GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 51 - 75 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
VEGFA-VEGFR2 Pathway
  • Abi1
  • Abi2
  • Arha
  • Arha2
  • Axl
  • Baiap2
  • Bcar1
  • Brk1
  • Cas
  • Cdc42
  • Crk
  • Crkas
  • Crko
  • Csbp1
  • Csbp2
  • Cyba
  • Cybb
  • Cyfip1
  • Cyfip2
  • Elmo1
  • Elmo2
  • Fak
  • Fak1
  • Fak2
  • Flk1
  • Fyn
  • Hem2
  • Hsp27
  • Hsp86
  • Hsp90aa1
  • Hspb1
  • Hspca
  • Itgav
  • Itgb3
  • Kdr
  • Mapk11
  • Mapk12
  • Mapk13
  • Mapk14
  • Mapkapk2
  • Mapkapk3
  • Nap1
  • Ncf1
  • Ncf2
  • Ncf4
  • Nck1
  • Nck2
  • Nckap1
  • Nckap1l
  • Pak2
  • Pik3ca
  • Pik3cb
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Pkacb
  • Prkaca
  • Prkacb
  • Ptk2
  • Ptk2b
  • Pxn
  • Pyk2
  • Rac
  • Rac1
  • Rhoa
  • Rock1
  • Rock2
  • Sapk3
  • Sck
  • Sh2d2a
  • Shb
  • Shc2
  • Src
  • Vav
  • Vav1
  • Vav2
  • Vav3
  • Vegf
  • Vegfa
  • Wasf1
  • Wasf2
  • Wasf3
  • Wave1
Rattus norvegicus (Norway rat)
eNOS activation
  • Akt1
  • Apt1
  • CaMIII
  • Calm3
  • Cam3
  • Camc
  • Cav
  • Cav1
  • Cygb
  • Ddah
  • Ddah1
  • Hsp86
  • Hsp90aa1
  • Hspca
  • Lypla1
  • Nos3
  • Spr
  • Stap
Rattus norvegicus (Norway rat)
Removal of aminoterminal propeptides from gamma-carboxylated proteins
  • Bglap
  • Bglap2
  • Cf9
  • F10
  • F2
  • F7
  • F9
  • Fur
  • Furin
  • Gas6
  • Pcsk3
  • Proc
  • Pros
  • Pros1
  • Proz
Rattus norvegicus (Norway rat)
Tristetraprolin (TTP, ZFP36) binds and destabilizes mRNA
  • Dcp1a
  • Dcp2
  • Dis3
  • Exosc1
  • Exosc2
  • Exosc3
  • Exosc4
  • Exosc5
  • Exosc6
  • Exosc7
  • Exosc8
  • Exosc9
  • LOC103690064
  • LOC679140
  • Mapkapk2
  • Tis11
  • Tnpo1
  • Ttp
  • Xrn1
  • Ywhab
  • Zfp36
Rattus norvegicus (Norway rat)
MET receptor recycling
  • Arf6
  • Ash
  • Crk
  • Crkl
  • Crko
  • Gab1
  • Gga3
  • Grb2
  • Hgf
  • Met
  • Rab4
  • Rab4a
  • Rab4b
Rattus norvegicus (Norway rat)
Xenobiotics
  • Ahr
  • Ahrr
  • Arnt
  • Arnt2
  • Cyp1a-1
  • Cyp1a1
  • Cyp2a-1
  • Cyp2a-2
  • Cyp2a-3
  • Cyp2a1
  • Cyp2a2
  • Cyp2a3
  • Cyp2a3a
  • Cyp2b21
  • Cyp2c-6
  • Cyp2c6
  • Cyp2c66
  • Cyp2d-18
  • Cyp2d-4
  • Cyp2d18
  • Cyp2d4
  • Cyp2e
  • Cyp2e-1
  • Cyp2e1
  • Cyp2f2
  • Cyp2f4
  • Cyp2j16
  • Cyp2j3
  • Cyp2j9
  • Cyp2s1
  • Cyp2w1
  • Cyp3a-1
  • Cyp3a-2
  • Cyp3a1
  • Cyp3a11
  • Cyp3a13
  • Cyp3a18
  • Cyp3a2
  • Cyp3a62
  • Cyp3a9
  • LOC100912265
Rattus norvegicus (Norway rat)
Butyrate Response Factor 1 (BRF1) binds and destabilizes mRNA
  • Akt1
  • Brf1
  • Cmg1
  • Dcp1a
  • Dcp2
  • Dis3
  • Exosc1
  • Exosc2
  • Exosc3
  • Exosc4
  • Exosc5
  • Exosc6
  • Exosc7
  • Exosc8
  • Exosc9
  • LOC103690064
  • LOC679140
  • Mapkapk2
  • Tis11b
  • Xrn1
  • Ywhab
  • Zfp36l1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Regulation of HSF1-mediated heat shock response
  • Aaas
  • Bag1
  • Bag2
  • Bag4
  • Bag5
  • Dnajb1
  • Dnajb6
  • Dnajc2
  • Erk1
  • Erk2
  • Fam10a1
  • Gp210
  • Grp75
  • Grp78
  • Gsk3b
  • Hikeshi
  • Hip
  • Hsc70
  • Hsc73
  • Hsf1
  • Hsp105
  • Hsp110
  • Hsp70-1
  • Hsp70-2
  • Hsp70-3
  • Hspa1
  • Hspa12a
  • Hspa12b
  • Hspa13
  • Hspa14
  • Hspa1a
  • Hspa1b
  • Hspa1l
  • Hspa2
  • Hspa4
  • Hspa5
  • Hspa8
  • Hspa9
  • Hspa9a
  • Hsph1
  • Hsph2
  • Hst70
  • Irp94
  • LOC683983
  • Mapk
  • Mapk1
  • Mapk3
  • Mapkapk2
  • Mida1
  • Mrnp41
  • Ndc1
  • Npap60
  • Nup107
  • Nup121
  • Nup133
  • Nup153
  • Nup155
  • Nup160
  • Nup188
  • Nup205
  • Nup210
  • Nup214
  • Nup35
  • Nup37
  • Nup42
  • Nup43
  • Nup50
  • Nup53
  • Nup54
  • Nup58
  • Nup62
  • Nup84
  • Nup85
  • Nup88
  • Nup93
  • Nup98
  • Nupl1
  • Nupl2
  • Pcnt1
  • Pom121
  • Pom210
  • Prkm1
  • Prkm3
  • Rae1
  • Ranbp2
  • Rpa1
  • Rpa2
  • Rpa3
  • Rps19bp1
  • Sec13
  • Sec13l1
  • Sirt1
  • St13
  • Stch
  • Tmem48
  • Tpr
  • Ywhae
  • Zrf1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Ovarian tumor domain proteases
  • Apc
  • Arha
  • Arha2
  • Cdc2
  • Cdc2a
  • Cdk1
  • Cdkn1
  • Esr
  • Esr1
  • Estr
  • Hshin7
  • Ikbkg
  • LOC100360606
  • LOC100360645
  • Nemo
  • Nod1
  • Nod2
  • Nr3a1
  • Otub1
  • Otub2
  • Otud3
  • Otud7a
  • Otud7b
  • P53
  • Pten
  • Rhoa
  • Ripk1
  • Ripk2
  • Rnf128
  • Rps27a
  • Tnfaip3
  • Tnip1
  • Tnip2
  • Tp53
  • Traf3
  • Traf6
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Ube2d1
  • Vcip135
  • Vcp
  • Vcpip1
  • Yod1
  • Zranb1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Formation of the ternary complex, and subsequently, the 43S complex
  • AABR07029195.1
  • EIF3EIP
  • EIF3F
  • EIF3K
  • EIF3L
  • EIF3M
  • EIF3S12
  • EIF3S5
  • EIF3S6IP
  • Eif1a
  • Eif2a
  • Eif2g
  • Eif2s1
  • Eif2s2
  • Eif2s3
  • Eif2s3x
  • Eif3a
  • Eif3b
  • Eif3c
  • Eif3d
  • Eif3e
  • Eif3f
  • Eif3g
  • Eif3h
  • Eif3i
  • Eif3j
  • Eif3k
  • Eif3l
  • Eif3m
  • Eif3s1
  • Eif3s10
  • Eif3s2
  • Eif3s3
  • Eif3s4
  • Eif3s6
  • Eif3s7
  • Eif3s8
  • Eif3s9
  • Fau
  • Fte-1
  • Fte1
  • Int6
  • LOC100361854
  • LOC100361933
  • Lamr1
  • Rig
  • Rps10
  • Rps11
  • Rps12l8
  • Rps13
  • Rps14
  • Rps15
  • Rps15a
  • Rps16
  • Rps17
  • Rps18
  • Rps19
  • Rps2
  • Rps20
  • Rps21
  • Rps23
  • Rps24
  • Rps25
  • Rps26
  • Rps26-ps13
  • Rps26l2
  • Rps26l4
  • Rps26l6
  • Rps27
  • Rps27a
  • Rps27l
  • Rps28
  • Rps29
  • Rps3
  • Rps3a
  • Rps4
  • Rps4x
  • Rps4y2
  • Rps5
  • Rps6
  • Rps7
  • Rps7-ps23
  • Rps8
  • Rps9
  • Rpsa
  • S27-1
  • Uba80
  • Ubcep1
Rattus norvegicus (Norway rat)
SUMOylation of immune response proteins
  • Ikba
  • Ikbke
  • Ikbkg
  • Nemo
  • Nfkb2
  • Nfkbia
  • Pias3
  • Pias4
  • Rela
  • Sumo1
  • Sumo3
  • Topors
  • Ubce9
  • Ube2i
Rattus norvegicus (Norway rat)
Intracellular metabolism of fatty acids regulates insulin secretion
  • Acs3
  • Acs4
  • Acsl3
  • Acsl4
  • Cd36
  • Facl3
  • Facl4
  • Fat
Rattus norvegicus (Norway rat)
Growth hormone receptor signaling
  • Erk1
  • Erk2
  • Gh
  • Gh1
  • Ghr
  • Jak2
  • Lyn
  • Mapk
  • Mapk1
  • Mapk3
  • Mgf
  • Prkm1
  • Prkm3
  • Prl
  • Prlr
  • Ptpn1
  • Sh2-b
  • Sh2b1
  • Sh2bpsm1
  • Stat5a
  • Stat5b
Rattus norvegicus (Norway rat)
Synthesis of (16-20)-hydroxyeicosatetraenoic acids (HETE)
  • Cyp1a-1
  • Cyp1a-2
  • Cyp1a1
  • Cyp1a2
  • Cyp1b1
  • Cyp2c66
  • Cyp2u1
  • Cyp4a-8
  • Cyp4a12
  • Cyp4a8
  • Cyp4f4
  • LOC100912265
Rattus norvegicus (Norway rat)
Sealing of the nuclear envelope (NE) by ESCRT-III
  • Cc2d1b
  • Chmp2a
  • Chmp2b
  • Chmp3
  • Chmp4b
  • Chmp4c
  • Chmp6
  • Chmp7
  • Ist1
  • LOC679312
  • Spast
  • Spg4
  • Tuba1
  • Tuba1a
  • Tuba1b
  • Tuba1c
  • Tuba2
  • Tuba3
  • Tuba3a
  • Tuba3b
  • Tuba4
  • Tuba4a
  • Tuba6
  • Tuba8
  • Tubal3
  • Tubb1
  • Tubb2a
  • Tubb2b
  • Tubb2c
  • Tubb3
  • Tubb4b
  • Vps24
  • Vps4a
  • vps4-A
Rattus norvegicus (Norway rat)
Calcitonin-like ligand receptors
  • Adm
  • Adm2
  • Am2
  • Calc
  • Calca
  • Calcb
  • Calcr
  • Calcrl
  • Cgrpr
  • Iapp
  • Ramp1
  • Ramp2
  • Ramp3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Signaling by BMP
  • Actrii
  • Actriib
  • Acvr2
  • Acvr2a
  • Acvr2b
  • Acvrl1
  • Acvrlk1
  • Amh
  • Amhr2
  • Bmp-2
  • Bmp10
  • Bmp2
  • Bmpr1a
  • Bmpr1b
  • Bmpr2
  • Chrdl1
  • Frp
  • Fstl1
  • Gdf2
  • Grem2
  • Inha
  • Inhba
  • Kjr
  • Mad1
  • Madh1
  • Madh4
  • Madh5
  • Madh7
  • Madh8
  • Madh9
  • Ng1
  • Ski
  • Smad1
  • Smad4
  • Smad5
  • Smad6
  • Smad7
  • Smad8
  • Smad9
  • Smurf1
  • Smurf2
  • Tgfbr3
  • Ube2d1
  • Ube2d3
  • Zfyve16
Rattus norvegicus (Norway rat)
Negative regulation of FGFR3 signaling
  • Ash
  • Cbl
  • Erk1
  • Erk2
  • Fgf-1
  • Fgf-2
  • Fgf-5
  • Fgf-9
  • Fgf1
  • Fgf16
  • Fgf17
  • Fgf18
  • Fgf2
  • Fgf20
  • Fgf23
  • Fgf4
  • Fgf5
  • Fgf7a
  • Fgf8
  • Fgf9
  • Fgfa
  • Fgfr3
  • Frs2
  • Grb2
  • LOC100360645
  • Mapk
  • Mapk1
  • Mapk3
  • Prkm1
  • Prkm3
  • Ptpn11
  • Rps27a
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
HuR (ELAVL1) binds and stabilizes mRNA
  • Anp32a
  • Crm1
  • Elavl1
  • Hur
  • Lanp
  • Nup214
  • Pkca
  • Pkcd
  • Prkca
  • Prkcd
  • Set
  • Tnfsf13
  • Xpo1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Formation of the cornified envelope
  • AABR07044375.1
  • Bsp1
  • Casp14
  • Cdsn
  • Cela2a
  • Dsc1
  • Dsc2
  • Dsc3
  • Dsg1
  • Dsg2
  • Dsg3
  • Dsg4
  • Dsp
  • Ela2
  • Ela2a
  • Evpl
  • Jup
  • Kaz
  • Kazn
  • Klk12
  • Klk13
  • Klk14
  • Klk5
  • Klk8
  • Klnk
  • Klnl
  • Klnm
  • Lipk
  • Lipm
  • Lipn
  • Nrpn
  • Perp
  • Pg
  • Pkp1
  • Pkp2
  • Pkp3
  • Pkp4
  • Ppl
  • Prss19
  • Rptn
  • Spink5
  • Spink5l1
  • Spink6
  • Sprr3
  • Stfa2l3
  • Tgm1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Signaling by Retinoic Acid
  • Cpt-1
  • Cpt1
  • Cpt1a
  • Cpt1b
  • Crabp2
  • Dlat
  • Dld
  • Fabp5
  • LOC311254
  • Nr2b1
  • Nr2b2
  • Nr2b3
  • Pdh
  • Pdha1
  • Pdha1l1
  • Pdha2
  • Pdhb
  • Pdhx
  • Pdk1
  • Pdk2
  • Pdk4
  • Rara
  • Rarb
  • Rarg
  • Rcor-1
  • Rxra
  • Rxrb
  • Rxrg
Rattus norvegicus (Norway rat)
FGFR1c ligand binding and activation
  • FGF6
  • Fgf-1
  • Fgf-2
  • Fgf-5
  • Fgf-9
  • Fgf1
  • Fgf17
  • Fgf2
  • Fgf20
  • Fgf23
  • Fgf4
  • Fgf5
  • Fgf6
  • Fgf7a
  • Fgf7b
  • Fgf8
  • Fgf9
  • Fgfa
  • Fgfr1
  • Flg
  • Gipc
  • Gipc1
  • Rgs19ip1
  • Tgfbr3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Formation of the beta-catenin:TCF transactivating complex
  • Baf190a
  • Bcl9
  • Bcl9l
  • Brg1
  • Catnb
  • Cbp
  • Cdc73
  • Crebbp
  • Ctnnb1
  • Ep300
  • Esp2
  • Esp3
  • Grg4
  • Hdac1
  • Hrpt2
  • Htatip
  • Kat5
  • Lef1
  • Leo1
  • Pygo1
  • Pygo2
  • Ruvbl1
  • Smarca4
  • Snf2b
  • Snf2l4
  • Tcf7
  • Tcf7l1
  • Tcf7l2
  • Tert
  • Tip49
  • Tip49a
  • Tip60
  • Tip60b
  • Tle1
  • Tle2
  • Tle3
  • Tle4
  • Trrap
Rattus norvegicus (Norway rat)
Regulated proteolysis of p75NTR
  • Adam17
  • Aph1a
  • Ncstn
  • Ngfr
  • Ps2
  • Psen1
  • Psen2
  • Psenen
  • Psnl1
  • Psnl2
  • Tace
  • Tnfrsf16
Rattus norvegicus (Norway rat)
Regulation of TP53 Activity through Phosphorylation
  • Aik
  • Aik2
  • Aim1
  • Airk1
  • Airk2
  • Ampk1
  • Ark1
  • Ark2
  • Atm
  • Atr
  • Atrip
  • Aura
  • Aurka
  • Aurkb
  • Ayk1
  • Bard1
  • Blm
  • Brca1
  • Brip1
  • Btak
  • Ccna1
  • Ccna2
  • Cdk2
  • Cdk5
  • Cdk5r
  • Cdk5r1
  • Cdkn2
  • Cdkn5
  • Chek1
  • Chk1
  • Ciidbp
  • Ck2n
  • Cnk
  • Csbp1
  • Csbp2
  • Csnk2a1
  • Csnk2a2
  • Csnk2b
  • Ctip
  • Dn7
  • Dna2
  • Dyrk2
  • Exo1
  • Fnk
  • Hipk1
  • Htatip
  • Hus1
  • Iak1
  • Kat5
  • LOC100360645
  • LOC685619
  • Lkb1
  • Mapk11
  • Mapk14
  • Mapkapk5
  • Mdm2
  • Mdm4
  • Mdmx
  • Mre11
  • Mre11a
  • Nbn
  • Nbs1
  • Noc2l
  • Nuak1
  • P53
  • PSSALRE
  • Plk3
  • Prkaa1
  • Prkab1
  • Prkab2
  • Prkag1
  • Prkag2
  • Prkag3
  • RGD1564788
  • Rad1
  • Rad17
  • Rad50
  • Rad9a
  • Rad9b
  • Rbbp8
  • Rfc2
  • Rfc3
  • Rfc4
  • Rfc5
  • Rhno1
  • Rmi1
  • Rmi2
  • Rpa1
  • Rpa2
  • Rpa3
  • Rps27a
  • Ssrp1
  • Stk1
  • Stk11
  • Stk12
  • Stk15
  • Stk5
  • Stk6
  • Supt16h
  • Taf1
  • Taf11
  • Taf12
  • Taf13
  • Taf15
  • Taf2
  • Taf2e
  • Taf2g
  • Taf4
  • Taf4b
  • Taf5
  • Taf6
  • Taf7
  • Taf7l-ps1
  • Taf9
  • Taf9b
  • Taf9l
  • Tafii31
  • Tbp
  • Tip60
  • Tip60b
  • Top3a
  • Topbp1
  • Tp53
  • Tp53rk
  • Tp53rka
  • Tp53rkb
  • Tpx2
  • Trp53rka
  • Trp53rkb
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Wrn
Rattus norvegicus (Norway rat)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

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Last updated: August 19, 2024