRC1
  • TLN
  • TLN1
  • VCL
  • VWF
  • YWHAB
Homo sapiens (human)
Signaling by phosphorylated juxtamembrane, extracellular and kinase domain KIT mutants
  • APRF
  • FYN
  • GRB1
  • HRAS
  • HRAS1
  • JAK2
  • JTK8
  • KIT
  • LCK
  • LYN
  • NRAS
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • SCFR
  • SOS1
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT5
  • STAT5A
  • STAT5B
  • YES
  • YES1
Homo sapiens (human)
Signaling by plasma membrane FGFR1 fusions
  • BAG4
  • BFGFR
  • C8orf2
  • CEK
  • ERLIN2
  • FGFBR
  • FGFR1
  • FLG
  • FLT2
  • HBGFR
  • SODD
  • SPFH2
Homo sapiens (human)
Signaling downstream of RAS mutants
  • APBB1IP
  • ARAF
  • ARAF1
  • ARB2
  • ARR1
  • ARR2
  • ARRB1
  • ARRB2
  • BRAF
  • BRAF1
  • BRAP
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • CNK1
  • CNK2
  • CNKSR1
  • CNKSR2
  • CSK
  • CTAK1
  • EMK2
  • ERK1
  • ERK2
  • F8VWF
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • FN
  • FN1
  • GP2B
  • GP3A
  • HRAS
  • HRAS1
  • IQGAP1
  • ITGA2B
  • ITGAB
  • ITGB3
  • JAK2
  • KIAA0051
  • KIAA0902
  • KIAA0968
  • KIAA1027
  • KRAS
  • KRAS2
  • KREV1
  • KSR
  • KSR1
  • KSR2
  • MAP2K1
  • MAP2K2
  • MAP3K11
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MARK3
  • MEK1
  • MEK2
  • MKK2
  • MLK3
  • NRAS
  • PBP
  • PEBP
  • PEBP1
  • PHB
  • PHB1
  • PKS
  • PKS2
  • PREL1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PRKMK1
  • PRKMK2
  • PTK1
  • RAF
  • RAF1
  • RAFB1
  • RAP1A
  • RAP1B
  • RARP1
  • RASK2
  • RIAM
  • RNF52
  • SPRK
  • SRC
  • SRC1
  • TLN
  • TLN1
  • VCL
  • VWF
  • YWHAB
Homo sapiens (human)
Signalling to ERK5
  • BMK1
  • ERK5
  • MAP2K5
  • MAPK7
  • MEK5
  • MKK5
  • PRKM7
  • PRKMK5
Homo sapiens (human)
Signalling to RAS
  • HRAS
  • HRAS1
  • MTC
  • NGF
  • NGFB
  • NRAS
  • NSHC
  • NTRK1
  • SCK
  • SHC
  • SHC1
  • SHC2
  • SHC3
  • SHCA
  • SHCB
  • SHCC
  • SOS1
  • TRK
  • TRKA
Homo sapiens (human)
Signalling to STAT3
  • APRF
  • MTC
  • NGF
  • NGFB
  • NTRK1
  • STAT3
  • TRK
  • TRKA
Homo sapiens (human)
Signalling to p38 via RIT and RIN
  • BRAF
  • BRAF1
  • MTC
  • NGF
  • NGFB
  • NTRK1
  • RAFB1
  • RIBB
  • RIN
  • RIT
  • RIT1
  • RIT2
  • ROC1
  • ROC2
  • TRK
  • TRKA
Homo sapiens (human)
Small interfering RNA (siRNA) biogenesis
  • AGO1
  • AGO2
  • AGO3
  • AGO4
  • DICER
  • DICER1
  • EIF2C1
  • EIF2C2
  • EIF2C3
  • EIF2C4
  • HERNA
  • KIAA0928
  • KIAA1567
  • PACT
  • PRKRA
  • RAX
  • TARBP2
  • TRAX
  • TRBP
  • TSN
  • TSNAX
Homo sapiens (human)
Smooth Muscle Contraction
  • ACTA2
  • ACTA3
  • ACTG2
  • ACTL3
  • ACTSA
  • ACTSG
  • ACTVS
  • ALDH2
  • ALDM
  • ANX1
  • ANX2
  • ANX2L4
  • ANX6
  • ANXA1
  • ANXA2
  • ANXA6
  • C15orf13
  • CACNA1G
  • CACNA1H
  • CACNA1I
  • CAD
  • CAL1H
  • CALD1
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAV3
  • CDM
  • DYSF
  • FER1L1
  • GUC1A2
  • GUC1A3
  • GUC1B3
  • GUCSA2
  • GUCSA3
  • GUCSB3
  • GUCY1A1
  • GUCY1A2
  • GUCY1A3
  • GUCY1B1
  • GUCY1B2
  • GUCY1B3
  • HSRLC
  • ITGA1
  • ITGB5
  • KIAA0866
  • KIAA0894
  • KIAA1027
  • KIAA1120
  • KIAA1123
  • KIAA1296
  • LMOD1
  • LPC1
  • LPC2D
  • MG53
  • MLC1SA
  • MLC2
  • MLCB
  • MLCK
  • MLCK1
  • MRLC1
  • MRLC2
  • MRLC3
  • MYH11
  • MYL10
  • MYL11
  • MYL12A
  • MYL12B
  • MYL2A
  • MYL5
  • MYL6
  • MYL6B
  • MYL7
  • MYL9
  • MYLC2A
  • MYLC2B
  • MYLC2PL
  • MYLK
  • MYLK1
  • MYLPF
  • MYRL2
  • PAK1
  • PAK2
  • PDE5
  • PDE5A
  • PLRLC
  • PXN
  • RLC
  • SCAM1
  • SH3D5
  • SORBS1
  • SORBS3
  • TLN
  • TLN1
  • TMSA
  • TMSB
  • TPM1
  • TPM2
  • TPM3
  • TPM4
  • TRIM72
  • VCL
Homo sapiens (human)
Sodium-coupled phosphate cotransporters
  • GLVR1
  • GLVR2
  • PIT1
  • PIT2
  • SLC20A1
  • SLC20A2
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Last updated: August 19, 2024